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当前共找到 10543 篇文献,本页显示第 1541 - 1560 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1541 2026-02-12
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
研究论文 本文介绍了一种名为VISTA的新方法,用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 VISTA结合变分推理和几何深度学习,联合建模单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据,并引入不确定性量化,以解决空间转录组学技术中基因数量有限的问题 NA 旨在通过预测未观测基因的表达,增强空间转录组学数据的分析能力,以更好地理解空间诱导的细胞状态和特征 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 变分推理, 几何深度学习 基因表达数据 四个空间转录组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1542 2026-02-12
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为SNOW的深度学习算法,用于解卷积单细胞时间序列数据,以分离时间依赖和独立成分 提出SNOW算法,能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞时间序列 NA 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战,如时间与细胞类型贡献的解卷积、区分真实动态与批次效应 单细胞RNA测序时间序列数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1543 2026-02-12
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组,并发现转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中起关键作用 首次通过单细胞RNA测序技术识别HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子,并揭示其在肾上腺性别二态性和脂质代谢调控中的多功能作用 研究主要基于小鼠模型,人类肾上腺中的具体机制尚未完全阐明 探究维持肾上腺皮质细胞差异响应能力的分子机制 肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞(zona fasciculata) 单细胞组学 肾上腺功能障碍 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 使用报告基因小鼠的肾上腺样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1544 2026-02-12
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为VISTA的新方法,用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平,以解决现有技术基因覆盖限制的问题 VISTA结合变分推断和几何深度学习,联合建模单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,并引入不确定性量化,实现了对未观测基因表达的高效预测 方法依赖于单细胞RNA-seq和空间转录组学数据的联合可用性,且性能可能受数据质量和整合难度的影响 开发一种能够预测空间转录组学数据中未观测基因表达水平的方法,以增强空间诱导细胞状态和特征的分析能力 单细胞RNA-seq数据和亚细胞空间转录组学数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 变分推断, 几何深度学习 基因表达数据, 空间数据 四个空间转录组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1545 2026-02-12
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025, Frontiers in allergy IF:3.3Q2
研究论文 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)患者胃肠道中MRGPRX2表达肥大细胞的增加及其在炎症性肠病(IBD)中的作用 首次在HαT背景下,结合空间转录组学和质谱流式细胞术,揭示了胃肠道肥大细胞表型改变及MRGPRX2表达上调与IBD活动的关联 样本量较小(空间转录组学n=8,质谱流式n=14),且仅针对特定肠道部位(降结肠和小肠)进行分析,可能限制结果的普适性 阐明HαT对胃肠道肥大细胞表型及MRGPRX2表达的影响,探索其在IBD症状发生中的潜在机制 遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)患者及匹配的非HαT对照者的肠道组织样本 空间转录组学 炎症性肠病 空间转录组分析、质谱流式细胞术(CyTOF)、微滴数字PCR(ddPCR)、基因分型 NA 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 854份生物样本库IBD样本进行基因分型;空间转录组分析8例(HαT=4,对照=4);质谱流式分析14例(HαT=5,对照=9) NA 空间转录组学、单细胞蛋白质组学 NA NA
1546 2026-02-12
Multi-omics integration and machine learning-driven construction of an immunogenic cell death prognostic model for colon cancer and functional validation of FCGR2A
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过多组学整合与机器学习构建了一个基于免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因的结肠癌预后模型,并验证了关键基因FCGR2A的功能 首次系统性地利用ICD相关基因构建结肠癌预后模型,结合单细胞RNA-seq数据解析T细胞状态,并通过大量机器学习模型组合优化特征选择 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证;体外功能实验仅针对单个基因(FCGR2A) 开发基于免疫原性细胞死亡的预后模型,探索其与肿瘤免疫微环境及治疗敏感性的关联 结肠腺癌(COAD)患者 机器学习 结肠癌 转录组学分析、单细胞RNA-seq、机器学习模型构建 随机生存森林(Random Survival Forest) 转录组数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 TCGA和GTEx的结肠腺癌患者数据,以及GSE17538和GSE38832作为外部验证队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1547 2026-02-12
Multi-omics characterization of RNF157 expression patterns in hepatocellular carcinoma and development of an RNF157-associated prognostic signature
