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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 1801 - 1820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1801 | 2026-05-16 |
Transcriptomic profiling of senescence effects on blood-brain barrier-related gene expression in brain capillary endothelial cells in a mouse model of paclitaxel-induced chemobrain
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01561-5
PMID:39976844
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老对血脑屏障相关基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老通过转录组改变（如下调细胞连接组装通路、上调细胞外基质重塑和炎症信号通路）导致血脑屏障功能障碍的机制 | 研究基于小鼠模型，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何改变与血脑屏障完整性相关的基因表达模式 | 紫杉醇处理小鼠与对照组小鼠的脑毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 化疗引起的认知障碍（化学脑） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 紫杉醇处理组和对照组小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1802 | 2026-05-16 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal a Tumor Immune Cell Profile for Predicting Bladder Cancer Risk and Immunotherapy Outcomes
2025-06, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.01.016
PMID:40122457
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研究论文 | 利用肿瘤浸润免疫细胞相关基因构建模型，预测膀胱癌风险和免疫治疗效果 | 首次结合20种机器学习算法与孟德尔随机化方法，基于肿瘤浸润免疫细胞特征评分构建膀胱癌预后及免疫治疗预测模型 | 未提及明确局限性 | 开发基于肿瘤浸润免疫细胞的膀胱癌预测模型 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习集成模型（20种算法） | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多组RNA表达数据和单细胞RNA数据（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1803 | 2025-05-22 |
Corrigendum to "Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics"
2025-Jun, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100088
PMID:40393347
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1804 | 2026-05-16 |
Exploring genetic and immune cell dynamics in systemic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection via machine learning
2025-05-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae537
PMID:39361430
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研究论文 | 通过机器学习探索系统性红斑狼疮合并EB病毒感染患者的遗传和免疫细胞动态变化 | 首次利用机器学习识别出IFI27作为SLE合并EBV感染的关键基因，并结合单细胞RNA测序揭示其在CD4 CTL和B细胞亚群中的表达模式 | 未提供具体局限性信息 | 识别SLE合并EBV感染患者中的关键基因和免疫细胞 | 系统性红斑狼疮合并EB病毒感染患者 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来源于GEO数据库的多个数据集（GSE50772、GSE81622、GSE85599、GSE45918） | NA | NA | NA | NA |
| 1805 | 2026-05-16 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies APOC1 as a biomarker and therapeutic target for G0/G1 cell cycle arrest in cholangiocarcinoma
2025-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111028
PMID:40064358
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research paper | 通过整合单细胞和批量RNA测序，确定了APOC1作为胆管癌G0/G1细胞周期阻滞的生物标志物和治疗靶点 | 首次识别APOC1为胆管癌G0/G1期阻滞的特征基因，并利用单细胞RNA测序验证其表达峰与细胞周期的关联 | NA | 探索胆管癌中诱导G0/G1期阻滞的分子机制以及鉴定G0/G1期特征生物标志物 | 胆管癌细胞 | machine learning | 胆管癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1806 | 2026-05-16 |
