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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1801 | 2025-11-24 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal lactylation-associated tumor cell clusters and define a prognostic risk model in glioblastoma
2025-Nov-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15291-6
PMID:41275140
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了胶质母细胞瘤中乳酸化相关的肿瘤细胞簇,并构建了预后风险模型 | 首次系统描绘了GBM中乳酸化的空间和单细胞景观,发现高乳酸化恶性亚群在缺氧肿瘤核心富集,并构建了基于乳酸化基因的预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能机制研究 | 探究胶质母细胞瘤中乳酸化的空间分布特征及其预后意义 | 胶质母细胞瘤组织和细胞系 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,Western blotting,免疫组织化学 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 基于GEO和TCGA数据库的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1802 | 2025-11-24 |
ASAH1-mediated sphingolipid metabolic reprogramming in venetoclax resistance of AML: beyond the monocytic phenotypes
2025-Nov-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15272-9
PMID:41275169
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了ASAH1介导的鞘脂代谢重编程在急性髓系白血病 Venetoclax耐药机制中的关键作用 | 首次发现单核细胞AML中鞘脂代谢异常与Venetoclax耐药相关,并证明ASAH1基因敲除可增强药物敏感性而不影响单核细胞表型标记 | 研究主要基于体外细胞系和动物模型,需要进一步临床验证 | 探索急性髓系白血病对Venetoclax耐药的分子机制 | 急性髓系白血病患者骨髓样本、患者来源异种移植模型和诱导耐药细胞系 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,脂质组学测序,基因敲除 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,脂质组学数据 | AML患者骨髓样本、PDX模型和耐药细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,脂质组学测序 | NA | NA |
| 1803 | 2025-11-24 |
PTPN9 dephosphorylates IGF1RY1165/1166 and alleviates IGF1R-mediated resistance to tyrosine kinase inhibitor in cholangiocarcinoma
2025-Nov-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03594-2
PMID:41275311
|
研究论文 | 本研究揭示PTPN9通过去磷酸化IGF1R Y1165/1166位点缓解胆管癌对酪氨酸激酶抑制剂的耐药性 | 首次发现PTPN9是IGF1R的新型底物,并阐明其在调节mTKI敏感性和肿瘤进展中的关键作用 | NA | 探究PTPN9在胆管癌中对酪氨酸激酶抑制剂耐药性的调节机制 | 胆管癌患者、原位小鼠模型、胆管癌细胞系 | 癌症生物学 | 胆管癌 | 免疫沉淀-质谱联用、单细胞RNA测序、ELISA、免疫组织化学、晶体结构分析 | NA | 蛋白质组学数据、转录组数据、临床组织数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1804 | 2025-11-24 |
Micro-Organ Chip Deciphers Tumor-Derived G-CSF as Remote Commander of Lung Pre-Metastatic Niche via VEGFA-KDR Cascade
2025-Nov-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518584
PMID:41275332
|
研究论文 | 本研究利用微器官芯片技术揭示了乳腺癌来源的G-CSF通过VEGFA-KDR信号轴远程调控肺转移前微环境形成的机制 | 首次使用微器官芯片实现肿瘤与肺组织非接触共培养,发现PMN形成不依赖肿瘤细胞直接接触且具有非肿瘤类型特异性,鉴定G-CSF-KDR轴为新型调控通路 | 研究基于体外芯片模型,需进一步体内验证;机制研究主要聚焦于G-CSF-VEGFA-KDR轴,可能存在其他调控因子 | 探究乳腺癌肺转移前微环境的形成机制 | 肿瘤组织与肺组织的相互作用 | 器官芯片技术 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 细胞因子阵列分析 | 微器官芯片 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1805 | 2025-11-24 |
AI-driven discovery of dual antiaging and anti-AD therapeutics via PROTAC target deconvolution of a super-enhancer-regulated axis
2025-Nov-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz9283
PMID:41259504
|
研究论文 | 通过人工智能驱动的PROTAC靶点解析方法发现褪黑素作为兼具抗衰老和抗阿尔茨海默病双重作用的候选治疗药物 | 结合人工智能筛选、PROTAC靶点解析和超级增强子机制研究,建立了从AI发现到临床应用的创新药物研发范式 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的临床验证 | 开发同时针对生物衰老和阿尔茨海默病的双重作用治疗药物 | 褪黑素及其作用机制 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,PROTAC化学蛋白质组学 | AI驱动筛选模型 | 血清蛋白质组数据,转录组数据,表观遗传数据 | 161名人类个体 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1806 | 2025-11-24 |
