单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1581	2025-03-15	Identification of cold tumor induction-related markers in pancreatic cancer and the clinical implication of PCDH7 2025-Jan-24, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-025-06095-z PMID:39856454	研究论文	本研究旨在识别与胰腺导管腺癌（PDAC）冷肿瘤免疫微环境（TIME）诱导相关的标记基因，并探讨PCDH7的临床意义	通过RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq）识别了与PDAC冷TIME相关的六个基因，特别是PCDH7，并验证了其与CD8+ T细胞浸润的负相关性及其作为PDAC患者预后标志物的潜力	研究样本量较小，且主要基于小鼠模型，需要进一步在更大规模的人类样本中验证	识别与PDAC冷TIME诱导相关的标记基因，并探讨其临床意义	胰腺导管腺癌（PDAC）细胞	肿瘤免疫学	胰腺癌	RNA测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组化（IHC）	NA	RNA测序数据，单细胞RNA测序数据，免疫组化数据	10个来自KPC小鼠的原代PDAC培养物，人类PDAC样本
1582	2025-03-15	Single-cell RNA-sequencing reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment characteristics between ocular adnexal mucosa-associated lymphoid lymphoma and IgG4-related ophthalmic disease 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1508559 PMID:40078987	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了眼附属器黏膜相关淋巴组织淋巴瘤（MALT淋巴瘤）和IgG4相关眼病（IgG4-ROD）的细胞组成、转录异质性和免疫微环境特征	首次对眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4-ROD进行单细胞转录组测序比较分析，揭示了两种疾病的细胞组成、关键通路和免疫微环境差异	样本量较小，仅包括3例MALT淋巴瘤和3例IgG4-ROD患者	探讨MALT淋巴瘤和IgG4-ROD在细胞组成、转录异质性和免疫微环境方面的差异	眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4-ROD患者的眼眶泪腺区域组织样本	数字病理学	淋巴瘤, IgG4相关眼病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	3例MALT淋巴瘤患者和3例IgG4-ROD患者的组织样本
1583	2025-03-15	Development of a tertiary lymphoid structure-based prognostic model for breast cancer: integrating single-cell sequencing and machine learning to enhance patient outcomes 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1534928 PMID:40078998	研究论文	本文开发了一种基于三级淋巴结构（TLS）的乳腺癌预后模型，结合单细胞测序和机器学习技术，以提高患者预后	通过整合单细胞RNA测序和机器学习算法，识别了关键的TLS相关基因，并开发了一个新的TLS预测模型，该模型在预测乳腺癌患者总体生存率方面优于传统模型	研究依赖于多个独立的乳腺癌队列数据，可能存在数据异质性问题，且样本量虽大，但未涵盖所有乳腺癌亚型	开发并验证一种基于TLS的乳腺癌预后模型，以改善患者预后	乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	机器学习	RNA测序数据	来自13个独立乳腺癌队列的9,551名患者
1584	2025-03-15	The sentinels of coronary artery disease: heterogeneous monocytes 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1428978 PMID:40079002	综述	本文探讨了冠状动脉疾病（CAD）中单核细胞的异质性，重点关注单核细胞亚群数量、比例及功能受体表达的变化及其与临床特征的相关性	提出了增强单核细胞异质性临床实用价值的策略，并概述了CAD领域未来的研究方向	NA	探讨单核细胞在冠状动脉疾病中的异质性及其临床意义	冠状动脉疾病患者中的单核细胞	NA	心血管疾病	高参数流式细胞术和单细胞测序技术	NA	NA	NA
1585	2025-03-15	Analysis of single-cell and spatial transcriptomics in TNBC cell-cell interactions 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1521388 PMID:40079015	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）在三阴性乳腺癌（TNBC）细胞间相互作用研究中的应用	强调了scRNA-seq和ST在探索TNBC异质性、细胞空间分布模式和细胞间相互作用中的应用	未提及具体的研究限制	增强对TNBC在细胞水平上的理解，以开发有效的治疗靶点	三阴性乳腺癌（TNBC）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（ST）	NA	单细胞RNA测序数据，空间转录组数据	NA
1586	2025-03-14	Pathogenesis, attenuation, and treatment strategies for keloid management 2025-Jun, Tissue & cell IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.tice.2025.102800 PMID:39999656	综述	本文综述了瘢痕疙瘩的发病机制、减缓和治疗策略，包括各种治疗方法的优缺点	介绍了单细胞RNA测序和转录组学研究在理解瘢痕疙瘩发病机制中的应用，并讨论了纳米治疗技术如微针、纳米颗粒、脂质体和外泌体的进展	瘢痕疙瘩治疗后容易复发，随访非常重要，使得治疗过程复杂	探讨瘢痕疙瘩的发病机制、减缓和治疗策略	瘢痕疙瘩	NA	皮肤疾病	单细胞RNA测序, 转录组学	NA	NA	NA
1587	2025-03-14	Integrated multi-omics characterization of neuroblastoma with bone or bone marrow metastasis 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101511 PMID:40070366	研究论文	本文通过整合多组学方法，研究了伴有骨或骨髓转移的神经母细胞瘤（NB-BBM）的发病机制及其复杂的免疫微环境	使用Swin-Transformer进行病理组织学特征识别，预测NB-BBM的发生，并通过单细胞转录组学识别与BBM密切相关的肿瘤细胞亚群和肿瘤相关巨噬细胞亚群，突出了转酮醇酶（TKT）作为NB转移进展的关键分子标志物	研究样本量较小，仅涉及142例石蜡包埋的苏木精-伊红染色肿瘤切片图像	阐明NB-BBM的发病机制及其免疫微环境，以促进更有效的风险预测和治疗策略的开发	伴有骨或骨髓转移的神经母细胞瘤（NB-BBM）	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞转录组学	Swin-Transformer	图像	142例石蜡包埋的苏木精-伊红染色肿瘤切片图像
1588	2025-03-14	Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth 2025-Mar-13, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322280 PMID:40079140	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析了出生后第一天小鼠主动脉瓣结构的细胞异质性	发现了出生后第一天特有的新型瓣膜内皮细胞亚群和三个未被充分认识的瓣膜间质细胞亚群	研究仅限于出生后第一天的小鼠主动脉瓣，未涵盖其他发育阶段或其他物种	探讨主动脉瓣在出生后成熟过程中结构和功能关系的机制	小鼠主动脉瓣结构	生物医学	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	出生后第一天的小鼠主动脉瓣
1589	2025-03-14	Loss of N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 leads to meiotic prophase abnormalities and male sub-fertility in mice 2025-Mar-13, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf052 PMID:40079145	研究论文	本文研究了N-6腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1（N6AMT1）在小鼠精子发生过程中对减数分裂进展的关键作用	首次揭示了N6AMT1在减数分裂前期中的关键作用，特别是在性染色体失活（MSCI）和DNA双链断裂（DSB）修复中的功能	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨N6AMT1在小鼠精子发生过程中的作用及其对雄性生育能力的影响	小鼠生殖细胞，特别是精母细胞	分子生物学	NA	单细胞RNA-seq，批量RNA-seq	NA	RNA-seq数据	N6amt1基因敲除小鼠及其对照小鼠
1590	2025-03-14	MAP4K4 aggravates microvascular anomalies in diabetic retinopathy in a YTHDF2-dependent manner 2025-Mar-12, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06398-3 PMID:40072537	研究论文	本文探讨了MAP4K4在糖尿病视网膜病变中的微血管异常中的作用及其通过YTHDF2依赖的机制	揭示了MAP4K4通过YTHDF2调控NF-κB信号通路在糖尿病视网膜病变中的新机制	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步的人体临床试验验证	研究MAP4K4在糖尿病视网膜病变中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力	糖尿病视网膜病变患者和小鼠模型	生物医学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	RNA测序数据	8名糖尿病视网膜病变患者和11名非糖尿病个体的视网膜样本
1591	2025-03-14	Intrapancreatic adipocytes and beta cell dedifferentiation in human type 2 diabetes 2025-Mar-12, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06392-9 PMID:40072535	研究论文	本研究探讨了胰腺脂肪沉积与2型糖尿病患者β细胞功能障碍之间的关系	通过组织学和单细胞RNA-seq分析，揭示了胰腺脂肪含量与β细胞去分化之间的空间关系及其对基因表达的影响	样本量较小（50名器官捐献者），且仅基于组织学和生物信息学分析，缺乏功能性实验验证	研究胰腺脂肪与胰岛β细胞功能障碍在2型糖尿病中的相关性	人类胰腺样本（50名器官捐献者，其中15名患有2型糖尿病）	糖尿病研究	2型糖尿病	组织学分析、单细胞RNA-seq、生物信息学分析	NA	组织样本、单细胞RNA-seq数据	50名器官捐献者（15名2型糖尿病患者，35名非糖尿病患者）
1592	2025-03-14	Single-cell RNA sequencing generates an atlas of normal tibia cartilage under mechanical loading conditions 2025-Mar-12, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05234-x PMID:40072674	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）深入探讨了机械负荷对软骨细胞的影响，并生成了正常胫骨软骨在机械负荷条件下的图谱	首次使用单细胞RNA测序技术系统地分析了机械负荷对软骨细胞的影响，并鉴定了不同负荷条件下的关键基因	样本量相对较小，仅涉及6名捐赠者的11个软骨组织样本	研究机械负荷对软骨细胞的影响及其生物学过程	胫骨软骨组织中的软骨细胞	单细胞测序	骨关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	6名捐赠者的11个软骨组织样本，共132,685个细胞
1593	2025-03-14	Heterogeneous cellular responses to hyperthermia support combined intraperitoneal hyperthermic immunotherapy for ovarian cancer mouse models 2025-Mar-12, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adp2124 PMID:40073154	研究论文	本研究探讨了高温腹腔化疗（HIPEC）在卵巢癌中的效果，并通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤和微环境对高温的异质性反应	通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术，揭示了高温下肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞的转录调控机制，并提出了高温与免疫检查点阻断联合治疗的新策略	研究仍处于初步阶段，需要进一步的临床试验验证其效果	探索高温腹腔化疗在卵巢癌治疗中的效果及其与免疫治疗的联合应用	卵巢癌小鼠模型	癌症研究	卵巢癌	单细胞RNA测序, CUT&Tag	小鼠模型	RNA测序数据	NA
1594	2025-03-14	EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses 2025-Mar-12, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkaf004 PMID:40073167	研究论文	本文研究了组蛋白H3赖氨酸27甲基转移酶EZH2在流感感染后记忆B细胞形成中的作用	揭示了EZH2在记忆B细胞分化和功能潜力中的关键表观遗传调控作用	EZH2敲除并未完全有效，表明存在维持EZH2甲基转移酶活性的强烈选择压力	探讨EZH2在记忆B细胞编程和回忆反应中的调控机制	小鼠（Mus musculus）	表观遗传学	流感	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
1595	2025-03-14	CAD manipulates tumor intrinsic DHO/UBE4B/NF-κB pathway and fuels macrophage cross-talk, promoting hepatocellular carcinoma metastasis 2025-Mar-12, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001304 PMID:40073276	研究论文	本文探讨了CAD通过操纵肿瘤内在的DHO/UBE4B/NF-κB通路，促进肝细胞癌（HCC）转移的机制	首次揭示了CAD在HCC转移中的关键作用及其通过DHO/UBE4B/NF-κB通路的具体机制	研究主要基于体外和体内实验，临床应用的直接证据尚需进一步验证	阐明PVTT形成和肿瘤转移的机制，并识别临床干预的潜在靶点	159名HCC患者（包括37例PVTT病例）	肿瘤学	肝细胞癌	代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序	NA	多组学数据	159名HCC患者
