单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10549 篇文献,本页显示第 1421 - 1440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1421 2026-01-18
S1PR3 Inhibition in alveolar epithelial cells alleviates pulmonary fibrosis by enhancing alveolar barrier function
2025-Dec-12, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本文研究了S1PR3在肺泡上皮细胞中的表达及其在肺纤维化中对肺泡-毛细血管屏障功能的影响 首次揭示了S1PR3在肺纤维化中通过调节紧密连接蛋白表达影响肺泡屏障功能的具体机制,并提出了S1PR3作为治疗靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证,且S1PR3抑制的长期安全性未知 探究S1PR3在肺纤维化发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的可行性 肺泡上皮细胞、特发性肺纤维化患者样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、siRNA敲低、选择性拮抗剂抑制 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织病理学图像 公共单细胞RNA测序数据集中的IPF患者样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1422 2026-01-18
NSUN7 is a catalytically inactive RNA m5C methyltransferase essential for sperm flagellum assembly
2025-Dec-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了NSUN7是一种无催化活性的RNA m5C甲基转移酶,对精子鞭毛组装至关重要 首次明确了NSUN7缺乏催化活性,并揭示了其通过非催化调控功能在精子发生中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接相关性尚需进一步验证 阐明NSUN7的酶学功能和生理作用 小鼠睾丸组织、精子细胞 分子生物学 男性不育症 转录组m5C质谱分析、超快速亚硫酸氢盐测序、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、质谱数据 Nsun7基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1423 2026-01-18
Unveiling key genes for intervertebral disc degeneration prediction and potential drug discovery
2025-Dec-11, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合多个基因表达数据集和单细胞RNA测序数据,识别了与椎间盘退变(IDD)相关的关键基因,并构建了诊断模型及探索了潜在治疗药物 首次结合三个基因表达数据集和单细胞RNA测序数据识别IDD关键基因,并利用Connectivity Map数据库进行药物发现,同时通过临床样本验证基因表达 研究依赖于公开数据集,临床样本量可能有限,且药物发现部分需进一步实验验证 探索椎间盘退变的致病基因,构建诊断模型并识别潜在治疗药物 椎间盘退变(IDD)相关的基因表达数据和临床椎间盘组织样本 生物信息学 椎间盘退变 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学(IHC)染色、分子对接 诊断模型 基因表达数据、单细胞测序数据、临床组织样本 三个基因表达数据集、一个单细胞RNA测序数据集及临床椎间盘组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1424 2026-01-18
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究揭示了在代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)微环境中,高表达CD29的调节性T细胞(Tregs)通过促进细胞粘附驱动疾病向肝细胞癌(HCC)恶性转化 首次在MASLD背景下,通过单细胞RNA测序识别出高表达整合素β1(CD29)的Treg亚群,并阐明其通过增强细胞粘附驱动MASH向HCC转化的新机制 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的普适性仍需进一步验证;CD29靶向治疗策略的临床转化潜力有待评估 探究Tregs在MASLD向HCC恶性转化过程中的作用机制,并评估CD29作为潜在治疗靶点的价值 MASLD小鼠模型(通过高脂饮食和2-乙酰氨基芴诱导)及肝脏中的T淋巴细胞亚群 单细胞组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,体外功能实验 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 MASLD小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1425 2026-01-18
scRNA-Seq Reveals Sustained Pro-Inflammation by Innate Immune Activation in In Utero HBV-Exposed Neonates of High HBsAg Mothers
