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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1721 | 2025-11-26 |
Correction: Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1718125
PMID:41280907
|
correction | 对前列腺癌研究中关于NEFH+恶性细胞亚型的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | prostate cancer | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1722 | 2025-11-25 |
Ciao3 knockout causes acute lung injury through immune activation using single cell sequencing
2025-Dec-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124063
PMID:41187899
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示Ciao3基因敲除通过免疫激活导致急性肺损伤的机制 | 首次在Ciao3条件性敲除小鼠模型中结合单细胞RNA测序技术系统阐明免疫细胞在急性肺损伤中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本数量有限 | 阐明Ciao3基因缺失导致急性肺损伤的分子机制 | Ciao3基因突变患者和内皮细胞特异性Ciao3敲除小鼠 | 单细胞生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 1名纯合子患者和Ciao3条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1723 | 2025-11-25 |
Malignant cell-mediated Treg immune suppression via ICOSLG-ICOS axis in tumor microenvironment relates to nasopharyngeal carcinoma prognosis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115743
PMID:41151481
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示鼻咽癌肿瘤微环境中恶性细胞通过ICOSLG-ICOS轴激活Treg细胞介导免疫抑制的机制 | 首次在鼻咽癌中发现Mal (TUBB2B+)细胞通过ICOSLG-ICOS通路激活Treg (TNFRSF4+)细胞,进而抑制多种免疫细胞功能的免疫逃逸新机制 | 研究样本主要来自亚洲人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 阐明鼻咽癌肿瘤微环境中细胞间相互作用与患者预后的关系 | 鼻咽癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境中的各类细胞 | 单细胞生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫组化 | scissor, scAB, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 82个样本共488,771个细胞(其中50个样本269,521个单细胞),183例鼻咽癌患者批量RNA数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1724 | 2025-11-25 |
Melatonin ameliorates bronchopulmonary dysplasia by modulating the NF-κB pathway via the gut microbiota-short-chain fatty acid axis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115730
PMID:41151484
|
研究论文 | 本研究揭示了褪黑素通过调节肠道微生物群-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的机制 | 首次发现褪黑素通过增加肠道Ligilactobacillus murinus丰度和短链脂肪酸产生,抑制NF-κB通路和细胞焦亡来改善BPD | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明褪黑素通过肠道微生物-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的作用机制 | 博来霉素诱导的BPD小鼠模型、人支气管上皮细胞(BEAS-2B)、婴儿肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 支气管肺发育不良 | 宏基因组学、16S rRNA测序、非靶向代谢组学、RNA转录组学、单细胞RNA测序 | 动物模型、细胞模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | BPD小鼠模型、BEAS-2B细胞系、公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学,转录组学 | NA | NA |
| 1725 | 2025-11-25 |
Pirfenidone regulates obesity-related renal injury through the SIRT3 signaling pathway
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115709
PMID:41151486
|
研究论文 | 本研究探讨了吡非尼酮通过SIRT3信号通路调节肥胖相关肾损伤的作用机制 | 首次揭示吡非尼酮通过SIRT3依赖方式改善肥胖相关肾损伤的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行临床验证 | 探究吡非尼酮对肥胖相关肾损伤的治疗作用及其分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠、人近端肾小管上皮细胞(HK-2)和人原代肾近端小管上皮细胞(PTECs) | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序分析、分子对接、免疫共沉淀 | 动物模型、细胞模型 | 分子生物学数据、细胞实验数据 | C57BL/6J雄性小鼠分组实验,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1726 | 2025-11-25 |
GPRC5A+ myCAFs promote ESCC progression via TGF-β-induced fibroblast activation and ANXA1-mediated M2 macrophage polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115663
PMID:41082840
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现GPRC5A+肌成纤维细胞通过TGF-β通路激活成纤维细胞和ANXA1介导的M2巨噬细胞极化促进食管鳞癌进展 | 首次鉴定GPRC5A作为肌成纤维细胞亚群特异性标志物,并揭示其通过双重机制驱动肿瘤进展的新机制 | 样本量相对有限(15例肿瘤和11例正常组织),需进一步验证 | 探究食管鳞癌中癌相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境调控中的作用机制 | 食管鳞癌组织和正常食管组织 | 单细胞生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序,转录组去卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例ESCC肿瘤组织和11例正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1727 | 2025-11-25 |
Paeoniflorin attenuates hepatic ischemia-reperfusion injury by modulating Tmem176b+ macrophages polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115657
