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当前共找到 10799 篇文献，本页显示第 1421 - 1440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-12-18 |
ST-FFPE-mIF: integrating spatial transcriptomics and multiplex immunofluorescence in formalin-fixed paraffin-embedded tissues using Stereo-seq
2025-Dec-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03900-3
PMID:41402878
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1422 | 2025-12-20 |
Spatial transcriptomic alignment, integration, and 3D reconstruction by STAIR
2025-Dec-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03895-x
PMID:41398698
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STAIR的端到端解决方案，用于空间转录组学中的切片对齐、整合和3D重建 | 首次提出使用具有点水平和切片水平注意力机制的异构图注意力网络，实现统一嵌入空间并指导无监督3D重建，在平行切片的z轴重建方面表现出首创性性能 | NA | 解决空间转录组学中将多个切片合并为统一3D图谱的挑战 | 空间转录组学数据切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 异构图注意力网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1423 | 2025-12-20 |
Differential Regulation of APOE4-Mediated Astrocytic Lipid Metabolism by BMP Signaling Exacerbates Alzheimer's Disease Pathologies in Neurons
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.14.694212
PMID:41415446
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研究论文 | 本研究探讨了BMP信号如何通过调控APOE4介导的星形胶质细胞脂质代谢，加剧阿尔茨海默病神经元病理 | 首次揭示了BMP信号在APOE4与衰老相互作用中的关键角色，并建立了星形胶质细胞脂质代谢与神经元tau蛋白过度磷酸化之间的因果关系 | 研究主要基于体外iPSC模型，缺乏体内验证；样本规模未明确说明 | 探究衰老相关BMP信号与APOE4多态性在阿尔茨海默病发病机制中的相互作用 | iPSC来源的星形胶质细胞与共培养的神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 细胞共培养模型 | 转录组数据、蛋白质磷酸化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1424 | 2025-12-20 |
A transition zone enriched WIF1 ⁺ basal cell subtype is associated with benign prostatic hyperplasia
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692826
PMID:41415376
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，识别出在良性前列腺增生中富集的WIF1⁺基底细胞亚型，并探讨其在前列腺过渡区的分布及潜在病理作用 | 首次通过大规模单细胞RNA测序识别出前列腺过渡区富集的WIF1⁺基底细胞亚型，并揭示其与良性前列腺增生发病机制的关联 | 研究基于前列腺切除标本的良性区域，可能未完全反映疾病进展或不同阶段的细胞变化 | 探究人类前列腺不同区域的细胞组成及其疾病易感性，特别是良性前列腺增生的发病机制 | 人类前列腺的良性区域，包括过渡区和非过渡区 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前列腺切除标本的良性区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1425 | 2025-12-20 |
Acute neuroinflammation induces prolonged transcriptional reprogramming in microglia
2025-Dec-10, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03572-7
PMID:41372988
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研究论文 | 本研究探讨急性神经炎症对小鼠小胶质细胞的长期转录影响，发现即使炎症消退，小胶质细胞仍存在持续的转录重编程和疾病相关特征 | 首次系统揭示急性神经炎症可诱导小胶质细胞产生持久的转录重编程，并发现这些急性特征与阿尔茨海默病模型及人类神经炎症疾病的小胶质细胞特征重叠 | 观察期短于慢性神经退行性疾病的病程，且主要基于小鼠模型 | 探究急性神经炎症对小胶质细胞的长期影响及其与神经退行性疾病的潜在关联 | 小鼠小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1426 | 2025-12-20 |
MoDaH achieves rate optimal batch correction
2025-Dec-10, ArXiv
PMID:41415606
|
研究论文 | 本文提出了一种基于混合模型的数据协调方法（MoDaH），用于单细胞组学数据的批次校正，并首次提供了批次校正的理论保证 | 首次为批次校正问题建立了极小极大最优误差率，并证明所提方法MoDaH能够达到该最优率，这是首个具有理论保证的批次校正算法 | NA | 开发一种具有理论保证的批次校正算法，以解决单细胞组学数据分析中批次效应带来的技术干扰 | 单细胞RNA测序数据和空间蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间蛋白质组学 | 高斯混合模型 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1427 | 2025-12-20 |
Toward a better pan-tumor predictive signature for unleashing precision immuno-oncology
2025-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013213
PMID:41365533
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评论 | 本文探讨了免疫检查点抑制剂（ICI）在实体瘤治疗中的预测生物标志物，并提出了一种新型免疫特征评分以优化精准免疫肿瘤学 | 提出了一种基于DNA和RNA分析的新型免疫特征评分（Immune Profile Score），旨在预测实体瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应，并强调了整合多组学数据、单细胞技术和临床因素的重要性 | 该评分系统仍需前瞻性验证和进一步优化，以实现其在精准免疫肿瘤学中的全部潜力 | 开发更准确的预测生物标志物，以改善实体瘤患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应和精准医疗应用 | 实体瘤患者，特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的群体 | 精准医疗 | 实体瘤 | DNA和RNA分析，单细胞RNA技术，多组学基因特征分析 | NA | 基因表达数据，分子特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1428 | 2025-12-20 |
ALKBH5-Mediated ITGB1 m6A Modification in Ovarian Cancer Progression and Immune Evasion
2025-Dec-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01127-w
PMID:41366552
|
研究论文 | 本研究揭示了m6A去甲基化酶ALKBH5通过调控ITGB1表达促进卵巢癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次发现ALKBH5通过介导ITGB1的m6A修饰调控卵巢癌免疫逃逸，并提出了ALKBH5-ITGB1轴作为新的诊断标志物和治疗靶点 | 未明确说明样本量大小，且主要依赖公共数据库验证，缺乏大规模临床队列验证 | 探究ALKBH5介导的m6A修饰在卵巢癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 卵巢癌细胞及相关的m6A修饰调控机制 | 计算生物学 | 卵巢癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 深度学习, 共表达网络分析 | 深度学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1429 | 2025-12-20 |
SP140 limits type I interferon-driven pathology, preserving T cell motility and promoting resistance in tuberculosis
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.05.692491
PMID:41415425
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究SP140在结核病中如何通过限制I型干扰素信号通路来维持T细胞免疫和宿主抵抗力 | 首次揭示SP140通过抑制I型干扰素驱动的病理过程来保护T细胞功能和运动性，从而促进结核病抵抗力 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究结核病易感宿主中CD8⁺ T细胞反应的差异及SP140的作用机制 | 感染结核分枝杆菌的小鼠模型，特别是缺乏SP140转录抑制因子的小鼠 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，活体显微镜成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1430 | 2025-12-20 |
Senescence-Linked Fibrosis in the Aging Human Ovary Revealed by p16-Based Histological Profiling and Spatial Transcriptomics
2025-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.692228
PMID:41415409
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研究论文 | 本研究通过p16蛋白表达、空间转录组学和AI引导的数字病理学，揭示了人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布及其与纤维化的关联 | 首次结合p16免疫组化、多重免疫荧光、空间转录组学和AI分析，系统绘制了绝经后卵巢衰老细胞的空间微环境，并识别出与p16阳性区域相关的32基因特征BuckSenOvary | 研究主要基于绝经后卵巢样本，可能未全面涵盖卵巢衰老的早期阶段；样本数量有限，需进一步验证 | 探究人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布、特征及其与纤维化的关系，以识别潜在的治疗靶点 | 人类绝经后卵巢组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | p16免疫组化、多重免疫荧光、空间转录组学、AI引导的数字病理学 | AI | 图像、空间转录组数据 | 92个空间区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1431 | 2025-12-20 |
A deep generative model for deciphering cellular dynamics and in silico drug discovery in complex diseases
2025-Dec, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01423-7
PMID:40542107
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络，用于分析时间序列单细胞转录组数据，以解析疾病进展中的复杂细胞动态并辅助计算机药物发现 | 开发了首个专门针对时间序列单细胞转录组数据的深度生成模型，能够学习疾病相关的细胞嵌入表示，并用于精准的药物扰动建模和筛选 | 论文未明确说明模型在其他疾病类型中的验证范围和局限性，也未详细讨论计算资源需求或模型可扩展性 | 开发计算工具以深入分析疾病进展的细胞动态，并实现靶向的计算机药物干预发现 | 特发性肺纤维化患者的单细胞转录组数据、COVID-19相关数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1432 | 2025-12-20 |
MMP13-Expressing and COL11A1-Expressing Cancer-Associated Fibroblasts: Key Drivers of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression and Prognostic Indicators
2025-Dec, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104247
PMID:41005711
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了食管鳞状细胞癌中三种关键的癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示了其中MMP13和COL11A1表达的CAF亚型与不良预后及癌症进展的关联 | 首次报道了CAF亚型与食管鳞状细胞癌病理分期进展之间的关联，并识别出MMP13和COL11A1表达的myCAF亚型作为关键的预后指标 | 研究样本量有限，且主要关注晚期患者，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其预后价值 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本 | 单细胞组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，组织切片图像 | 未明确样本数量，但包括单细胞测序样本和手术切除标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1433 | 2025-12-20 |
Andrias Davidianus Peptide Hydrogel Enables Sustained SR9011 Release to Promote Efferocytosis and Alleviate Colitis
2025-Dec, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202509049
PMID:41163542
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研究论文 | 本研究探讨了NR1D1在溃疡性结肠炎中的作用，并开发了一种基于大鲵肽水凝胶的NR1D1激动剂SR9011递送系统，以促进胞葬作用并缓解结肠炎 | 首次将NR1D1鉴定为溃疡性结肠炎中上皮细胞更新和胞葬作用的核心调节因子，并创新性地设计了一种结合大鲵肽的水凝胶用于靶向、持续肠道递送NR1D1激动剂SR9011 | 药代动力学分析仅限于结肠组织，未全面评估全身分布 | 研究NR1D1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用，并开发基于水凝胶的NR1D1激活治疗策略 | 人类溃疡性结肠炎活检样本、小鼠结肠炎模型 | 生物医学工程 | 溃疡性结肠炎 | CUT&Tag分析、ChIP-qPCR、荧光素酶测定、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、染色质占据数据、单细胞转录组数据 | 人类UC活检样本和小鼠结肠炎模型（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1434 | 2025-12-20 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00613-y
PMID:41184589
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研究论文 | 本研究揭示了多能心咽祖细胞在细胞周期驱动下通过转录组成熟获得多谱系能力的过程 | 结合转基因样本条形码与单细胞RNA测序技术，首次发现心咽祖细胞在G1、S和G2期转录组动态变化，并提出“转录组成熟”和“行为能力”新概念 | 研究基于海鞘模型，可能不直接适用于高等脊椎动物 | 探究发育过程中多能祖细胞如何通过细胞周期调控获得多谱系分化能力 | 海鞘（Ciona）的心咽祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1435 | 2025-12-20 |
Single-cell profiling reveals three endothelial-to-hematopoietic transitions with divergent isoform expression landscapes
2025-Dec, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00740-z
PMID:41219569
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研究论文 | 本研究结合分化实验和全长单细胞转录组数据，揭示了卵黄囊和主动脉-性腺-中肾区域中三种不同的内皮向造血转化轨迹及其独特的异构体表达模式 | 首次在单细胞水平上识别并定位了三种不同的内皮向造血转化轨迹，并发现AGM区域造血内皮具有更高的异构体复杂性及特异性表达模式 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制探索可能不足，且样本来源和数量有限 | 探究造血内皮中造血祖细胞与造血干细胞命运选择的机制 | 卵黄囊和主动脉-性腺-中肾区域的造血内皮细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 全长单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1436 | 2025-12-20 |
Randomized Spatial PCA (RASP): A computationally efficient method for dimensionality reduction of high-resolution spatial transcriptomics data
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013759
PMID:41370353
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研究论文 | 本文提出了一种名为随机空间主成分分析（RASP）的计算高效方法，用于高分辨率空间转录组学数据的降维处理 | RASP是一种新颖的空间感知降维方法，比现有技术快几个数量级，可扩展至超过10万个位置的数据集，支持非转录组协变量的灵活整合，并能重建去噪和空间平滑的基因表达值 | RASP本身不是聚类或区域检测方法，细胞类型和空间区域需要通过聚类RASP的主成分来获得，且有效聚类分辨率依赖于K最近邻图和平滑参数β | 开发一种计算高效的空间转录组学数据降维方法，以促进组织结构的理解 | 人类和小鼠组织的高分辨率空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 随机空间主成分分析 | PCA | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium, 10x Xenium, 以及Stereo-Seq和MERFISH技术 |
| 1437 | 2025-12-20 |
Hydrogel-Wrapped Calendula officinalis L. extracellular vesicles - A novel approach to enhance fracture healing by Macrophage reprogramming
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102592
PMID:41404424
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研究论文 | 本研究开发了一种包裹金盏花细胞外囊泡的ROS响应性水凝胶，用于通过巨噬细胞重编程促进骨折愈合 | 首次结合单细胞RNA测序、网络药理学和ROS响应性水凝胶技术，开发了具有巨噬细胞靶向功能的植物细胞外囊泡递送系统 | 未在摘要中明确说明 | 阐明骨折愈合过程中M1巨噬细胞极化的机制，并开发一种新型治疗策略 | 骨折愈合过程、巨噬细胞极化、植物细胞外囊泡 | 单细胞组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序, 网络药理学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1438 | 2025-12-20 |
A reappraisal of type 2 cytokine-producing cells in atopic dermatitis: Spotlight on Tc2 cells
2025-Dec, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.09.006
PMID:41073189
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综述 | 本文重新评估了特应性皮炎中产生2型细胞因子的细胞，特别关注Tc2细胞的作用 | 挑战了传统以Th2细胞为中心的范式，通过单细胞RNA测序数据分析提出Tc2细胞可能是IL-13的重要甚至主要来源 | NA | 重新评估特应性皮炎中2型细胞因子的细胞来源，特别是IL-13的产生细胞 | 特应性皮炎病变皮肤中的CD4⁺ Th2细胞和CD8⁺ Tc2细胞 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1439 | 2025-12-20 |
Enhancing RNA Capture Efficiency in Spatial Transcriptomics: A Review of Innovative Technologies and Strategies
2025-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211076
PMID:41303559
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综述 | 本文系统综述了近年来提升空间转录组学中RNA捕获效率的创新技术与策略 | 重点比较了Decoder-seq、Stereo-seq V2、MAGIC-seq和MSN-seq等前沿技术，并强调了针对FFPE临床样本的优化方法以及整合人工智能的计算预测方法 | 作为一篇综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要依赖现有文献进行总结分析 | 提升空间转录组学中RNA捕获效率，并促进该技术在基础研究和临床应用中的效用 | 空间转录组学技术及其相关的RNA捕获策略 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1440 | 2025-12-20 |
COL8A1 regulates endothelial phenotype in inflammatory endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00339.2025
PMID:41042748
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研究论文 | 本研究探讨了胶原蛋白VIII α1链（COL8A1）在炎症诱导的内皮-间质转化（EndMT）中对内皮细胞表型的调控作用 | 首次揭示了COL8A1在炎症性EndMT中的双相调控作用，并阐明其通过NF-κB/Snail信号通路影响内皮稳定性的机制 | 研究主要基于体外细胞模型（HAECs），体内功能验证和临床相关性需要进一步研究 | 探究COL8A1在炎症性内皮-间质转化中的作用机制 | 小鼠和人类内皮细胞，特别是人主动脉内皮细胞（HAECs） | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析，基因过表达与敲低 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠和人类内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |