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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2026-05-27 |
Recurrent Composite Markers of Cell Types and States
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549344
PMID:37503180
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research paper | 提出RECOMBINE算法，用于识别重复的复合标记集，以定义和区分层次细胞身份 | RECOMBINE是一种新的算法，能够从单细胞数据中识别重复的复合标记集，相比传统差异基因表达分析等方法，在识别区分性标记方面具有更高准确性，并能在空间转录组学数据中验证 | 标题和摘要未提及局限性 | 开发一种算法，识别可解释的复合标记集，以定义和区分层次细胞类型和状态 | 小鼠视觉皮层、CD8+ T细胞状态、小鼠肠道罕见亚群、来自Tabula Sapiens项目的人类组织 | machine learning | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | RECOMBINE算法 | 基因表达数据 | 小鼠视觉皮层样本、小鼠肠道样本、多种人体组织样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1622 | 2026-05-27 |
Dynamic single-cell transcriptomic reveals the cellular heterogeneity and a novel fibroblast subpopulation in laryngotracheal stenosis
2025-03-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00639-6
PMID:40165307
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研究论文 | 通过对喉气管狭窄大鼠模型进行动态单细胞转录组分析，揭示了细胞异质性和一种新的成纤维细胞亚群 | 首次对喉气管狭窄进行动态单细胞RNA测序，发现了新的软骨细胞损伤相关成纤维细胞亚群（CIRF），并揭示了其潜在起源和转化机制 | 研究基于大鼠模型，结果需在人类样本中验证；未深入探讨CIRF的功能机制 | 阐明喉气管狭窄发展过程中的细胞异质性和分子机制 | 喉气管狭窄大鼠模型在不同时间点的喉气管组织 | 数字病理学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的喉气管组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 动态单细胞RNA测序 |
| 1623 | 2026-05-27 |
Exploring the mechanisms of PANoptosis in osteoarthritis and the therapeutic potential of andrographolide through bioinformatics and single-cell analysis
2025-03-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00629-8
PMID:40165317
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研究论文 | 通过生物信息学和单细胞分析探索骨关节炎中PANoptosis的机制及穿心莲内酯的治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序分析骨关节炎中PANoptosis相关基因的表达，并预测穿心莲内酯作为潜在治疗药物 | 仍缺乏对PANoptosis基因的详细分析及治疗药物的探索 | 探索骨关节炎中PANoptosis的机制及穿心莲内酯的治疗潜力 | 骨关节炎软骨中的PANoptosis相关基因及关键细胞群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1624 | 2026-05-27 |
Identification of druggable targets in acute kidney injury by proteome- and transcriptome-wide Mendelian randomization and bioinformatics analysis
2025-03-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00631-0
PMID:40148878
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研究论文 | 通过蛋白质组和转录组孟德尔随机化及生物信息学分析，确定急性肾损伤的可药物靶点 | 整合多组学孟德尔随机化方法，结合批量转录组和单细胞转录组数据，系统性识别急性肾损伤的潜在治疗靶点并探索药物再利用机会 | 未在更大队列或不同种族中验证，且药物再利用分析需进一步实验验证 | 利用遗传数据和多组学分析，寻找急性肾损伤的可药物靶点及药物再利用潜力 | 急性肾损伤患者相关蛋白质和基因表达数据 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 孟德尔随机化、全转录组关联分析、单细胞转录组学 | NA | 遗传数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1625 | 2026-05-27 |
Developmental molecular signatures define de novo cortico-brainstem circuit for skilled forelimb movement
2025-Mar-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6150344/v1
PMID:40196004
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研究论文 | 本研究识别出一种先前未被发现的直接皮层-脑干回路，该回路在发育早期形成并持续至成年，通过单细胞RNA测序和功能沉默实验证实其在前肢精细运动中的关键作用 | 首次发现并定义了发育中通过神经肽Y（Npy）标记的皮层-脑干神经元（CBN），揭示了其不延伸至脊髓而直接投射至脑干的独特发育特征 | 未提及具体局限性 | 探究皮层向脑干投射在精细运动控制中的功能及发育分子机制 | 小鼠皮层-脑干神经元（CBN），特别是表达Npy的神经元亚群 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选（FACS）、功能沉默（化学遗传学） | NA | 转录组数据 | NA（未具体说明样本量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1626 | 2026-05-27 |
Prognostic and immunological implications of protein kinases in gastric cancer: a focus on hub gene ABL2 and its impact on the polarization of M2 macrophages
2025-03-24, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00636-9
PMID:40128818
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研究论文 | 通过分析胃癌中蛋白激酶的转录谱，鉴定出DE-KGs模型并揭示核心基因ABL2通过调节M2巨噬细胞极化促进胃癌进展 | 首次基于101种机器学习算法组合构建最优DE-KGs模型，并整合多组学数据及体外实验验证核心基因ABL2在胃癌免疫微环境中的关键作用 | 未提供临床试验编号，研究基于公共数据库且缺乏体内实验验证，具体机制仍需深入探索 | 探索胃癌中蛋白激酶的综合特征及其临床意义，评估DE-KGs模型对患者预后和免疫治疗反应的预测价值 | 胃癌患者的转录组数据、单细胞RNA-seq数据及细胞样本 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外实验 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | 基于GEO和TCGA数据库的胃癌患者样本，具体数量未提及 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1627 | 2026-05-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals a new mechanism of endothelial cell heterogeneity and healing in diabetic foot ulcers
2025-03-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00628-9
PMID:40121493
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术深入分析糖尿病足溃疡患者足部皮肤细胞异质性和内皮细胞转录组特征，揭示内皮细胞异质性及愈合的新机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示糖尿病足溃疡中内皮细胞异质性的新机制，并实验验证SH3BGRL3基因在高糖条件下促进内皮细胞增殖、迁移和血管生成能力的作用 | 未明确指出局限性 | 识别与糖尿病足溃疡愈合和进展相关的关键细胞群体和基因，探索新的治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者足部皮肤的内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1628 | 2026-05-27 |
Macrophage-derived SPP1 exacerbate myocardial injury by interacting with fibroblasts in viral myocarditis
2025-03-14, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00621-2
PMID:40087693
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析病毒性心肌炎急性期巨噬细胞亚群，发现SPP1+巨噬细胞通过分泌SPP1与成纤维细胞相互作用，加剧心肌损伤 | 首次揭示SPP1+巨噬细胞在病毒性心肌炎中通过自我招募及与成纤维细胞互作加重心肌免疫损伤的机制 | 未明确提及研究局限性 | 阐明病毒性心肌炎的免疫病理机制，探索潜在免疫治疗靶点 | CVB3诱导的病毒性心肌炎小鼠模型的心脏组织及巨噬细胞 | 机器学习 | 病毒性心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠心脏组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'（根据单细胞RNA-seq方法推测） |
| 1629 | 2026-05-27 |
Pharmacological activation of STAT1-GSDME pyroptotic circuitry reinforces epigenetic immunotherapy for hepatocellular carcinoma
2025-03-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332281
PMID:39486886
|
研究论文 | 本研究揭示通过药理激活STAT1-GSDME焦亡环路增强肝细胞癌的表观遗传免疫治疗 | 首次发现选择性HDAC抑制剂CXD101通过增强IFNγ响应基因的染色质可及性和H3K27高乙酰化，协同ICB激活STAT1驱动的抗肿瘤免疫，并促进GSDME介导的焦亡，形成自我强化的STAT1-GSDME焦亡环路 | NA | 识别与免疫检查点阻断（ICB）耐药相关的可药物组蛋白去乙酰化酶（HDAC），并开发易于转化的肝细胞癌（HCC）联合治疗方案 | 肝细胞癌患者肿瘤细胞中的HDAC亚型表达及ICB耐药相关机制 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 单细胞转录组, 表观基因组数据 | 来自pembrolizumab试验（NCT03419481）的HCC患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序用于单细胞RNA测序和单细胞多组学分析 |
| 1630 | 2026-05-27 |
Integration of lipidomics with targeted, single cell, and spatial transcriptomics defines an unresolved pro-inflammatory state in colon cancer
2025-03-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332535
PMID:39658263
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研究论文 | 通过整合脂质组学、靶向分析、单细胞转录组学和空间转录组学，揭示结肠癌中存在未解决的促炎状态 | 首次通过脂质类转换缺陷解释结直肠癌中脂质失调的机制，并提出“消退医学”作为新的治疗方向 | 未提及 | 探索结直肠癌中脂质失调是否由炎症消退失败驱动 | 人类结直肠癌组织及其配对正常样本 | 计算病理学 | 结直肠癌 | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS），定量逆转录PCR，大规模基因表达分析，空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 脂质组学数据，基因表达数据，空间转录组数据，单细胞转录组数据 | 40对（非靶向分析）和81对（靶向定量分析）人类结直肠癌及正常配对样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 1631 | 2026-05-27 |
Single-cell RNA sequencing in ovarian cancer: Current progress and future prospects
2025-03, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2025.01.002
PMID:39778630
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序在卵巢癌发展、异质性、肿瘤微环境和治疗耐药性研究中的应用，并探讨了其局限性和未来方向 | 首次综合比较和总结了多项利用scRNA-seq研究卵巢癌的研究成果，填补了该领域缺乏全面综述的空白 | 可能受限于现有研究的样本量和scRNA-seq技术的固有局限性，如细胞捕获效率和测序深度 | 总结scRNA-seq在卵巢癌研究中的发现，评估其应用前景 | 卵巢癌相关的scRNA-seq研究文献和数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1632 | 2026-05-27 |
Causal differential expression analysis under unmeasured confounders with causarray
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635593
PMID:39975097
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研究论文 | 提出了causarray，一种用于分析基于阵列的基因组数据的双重稳健因果推断框架，能够在单细胞和批量细胞水平上进行因果差异表达分析 | 引入广义混杂因子调整方法以处理未测量的混杂因素，并结合半参数推断与灵活的机器学习技术，提供稳健的治疗效应统计估计 | 未明确说明局限性，但可能依赖数据质量和模型假设 | 解决观测基因组数据中因选择偏差和未测量混杂因素导致的因果推断挑战 | 基于阵列的基因组数据（批量细胞和单细胞水平） | 机器学习 | 自闭症、阿尔茨海默病 | 单细胞测序、CRISPR、批量RNA-seq | 双重稳健因果推断模型、机器学习技术 | 基因表达数据 | 两个单细胞基因组研究：小鼠大脑发育中的自闭症风险基因（体内Perturb-seq）和三个阿尔茨海默病人脑转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1633 | 2026-05-27 |
TNBC response to paclitaxel phenocopies interferon response which reveals cell cycle-associated resistance mechanisms
2025-02-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82218-9
PMID:39905117
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research paper | 本研究通过实验与计算结合的方法，揭示了三阴性乳腺癌对紫杉醇的反应中干扰素应答的模拟现象及细胞周期相关的耐药机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示紫杉醇诱导的先天免疫程序上调与干扰素应答相似，并鉴定出FOSL1、NFE2L2和ELF3等转录因子在细胞周期调控和核结构中的新作用，提出ELF3作为紫杉醇耐药的潜在生物标志物 | 研究主要基于体外TNBC细胞系和水晶成像实验，缺乏体内模型和临床样本验证，且功能验证仅限于siRNA敲降，未探索CRISPR或药物抑制等正交方法 | 探索紫杉醇对三阴性乳腺癌细胞在细胞和分子水平上的影响，并解析其耐药机制 | 三阴性乳腺癌（TNBC）细胞系及公开乳腺癌患者数据 | machine learning | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, siRNA敲降, 活细胞成像 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 活细胞成像数据 | 体外TNBC细胞系实验，公开数据集包括患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒用于单细胞RNA测序 |
| 1634 | 2026-05-27 |
Microbiota-induced S100A11-RAGE axis underlies immune evasion in right-sided colon adenomas and is a therapeutic target to boost anti-PD1 efficacy
2025-01-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332193
PMID:39251326
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研究论文 | 本研究揭示了微生物群诱导的S100A11-RAGE轴在右侧结肠腺瘤中参与免疫逃逸，并可作为增强抗PD1疗效的治疗靶点 | 首次通过单细胞和空间转录组学解析右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌移位，进而激活S100A11-RAGE轴促进免疫逃逸的机制，并发现靶向该轴可提升免疫治疗效果 | 未提及具体局限性信息 | 表征左右侧结肠腺瘤的差异及其在早期结肠肿瘤发生中的作用机制 | 左右侧结肠腺瘤组织、细胞、动物模型及临床标本 | 数字病理学, 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 包含单细胞和空间转录组数据集分析，以及细胞、动物实验和临床标本验证 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1635 | 2026-05-27 |
The loss of dNK1/2 and EVT1 cells at the maternal-fetal interface is associated with recurrent miscarriage†
2025-01-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae136
PMID:39303127
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研究论文 | 通过单细胞测序分析复发性流产患者与健康供体的母胎界面细胞，发现dNK1/2和EVT1细胞缺失是该疾病的显著病理特征 | 首次鉴定出表达dNK1和dNK2双标志物的新亚群dNK1/2，并发现其在复发性流产组织中完全缺失；同时将绒毛外滋养细胞分为EVT1和EVT2亚群，揭示EVT1缺失与复发性流产的关联 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量较小或缺乏功能验证实验 | 识别复发性流产组织中细胞特征的异常，为理解该疾病提供新见解 | 复发性流产患者与健康供体的母胎界面组织细胞（包括蜕膜自然杀伤细胞和绒毛外滋养细胞亚群） | 单细胞测序、免疫学、生殖医学 | 复发性流产 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 复发性流产患者和健康供体样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1636 | 2026-05-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals common interactions between follicle immune cells and granulosa cells in premature ovarian insufficiency patients†
2025-01-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae157
PMID:39513542
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者卵泡免疫细胞与颗粒细胞之间的共同相互作用 | 首次在单细胞水平上分析POI、正常卵巢储备和高级母龄女性的卵泡微环境，发现VEGFA-FLT1相互作用的缺失可能与颗粒细胞衰老和炎症相关 | 样本量较小（共9名女性），且仅针对首次穿刺的卵泡，可能无法完全代表整体卵泡微环境 | 探究早发性卵巢功能不全患者的卵泡微环境特征，并寻找潜在治疗靶点 | 早发性卵巢功能不全患者、正常卵巢储备女性及高级母龄女性的卵泡细胞 | 数字病理学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名女性（3名POI患者、3名正常卵巢储备者、3名高级母龄者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1637 | 2026-05-25 |
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-Sep-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.024
PMID:40412386
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研究论文 | 通过构建三维血管化胰岛类器官，改善多能干细胞来源的胰岛细胞功能成熟度 | 首次将血管内皮细胞和成纤维细胞与干细胞来源胰岛细胞组装成三维血管化类器官，并在微流控装置中实现灌注；揭示血管通过形成胰岛样基底膜和BMP信号通路促进β细胞功能成熟 | 未提及具体局限性 | 研究血管化对干细胞来源胰岛类器官功能成熟的影响及其机制 | 人干细胞来源的胰岛细胞、人原代内皮细胞、成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1638 | 2026-05-25 |
Association of DNA damage response signals and oxidative stress status with nivolumab efficacy in patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03032-2
PMID:40410274
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研究论文 | 评估头颈部鳞状细胞癌患者外周血单核细胞中DNA损伤反应信号与氧化应激状态对纳武利尤单抗疗效的关联 | 首次在HNSCC患者中研究基线PBMCs中DDR相关信号和氧化应激状态与免疫检查点抑制剂疗效的关联，并利用空间转录组学分析肿瘤、白细胞和巨噬细胞三个分子定义的组织区室 | 样本量较小（26例健康对照和50例患者），且未提及外部验证队列，结果需进一步验证才能作为非侵入性生物标志物 | 检验基线HNSCC患者PBMCs中DDR相关信号与免疫检查点抑制剂（纳武利尤单抗）反应相关的假说 | 26例健康对照和50例复发性/转移性头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、血液样本数据 | 26例健康对照和50例复发性/转移性HNSCC患者 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析肿瘤、白细胞和巨噬细胞三个组织区室 |
| 1639 | 2026-05-25 |
Down-regulation of IGFBP2 mediates endometrial epithelial cells senescence in thin endometrium
2025-07-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf032
PMID:40700608
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现，薄型子宫内膜中IGFBP2表达下调导致子宫内膜上皮细胞衰老，并揭示了其通过PI3K/AKT信号通路调控PTEN活性的机制 | 首次阐明IGFBP2下调通过PTEN/PI3K/AKT通路介导子宫内膜上皮细胞衰老，并在体内外模型中验证重组IGFBP2蛋白抗衰老效果优于传统药物达沙替尼 | 未明确IGFBP2上游调控机制；小鼠模型与人类TE病理差异需进一步验证 | 阐明薄型子宫内膜中IGFBP2调控上皮细胞衰老的分子机制及治疗潜力 | 人类原代子宫内膜上皮细胞、Ishikawa细胞系、薄型子宫内膜小鼠模型 | 数字病理学 | 子宫内膜相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 薄型子宫内膜和正常对照组织的单细胞RNA测序数据；小鼠模型数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1640 | 2026-05-25 |
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.647417
PMID:40568142
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和活细胞成像，揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的分子特征及其主动运动功能 | 首次证明前庭动纤毛具有初级纤毛和运动纤毛的双重分子身份，并发现其能自发产生运动，挑战了传统认为动纤毛仅为感觉结构的观点 | 未详细说明成像技术的分辨率限制及跨物种比较中可能存在的差异 | 阐明前庭动纤毛的结构、分子组成和功能特征 | 成年小鼠、斑马鱼、牛蛙和人类的前庭毛细胞及动纤毛 | 分子生物学, 细胞生物学 | 前庭疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 成年小鼠和人类的前庭毛细胞（未明确具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |