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当前共找到 10621 篇文献，本页显示第 1801 - 1820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1801 | 2025-12-20 |
The tree labeling polytope: a unified approach to ancestral reconstruction problems
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.14.638328
PMID:40027631
|
研究论文 | 本文提出了一种基于树标记多面体的统一方法，用于解决系统发育树中的祖先状态重建问题，并展示了其在多种现代应用中的有效性 | 引入了树标记多面体这一几何框架，将祖先重建问题转化为线性规划问题，并支持额外全局约束的整合，相比传统动态规划方法更具灵活性和扩展性 | NA | 开发一种统一的多面体方法，以高效解决系统发育树中的祖先状态重建问题，特别是在存在额外全局约束的情况下 | 系统发育树及其祖先状态标记 | 计算生物学 | 肺癌 | 线性规划、混合整数规划 | NA | 系统发育树数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1802 | 2025-12-20 |
Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol
2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100672
PMID:40319860
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研究论文 | 本研究通过构建miRNA和mRNA共表达网络，识别了受雌二醇调控的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 首次结合TCGA数据库和雌二醇处理的细胞测序数据，构建miRNA-mRNA调控网络，并利用单细胞转录组数据验证基因表达变化 | 样本量相对有限，特别是雌二醇处理组仅3个重复，且依赖公共数据库数据，未进行实验验证 | 识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 子宫内膜样子宫内膜癌患者样本和雌二醇处理的子宫内膜癌Ishikawa细胞 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | RNA测序、单细胞转录组测序 | 共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络 | RNA表达谱、单细胞转录组数据 | TCGA数据库408例患者样本，雌二醇处理细胞实验9个样本（3个对照组，3个低剂量组，3个高剂量组） | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 1803 | 2025-12-20 |
Potential function exploration of lncRNAs in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from whole transcriptome sequencing data analysis
2025 Jan-Dec, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100732
PMID:40782499
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研究论文 | 本研究通过全转录组测序数据分析，探索长链非编码RNA在特发性肺纤维化中的潜在功能 | 结合RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，识别与IPF相关的差异表达lncRNAs及其共表达网络，并发现特定lncRNAs在炎症反应通路中的富集 | 样本量较小（12名IPF患者和5名对照），且为诊断性研究，需进一步验证 | 探索lncRNAs在特发性肺纤维化中的功能和作用机制 | 特发性肺纤维化患者和对照的RNA测序数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | WGCNA | RNA测序数据 | 12名IPF患者和5名对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1804 | 2025-12-18 |
Molecular mechanisms related to neutrophils in sepsis using single-cell sequencing combined with Mendelian randomization analysis
2025, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/213752
PMID:41403633
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1805 | 2025-12-20 |
Decoding cardiac metabolic reprogramming through single-cell multi-omics: from mechanisms to therapeutic applications
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1710474
PMID:41403700
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示心脏代谢重编程在心血管疾病中的机制，并探讨了其治疗应用前景 | 系统整合了单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等前沿技术，首次在单细胞分辨率下系统解析心脏细胞的代谢异质性、动态变化和细胞间通讯，并连接基础机制与代谢靶向干预策略 | 将研究发现转化为临床实践仍面临挑战，包括技术标准化、数据整合及临床验证等方面的障碍 | 阐明心脏代谢重编程在心血管疾病中的病理机制，并探索基于代谢干预的治疗策略 | 心脏细胞（在生理和病理条件下） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，单细胞表观基因组学，空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1806 | 2025-12-20 |
Integrative multi-omics analysis identifies a PTM-related immune signature and IRF9 as a driver in ccRCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707375
PMID:41403935
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，在透明细胞肾细胞癌中鉴定了一个与翻译后修饰相关的免疫特征，并发现IRF9作为驱动因子 | 首次构建了一个基于翻译后修饰的五基因预后特征，并实验验证了IRF9在ccRCC中的功能驱动作用 | 研究主要基于回顾性队列和生物信息学分析，需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发ccRCC的预后生物标志物并探索其免疫治疗反应预测价值 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析，单细胞RNA-seq，免疫组化，qPCR，功能实验 | 随机生存森林模型 | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据，临床数据 | TCGA-KIRC队列，E-MTAB-1980队列，IMvigor210免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1807 | 2025-12-20 |
Pan-cancer multi-omics analysis of CCT4 in tumor progression and cancer immunity, with focus on lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714837
PMID:41403933
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了CCT4在泛癌及肺腺癌中的表达模式、临床意义及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 首次在泛癌层面整合多组学数据揭示CCT4与免疫浸润的关联，并通过单细胞RNA测序发现CCT亚基在肿瘤上皮细胞中的协同过表达及CCT4在增殖亚群中的特异性富集 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限，且CCT4的具体分子机制仍需进一步探索 | 阐明CCT4在肿瘤进展和癌症免疫中的作用，特别是在肺腺癌中的功能 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，包括肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观遗传学、免疫基因组学、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1808 | 2025-12-20 |
Immune dysregulation in preeclampsia: integrative analysis of peripheral transcriptomes and placental single-cell land-scapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638603
PMID:41403942
|
研究论文 | 本研究通过整合先兆子痫高风险孕妇外周血转录组和胎盘单细胞RNA测序数据，揭示了免疫失调的分子机制并识别了潜在生物标志物 | 首次将外周血转录组与胎盘单细胞图谱整合分析，识别出在两种数据集中均稳定表达的五个候选基因，并揭示了它们在特定免疫细胞中的表达模式 | 未明确说明样本的具体数量，且候选基因名称在摘要中被省略，限制了结果的直接验证 | 探索先兆子痫中免疫失调的分子机制，并识别早期检测和机制研究的生物标志物 | 先兆子痫高风险孕妇的外周血和胎盘组织 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组分析 | 机器学习特征选择 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1809 | 2025-12-20 |
Upscaling: efficient generation of human lung organoids from induced pluripotent stem cells using a stirring bioreactor
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1684315
PMID:41404197
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用搅拌生物反应器高效生成人肺类器官的方法，并与手动培养方式进行了比较 | 采用配备独特膜搅拌器的搅拌罐生物反应器进行规模化、自动化培养，实现了动物成分自由的生产过程 | NA | 开发高效生成人诱导多能干细胞来源肺类器官的方法，用于疾病模拟和药物反应研究 | 人诱导多能干细胞来源的肺类器官 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1810 | 2025-12-20 |
Deciphering B Cell Heterogeneity and Pathogenic Mechanisms in Osteoporosis Through Single-Cell RNA Sequencing
2025, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9979105
PMID:41404455
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了骨质疏松症中B细胞亚群的异质性及其在疾病进展中的作用，并识别出两个关键的信号通路 | 首次在骨质疏松症中利用单细胞RNA测序技术系统性地解析B细胞亚群的异质性，并识别出MIF-(CD74+CXCR4)和LGALS9-CD45这两个新的信号通路作为疾病进展的潜在关键调节因子 | 样本量较小（仅包括3名骨质疏松症患者和1名非骨质疏松症患者），且数据来源于公共数据库，可能限制了结果的普遍性和统计效力 | 探究B细胞亚群在骨质疏松症中的作用及其对骨代谢的影响 | 人类股骨头组织细胞，包括骨质疏松症患者和非骨质疏松症患者的样本 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名患者（3名骨质疏松症患者和1名非骨质疏松症患者）的股骨头组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1811 | 2025-12-19 |
PLAGL2 promotes HCC progression by recruiting tumour-associated macrophages via CCL2/CCR2 signalling
2025-Dec-17, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70295
PMID:41407384
|
研究论文 | 本研究揭示了PLAGL2通过调控CCL2/CCR2信号通路招募肿瘤相关巨噬细胞并促进其M2极化，从而驱动肝细胞癌进展的分子机制 | 首次发现PLAGL2是CCL2的新型转录因子，并通过CCL2-CCR2轴调控肿瘤相关巨噬细胞的趋化和极化，为肝细胞癌治疗提供了新的潜在药物靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在临床样本中充分验证；CCR2抑制剂的治疗效果需进一步临床评估 | 阐明PLAGL2调控肿瘤相关巨噬细胞促进肝细胞癌进展的分子机制 | 肝细胞癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、流式细胞术、小鼠原位肝癌模型、皮下肿瘤模型、体外共培养 | 小鼠肿瘤模型、体外细胞模型 | 单细胞测序数据、流式细胞数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和体外实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1812 | 2025-12-19 |
PCK1 deficiency promotes MASH-HCC progression by 12-HETE-induced CD8+ T cell dysfunction
2025-Dec-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334562
PMID:41407525
|
研究论文 | 本研究揭示了肝细胞内在酶PCK1在MASH-HCC中通过12-HETE-p38信号通路介导CD8+ T细胞功能障碍的关键作用 | 首次发现PCK1缺乏通过诱导12-HETE积累导致CD8+ T细胞功能障碍，从而促进MASH-HCC进展，并证明PCK1可作为代谢检查点增强抗PD-1免疫疗法疗效 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限；机制研究集中在12-HETE-p38通路，可能存在其他未探索的调控途径 | 探究PCK1在MASH-HCC中的作用及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肝细胞特异性Pten和Pck1双等位基因敲除小鼠、MASH-HCC患者肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、非靶向代谢组学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、代谢组数据 | 未明确样本数量，包括小鼠模型和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1813 | 2025-12-19 |
Target Fibroblast-B cell crosstalk via MIF signaling drives pathogenic B cell differentiation and joint damage in knee osteoarthritis
2025-Dec-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02154-w
PMID:41407905
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了膝骨关节炎中成纤维细胞与B细胞通过MIF信号传导的相互作用，驱动致病性B细胞分化并导致关节损伤 | 首次在膝骨关节炎中系统描绘了B细胞的异质性，并发现了成纤维细胞通过MIF-(CD74+CXCR4/CD44)信号通路调控致病性DERL3+B细胞分化的新机制 | 研究样本量相对有限（9名健康对照和21名KOA患者），且小鼠模型可能无法完全模拟人类KOA的复杂病理过程 | 阐明膝骨关节炎中B细胞的异质性、活化机制及其对软骨损伤的贡献，并探索潜在的治疗靶点 | 人类膝骨关节炎患者的关节组织（包括软骨下骨和滑膜）以及ACLT+DMM诱导的小鼠KOA模型 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，Western blotting，体外共培养系统，伪时间轨迹分析，配体-受体相互作用图谱 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，组织学图像数据 | 30例人类样本（9名健康对照，21名KOA患者）及小鼠KOA模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1814 | 2025-12-19 |
Integrative bioinformatics-machine learning-experimental validation identifies shared immunomodulatory targets in psoriasis and psoriatic arthritis and deciphers allicin's therapeutic mechanism
2025-Dec-17, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04777-6
PMID:41408482
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学、机器学习与实验验证，识别了银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，并揭示了蒜素（allicin）的治疗机制 | 结合WGCNA、PPI网络与机器学习算法识别关键免疫相关基因，并通过反向药物筛选、分子对接及实验验证，首次系统阐明蒜素通过抑制NF-κB通路调控CXCL10、ISG15和IFI27的机制 | 研究主要基于公共转录组数据，实验验证部分可能受样本量限制；分子机制虽经初步验证，但体内药效与长期安全性仍需进一步研究 | 识别银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，预测潜在治疗药物并验证其作用机制 | 银屑病和银屑病关节炎患者的转录组数据、免疫相关基因、候选药物（蒜素） | 生物信息学 | 银屑病 | 转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR、分子对接与动力学模拟 | 随机森林、LASSO | 基因表达数据 | 基于GEO数据库的公共转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1815 | 2025-12-19 |
Senescent CD4+ T Cells Drive Diabetic Periodontitis via JAK-STAT-ROS-p38 MAPK
2025-Dec-17, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251400253
PMID:41408493
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病性牙周炎中衰老CD4+ T细胞通过JAK-STAT-ROS-p38 MAPK信号通路驱动疾病进展的免疫病理机制 | 首次在糖尿病性牙周炎中鉴定出CD4+ T细胞衰老的关键作用，并阐明JAK-STAT-mtROS与TNF-α-p38 MAPK炎症信号级联之间的交互作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人体组织验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究糖尿病性牙周炎的免疫病理机制，特别是CD4+ T细胞衰老在疾病进展中的作用 | 糖尿病性牙周炎小鼠模型的牙龈组织CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病并发症（牙周炎） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的糖尿病性牙周炎小鼠牙龈组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1816 | 2025-12-19 |
Injury-Activated ERMs Undergo EMT and May Contribute to Periodontal Repair
2025-Dec-17, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251397858
PMID:41408679
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研究论文 | 本研究探讨了损伤激活的上皮马氏残余（ERMs）在牙周修复中的作用，通过分析其在发育和损伤响应中的行为变化 | 揭示了损伤激活的ERMs经历上皮-间质转化（EMT），并可能通过表达Wnt通路成分和基质重塑参与牙周修复 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本，可能未完全涵盖所有牙周损伤类型或临床变异性 | 探究ERMs在牙周损伤修复中的激活机制和功能贡献 | 小鼠和人类牙周组织中的上皮马氏残余（ERMs） | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学（IHC），Wnt谱系示踪 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 涉及小鼠牙周损伤模型和人类组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1817 | 2025-12-19 |
cGAS-STING pathway reprograms macrophage polarization and is highly expressed in responding tumors after neoadjuvant immunotherapy in head and neck carcinoma
2025-Dec-17, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025209
PMID:41408831
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研究论文 | 本研究探讨了cGAS-STING通路在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用，并评估了STING激动剂的治疗潜力 | 首次系统性地结合临床数据分析、体外实验和单细胞RNA测序，揭示了STING激动剂MSA-2能够重编程肿瘤相关巨噬细胞向M1表型极化，并证实该通路在免疫治疗应答患者中高表达 | 研究主要基于体外细胞实验和回顾性临床数据分析，缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床试验数据 | 评估cGAS-STING通路在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的功能作用及STING激动剂的治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者临床样本、TCGA-HNSC数据集、RAW 264.7巨噬细胞系 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组化图像 | TCGA-HNSC数据集、临床样本（数量未明确）、单细胞RNA测序数据来自接受新辅助免疫治疗的HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1818 | 2025-12-19 |
A mouse organoid platform for modeling cerebral cortex development and cis-regulatory evolution in vitro
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.001
PMID:40876454
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研究论文 | 本研究开发了一种从小鼠外胚层干细胞生成大脑皮层类器官的可重复方案，并利用该平台结合单细胞RNA测序技术，研究了不同小鼠亚种间皮层发育的顺式调控进化差异 | 首次建立了可重复的小鼠大脑皮层类器官生成方案，并利用F1杂交干细胞结合单细胞测序技术，系统绘制了发育过程中皮层细胞类型的顺式调控变异图谱 | 研究仅限于小鼠模型，且类器官系统可能无法完全模拟体内发育的复杂性 | 研究大脑皮层发育的基因调控网络及其在哺乳动物进化中的变异机制 | 小鼠大脑皮层类器官，来源于实验室小鼠（C57BL/6J）与四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 来源于5个小鼠品系（C57BL/6J及4个野生近交系）杂交的F1代外胚层干细胞生成的皮层类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1819 | 2025-12-19 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells identifies redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.024
PMID:40865519
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研究论文 | 本研究通过大规模单细胞RNA测序分析玉米和拟南芥的茎尖分生组织，鉴定出保守的干细胞调控因子，并揭示了这些因子与谷物产量性状的关联 | 首次在植物中通过优化的单细胞测序技术捕获大量CLAVATA3和WUSCHEL表达的稀有干细胞，并跨物种比较鉴定出深度保守的调控因子 | 未明确说明样本处理的潜在批次效应或技术重复的统计验证细节 | 鉴定植物茎尖干细胞的关键调控因子及其与作物产量性状的关联 | 玉米和拟南芥的茎尖分生组织干细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 数千个表达CLAVATA3和WUSCHEL的干细胞（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1820 | 2025-12-19 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights specific cell types manipulated by Fusarium head blight fungus leading to wheat susceptibility
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.022
PMID:40845857
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了小麦胚芽鞘对适应性和非适应性镰刀菌感染的细胞类型特异性响应 | 首次应用单细胞RNA测序于小麦-真菌互作研究，揭示了不同细胞类型在非宿主抗性和易感性中的差异化免疫响应 | 研究仅关注了接种后1-3天的早期响应，未涵盖整个疾病进程；样本量虽大但限于特定时间点 | 探究小麦在适应性和非适应性镰刀菌感染下的细胞类型特异性转录组响应机制 | 小麦胚芽鞘细胞 | 植物病理学与单细胞组学 | 小麦赤霉病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 超过90,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |