单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1621	2025-03-14	Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth 2025-Mar-13, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322280 PMID:40079140	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析了出生后第一天小鼠主动脉瓣结构的细胞异质性	发现了出生后第一天特有的新型瓣膜内皮细胞亚群和三个未被充分认识的瓣膜间质细胞亚群	研究仅限于出生后第一天的小鼠主动脉瓣，未涵盖其他发育阶段或其他物种	探讨主动脉瓣在出生后成熟过程中结构和功能关系的机制	小鼠主动脉瓣结构	生物医学	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	出生后第一天的小鼠主动脉瓣
1622	2025-03-14	Loss of N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 leads to meiotic prophase abnormalities and male sub-fertility in mice 2025-Mar-13, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf052 PMID:40079145	研究论文	本文研究了N-6腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1（N6AMT1）在小鼠精子发生过程中对减数分裂进展的关键作用	首次揭示了N6AMT1在减数分裂前期中的关键作用，特别是在性染色体失活（MSCI）和DNA双链断裂（DSB）修复中的功能	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨N6AMT1在小鼠精子发生过程中的作用及其对雄性生育能力的影响	小鼠生殖细胞，特别是精母细胞	分子生物学	NA	单细胞RNA-seq，批量RNA-seq	NA	RNA-seq数据	N6amt1基因敲除小鼠及其对照小鼠
1623	2025-03-14	MAP4K4 aggravates microvascular anomalies in diabetic retinopathy in a YTHDF2-dependent manner 2025-Mar-12, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06398-3 PMID:40072537	研究论文	本文探讨了MAP4K4在糖尿病视网膜病变中的微血管异常中的作用及其通过YTHDF2依赖的机制	揭示了MAP4K4通过YTHDF2调控NF-κB信号通路在糖尿病视网膜病变中的新机制	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步的人体临床试验验证	研究MAP4K4在糖尿病视网膜病变中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力	糖尿病视网膜病变患者和小鼠模型	生物医学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	RNA测序数据	8名糖尿病视网膜病变患者和11名非糖尿病个体的视网膜样本
1624	2025-03-14	Intrapancreatic adipocytes and beta cell dedifferentiation in human type 2 diabetes 2025-Mar-12, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06392-9 PMID:40072535	研究论文	本研究探讨了胰腺脂肪沉积与2型糖尿病患者β细胞功能障碍之间的关系	通过组织学和单细胞RNA-seq分析，揭示了胰腺脂肪含量与β细胞去分化之间的空间关系及其对基因表达的影响	样本量较小（50名器官捐献者），且仅基于组织学和生物信息学分析，缺乏功能性实验验证	研究胰腺脂肪与胰岛β细胞功能障碍在2型糖尿病中的相关性	人类胰腺样本（50名器官捐献者，其中15名患有2型糖尿病）	糖尿病研究	2型糖尿病	组织学分析、单细胞RNA-seq、生物信息学分析	NA	组织样本、单细胞RNA-seq数据	50名器官捐献者（15名2型糖尿病患者，35名非糖尿病患者）
1625	2025-03-14	Single-cell RNA sequencing generates an atlas of normal tibia cartilage under mechanical loading conditions 2025-Mar-12, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05234-x PMID:40072674	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）深入探讨了机械负荷对软骨细胞的影响，并生成了正常胫骨软骨在机械负荷条件下的图谱	首次使用单细胞RNA测序技术系统地分析了机械负荷对软骨细胞的影响，并鉴定了不同负荷条件下的关键基因	样本量相对较小，仅涉及6名捐赠者的11个软骨组织样本	研究机械负荷对软骨细胞的影响及其生物学过程	胫骨软骨组织中的软骨细胞	单细胞测序	骨关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	6名捐赠者的11个软骨组织样本，共132,685个细胞
