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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-03-18
ImageDoubler: image-based doublet identification in single-cell sequencing
2025-01-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究提出了一种基于图像的模型ImageDoubler,用于识别单细胞测序中的双联体 首次利用Fluidigm单细胞测序图像数据进行双联体识别,相比传统基于基因组模拟数据的方法,F1分数至少提升33.1% 方法目前主要针对Fluidigm平台图像数据,在其他单细胞测序平台上的适用性有待验证 开发更有效的单细胞测序双联体检测方法 单细胞测序数据中的双联体(两个或多个细胞被一起测序) 数字病理学 NA 单细胞测序 图像识别模型 图像 NA Fluidigm 单细胞测序 NA Fluidigm单细胞测序图像数据
162 2026-03-17
A phenotypic brain organoid atlas and biobank for neurodevelopmental disorders
2025-Dec-04, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究建立了一个包含352个公开可用的神经发育障碍患者来源iPSC的生物库,并通过对35名代表性患者的6000多个脑类器官进行分析,揭示了不同疾病类别的特异性细胞表型 创建了首个大规模、遗传多样性的神经发育障碍iPSC生物库,并系统性地将脑类器官表型与临床疾病类别相关联,构建了基因型与表型之间的桥梁 研究仅基于35名代表性患者的类器官进行分析,样本代表性可能有限;类器官模型仍不能完全模拟人脑发育的复杂性 建立神经发育障碍的生物库和脑类器官图谱,以揭示疾病机制并支持未来的疾病建模和治疗开发 神经发育障碍患者来源的诱导多能干细胞及其衍生的脑类器官 数字病理学 神经发育障碍 单细胞转录组测序,组织学分析 脑类器官模型 单细胞转录组数据,组织学图像,临床数据,脑成像数据,基因组数据 352个患者来源iPSC系(来自公开生物库),35名代表性患者(超过6000个脑类器官),10名神经典型对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
163 2026-03-17
Single cell and spatial transcriptomic profiling of the type 2 diabetic coronary microcirculation and myocardium
2025-12, Basic research in cardiology IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌中与脂肪生成、脂肪酸代谢和氧化磷酸化相关的基因表达上调,为冠状动脉微血管疾病的机制提供了新见解 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,全面分析2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌的转录组差异,识别出新的基因表达特征和关键调控因子 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且未进行功能验证实验以确认这些基因表达变化在疾病进展中的具体作用 探究2型糖尿病中冠状动脉微血管疾病的转录组差异,识别潜在的治疗靶点 2型糖尿病小鼠的冠状动脉微循环和心肌组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA序列数据, 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及2型糖尿病小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
164 2026-03-17
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal ITGA5-driven epithelial-mesenchymal transition and metabolic adaptation in thyroid cancer
2025-10-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本文通过单细胞和批量转录组分析揭示了ITGA5驱动的上皮-间质转化和代谢适应在甲状腺癌中的作用 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统性地研究了ITGA5在甲状腺癌中的功能,并揭示了其通过激活上皮-间质转化和肿瘤微环境重塑促进肿瘤侵袭性的新机制 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且临床样本来源有限,可能无法完全反映肿瘤异质性 探究ITGA5在甲状腺癌进展中的分子机制及其与患者预后的关联 甲状腺癌组织样本、BCPAP和8505C甲状腺癌细胞系 数字病理学 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, GO分析, 通路分析 NA 转录组数据, 单细胞数据 TCGA数据库中的甲状腺癌样本及体外培养的细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
165 2026-03-17
Single-cell mapping of TMZ-resistant glioma reveals CXCL2/3-CXCR2-associated neutrophil communication
2025-10-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了替莫唑胺耐药胶质瘤中CXCL2/3-CXCR2信号轴介导的肿瘤细胞与中性粒细胞通讯机制 首次在单细胞水平上绘制了TMZ耐药胶质瘤的微环境图谱,并发现了一个独特的CXCL2/3-CXCR2趋化轴介导的肿瘤-中性粒细胞通讯回路 研究主要基于转录组数据分析,功能验证实验相对有限,且未在体内模型中充分验证CXCR2抑制的治疗效果 探究胶质母细胞瘤中替莫唑胺耐药的微环境机制 胶质瘤细胞(包括TMZ耐药和对照细胞)及肿瘤微环境中的免疫细胞(特别是中性粒细胞) 单细胞转录组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 基于已发表的大规模单细胞RNA-seq数据集进行分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
166 2026-03-17
Mechanistic insights into iguratimod action in asthma-COPD overlap through multi-omics and in-silico modelling
2025-10-10, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合生物信息学方法,分析哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO)的基因表达数据,结合分子对接和动力学模拟,探讨了艾拉莫德(IGU)在ACO中的作用机制 首次将多组学(批量与单细胞RNA测序)与计算机模拟(分子对接和动力学模拟)相结合,系统研究了艾拉莫德在ACO中的潜在治疗靶点和作用机制 研究主要基于公共数据库的基因表达数据,缺乏实验验证,且分子动力学模拟时间较短(200纳秒),可能无法完全反映长期动态行为 探究艾拉莫德在哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO)中的分子作用机制,识别关键靶点基因 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO)相关的基因表达数据,以及艾拉莫德(IGU)小分子药物 生物信息学 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO) 批量RNA测序,单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 NA 基因表达数据 NA NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
167 2026-03-17
Tryptophan metabolic dysregulation drives immune activation and cartilage degradation in osteoarthritis: Functional validation integrated with transcriptomic and single-cell RNA sequencing
2025-09-30, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究系统探索了色氨酸代谢异常在骨关节炎发病机制中的潜在作用,整合转录组学和单细胞RNA测序数据 首次系统揭示色氨酸代谢失调驱动骨关节炎免疫激活和软骨降解的代谢机制,提出犬尿氨酸通路作为潜在治疗靶点 研究主要基于体外细胞模型和测序数据,缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 阐明色氨酸代谢在骨关节炎发病中的作用机制 骨关节炎软骨组织、IL-1β刺激的软骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
168 2026-03-17
Single-cell transcriptomic analysis of interactions of peritoneal mesenchymal stem cells with macrophages in prevention of peritoneal membrane injury
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析探讨了腹膜间充质干细胞与巨噬细胞的相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜损伤中的作用 首次在腹膜损伤模型中应用单细胞RNA测序技术解析pMSCs通过调控巨噬细胞亚群发挥保护作用的分子机制 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性仍需验证;单细胞测序样本量有限 探究腹膜间充质干细胞(pMSCs)与巨噬细胞相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜膜损伤中的机制 Sprague-Dawley大鼠的腹膜组织、腹膜间充质干细胞、巨噬细胞 单细胞转录组学 腹膜损伤 单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据 大鼠模型(具体数量未明确说明) Illumina 单细胞RNA-seq HiSeq X Ten HiSeq X Ten平台进行单细胞RNA测序,使用Cell Ranger软件和Mouse_ref_Immgen数据集进行分析
169 2026-03-17
Rutaecarpine alleviates liver fibrosis by modulating the TRPV1/Connexin 43 axis: A study based on transcriptome data, single-cell sequencing data, and cell experiments
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究基于转录组数据、单细胞测序数据和细胞实验,探讨了吴茱萸碱通过调节TRPV1/Connexin 43轴缓解肝纤维化的潜在机制 结合转录组、单细胞测序和细胞实验,首次揭示了吴茱萸碱通过调控TRPV1/Cx43轴缓解肝纤维化的新机制 研究主要基于体外细胞模型和公开数据集,缺乏体内动物模型的验证 探索吴茱萸碱缓解肝纤维化的潜在分子机制 肝纤维化相关的分子通路(TRPV1/Cx43轴)及吴茱萸碱的药理作用 生物信息学与分子生物学 肝纤维化 转录组分析、单细胞测序、分子对接、细胞模型实验 逻辑回归模型、ROC曲线分析、分子对接模型 基因表达数据、单细胞测序数据、体外细胞实验数据 基于公开数据集GSE84044,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
170 2026-03-17
Role of Defense/Immunity Proteins in Non-Obstructive Azoospermia: Insights from Gene Expression and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2025-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本研究通过基因表达和单细胞RNA测序分析,探讨了防御/免疫蛋白在非梗阻性无精子症中的作用 首次结合多数据集基因表达分析和单细胞RNA测序技术,系统揭示了免疫相关基因在非梗阻性无精子症不同睾丸细胞群体中的差异表达模式 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认这些免疫相关基因在NOA发病机制中的具体功能 探究免疫失调在非梗阻性无精子症发病机制中的作用,并识别关键的免疫相关基因 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织和相关基因表达数据 单细胞组学 男性不育症 单细胞RNA测序, 基因表达分析 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 多个数据集(具体样本数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
171 2026-03-17
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了2至3岁儿童鼻气道上皮细胞的发育表型,探讨了喘息表型和婴儿期呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的联合影响 首次在预先设计的嵌套出生队列中,结合喘息表型和RSV感染状态,使用单细胞RNA测序技术系统表征了儿童气道上皮的发育异常和免疫反应变化 研究样本局限于特定年龄段的儿童,且为观察性研究,难以确定因果关系 阐明哮喘儿童气道上皮的发育机制,特别是喘息表型和早期RSV感染对其的影响 2至3岁儿童的鼻气道上皮细胞 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 来自四个互斥组的儿童(喘息/非喘息与RSV感染/未感染组合) NA 单细胞RNA-seq NA NA
172 2026-03-17
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2025-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞转录组学研究了SOCE阻断剂BTP2和CM4620对人类外周血单个核细胞中免疫细胞炎症反应的靶向调节作用 首次利用多重单细胞RNA测序揭示SOCE阻断剂对CD8效应T细胞、NK细胞和CD4调节性T细胞炎症基因表达的差异性调控,显示其比传统免疫抑制剂更具选择性 研究仅基于体外多克隆刺激的正常人PBMCs,未涉及体内模型或疾病状态,且SOCE阻断剂的作用机制仍需进一步探索 探究SOCE阻断剂对免疫细胞功能的调控机制及其治疗潜力 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞转录组学 免疫介导性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用正常人PBMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
173 2026-03-16
Single-Cell RNA Sequencing Study on Two Synovial Derived Tumors in the Temporomandibular Joint
2025-Dec, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的细胞组成、分化轨迹及细胞间通讯 首次在颞下颌关节滑膜来源肿瘤中应用单细胞RNA测序技术,揭示了滑膜成纤维样细胞作为共同起源,并通过COMP/TGFβ/SMAD信号通路促进软骨分化的新机制 样本量较小,仅针对颞下颌关节特定肿瘤,可能限制了结果的普适性 研究颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的细胞组成与分化轨迹 颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的组织样本 单细胞测序 滑膜来源肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及两种颞下颌关节肿瘤的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
174 2026-03-16
Early-life gut microbiome maturity regulates blood-brain barrier and cognitive development
2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究探讨了早期肠道微生物组的成熟度如何通过影响血脑屏障完整性和大脑转录程序来调节认知发育 首次通过将无菌孕鼠定植人类足月或早产婴儿肠道微生物,建立了微生物组成熟度与血脑屏障完整性及认知功能发育的直接因果关系 研究基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;微生物组影响的具体分子机制尚未完全阐明 探究早期肠道微生物组成熟度对血脑屏障发育和认知功能的影响机制 无菌孕鼠及其后代(定植人类足月或早产婴儿肠道微生物) 微生物组学与神经发育 神经发育障碍 单细胞RNA测序、宏基因组学、代谢组学 动物模型(小鼠) 基因表达数据、微生物组数据、代谢物数据 无菌孕鼠及其后代(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序、宏基因组学、代谢组学 NA NA
175 2026-03-16
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-Nov, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)骨髓微环境中两种不同的间充质基质细胞群及其功能 首次在B-ALL患者中鉴定出早期间充质祖细胞和成脂祖细胞两种不同的基质细胞群,并发现成脂祖细胞通过IL-7和VCAM1信号支持白血病细胞 研究样本主要来自儿科患者,可能无法完全代表成人B-ALL的微环境特征 解析B-ALL骨髓微环境的细胞异质性及其在白血病进展中的作用 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