Unveiling the role of gastric cancer-associated mesenchymal stem cells and neutrophil extracellular traps through multi-omics analysis
2025-Nov-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04768-7
PMID:41261408
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示胃癌相关间充质干细胞和中性粒细胞胞外诱捕网在肿瘤微环境中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和功能富集分析系统解析GC-MSCs与NETs在胃癌微环境重塑中的相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探究胃癌微环境中GC-MSCs和NETs的分子机制及治疗靶点 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞组成和分子网络 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 功能富集分析 | NA | 转录组数据 | TCGA和GEO公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1807 | 2025-11-24 |
MRAP mediated adipocyte differentiation by thymic mesenchymal stromal cells contributes to thymic involution
2025-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64973-z
PMID:41266306
|
研究论文 | 本研究揭示了胸腺间充质基质细胞通过MRAP介导的脂肪细胞分化在年龄相关性胸腺退化中的作用机制 | 首次发现MRAP是胸腺间充质基质细胞脂肪生成的关键驱动因子,并阐明胸腺素-α1通过FoxO1信号通路促进MRAP表达的机制 | NA | 探究年龄相关性胸腺退化中脂肪沉积的细胞和分子机制 | 胸腺间充质基质细胞、小鼠和人类胸腺组织 | 细胞生物学 | 年龄相关性胸腺退化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和年老小鼠及人类胸腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1808 | 2025-11-24 |
Macrophage mitophagy-related genes predict prognosis and therapeutic response in lung adenocarcinoma
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24769-z
PMID:41266404
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习算法,开发了基于巨噬细胞线粒体自噬相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次将巨噬细胞线粒体自噬相关基因与肺腺癌预后关联,并鉴定出TUBB6和CAT作为核心预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 识别关键的巨噬细胞线粒体自噬相关基因并建立肺腺癌预后模型 | 肺腺癌患者和巨噬细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | LASSO, SVM, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1809 | 2025-11-24 |
Integrative analysis identifies STX16 as a prognostic and immune-associated biomarker in ccRCC
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24921-9
PMID:41266441
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,系统探讨了STX16在肾透明细胞癌中的表达模式、预后价值和免疫功能 | 首次系统揭示STX16在ccRCC中的预后价值和免疫调节功能,并通过单细胞测序解析其在肿瘤微环境中的异质性表达 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多体内实验和临床样本验证 | 探究STX16在肾透明细胞癌中的表达特征、临床意义和生物学功能 | 肾透明细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 生物信息学分析,Western blot,免疫组化,siRNA敲低,单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据,临床数据,蛋白质数据 | TCGA等公共数据库中的ccRCC样本,实验室细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1810 | 2025-11-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals age-related heterogeneity in the tumor microenvironment of breast cancer patients
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24720-2
PMID:41266463
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示乳腺癌肿瘤微环境中与年龄相关的异质性 | 首次在单细胞水平系统比较年轻与老年乳腺癌患者肿瘤微环境的差异,发现干扰素刺激基因在年轻患者肿瘤发生中的关键作用 | 样本量有限(仅10例患者) | 研究年龄对乳腺癌肿瘤微环境组成和功能的影响 | 乳腺癌患者的肿瘤组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化染色,伪时间轨迹分析 | inferCNV | 单细胞转录组数据,临床生存数据,蛋白质表达数据 | 10例乳腺癌患者(5例≤40岁,5例≥70岁),包含33,664个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1811 | 2025-11-24 |
Integrative analysis reveals prognostic value of cuproptosis and copper hemostasis related genes in immunotherapy for non-small cell lung cancer
2025-Nov-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01138-7
PMID:41266534
|
研究论文 | 本研究通过整合分析五个NSCLC免疫治疗队列的RNA测序数据,开发了基于铜死亡和铜稳态相关基因的预后模型 | 首次发现铜依赖性增殖亚型与不良预后和免疫抑制肿瘤微环境相关,并构建了结合101种算法模型的机器学习流程进行风险分层 | 研究基于回顾性队列数据,需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探索铜死亡和铜稳态相关基因在非小细胞肺癌免疫治疗中的预后价值 | 非小细胞肺癌患者和临床标本 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序, 单细胞测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学 | 机器学习集成模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 五个NSCLC免疫治疗队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1812 | 2025-11-24 |
Characterization of the bone marrow architecture of multiple myeloma using spatial transcriptomics
2025-Nov-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08975-z
PMID:41266582
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术表征多发性骨髓瘤骨髓结构的空间特征 | 开发了整合空间和单细胞转录组数据的定制分析框架,首次实现了矿化长骨组织中细胞组成和相互作用的原位映射 | Visium技术在表征空间调控机制方面存在能力限制 | 研究多发性骨髓瘤骨髓结构的空间特征及其在疾病进展中的作用 | 健康和多发性骨髓瘤小鼠模型的骨髓样本,以及多发性骨髓瘤患者样本 | 空间转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | 定制分析框架 | 空间基因表达数据,单细胞转录组数据 | 健康和多发性骨髓瘤小鼠模型,多发性骨髓瘤患者活检样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Gene Expression | Visium Spatial Gene Expression平台用于福尔马林固定石蜡包埋骨髓切片 |
| 1813 | 2025-11-24 |
TPM2 regulates contractility and biomechanical properties in trabecular meshwork cells
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24993-7
PMID:41266745
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研究论文 | 本研究探讨TPM2在小梁网细胞中对收缩相关分子表达和生物力学特性的调控作用 | 首次揭示TPM2通过调节小梁网细胞收缩性、改变细胞骨架结构和诱导生物力学特性变化来调控房水流出 | 分子调控机制尚未完全阐明 | 研究TPM2对小梁网细胞收缩性和生物力学特性的影响 | 人小梁网细胞(HTMCs) | 细胞生物学 | 原发性开角型青光眼(POAG) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1814 | 2025-11-24 |
Benchmarking deep learning methods for biologically conserved single-cell integration
2025-Nov-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03869-z
PMID:41267095
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研究论文 | 评估深度学习单细胞数据整合方法并改进基准测试框架 | 提出基于相关性的损失函数和增强的基准测试指标scIB-E,更好地保留生物信号 | 现有单细胞整合基准指数在保留细胞类型内信息方面存在局限 | 系统评估单细胞数据整合方法并改进基准测试策略 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | 数百万细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1815 | 2025-11-24 |
Machine learning-powered discovery of a novel berberine derivative inducing SCD-dependent ferroptosis in osteosarcoma
2025-Nov-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07358-6
PMID:41267108
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研究论文 | 本研究通过机器学习引导发现了一种新型小檗碱衍生物B1,可诱导骨肉瘤发生SCD依赖性铁死亡 | 首次将机器学习整合到蛋白质组学发现流程中,鉴定出SCD为关键靶点,并发现B1作为分子胶诱导SCD泛素化降解的新机制 | 研究主要基于体外细胞系和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发针对耐药骨肉瘤的新型治疗策略 | 骨肉瘤细胞系(143B、U2OS、HOS)和BALB/c裸鼠模型 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 蛋白质组测序、单细胞RNA测序、分子对接、热位移分析、表面等离子共振、免疫共沉淀、泛素化分析、脂质组学 | LASSO、Ridge、Elastic Net、mRMR | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、分子相互作用数据 | 多种骨肉瘤细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组测序 | NA | NA |
| 1816 | 2025-11-24 |
Genome doubling as a dynamic driver of ovarian cancer evolution: insights from single-cell sequencing
2025-Nov-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01860-7
PMID:41257949
|
综述 | 本文通过单细胞测序技术探讨全基因组加倍作为卵巢癌进化动态驱动因子的作用机制 | 重新定义全基因组加倍在肿瘤进化中的核心驱动作用,揭示其通过抑制先天免疫通路导致免疫抑制表型的新机制 | NA | 探讨全基因组加倍在高级别浆液性卵巢癌进化过程中的动态驱动作用及临床意义 | 高级别浆液性卵巢癌 | 基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1817 | 2025-11-24 |
Precise combination therapy of radiotherapy and immunotherapy guided by joint PD-L1 imaging and T-cell imaging
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012300
PMID:41260899
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研究论文 | 本研究开发了一种通过联合PD-L1成像和T细胞成像指导放疗与免疫治疗精准联合治疗的新策略 | 首次提出联合使用PD-L1表达动态成像和肿瘤浸润T细胞成像来指导和预测放疗与免疫检查点抑制剂联合治疗的时机与疗效 | 研究仅在动物模型中进行验证,尚未在临床患者中证实其有效性 | 提高放疗与PD-1/PD-L1阻断疗法联合治疗的有效性和安全性 | 免疫热肿瘤和冷肿瘤模型 | 分子影像学 | 癌症 | SPECT/CT成像,单细胞RNA测序 | NA | 影像数据,基因表达数据 | 动物肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序,分子影像 | NA | 使用PD-L1靶向探针(99mTc-MY1523)和T细胞靶向探针(99mTc-sum IL-2)进行SPECT/CT成像 |
| 1818 | 2025-11-24 |
Oligoclonal tumor-specific CD8 T-cell revival and IRE1α/XBP1-GDF15-mediated immunosuppressive niches determine neoadjuvant chemoimmunotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012630
PMID:41260902
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学技术,揭示了宫颈癌新辅助化疗免疫治疗疗效差异的免疫学机制 | 发现内质网应激信号IRE1α/XBP1轴通过诱导GDF15产生促进免疫抑制微环境形成,并鉴定出寡克隆肿瘤特异性CD8 T细胞复活与治疗反应的关系 | 样本量相对有限(单细胞测序n=10,验证队列n=23),需要更大规模研究验证 | 探究局部晚期宫颈癌新辅助化疗免疫治疗疗效差异的分子机制 | 局部晚期宫颈癌患者样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,空间转录组学,多重免疫组化 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化数据 | 单细胞测序10例患者(5对治疗前后配对样本),验证队列23例患者,6例手术标本mIHC分析 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1819 | 2025-11-24 |
From sample to clinical insight: a review of exome sequencing in disease diagnostics
2025-Nov-19, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.11.007
PMID:41271122
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综述 | 本文全面回顾了外显子组测序在疾病诊断中的方法学、数据分析流程、临床应用及伦理考量 | 系统评估了新兴长读长测序系统与多组学整合框架,强调了机器学习在变异优先排序中的未来方向 | 作为综述文章未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳分析 | 探讨外显子组测序在疾病诊断和精准医疗中的临床应用与发展前景 | 外显子组测序技术及其在人类疾病诊断中的应用 | 基因组学 | 多种疾病 | 外显子组测序 | 机器学习 | 基因组数据 | NA | NA | 外显子组测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 1820 | 2025-11-24 |
Toward a ToxAtlas of Carbon-Based Nanomaterials: Single-Cell RNA Sequencing Reveals Initiating Cell Circuits in Pulmonary Inflammation
2025-Nov-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12054
PMID:41183169
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示碳基纳米材料引发肺部炎症的起始细胞回路 | 首次在单细胞分辨率下系统比较不同碳基纳米材料引发的特异性分子起始事件,并开发了ToxAtlas网络工具 | 仅关注急性炎症反应(12小时),未研究长期慢性炎症发展过程 | 理解纳米材料特性如何驱动急性肺部炎症反应 | 小鼠肺部细胞 | 单细胞组学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肺部细胞(鉴定出41种细胞状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |