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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2026-05-23 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
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研究论文 | 该研究探讨了mTOR信号通路在TGF-β处理后的人肺成纤维细胞及肺纤维化中对多种代谢途径的调控作用 | 首次揭示了mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调控多种代谢途径,包括氨基酸稳态、糖酵解和三羧酸循环,并利用单细胞RNA测序数据验证了这些途径在IPF患者肺病理成纤维细胞中的上调 | 未明确提及实验样本量、平台具体配置及体外模型与体内临床应用的潜在差异 | 阐明mTOR及其下游效应因子ATF4在肺成纤维细胞代谢重编程中的调控机制,并识别可能用于抑制纤维化过程的新型代谢途径 | 人肺成纤维细胞(经TGF-β处理)及IPF患者肺组织 | 数字病理 | 肺纤维化 | RNA测序, 代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1682 | 2026-05-23 |
Exploring the role of oxidative stress in carotid atherosclerosis: insights from transcriptomic data and single-cell sequencing combined with machine learning
2025-01-29, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00600-7
PMID:39881407
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研究论文 | 通过转录组数据和单细胞测序结合机器学习,探索氧化应激在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次将氧化应激相关基因与单细胞测序数据结合机器学习模型,揭示驻留样巨噬细胞和泡沫巨噬细胞中IDH1和CD36等基因上调在斑块形成和进展中的关键作用 | 基于生物信息学分析,缺乏实验验证,且样本量可能有限 | 识别与颈动脉粥样硬化斑块形成、进展和稳定相关的关键氧化应激基因及免疫细胞浸润 | 颈动脉粥样硬化斑块组织及单细胞数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1683 | 2026-05-23 |
Uncovering glycolysis-driven molecular subtypes in diabetic nephropathy: a WGCNA and machine learning approach for diagnostic precision
2025-01-21, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00601-6
PMID:39838413
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研究论文 | 利用WGCNA和机器学习方法揭示糖尿病肾病中糖酵解驱动的分子亚型,并提供诊断标志物 | 首次系统分析糖尿病肾病中糖酵解相关基因的表达模式,结合WGCNA和机器学习识别关键基因,并通过单细胞测序验证 | 研究基于公共数据集分析,体外实验仅验证正常对照样本,缺乏体内验证和临床队列验证 | 探究糖酵解相关基因在糖尿病肾病中的作用及其与免疫微环境的关系,构建诊断模型 | 糖尿病肾病患者的肾组织样本及正常对照 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | RNA-seq, 单细胞测序, qRT-PCR | 极端梯度提升模型 (XGB) | 基因表达数据 | 来自GSE30122、GSE30528、GSE96804和GSE142153数据集,具体样本量未在摘要中说明 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1684 | 2026-05-23 |
Animal and vegetal materials of mouse oocytes segregate at first zygotic cleavage: a simple mechanism that makes the two-cell blastomeres differ reciprocally from the start
2025-01-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae045
PMID:39786543
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研究论文 | 通过控制小鼠卵母细胞受精位点并分析首次卵裂后子细胞转录组,揭示动物极与植物极物质在首次卵裂时分离,导致两细胞期卵裂球从一开始就彼此不同 | 首次证明哺乳动物卵母细胞首次卵裂沿赤道方向进行,从而将动物极和植物极物质分别分配到两个卵裂球中,挑战了传统认为的经线分裂模型和可变分裂模型 | 仅在小鼠模型中验证,人类卵母细胞的相关机制尚需进一步研究;实验通过ICSI控制受精位点,可能不适用于自然受精情况 | 探究小鼠受精卵首次卵裂后姐妹卵裂球差异的起源机制,区分两种对立模型(平衡分配与可变分配) | 小鼠卵母细胞及受精卵 | 数字病理学 | NA | ICSI, 单细胞转录组分析, 图像分析 | 无监督层次聚类 | 转录组数据, 图像数据 | 小鼠卵母细胞(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1685 | 2026-05-23 |
Pro-cumulin addition in a biphasic in vitro oocyte maturation system modulates human oocyte and cumulus cell transcriptomes
2025-01-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf001
PMID:39862403
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研究论文 | 研究在双相体外卵母细胞成熟系统中添加原-cumulin对人类卵母细胞和卵丘细胞转录组的影响 | 首次在人类双相IVM培养中探究卵母细胞分泌因子原-cumulin对来自小型窦状卵泡的卵母细胞和卵丘细胞转录组的调控作用 | 未来需在蛋白质组学水平评估原-cumulin的效果及胚胎学结果,特别是对部分去颗粒卵母细胞的潜在改善作用 | 阐明原-cumulin添加对人类双相IVM系统中卵母细胞和卵丘细胞转录组的影响 | 人类卵丘-卵母细胞复合体(完全被卵丘细胞包裹或部分去颗粒的) | 数字病理学 | 不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 人类卵丘-卵母细胞复合体(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1686 | 2026-05-23 |
Evolutionary convergence of sensory circuits in the pallium of amniotes
2025-01-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp3411
PMID:39946453
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研究论文 | 通过出生日期分析、单细胞RNA和空间转录组学以及数学建模,比较鸟类、蜥蜴和哺乳动物端脑中感觉回路的发育和演化 | 揭示了不同物种间感觉回路神经元的生成时间和脑区差异,发现谷氨酸能神经元转录组进程的早期发育分歧 | NA | 研究羊膜动物端脑中感觉回路的演化关系 | 鸡、壁虎和老鼠的端脑感觉回路 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种物种(鸡、壁虎、老鼠) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1687 | 2026-05-22 |
Putative muscle stem cells promote Xenopus tail regeneration by modifying macrophage function via c1qtnf3
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504410122
PMID:41264239
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研究论文 | 研究发现假定的肌肉干细胞通过c1qtnf3调节巨噬细胞功能,促进非洲爪蟾尾部再生 | 首次揭示了肌肉干细胞通过c1qtnf3基因调控巨噬细胞功能以促进尾部再生的机制 | 研究主要基于非洲爪蟾模型,其结论在哺乳动物中的适用性尚未验证 | 探究尾部再生过程中组织干细胞的动态行为及其调控机制 | 非洲爪蟾蝌蚪的侧群细胞和假定肌肉干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因敲低 | NA | 基因表达数据 | 侧群细胞样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1688 | 2026-05-22 |
Engineering a spatiotemporal macrophage circuit via STING phase separation to override immune suppression in pancreatic cancer
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504718122
PMID:41264244
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研究论文 | 通过STING相分离工程化时空巨噬细胞回路以克服胰腺癌免疫抑制 | 首次利用STING相分离机制构建巨噬细胞重编程平台PMMB,通过时空顺序控制实现TAM从免疫抑制向抗肿瘤表型转化 | 目前仅在临床前模型验证,缺乏人体临床试验数据,且STING相分离的长期安全性待评估 | 开发克服胰腺导管腺癌免疫抑制微环境的巨噬细胞靶向免疫治疗新策略 | 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)亚群及CD8+T细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 1689 | 2026-05-22 |
Precise combination therapy of radiotherapy and immunotherapy guided by joint PD-L1 imaging and T-cell imaging
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012300
PMID:41260899
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研究论文 | 通过SPECT/CT成像技术联合监测肿瘤PD-L1表达和肿瘤浸润T细胞,指导放疗与PD-1/PD-L1阻断治疗的精准联合方案,提升疗效和安全性 | 首创利用SPECT/CT成像同时监测肿瘤PD-L1表达动态变化和T细胞浸润改变,实现联合治疗的时机指导与预后预测,提升个体化精准治疗水平 | 未明确提及研究局限,但可推断成像策略的临床转化仍需更大规模验证,且不同肿瘤模型间的疗效差异需进一步解析 | 探索利用PD-L1成像和T细胞成像联合指导放疗与免疫治疗精准组合的策略,以提高疗效和安全性,推动个体化精准癌症治疗 | 免疫热肿瘤和免疫冷肿瘤模型(小鼠) | 数字病理学 | 癌症 | SPECT/CT成像、单细胞RNA测序 | NA | 成像数据、单细胞转录组数据 | 免疫热和冷肿瘤小鼠模型,含多个时间点的成像和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析肿瘤微环境变化 |
| 1690 | 2026-05-22 |
Oligoclonal tumor-specific CD8 T-cell revival and IRE1α/XBP1-GDF15-mediated immunosuppressive niches determine neoadjuvant chemoimmunotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012630
PMID:41260902
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、VDJ测序和空间转录组学分析,揭示了新辅助化学免疫治疗在局部晚期宫颈癌中疗效的决定因素,即寡克隆肿瘤特异性CD8+T细胞复苏和IRE1α/XBP1-GDF15介导的免疫抑制微环境 | 首次阐明了IRE1α/XBP1-GDF15轴在药物耐受持久细胞(DTP)中介导的ER应激信号如何形成免疫抑制微环境,并影响新辅助化学免疫治疗疗效 | NA | 探究新辅助化学免疫治疗在局部晚期宫颈癌中疗效差异的微环境动态决定因素 | 局部晚期宫颈癌患者的肿瘤微环境,包括肿瘤细胞、CD8+T细胞、髓系细胞等 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序, 空间转录组学, 多重免疫组化, 小鼠模型 | NA | RNA-seq数据,单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化图像 | 10例患者(5对治疗前后配对样本),另外23例患者用于验证,6例手术切除标本用于多重免疫组化分析 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞VDJ-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA-seq和VDJ-seq,空间转录组学平台用于空间分析 |
| 1691 | 2026-05-22 |
USP2-mediated PPARγ stabilization promotes hepatocellular carcinoma progression and M2 macrophage polarization via oleic acid
2025-Nov-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012721
PMID:41193183
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研究论文 | 本文发现USP2通过去泛素化稳定PPARγ,促进肝细胞癌进展和油酸介导的M2巨噬细胞极化 | 首次揭示USP2通过K48位去泛素化稳定PPARγ,促进脂肪酸合成和油酸分泌,进而诱导M2巨噬细胞极化并形成IL-10/STAT3/USP2正反馈环路 | NA | 探究去泛素化酶USP2在肝细胞癌进展和肿瘤微环境免疫调节中的作用机制 | 肝细胞癌患者来源类器官、HCC细胞系、动物模型及共培养系统 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、免疫共沉淀、CUT&RUN、ELISA、质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、免疫组化数据、代谢数据 | 肝细胞癌患者类器官、细胞系及动物模型样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序平台 |
| 1692 | 2026-05-22 |
TRIB3 promotes endometrial cancer progression through interacting with E2F1 and enhancing PKM2-mediated tumor glycolysis
2025-11, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.09.008
PMID:40997650
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研究论文 | 探究TRIB3通过与E2F1相互作用并增强PKM2介导的肿瘤糖酵解来促进子宫内膜癌进展的机制 | 首次揭示TRIB3通过稳定E2F1并增强PKM2转录来促进子宫内膜癌的恶性行为和糖酵解,并鉴定出吲达帕胺作为TRIB3的化合物抑制剂 | 未提及具体局限性 | 探究TRIB3在子宫内膜癌中的作用及其潜在机制 | 子宫内膜癌组织和细胞 | 机器学习 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 免疫共沉淀, 双荧光素酶报告实验, 免疫荧光双染, 泛素化实验, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 人类子宫内膜癌和癌旁非肿瘤组织,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1693 | 2026-05-22 |
Smooth muscle expression of RNA editing enzyme ADAR1 controls activation of the RNA sensor MDA5 in atherosclerosis
2025-Oct, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00710-5
PMID:40958051
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研究论文 | 本研究揭示了RNA编辑酶ADAR1在平滑肌细胞中调控RNA传感器MDA5的激活,从而影响动脉粥样硬化的发展 | 首次阐明平滑肌细胞特异性ADAR1表达通过抑制MDA5激活维持血管完整性,限制动脉粥样硬化和钙化,并发现RNA编辑在CAD中的细胞类型特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类队列分析为相关性结果,因果关系需进一步验证 | 探讨ADAR1介导的RNA编辑在冠状动脉疾病和动脉粥样硬化中的作用机制 | 人类动脉粥样硬化斑块、人类冠状动脉平滑肌细胞、条件性SMC特异性Adar敲除小鼠模型 | 机器学习 | 冠状动脉疾病, 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 人类斑块分析、Athero-Express颈动脉内膜切除术队列(具体样本数未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1694 | 2026-05-22 |
A specific gene expression program underlies antigen archiving by lymphatic endothelial cells in mammalian lymph nodes
2025-Sep-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63543-7
PMID:40998762
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研究论文 | 利用单细胞测序与空间转录组学揭示淋巴管内皮细胞在哺乳动物淋巴结中存档抗原的特定基因表达程序 | 首次鉴定出天花板和底板淋巴管内皮细胞具有最长的抗原存档时间,并利用机器学习定义了预测抗原存档能力的独特转录程序 | 未提及具体研究局限性 | 探究淋巴管内皮细胞如何实现持久的抗原存档,以及高抗原水平的淋巴管内皮细胞是否表达独特的转录程序 | 小鼠和人类淋巴结中的淋巴管内皮细胞和树突状细胞 | 机器 | 基孔肯雅病毒感染 | 单细胞测序、空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 小鼠和人类数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1695 | 2026-05-22 |
Single-cell transcriptional analysis of murine mesenteric lymph nodes following oral lyso-phosphatidylserine nanoparticle administration reveals cellular heterogeneity in tolerance features
2025-09, Journal of pharmaceutical sciences
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.xphs.2025.103919
PMID:40712826
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了口服LysoPS纳米颗粒诱导小鼠肠系膜淋巴结耐受特征的细胞异质性 | 首次利用单细胞RNA测序技术解析了含溶血磷脂酰丝氨酸的耐受性纳米颗粒在口服给药后诱导免疫耐受的细胞互作机制,并发现TGF-β信号通路在B细胞、T细胞和NK细胞中调控耐受相关RNA表达 | 未明确LysoPS纳米颗粒在人体中的耐受诱导机制及其长期安全性 | 阐明口服LysoPS纳米颗粒诱导免疫耐受的生物学过程和细胞通讯机制 | 小鼠肠系膜淋巴结中的免疫细胞(B细胞、T细胞和NK细胞) | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肠系膜淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1696 | 2026-05-22 |
A multimorphic variant in ThPOK causes an inborn error of immunity with T cell defects and fibrosis
2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241174
PMID:40392549
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研究论文 | 报道了ThPOK基因新发杂合错义突变导致的首次人类疾病,表现为T细胞缺陷和纤维化 | 首次发现ThPOK基因突变引发人类疾病,揭示ThPOK突变具有多形态活性(反效、无效和新效),不仅影响CD4+ T细胞发育,还意外发现其在TCR激活和成纤维细胞纤维化通路调控中的新角色 | 未提及明确局限性 | 阐明ThPOK基因突变导致人类免疫缺陷病的机制 | 一位携带ThPOK K360N突变患者的临床样本及体外转导的健康人T细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序,慢病毒转导 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者,健康对照T细胞和成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1697 | 2026-05-22 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.24.665575
PMID:40777386
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示多氯联苯对成年小鼠大脑的分子效应 | 首次通过空间转录组学技术系统分析PCB暴露对小鼠五个脑区基因表达的分子特征,并揭示其与血脑屏障完整性的关联 | 未说明具体局限性 | 评估人类相关PCB混合物对大脑功能与认知的影响机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1698 | 2026-05-22 |
Molecular Mechanisms of Intervertebral Disc Degeneration: Significance of SPARC Gene Expression
2025-06-01, Journal of musculoskeletal & neuronal interactions
IF:1.7Q4
PMID:40452200
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研究论文 | 通过生物信息学分析与体外实验探究SPARC基因在椎间盘退变中的作用 | 首次结合单细胞测序数据与体外实验系统揭示SPARC基因在椎间盘退变中的表达上调及其与COL2A1和ACAN表达变化的相关性 | 未明确提及具体局限性 | 探索SPARC基因在椎间盘退变中的分子机制及治疗靶点潜力 | 椎间盘退变相关的髓核细胞 | 机器学习和生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、免疫组化 | NA | 单细胞测序数据、实验数据 | 来自GEO和CNGBdb数据库的单细胞测序数据及体外实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1699 | 2026-05-22 |
Myeloid Fatty Acid Metabolism Activates Neighboring Hematopoietic Stem Cells to Promote Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-May-20, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 揭示髓系脂肪酸代谢通过激活邻近造血干细胞促进射血分数保留的心力衰竭的机制 | 首次发现心肌代谢性HFpEF患者外周血造血干细胞升高,并阐明了髓系脂肪酸代谢通过Vcam1信号调控造血干细胞微环境的新机制 | NA | 阐明射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)中先天性免疫反应及其因果机制 | 患者样本、小鼠模型中的造血干细胞、骨髓细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 质谱分析, 碳标记 | NA | 单细胞基因表达数据, 流式细胞术数据, 代谢数据 | 患者样本和小鼠模型(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1700 | 2026-05-22 |
Disruption of GPSM1/CSF1 signaling reprograms tumor-associated macrophages to overcome anti-PD-1 resistance in colorectal cancer
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010826
PMID:40010765
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研究论文 | 本研究揭示了GPSM1/CSF1信号通路在结直肠癌中调控肿瘤相关巨噬细胞以克服抗PD-1耐药性的机制 | 首次阐明GPSM1通过去泛素化酶USP9X稳定化并激活MEIS3核转位,促进CSF1表达,驱动巨噬细胞向免疫抑制性M2表型极化,从而导致抗PD-1耐药的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本量有限,且未详细探讨其他潜在耐药机制 | 探究GPSM1在结直肠癌肿瘤微环境中对抗PD-1耐药性的调控作用及潜在治疗策略 | 抗PD-1耐药的结直肠癌患者肿瘤样本和C57BL/6小鼠原位结直肠癌异种移植模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 质谱流式细胞术, 流式细胞术, ChIP-PCR, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 抗PD-1耐药结直肠癌患者肿瘤样本及C57BL/6小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |