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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2026-01-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct senotypes and a quiescence-senescence continuum at the transcriptome level following chemotherapy
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653730
PMID:40463227
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研究论文 | 本研究结合延时成像与单细胞RNA测序,揭示了化疗后细胞在转录组水平上存在不同的衰老类型以及静息-衰老连续体 | 首次通过单细胞RNA测序结合延时成像,将异质性细胞周期表型与转录组景观联系起来,并识别出多种衰老类型及两种不同的细胞周期阻滞途径 | 研究仅使用依托泊苷处理,未涵盖其他化疗药物;样本来源和数量未明确说明 | 区分化疗后细胞的静息与衰老状态,并探究其转录组特征 | 化疗处理后的细胞 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,延时成像 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1622 | 2026-01-09 |
ABCC3 Is a Differential Marker of CYP11B2-Negative Zona Glomerulosa Cells in Human Adrenal Cortex
2025-May-07, Endocrine pathology
IF:11.3Q1
DOI:10.1007/s12022-025-09862-3
PMID:40332623
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研究论文 | 本研究揭示了ABCC3作为人类肾上腺皮质中CYP11B2阴性球状带细胞的新型标志物,可用于区分正常肾上腺分区与醛固酮增多症相关的病变 | 首次发现ABCC3与醛固酮合酶CYP11B2在肾上腺球状带细胞中呈反向表达模式,并证明ABCC3可作为特异性区分CYP11B2阴性球状带细胞的标志物 | 研究主要基于组织样本和体外细胞实验,尚未在更大规模的临床队列中验证ABCC3标志物的诊断效能 | 探究ABCC3在人类肾上腺皮质中的表达模式及其在原发性醛固酮增多症中的病理学意义 | 人类肾上腺皮质组织、醛固酮生成腺瘤、皮质醇生成腺瘤、无功能腺瘤、醛固酮生成微结节及培养的人肾上腺皮质细胞 | 病理学 | 原发性醛固酮增多症 | 空间转录组学、免疫荧光共定位、细胞培养、基因表达分析 | NA | 组织样本、细胞样本、基因表达数据 | 多种肾上腺腺瘤样本及相邻肾上腺皮质组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1623 | 2026-01-09 |
YAP Overcomes Mechanical Barriers to Induce Mitotic Rounding and Adult Cardiomyocyte Division
2025-Jan-07, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了YAP5SA如何克服机械障碍,诱导成年心肌细胞进行有丝分裂圆化和分裂 | 揭示了YAP5SA通过克服心肌微环境的机械约束,促进成年心肌细胞重新进入细胞周期并进行分裂的新机制 | 研究主要基于YAP5SA过表达模型,可能未完全反映生理条件下的调控机制 | 探究成年哺乳动物心肌细胞细胞周期停滞的维持机制及YAP诱导的再进入机制 | 成年哺乳动物心肌细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、克隆分析、标记基因分析 | NA | RNA测序数据、功能研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1624 | 2026-01-09 |
Stem Cell Niche: iPSC-Based Assembloids for Modeling Human Hematopoiesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_629
PMID:40459837
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研究论文 | 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞生成模拟骨髓微环境的3D组装体协议,用于研究人类造血调控和疾病建模 | 开发了患者特异性3D骨髓模拟组装体,可精确控制细胞组成和遗传背景,成功模拟了骨髓增殖性肿瘤的关键特征 | NA | 研究人类造血调控机制和骨髓微环境重塑 | 诱导多能干细胞、人类原代间充质基质细胞、骨髓模拟3D组装体 | 数字病理学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1625 | 2026-01-09 |
Pan-Cancer Analysis of Enhancer-Induced PAN3-AS1 and Experimental Validation as a WFDC13-Promoting Factor in Colon Cancer
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069274
PMID:41502505
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析揭示了长链非编码RNA PAN3-AS1的致癌特性,并在结肠癌中实验验证了其通过竞争性结合miR-423-5p促进WFDC13表达的机制 | 首次在泛癌水平系统分析PAN3-AS1的诊断、预后价值及其与免疫微环境的关系,并揭示了增强子活性调控PAN3-AS1表达的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证;药物筛选部分仅为虚拟预测,未进行实验验证 | 探究PAN3-AS1在泛癌中的致癌特性及其在结肠癌中的具体调控机制 | PAN3-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症(特别是结肠癌)中的表达与功能 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞转录组学、染色质免疫沉淀、荧光素酶活性测定、RNA免疫沉淀、虚拟筛选、分子对接 | NA | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1626 | 2026-01-09 |
AGPAT3 Regulates Immune Microenvironment in Osteosarcoma via Lysophosphatidic Acid Metabolism
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.070558
PMID:41502512
