单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10543 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2026-02-17 |
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178304
PMID:41167410
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中类凋亡相关基因的图谱，并分析了其与预后及免疫微环境的关系，同时通过实验验证了关键调控因子TNK2的功能 | 首次在骨肉瘤中系统描绘类凋亡相关基因的图谱，揭示了其与预后和免疫微环境的关联，并通过单细胞RNA测序和功能实验验证了TNK2在类凋亡调控中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，实验验证部分仅限于细胞功能学实验，缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 | 阐明骨肉瘤中类凋亡相关基因的分子特征及其对预后和免疫微环境的影响，识别关键调控因子 | 骨肉瘤患者队列（TARGET和GSE21257数据集）及骨肉瘤细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、细胞功能实验（增殖、活力、迁移实验） | LASSO-Cox回归模型、共识聚类 | 基因表达数据（RNA-seq）、单细胞RNA测序数据 | TARGET和GSE21257两个患者队列（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1502 | 2026-02-17 |
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178258
PMID:41101682
|
综述 | 本文综述了将抗菌药物、双硫仑和二甲双胍重新用于癌症治疗的潜力，并探讨了RNA测序在揭示其作用机制和指导临床转化中的关键作用 | 系统性地将多种抗菌药物与双硫仑、二甲双胍并列，探讨其抗癌重定位的共性机制，并强调利用转录组学（尤其是单细胞和空间转录组学）来弥合机制认知差距并指导精准治疗 | 临床转化结果参差不齐，面临药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境成分等关键挑战，且除二甲双胍外，其他候选药物的临床前和临床研究数据相对有限 | 探讨药物重定位用于癌症治疗的潜力，并阐明RNA测序技术在理解药物作用机制和指导临床转化中的应用 | 抗菌药物（阿奇霉素、克拉霉素、氯碘羟喹、氯喹、多西环素、红霉素、伊维菌素、替加环素）、双硫仑和二甲双胍 | 自然语言处理 | 癌症 | RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1503 | 2026-02-17 |
Dissection of Gαs and Hedgehog signaling crosstalk reveals therapeutic opportunities to target adenosine receptor 2b in Hedgehog-dependent tumors
2025-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639530
PMID:40060632
|
研究论文 | 本研究通过组织学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了Gαs信号通路失活驱动的基底细胞癌（BCC）与经典Hedgehog SMO驱动肿瘤的相似性，并提出了靶向腺苷2B受体作为潜在治疗策略 | 首次发现Gαs通路失活可导致SMO独立的致癌Hedgehog信号，并证明激活Gαs偶联的腺苷2B受体能抑制Hedgehog信号和肿瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型和人类BCC突变分析，临床转化潜力需进一步验证 | 探索Gαs与Hedgehog信号串扰在基底细胞癌中的作用，寻找新的治疗靶点 | 小鼠BCC样肿瘤和人类基底细胞癌 | 肿瘤生物学 | 基底细胞癌 | 组织学分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1504 | 2026-02-16 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveal the reorganization of cerebellar microglia with aging
2025-Dec-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116624
PMID:41307999
|
研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，揭示了小脑小胶质细胞在衰老过程中的重组和适应性变化 | 首次通过单细胞核RNA测序、小胶质细胞批量RNA测序和MERFISH空间转录组学，系统揭示了小脑小胶质细胞在衰老中的早期显著变化及其与颗粒细胞的邻近关系，并识别出一种神经元相关的小胶质细胞特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类小脑衰老的类似变化尚未验证；空间分析可能受限于MERFISH技术的分辨率和覆盖范围 | 探究小脑在衰老过程中的转录组变化，特别是小胶质细胞的重组和适应性 | 小鼠小脑组织，重点关注小胶质细胞和颗粒细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞核RNA测序，批量RNA测序，MERFISH空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | 涉及十五个小鼠脑区域，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1505 | 2026-02-16 |
Multi-omics integration and machine learning define robust molecular subtypes and prognostic signatures in hepatocellular carcinoma
2025-Dec-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07574-0
PMID:41423668
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，定义了肝细胞癌的稳健分子亚型并构建了预后特征模型 | 结合十种聚类算法进行整合多组学聚类识别分子亚型，并应用十种机器学习算法构建共识预后特征，同时纳入单细胞RNA测序和空间转录组学数据解析关键基因的细胞起源和空间表达模式 | 需要前瞻性临床验证来确认模型的预测性能 | 精炼肝细胞癌的分子分型并改善预后预测 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 多组学整合、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习算法（未指定具体模型） | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1506 | 2026-02-16 |
Orthologous genes of the red flour beetle Tribolium castaneum and the vinegar fly Drosophila melanogaster
2025-Dec-12, BMC genomic data
IF:1.9Q3
DOI:10.1186/s12863-025-01397-0
PMID:41388371
|
研究论文 | 本文生成了果蝇和赤拟谷盗之间的直系同源基因列表，为比较基因组学研究提供资源 | 利用OrthoFinder平台和eggNOG数据库，结合手动系统发育树分析，生成了超过9,000个直系同源基因的全面列表 | NA | 为果蝇和赤拟谷盗之间的比较基因组和基因功能研究提供直系同源基因的严谨分配和汇编 | 果蝇和赤拟谷盗的参考蛋白质组 | 比较基因组学 | NA | 系统发育直系同源性推断 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1507 | 2026-02-16 |
Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals the non-cardiomyocytes heterogeneity and novel cell populations in dilated cardiomyopathy
2025-Jan-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05983-1
PMID:39762897
|
研究论文 | 本研究通过整合分析扩张型心肌病（DCM）和正常心脏组织的单细胞RNA测序（scRNA-seq）与批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，揭示了DCM中非心肌细胞的异质性，并识别了参与疾病过程的新型细胞亚群 | 首次构建了DCM的单细胞转录图谱，并利用多种机器学习算法（xCell, EPIC, MCP counter, CIBERSORT）高精度地识别了DCM相关细胞类型，发现了具有不同功能的成纤维细胞和巨噬细胞新亚群（如增殖性F3细胞、肌成纤维细胞F6细胞、M2-like1和M2-like2巨噬细胞），并揭示了GAS6-MERTK轴在细胞间通讯中的潜在作用 | 样本量相对较小（7个DCM样本和3个正常样本），研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 | 揭示扩张型心肌病（DCM）中非心肌细胞的异质性及其在疾病发生中的作用，探索潜在的免疫治疗靶点 | 人类心脏组织（来自DCM患者和正常供体） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 机器学习算法（包括xCell, EPIC, MCP counter, CIBERSORT） | 基因表达数据（转录组） | 总计70,958个单细胞数据点，来源于7个DCM样本和3个正常心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1508 | 2026-02-16 |
Integrating traditional omics and AI-driven approaches for discovery and validation of novel MicroRNA biomarkers and therapeutic targets in thyroid cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727032
PMID:41684520
|
研究论文 | 本研究整合传统组学技术与人工智能方法，结合单细胞验证，以发现和验证甲状腺癌中新型microRNA生物标志物和治疗靶点 | 将批量转录组学的荟萃分析与机器学习特征选择、单细胞空间图谱相结合，增强了生物标志物的发现和验证能力 | 未明确说明样本来源的多样性或潜在偏差，且单细胞数据仅来自23个样本，可能限制普遍性 | 发现和验证甲状腺癌中可靠的生物标志物和治疗靶点 | 甲状腺癌样本、TPC-1和BHT101细胞系、以及小鼠异种移植模型 | 机器学习 | 甲状腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPRi, 功能实验 | 机器学习特征选择 | 转录组数据, 单细胞数据 | 3个批量RNA-seq数据集和23个甲状腺癌样本的196,145个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1509 | 2026-02-15 |
Bronchial epithelial transcriptome reveals dysregulated interferon and inflammatory responses to rhinovirus in exacerbation-prone pediatric asthma
2025-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197711
PMID:41217821
|
研究论文 | 本研究通过器官型支气管上皮细胞培养，结合bulk和单细胞转录组学及靶向蛋白分析，揭示了易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染的过度干扰素和炎症反应机制 | 首次在易加重型儿童哮喘患者中，通过单细胞转录组学揭示了细胞类型特异性（特别是非纤毛细胞）对鼻病毒感染的过度反应，并发现基线干扰素刺激基因表达降低是易感性的可调节因果决定因素 | 研究基于体外器官型培养模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本量可能有限；未涉及长期临床结局验证 | 探究易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染易感性的宿主因素和分子机制 | 来自特征明确的哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮细胞培养物 | 数字病理学 | 哮喘 | bulk转录组学, 单细胞转录组学, 靶向蛋白分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮细胞培养物（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1510 | 2026-02-15 |
Targeting the pentose phosphate pathway mitigates graft-versus-host disease by rewiring alloreactive T cell metabolism
2025-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.192774
PMID:41355795
|
研究论文 | 本研究揭示了戊糖磷酸途径在急性移植物抗宿主病中的作用，并发现靶向该途径的关键酶6PGD可减轻疾病严重程度，同时保留抗肿瘤效应 | 首次阐明戊糖磷酸途径在调控同种异体反应性T细胞代谢和功能中的关键作用，并确定6PGD为减轻aGvHD同时保留GvT效应的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；长期抑制PPP的潜在副作用尚未明确 | 探索葡萄糖代谢下游途径在急性移植物抗宿主病中的作用，寻找特异性治疗靶点 | 同种异体反应性T细胞 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1511 | 2026-02-15 |
Integrating multi-omics data to resolve patterns of ion channel regulation in melanoma and predict tumor treatment response
2025-Dec-05, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01866-x
PMID:41348242
|
研究论文 | 本研究整合单细胞空间转录组和多组学数据，分析皮肤黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式，并构建评分系统以预测肿瘤治疗反应 | 首次在皮肤黑色素瘤中系统评估离子通道相关基因的调控模式，结合单细胞空间转录组数据揭示其与肿瘤微环境细胞浸润特征的关联，并构建了可量化的ICRG评分系统 | 研究基于现有数据进行分析，需要进一步实验验证ICRG基因的具体功能机制 | 解析皮肤黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式，并预测肿瘤治疗反应 | 皮肤黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞空间转录组学，多组学数据分析 | SCENIC分析，伪时间分析 | 转录组数据，空间转录组数据，多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1512 | 2026-02-15 |
Spatial transcriptomics iterative hierarchical clustering (stIHC): A novel method for identifying spatial gene co-expression modules
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70011
PMID:41674714
|
研究论文 | 本文提出了一种名为空间转录组学迭代层次聚类（stIHC）的新方法，用于识别空间基因共表达模块 | stIHC方法能够检测稀有或独特的空间表达模式，优于现有方法如SPARK、SPARK-X、MERINGUE和SpatialDE | NA | 开发一种新方法以改进空间转录组学数据中空间可变基因的聚类分析 | 空间转录组学数据中的空间可变基因 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 迭代层次聚类 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium, 10x Xenium, Spatial Transcriptomics |
| 1513 | 2026-02-15 |
Cell lineage tracing: Methods, applications, and challenges
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70006
PMID:41674713
|
综述 | 本文综述了细胞谱系追踪的实验和计算方法，强调了它们的优势、局限性和协同作用 | 整合了从早期标记技术到现代CRISPR-Cas9条形码等遗传工具的实验方法，以及用于分析单细胞测序等高维数据的计算方法，并讨论了人工智能增强的未来发展方向 | 存在准确性、分辨率、多组学整合和可扩展性方面的挑战 | 理解细胞命运和谱系关系，应用于发育生物学、组织再生和疾病进展研究 | 细胞谱系追踪技术 | NA | NA | CRISPR-Cas9条形码，单细胞测序，多组学技术 | NA | 高维数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1514 | 2026-02-15 |
A perspective on developing foundation models for analyzing spatial transcriptomic data
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70010
PMID:41674716
|
观点文章 | 本文探讨了开发用于分析空间转录组数据的基石模型的必要性、当前进展、潜在任务及未来方向 | 首次系统性地从视角角度审视开发空间转录组基石模型的需求、机遇与挑战，并强调其在提升研究效率、促进新生物学发现和提供用户友好访问方面的潜力 | 作为观点性文章，未提供具体实验数据或模型验证，主要基于理论讨论和前瞻性分析 | 探讨开发用于空间转录组数据分析的基石模型的可行性、任务应用及未来发展方向 | 空间转录组数据及其分析模型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 基石模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1515 | 2026-02-15 |
Stigmasterol attenuates atherosclerosis by inhibiting inflammatory signaling and foam cell formation
2025-Dec, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70056
PMID:41676448
|
研究论文 | 本研究揭示了植物甾醇中的豆甾醇通过抑制炎症信号和泡沫细胞形成来减轻动脉粥样硬化 | 首次结合单细胞RNA测序和功能实验，阐明了豆甾醇通过调节泡沫细胞多样性和炎症发挥血管保护作用的机制，特别是其对CD86巨噬细胞极化和平滑肌细胞向巨噬样泡沫细胞转分化的抑制作用 | 研究主要在ApoE敲除小鼠模型中进行，人体内的效果和转化潜力尚需进一步验证 | 探究植物甾醇（特别是豆甾醇）对动脉粥样硬化中泡沫细胞形成、炎症反应和脂质代谢的影响及其分子机制 | ApoE敲除小鼠的主动脉组织、巨噬细胞、平滑肌细胞及其衍生的泡沫细胞 | 单细胞组学与心血管疾病研究 | 心血管疾病（动脉粥样硬化） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能测定 | NA | 单细胞转录组数据，功能实验数据 | ApoE敲除小鼠主动脉组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1516 | 2026-02-15 |
A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.015
PMID:40957419
|
研究论文 | 本文探讨了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结内细胞网络的重组，揭示了TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴在促进免疫逃逸和转移中的作用 | 发现TLR4配体通过诱导FRC表达CCL2和CCL7，促进单核细胞归巢至TDLN，形成免疫抑制微环境，并证明局部TLR4抑制联合αPD-1疗法可减少转移 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且TLR4抑制疗法的长期安全性和临床转化需进一步评估 | 研究三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结的细胞网络重组及其在免疫逃逸和转移中的作用机制 | 三阴性乳腺癌小鼠模型及人类TNBC TDLN样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1517 | 2026-02-15 |
The impact of asymmetrical gene expression on the development of spike morphology in Triticum aestivum
2025-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70047
PMID:41674570
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组图谱探索了小麦穗发育过程中不对称基因三重表达对产量性状调控的影响 | 首次在小麦穗双棱期构建了单细胞转录组图谱，揭示了10种不同细胞类型及1410个基因的表达模式，并发现不对称基因三重表达是细胞分化的关键因素 | 研究仅基于一个普通小麦品种（济麦22）的5989个细胞，样本代表性有限，且分子调控机制仍需进一步验证 | 探究小麦穗发育的分子调控机制及其对产量性状的影响 | 普通小麦品种济麦22的双棱期穗细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 5989个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1518 | 2026-02-15 |
Microbiota humanization drives human-like metabolic and immune transcriptomic shifts in pigs
2025-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70034
PMID:41674575
|
研究论文 | 本研究通过将人类粪便微生物群移植到抗生素处理的猪体内，建立了肠道微生物群人源化猪模型，并系统评估了其微生物组成、血清代谢物和免疫细胞谱的变化 | 首次在猪模型中通过人类粪便微生物群移植，实现了肠道微生物群、血清代谢谱和免疫细胞转录组向人类特征的系统性转变，为研究宿主-微生物群相互作用提供了一个强大的大型动物平台 | 研究未详细探讨微生物群人源化对猪器官移植排斥反应的具体影响，也未评估长期移植效果的稳定性 | 研究人类微生物群移植对猪的肠道微生物组成、代谢表型和免疫系统的影响，以推动异种移植和微生物组疗法的发展 | 肠道微生物群人源化猪模型 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、准靶向代谢组学、单细胞转录组测序 | NA | 宏基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1519 | 2026-02-15 |
scSCC: A swapped contrastive learning-based clustering method for single-cell gene expression data
2025-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.85
PMID:41675506
|
研究论文 | 本文提出了一种基于交换对比学习的单细胞基因表达数据聚类方法scSCC，通过结合实例对比学习和交换预测模块来提取适合聚类的细胞表示 | scSCC创新性地结合了实例对比学习模块和交换预测模块，通过聚类原型向潜在空间注入聚类信号，使同一簇的细胞向共同原型聚集，从而增强聚类友好性 | NA | 开发一种新的单细胞RNA-seq数据聚类算法以提高细胞类型解密的准确性 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1520 | 2026-02-15 |
Bioinformatics perspectives on transcriptomics: A comprehensive review of bulk and single-cell RNA sequencing analyses
2025-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.78
PMID:41675508
|
综述 | 本文系统比较了bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq的计算分析流程，包括其基本原理、应用、优势与局限性，并展望了转录组研究的未来方向 | 提供了bulk RNA-seq与scRNA-seq技术的全面系统比较，强调了计算工具、机器学习及NGS平台在转录组研究中的整合应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据或具体案例分析，主要基于现有文献进行总结 | 全面理解bulk RNA-seq和scRNA-seq技术，包括其优势、局限性和计算考量，以推动转录组研究的发展 | 转录组（RNA分子集合）及其在生理过程中的调控作用 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |