单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 1761 - 1780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2025-07-26 |
Individualized therapy guided by single-cell sequencing in anti-GABAAR encephalitis
2025-Mar-08, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03300-y
PMID:40057475
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术指导抗GABAAR脑炎的个体化治疗 | 首次在抗GABAAR脑炎患者中应用单细胞测序技术，并发现CD8 T细胞单克隆群和异常JAK-STAT信号通路在疾病中的作用 | 研究仅基于一个病例，样本量有限 | 探索抗GABAAR脑炎的发病机制并开发个体化治疗方案 | 一名难治性抗GABAAR脑炎患者及四名健康志愿者的外周血单核细胞和脑脊液细胞 | 数字病理学 | 脑炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 1名患者和4名健康志愿者的PBMCs及患者的脑脊液细胞 |
| 1762 | 2025-07-26 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631842
PMID:39829792
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研究论文 | 一项为期三年的纵向研究，探讨了多次COVID-19加强疫苗接种对T细胞和抗体反应的长期影响 | 首次全面分析了多次疫苗接种后T细胞反应的动态变化，揭示了无症状感染者的独特免疫特征 | 样本量相对较小（78人），且仅针对未报告有症状感染的接种者 | 了解重复COVID-19疫苗接种对适应性免疫的长期影响 | 78名接种疫苗且未报告有症状感染的个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫反应数据 | 78名接种疫苗的个体 |
| 1763 | 2025-07-26 |
Reversal of inflammatory reprogramming by vasodilator agents in pulmonary hypertension
2025-Jan, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00486-2024
PMID:39811555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了血管扩张剂对肺动脉高压（PAH）患者外周血单个核细胞（PBMCs）炎症反应的逆转作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了血管扩张剂治疗对PAH患者PBMCs炎症转录组和信号通路的逆转作用，并发现单核细胞中'代谢调节中的胰高血糖素信号'通路在治疗后发生逆转 | 样本量较小（对照组3例，治疗前PAH患者4例，PDE5i治疗组7例，PDE5i+macitentan治疗组6例），且仅观察了3个月的治疗效果 | 阐明血管扩张剂是否逆转PAH的炎症激活机制，并开发基于血液的诊断和预后工具 | 特发性PAH（iPAH）和系统性硬化相关PAH（sscPAH）患者及非PAH对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组3例，治疗前PAH患者4例，PDE5i治疗组7例，PDE5i+macitentan治疗组6例 |
| 1764 | 2025-07-26 |
Integrated Multi-Omics Profiling Identifies PDZ-Binding Kinase (PBK) as a Novel Prognostic Biomarker in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S493907
PMID:40697330
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研究论文 | 该研究通过整合多组学分析，鉴定出PDZ结合激酶（PBK）作为肝细胞癌（HCC）的新型预后生物标志物 | 首次发现PBK通过三种协同机制驱动HCC进展，并作为预后分层和免疫治疗抵抗预测的双功能生物标志物 | 研究主要基于TCGA-LIHC队列数据，需进一步临床样本验证 | 寻找肝细胞癌的新型免疫治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC）患者肿瘤样本及Huh7细胞系 | 肿瘤基因组学 | 肝细胞癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、siRNA敲低 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | TCGA-LIHC队列样本及Huh7细胞系 |
| 1765 | 2025-07-26 |
Integrated Transcriptomic Analysis Provided Diagnostic and Pathophysiological Insights for Epilepsy
2025, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/5925485
PMID:40697415
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研究论文 | 通过整合转录组分析，为癫痫的诊断和病理生理学提供新见解 | 鉴定了与癫痫密切相关的四个关键基因（CD3D、CD3G、CTSW和JCHAIN），并构建了一个具有强区分能力的诊断模型 | 研究依赖于公开的转录组数据集，可能受到样本量和数据质量的限制 | 揭示癫痫的病理生理学基础并改进潜在诊断和治疗策略 | 癫痫相关的差异表达基因（DEGs）和枢纽基因 | 生物信息学 | 癫痫 | 转录组分析、单细胞测序、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析 | 诊断模型 | 基因表达数据 | 两个癫痫数据集（GSE143272和GSE32534）及单细胞测序数据（GSE201048） |
| 1766 | 2025-07-26 |
Mechanistic Insights into Shenzhuo Formula for Diabetic Retinopathy: Integrating UPLC-Q-TOF-MS/MS, Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing Data, and Experimental Validation
2025, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S505055
PMID:40698062
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研究论文 | 本研究通过整合UPLC-Q-TOF-MS/MS、网络药理学、单细胞RNA测序数据和实验验证，探讨了参竹配方(SZF)在糖尿病视网膜病变(DR)治疗中的潜在机制 | 首次结合多种先进技术手段全面解析SZF的作用机制，并发现HIF-1α-VEGFA信号通路可能是其核心作用靶点 | 需要进一步的实验验证来确认这些机制 | 开发更安全有效的早期糖尿病视网膜病变治疗策略 | 糖尿病视网膜病变(DR) | 生物医学研究 | 糖尿病视网膜病变 | UPLC-Q-TOF-MS/MS, 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接 | Db/db小鼠模型 | 质谱数据, 测序数据, 影像数据 | Db/db小鼠(未明确数量)和GSE245561数据集中的临床样本 |
| 1767 | 2025-07-26 |
Mapping the immunological landscape and emerging immunotherapeutic strategies in cervical cancer: a comprehensive review
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1620501
PMID:40708940
|
综述 | 本文全面回顾了宫颈癌的免疫学景观及新兴免疫治疗策略 | 整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和多路成像等先进技术来理解免疫异质性并发现新治疗靶点 | 缺乏可靠的生物标志物来预测哪些患者能从免疫治疗中获益，且患者间免疫景观的异质性增加了复杂性 | 开发针对宫颈癌的有效、个性化免疫治疗策略 | 宫颈癌的肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多路成像 | NA | NA | NA |
| 1768 | 2025-07-26 |
Gut-tropic α4β7+CD8+ T cells contribute to pancreatic β cell destruction in type 1 diabetes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623428
PMID:40709181
|
研究论文 | 本文探讨了肠道趋向性α4β7+CD8+ T细胞在1型糖尿病中对胰腺β细胞的破坏作用 | 揭示了肠道趋向性CD8+ T细胞在1型糖尿病发病机制中的新作用，并发现整合素α4β7是其致病性的关键介质 | 研究样本量相对较小，且主要基于观察性数据，需要进一步实验验证 | 阐明非特异性T细胞向胰岛迁移的机制及其在1型糖尿病中的潜在致病作用 | 1型糖尿病患者、健康对照者及NOD小鼠 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、相关性分析、细胞因子分析 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 99名1型糖尿病患者、57名健康对照者、10名1型糖尿病供体、11名自身抗体阳性供体、15名非糖尿病对照及NOD小鼠 |
| 1769 | 2025-07-25 |
A novel immunocompetent transgenic mouse model of DHF reveals Syk-mediated Th2-polarized cytokine storm as a key driver of vascular leakage
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2531178
PMID:40623122
|
研究论文 | 该研究建立了一种新型免疫活性转基因小鼠模型，用于研究登革热出血热（DHF）的发病机制 | 首次建立了具有完整先天/适应性免疫的免疫活性小鼠模型，揭示了Syk介导的Th2极化细胞因子风暴是血管渗漏的关键驱动因素 | NA | 研究登革热出血热（DHF）的发病机制 | hTim4转基因C57BL/6J小鼠和人类DHF组织 | 免疫病理学 | 登革热出血热 | 单细胞RNA测序和空间转录组学分析 | 转基因小鼠模型 | RNA测序数据和转录组数据 | NA |
| 1770 | 2025-07-25 |
PD-1 regulates tumor-infiltrating CD8+ T cells in both a cell-intrinsic and a cell-extrinsic fashion
2025-Oct-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230542
PMID:40705010
|
研究论文 | 研究PD-1在肿瘤浸润CD8+ T细胞中的细胞内在和外在调控机制 | 开发了一种可诱导的PD-1敲除模型，揭示了PD-1抑制剂通过非细胞自主机制增强T细胞功能的新机制 | 研究仅基于MC38肿瘤细胞模型，未在其他肿瘤模型中验证 | 探究PD-1缺失对CD8+ T细胞功能的影响及其在肿瘤微环境中的作用机制 | PD-1缺失和表达的CD8+ T细胞 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA-seq和TCR-seq | 可诱导PD-1敲除模型 | 基因表达数据和T细胞受体序列数据 | MC38肿瘤细胞模型中的CD8+ T细胞 |
| 1771 | 2025-07-25 |
POSTN is exclusively activated in cancer-associated fibroblasts and leads to unfavorable prognosis of patients with gastric cancer
2025-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2877
PMID:40692747
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research paper | 该研究揭示了POSTN在胃癌相关成纤维细胞中的特异性激活及其与患者不良预后的关联 | 首次发现POSTN在CAFs中的显著上调及其通过YAP1/TEAD1共转录因子的直接调控机制 | 研究主要基于公共数据库和免疫组化数据，缺乏体内实验验证 | 探究胃癌肿瘤微环境中CAF相关标志物的临床意义及其在耐药性中的作用 | 胃癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | digital pathology | gastric cancer | 免疫组化染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床样本数据 | 内部队列胃癌患者样本及公共数据库数据 |
| 1772 | 2025-07-25 |
Rethinking eco-evo studies of gene expression for non-model organisms in the genomic era
2025-Aug, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17378
PMID:38721834
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perspective | 探讨基因组时代下非模式生物基因表达研究的生态与进化研究新方向 | 提出利用长读长测序和单细胞RNA测序技术解决传统RNA测序在非模式生物研究中的局限性 | 未具体说明技术应用中的实际挑战或数据解读难度 | 推动生态基因组学中基因表达研究的精度与深度 | 非模式生物的基因表达 | 生态基因组学 | NA | 长读长测序(long-read sequencing), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
| 1773 | 2025-07-25 |
NFATc1 Fosters Allergic Contact Dermatitis Responses by Enhancing the Induction of IL-17-Producing CD8 Cells
2025-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.11.014
PMID:39733935
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研究论文 | 本文研究了NFATc1在过敏性接触性皮炎中对IL-17产生的CD8 T细胞（Tc17细胞）的诱导作用 | 揭示了NFATc1在调控CD8 T细胞向Tc17细胞分化中的关键作用，并提出了NFATc1作为减轻CD8 T细胞介导的过敏反应的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探究NFATc1在过敏性接触性皮炎中的作用机制 | 小鼠模型中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 野生型小鼠和Nfatc1xCd4-cre小鼠 |
| 1774 | 2025-07-25 |
Long-Term High-Fat Diet Affected Bone Marrow Microenvironment During Aging at Single-Cell Resolution
2025-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70276
PMID:40692664
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率探讨了长期高脂饮食对衰老过程中骨髓微环境的影响 | 揭示了长期高脂饮食导致骨髓微环境中成骨向成脂转变的机制，并发现了骨髓与大脑之间可能的信号交流轴 | 研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明长期高脂饮食如何影响衰老过程中的骨髓和实体器官 | 衰老小鼠的骨髓微环境 | 生物医学 | 骨质疏松症 | 单细胞转录组学 | LHA小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1775 | 2025-07-25 |
Targeting tumor-associated CCR2+ macrophages to inhibit pancreatic cancer recurrence following irreversible electroporation
2025-Jul-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw2937
PMID:40700478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不可逆电穿孔（IRE）后胰腺导管腺癌（PDAC）模型的肿瘤免疫微环境，发现IRE诱导了CCR2肿瘤相关巨噬细胞（CCR2 TAM）介导的免疫抑制微环境，并开发了一种新型巨噬细胞蛋白脂质体（mPLV）共封装CCR2拮抗剂PF-4136309和吉西他滨，以抑制肿瘤复发 | 揭示了CCR2 TAM在IRE诱导的免疫抑制中的作用，并开发了新型mPLV药物递送系统以增强IRE的临床潜力 | 研究仅限于临床前PDAC模型，尚未进行人体试验 | 探索IRE治疗后PDAC复发机制并开发抑制复发的治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）模型 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 临床前PDAC模型 | RNA测序数据 | NA |
| 1776 | 2025-07-25 |
Generation of Porcine Blastoids from Embryonic Stem Cells
2025-Jul-25, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_651
PMID:40705202
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research paper | 该研究开发了一种从猪胚胎干细胞生成类囊胚结构的方法 | 首次报道了从猪胚胎干细胞生成类囊胚结构的三维两步分化策略 | 未提及体内发育潜能或功能验证 | 建立大型动物胚胎发育研究模型 | 猪胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 3D细胞培养 | 类囊胚模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 |
| 1777 | 2025-07-25 |
Prognostic significance of somatic mutations in myeloid cells of men with chronic heart failure - interaction between loss of Y chromosome and clonal haematopoiesis
2025-Jul-24, European journal of heart failure
IF:16.9Q1
DOI:10.1002/ejhf.3778
PMID:40702883
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研究论文 | 探讨男性慢性心力衰竭患者骨髓细胞中体细胞突变的预后意义，特别是Y染色体缺失与克隆性造血之间的相互作用 | 首次揭示Y染色体缺失(LOY)与克隆性造血(CHIP)在慢性心力衰竭患者中的相互作用及其对预后的影响 | 研究仅针对男性患者，未包括女性患者的数据 | 评估LOY和CHIP突变对慢性心力衰竭患者预后的影响 | 781名男性慢性心力衰竭患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据 | 781名男性慢性心力衰竭患者 |
| 1778 | 2025-07-25 |
Enhancing and accelerating cell type deconvolution of large-scale spatial transcriptomics slices with dual network model
2025-Jul-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf419
PMID:40704686
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研究论文 | 提出一种名为jMF2D的双网络模型，用于增强和加速大规模空间转录组切片的细胞类型反卷积 | jMF2D通过联合学习细胞类型相似性网络，整合scRNA-seq和空间转录组数据，提高了反卷积的准确性和效率，节省了约90%的运行时间 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种高效准确的细胞类型反卷积算法，用于分析空间转录组数据 | scRNA-seq和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, 空间转录组 | 非负矩阵分解算法（jMF2D） | RNA-seq数据 | 多种平台生成的不同数据集 |
| 1779 | 2025-07-25 |
Single-Cell RNA Sequencing of Murine Limbal Epithelia Reveals Gas1 as a Novel Stem/Progenitor Cell Marker for the Corneal Epithelium
2025-Jul-24, Cornea
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/ICO.0000000000003938
PMID:40704715
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术发现Gas1作为角膜上皮干细胞/祖细胞的新标记物 | 首次发现Gas1作为角膜上皮干细胞/祖细胞的新标记物，可用于识别和富集这些细胞 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 鉴定角膜上皮干细胞/祖细胞的标记物 | 鼠类角膜缘上皮细胞 | 数字病理学 | 角膜疾病 | scRNA-seq, SmartSeq-2, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 5至60周龄小鼠 |
| 1780 | 2025-07-25 |
Decoding epithelial-fibroblast interactions in lung adenocarcinoma through single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jul-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06250-6
PMID:40705084
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，解析了肺腺癌中上皮细胞与成纤维细胞间的相互作用及其在肿瘤微环境中的动态变化 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了肺腺癌中上皮细胞与成纤维细胞亚群的关键互作及其在肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小（21例患者），可能限制了结果的普遍性 | 揭示肺腺癌肿瘤微环境中上皮细胞与基质细胞的相互作用及其在肿瘤进展中的角色 | 肺腺癌患者的上皮细胞和成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 肺腺癌 | scRNA-seq, 空间转录组学, CNV分析 | Seurat, Harmony, CellChat, MEBOCOST, CellTrek | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 21例肺腺癌患者 |