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研究论文 | 本研究探讨了AGPAT3通过溶血磷脂酸代谢调控骨肉瘤免疫微环境的作用 | 首次将AGPAT3与骨肉瘤预后及免疫微环境调控联系起来,并发现其通过LPA-TAM-LPAR6轴抑制细胞毒性T细胞功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探索甘油脂代谢在骨肉瘤中的作用及其对免疫微环境的调控机制 | 骨肉瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及免疫细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、LASSO回归、虚拟筛选 | NA | RNA测序数据、单细胞数据 | 来自TARGET数据库的骨肉瘤样本及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1627 | 2026-01-09 |
ETV4-Mediated PD-L1 Upregulation Promotes Immune Evasion and Predicts Poor Immunotherapy Response in Melanoma
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.070180
PMID:41502516
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子ETV4通过上调PD-L1促进黑色素瘤免疫逃逸,并预测免疫治疗反应不良 | 首次发现ETV4作为关键转录因子调控PD-L1表达,介导黑色素瘤免疫逃逸,并可作为免疫治疗反应的预测生物标志物 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肝细胞癌,其他癌症类型中的ETV4功能尚未验证 | 阐明ETV4在肿瘤免疫逃逸中的作用及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 黑色素瘤和肝细胞癌患者样本、肿瘤细胞、免疫细胞及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、功能研究、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但包括黑色素瘤和肝细胞癌患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1628 | 2026-01-09 |
STC2+ Malignant Cell State Associated with EMT, Tumor Microenvironment Remodeling, and Poor Prognosis Revealed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Colorectal Cancer
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.070143
PMID:41502509
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学,在结直肠癌中鉴定出一种与上皮-间质转化、肿瘤微环境重塑及不良预后相关的STC2+恶性细胞亚群 | 整合多组学方法识别了空间富集于肿瘤区域且代谢重编程的STC2+恶性细胞亚群,揭示了其作为信号枢纽及潜在治疗靶点的新作用 | NA | 旨在识别结直肠癌中利用缺氧和果糖代谢等替代代谢途径改变肿瘤微环境的恶性亚群,并解析其细胞间信号网络和空间组织 | 结直肠癌组织样本,包括肝转移样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合分析 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1629 | 2026-01-09 |
ELK4 Promotes Vasculogenic Mimicry in Oral Squamous Cell Carcinoma via Driving DHFR Transcriptional Activation
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069612
PMID:41502523
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研究论文 | 本研究揭示了ELK4通过驱动DHFR转录激活促进口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态形成的机制 | 首次发现ELK4/DHFR轴在口腔鳞状细胞癌血管生成拟态中的关键调控作用,并阐明其表观遗传机制 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 | 阐明口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态的调控机制 | 口腔鳞状细胞癌细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, H3K27ac ChIP-seq, ChIP-qPCR | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 来自TCGA和GEO数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 1630 | 2026-01-08 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies the immunosuppressive spatial niche in KRAS-mutant colorectal cancer
2025-Dec-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013763
PMID:41475845
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了KRAS突变结直肠癌中肿瘤上皮细胞通过MDK_SDC4信号轴招募单核细胞,并与成纤维细胞分泌的胶原相互作用,共同形成免疫抑制空间微环境 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术,系统解析了KRAS突变结直肠癌中免疫抑制空间微环境的形成机制,并识别了关键的细胞间通讯通路 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本量相对有限,可能影响结果的普适性;未进行体内功能实验验证靶点 | 探究KRAS突变结直肠癌的肿瘤微环境异质性,识别免疫抑制空间微环境的形成机制 | KRAS突变结直肠癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Scanpy, Cell2location, CellChat, MISTy, stLearn | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1631 | 2026-01-08 |
Integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics identifies prognostic genes associated with neddylation in colorectal cancer
2025-Dec-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04340-y
PMID:41444773
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别与结直肠癌中neddylation相关的预后基因,并构建了一个三基因预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统分析neddylation相关基因在结直肠癌中的预后价值,并构建了包含PSMD12、PSMB2和FBXL5的新型三基因预后模型 | 研究依赖于公共数据集,缺乏独立的前瞻性队列验证;空间转录组样本量有限,可能影响结果的普适性 | 识别结直肠癌中与neddylation相关的预后基因,以改进治疗策略 | 结直肠癌患者样本,包括单细胞RNA测序、空间转录组和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 | 回归分析,风险模型,列线图模型 | 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 | TCGA-CRC数据集(训练/内部验证,7:3分割),GSE28722(外部验证),GSE132257(scRNA-seq),GSE226997(ST) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1632 | 2026-01-08 |
Identification and experimental validation of biomarkers for acute myeloid leukemia based on single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-23, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102059
PMID:41448409
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和基因调控网络分析,识别并实验验证了急性髓系白血病的生物标志物 | 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法识别AML生物标志物,并通过体外实验验证其功能 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内或临床验证数据 | 识别和验证急性髓系白血病的可靠生物标志物 | 急性髓系白血病相关细胞和基因 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 基因调控网络分析, GSEA富集分析, 细胞转染, 细胞增殖实验, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22,742个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1633 | 2026-01-08 |
PTEN deficiency linked to chromosome 10q loss leads to aggressive NF2 mutant meningioma biology
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.21.695820
PMID:41497607
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研究论文 | 本研究通过分析人类脑膜瘤的RNA测序数据,并结合小鼠模型,揭示了PTEN缺失与YAP1激活共同驱动侵袭性NF2突变脑膜瘤的生物学机制 | 首次在免疫活性小鼠模型中证实PTEN缺失会显著加速YAP1驱动的肿瘤发生,并通过跨物种整合验证了该模型能准确复现侵袭性NF2突变脑膜瘤的转录程序 | NA | 表征侵袭性NF2突变脑膜瘤的生物学特征并探究其驱动机制 | 人类脑膜瘤组织样本及基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1634 | 2026-01-08 |
A Multi-omic Atlas of Human Choroid Plexus in Alzheimer's Disease
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.23.690014
PMID:41394664
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序、空间转录组学、单核ATAC测序和蛋白质组学数据,构建了阿尔茨海默病患者脉络丛的多组学图谱,揭示了其在疾病中的细胞状态转变和功能障碍 | 首次构建了阿尔茨海默病脉络丛的多组学综合图谱,识别了17种细胞状态和三大表型轴,并发现了疾病相关的多细胞信号枢纽 | 样本来源仅限于ROSMAP队列,且未明确探讨这些发现与临床症状进展的直接因果关系 | 阐明脉络丛在阿尔茨海默病病理生理学中的作用和功能障碍机制 | 来自69名ROSMAP参与者的脉络丛组织样本,涵盖正常认知、轻度认知障碍和阿尔茨海默病痴呆 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 单核ATAC测序, 蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质组数据 | 69名ROSMAP参与者的脉络丛样本 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学, 单核ATAC-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1635 | 2026-01-08 |
Formononetin suppresses osteosarcoma by targeting MYO1B and remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Dec, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0284083
PMID:41488589
|
研究论文 | 本研究通过患者来源异种移植模型和单细胞多组学测序,揭示了芒柄花素通过靶向MYO1B和重塑肿瘤免疫微环境来抑制骨肉瘤的分子机制 | 首次在单细胞水平上全面解析了芒柄花素抗骨肉瘤的作用机制,并鉴定出MYO1B为其关键作用靶点 | 研究主要基于PDX模型和体外实验,缺乏大规模临床样本验证 | 探索低毒性抗骨肉瘤新疗法的作用机制 | 骨肉瘤细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞多组学 | 骨肉瘤 | 单细胞多组学测序 | PDX模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 1636 | 2026-01-08 |
Single-cell transcriptome analysis elucidates the microenvironmental interactions between colorectal cancer and sarcopenia