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学和单细胞分析,表征了肝细胞癌中E3泛素连接酶RNF157的表达模式,开发了一个RNF157相关的预后特征,并探讨了其与肿瘤微环境的关系 在单细胞分辨率下表征RNF157在肝细胞癌中的异质性表达模式,并基于此开发了一个新的预后特征模型 预后模型的预测性能中等,需要独立验证才能临床应用 表征RNF157在肝细胞癌中的表达模式,开发预后特征,并探索其与肿瘤微环境的关系 肝细胞癌患者样本 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 多组学分析, 流式细胞术 预后特征模型 RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据 来自TCGA、GEO数据库和scRNA-seq数据集(GSE149614)的临床和RNA表达数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1548 2026-02-12
Integrative multi-omics and experimental analyses implicate PTK2 as a lorazepam-associated biomarker and potential therapeutic target in ovarian cancer
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析和实验验证,发现PTK2是劳拉西泮与卵巢癌之间的潜在生物标志物和治疗靶点 首次将神经活性药物劳拉西泮与卵巢癌的分子靶点联系起来,并通过空间转录组学揭示了PTK2在肿瘤微环境中的特异性分布 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接药效学证据 识别和验证劳拉西泮与卵巢癌共有的分子靶点,以发现新的生物标志物和治疗机制 卵巢癌相关基因与劳拉西泮潜在靶点的交集基因,特别是PTK2基因 计算生物学 卵巢癌 qPCR, CCK-8, 克隆形成, 伤口愈合, 流式细胞术, 单细胞转录组学, 空间转录组学 Lasso-Cox模型 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
1549 2026-02-12
Single-cell RNA-seq reveals a key role for Vibrio cholerae Mak toxins in Tetrahymena pyriformis killing and bacterial survival
2025, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq技术揭示了霍乱弧菌Mak毒素在杀死四膜虫和细菌在EFVs中存活的关键作用 首次利用单细胞转录组学分析霍乱弧菌暴露于四膜虫时的异质性基因表达,并识别出Mak毒素作为抵抗原生动物捕食和EFVs内存活的关键介质 研究仅关注霍乱弧菌和四膜虫的相互作用,分子机制细节仍需进一步探索 探究霍乱弧菌抵抗原生动物捕食的分子机制及其在EFVs中的存活策略 霍乱弧菌和四膜虫 单细胞转录组学 霍乱 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 5,344个细菌细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1550 2026-02-12
BMP and NODAL paracrine signalling regulate the totipotent-like cell state in embryonic stem cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和计算框架,探讨了细胞间通讯如何调控胚胎干细胞中的全能样细胞状态,揭示了BMP和NODAL信号通路的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和计算建模,系统分析胚胎干细胞中配体-受体相互作用,并功能验证BMP和NODAL信号在调控全能样细胞状态中的核心角色 研究主要基于体外培养系统,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂环境,且信号通路的调控机制仍需进一步在体内验证 探究细胞间通讯在调控胚胎干细胞命运转变中的作用,特别是针对全能样细胞状态 异质性胚胎干细胞群体,尤其是模拟两细胞期胚胎的全能样细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 计算框架(用于建模配体-受体相互作用和下游调控效应) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1551 2026-02-11
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025-Dec-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)与炎症性肠病(IBD)患者胃肠道中MRGPRX2阳性肥大细胞的增加及其与疾病活动的关联 首次在HαT和IBD背景下,通过多平台方法(空间转录组学、质谱流式细胞术)系统揭示了胃肠道肥大细胞丰度增加、活化标志物(CD203c、LAMP-1、SIGLEC8)上调以及MRGPRX2表达增强的现象 样本量相对较小(空间转录组学n=8,质谱流式细胞术n=14),且研究主要基于观察性关联,尚未明确MRGPRX2介导的肥大细胞活化在HαT相关胃肠道症状中的直接因果机制 探究HαT是否通过改变肥大细胞受体MRGPRX2的表达及活化状态,影响IBD的胃肠道病理过程 HαT患者、非HαT的IBD患者以及健康对照者的胃肠道组织样本 数字病理学 炎症性肠病 空间转录组学、质谱流式细胞术(CyTOF)、数字PCR(ddPCR)、基因分型 NA 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 共分析873份样本(854份生物库IBD样本用于基因分型,8份结肠组织用于空间转录组学,14份小肠活检用于质谱流式细胞术) NA 空间转录组学, 质谱流式细胞术 NA NA
1552 2026-02-11
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-12, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 本研究构建了一个基于NOTCH相关基因的预后风险模型(NOTCH评分),用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存、免疫浸润和治疗反应 首次整合NOTCH信号通路相关基因构建预后模型,并系统评估其与肿瘤微环境、免疫治疗反应及药物敏感性的关联 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在单细胞和蛋白水平的验证样本量有限 开发头颈部鳞状细胞癌的预后预测工具并探索其与肿瘤微环境及治疗反应的关联 头颈部鳞状细胞癌患者 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学 LASSO回归模型 基因表达数据、临床数据 未明确具体样本数量,但包含训练和验证队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1553 2026-02-11
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-Oct, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾病进展中的关键调控作用 首次构建并验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2这一ceRNA调控轴在慢性肾病进展中的作用机制 生物信息学和临床队列的样本量有限 识别慢性肾病的新型诊断生物标志物和治疗靶点 慢性肾病患者、健康对照者、TCMK1细胞系 生物信息学 慢性肾病 单细胞测序、双荧光素酶报告基因检测、生物信息学分析 NA 基因表达数据、临床样本数据 64名慢性肾病患者和20名健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1554 2026-02-11
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了脂氧素B4(LXB4)在眼压升高期间如何调节TRPV4通道激活的Müller胶质细胞反应性,并揭示了Müller胶质细胞自身是视网膜中LXB4的重要来源 首次证实Müller胶质细胞是视网膜中抗炎和神经保护性脂质介质LXB4的内源性来源,并揭示了TRPV4机械应力激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号传导的双重作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床样本中得到验证 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症,以及Müller胶质细胞自身是否参与视网膜脂氧素通路 小鼠Müller胶质细胞(原代和永生化细胞系)、小鼠视网膜组织 神经科学 青光眼 RNA bulk-sequencing, qPCR, LC-MS/MS脂质组学, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫染色, 免疫印迹 NA 转录组数据, 脂质组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1555 2026-02-11
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究探讨了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老来调控毛囊老化的机制,并提出了针对性的干预策略 首次在转基因小鼠模型中揭示了表皮过度表达IGF-1会直接导致毛囊干细胞衰老和毛囊早衰,并验证了通过调控下游通路或清除衰老细胞来逆转这一过程的可行性 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤中的机制验证尚需进一步临床研究 探究IGF-1信号通路在器官老化特别是毛囊衰老中的作用机制 小鼠皮肤组织、人类皮肤样本、转基因小鼠模型 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1556 2026-02-11
Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老对小鼠造血免疫系统的影响,并证明了抗氧化剂吡咯喹啉醌(PQQ)能够通过减轻氧化应激、逆转免疫衰老表型、恢复免疫稳态来改善免疫衰老 首次在单细胞分辨率下系统描绘了PQQ对衰老造血免疫系统的重编程作用,并鉴定了ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点,同时结合机器学习程序验证了PQQ的衰老细胞清除(senolytic)和衰老表型调节(senomorphic)效应 研究基于小鼠模型,其在人体中的效果和机制仍需进一步验证;单细胞测序仅聚焦于脾脏和骨髓细胞,未涵盖其他免疫器官或组织 探究衰老对造血免疫系统的影响,并评估抗氧化剂PQQ在改善免疫衰老、恢复免疫稳态方面的潜力 小鼠的脾脏和骨髓细胞 单细胞组学 免疫衰老 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习程序 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1557 2026-02-11
Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析从儿童到衰弱老年人的PBMCs的bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,揭示了免疫衰老的转录组变化、炎症动态和适应性免疫改变 首次结合bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,全面描绘了从儿童到衰弱老年人PBMCs的免疫衰老动态变化,并识别了衰弱老年人特有的免疫细胞表型异常 研究仅基于PBMCs样本,可能无法完全反映组织特异性免疫变化;样本年龄跨度虽广,但未详细说明各年龄组样本量 探究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老在健康衰老和衰弱状态中的机制 外周血单个核细胞(PBMCs) 生物信息学 老年疾病 RNA-seq NA 转录组数据 从儿童到衰弱老年人的PBMCs样本(具体数量未说明) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1558 2026-02-10
Exploring hypoxia- and cuproptosis-related biomarkers in periodontitis based on transcriptome and single-cell analysis
2025-Dec-29, Clinical oral investigations IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞分析,探索了牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的生物标志物 首次将缺氧相关基因与铜死亡相关基因结合,在牙周炎中进行系统性生物标志物鉴定,并利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平验证了关键基因的表达模式 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的实验验证和前瞻性临床研究来确认生物标志物的临床效用 识别和表征牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的关键生物标志物,以深入理解其分子机制 牙周炎患者与健康对照的基因表达数据 生物信息学 牙周炎 转录组分析,单细胞RNA测序 机器学习(Boruta算法,LASSO回归,递归特征消除) 基因表达数据 来自GEO数据库的多个牙周炎数据集(包括GSE16134, GSE10334, GSE152042) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1559 2026-02-10
Lifting regenerative barriers promotes epithelial cell fate plasticity supporting lineage conversion
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了成年上皮细胞在再生过程中命运可塑性的调控机制,揭示了HIF1a-SOX9轴作为限制细胞身份转换的关键屏障 首次发现HIF1a-SOX9轴作为上皮细胞命运可塑性的关键调节因子,并证明解除再生屏障可促进食管细胞向皮肤细胞的谱系转换 研究基于3D再生培养系统,可能无法完全模拟体内复杂环境;谱系转换效率较低,机制仍需进一步验证 探究成年上皮细胞命运可塑性的调控机制及再生过程中的谱系转换限制因素 成年食管上皮细胞与真皮基质细胞 再生医学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1560 2026-02-10
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术,揭示了牛感染布氏锥虫时存在隐秘的传播适应性血流形式,挑战了基于啮齿动物模型的传统假设 首次在牛的低寄生虫血症水平下,通过单细胞转录组学识别出具有细长型和粗短型相关转录组的混合寄生虫群体,揭示了宿主特异性差异 研究主要基于牛和鼠类感染模型,可能未完全覆盖所有自然宿主或环境条件下的寄生虫行为,且形态学标记蛋白表达未在粗短型样寄生虫中检测到 探究布氏锥虫在自然宿主(牛)中的发育和传播机制,特别是低寄生虫血症条件下的形式分化 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的寄生虫群体,包括其转录组和形态特征 寄生虫学与传染病学 非洲动物锥虫病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、显微镜观察 NA 转录组数据、图像数据 牛和鼠类感染样本,具体数量未在摘要中指定 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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