176 2026-03-16
Psychological stress and social support are associated with opposing single-cell pro-inflammatory gene regulatory mechanisms in adults
2025-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析,探讨了心理压力和社会支持对成年人外周血单个核细胞中促炎基因调控机制的影响 首次在单细胞水平上揭示了心理压力和社会支持如何通过不同的转录因子调控机制影响免疫基因表达,特别是干扰素信号通路 研究样本仅限于165名非裔美国成年人,年龄范围较窄(50-89岁),可能限制了结果的普适性 探究心理压力和社会支持如何通过分子机制调节免疫系统的炎症反应 165名自我报告的非裔美国成年人(年龄50-89岁)的外周血单个核细胞 单细胞组学 炎症相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq) NA 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据 165名成年人 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
177 2026-03-16
Loss of BAP1 defines a unique subtype of TP53-mutated de novo AML and confers sensitivity to BCL-xL inhibitors
2025-Sep-18, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文发现BAP1缺失与TP53突变在急性髓系白血病中共存,定义了独特的亚型,并揭示了其对BCL-xL抑制剂的敏感性 首次揭示BAP1缺失与TP53突变在AML中的协同作用,定义了新的白血病亚型,并发现其依赖BCL2L1表达,对BCL-xL抑制剂敏感 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,人类疾病异质性可能未被完全捕捉 探究与TP53缺陷协同促进红细胞白血病转化的遗传改变 TP53突变的急性髓系白血病患者及小鼠模型 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 NA 基因表达数据, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
178 2026-03-16
CD81+ senescent-like fibroblasts exaggerate inflammation and activate neutrophils via C3/C3aR1 axis in periodontitis
2025-Aug-13, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用,发现CD81+衰老样成纤维细胞通过C3/C3aR1轴加剧炎症并激活中性粒细胞 首次鉴定出CD81在衰老牙龈成纤维细胞中高表达,并揭示了其通过C3/C3aR1轴招募中性粒细胞、维持炎症的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化潜力仍需进一步验证 探究细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用及具体分子机制 人类牙周炎样本、小鼠牙周炎模型、牙龈成纤维细胞 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类牙周炎样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
179 2026-03-16
Defining the Ovarian Cancer Precancerous Landscape through Modeling Fallopian Tube Epithelium Reprogramming Driven by Extracellular Vesicles
2025-Aug-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过微流体组织培养平台结合空间转录组学和蛋白质组学分析,探索卵巢癌来源的小细胞外囊泡如何驱动输卵管上皮细胞重编程,揭示卵巢癌前病变的分子机制 开发了一个结合空间转录组学和蛋白质组学读出的微流体组织培养平台,首次同时捕获组织对细胞外囊泡的短期转录组变化和长期分泌囊泡蛋白质组变化,为研究细胞外囊泡-组织相互作用提供了新工具 研究基于体外模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境;样本规模有限,需要进一步验证 探索卵巢癌来源的细胞外囊泡如何驱动输卵管上皮细胞重编程,以理解卵巢癌前病变的分子机制 人输卵管上皮细胞(hFTE)及其对卵巢癌来源小细胞外囊泡(sEV)的响应 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学,蛋白质组学,微流体组织培养 微流体组织培养平台 转录组数据,蛋白质组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及人输卵管上皮细胞培养 NA 空间转录组学,蛋白质组学 NA NA
180 2026-03-16
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文介绍了一种通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的详细实验方案 提供了一种针对真菌细胞壁颗粒zymosan诱导的肺部无菌炎症模型,结合细胞表面和细胞内标记的全面染色技术,适用于下游单细胞测序等应用 NA 探索肺部中性粒细胞在生理和病理条件下的复杂功能 小鼠肺部组织及气腔中的中性粒细胞 数字病理学 肺部炎症 流式细胞术 NA 细胞表型数据 NA NA NA NA NA
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