Morphogenic, molecular and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-04-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 通过多尺度3D成像和单细胞转录组学，揭示了鸡肺单向气流适应性的形态发生、分子和细胞特征 | 首次阐明了鸡肺中支气管末梢融合形成副支气管的过程，并发现了一种鸡特有的KRT14阳性肺泡腔细胞类型 | 研究主要基于鸡肺，对于其他鸟类或物种的泛化性有限，且功能验证尚未深入 | 探索禽类肺单向气流的发育机制及其与哺乳动物双向呼吸肺的差异 | 鸡肺的关键发育阶段样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 3D图像，单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 多关键发育阶段的鸡肺样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，Stereo-seq空间转录组学 |
| 1807 | 2026-05-16 |
Restorative Effects of Short-Chain Fatty Acids on Corneal Homeostasis Disrupted by Antibiotic-Induced Gut Dysbiosis
2025-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.010
PMID:39732390
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research paper | 本研究探讨了抗生素诱导的肠道菌群失调对小鼠角膜稳态的影响，并发现短链脂肪酸可恢复角膜功能 | 首次系统揭示了肠道菌群通过短链脂肪酸信号调控角膜昼夜节律基因表达、屏障完整性和神经密度的分子机制 | 未在人体样本中验证，且短链脂肪酸对无菌小鼠的治疗效果未涉及 | 研究肠道菌群失调对角膜稳态的影响及短链脂肪酸的恢复作用 | 小鼠角膜组织及肠道菌群 | digital pathology | geriatric disease | RNA-seq, single-cell sequencing | NA | gene expression data | 未明确说明样本量 | Illumina | RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | RNA测序和单细胞测序 |
| 1808 | 2026-05-16 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Mar, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
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研究论文 | 通过先进的单细胞转录组学分析技术，本研究揭示了囊性纤维化气道上皮中的新型基因和调控网络，为开发靶向治疗策略提供了新靶点 | 本研究采用改进的分析方法，整合多源数据并利用全面的肺部参考面板进行标准化和映射，发现了此前未与囊性纤维化气道疾病关联的新型基因和调控网络 | NA | 通过增强的单细胞转录组学分析阐明囊性纤维化相关的分子机制，并识别新的治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照的肺组织样本 | 机器学习 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1809 | 2026-05-16 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Unraveled Spatial Evolution of Papillary Thyroid Cancer
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404491
PMID:39540244
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示甲状腺乳头状癌的空间演化机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学解析甲状腺乳头状癌的空间异质性和演化路径，发现肿瘤细胞通过增强有氧代谢、抑制mRNA翻译及蛋白质合成、以及细胞间相互作用驱动多路径演化，并识别出恶性与转移基因足迹 | 单细胞RNA测序丢失空间信息，空间转录组学分辨率有限，可能遗漏稀有细胞亚型；需要更大样本验证足迹的诊断价值 | 阐释甲状腺乳头状癌的空间异质性、恶性进展和转移机制，提出改进的诊断策略 | 甲状腺乳头状癌肿瘤细胞及其正常甲状腺细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1810 | 2026-05-15 |
scRNA-seq of Penaeus japonicus hemocytes under environmentally-induced restriction of sand-diving behavior
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111125
PMID:41038398
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析日本对虾血细胞在环境诱导的沙潜行为限制下的分子响应 | 首次利用单细胞转录组技术研究日本对虾血细胞在底质缺失条件下的分子变化，识别出与沙潜行为调控相关的关键候选基因 | 关键候选基因（如trpa1、trpm和cut蛋白家族）的具体功能有待进一步验证 | 探究日本对虾在沙潜行为受限时的分子响应机制 | 日本对虾（Penaeus japonicus）血细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qRT-PCR、RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 日本对虾血细胞样品，涉及三种培养系统（沙组、无沙组、无沙应激组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1811 | 2026-05-15 |
ScASplicer: An interactive shiny/R application for alternative splicing analysis of single-cell sequencing
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111116
PMID:41038402
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研究论文 | 开发了一个名为ScASplicer的交互式Shiny/R应用程序，用于单细胞测序的可变剪接分析 | 通过开发Python包简化输入文件生成并扩展MARVEL至多细胞群体分析，首次提供无需编程的交互式单细胞可变剪接探索平台 | 未说明限制条件 | 为单细胞RNA测序的可变剪接分析提供一个通用且用户友好的网络应用程序 | 单细胞RNA测序数据中的可变剪接事件 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1812 | 2026-05-15 |
SerpinB2 promotes the proliferation of glioma cells by regulating the cell cycle through the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111148
PMID:41176096
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研究论文 | 本文结合转录组测序和单细胞转录组分析，揭示了SerpinB2通过Wnt/β-catenin信号通路调控细胞周期促进胶质瘤细胞增殖的分子机制 | 首次利用转录组与单细胞转录组联合分析阐明SerpinB2在胶质瘤中的促增殖机制，并通过Wnt/β-catenin通路调控细胞周期S期 | 未提及具体局限性，可能包括样本量有限及动物模型与人类肿瘤的差异 | 阐明SerpinB2在胶质瘤细胞增殖中的分子机制 | 胶质瘤细胞及荷瘤小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 胶质瘤 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 转录组序列数据、单细胞转录组数据 | CGGA和TISCH数据库中的胶质瘤样本及荷瘤小鼠 | NA | 单细胞转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1813 | 2026-05-15 |
A bioinformatics pipeline for identifying homoplasmic and heteroplasmic mitochondrial DNA SNVs in single-cell RNA-Seq datasets
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111122
PMID:41061772
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研究论文 | 开发了一个用于在单细胞RNA测序数据中鉴定同质和异质性线粒体DNA单核苷酸变异的生物信息学流程 | 该流程通过质控、比对到线粒体基因组、SNV识别和注释，并使用覆盖率阈值检测异质性，同时过滤测序错误和新颖的删除策略，包括链偏倚、RNA修饰错误和过度代表变异 | 未在本文中明确讨论，但可能依赖于scRNA-seq数据的质量和现有比对方法的准确性 | 提高从公共scRNA-seq数据中可靠检测mDNA SNV的能力，理解其机制和临床表现 | 单细胞RNA测序数据中的线粒体DNA同质和异质性单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1814 | 2026-05-15 |
TSC2/mTORC1 integrates deoxynivalenol signals recognized by membrane receptors IR and EGFR to restrict intestinal stem cell function
2025-08-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138769
PMID:40466374
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术，发现TSC2/mTORC1通路整合膜受体IR和EGFR识别的脱氧雪腐镰刀菌烯醇信号，限制肠道干细胞功能 | 首次阐明脱氧雪腐镰刀菌烯醇通过膜受体IR和EGFR调控TSC2/mTORC1活性，进而影响肠道干细胞功能的分子机制 | 尚未提及具体的局限性 | 探究膜受体如何整合细胞外脱氧雪腐镰刀菌烯醇信号以损害肠道干细胞的定向命运决定 | 猪肠道干细胞、猪肠道类器官、IPEC-J2细胞系 | 机器学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序、等温滴定量热法 | NA | 基因表达数据 | 使用猪肠道类器官和IPEC-J2细胞系的体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1815 | 2026-05-15 |
Tryptamine Metabolism and Functionalization in Gut Commensal Bacteria Expand Human Tryptamine Signaling Responses
2025-07-18, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.5c00313
PMID:40577169
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研究论文 | 本研究通过筛选人类粪便来源细菌培养物上清液，发现并鉴定了由肠道共生菌产生的新型色胺衍生物，这些分子能激活人类褪黑素受体及多种GPCR，并具有抗炎活性 | 首次发现肠道共生菌中色胺代谢产生的两种新型小分子（含尿素核心对称双色胺结构及单色胺功能化修饰），并阐明其作为褪黑素受体1A/1B、P2RY11、GPR55受体激动剂及可溶性环氧化物水解酶抑制剂的多重生物活性 | 未具体说明研究局限性，但可能包括在体实验仅采用小鼠模型、未验证人类肠道微环境中的实际浓度效应、单细胞RNA测序分析仅评估单一化合物处理效果等 | 探索人类肠道微生物代谢产生的功能小分子对GPCR信号通路的影响，扩展人类与微生物界面色胺信号传导的认知 | 人类粪便来源细菌培养物上清液、肠道共生菌R. intestinalis、小鼠肠道组织中的上皮内淋巴细胞 | 机器学习和统计方法 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1816 | 2026-05-15 |
Deciphering the molecular mechanism of YY1/HIF1A modulating ovarian cancer angiogenesis based on single-cell transcriptomics technology
2025 Jul-Dec, Mutation research
DOI:10.1016/j.mrfmmm.2025.111916
PMID:41072350
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研究论文 | 基于单细胞转录组学技术解析YY1/HIF1A调控卵巢癌血管生成的分子机制 | 首次通过单细胞转录组学分析结合细胞实验，揭示了YY1通过竞争性结合FBXW7稳定HIF1A表达，进而促进卵巢癌血管生成的具体机制 | 未提及 | 探讨YY1在卵巢癌血管生成中的作用及其分子机制 | 卵巢癌细胞及单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学, 共培养技术, 免疫共沉淀, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测, qRT-PCR, Western blotting | NA | 转录组数据 | GEO数据库中的卵巢癌肿瘤样本及邻近样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1817 | 2026-05-15 |
Chikungunya virus persists in joint-associated macrophages and promotes chronic disease
2025-Jun-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6917990/v1
PMID:40678223
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和流式细胞术探究基孔肯雅病毒在小鼠关节相关组织中的持续存在及其对慢性疾病的促进作用 | 首次揭示了基孔肯雅病毒RNA在关节相关巨噬细胞中持续复制并驱动慢性关节炎症的机制，通过CD4 T细胞与巨噬细胞的相互作用阐明了慢性疾病的免疫病理学基础 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化仍需进一步验证；未详细说明病毒RNA复制的具体分子机制 | 阐明甲病毒（如基孔肯雅病毒）引起慢性肌肉骨骼疼痛和炎症的持久化机制 | 感染基孔肯雅病毒或其他甲病毒的小鼠关节相关组织 | 数字病理学 | 基孔肯雅病毒病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | 小鼠关节相关组织样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞转录组平台和10x Visium空间转录组平台 |
| 1818 | 2026-05-15 |
QCatch: A framework for quality control assessment and analysis of single-cell sequencing data
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.15.659779
PMID:40667252
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研究论文 | 介绍QCatch，一个用于单细胞测序数据质量控制评估和生成的Python命令行工具 | 专门针对alevin-fry和simpleaf输出设计，生成交互式HTML质量控制报告，并以内附带注释的H5AD格式导出结果 | 未提及具体局限性 | 为单细胞测序数据提供标准化质量控制报告功能 | 单细胞测序数据 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1819 | 2026-05-15 |
Direct microglia replacement reveals pathologic and therapeutic contributions of brain macrophages to a monogenic neurological disease
2025-May-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.019
PMID:40311614
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研究论文 | 通过直接替换小胶质细胞，揭示脑巨噬细胞在单基因神经系统疾病中的病理和治疗作用 | 首次通过单细胞测序揭示Krabbe病中干扰素反应特征和小胶质细胞失调，并利用直接CNS单核细胞注射实现高效小胶质细胞替换，证明该疗法可显著改善疾病 | 主要在动物模型中进行，临床转化需进一步验证安全性和有效性 | 阐明巨噬细胞在Krabbe病病理和治疗中的具体角色，探索直接小胶质细胞替换的潜在治疗价值 | Krabbe病（球细胞脑白质营养不良）模型小鼠（twitcher小鼠）及人类脑标本 | 机器学习 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 动物模型（twitcher小鼠）及人类脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1820 | 2026-05-15 |
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction on mammalian brain aging
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.04.652093
PMID:40654944
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研究论文 | 通过时空剖析揭示卡路里限制对哺乳动物大脑衰老的影响 | 利用高可扩展单核基因组学和空间转录组学平台，首次在区域和细胞类型特异性分辨率下解析卡路里限制抗衰老的分子和细胞机制 | 未明确提及，但可能包括仅在小鼠模型中验证，且卡路里限制对人类大脑衰老的转化应用需进一步研究 | 阐明卡路里限制对衰老大脑的分子和细胞保护机制，特别是区域特异性效应 | 小鼠大脑（来自36只小鼠，3个年龄组，超过50万个细胞），以及来自卡路里限制和对照条件下老年小鼠的12个脑切片进行空间转录组分析 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单核基因组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 36只小鼠大脑、12个脑切片、超过50万个细胞 | 10x Genomics | 单核RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单核3'测序、10x Visium空间转录组学 |