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学测序分析了高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态,揭示了先天免疫激活导致的持续促炎症状态 首次使用单细胞多组学测序技术,结合转录组和表面标记物表达,系统评估了高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫细胞功能变化,特别是CD8+T细胞的耗竭标记物表达和先天免疫细胞的促炎症特征 样本量相对较小,仅包括低和高HBsAg滴度两组母亲所生婴儿,且未涉及长期随访数据以评估免疫状态的持久性影响 探究高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态,特别是先天免疫激活和适应性免疫受损的机制 来自低和高HBsAg滴度母亲的新生儿外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 乙型肝炎 单细胞多组学测序,免疫表型分析 NA 单细胞转录组和表面标记物表达数据 两组新生儿(低HBsAg滴度组和高HBsAg滴度组),具体样本数未明确说明 NA 单细胞多组学测序 NA NA
1426 2026-01-18
Reconstruction and analysis of the gene network regulating apoptosis in hepatocellular carcinoma based on scRNA-seq data and the ANDSystem knowledge base
2025-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii IF:0.9Q3
研究论文 本研究基于单细胞转录组测序数据和ANDSystem知识库,重建并分析了肝细胞癌中调控肝细胞凋亡的基因网络 结合scRNA-seq数据和人工智能驱动的知识库,重建了肝细胞癌凋亡调控网络,并识别了未在Gene Ontology中标注为凋亡参与者的关键蛋白(如CDKN1A、ERBB2、IL8、EGR1)在凋亡中的作用 研究依赖于计算分析和现有知识库注释,未进行实验验证;网络重建可能受数据质量和知识库完整性的限制 分析肝细胞癌中凋亡过程的分子机制,识别关键调控基因和蛋白,为寻找新的治疗靶点提供依据 肝细胞癌中的肝细胞(肿瘤肝细胞与正常肝组织肝细胞) 计算系统生物学 肝细胞癌 单细胞转录组测序 基因网络重建与分析 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1427 2026-01-18
Human iPSC-derived spinal neural progenitors enhance sensorimotor recovery in spinal cord-injured NOD-SCID mice via differentiation and microenvironment regulation
2025-Aug-22, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究开发了一种通过移植人iPSC来源的脊髓神经祖细胞治疗脊髓损伤的方法,并在小鼠模型中验证了其通过促进神经元分化和调节微环境来改善感觉运动功能恢复的双重机制 首次利用人iPSC来源的脊髓神经祖细胞在脊髓损伤模型中同时实现神经元分化和损伤微环境调节,并通过单细胞测序技术系统揭示了细胞移植后的分化轨迹和宿主微环境的变化 研究在免疫缺陷小鼠模型中进行,未能完全模拟人类脊髓损伤后的免疫反应;长期安全性和疗效仍需进一步验证 开发基于干细胞移植的脊髓损伤治疗新策略 脊髓损伤的NOD-SCID小鼠模型 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, 单核转录组测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核转录组学 NA NA
1428 2026-01-18
Spatial Transcriptomics Advances the Use of Canine Patients in Cancer Research: Analysis of Osteosarcoma-Bearing Pet Dogs Enrolled in a Clinical Trial
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究首次将GeoMx犬类癌症图谱应用于骨肉瘤临床试验中犬类患者的预后相关样本,通过空间转录组学分析揭示了与疾病无进展间隔相关的基因和通路 首次在犬类骨肉瘤临床试验样本中应用GeoMx犬类癌症图谱进行空间转录组学分析,验证了犬类模型在人类癌症研究中的价值 样本量较小(n=16),仅基于疾病无进展间隔进行分组,可能未涵盖所有临床变量 利用犬类骨肉瘤模型研究人类骨肉瘤的分子机制和预后标志物 犬类骨肉瘤患者的原发性肿瘤组织样本 数字病理学 骨肉瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 16个犬类骨肉瘤样本(高DFI组8个,低DFI组8个) NA 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler GeoMx犬类癌症图谱,用于福尔马林固定石蜡包埋组织的空间转录组分析
1429 2026-01-18
Myeloid Fatty Acid Metabolism Activates Neighboring Hematopoietic Stem Cells to Promote Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-May-20, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本文通过比较患者样本和动物模型,揭示了骨髓脂肪酸代谢如何激活邻近造血干细胞,从而促进射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)的机制 首次发现骨髓脂肪酸代谢通过重塑Vcam1启动子激活造血干细胞,促进HFpEF的系统性炎症和心脏舒张功能障碍 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限,且HFpEF的复杂病理机制可能涉及其他未被探索的因素 探究HFpEF中骨髓脂肪酸代谢对造血干细胞激活的因果机制 HFpEF患者样本、小鼠模型、骨髓细胞和造血干细胞 心血管疾病 心力衰竭 流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、碳标记 NA 基因表达数据、代谢数据、细胞表型数据 患者样本和小鼠模型,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1430 2026-01-18
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
研究论文 本文提出了一种自适应噪声稳定化方法,用于低秩信号在异方差噪声下的检测与恢复 开发了一种基于随机矩阵理论和Dyson方程的自适应归一化程序,能均衡数据矩阵行列间的平均噪声方差,支持广泛的噪声分布和信号结构 NA 解决异方差噪声环境下低秩信号检测与恢复的挑战 数据矩阵中的低秩信号 机器学习 NA NA NA 矩阵数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1431 2026-01-17
Development and validation of a CAF-related signature for prognosis and therapy response in colorectal cancer: new insights on HSPB1
2025-Dec-17, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,开发并验证了一个基于癌症相关成纤维细胞(CAF)相关基因的预后和治疗反应预测模型(CRPS),用于结直肠癌 整合了101种10种机器学习算法的组合,构建了CRPS模型,该模型在预后预测上优于58个现有CRC预后模型,并首次揭示了HSPB1基因在CAF恶性转化和亚型转换中的关键作用 NA 开发并验证一个基于CAF相关基因的预后和治疗反应预测模型,以改善结直肠癌的临床管理 结直肠癌患者样本,包括大规模公共数据集和内部数据集 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 机器学习算法组合 转录组数据 总计1,541名患者(包括公共和内部数据集),以及478名患者用于免疫治疗疗效预测 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1432 2026-01-17
Identification and validation of palmitoylation metabolism related biomarkers in osteoarthritis using transcriptomic and single cell RNA sequencing analyses
2025-Dec-11, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过转录组学和单细胞RNA测序分析,识别并验证了骨关节炎中与棕榈酰化代谢相关的生物标志物BUB1B和KIF15 首次将蛋白质棕榈酰化代谢与骨关节炎联系起来,并利用机器学习算法和单细胞测序技术识别出新的生物标志物,揭示了其在特定软骨细胞亚群中的差异表达 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内功能实验验证这些生物标志物的具体作用机制 探索骨关节炎中与蛋白质棕榈酰化代谢相关的生物标志物及其诊断和治疗潜力 骨关节炎患者的软骨组织和临床样本 生物信息学 骨关节炎 转录组测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR,分子对接 机器学习算法 RNA测序数据,基因表达数据 未明确指定样本数量,使用了临床OA样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1433 2026-01-17
Machine learning-based identification of kbhb-affected tumor cell subsets as prognostic and therapeutic targets in breast cancer
2025-Dec-11, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,利用机器学习识别受Kbhb影响的乳腺癌细胞亚群,并评估其预后和治疗潜力 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,识别受Kbhb代谢重编程影响的特定肿瘤细胞亚群,并开发基于机器学习的预后模型 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证Kbhb机制在更多临床样本中的普适性 识别Kbhb影响的乳腺癌细胞亚群,评估其作为预后和治疗靶点的潜力 乳腺癌细胞亚群,特别是受Kbhb相关基因影响的肿瘤细胞 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学数据整合 机器学习模型(基于101种算法组合) 多组学数据(包括基因表达、单细胞和空间转录数据) NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1434 2026-01-17
IL-1β-mediated suppression of CIITA attenuates IFN-γ-induced MHC-II expression on Fibroblasts
2025-Dec-10, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了IL-1β通过抑制CIITA表达来减弱IFN-γ诱导的成纤维细胞MHC-II表达,从而调节肿瘤微环境中的免疫抑制 首次发现IL-1β作为IFN-γ/STAT1/CIITA轴的有效抑制剂,揭示了CAF介导免疫抑制的新细胞因子调控机制 研究主要基于体外实验,体内验证和临床相关性有待进一步探索 阐明成纤维细胞中MHC-II表达的上游细胞因子调控机制 癌症相关成纤维细胞(CAFs) 肿瘤免疫学 癌症 流式细胞术、转录组分析、qRT-PCR、慢病毒转导、CRISPR/Cas9基因编辑、scRNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq NA 基因表达数据、表观基因组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq NA NA
1435 2026-01-17
Modelling the metastatic immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2025-Dec-10, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究使用4T1.2和67NR乳腺癌细胞系作为三阴性乳腺癌的免疫活性小鼠模型,比较了乳腺脂肪垫原位注射与乳腺导管内注射两种植入方法对肿瘤转移、进展及肿瘤微环境的影响 通过比较不同植入方法(乳腺脂肪垫原位注射与导管内注射),揭示了植入方法如何影响肿瘤的固有转移潜力、进展以及肿瘤细胞与微环境的共进化,并发现导管内注射能更好地模拟早期肿瘤发生事件 研究基于小鼠模型,可能无法完全反映人类三阴性乳腺癌的复杂性;样本量未明确说明,可能限制统计效力 研究三阴性乳腺癌的转移性免疫微环境,探索不同肿瘤植入方法对肿瘤进展和免疫反应的影响 4T1.2和67NR乳腺癌细胞系作为三阴性乳腺癌的免疫活性小鼠模型 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌 靶向单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1436 2026-01-17
A core stemness-associated module reveals PLK1, NUF2, KIF23, CDCA8, TOP2A, CENPF, AURKA, and ASPM as key genes in rectal cancer
2025-Dec-10, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和高维共表达网络分析,识别出一个与直肠癌干细胞相关的八基因核心模块,并验证了其诊断和预后价值 首次结合单细胞图谱和高维共表达网络分析,在直肠癌中定义了一个与干细胞特性相关的八基因特征,并揭示了其与G2/M检查点及免疫微环境的关联 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内和临床验证 识别直肠癌特异性癌症干细胞生物标志物和治疗靶点 直肠癌干细胞样细胞群 数字病理学 直肠癌 单细胞转录组学, qRT-PCR, 分子对接 hdWGCNA 单细胞RNA-seq数据, 批量RNA-seq数据 来自GSE199726、TCGA-READ和GEO GSE90627队列的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1437 2026-01-17
Unveiling the role of angiogenesis-related biomarkers in diabetic nephropathy via transcriptomics
2025-Dec-09, Diabetology & metabolic syndrome IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过转录组学分析,结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序,鉴定了糖尿病肾病中与血管生成相关的生物标志物,并探讨了其在疾病中的作用 首次整合公共数据库数据、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,系统识别了CD44、HSPG2、LPAR1和PTGES作为糖尿病肾病的新型生物标志物和风险因子,并构建了诊断列线图 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证;样本来源和数量可能受限,且机制研究尚需进一步实验证实 探索糖尿病肾病中血管生成相关生物标志物,为临床诊断和治疗提供理论依据 糖尿病肾病患者的转录组数据及相关生物样本 生物信息学 糖尿病肾病 转录组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting NA 转录组数据、基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1438 2026-01-17
Comprehensive profiling of smoke-induced T cells in mice implicates clonal γδT17 cells as a hallmark of COPD
2025-Dec-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、TCR测序和流式细胞术验证,全面分析了吸烟诱导的小鼠T细胞变化,揭示了克隆性γδT17细胞作为慢性阻塞性肺疾病(COPD)的标志物及其保护性作用 首次在吸烟诱导的COPD模型中,通过单细胞多组学技术系统表征了T细胞的改变,并发现克隆性扩增的γδT17细胞在炎症中具有保护功能,为COPD的早期预防和治疗提供了新靶点 研究基于小鼠模型,结果在人类COPD患者中的适用性需进一步验证;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞亚群或低丰度细胞类型 探究吸烟诱导的慢性阻塞性肺疾病(COPD)中T细胞的免疫反应机制,以寻找新的治疗靶点 小鼠模型中的T细胞,特别是吸烟暴露后肺组织和循环系统中的γδ T细胞 单细胞组学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序, TCR测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1439 2026-01-17
Pan-cancer profiling links C1orf50 to DNA repair and immune modulation in ovarian cancer
2025-Dec-08, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过泛癌分析揭示了C1orf50在卵巢癌中与DNA修复和免疫调节的关联 首次将C1orf50与卵巢癌的基因组不稳定性、DNA修复缺陷和免疫抑制微环境联系起来,并利用单细胞RNA测序数据深入分析其免疫调节作用 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证,且结论需要前瞻性研究和功能实验进一步确认 探究C1orf50在多种癌症特别是卵巢癌中的功能及其在免疫基因组背景下的作用 多种癌症类型,重点关注卵巢癌,使用TCGA和单细胞RNA测序公共数据集 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1440 2025-12-07
Identification of sepsis pyroptosis-related genes based on single-cell sequencing technology and experimental verification
2025-Dec-05, BMC immunology IF:2.9Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
回到顶部