2025-Nov-28, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046084
PMID:41327651
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据,揭示了结直肠癌与肌肉减少症之间共享细胞类型的跨组织功能异质性及其微环境相互作用机制 | 首次结合CRC肿瘤组织和SP肌肉组织的单细胞转录组数据,系统解析跨组织微环境异质性,识别共享核心细胞类型及其功能分化,并发现潜在的全域调控因子 | 样本量相对有限(16个CRC组织和17个SP组织),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 | 阐明结直肠癌与肌肉减少症之间的微环境相互作用机制及其对预后的影响 | 结直肠癌肿瘤组织和肌肉减少症肌肉组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | Harmony(批次效应校正)、CellChat(细胞通讯建模) | 单细胞转录组数据 | 16个CRC肿瘤组织和17个SP肌肉组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 1637 | 2026-01-08 |
Identification of ferroptosis-related therapeutic targets and causal risk factors in aortic dissection via multi-omics integration
2025-Nov-28, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045975
PMID:41327739
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,识别了主动脉夹层中与铁死亡相关的关键基因、调控网络及潜在的因果风险因素 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统探索了铁死亡相关基因在主动脉夹层中的细胞特异性表达模式,并揭示了肠道微生物和血清代谢物与疾病的潜在因果关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;孟德尔随机化分析结果可能受混杂因素影响 | 阐明铁死亡在主动脉夹层发病机制中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 | 主动脉夹层患者与对照组的基因表达数据、单细胞转录组数据、肠道微生物组和血清代谢组数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 | LASSO回归, 受试者工作特征分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联数据, 微生物组数据, 代谢组数据 | 基于公共数据库(GEO)的样本,具体数量未明确说明;涉及211种肠道微生物分类群和1400种血清代谢物的GWAS汇总数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1638 | 2026-01-08 |
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02447-z
PMID:41307600
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研究论文 | 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据,揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂(IRE1/XBP1、ATF6、PERK)作为一个分级调控系统在单细胞分辨率上的动态协调机制 | 引入了臂特异性指标(如Rheostat Index和平衡度)来量化UPR各臂的活动及其协调性,并首次在单细胞水平上描绘了UPR三臂沿谱系轨迹的动态优势切换模式 | 转录组分析仅能推断臂特异性协调,功能验证需要扰动研究和蛋白质水平读数 | 探究胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂是否作为单细胞分辨率的分级控制系统运作 | 胶质母细胞瘤细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发现队列871个细胞,验证队列11,877个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SMART-seq | 10x Chromium单细胞基因表达解决方案,SMART-seq全长单细胞RNA测序技术 |
| 1639 | 2026-01-08 |
Mesothelin-expressing triple-negative breast cancer: a highly invasive and immunosuppressive subtype
2025-Nov-25, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-025-07860-x
PMID:41288782
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研究论文 | 本研究探讨了间皮素(MSLN)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的表达及其与肿瘤侵袭性和免疫抑制微环境的关系 | 首次通过泛癌分析揭示MSLN在TNBC中的重要性,结合空间转录组学和单细胞数据识别MSLN高表达的肿瘤亚群及其特征 | 研究样本量有限,且主要基于局部队列,缺乏大规模多中心验证 | 探究MSLN在TNBC中的临床病理特征及其对治疗反应的影响 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,单细胞数据 | 局部队列及公共单细胞数据,具体样本数未明确 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1640 | 2026-01-08 |
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00996-x
PMID:41174221
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研究论文 | 本研究通过一项随机、双盲、安慰剂对照试验,评估了线粒体自噬诱导剂尿石素A对健康中年成年人免疫系统的影响 | 首次在人体临床试验中证明尿石素A能够调节免疫细胞组成和功能,特别是扩增幼稚样CD8 T细胞并增强其脂肪酸氧化能力 | 样本量较小(50名参与者),干预时间较短(仅4周),且研究对象为健康中年成年人,结果可能不适用于其他人群 | 探究尿石素A是否能够改善与年龄相关的免疫衰退 | 健康中年成年人的外周血免疫细胞 | NA | 老年性疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,单细胞转录组数据 | 50名健康中年成年人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |