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当前共找到 10536 篇文献，本页显示第 1861 - 1880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2026-01-08 |
ASPEN: Robust detection of allelic dynamics in single cell RNA-seq
2025-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.649227
PMID:40949971
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ASPEN的统计方法，用于在F1杂交单细胞转录组数据中建模等位基因均值和方差，以检测等位基因动态变化 | ASPEN采用敏感映射流程和自适应收缩技术，能区分单细胞中的等位基因失衡和方差，相比现有方法在稀疏液滴单细胞数据中表现出更高的敏感性和更低的假发现率 | NA | 开发一种统计方法来检测单细胞RNA-seq数据中的等位基因动态变化，以解析复杂调控现象 | F1杂交单细胞转录组数据，具体应用于小鼠脑类器官和T细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | 统计模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1862 | 2026-01-08 |
Oxidative Stress Links Thyroid Autoimmunity to Cancer: Peroxiredoxin 2 Protection via Genomic and Single-Cell Insights
2025-Sep, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251360744
PMID:40735789
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的共享遗传因素，并确定了过氧化物还原酶2（PRDX2）的关键保护作用 | 首次通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和机器学习分类模型的整合方法，系统性地识别了连接自身免疫性甲状腺疾病与甲状腺癌的因果基因及其表达模式 | 研究主要基于欧洲人群（FinnGen）的遗传数据，结论在其他人群中的普适性有待验证；单细胞测序样本量相对有限 | 探究桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的共享遗传机制和分子联系 | 桥本甲状腺炎和甲状腺癌（包括乳头状癌和未分化癌）患者及正常甲状腺组织 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析 | 机器学习分类模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 76,243个甲状腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1863 | 2026-01-08 |
Gene Regulatory Network Inference from Pseudotime-Ordered scRNA-seq Data via Time-Lagged Divergence Measures
2025-Sep, Bioinformatics research and applications : ... international symposium, ISBRA ... proceedings. ISBRA (Conference)
DOI:10.1145/3774976.3774995
PMID:41488124
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研究论文 | 提出了一种名为PseudoGRN的新型整合框架，用于从时间序列单细胞RNA测序数据推断细胞类型特异性基因调控网络 | 整合了多种伪时间推断方法、时滞散度度量、非冗余惩罚网络推断和偏相关分析，能够从稀疏时间分辨率数据重建有向基因调控网络 | NA | 从时间序列单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 整合框架（包含伪时间推断、时滞散度度量、惩罚网络推断、偏相关分析） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1864 | 2026-01-08 |
Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jun-24, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c02111
PMID:40489257
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研究论文 | 本文介绍了一种名为nanocoding的新技术，利用脂质纳米颗粒（LNPs）进行高密度条形码标记，用于多重单细胞RNA测序 | 采用脂质纳米颗粒作为条形码载体，通过多种可控的细胞摄取方式，将条形码负载量提高10-100倍，并能在细胞裂解时提供保护和高效释放 | NA | 开发一种高效、稳定的样本多重标记技术，以降低单细胞RNA测序的成本并减少批次效应 | 培养细胞系、组织消化物中的异质性细胞（如脾脏和肥胖啮齿动物脂肪组织） | 单细胞测序技术 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 涉及培养细胞系、脾脏消化物（6重条形码样本）和肥胖啮齿动物脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1865 | 2026-01-08 |
Time-Varying Gene Regulatory Networks Inference Using KL Divergence from Single Cell Data
2025-May, Proceedings of the ... International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology
DOI:10.1109/icbbt65815.2025.11276344
PMID:41488127
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研究论文 | 本文提出了一种基于KL散度的新框架，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断时变基因调控网络 | 整合KL散度的时间变异测量、自回归模型和正则化方法，以应对高维、稀疏和时序异质性的挑战 | NA | 从时间序列单细胞RNA测序数据中准确重建动态基因调控网络 | 10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1866 | 2026-01-08 |
The eNAMPT-Integrin α5β1 Axis Mediates Neutrophil-Endothelial Cell Interactions Driving Inflammation in Ulcerative Colitis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S554975
PMID:41487969
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与体内实验结合，揭示了eNAMPT-整合素α5β1轴在溃疡性结肠炎中介导中性粒细胞-内皮细胞相互作用并驱动炎症的关键机制 | 首次发现eNAMPT作为信号分子结合内皮整合素α5β1，介导病理性中性粒细胞-内皮细胞通讯，并验证其作为UC治疗新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步开展 | 揭示溃疡性结肠炎中致病性中性粒细胞活化的关键信号轴 | 溃疡性结肠炎患者样本及小鼠模型中的中性粒细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1867 | 2026-01-08 |
Bullous pemphigoid induced by anti-IL-23 monoclonal antibody in a psoriatic patient: a case report
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1709423
PMID:41488061
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病例报告 | 本研究报道了一例银屑病患者在使用抗IL-23单克隆抗体guselkumab后诱发大疱性类天疱疮的罕见不良反应，并通过单细胞RNA测序揭示了其潜在的免疫失衡和表皮修复缺陷机制 | 首次结合临床病例与单细胞RNA测序技术，系统分析了抗IL-23生物制剂诱导大疱性类天疱疮的细胞和分子机制，揭示了角质形成细胞应激标志物和干扰素相关基因的上调 | 本研究为单病例报告，样本量小，结果需在更大队列中验证，且未深入探讨IL-23与干扰素信号通路的交互作用 | 探讨抗IL-23生物制剂guselkumab治疗银屑病时诱发大疱性类天疱疮的罕见不良反应及其潜在机制 | 一名78岁中重度银屑病女性患者，在使用guselkumab后出现大疱性类天疱疮的皮肤病变 | 数字病理学 | 银屑病与大疱性类天疱疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者（银屑病与大疱性类天疱疮病变组织对比） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1868 | 2026-01-08 |
Single-cell dissection of PTM-related networks reveals an immunosuppressed osteosarcoma ecosystem
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1718941
PMID:41488055
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据与PTM相关基因集，构建了一个PTM相关框架，用于揭示骨肉瘤的免疫抑制微环境特征 | 首次将PTM相关基因集与单细胞转录组数据结合，构建了骨肉瘤的PTM相关预后评分，并识别出GRN作为免疫抑制和恶性特征的关键介质 | 研究基于公开数据集和体外细胞实验，缺乏体内验证和临床样本的直接验证 | 探索PTM相关转录组程序在骨肉瘤中的作用，并识别与预后和免疫微环境相关的关键基因 | 骨肉瘤细胞系（U2OS和HOS）及公开的单细胞RNA测序数据集（GSE162454、TARGET-OS、GSE21257、GSE16091） | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ssGSEA、ESTIMATE、TIDE评分、SHAP分析、GRN功能丧失实验 | 预后评分模型、SHAP解释模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 多个公开数据集（包括GSE162454、TARGET-OS、GSE21257、GSE16091）及U2OS和HOS细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1869 | 2026-01-08 |
Serum CHI3L1 levels correlate with disease activity in rheumatoid arthritis and reveal potential molecular mechanisms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729989
PMID:41488645
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研究论文 | 本研究探讨了CHI3L1在类风湿关节炎中的分子调控机制及其与疾病活动的关联，并评估了其作为诊断和监测生物标志物的潜力 | 整合了转录组学、单细胞RNA测序和临床血清检测，首次系统揭示了CHI3L1在RA中的成纤维细胞特异性表达及其与免疫失调的关联，并通过药物预测和分子对接提出了潜在治疗候选药物 | 研究为探索性分析，需要进一步的功能实验和前瞻性研究进行验证 | 阐明CHI3L1在类风湿关节炎中的分子调控机制及其与疾病活动的关联，评估其作为诊断、动态监测和精准治疗靶点的潜力 | 类风湿关节炎患者 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 转录组学分析, 单细胞RNA-seq, 化学发光免疫测定, 分子对接 | Wilcoxon检验, ROC曲线, WGCNA, CIBERSORT | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 临床血清数据 | RA患者102例, 对照79例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1870 | 2026-01-08 |
Multi-omics profiling unravel the immune landscape diversity by prognostic signatures of immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1735893
PMID:41488652
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析开发了一个四基因预后特征，用于预测三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应和生存结局 | 整合了多重免疫荧光、bulk RNA测序和单细胞RNA测序，构建了一个反映肿瘤免疫微环境异质性的四基因预后特征 | 研究基于回顾性队列，需要前瞻性验证；样本量有限，可能影响模型的泛化能力 | 开发一个能够预测三阴性乳腺癌患者免疫治疗反应和预后的生物标志物特征 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫荧光，bulk RNA测序，单细胞RNA测序，CIBERSORT，CellChat分析，基因敲低和过表达功能实验 | 预后特征模型 | 图像，RNA测序数据 | 一个内部队列和三个独立外部队列的TNBC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1871 | 2026-01-07 |
SGMS2+ macrophages enhance NR4A3hi NK cell infiltration to improve prognosis and PD-1 treatment efficacy in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07040-x
PMID:41316300
|
研究论文 | 本研究揭示了SGMS2在肝细胞癌中通过极化巨噬细胞为M1表型并分泌CXCL2招募NR4A3hi NK细胞，从而改善预后和增强PD-1治疗效果的机制 | 首次阐明了SGMS2在巨噬细胞中的特异性作用，及其通过CXCL2介导的NK细胞招募机制改善肝细胞癌免疫微环境和PD-1治疗反应 | 研究主要基于回顾性临床数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限（临床队列188例） | 探究SGMS2在肝细胞癌免疫微环境中的作用及其对患者预后和PD-1治疗疗效的影响 | 肝细胞癌患者组织样本、TCGA数据库、THP-1单核细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、流式细胞术、慢病毒转染 | NA | RNA-seq数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | TCGA-LIHC数据集371例，独立临床队列188例（2017-2022） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1872 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1873 | 2026-01-07 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02773-6
PMID:41299485
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析，揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用，并识别了FABP4、RNASET2和FILIP1L作为潜在诊断标志物和治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，应用机器学习算法识别与巨噬细胞胆固醇代谢相关的关键基因，并构建风险评分模型进行外部验证，同时通过体外实验验证基因功能 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能受样本来源和批次效应影响；体外实验验证范围有限，需进一步体内研究确认基因功能 | 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制，并识别相关诊断和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者组织样本中的巨噬细胞及相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 逻辑回归, 机器学习算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的一个单细胞RNA测序数据集和多个批量mRNA转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1874 | 2026-01-07 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
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研究论文 | 本研究设计了一种多酶纳米催化剂，通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 开发了表面修饰有胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin的单原子钴基纳米酶（Rh@SAE），首次将催化疗法应用于急性胰腺炎治疗，并同时靶向细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于动物模型，尚未进行临床试验；纳米材料的长期生物安全性需要进一步评估 | 开发新型纳米药物治疗急性胰腺炎，改善临床预后 | 急性胰腺炎（AP）和重症急性胰腺炎（SAP）的病理过程 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1875 | 2026-01-07 |
SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013667
PMID:41223185
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研究论文 | 本文提出了一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的新型深度学习模型SpaMWGDA，用于空间转录组数据的空间域识别 | 通过多视图加权融合图卷积网络和数据增强，成功捕获了spot特征的全面邻域信息，并自适应地学习空间信息与基因特征之间的依赖关系 | 未在摘要中明确提及 | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性和效率 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多视图加权融合图卷积网络（GCN） | 基因表达和空间信息数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1876 | 2026-01-07 |
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03996-4
PMID:41174727
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研究论文 | 本研究通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据，识别出UBE2H作为结直肠癌对奥沙利铂耐药的潜在标志物 | 首次将多组学数据（转录组、甲基化组、单细胞RNA测序）整合分析，系统揭示了UBE2H在奥沙利铂耐药中的作用及其与免疫微环境、细胞分化和增殖状态的关联 | 研究主要基于细胞系和公共数据集，缺乏前瞻性临床队列验证；耐药机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 识别结直肠癌对奥沙利铂耐药的生物标志物并探索其生物学机制 | 结直肠癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、正常结肠组织单细胞数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型, 差异表达分析 | 转录组数据, 甲基化数据, 单细胞基因表达数据 | 多个公共数据集（TCGA及5个GEO数据集）及细胞系数据，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 1877 | 2026-01-07 |
[Progress of scRNA-seq technology in nasopharyngeal carcinoma research]
2025-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology head and neck surgery
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在鼻咽癌研究中的应用进展 | 总结了scRNA-seq技术在揭示鼻咽癌肿瘤细胞亚群、进化轨迹及肿瘤微环境细胞功能与相互作用方面的新思路 | NA | 探讨scRNA-seq技术在鼻咽癌发病机制、肿瘤异质性、肿瘤微环境、耐药性及治疗反应研究中的应用 | 鼻咽癌 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1878 | 2026-01-07 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's Disease (AD)
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667719
PMID:40766691
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研究论文 | 本研究利用多区域空间转录组学结合Aβ免疫荧光染色，揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在多个脑区同时进行空间转录组学与Aβ斑块分析，识别了抑制性神经元和细胞通讯网络的区域特异性变化 | 样本量较小（仅两名患者），且局限于Braak III和Thal 4阶段的AD病例，可能无法代表疾病全谱 | 探究阿尔茨海默病中脑区特异性对Aβ斑块诱导变化的脆弱性和恢复力的细胞与分子机制 | 两名Braak III和Thal 4阶段阿尔茨海默病患者的多个脑区组织，包括内嗅、枕颞、背外侧前额和纹状皮质 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 两名患者，覆盖四个脑区 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1879 | 2026-01-07 |
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643375
PMID:40166309
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研究论文 | 本文通过分析流感A病毒感染细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了宿主因子OASL的内在表达对IFNL诱导的关键作用 | 开发了一种分析时间序列单细胞RNA测序数据的方法，以识别调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子，并首次发现干扰素刺激基因OASL的内在表达是流感A病毒感染中IFNL稳健诱导所必需的 | 未明确说明样本量或实验设计的详细限制，可能局限于流感A病毒感染的特定模型 | 识别在病毒感染中调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子 | 流感A病毒感染的细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1880 | 2026-01-07 |
Spatially distinct cellular and molecular landscapes define prognosis in triple negative breast cancer
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637503
PMID:39990419
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，深入分析了三阴性乳腺癌中不同预后患者的细胞和分子异质性 | 首次利用空间转录组学技术，系统揭示了三阴性乳腺癌不同预后背后的空间和分子异质性，并识别出能高精度分类预后的上皮基因特征 | 研究样本量相对较小（32例），且为回顾性设计，可能限制结果的普遍性 | 探究三阴性乳腺癌不同预后的细胞和分子基础，以推动精准诊断和治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 卷积神经网络（CNN） | 空间转录组数据 | 32例女性患者（17例良好预后，15例不良预后） | NA | 空间转录组学 | GeoMX® Digital Spatial Profiler | GeoMx人类全转录组图谱（WTA）面板 |