本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2026-02-21 |
Multi-omics profiling of acute Pseudomonas aeruginosa pneumonia unmasks conventional NK cell depletion and stage-specific therapeutic targets
2025-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2490206
PMID:40216004
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了急性铜绿假单胞菌肺炎中宿主固有免疫反应的特征,特别是常规NK细胞的耗竭及其作为早期免疫检查点失效的作用 | 首次通过整合蛋白质组、细胞群和转录组分析,并结合公共单细胞RNA测序数据,明确了在铜绿假单胞菌肺炎早期常规NK细胞(而非组织驻留NK细胞)特异性耗竭是关键的早期免疫检查点失效事件 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的普适性有待验证;公共scRNA-seq数据的分析可能受限于原始实验设计和样本来源的异质性 | 阐明吸入性铜绿假单胞菌感染后宿主固有免疫反应的特征,并识别潜在的阶段特异性治疗靶点 | 铜绿假单胞菌感染的小鼠模型,以及公共数据库中的单细胞RNA测序数据集 | 免疫学,感染性疾病研究 | 肺炎(医院获得性肺炎和呼吸机相关性肺炎) | RNA测序,单细胞RNA测序,蛋白质分析,细胞群分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞计数数据 | NA | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1482 | 2026-02-21 |
Molecular mechanism of PANoptosis and programmed cell death in neurological diseases
2025-06-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106907
PMID:40204169
|
综述 | 本文系统解析了PANoptosis的分子机制及其在神经系统疾病中的作用,并提出了靶向治疗框架 | 首次系统综述了PANoptosis作为炎症性程序性细胞死亡在神经疾病中的分子机制与治疗潜力 | NA | 阐明PANoptosis在神经系统疾病中的分子机制并开发精准治疗策略 | 神经系统疾病中的程序性细胞死亡通路 | NA | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1483 | 2026-02-20 |
CXCR6 defines a distinct resident state in γδ T cells for protecting from liver cirrhosis
2025-Dec-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001643
PMID:41380134
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了肝脏中CD69+CXCR6+ γδ T细胞在健康状态下富集并产生IFN-γ和IL-2,但在肝硬化组织中显著减少,且其缺失与疾病严重程度相关,这些细胞通过FasL-Fas信号诱导肝星状细胞凋亡来限制纤维化进展 | 首次识别并表征了肝脏中CD69+CXCR6+ γδ T细胞作为组织驻留记忆T细胞的一个独特亚群,并证明其在肝硬化中具有保护性作用,通过FasL-Fas信号通路抑制纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证可能有限,且具体调控机制和临床应用潜力需进一步探索 | 探究γδ T细胞在肝纤维化发生和发展中的作用,特别是组织驻留记忆T细胞亚群的功能 | 肝脏中的γδ T细胞,特别是CD69+CXCR6+亚群,以及肝星状细胞 | 免疫学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA序列数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1484 | 2026-02-20 |
Targeting tumor microenvironment with biomimetic nanovesicles for non-small cell lung cancer gene therapy
2025-Oct-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03684-5
PMID:41035023
|
研究论文 | 本文开发了一种仿生纳米囊泡,通过靶向肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)进行非小细胞肺癌(NSCLC)的基因治疗 | 首次构建了CAF膜包被的siRNA系统,靶向CAFs中高表达的ACTN1基因,用于NSCLC治疗 | CAFs与癌细胞相互作用的精确机制仍不明确,且研究主要基于体外和体内实验,临床转化潜力待验证 | 开发一种靶向肿瘤微环境的新型基因治疗策略,以改善非小细胞肺癌的治疗效果 | 非小细胞肺癌(NSCLC)及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1485 | 2026-02-20 |
Upregulation of interferon-γ activation in patients with anti-interferon-γ autoantibodies immunodeficiency syndrome: insights from single-cell analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659383
PMID:41710026
|
研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征的免疫图谱,揭示了其Th1偏向、IFN-γ驱动的疾病机制 | 首次对AIGAs免疫缺陷综合征进行单细胞RNA测序分析,绘制了其免疫细胞亚群图谱,并揭示了CD4+ Tem与CD14+单核细胞间的交互作用驱动持续Th1炎症的新机制 | 样本量较小(8名患者和3名健康对照),且研究主要基于外周血单核细胞,可能未完全反映组织特异性免疫变化 | 阐明抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征的致病机制和免疫景观 | 抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷综合征 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 8名AIGAs患者(4名感染期,4名稳定期)和3名健康对照用于scRNA-seq;扩展队列包括15名患者和10名对照用于流式验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1486 | 2026-02-19 |
Ligustrazine attenuates ferroptosis in proximal straight tubule cells via IGF2BP1-Odc1 regulation in a CKD model
2025-Dec-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004073
PMID:41342566
|
研究论文 | 本研究探讨了川芎嗪通过调控IGF2BP1-Odc1通路减轻慢性肾病模型中近端直小管细胞铁死亡的作用机制 | 首次发现川芎嗪通过干扰IGF2BP1与m6A修饰的Odc1 mRNA结合,缩短Odc1 mRNA半衰期,从而抑制铁死亡,为慢性肾病治疗提供了新靶点 | 研究主要基于大鼠模型和原代细胞实验,临床转化效果需进一步验证;机制研究集中于IGF2BP1-Odc1轴,可能存在其他调控通路 | 评估川芎嗪治疗慢性肾病的有效性并阐明其分子机制 | 慢性肾病大鼠模型、原代近端直小管细胞 | 分子生物学与病理生理学 | 慢性肾病 | LC-MS/MS分析、单细胞测序、基因过表达与敲低、细胞与动物实验 | NA | 测序数据、质谱数据、蛋白与mRNA表达数据 | 大鼠模型(对照组、CKD组、川芎嗪干预组)及原代细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1487 | 2026-02-19 |
Integrated single-cell multi-omics profiling reveals a senescence-associated hematopoietic landscape and regulatory network in aging bone marrow
2025-Nov-24, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10352-6
PMID:41284112
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学分析,揭示了衰老骨髓中与衰老相关的造血景观和调控网络 | 识别了一个新的造血亚群,激活细胞衰老通路,并通过NMU信号增强与CD8⁺ T细胞的炎症串扰,同时发现CAPN1-MAP2K1-JUND模块作为衰老的潜在预测标志物 | 样本量较小(仅6个年轻和衰老骨髓样本),且依赖独立队列进行验证,可能限制结果的普遍性 | 表征骨髓中与年龄相关的变化并识别关键驱动因素 | 年轻和衰老的骨髓样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 伪批量转录组学, WGCNA, CellChat分析, 差异表达分析, Cox回归模型, ROC曲线分析, 免疫组化, Western blot, 分子对接 | Cox回归模型 | 单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 批量RNA-seq数据 | 6个年轻和衰老骨髓样本,以及两个独立批量RNA队列(n=58) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1488 | 2026-02-19 |
Novel GABAAR antagonists target networked gene hubs at the leading edge in high-grade gliomas
2025-Nov-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf143
PMID:40497637
|
研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析识别高级别胶质瘤前沿的关键离子通道基因,并验证GABAAR拮抗剂在抑制肿瘤进展中的作用 | 首次通过加权基因共表达网络分析结合单细胞和空间转录组学,系统识别高级别胶质瘤前沿的离子通道基因枢纽,并发现GABAAR拮抗剂能有效抑制肿瘤侵袭和增殖 | 研究主要基于体外胶质瘤类器官模型,未在体内动物模型中进行充分验证,且样本量相对有限 | 确定高级别胶质瘤中离子通道基因的网络化表达,并验证靶向这些通道的药物对肿瘤进展的抑制作用 | 弥漫性中线胶质瘤和胶质母细胞瘤患者肿瘤样本及患者来源的胶质母细胞瘤外植类器官 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量,但涉及患者肿瘤样本和类器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1489 | 2026-02-19 |
CAF-derived LRRC15 orchestrates macrophage polarization and limits PD-1 immunotherapy efficacy in glioblastoma
2025-Nov-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf157
PMID:40569145
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)中LRRC15表达在胶质母细胞瘤抗PD-1治疗非应答者中的关键作用,并阐明了其通过调控巨噬细胞极化和免疫抑制微环境限制免疫治疗效果的分子机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出LRRC15高表达的CAFs亚群,并揭示了其通过FAK/SRC/NF-κB通路促进IL8表达,进而驱动巨噬细胞M2极化的新机制,同时发现巨噬细胞通过TGF-β/SMAD2通路反馈调节LRRC15表达的双向调控环路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类患者中进行大规模临床验证;LRRC15靶向治疗的具体药物开发和安全评估仍需进一步研究 | 探究胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中CAFs调控巨噬细胞极化并影响PD-1免疫治疗疗效的分子机制 | 胶质母细胞瘤组织、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、巨噬细胞、小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(stRNA-seq)、生物信息学分析、体外功能验证、体内动物实验 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及抗PD-1治疗应答者与非应答者的临床样本比较 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1490 | 2026-02-19 |
Plasmablast-like lymphoma cells as a distinct subpopulation confer multidrug resistance in PCNSL
2025-Nov-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf154
PMID:40580931
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和B细胞受体测序等方法,揭示了原发性中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)中浆母细胞样淋巴瘤细胞(PBLCs)作为一个独特的恶性B细胞亚群,与多药耐药和不良预后相关 | 首次在PCNSL中识别出PBLCs这一独特的恶性B细胞亚群,并阐明了其通过上调XBP1和PRDM1等转录因子、下调CD20、Bruton酪氨酸激酶和FAS表达,导致多药耐药和免疫逃逸的分子机制 | 样本量相对较小(56例患者),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证PBLCs的临床意义和靶向治疗策略 | 探究PCNSL的分子特征和耐药机制,以改善治疗策略 | 56例新诊断的PCNSL患者的肿瘤活检标本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学,B细胞受体测序,转录组信息多重免疫组化,离体药物反应实验 | NA | 单细胞RNA-seq数据,免疫组化图像,药物反应数据 | 56例新诊断的PCNSL患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1491 | 2026-02-19 |
Proneural-mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import
2025-Nov-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf160
PMID:40627673
|
研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中前神经-间充质杂交细胞的特性及其在治疗抵抗中的作用 | 首次实时监测胶质母细胞瘤细胞可塑性,并揭示了杂交细胞在治疗抵抗中的关键作用及其分子机制 | 研究主要基于患者来源的细胞系和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤细胞可塑性的分子机制及治疗抵抗的原因 | 胶质母细胞瘤细胞,特别是前神经-间充质杂交细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,单细胞ChIP测序,核蛋白质组学,高分辨率成像 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 多个患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1492 | 2026-02-19 |
ZiPo: A Deep Neural Network to De-Noise Single-Cell RNA Sequencing Data
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3572783
PMID:40811273
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ZiPo的深度人工神经网络,用于去噪单细胞RNA测序数据,通过估计率和预测文库大小来处理测量丢失问题 | ZiPo引入了可调节的零膨胀分布来捕获丢失事件,并采用尺度不变损失项使权重稀疏,从而提高模型的生物可解释性 | NA | 改进单细胞RNA测序数据分析,减少测量丢失对结果的影响 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度人工神经网络,深度自编码器 | 基因表达数据 | 三个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1493 | 2026-02-19 |
Identifiability for Gaussian Processes with Holomorphic Kernels
2025-Apr, ... International Conference on Learning Representations
PMID:41695776
|
研究论文 | 本文为在零附近全纯的高斯过程核开发了一个新的理论框架,以确定核参数的可识别性 | 针对在零附近全纯的核(如平方指数核、周期核和有理二次核及其组合),开发了一个新的理论框架来研究其参数可识别性,填补了现有研究主要关注Matérn型核的空白 | NA | 确定高斯过程核参数的可识别性,以支持参数在应用中的有意义的解释 | 高斯过程的核参数,特别是那些在零附近全纯的核 | 机器学习 | NA | NA | 高斯过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1494 | 2026-02-19 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomes reveals the prognostic value of polyamine metabolism biomarkers and immune microenvironment features in gastric cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1658975
PMID:41693709
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了多胺代谢生物标志物和免疫微环境特征在胃癌中的预后价值 | 首次在胃癌中整合单细胞和批量RNA-seq数据,系统评估多胺代谢相关基因的预后意义,并构建了一个基于13个基因的稳健预后模型 | 研究主要基于公共数据集,缺乏前瞻性临床验证,且样本量可能有限 | 评估多胺代谢相关基因在胃癌预后和免疫微环境中的作用,并开发预后分层模型 | 胃癌患者的转录组数据,包括单细胞和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,机器学习算法 | StepCox,弹性网络,以及10种机器学习算法的组合 | 转录组数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1495 | 2026-02-19 |
KLF4 orchestrates a Ccl2+ fibroblast-mediated inflammatory network driving preterm birth
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1700275
PMID:41694684
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示了KLF4通过调控Ccl2+成纤维细胞亚群介导的炎症网络在早产发病机制中的关键作用 | 首次结合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法,鉴定出KLF4是早产的遗传风险因子,并阐明了Ccl2+成纤维细胞亚群在KLF4依赖的炎症调控网络中的核心作用 | 研究主要基于小鼠和大鼠模型,虽进行了临床样本验证,但在人类中的直接机制证据仍需进一步探索;单细胞数据集来源有限 | 阐明早产的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 早产小鼠模型、大鼠宫内感染模型、人类早产患者外周血和胎盘组织 | 单细胞组学 | 早产 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 胎盘外植体培养 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 临床样本数据 | 来自公共数据集GSE200289和E-MTAB-11491的小鼠单细胞数据,以及FinnGen和IEU GWAS数据库的eQTL数据,并进行了体内外实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1496 | 2026-02-19 |
M2 macrophage infiltration drives tumor progression and identifies a multigene prognostic signature in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659048
PMID:41704537
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了M2肿瘤相关巨噬细胞在食管癌进展中的机制作用,并构建了一个四基因预后模型 | 利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据整合分析,识别了M2巨噬细胞相关的关键基因,并构建了一个新的四基因预后特征,同时通过体内外实验验证了IL1RN和IL36G在肿瘤进展中的功能作用 | NA | 阐明M2肿瘤相关巨噬细胞在食管癌进展中的机制作用,并构建一个M2巨噬细胞相关基因特征用于预后预测 | 食管癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 多变量Cox回归分析 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1497 | 2026-02-18 |
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence by assessing the immunosuppressive properties of tumors
2025-Nov-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0326
PMID:41186269
|
研究论文 | 本研究评估了新型27基因面板Sig27及其衍生面板Sig27IMG在前列腺癌复发预测中的作用,并揭示了其与免疫抑制特征(特别是肿瘤相关单核/巨噬细胞和内皮细胞)的关联 | 开发了新型27基因面板Sig27及其衍生5基因面板Sig27IMG,用于前列腺癌复发风险分层,并首次系统性地揭示了这些基因在多种癌症类型中与肿瘤相关单核/巨噬细胞、树突状细胞和内皮细胞的免疫抑制功能的关联 | 研究主要基于回顾性RNA-seq数据集,需要前瞻性临床验证来确认其预测价值;样本量虽大但可能存在批次效应;未详细探讨这些基因在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 开发并验证基因表达面板用于前列腺癌复发风险分层,并探究其与肿瘤免疫抑制特征的关联 | 前列腺癌患者肿瘤组织样本(包括原发性和转移性)以及多种癌症类型的肿瘤样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 基因表达面板(多基因特征) | 基因表达数据(RNA-seq和scRNA-seq) | 批量RNA-seq:3,133个肿瘤样本(13个数据集);单细胞RNA-seq:53名患者(6个数据集);多癌症类型验证:单细胞RNA-seq 386名患者(26种癌症类型),批量RNA-seq 5,672名患者(17种癌症类型) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1498 | 2026-02-18 |
Deconvolution and Phylogeny Inference of Diverse Variant Types Integrating Bulk DNA-seq with Single-cell RNA-seq
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634791
PMID:39975330
|
研究论文 | 本文开发了一种名为TUSV-int的方法,通过整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据,进行去卷积和系统发育推断,以解决癌症克隆结构重建中的技术限制 | TUSV-int首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据,利用整数线性规划同时处理SNV、CNA和SV等多种变异类型,提高了克隆谱系树的分辨率 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性,且scDNA-seq的高成本和挑战性可能限制大规模队列应用,对结构变异和拷贝数变异的观测在RNA-seq中仍存在困难 | 开发一种整合多组学数据的方法,以改进癌症克隆谱系树的重建和突变历史解析 | 癌症基因组数据,包括bulk DNA-seq和scRNA-seq数据,专注于乳腺癌数据集 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk DNA-seq, scRNA-seq | 整数线性规划 | 基因组序列数据,RNA序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk DNA-seq | NA | NA |
| 1499 | 2026-02-17 |
Decoding Dendritic Cell Subtypes via Integrated Radiogenomics: A Stacked Ensemble Model for Predicting Immunotherapy Response in NSCLC
2025-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501990R
PMID:41160086
|
研究论文 | 本研究开创了一个整合单细胞RNA测序、影像组学和深度学习的多模态框架,用于解码树突状细胞介导的非小细胞肺癌抗PD-1治疗反应机制 | 首次将单细胞转录组学、影像组学和深度学习通过堆叠集成学习模型相结合,用于预测NSCLC免疫治疗反应,并识别出六个与树突状细胞亚型相关的关键标志基因 | 研究样本量有限,且结果需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 预测非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂(抗PD-1)的治疗反应 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本(来自应答者和无应答者) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,影像组学分析,机器学习 | LSTM, ResNet50, 堆叠集成学习模型 | 单细胞转录组数据,临床数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1500 | 2026-02-17 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
|
研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化分析、单细胞转录组数据整合及神经病理学验证,揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关联,并识别出小胶质细胞中CTSH-GRN-TMEM106B和TREM2-IL-34相关网络在疾病发生发展中的潜在作用 | 采用双向孟德尔随机化框架,结合单细胞转录组数据和神经病理学验证,系统性地建立了外周血浆/脑脊液蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关联,并构建了与小胶质细胞功能相关的蛋白互作网络 | 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析,虽然进行了神经病理学验证,但仍需进一步的功能实验来证实这些蛋白网络在AD中的具体分子机制 | 阐明外周生物标志物与阿尔茨海默病中枢神经系统之间的因果关联及潜在机制 | 阿尔茨海默病患者及对照个体的血浆蛋白、脑脊液蛋白、大脑蛋白质组数据以及前额叶皮层单细胞转录组数据 | 生物信息学与计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光,蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,遗传数据,组织图像数据 | 分析涉及734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种大脑蛋白,并使用AD患者死后脑组织样本进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |