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当前共找到 10788 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-12-19 |
Charting the cardiac landscape: Advances in spatial transcriptomics for heart biology
2025 Nov-Dec, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103648
PMID:40882280
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在心脏生物学中的应用进展，包括技术范围、技术考虑以及从早期空间映射到现代高分辨率多模态方法的演变 | 强调了空间转录组学如何通过提供完整组织内基因表达的高分辨率图谱，革命性地改变了对心脏生物学的理解，并展示了多模态方法在揭示细胞类型特异性反应和分子机制方面的扩展应用 | NA | 探讨空间转录组学在心脏发育、疾病和再生研究中的应用，并讨论其在心血管生物学和治疗中的未来方向 | 心脏组织，包括发育中的人类心脏和成年后心肌梗死后的心脏 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1502 | 2025-12-19 |
How to get the most out of your cancer spatial transcriptomics data
2025 Nov-Dec, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103657
PMID:41108891
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综述 | 本文为癌症研究人员提供了空间转录组学数据分析的路径指南，涵盖主要分析方法、常用工具、新兴技术以及实验设计考量 | 系统梳理了癌症空间转录组学数据分析的完整流程与策略，整合了从基础可视化到前沿机器学习方法的分析技术全景，并前瞻性地讨论了实验设计与团队协作等实践问题 | 作为综述文章，未提出新的分析方法或工具，主要侧重于现有技术的梳理与指南性建议 | 为癌症研究人员提供空间转录组学数据分析的实用指南与策略 | 空间转录组学数据分析方法、工具及其在癌症研究中的应用 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 机器学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1503 | 2025-12-19 |
Nanobody Immunolabelling and three-dimensional imaging reveals spatially restricted LYVE1 expression by kidney lymphatic vessels in mice
2025-Oct-13, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03759-3
PMID:41084009
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研究论文 | 本研究利用纳米抗体免疫标记和三维成像技术，揭示了小鼠肾脏淋巴管中LYVE1表达的空间限制性特征 | 开发了针对LYVE1的纳米抗体，实现了对完整器官内淋巴管网络的更快速、更深层标记，克服了传统抗体渗透性不足的局限 | 研究主要聚焦于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证；纳米抗体的应用范围可能受限于特定标记物 | 开发新型淋巴管标记工具并研究肾脏淋巴管的特异性表达模式 | 小鼠肾脏、皮肤、心脏和肺部的淋巴管 | 数字病理学 | NA | 纳米抗体免疫标记、三维成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 小鼠器官样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1504 | 2025-12-19 |
LncCE: Landscape of Cellularly-elevated lncRNAs in Single Cells Across Normal and Cancer Tissues
2025-09-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf069
PMID:40833782
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研究论文 | 本研究提出了一个名为LncCE的资源，用于在单细胞分辨率下系统探索正常组织和癌组织中的细胞高表达长链非编码RNA | 首次在单细胞水平系统构建了跨正常和癌组织的细胞高表达lncRNA图谱，并整合了临床生存关联分析 | 分析基于现有的单细胞RNA测序数据集，可能受数据质量和覆盖范围的限制 | 构建一个全面、定量且用户友好的lncRNA细胞高表达图谱数据库 | 长链非编码RNA在正常组织和癌组织中的细胞特异性表达模式 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 181个单细胞RNA测序数据集，涵盖20个胎儿正常组织、59个成人正常组织、32种成人癌症类型和5种儿童癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1505 | 2025-12-19 |
scPlantLLM: A Foundation Model for Exploring Single-cell Expression Atlases in Plants
2025-07-11, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf024
PMID:40094454
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研究论文 | 本文开发了一个名为scPlantLLM的Transformer基础模型，用于处理和分析植物单细胞RNA测序数据，以解决批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战 | 开发了首个针对植物单细胞数据的Transformer基础模型，采用包含掩码语言建模和细胞类型注释任务的顺序预训练策略，在零样本学习场景下实现了高达0.91的准确率 | 模型主要基于拟南芥数据集进行验证，在其他植物系统中的泛化能力有待进一步评估 | 开发一个先进的计算模型，以解决植物单细胞RNA测序数据分析中的关键挑战，包括批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断 | 植物单细胞RNA测序数据，特别是拟南芥的单细胞表达图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞基因表达数据 | 数百万个植物单细胞数据点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1506 | 2025-12-19 |
Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes
2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426339122
PMID:40526717
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Sp140L是一种疱疹病毒限制因子，能抑制病毒转录并激活干扰素刺激基因 | 首次揭示Sp140L作为疱疹病毒限制因子，并发现其连接病毒DNA感知与转录抑制至干扰素非依赖性先天免疫反应 | 研究主要基于EBV感染的B细胞模型，其他细胞类型或体内环境的适用性需进一步验证 | 探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制，并鉴定新的宿主限制因子 | EBV感染的B细胞及疱疹病毒Saimiri的ORF3蛋白 | 单细胞组学 | 病毒感染（EBV相关疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EBNA-LP敲除（LPKO）感染的B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1507 | 2025-12-19 |
Temporal transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model of tauopathy display cell type- and sex-specific differences
2025-05-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02013-z
PMID:40336141
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了THY-Tau22小鼠模型中tau蛋白病的性别和年龄依赖性转录组变化 | 首次在THY-Tau22小鼠模型中系统揭示了tau蛋白病相关的性别特异性转录组变化及其年龄依赖性演化 | 研究仅基于小鼠模型，人类数据的验证有限，且样本年龄点较少 | 探究阿尔茨海默病相关tau蛋白病中性别特异性和性别二态性转录组变化的细胞类型特异性及年龄依赖性 | THY-Tau22转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17月龄和7月龄的THY-Tau22及野生型小鼠皮质组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1508 | 2025-12-19 |
Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model
2025-Apr-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052024
PMID:40114603
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、三维成像及多模态磁共振成像技术，揭示了人类常染色体显性多囊肾病（ADPKD）肾脏中微血管异常的早期特征，并在Pkd1突变小鼠模型中验证了这些发现 | 首次结合单细胞转录组学、几何拓扑分析和动脉自旋标记磁共振成像，系统描述了ADPKD肾脏微血管异常的分子特征和时空动态，并证实其在人类和小鼠模型中的一致性 | 研究主要基于晚期人类ADPKD样本和Pkd1突变小鼠模型，可能无法完全反映疾病早期阶段的血管变化，且样本量有限 | 探究ADPKD肾脏微血管异常的发病机制和早期特征，为血管靶向治疗提供依据 | 人类ADPKD肾脏组织、Pkd1突变小鼠的肾脏（包括出生后和胎儿期） | 数字病理学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞转录组学、三维成像、几何拓扑分析、分形分析、多模态磁共振成像、动脉自旋标记 | Pkd1突变小鼠模型 | 转录组数据、图像数据、磁共振成像数据 | 人类ADPKD肾脏样本（晚期囊性病理和排泄功能衰竭）、Pkd1突变小鼠肾脏样本（出生后和胎儿期） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1509 | 2025-12-18 |
Exploring Single-Cell and Multi-Omics Technologies and Their Role in Unravelling Tumor Heterogeneity of Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec-17, Journal of liver cancer
DOI:10.17998/jlc.2025.11.29
PMID:41402037
|
综述 | 本文综述了单细胞和多组学技术在揭示肝细胞癌肿瘤异质性中的变革性作用 | 强调了单细胞和空间组学技术如何通过高分辨率分析重塑HCC研究，推动生物标志物、治疗靶点和患者分层策略的发现 | 高成本、技术要求高以及可及性有限，特别是在资源有限的环境中，是其广泛应用的主要障碍 | 探讨单细胞和多组学技术在解析肝细胞癌肿瘤异质性中的作用 | 肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、表观基因组学、多组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1510 | 2025-12-18 |
Integrating RNA-seq and Single-Cell RNA-seq to Uncover Transcriptional Signature of Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-16, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11310-0
PMID:41402612
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1511 | 2025-12-18 |
POU5F1 upregulates SPP1 to sustain stem-like traits and malignant phenotypes via JAK1/STAT3 in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004469
PMID:41403335
|
研究论文 | 本研究揭示了POU5F1通过上调SPP1并激活JAK1/STAT3信号通路，维持透明细胞肾细胞癌的干细胞样特性和恶性表型 | 首次系统验证了POU5F1-SPP1-JAK1/STAT3轴在ccRCC中的作用机制，为同时靶向肿瘤细胞和癌症干细胞提供了新的治疗策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本量有限（30对组织），需要更大规模的临床验证 | 探究SPP1在透明细胞肾细胞癌中的功能及其上游调控机制 | 透明细胞肾细胞癌组织样本（30对）、786-O/769-P细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA-seq、功能实验（增殖、迁移、肿瘤球形成）、分子机制研究（ChIP、Co-IP、双荧光素酶报告基因检测）、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床生存数据 | 30对ccRCC组织样本、2种细胞系（786-O/769-P）、裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1512 | 2025-12-18 |
Prognostic role of stress granule-related Gene signatures in pancreatic ductal adenocarcinoma: insights from 101-combination machine learning and single-cell sequencing
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004458
PMID:41403347
|
研究论文 | 本研究通过结合机器学习与单细胞测序技术，开发并验证了一个基于应激颗粒相关基因的胰腺导管腺癌预后风险模型 | 首次利用101种机器学习算法组合识别预后相关的应激颗粒基因，并结合单细胞测序分析关键细胞类型与细胞间通讯 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性队列验证 | 探究应激颗粒在胰腺导管腺癌中的机制，重点关注风险分层与治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法组合（包括Cox回归等） | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个PDAC数据集，包括单细胞数据集GSE197177 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1513 | 2025-12-18 |
Cancer associated fibroblast exosomal miR-214-3p regulated by hnRNPA2B1 promotes cisplatin resistance by inhibiting ferroptosis
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003946
PMID:41405275
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研究论文 | 本研究揭示了hnRNPA2B1通过调控CAF中外泌体miR-214-3p的分选，促进骨肉瘤顺铂耐药的新机制 | 首次发现hnRNPA2B1通过识别GGAG基序调控CAF外泌体中miR-214-3p的分选，并阐明该外泌体通过抑制GPX4表达减少铁死亡从而介导顺铂耐药 | 研究主要聚焦于骨肉瘤，未在其他癌症类型中验证该机制；体内实验数据可能有限 | 探究CAF外泌体介导的骨肉瘤顺铂耐药机制 | 骨肉瘤细胞、癌症相关成纤维细胞(CAF)、外泌体 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀、外泌体功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、分子表达数据 | 顺铂敏感与耐药样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1514 | 2025-12-18 |
Natural killer cell infiltration elicits gender-dependent dichotomous clinical outcomes in urothelial carcinoma
2025-Dec-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.70196
PMID:41368948
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研究论文 | 本研究通过多队列回顾性分析，揭示了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中具有性别依赖性的临床影响 | 首次系统阐明了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中的性别二态性临床作用，并揭示了其背后不同的功能状态和肿瘤微环境特征 | 研究为回顾性设计，需前瞻性研究验证；机制探索尚不完整 | 探究自然杀伤细胞如何介导尿路上皮癌的性别差异及其临床意义 | 尿路上皮癌患者 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 免疫组化、转录组学、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 图像、文本（转录组数据） | 885名患者（671名男性，214名女性） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1515 | 2025-12-18 |
Targeting KRAS Inhibitor-Resistant Pancreatic Cancer with an MUC1-C Antibody-Drug Conjugate
2025-Dec-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2333
PMID:41086055
|
研究论文 | 本研究探讨了MUC1-C蛋白在介导胰腺导管腺癌细胞对KRAS抑制剂耐药中的作用，并评估了抗MUC1-C抗体药物偶联物的治疗效果 | 揭示了KRAS G12D抑制通过激活MUC1-C/NF-κB p65自诱导通路上调MUC1-C蛋白，进而驱动耐药的新机制，并首次证明抗MUC1-C ADC能有效克服KRAS抑制剂耐药 | 研究主要基于KRAS G12D突变模型，未涵盖其他KRAS突变类型；临床前模型的转化潜力需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌对KRAS抑制剂耐药的机制，并开发针对耐药的新型治疗策略 | 胰腺导管腺癌KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型，以及PDAC患者肿瘤样本 | 癌症生物学与治疗学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学染色、体外和体内药效评估 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、药效数据 | 3个PDAC KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型，以及未明确数量的PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1516 | 2025-12-18 |
Systematic scRNA-seq screens profile neural organoid response to morphogens
2025-Dec-15, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02927-5
PMID:41398501
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研究论文 | 本研究通过系统性的单细胞RNA测序筛选，全面描绘了人类神经类器官对形态发生素的响应模式 | 首次在人类神经类器官中系统性地研究了形态发生素的时间、浓度和组合对神经上皮区域特化的影响，并整合深度学习模型预测分化结果 | 研究主要基于体外类器官模型，与体内发育环境的生理相关性仍需进一步验证 | 解析形态发生素在人类神经类器官区域化过程中的调控机制 | 人类神经类器官 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及多条件、多时间点的系统性筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1517 | 2025-12-18 |
Identification of diagnostic and prognostic phospholipid biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis via machine learning and in vivo validation
2025-Dec-12, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00845-3
PMID:41388329
|
研究论文 | 本研究通过整合多个数据集的微阵列数据，利用机器学习技术构建了特发性肺纤维化（IPF）的诊断和预后模型，并鉴定了磷脂相关的生物标志物 | 结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习方法，首次开发了基于8个基因的诊断模型和11个基因的预后模型，并通过单细胞测序和动物模型验证了关键基因GABARAPL1和UNC13B在IPF中的下调表达 | 需要进一步验证以评估其临床适用性 | 鉴定特发性肺纤维化（IPF）的诊断和预后磷脂生物标志物 | 特发性肺纤维化（IPF）患者和IPF小鼠模型 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 微阵列数据分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自八个数据集的微阵列数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1518 | 2025-12-18 |
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509534122
PMID:41337486
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研究论文 | 本研究通过结合遗传条形码技术与单细胞转录组测序，追踪了食管癌前病变细胞的谱系，揭示了具有高可塑性的前体细胞群及其在肿瘤发生早期的作用 | 首次将遗传条形码技术与单细胞RNA测序相结合，用于追踪食管癌前病变细胞的谱系动态，并鉴定出具有高可塑性的独特前体细胞群 | NA | 阐明食管癌前病变细胞的起源、谱系轨迹及其在早期肿瘤发生中的作用 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 遗传条形码技术，单细胞RNA测序，空间转录组学 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1519 | 2025-12-18 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces the tumor-infiltrating Treg phenotype for tumor growth
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424251122
PMID:41343674
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤微环境中前列腺素E2通过EP2/EP4信号通路诱导肿瘤浸润性调节性T细胞表型，从而促进肿瘤生长的核心机制 | 首次鉴定出PGE2-EP2/EP4-cAMP-PKA通路是诱导跨物种、跨肿瘤类型保守的TI-Treg表型的共同机制，并证实其在人和小鼠模型中的关键作用 | 研究主要聚焦于PGE2信号通路，肿瘤微环境中可能还存在其他诱导TI-Treg表型的机制未被探讨 | 探究肿瘤微环境中诱导肿瘤浸润性调节性T细胞独特表型的分子机制及其对肿瘤生长的影响 | 小鼠和人类的调节性T细胞（包括诱导性Tregs和天然Tregs）、Lewis肺癌模型、鼻咽癌患者单细胞数据 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、鼻咽癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、细胞功能数据 | 小鼠肿瘤模型、人类鼻咽癌患者单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1520 | 2025-12-18 |
Hybrid identity and distinct methylation profiles of incomplete intestinal metaplasia in the stomach
2025-Dec-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335793
PMID:40691053
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学、DNA甲基化分析和单细胞RNA测序，揭示了胃不完全肠上皮化生（Inc IM）的分子特征及其作为胃癌前病变的角色 | 首次利用空间转录组学结合定制谱系富集面板，揭示了Inc IM的混合谱系特征和起源于深部胃窦腺细胞，并发现其与胃癌（特别是微卫星稳定型肿瘤）的分子相似性 | 研究主要基于组织样本和类器官模型，可能无法完全反映体内环境的复杂性，且样本量未明确说明 | 阐明Inc IM的分子身份、分化潜能和致癌相关性，以确定其作为胃癌前病变的真实性 | 胃肠上皮化生（GIM）组织、胃癌组织以及亚型特异性GIM类器官模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学、DNA甲基化分析、染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、甲基化数据、染色质可及性数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 定制谱系富集面板用于空间转录组学分析 |