1626	2025-03-14	Heterogeneous cellular responses to hyperthermia support combined intraperitoneal hyperthermic immunotherapy for ovarian cancer mouse models 2025-Mar-12, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adp2124 PMID:40073154	研究论文	本研究探讨了高温腹腔化疗（HIPEC）在卵巢癌中的效果，并通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤和微环境对高温的异质性反应	通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术，揭示了高温下肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞的转录调控机制，并提出了高温与免疫检查点阻断联合治疗的新策略	研究仍处于初步阶段，需要进一步的临床试验验证其效果	探索高温腹腔化疗在卵巢癌治疗中的效果及其与免疫治疗的联合应用	卵巢癌小鼠模型	癌症研究	卵巢癌	单细胞RNA测序, CUT&Tag	小鼠模型	RNA测序数据	NA
1627	2025-03-14	EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses 2025-Mar-12, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkaf004 PMID:40073167	研究论文	本文研究了组蛋白H3赖氨酸27甲基转移酶EZH2在流感感染后记忆B细胞形成中的作用	揭示了EZH2在记忆B细胞分化和功能潜力中的关键表观遗传调控作用	EZH2敲除并未完全有效，表明存在维持EZH2甲基转移酶活性的强烈选择压力	探讨EZH2在记忆B细胞编程和回忆反应中的调控机制	小鼠（Mus musculus）	表观遗传学	流感	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
1628	2025-03-14	CAD manipulates tumor intrinsic DHO/UBE4B/NF-κB pathway and fuels macrophage cross-talk, promoting hepatocellular carcinoma metastasis 2025-Mar-12, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001304 PMID:40073276	研究论文	本文探讨了CAD通过操纵肿瘤内在的DHO/UBE4B/NF-κB通路，促进肝细胞癌（HCC）转移的机制	首次揭示了CAD在HCC转移中的关键作用及其通过DHO/UBE4B/NF-κB通路的具体机制	研究主要基于体外和体内实验，临床应用的直接证据尚需进一步验证	阐明PVTT形成和肿瘤转移的机制，并识别临床干预的潜在靶点	159名HCC患者（包括37例PVTT病例）	肿瘤学	肝细胞癌	代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序	NA	多组学数据	159名HCC患者
1629	2025-03-14	Large-scale dependency and drug screens characterize the therapeutic vulnerabilities of Multiple Myeloma with 1q 2025-Mar-12, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025102 PMID:40073369	研究论文	本研究通过大规模依赖性和药物筛选，系统性地描述了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并展示了其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加	首次系统性地描述了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并揭示了MCL1和PI3K抑制剂在1q+多发性骨髓瘤中的协同作用及其作用机制	研究主要基于体外实验，需要进一步的临床试验验证	开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗	1q+多发性骨髓瘤患者	癌症研究	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
1630	2025-03-14	Single-cell profiling reveals the intratumor heterogeneity and immunosuppressive microenvironment in cervical adenocarcinoma 2025-Mar-11, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.97335 PMID:40066698	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了宫颈腺癌（ADC）与鳞状细胞癌（SCC）在肿瘤免疫微环境和肿瘤异质性方面的差异	首次在单细胞水平上揭示了ADC特有的上皮细胞亚群及其与免疫抑制微环境的相互作用，特别是Epi_10_CYSTM1簇在淋巴结转移预测中的潜在价值	样本量相对较小，仅包括11个ADC样本和4个SCC样本	探讨宫颈腺癌（ADC）与鳞状细胞癌（SCC）在肿瘤免疫微环境和肿瘤异质性方面的差异	宫颈腺癌（ADC）和鳞状细胞癌（SCC）的肿瘤组织	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序、免疫化学、多重免疫荧光	NA	RNA测序数据、免疫化学数据、免疫荧光数据	11个ADC样本和4个SCC样本
1631	2025-03-14	Distinct cellular mechanisms underlie chemotherapies and PD-L1 blockade combinations in triple-negative breast cancer 2025-Mar-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.01.007 PMID:39919737	研究论文	本文通过整合已发表和新生成的单细胞RNA测序数据，研究了三阴性乳腺癌（TNBC）患者在接受紫杉醇（PTX）、白蛋白结合型紫杉醇（Nab-PTX）及其与抗PD-L1抗体阿特珠单抗（ATZ）联合治疗时的肿瘤免疫微环境（TIME）	研究发现，与ATZ加PTX相比，ATZ加Nab-PTX能够重新编程TCF7干细胞样效应记忆CD8 T细胞（Tsem）和CD4 T滤泡辅助细胞（Tfh），并且Nab-PTX还能重塑髓系细胞区室，扩大肥大细胞和促炎性巨噬细胞	研究机制尚未完全明确，需要进一步实验验证	探讨免疫检查点阻断（ICB）与化疗联合治疗三阴性乳腺癌（TNBC）的机制	三阴性乳腺癌（TNBC）患者和小鼠模型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	人类TNBC样本和小鼠模型
1632	2025-03-14	Microglial reprogramming enhances antitumor immunity and immunotherapy response in melanoma brain metastases 2025-Mar-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.01.008 PMID:39919736	研究论文	本文通过临床前模型和单细胞转录组学，揭示了增强黑色素瘤脑转移抗肿瘤免疫的机制	发现激活小胶质细胞中的Rela/NF-κB通路促进黑色素瘤脑转移，并证明靶向该通路可重编程小胶质细胞为促炎表型，增强抗肿瘤免疫	研究主要基于临床前模型，尚未在广泛的患者群体中验证	探索黑色素瘤脑转移的生物学机制及脑免疫微环境在治疗反应中的作用	黑色素瘤脑转移	肿瘤免疫学	黑色素瘤	单细胞转录组学	临床前模型	转录组数据	未明确说明具体样本数量
1633	2025-03-14	ZNF385A was identified as a novel colorectal cancer-related functional gene by analysis of the interaction and immune characteristics of oxidative stress and the inflammatory response 2025-Mar-10, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02024-1 PMID:40064736	研究论文	本研究通过分析氧化应激和炎症反应的相互作用及免疫特性，识别出ZNF385A作为结直肠癌相关的新功能基因	首次发现ZNF385A作为结直肠癌的新型致癌基因，并构建了包含七个特征的预后风险模型	需要进一步研究以验证模型在其他数据集中的普适性及ZNF385A的具体作用机制	探讨氧化应激和炎症反应与结直肠癌的关系，并识别相关功能基因	结直肠癌的单细胞RNA测序数据及肿瘤细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量聚合酶链反应（qPCR）、免疫组化	LASSO-Cox模型	RNA测序数据、临床病理参数	结直肠癌的单细胞RNA测序数据及肿瘤细胞样本
1634	2025-03-14	Integrative single cell transcriptomic analysis reveals 3p deletion associated tumor microenvironment and chemoresistance in head and neck squamous cell carcinoma 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92078-6 PMID:40064955	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了3p缺失与头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境及化疗耐药性的关联	首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，系统分析了3p缺失对HNSCC肿瘤微环境、免疫细胞浸润及治疗反应的影响，并识别出与生存相关的关键基因	研究主要依赖于公开数据库的数据，缺乏实验验证的广泛性	阐明3p缺失对HNSCC肿瘤微环境、免疫细胞浸润及治疗反应的影响，以识别新的治疗靶点	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、Western blotting、CCK8 assay	LASSO算法、Cox回归分析	RNA测序数据、蛋白质表达数据	来自GEO和TCGA数据库的HNSCC患者数据
1635	2025-03-14	Investigating ferroptosis-related genes NFE2L2 in neutrophils for ankylosing spondylitis: therapeutic potential of cassia twigs 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-88775-x PMID:40064975	研究论文	本研究探讨了铁死亡相关基因NFE2L2在中性粒细胞中对强直性脊柱炎的作用，以及中药肉桂在治疗强直性脊柱炎中的潜力	首次结合铁死亡相关基因、单细胞测序数据和中药成分分析，揭示了NFE2L2在强直性脊柱炎中的关键作用及肉桂的治疗潜力	研究主要基于生物信息学分析和分子对接，缺乏体内实验验证	探讨铁死亡与免疫细胞在强直性脊柱炎中的关系，以及中药肉桂的治疗潜力	强直性脊柱炎患者的中性粒细胞和铁死亡相关基因NFE2L2	生物信息学	强直性脊柱炎	单细胞测序、转录组分析、分子对接	机器学习	临床数据、转录组数据、单细胞测序数据	NA
