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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-12-26 |
Setdb1 ablation in macrophages attenuates fibrosis in heart allografts
2025-Jul, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424534122
PMID:40553495
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了巨噬细胞中Setdb1介导的组蛋白甲基化在心脏同种异体移植物和肿瘤组织纤维化中的关键作用,并提出了靶向FN1与受体相互作用的抗纤维化治疗策略 | 首次在单细胞水平上阐明巨噬细胞中Setdb1通过CCR2-Creb/Setdb1轴调控Fn1表达,进而通过ITGA5和PIRA受体促进纤维化的新机制,并发现该通路在移植排斥和肿瘤免疫排斥中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;纤维化抑制对肿瘤发展的长期影响尚未明确;具体受体信号通路细节需进一步解析 | 探究巨噬细胞中Setdb1介导的组蛋白甲基化在组织纤维化中的作用机制,并开发针对纤维化相关疾病的治疗靶点 | 人类和小鼠的心脏同种异体移植物、肿瘤组织、巨噬细胞、成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量,包含人类和小鼠心脏移植物及肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1622 | 2025-12-26 |
The peripheral Atf3 + neuronal population is responsible for nerve regeneration at the early stage of nerve injury revealed by single-cell RNA sequencing
2025-03-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024169
PMID:39539109
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠背根神经节在神经损伤早期出现的一个表达Atf3的新神经元亚群,该亚群与神经再生密切相关 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出CCI诱导的Atf3高表达神经元亚群,并揭示其作为促再生群体的转录特征及与卫星胶质细胞的细胞间通讯网络 | 研究仅聚焦于损伤后第3天的早期阶段,未涵盖完整的再生过程动态变化 | 探究周围神经损伤后感觉神经元再生状态的转录组变化机制 | 小鼠背根神经节细胞 | 单细胞组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1623 | 2025-12-26 |
High throughput identification of genetic regulators of microglial inflammatory processes in Alzheimer's disease
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.09.642133
PMID:40161839
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞RNA测序,系统探究了阿尔茨海默病GWAS变异如何调控人源诱导多能干细胞衍生小胶质细胞的炎症反应 | 首次将CRISPRi筛选与单细胞RNA测序(CROP-seq)结合,系统鉴定AD遗传风险因子对小胶质细胞炎症状态的调控功能 | 研究主要基于体外诱导的小胶质细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 阐明阿尔茨海默病遗传风险因子对小胶质细胞炎症反应的调控机制 | 人源诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制筛选, 单细胞RNA测序, CROP-seq | CRISPRi筛选模型 | 单细胞转录组数据 | 针对119个AD GWAS位点进行筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1624 | 2025-12-26 |
Identification of Novel Biomarkers and Potential Therapeutic Targets for Systemic Sclerosis: An Integrated Analysis of Plasma Proteome-Wide Mendelian Randomization and Transcriptome
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S561740
PMID:41431733
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研究论文 | 本研究通过整合血浆蛋白质组范围的孟德尔随机化与转录组分析,识别了系统性硬化症(SSc)的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次结合血浆蛋白质组范围的孟德尔随机化与转录组数据,识别出CCL19和LOXL2作为SSc的新型生物标志物,并预测了潜在的治疗副作用 | 研究数据来源于公共数据库,缺乏实验验证,且样本量可能有限 | 识别系统性硬化症的新型生物标志物和潜在治疗靶点,并探索其潜在机制 | 系统性硬化症患者相关的血浆蛋白质和转录组数据 | 生物信息学 | 系统性硬化症 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序(scRNA-seq),差异表达基因分析 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1625 | 2025-12-25 |
Post-Translational Modification Mediated By Acylation Modification Related Genes Induces Immunosuppression and Immunotherapy Resistance in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-26, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000594
PMID:41439580
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研究论文 | 本研究通过构建酰化修饰相关基因的评分系统(AM.score),揭示了其在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的预后价值及与免疫治疗反应的关系 | 首次系统整合11种酰化修饰类型,利用机器学习方法构建AM.score,并验证其在多个独立队列中预测HNSCC患者预后和免疫治疗疗效的能力 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源为公共数据库和内部队列,可能存在选择偏倚 | 探究酰化修饰相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后意义及其与免疫微环境和免疫治疗反应的关系 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | WGCNA、机器学习、scRNA-seq | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个队列(TCGA-HNSCC、GSE41613、GSE42743、GSE65858及内部队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1626 | 2025-12-25 |
Mycn regulates vascular development through PI3K signaling pathway in zebrafish
2025-Dec-24, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70104
PMID:41439407
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和活体成像分析,确认了Mycn在斑马鱼血管生成过程中的表达,并利用基因工程突变体探究了Mycn在血管发育中的关键作用 | 首次在斑马鱼模型中证实Mycn通过PI3K信号通路调控血管发育,揭示了Mycn缺陷导致血管异常的具体机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,未在哺乳动物或人类系统中验证 | 探究Mycn在血管发育中的具体作用机制 | 斑马鱼(Danio rerio) | 发育生物学 | 血管发育异常 | 单细胞RNA测序,活体成像,基因工程突变 | 斑马鱼遗传模型 | RNA-seq数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1627 | 2025-12-25 |
CD146+ CAFs mediate immunosuppression in gastric cancer via COL4A1: potential therapeutic targets
2025-Dec-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013577
PMID:41423274
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出胃癌中一个独特的CD146+癌症相关成纤维细胞亚群,并揭示了其通过JAG1-NOTCH3信号通路促进COL4A1分泌,进而驱动巨噬细胞M2样极化并抑制CD8+ T细胞功能的免疫抑制机制 | 首次在胃癌中鉴定出CD146+ CAFs这一特异性亚群,并系统阐明了其通过JAG1-NOTCH3-CD146-COL4A1信号轴介导免疫抑制的完整分子机制 | 研究样本量相对有限(9对患者匹配组织),且主要聚焦于CD146+ CAFs,其他CAF亚群的作用尚未充分探索 | 识别胃癌中特定的CAF亚群并阐明其介导免疫抑制的分子机制 | 胃癌患者肿瘤组织及癌旁正常组织中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9对患者匹配的肿瘤与癌旁正常组织,共8,322个高质量成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1628 | 2025-12-25 |
Implications of Single-Cell RNA Sequencing in Cervical Cancer: Unravelling the Molecular Landscape
2025-Dec-16, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c06987
PMID:41427221
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在宫颈癌研究中的应用,重点关注方法学进展、关键发现及其对诊断、预后和治疗干预的影响 | 利用单细胞RNA测序技术,在单细胞分辨率下解析宫颈癌肿瘤微环境,识别具有诊断和预后潜力的生物标志物,并发现新的治疗靶点 | NA | 总结单细胞RNA测序在宫颈癌研究中的应用,以改善诊断、预后和治疗策略 | 宫颈癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1629 | 2025-12-25 |
An Anti-Inflammatory and Pro-Angiogenic Porous Aloe Polysaccharide-Collagen Dressing Accelerates Wound Healing
2025-Dec-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c01158
PMID:41329879
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研究论文 | 本研究开发了一种新型多孔芦荟多糖-胶原复合伤口敷料,并通过体内外实验验证其加速伤口愈合的效果 | 首次结合芦荟多糖与胶原蛋白构建多孔复合伤口敷料,并利用单细胞测序技术揭示其调控免疫细胞比例的作用机制 | 未明确说明动物模型的具体类型与样本量细节,长期生物相容性数据有待进一步验证 | 开发具有抗炎促血管生成功能的新型伤口敷料以加速伤口愈合 | 芦荟多糖-胶原复合伤口敷料(AP-CD)及其对伤口愈合过程的影响 | 生物材料与组织工程 | 伤口愈合障碍 | 单细胞测序,扫描电子显微镜,能量色散谱,CCK-8检测,乳酸脱氢酶渗漏率测定 | NA | 显微图像,生化检测数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1630 | 2025-12-25 |
Spatiotemporal trajectory of senescence in mesocarp cell clusters of Hylocereus undatus based on single-cell and spatial transcriptomics
2025-Dec-12, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154672
PMID:41435797
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学,揭示了火龙果中果皮细胞簇在衰老过程中的时空轨迹和功能分化 | 首次通过单细胞RNA测序与空间转录组学结合,精确映射火龙果中果皮四个细胞簇的空间分布和分化轨迹,并揭示其在衰老过程中的功能分工 | 研究主要基于火龙果这一特定物种,结论在其他植物中的普适性有待验证 | 探究火龙果果实衰老过程中中果皮细胞簇的时空分化轨迹和功能 | 火龙果(Hylocereus undatus)果实的中果皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,荧光显微镜 | SingleR, SciBet, CARD, RCTD, SCODE | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1631 | 2025-12-25 |
Distinct expression of CD56 and CD19 marks molecular and functional endotypes of tetanus- versus RBD-specific human bone marrow plasma cells
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf059
PMID:40581803
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研究论文 | 本研究通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序数据,探讨了CD56和CD19在人骨髓浆细胞(BMPC)上的共表达模式,揭示了破伤风类毒素与SARS-CoV-2 RBD特异性BMPC之间的分子和功能差异 | 首次将CD56和CD19的表达差异与抗原特异性BMPC的分子和功能内型联系起来,特别是发现CD56+CD19- BMPC在破伤风特异性群体中富集,而RBD特异性群体则缺乏CD56表达,这为理解浆细胞存活和组织驻留机制提供了新见解 | 研究主要基于流式细胞术和现有scRNA-seq数据,未进行功能性实验验证CD56在组织驻留中的直接作用,且样本来源和数量可能有限 | 探究不同抗原特异性骨髓浆细胞亚群的表型和转录特征,以理解其存活和竞争动态 | 人骨髓浆细胞,包括总BMPC以及破伤风类毒素和SARS-CoV-2 RBD特异性BMPC | 免疫学 | 传染病 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞术数据,scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1632 | 2025-12-25 |
Type 1 regulatory cells suppress T-cell cytotoxicity to alleviate liver injury during acute hepatitis B virus infection in mice
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf229
PMID:40925590
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠急性HBV感染模型,利用单细胞RNA测序揭示了HBsAg特异性CD4+ T细胞的异质性,并发现Tr1细胞通过IL-10介导的机制抑制T细胞毒性,从而减轻肝脏免疫病理损伤 | 首次在急性HBV感染模型中,通过单细胞RNA测序技术系统性地表征了HBsAg特异性CD4+ T细胞的功能亚群,特别是明确了Tr1细胞通过IL-10调节T细胞毒性以保护肝脏免受免疫病理损伤的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能无法完全直接转化到人类HBV感染;主要关注急性感染阶段,对慢性感染的调控机制未涉及;IL-10的具体作用通路和靶细胞有待进一步阐明 | 探究急性HBV感染期间调节T细胞反应以避免免疫病理损伤的机制 | 小鼠急性HBV感染模型中的HBsAg特异性CD4+ T细胞亚群,特别是Tr1细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,水动力注射,腺病毒载体递送 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1633 | 2025-12-25 |
Transcriptional states of lung cancer microenvironment reveal macrophage subtype dynamics linked to disease progression
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf253
PMID:40972001
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据集,对肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞亚型进行了精细分类,揭示了脂质相关巨噬细胞亚型在疾病进展中的动态变化及其与预后的关联 | 结合细胞基因评分与层次分类方法,定义了7种具有不同转录程序和丰度的巨噬细胞亚型,特别是发现了脂质相关TAMs随疾病进展扩张并具有免疫抑制和促肿瘤特征,而组织驻留巨噬细胞减少 | 空间转录组分析依赖于去卷积技术推断细胞类型组成,对于TAMs的精细亚群,准确的基因表达特征至关重要,这可能引入推断偏差 | 解析肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞的多样性和功能特化,以揭示其与疾病进展和预后的关系 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌患者样本中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 来自大型癌症队列的数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1634 | 2025-12-25 |
Single-cell analysis of differential fat deposition in chicken pectoral muscle and abdominal fat tissues
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105938
PMID:41108936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了固始鸡胸肌和腹部脂肪组织的细胞类型和分子特征,揭示了脂肪沉积的组织特异性差异 | 首次在固始鸡中应用单细胞RNA测序技术比较胸肌和腹部脂肪组织的细胞类型特异性基因表达,并验证了G0S2基因在腹部脂肪细胞中的特异性促脂肪生成作用 | 研究仅针对2周龄鸡的组织样本,未涵盖其他发育阶段;样本量有限,且仅针对固始鸡一个品种 | 探究固始鸡胸肌和腹部脂肪沉积的机制差异 | 固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 2周龄固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1635 | 2025-12-25 |
Decoding the B-cell immune landscape in duck hepatitis A virus type 3 through single-cell genomics
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105929
PMID:41056664
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和B细胞受体分析,解码了鸭甲型肝炎病毒3型感染下小鼠脾脏B细胞的免疫景观 | 创新性地识别了一个新的IGHV1种系克隆IGHV1-20,并发现了一个新的B细胞亚群Gm37915+ B细胞与Nuggc+ B细胞之间增强的细胞通讯趋势 | 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映鸭或其他物种中的免疫反应,且样本量未明确说明 | 探索DHAV-3免疫机制并识别潜在治疗靶点 | 用DHAV-3免疫的小鼠脾脏B细胞 | 单细胞基因组学 | 鸭病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),B细胞受体(BCR)文库分析 | NA | 单细胞基因表达数据,BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1636 | 2025-12-25 |
Single-cell transcriptome analyses reveal disturbed decidual microenvironment in women of advanced maternal age
2025-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70541
PMID:41407538
|
研究论文 | 本研究通过整合组织学、类器官模型和高分辨率单细胞RNA测序,揭示了高龄产妇蜕膜微环境的病理重塑特征 | 首次提供了高龄产妇人类蜕膜的单细胞图谱,并鉴定出PRR15-TGF-β轴这一新的调控通路 | 研究样本仅限于孕早期蜕膜组织,未涵盖整个妊娠期变化 | 表征高龄产妇的蜕膜微环境,以确定关键病理变化和调控通路 | 高龄产妇和适龄产妇的孕早期蜕膜组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高龄产妇和适龄产妇的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 1637 | 2025-12-23 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema"
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70723
PMID:41424021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1638 | 2025-12-25 |
Roxadustat enhances inflammation and metabolic reprogramming in human leukocytes by affecting oxygen sensing
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf167
PMID:40796302
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研究论文 | 本研究探讨了罗沙司他对人类外周血单个核细胞的影响,重点关注其通过影响氧感应机制增强炎症反应和代谢重编程的作用 | 首次在临床相关浓度下系统评估罗沙司他对人类PBMCs的免疫调节作用,结合单细胞RNA测序揭示白细胞亚群动态变化,并模拟炎症性缺氧条件探索联合效应 | 研究主要基于体外实验,未在体内模型或患者中验证;样本量有限;未长期观察罗沙司他的免疫效应 | 探究HIF稳定剂罗沙司他对循环白细胞免疫活性和代谢的影响 | 人类外周血单个核细胞(PBMCs) | 免疫学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序,蛋白质和基因表达分析,氧消耗和细胞外酸化率测定 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1639 | 2025-12-25 |
Phylogenomic Analysis of Deep-Branching Telonemid
2025-Nov-28, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf202
PMID:41157959
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序和系统基因组分析,探讨了Telonemia门中TEL2亚群新物种对真核生物超群演化关系的影响 | 首次从太平洋远洋中分离出Telonemia门TEL2亚群的单细胞,并利用单细胞转录组测序数据填补了该门系统基因组数据的空白 | 贝叶斯分析未能收敛于特定拓扑结构,且不同数据子集分析结果存在不一致性,表明演化关系仍不稳定 | 研究Telonemia门与SAR超群及其他稀疏采样真核生物超群(如Hemimastigophora、Provora、Haptista)的演化关系 | Telonemia门中的TEL2亚群单细胞样本 | 系统基因组学 | NA | 单细胞转录组测序、系统基因组分析、最大似然法、贝叶斯分析 | NA | 转录组序列数据 | 1个从太平洋远洋分离的Telonemia门TEL2亚群单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1640 | 2025-12-25 |
Injury-induced connexin 43 expression regulates endothelial wound healing
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00153.2025
PMID:41060772
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研究论文 | 本研究揭示了机械损伤诱导连接蛋白43(Cx43)上调,并通过间隙连接介导的细胞间通讯促进内皮细胞迁移和增殖,从而加速血管损伤后的伤口愈合 | 首次证明大动脉内皮机械损伤可诱导间隙连接蛋白Cx43表达,并阐明其磷酸化依赖的调控机制在内皮愈合中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类血管组织中得到验证;单细胞测序样本量相对有限(10,829个细胞) | 探究Cx43在血管内皮损伤修复中的分子机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 血管疾病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | 基因敲除小鼠模型,点突变小鼠模型 | 基因表达数据 | 10,829个细胞(来自野生型和Cx43敲除小鼠的损伤颈动脉) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |