单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10496 篇文献，本页显示第 1601 - 1620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1601 | 2025-11-27 |
Rewiring the transcriptome: diagnostic and therapeutic implications of alternative splicing in solid cancers
2025-Nov-26, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11302-8
PMID:41296088
|
综述 | 本文综述了实体瘤中可变剪接的分子机制、临床意义及治疗策略 | 系统整合了可变剪接在癌症诊断和治疗中的最新进展，强调剪接衍生新抗原和靶向治疗策略的创新性 | 存在剪接异质性、脱靶效应和蛋白质水平验证不完整等临床转化挑战 | 探讨可变剪接在实体瘤中的诊断和治疗意义 | 实体瘤（包括乳腺癌、前列腺癌、肺癌、结直肠癌和中枢神经系统肿瘤） | 生物医学 | 实体瘤 | 长读长测序、单细胞转录组学、蛋白质基因组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1602 | 2025-11-27 |
Tumor microenvironment-mediated immune evasion and resistance in prostate cancer: mechanisms, cross-talk, and therapeutic opportunities
2025-Nov-26, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01944-0
PMID:41296089
|
综述 | 本文系统分析前列腺癌免疫抑制性肿瘤微环境的组成机制及其介导的免疫逃逸与治疗抵抗，并探讨相关精准治疗策略 | 整合单细胞RNA测序、空间多组学等高维技术重新定义肿瘤-免疫-基质相互作用机制 | NA | 阐明前列腺癌免疫抑制微环境机制并探索精准治疗机会 | 前列腺癌肿瘤微环境中的细胞、基质和分子成分 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间多组学, 高维成像技术 | NA | 多组学数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间多组学 | NA | NA |
| 1603 | 2025-11-27 |
Prognostic and therapeutic response prediction in glioblastoma multiforme using a lactylation-associated gene signature
2025-Nov-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04017-6
PMID:41296151
|
研究论文 | 本研究通过分析乳酸化相关基因构建了胶质母细胞瘤预后预测模型 | 首次建立了基于乳酸化相关基因的胶质母细胞瘤预后特征模型，并揭示了乳酸化在不同免疫细胞亚型中的差异分布 | 研究基于回顾性队列数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索乳酸化修饰在胶质母细胞瘤进展中的功能作用并建立预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织和正常组织 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 基因表达分析，LASSO回归分析，单细胞测序 | LASSO回归模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | CGGA队列中的胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1604 | 2025-11-27 |
Integrated analysis identifies conserved transcription factors TCF12, E2F1, and TEAD4 with diagnostic and therapeutic value in osteoarthritis subchondral bone
2025-Nov-26, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01704-0
PMID:41296172
|
研究论文 | 通过整合分析鉴定出在骨关节炎软骨下骨中具有诊断和治疗价值的保守转录因子TCF12、E2F1和TEAD4 | 首次通过跨物种整合分析鉴定出三个保守转录因子在骨关节炎软骨下骨重塑中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 识别驱动骨关节炎进展的关键分子靶点和转录因子 | 人类骨关节炎患者、大鼠骨关节炎模型和小鼠DMM模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, sc-RNA seq, 免疫荧光, qPCR | NA | 基因表达数据 | 人类OA患者和大鼠OA模型的RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1605 | 2025-11-27 |
Development and validation of a cuproptosis-related gene signature for predicting prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2025-Nov-26, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04132-4
PMID:41296174
|
研究论文 | 开发并验证了一个基于铜死亡相关基因的胃癌预后预测模型 | 首次构建了基于铜死亡相关基因的胃癌预后模型，并评估了其对化疗和免疫治疗反应的预测价值 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 构建胃癌预后预测模型并评估其临床实用性 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，qRT-PCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌患者样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1606 | 2025-11-27 |
Tumor microenvironment-driven drug resistance in urologic cancers: mechanisms and therapeutic targets
2025-Nov-26, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01710-2
PMID:41296173
|
综述 | 探讨泌尿系统肿瘤微环境驱动耐药性的机制及治疗靶点 | 系统阐述肿瘤微环境中不同组分（如CAFs、ECM、免疫抑制细胞和缺氧条件）通过多重机制介导泌尿系统癌症耐药性，并提出整合单细胞/空间转录组学等新技术的研究方向 | NA | 解析泌尿系统肿瘤微环境介导治疗耐药性的机制并探索针对性治疗策略 | 肾细胞癌、膀胱癌和前列腺癌等泌尿系统肿瘤及其微环境组分 | 肿瘤生物学 | 泌尿系统肿瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官共培养系统 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1607 | 2025-11-27 |
Pyroptosis modulates multiple immune cell populations in targeted therapy-treated melanoma
2025-Nov-26, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0444
PMID:41296494