PMID:41092769
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示芍药苷通过调节Tmem176b+巨噬细胞极化减轻肝脏缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现芍药苷特异性靶向Tmem176b+巨噬细胞亚群,通过调控THBS1-CD47免疫抑制轴和SPP1-CD44促炎信号通路发挥保护作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;单细胞测序样本量相对有限 | 探究芍药苷在肝脏缺血再灌注损伤中对巨噬细胞极化的调节机制 | 肝脏缺血再灌注损伤小鼠模型中的巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 45,673个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1728 | 2025-11-25 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that macrophage ferroptosis inhibits MSC osteogenic differentiation in inflammatory microenvironments
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115744
PMID:41166988
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术,揭示巨噬细胞铁死亡在炎症微环境中抑制间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示巨噬细胞铁死亡通过调控M1/M2极化影响MSC PANoptosis和成骨分化的新机制 | 研究主要聚焦于巨噬细胞铁死亡的效应,其他细胞类型的贡献尚未充分探讨 | 探究炎症微环境中巨噬细胞铁死亡对骨再生和MSC成骨分化的影响机制 | 巨噬细胞、间充质干细胞(MSC)、骨感染临床样本 | 单细胞生物学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包含体内、体外实验和临床样本的多层次验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1729 | 2025-11-25 |
Single-Cell Profiling of Lichen Planus Reveals Type I IFN Response Triggering the Interface Dermatitis Reaction
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.043
PMID:40499747
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了扁平苔藓中I型干扰素反应触发界面皮炎反应的免疫发病机制 | 首次在扁平苔藓中发现I型干扰素富集环境,并证实IFN-β通过敏化角质形成细胞增强CD8 T细胞介导的细胞死亡 | NA | 研究扁平苔瘆的免疫发病机制及驱动界面皮炎反应的潜在机制 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤 | 单细胞组学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1730 | 2025-11-25 |
Analyzing the toxicological effects of PET-MPs on male infertility: Insights from network toxicology, mendelian randomization, and transcriptomics
2025-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2025.101076
PMID:40929757
|
研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、孟德尔随机化和转录组学方法,探讨了PET微塑料导致男性不育的分子机制 | 首次发现CLK4是PET微塑料导致男性不育的功能靶点,并揭示了其通过调节Th1细胞浸润和干扰精子发生过程的双重作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟,缺乏体内实验验证 | 探究PET微塑料对男性生殖功能损害的分子机制 | 男性不育相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 男性不育 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟, bulk RNA-seq, scRNA-seq | SMR分析 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1731 | 2025-11-25 |
Molecular insights into the role of tumor-specific endothelial cells in metastasis
2025-Dec, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104964
PMID:41015325
|
综述 | 本文综述了肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤转移和免疫逃逸中的关键作用及其治疗潜力 | 系统阐述了肿瘤特异性内皮细胞区别于正常内皮细胞的独特特征及其在肿瘤进展中的多重功能 | NA | 探讨肿瘤特异性内皮细胞在癌症转移和治疗中的作用机制 | 肿瘤特异性内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1732 | 2025-11-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Based Research Reveals Association Between M2a Macrophages and Tumor Spread through Air Spaces in Lung Adenocarcinoma
2025-Dec, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.07.017
PMID:40946801
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示M2a巨噬细胞通过CCL17/CCR4轴促进β-catenin信号通路,从而增强肺腺癌气腔播散的发生发展 | 创新性地结合单细胞RNA测序与数字空间分析空间转录组学技术,针对STAS的空间特性探索肿瘤相关巨噬细胞的作用机制 | NA | 探索肺腺癌中气腔播散的发生和定植机制,特别是肿瘤相关巨噬细胞在其中的作用 | 肺腺癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 数字空间分析空间转录组学 |
| 1733 | 2025-11-25 |
Comprehensive multi-omics analysis identifies transferrin receptor as a therapeutic target in esophageal cancer
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148121
PMID:41067362
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定转铁蛋白受体(TFRC)作为食管癌的潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、转录组分析和基因组关联研究,系统揭示TFRC在食管癌免疫逃逸中的关键作用机制 | NA | 识别食管癌的新型生物标志物并探索其在疾病进展中的作用 | 食管癌样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因表达数量性状位点分析,全基因组关联研究,多重免疫荧光检测 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1734 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals oocyte-granulosa crosstalk and regulatory networks driving chicken primordial follicle assembly
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148357
PMID:41109371
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鸡原始卵泡组装过程中卵母细胞与颗粒细胞的相互作用及调控网络 | 首次构建鸡生殖细胞和颗粒细胞的单细胞转录组图谱,揭示原始卵泡组装过程中的细胞异质性和双向调控机制 | 研究局限于鸡模型,调控机制在其它物种中的普适性需要进一步验证 | 解析鸡原始卵泡组装的分子调控机制 | 鸡卵巢生殖细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, Pseudotime轨迹分析, CellChat | 单细胞转录组数据 | 鸡卵巢关键发育阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1735 | 2025-11-25 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
|
综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类系统及其在预后预测和个性化治疗中的应用 | 系统整合了基于基因表达谱、免疫组化和深度学习图像分析的CMS分类方法,并探讨了单细胞测序解决肿瘤内异质性的新策略 | 肿瘤内异质性和技术障碍限制了临床应用的广泛采纳 | 评估CMS分类在结直肠癌预后预测和治疗指导中的价值 | 结直肠癌分子亚型及其临床特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析,免疫组化,单细胞RNA测序,深度学习 | 深度学习 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1736 | 2025-11-25 |
Adipose-derived mesenchymal stem cell therapy modulates mitochondrial function to attenuate acetaminophen-induced liver injury by DDIT4/PGC-1α axis
2025-Nov-24, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04815-3
PMID:41276869
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研究论文 | 本研究探讨脂肪来源间充质干细胞通过DDIT4/PGC-1α轴调节线粒体功能缓解对乙酰氨基酚诱导肝损伤的机制 | 首次揭示AMSCs通过DDIT4介导的PGC-1α上调诱导线粒体生物发生和线粒体自噬,从而恢复线粒体功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探究间充质干细胞治疗对乙酰氨基酚诱导肝损伤的线粒体功能调节机制 | 对乙酰氨基酚诱导肝损伤小鼠模型、肝细胞特异性DDIT4敲除小鼠、AILI患者肝组织样本 | 细胞治疗 | 药物性肝损伤 | RNA-Seq, snRNA-Seq, 空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据, 组织学数据 | 小鼠模型和患者肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1737 | 2025-11-25 |
PBMCpedia: a harmonized PBMC scRNA-seq database with unified mapping and enhanced celltype annotation
2025-Nov-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1245
PMID:41277528
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研究论文 | 本研究构建了一个统一处理与注释的PBMC单细胞RNA测序数据库PBMCpedia | 通过标准化流程统一处理24项公开研究的519个样本,提供跨疾病、细胞类型、性别和年龄组的元数据感知比较 | 仅包含公开可用数据,未涉及新样本采集 | 解决PBMC单细胞转录组研究中数据整合困难的问题 | 外周血单个核细胞(PBMC) | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病,传染病,神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体/B细胞受体谱数据,表面蛋白测量数据 | 519个样本(超过430万个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1738 | 2025-11-25 |
Single-cell transcriptome profiling reveals immunological fitness of HIV long-term non-progressors
2025-Nov-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01597-25
PMID:41277843
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HIV长期不进展者的免疫适应性特征 | 首次在单细胞水平系统比较HIV长期不进展者、典型进展者和健康捐赠者的免疫细胞转录组差异 | 样本量较小(仅12名参与者),仅分析外周血单个核细胞 | 研究HIV长期不进展者的免疫学特征与非进展机制 | HIV长期不进展者、典型进展者和健康捐赠者的外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | 单细胞转录组数据 | 12名个体(4名LTNP、4名TP、4名HD) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1739 | 2025-11-25 |
Cmss1 limits FMDV infection by enhancing antigen presentation and CD8+ T cell responses
2025-Nov-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01249-25
PMID:41277842
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了树突状细胞在口蹄疫病毒感染中的作用,并发现Cmss1通过增强抗原呈递和CD8+ T细胞反应限制病毒感染 | 首次开发了缺乏I型干扰素受体的小鼠感染模型,通过单细胞RNA测序绘制了FMDV感染小鼠脾脏DC的高分辨率图谱,并鉴定出Cmss1作为新的宿主因子 | 研究主要使用小鼠模型,结果在猪等自然宿主中的适用性需要进一步验证 | 探究树突状细胞在口蹄疫病毒感染中的作用机制,寻找抗病毒治疗新靶点 | 缺乏I型干扰素受体的C57BL/6小鼠、树突状细胞、FMDV病毒 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序、基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 感染FMDV的小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1740 | 2025-11-25 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2025-Nov-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术,探索宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络及苦参碱的治疗潜力 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术系统揭示宫颈癌代谢-免疫相互作用网络,并发现苦参碱通过调控钙信号通路和炎症相关基因发挥抗肿瘤作用 | 苦参碱的确切作用机制尚未完全明确,研究结果主要基于生物信息学分析和初步体外实验 | 探索宫颈癌的分子机制及苦参碱的治疗潜力,为宫颈癌治疗提供新的研究方向 | 宫颈癌组织样本及相关基因数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,空间转录组,生物信息学分析,分子对接 | CIBERSORT算法,ESTIMATE算法 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 从TCGA数据库筛选758个差异基因,其中453个与宫颈癌靶点重叠,发现20个核心基因 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | NA | NA |