1596	2025-03-14	Large-scale dependency and drug screens characterize the therapeutic vulnerabilities of Multiple Myeloma with 1q 2025-Mar-12, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025102 PMID:40073369	研究论文	本研究通过大规模依赖性和药物筛选，系统性地描述了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并展示了其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加	首次系统性地描述了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并揭示了MCL1和PI3K抑制剂在1q+多发性骨髓瘤中的协同作用及其作用机制	研究主要基于体外实验，需要进一步的临床试验验证	开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗	1q+多发性骨髓瘤患者	癌症研究	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
1597	2025-03-14	Single-cell profiling reveals the intratumor heterogeneity and immunosuppressive microenvironment in cervical adenocarcinoma 2025-Mar-11, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.97335 PMID:40066698	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了宫颈腺癌（ADC）与鳞状细胞癌（SCC）在肿瘤免疫微环境和肿瘤异质性方面的差异	首次在单细胞水平上揭示了ADC特有的上皮细胞亚群及其与免疫抑制微环境的相互作用，特别是Epi_10_CYSTM1簇在淋巴结转移预测中的潜在价值	样本量相对较小，仅包括11个ADC样本和4个SCC样本	探讨宫颈腺癌（ADC）与鳞状细胞癌（SCC）在肿瘤免疫微环境和肿瘤异质性方面的差异	宫颈腺癌（ADC）和鳞状细胞癌（SCC）的肿瘤组织	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序、免疫化学、多重免疫荧光	NA	RNA测序数据、免疫化学数据、免疫荧光数据	11个ADC样本和4个SCC样本
1598	2025-03-14	Distinct cellular mechanisms underlie chemotherapies and PD-L1 blockade combinations in triple-negative breast cancer 2025-Mar-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.01.007 PMID:39919737	研究论文	本文通过整合已发表和新生成的单细胞RNA测序数据，研究了三阴性乳腺癌（TNBC）患者在接受紫杉醇（PTX）、白蛋白结合型紫杉醇（Nab-PTX）及其与抗PD-L1抗体阿特珠单抗（ATZ）联合治疗时的肿瘤免疫微环境（TIME）	研究发现，与ATZ加PTX相比，ATZ加Nab-PTX能够重新编程TCF7干细胞样效应记忆CD8 T细胞（Tsem）和CD4 T滤泡辅助细胞（Tfh），并且Nab-PTX还能重塑髓系细胞区室，扩大肥大细胞和促炎性巨噬细胞	研究机制尚未完全明确，需要进一步实验验证	探讨免疫检查点阻断（ICB）与化疗联合治疗三阴性乳腺癌（TNBC）的机制	三阴性乳腺癌（TNBC）患者和小鼠模型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	人类TNBC样本和小鼠模型
1599	2025-03-14	Microglial reprogramming enhances antitumor immunity and immunotherapy response in melanoma brain metastases 2025-Mar-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.01.008 PMID:39919736	研究论文	本文通过临床前模型和单细胞转录组学，揭示了增强黑色素瘤脑转移抗肿瘤免疫的机制	发现激活小胶质细胞中的Rela/NF-κB通路促进黑色素瘤脑转移，并证明靶向该通路可重编程小胶质细胞为促炎表型，增强抗肿瘤免疫	研究主要基于临床前模型，尚未在广泛的患者群体中验证	探索黑色素瘤脑转移的生物学机制及脑免疫微环境在治疗反应中的作用	黑色素瘤脑转移	肿瘤免疫学	黑色素瘤	单细胞转录组学	临床前模型	转录组数据	未明确说明具体样本数量
1600	2025-03-14	ZNF385A was identified as a novel colorectal cancer-related functional gene by analysis of the interaction and immune characteristics of oxidative stress and the inflammatory response 2025-Mar-10, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02024-1 PMID:40064736	研究论文	本研究通过分析氧化应激和炎症反应的相互作用及免疫特性，识别出ZNF385A作为结直肠癌相关的新功能基因	首次发现ZNF385A作为结直肠癌的新型致癌基因，并构建了包含七个特征的预后风险模型	需要进一步研究以验证模型在其他数据集中的普适性及ZNF385A的具体作用机制	探讨氧化应激和炎症反应与结直肠癌的关系，并识别相关功能基因	结直肠癌的单细胞RNA测序数据及肿瘤细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量聚合酶链反应（qPCR）、免疫组化	LASSO-Cox模型	RNA测序数据、临床病理参数	结直肠癌的单细胞RNA测序数据及肿瘤细胞样本