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了GSDME介导的细胞焦亡在BRAF抑制剂联合MEK抑制剂治疗黑色素瘤时调节肿瘤内免疫细胞群的关键作用 | 首次系统阐明GSDME介导的细胞焦亡在靶向治疗中调节多种免疫细胞亚群（包括T细胞、NK细胞和调节性T细胞）浸润和功能的机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，在人类患者中的验证尚需进一步研究 | 探究GSDME介导的细胞焦亡在靶向治疗调节黑色素瘤免疫微环境中的作用机制 | 黑色素瘤肿瘤模型中的免疫细胞群 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 基因敲除模型, 突变体表达模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1608 | 2025-11-27 |
Maternal dietary fibre intake results in sex-specific single-cell molecular changes in the heart of the offspring
2025-Nov-25, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20257187
PMID:41082647
|
研究论文 | 本研究探讨母体膳食纤维摄入通过肠道微生物代谢产物短链脂肪酸对后代心脏细胞分子特征的性别特异性影响 | 首次在单细胞水平揭示母体膳食纤维摄入对后代心脏细胞转录组和免疫组成的性别特异性调控机制 | 研究仅使用小鼠模型，样本量有限（scRNA-seq n=16），未验证具体分子机制 | 确定孕期短链脂肪酸递送是否导致后代心脏产生性别和细胞特异性分子变化 | 孕期和哺乳期母鼠及其六周龄后代 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, FACS, 16S rRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫细胞分选数据, 微生物组数据 | scRNA-seq 16个样本, FACS 27个样本, 16S rRNA 28个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 1609 | 2025-11-27 |
Unraveling the carcinogenic mechanisms of benzo[a]pyrene in prostate cancer: a multi-omics approach
2025-Nov-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04842-0
PMID:41288678
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了苯并[a]芘在前列腺癌中的致癌机制 | 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学、分子对接、孟德尔随机化和文献计量学等多种方法系统研究BaP在前列腺癌中的作用机制 | NA | 阐明苯并[a]芘在前列腺癌发生发展中的致病机制 | 前列腺癌相关基因和苯并[a]芘作用靶点 | 多组学分析 | 前列腺癌 | 网络毒理学,单细胞转录组学,差异基因表达分析,分子对接,孟德尔随机化,文献计量学 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1610 | 2025-11-27 |
Unraveling the ferroptosis landscape in intervertebral disc degeneration through integrated bioinformatics and single-cell sequencing
2025-Nov-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04826-0
PMID:41288682
|
研究论文 | 通过整合生物信息学和单细胞测序技术系统解析椎间盘退变中铁死亡的作用机制并探索白藜芦醇的治疗潜力 | 首次在单细胞水平系统揭示椎间盘退变中铁死亡相关基因网络的细胞异质性表达模式及细胞间相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 阐明铁死亡在椎间盘退变发病机制中的作用并探索潜在药物治疗靶点 | 椎间盘退变患者样本及体外培养的髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 分子对接, CCK-8检测, RT-qPCR | CytoTRACE轨迹推断 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1611 | 2025-11-27 |
Mesothelin-expressing triple-negative breast cancer: a highly invasive and immunosuppressive subtype
2025-Nov-25, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-025-07860-x
PMID:41288782
|
研究论文 | 本研究探讨了间皮素表达的三阴性乳腺癌的临床病理特征及其与免疫抑制微环境的关系 | 首次系统研究MSLN表达TNBC的临床病理特征，发现其与免疫抑制微环境和化疗免疫治疗反应差相关 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 研究间皮素在三阴性乳腺癌中的作用及其临床意义 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,单细胞分析,泛癌分析 | NA | 转录组数据,临床数据 | 本地队列和公共数据库样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1612 | 2025-11-27 |
Using single cell sequencing to investigate tumor microenvironment differences in left and right colon cancer and prognosis-related core genes
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03375-5
PMID:41288794
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究左右结肠癌肿瘤微环境差异并构建预后相关风险模型 | 首次在单细胞水平系统比较左右结肠癌的肿瘤微环境差异，并识别出7个预后相关核心基因 | 数据来源于公共数据库，缺乏独立验证队列 | 探究左右结肠癌肿瘤微环境差异并建立预后预测模型 | 结肠癌患者单细胞RNA测序数据和TCGA数据库临床数据 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫组化 | Cox回归模型, 列线图模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据, 免疫组化图像 | GEO数据库单细胞数据和TCGA结肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1613 | 2025-11-27 |
Dominant intragraft plasma cells targeting bilirubin implicate local heme catabolism in human cardiac allograft vasculopathy
2025-Nov-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194138
PMID:41289018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现心脏移植物血管病变中浸润的浆细胞主要靶向胆红素，揭示了局部血红素代谢在疾病发展中的作用 | 首次发现心脏移植物血管病变中优势浆细胞克隆特异性靶向胆红素，揭示了局部血红素代谢产物作为自身抗原的新机制 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；机制研究尚未完全阐明胆红素特异性抗体在疾病发生中的具体作用 | 探究心脏移植物血管病变中移植物浸润浆细胞的抗原特异性及其在疾病发病机制中的作用 | 心脏移植患者的移植物组织和外周血浆细胞 | 单细胞测序 | 心脏移植物血管病变 | 单细胞RNA测序，免疫球蛋白基因分析，重组单克隆抗体生成，组织化学分析 | NA | 单细胞转录组数据，免疫球蛋白序列数据，组织影像数据 | 从移植物浆细胞克隆生成37个重组单克隆抗体，从外周血浆细胞生成24个对照抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1614 | 2025-11-27 |
Function and Development of Deep-sea Mussel Bacteriocytes Revealed by SnRNA-seq and Spatial Transcriptomics
2025-Nov-25, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf109
PMID:41289084
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示深海贻贝细菌细胞的功能与发育机制 | 首次结合原位去定植实验、单核转录组和空间转录组技术系统解析深海共生体系中细菌细胞的功能与发育轨迹 | NA | 探究深海贻贝与化学合成微生物共生体系中细菌细胞的功能特性和发育过程 | 深海贻贝的细菌细胞（宿主细胞内共生菌） | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位去定植实验, 多组学分析, 3D重建 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1615 | 2025-11-27 |
scDBImpute: Dual-branch Imputation for Single-cell RNA-seq Data Dropouts
2025-Nov-25, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3636928
PMID:41289139
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中丢失值填补的双分支插补方法 | 结合线性和非线性关联进行丢失值填补，不同于先前假设预定义结构的方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的丢失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双分支模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1616 | 2025-11-27 |
Construction of the cancer cell continuum reveals hybrid EMT state driving lung adenocarcinoma aggression
2025-Nov-25, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00991-9
PMID:41290994
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和细胞轨迹推断技术，重建肺腺癌中的上皮-间质转化(EMT)谱系，识别关键调控因子并开发预后风险分层模型 | 首次在肺腺癌中系统构建EMT连续谱，发现混合E/M状态具有最高转移潜能，并识别关键转录因子调控网络 | 样本量相对有限(10例患者)，需要更大队列验证发现 | 阐明肺腺癌中EMT连续谱的调控机制及其与肿瘤侵袭性的关系 | 肺腺癌患者的恶性上皮细胞 | 单细胞基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，细胞轨迹推断 | 风险分层模型，调控网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 10例肺腺癌患者的16,310个恶性上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1617 | 2025-11-27 |
Modelling the effects of human SUR1 R1420H variation on insulin secretory function using isogenic iPSC-derived pancreatic islets
2025-Nov-25, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06605-1
PMID:41291239
|
研究论文 | 利用等基因iPSC衍生的胰腺胰岛模型研究人类SUR1 R1420H变异对胰岛素分泌功能的影响 | 首次建立等基因iPSC衍生的胰腺胰岛平台，系统研究SUR1 R1420H变异在不同发育阶段对胰岛素分泌的时序性影响 | 研究仅基于两个亲本印第安美洲iPSC系，样本量有限 | 探究SUR1 R1420H变异是否导致KATP通道功能丧失及其对胰岛素分泌的发育阶段特异性影响 | 等基因iPSC衍生的胰腺胰岛（SC-islets） | 干细胞生物学 | 2型糖尿病 | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | iPSC衍生胰腺胰岛模型 | 基因表达数据，胰岛素分泌数据 | 两个亲本iPSC系（IS1和IS2）衍生的三种基因型（1420RR，1420RH，1420HH）SC-islets | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1618 | 2025-11-27 |
Mapping cellular interactions and communication landscapes in cervical cancer via single-cell transcriptomics
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04040-7
PMID:41291352
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学方法系统解析宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性及细胞间通讯网络 | 首次在宫颈癌中系统绘制细胞间通讯图谱并识别MIF通路在癌症相关成纤维细胞中的关键作用 | 样本量相对有限（20例患者），且主要基于公共数据库的再分析 | 阐明宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性、细胞间信号网络及分子机制 | 宫颈癌组织及癌旁正常组织 | 单细胞转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, ELISA | UMAP, t-SNE, 时序轨迹建模 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 20例患者的配对肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1619 | 2025-11-27 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据识别骨关节炎相关基因并筛选潜在治疗药物 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，通过多算法整合分析鉴定OA关键基因，并利用斑马鱼模型验证药物作用机制 | 研究样本来源未明确说明，药物预测需进一步临床验证 | 发现骨关节炎治疗新靶点和潜在药物 | 骨关节炎相关基因和药物靶点 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | 随机森林, 高维加权基因共表达网络分析, 蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1620 | 2025-11-27 |
Non-invasive assessment of activated renal macrophages by imaging of colony-stimulating factor 1 receptor in mouse model with ischemic acute kidney injury
2025-Nov-25, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-025-00482-6
PMID:41291764
|
研究论文 | 本研究通过CSF1R-PET成像技术无创评估小鼠缺血性急性肾损伤模型中活化的肾脏巨噬细胞 | 首次证明11C-CPPC-PET可作为临床可用工具无创检测活化的肾脏巨噬细胞，主要针对M2表型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 开发无创评估肾脏炎症的方法 | 小鼠缺血性急性肾损伤模型和肾脏/肾周脓肿模型 | 医学影像 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，PET成像，体外放射自显影，免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据，影像数据，组织学数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序，PET成像 | NA | NA |