1636	2025-03-14	Identification of potential drug targets for pelvic organ prolapse using a proteome-wide Mendelian randomization approach 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92800-4 PMID:40064973	研究论文	本研究通过蛋白质组范围的孟德尔随机化方法识别了盆腔器官脱垂（POP）的潜在药物靶点	首次使用蛋白质组范围的孟德尔随机化（PW-MR）和贝叶斯共定位分析识别了EFEMP1和MFAP4作为POP的潜在关键药物靶点，并通过单细胞RNA测序数据进一步验证了这些靶点在组织重塑和纤维化相关细胞类型中的表达模式	研究主要基于FinnGen队列的数据，可能需要更多样化的数据来验证结果的普适性	探索盆腔器官脱垂（POP）的新治疗靶点	盆腔器官脱垂（POP）患者	生物信息学	盆腔器官脱垂	蛋白质组范围的孟德尔随机化（PW-MR）、贝叶斯共定位分析、单细胞RNA测序、分子对接分析	NA	蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据	FinnGen队列数据
1637	2025-03-14	Transcriptome combined with single-cell sequencing explored prognostic markers associated with T cell exhaustion characteristics in head and neck squamous carcinoma 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91299-z PMID:40065044	研究论文	本研究通过转录组和单细胞测序技术，探索了头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中与T细胞耗竭特征相关的预后标志物	构建了HNSC的单细胞图谱，深入分析了T细胞的异质性，并揭示了C2 T细胞亚群在HNSC中的耗竭倾向，开发了临床预后模型并识别了相关药物	尽管绘制了T细胞异质性和分化轨迹，但这些亚群之间的相互关系仍不清楚，需要进一步研究以阐明具体的生物过程和分子进化机制	增强HNSC免疫治疗方法的疗效，改善患者预后	头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的T细胞	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞测序，转录组分析	临床预后模型	单细胞数据，转录组数据	NA
1638	2025-03-14	Imbalance of bladder neurohomeostasis by Myosin 5a aggravates diabetic cystopathy 2025-Mar-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-025-01140-6 PMID:40065210	研究论文	本研究探讨了Myosin 5a在糖尿病性膀胱病（DCP）中的潜在调节作用	首次揭示了Myosin 5a在糖尿病性膀胱病中的关键作用及其与膀胱过度活动的关联	研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证	研究Myosin 5a在糖尿病性膀胱病中的潜在调节作用	糖尿病大鼠和Myosin 5a缺陷的DBA小鼠	生物医学	糖尿病性膀胱病	单细胞RNA测序、尿动力学评估、细胞和组织分析	NA	RNA测序数据、尿动力学数据、细胞和组织分析数据	糖尿病大鼠和Myosin 5a缺陷的DBA小鼠
1639	2025-03-14	Tumor Prognostic Risk Model Related to Monocytes/Macrophages in Hepatocellular Carcinoma Based on Machine Learning and Multi-Omics 2025-Mar-10, Biological procedures online IF:3.7Q1 DOI:10.1186/s12575-025-00270-9 PMID:40065214	研究论文	本研究基于机器学习和多组学数据，探索了肝细胞癌中单核细胞/巨噬细胞相关基因表达谱，构建了一个预后模型，并研究了其与药物耐药性和免疫治疗反应的关系	首次基于单核细胞/巨噬细胞相关基因构建了肝细胞癌的预后模型，并验证了其与药物敏感性和免疫治疗反应的关系	样本量较小，仅使用了10个HCC组织活检样本的scRNA-seq数据	构建肝细胞癌的预后模型，并研究其与药物耐药性和免疫治疗反应的关系	肝细胞癌患者	机器学习	肝细胞癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), Western blot, 空间转录组学分析	单基因模型	RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 空间转录组数据	10个HCC组织活检样本，共24,597个细胞
1640	2025-03-14	Prognostic implications and characterization of tumor-associated tertiary lymphoid structures genes in pancreatic cancer 2025-Mar-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06152-8 PMID:40065365	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）中肿瘤相关三级淋巴结构（TA-TLS）基因的表达特征及其预后意义，并构建了基于TLS基因的评分系统和风险模型	首次整合了310名PDAC患者的转录组和临床数据，通过共识聚类识别出三种分子亚型，并构建了基于TLS基因的风险评估模型，进一步通过单细胞RNA测序和免疫组化验证了关键基因的表达	研究主要依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和样本选择的限制	探讨TA-TLS基因在PDAC中的表达特征及其对免疫治疗的影响，以增强PDAC免疫治疗的效果	310名PDAC患者的转录组和临床数据	数字病理学	胰腺癌	转录组分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化（IHC）	LASSO回归模型	转录组数据、临床数据	310名PDAC患者