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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2026-02-05 |
An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression
2025-05-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633
PMID:40408430
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研究论文 | 本研究通过工程化改造疱疹病毒蛋白TIP,使其能够招募LCK激酶直接激活T细胞中的STAT5蛋白,从而在无细胞因子的情况下维持CD8+ T细胞的存活和功能,并增强其在实体瘤中的抗肿瘤效果 | 首次利用工程化的病毒蛋白TIP作为平台,强制招募LCK激酶至STAT蛋白,实现了细胞因子非依赖性的靶向STAT激活,并重编程了T细胞内的信号通路 | 研究主要基于体外和动物模型,其临床转化效果和长期安全性尚未在人体中得到验证 | 旨在克服T细胞疗法中因JAK-STAT信号失调导致的功能受损问题,增强T细胞在实体瘤中的持久性和功能性 | 工程化病毒蛋白TIP、LCK激酶、STAT5蛋白、CD8+ T细胞、实体瘤模型 | 免疫工程、合成生物学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质工程、体内肿瘤模型 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1622 | 2026-02-05 |
A comprehensive analysis of scRNA-Seq and RNA-Seq unveils B cell immune suppression in the AAV-loaded brain
2025-Mar-05, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09609-6
PMID:40044925
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,结合孟德尔随机化分析,揭示了XBP1蛋白通过MDK-NCL配体-受体对及相关基因介导大脑中B细胞免疫抑制的潜在机制 | 首次利用scRNA-seq和RNA-seq数据结合孟德尔随机化分析,识别出XBP1在AAV载体诱导的大脑B细胞免疫抑制中的关键作用,并揭示了MDK-NCL配体-受体对的介导途径 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏体内或体外实验验证,且免疫抑制机制的具体调控网络和通路仍需进一步探索 | 探究AAV载体在大脑中引发的免疫反应,特别是B细胞免疫抑制的机制,以优化脑部基因治疗策略 | AAV载体处理的大脑组织,重点关注免疫细胞(如B细胞、小胶质细胞)及其转录组变化 | 生物信息学 | 神经疾病 | scRNA-seq, RNA-seq, 孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1623 | 2026-02-05 |
A Temporal and Spatial Atlas of Adaptive Immune Responses in the Lymph Node Following Viral Infection
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.635509
PMID:39975238
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为AIR-SPACE的整合方法,结合高分辨率空间转录组学与配对的高保真长读长T/B细胞受体测序,用于解析病毒感染后淋巴结内适应性免疫应答的时空动态 | 开发了AIR-SPACE这一创新方法,首次实现了在原生空间背景下同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库,并构建了病毒感染后淋巴结适应性免疫应答的全面时空图谱 | 研究目前仅应用于小鼠模型和痘苗病毒感染场景,尚未在人类样本或其他病原体感染中得到验证 | 解析病毒感染后淋巴结内适应性免疫应答的时空动态和组织结构 | 小鼠腘窝淋巴结在痘苗病毒感染后的适应性免疫细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学,长读长测序,T/B细胞受体测序 | NA | 空间转录组数据,受体序列数据 | 五个不同时间点的小鼠腘窝淋巴结样本 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 1624 | 2026-02-05 |
Frizzled5 controls murine intestinal epithelial cell plasticity through organization of chromatin accessibility
2025-02-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.10.021
PMID:39579769
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研究论文 | 本研究揭示了Frizzled5(Fzd5)作为Wnt通路受体,通过调控染色质可及性来控制小鼠肠道上皮细胞的可塑性,影响干细胞自我更新和谱系生成 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析,阐明Fzd5通过组织染色质可及性来调控肠道上皮细胞命运,特别是在干细胞和祖细胞中 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本或临床验证,且机制细节仍需进一步探索 | 探究Fzd5在肠道上皮细胞可塑性中的调控作用 | 小鼠肠道上皮细胞,包括Lgr5标记的肠道干细胞和Krt19标记的细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | NA | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1625 | 2026-02-05 |
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633627
PMID:39896613
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研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌的RNA-seq数据,探讨HPV整合对临床预后的影响,并识别相关生物标志物 | 首次基于RNA特征(如HPV-人类融合转录本和HPV基因转录比例)对HPV整合阳性患者进行分类,并揭示其与较差临床结局的关联 | 研究主要依赖RNA数据,DNA整合事件仅来自部分队列,可能未全面覆盖所有整合模式 | 探究HPV整合在头颈癌中的致癌机制及其与临床预后的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 261个HPV相关HNSCC样本(包括bulk和单细胞RNA-seq)及102名HPV阳性参与者的DNA整合事件 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1626 | 2026-02-05 |
The role of mitophagy-related genes in prognosis and immunotherapy of cutaneous melanoma: a comprehensive analysis based on single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Jan-11, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09593-x
PMID:39799269
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法,阐明了线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤预后和免疫治疗中的作用,并开发了一个预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法,构建了一个基于线粒体自噬相关基因的皮肤黑色素瘤预后模型,并揭示了其与免疫微环境及治疗响应的关联 | 研究依赖于公开数据库数据,未进行大规模独立临床队列验证,且模型在外部验证中的泛化能力有待进一步确认 | 阐明线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤中的作用,并开发预后预测模型 | 皮肤黑色素瘤患者的数据及细胞系 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR | 多种机器学习算法(包括但不限于ssGSEA, WGCNA) | 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据,临床数据 | 未明确指定样本数量,但使用了公开数据库中的皮肤黑色素瘤数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1627 | 2026-02-05 |
A novel tumor-progressing fibroblast signature derived from single-cell RNA sequencing enables prognostic stratification and reveals RNF11 as a functional regulator in bladder cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1722809
PMID:41624768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱癌中的癌症相关成纤维细胞,构建了一个基于四个基因的肿瘤进展成纤维细胞风险评分模型,用于预后分层,并验证了RNF11在膀胱癌进展中的功能调节作用 | 整合单细胞RNA测序与批量转录组学数据,构建了一个新的CAF相关预后模型(TPFR),并首次在膀胱癌中功能验证了RNF11作为肿瘤进展调节因子的作用 | 研究样本量相对有限(单细胞数据来自8名患者),且模型验证主要依赖于回顾性队列,需要在前瞻性临床队列中进一步验证 | 开发一个基于癌症相关成纤维细胞分子特征的预后分层模型,以改善膀胱癌患者的风险预测和精准医疗策略 | 膀胱癌患者、膀胱癌细胞系(T24和5637) | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、shRNA敲低、增殖/迁移/侵袭实验、转录组分析 | 非负矩阵分解共识聚类、LASSO-Cox回归、逐步选择模型 | 单细胞RNA测序数据、批量转录组数据 | 单细胞数据:8名BLCA患者;训练队列:359个TCGA-BLCA样本;验证队列:476个E-MTAB-4321样本;细胞实验:T24和5637膀胱癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1628 | 2026-02-05 |
Single-cell transcriptomics reveals mechanisms of Galt gene editing-induced liver injury involving HGF-VEGF-mediated intercellular signaling in mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1729321
PMID:41624789
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研究论文 | 本研究通过构建Galt基因编辑小鼠模型,利用单细胞转录组学揭示了Galt基因编辑诱导肝损伤的分子机制,涉及HGF-VEGF介导的细胞间信号传导 | 首次结合CRISPR/Cas9基因编辑技术与单细胞转录组学分析,系统阐明了Galt基因缺陷通过HGF和VEGF信号通路增强导致肝细胞水肿和肝损伤的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本或临床环境中验证,且机制研究仍处于探索阶段,需要进一步功能实验确认 | 阐明Galt基因编辑诱导肝损伤的分子机制,为半乳糖血症的发病机制提供新见解 | Galt基因编辑小鼠(GAL小鼠)模型 | 单细胞转录组学 | 半乳糖血症 | CRISPR/Cas9基因编辑,单细胞RNA-seq,qRT-PCR,Western blotting,H&E染色 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据,基因表达数据,组织病理学图像 | 未明确指定样本数量,但基于GAL小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1629 | 2026-02-05 |
Adiponectin receptor T-cadherin emerges as a novel regulator of adipose stem cell quiescence and adipogenesis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1734183
PMID:41624791
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析揭示了T-cadherin在脂肪干细胞静息和脂肪生成中的调控作用 | 首次将T-cadherin鉴定为脂肪干细胞中一个具有干细胞特性的独特亚群的调控因子,并阐明其通过DPP4维持干细胞状态的新机制 | 研究主要基于体外实验,未在体内模型中验证T-cadherin的功能;样本来源仅限于人类皮下脂肪组织 | 探究脂肪组织细胞和间充质干细胞的异质性,特别是T-cadherin在脂肪干细胞静息和脂肪生成中的调控作用 | 人类皮下脂肪组织来源的间充质干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 慢病毒转导, 长期活细胞成像, 脂肪生成分化实验 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 未明确样本数量的人类皮下脂肪组织来源MSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1630 | 2026-02-05 |
Commentary: Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1697007
PMID:41624841
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1631 | 2026-02-05 |
Unveiling the IL-1β/CXCL2 axis: a shared therapeutic target in periodontitis and inflammatory bowel disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728773
PMID:41624856
|
研究论文 | 本研究通过整合牙周炎和炎症性肠病的转录组数据,揭示了IL-1β/CXCL2轴作为两种疾病共有的炎症治疗靶点 | 首次整合牙周炎和炎症性肠病的批量与单细胞RNA-seq数据,识别出跨疾病的髓系细胞为中心的IL-1β/趋化因子炎症程序,并验证了IL-1β-CXCL2通路作为潜在治疗靶点 | 功能阻断研究尚未进行,需要进一步实验验证治疗因果关系 | 揭示牙周炎与炎症性肠病之间共享的细胞和分子机制,以寻找共同的治疗靶点 | 牙周炎患者和炎症性肠病患者的转录组数据,以及双炎症啮齿动物模型 | 生物信息学 | 牙周炎和炎症性肠病 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组分析, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 两个牙周炎队列(GSE16134和GSE10334),18个炎症性肠病样本的51,322个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1632 | 2026-02-05 |
Commentary: Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1752400
PMID:41624851
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1633 | 2026-02-05 |
Decoding thymic development: a single-cell atlas of tree shrew immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689906
PMID:41624883
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了树鼩出生后胸腺发育的全面细胞图谱,揭示了其免疫系统在物种间的保守性与特异性 | 首次通过单细胞RNA测序构建树鼩胸腺发育的细胞图谱,并识别出如ZNF683基因在CD8aa细胞发育后期表达等物种特异性变异 | 研究主要关注胸腺细胞,可能未全面覆盖树鼩整个免疫系统的复杂性;样本年龄范围可能限制了对发育全阶段的理解 | 解析树鼩作为临床前哺乳动物模型的免疫系统,特别是胸腺发育过程 | 树鼩的出生后胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及年轻和年老树鼩的胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1634 | 2026-02-03 |
Single-cell analysis of B cell dysregulation in pediatric sepsis stratified by disease severity
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34126-9
PMID:41476192
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了儿童脓毒症患者外周血白细胞,揭示了B细胞在疾病严重程度分层中的关键作用及其耗竭机制 | 首次在儿童脓毒症中应用单细胞RNA测序技术,识别并验证了自然杀伤样B细胞(NKB)等B细胞亚群的耗竭和转录重编程,拓宽了人类脓毒症中B细胞表型的认知 | 样本量较小(仅6名脓毒症患者和4名健康对照),且研究集中在儿科群体,可能限制结果的普遍性 | 探究儿童脓毒症中B细胞耗竭的机制及其与疾病严重程度的关系 | 儿童脓毒症患者(包括轻度和重度)及健康对照的外周血白细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 6名儿童脓毒症患者(3名轻度,3名重度)和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1635 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics and spatial validation reveal dysfunction of keratinocytes and NK cells driving acne development
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34373-w
PMID:41476262
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间免疫荧光技术,揭示了健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮中角质形成细胞与自然杀伤(NK)细胞的功能失调是驱动痤疮发展的关键机制 | 提出了“双重免疫-屏障失衡”的创新病理模型,首次系统阐述了角质形成细胞从防御到异常分化、以及NK细胞从激活到耗竭的时序性功能转变在痤疮进展中的核心作用 | 未明确说明样本的具体数量与人口统计学特征,且空间验证主要依赖免疫荧光技术,可能缺乏更高通量的空间多组学数据支撑 | 阐明痤疮发生发展的细胞与分子机制,为早期诊断和精准干预提供理论基础 | 健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病(痤疮) | 单细胞RNA测序,空间免疫荧光 | 伪时间分析,功能富集分析 | 单细胞转录组数据,空间成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1636 | 2026-02-03 |
VAMP5 promotes glioma progression through bioinformatics analysis clinical correlation and functional validation
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04375-1
PMID:41467924
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、临床关联和功能验证,揭示了VAMP5在胶质瘤进展中的促进作用 | 首次系统性地整合多组学数据(TCGA、GEO、单细胞RNA测序)并结合体外体内实验,全面阐明了VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义、功能角色及免疫调节机制,提出其作为新型预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和细胞系/动物模型,缺乏大规模前瞻性临床队列验证;VAMP5的具体下游信号通路和与免疫微环境相互作用的分子细节仍需进一步探索 | 探究VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义及功能作用,以寻找新的诊断、预后和治疗靶点 | 胶质瘤组织、正常脑组织、胶质母细胞瘤(GBM)细胞系、动物模型 | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、实时定量PCR、免疫组织化学、Western blot、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析、免疫浸润分析、体外功能实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、临床病理数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据、实验数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集及临床样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1637 | 2026-02-03 |
Integrated transcriptomic and single-cell analysis reveals cell cycle dysregulation and cellular heterogeneity in lung cancer
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04303-3
PMID:41467951
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析,揭示了肺癌中细胞周期失调和细胞异质性 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,识别了与临床表型相关的基因模块及细胞周期关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和有限组织样本,未在大型临床队列中进行验证 | 解析肺癌的转录景观和肿瘤微环境中的细胞异质性,以识别潜在治疗靶点和预后生物标志物 | 肺癌组织、邻近正常样本以及A549和H1299肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | WGCNA, 伪时间轨迹分析 | RNA序列数据 | 肺癌组织与邻近正常样本,以及A549和H1299细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1638 | 2026-02-03 |
CCL20 secreted by KRT15high tumor Cells promotes tertiary lymphoid structure formation and enhances anti-PD-1 therapy response in HPV+HNSCC
2025-Dec-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08359-5
PMID:41462011
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研究论文 | 本研究揭示了HPV阳性头颈鳞状细胞癌中KRT15高表达肿瘤细胞通过分泌CCL20促进三级淋巴结构形成,从而增强抗PD-1疗法疗效的机制 | 首次阐明HPV感染通过KRT15高表达肿瘤细胞分泌CCL20促进三级淋巴结构形成的具体机制,并证实其对抗PD-1疗法疗效的增强作用 | 样本量相对有限(59例患者),且机制研究主要在动物模型中进行,需进一步临床验证 | 探究HPV阳性头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构形成的机制及其对抗PD-1免疫疗法疗效的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者组织样本、单细胞测序数据、空间转录组数据及小鼠模型 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq、免疫组织化学、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 59例头颈鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1639 | 2026-02-03 |
Downregulated Expression of the IL7R and BACH2 Genes Is Associated with Immune Memory Loss in Adults Vaccinated Against HBV at Birth
2025-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010047
PMID:41614877
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了出生时接种乙肝疫苗的成年个体中免疫记忆丧失与IL7R和BACH2基因表达下调的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了IL7R和BACH2基因表达下调与乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的关联,为理解免疫记忆机制提供了新视角 | 样本量较小(仅15名参与者),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的分子机制 | 出生时接种乙肝疫苗的成年个体,包括5名无症状HBsAg携带者和10名HBsAg及抗-HBs阴性对照 | 单细胞组学 | 乙肝病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名参与者(5名病例,10名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1640 | 2025-12-29 |
Exploring cellular heterogeneity: single-cell and spatial transcriptomics of Alzheimer's disease brains and iPSC-derived microglia
2025-Dec-28, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01944-y
PMID:41456076
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |