单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1401	2025-03-19	Radiation from frequent whole-body CT scans induces systemic immunosuppression and immune activation of tumor tissue 2025-Apr, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102326 PMID:40014978	研究论文	本研究探讨了重复全身CT扫描对系统性免疫、肿瘤免疫微环境及肿瘤控制的影响	首次揭示了重复全身CT扫描辐射诱导系统性免疫抑制和肿瘤组织免疫激活的现象	研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明重复全身CT扫描对免疫系统及肿瘤控制的影响	Lewis肺癌小鼠模型	医学影像学	肺癌	ELISA、流式细胞术、免疫组化、RNA测序、单细胞测序	NA	生物样本数据	两组小鼠（对照组和多次全身CT扫描辐射组）
1402	2025-03-19	IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics 2025-Mar-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.111994 PMID:40071147	研究论文	本文探讨了IQGAP2蛋白在调节血脑屏障免疫动态中的作用	揭示了IQGAP2在维持血脑屏障免疫特权中的关键作用，并发现其在阿尔茨海默病中的表达减少	研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，人类数据较少	研究IQGAP2在血脑屏障免疫细胞渗透中的作用	小鼠、斑马鱼和人类组织	分子生物学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、组织样本	小鼠、斑马鱼模型及人类组织样本
1403	2025-03-19	Mediation of macrophage M1 polarization dynamics change by ubiquitin-autophagy-pathway regulated NLRP3 inflammasomes in PD-1 inhibitor-related myocardial inflammatory injury 2025-Mar-18, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-024-01979-1 PMID:40097836	研究论文	本文探讨了免疫检查点抑制剂（ICIs）引起的心肌炎症损伤的机制，特别是通过单细胞测序和动物模型研究了PD-1抑制剂如何通过STAT1/NF-κB/NLRP3信号通路激活心肌炎症，并探讨了泛素-自噬途径在炎症消退中的作用	首次揭示了PD-1抑制剂通过STAT1/NF-κB/NLRP3信号通路激活心肌炎症的机制，并发现泛素-自噬途径在炎症消退中的关键作用	研究主要基于动物模型和单细胞测序数据，临床样本量有限，需要进一步的大规模临床验证	探讨免疫检查点抑制剂（ICIs）引起的心肌炎症损伤的机制，并寻找潜在的治疗方法	肺癌患者和动物模型	免疫学	肺癌	单细胞测序（scRNA-seq）	动物模型和细胞模型	临床数据和实验数据	肺癌患者和动物模型
1404	2025-03-19	PLXDC1+ Tumor-Associated Pancreatic Stellate Cells Promote Desmoplastic and Immunosuppressive Niche in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 2025-Mar-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415756 PMID:40091495	研究论文	本研究通过RNA测序和ATAC-seq技术，结合单细胞和空间转录组学，揭示了胰腺星状细胞（PSCs）在胰腺导管腺癌（PDAC）中的异质性和功能，特别是PLXDC1+肿瘤相关PSCs在肿瘤边界形成促纤维化和免疫抑制微环境的作用	首次通过单细胞和空间转录组学结合ATAC-seq技术，系统性地揭示了PSCs在PDAC中的异质性和功能，并发现了PLXDC1+ TPSCs在免疫治疗中的关键作用	研究主要基于PDAC患者的样本，未涉及其他类型的胰腺癌或其他癌症类型	探究胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的功能和异质性，及其在免疫治疗中的作用	胰腺星状细胞（PSCs）和胰腺导管腺癌（PDAC）	数字病理学	胰腺癌	RNA测序、ATAC-seq、单细胞转录组学、空间转录组学、原位测序	NA	RNA测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据	来自PDAC患者和正常组织的胰腺星状细胞样本
1405	2025-03-19	Decoding Long-Distance Communication Under Mineral Stress: Advances in Vascular Signalling and Molecular Tools for Plant Resilience 2025-Mar-17, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15475 PMID:40091594	review	本文探讨了植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导机制，强调了其在根与茎之间作为通信网络的重要性	揭示了长距离信号传导在维持矿物质稳态和优化生长中的关键作用，并介绍了TRAP-Seq、异种嫁接和单细胞RNA测序等分子工具的新进展	NA	研究植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导机制，以提高作物的抗逆性和矿物质利用效率	植物	植物生物学	NA	TRAP-Seq, 异种嫁接, 单细胞RNA测序	NA	分子数据	NA
1406	2025-03-19	The dynamically evolving cell states and ecosystem from benign nevi to melanoma 2025-Mar-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2971 PMID:40094420	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了从良性痣到黑色素瘤的动态细胞状态变化及其关键机制	首次在先天性黑色素细胞痣（CMN）患者中，通过单细胞转录组测序识别了从痣到黑色素瘤进展过程中的四种不同黑色素细胞亚群状态，并揭示了其功能和调控途径的动态变化	样本量较小，仅涉及5名患者，可能限制了结果的普遍性	探索从良性痣到黑色素瘤的恶性转化过程中的细胞状态变化及其关键机制	5名诊断为先天性黑色素细胞痣（CMN）并发展为黑色素瘤的患者的多对组织样本	数字病理学	黑色素瘤	单细胞转录组测序，bulk RNA-seq	NA	单细胞转录组数据，bulk RNA-seq数据	5名患者的多对组织样本
1407	2025-03-19	Harnessing the Foundation Model for Exploration of Single-cell Expression Atlases in Plants 2025-Mar-17, Genomics, proteomics & bioinformatics DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf024 PMID:40094454	研究论文	本文介绍了一种名为scPlantLLM的Transformer模型，用于处理植物单细胞RNA测序数据，以解决批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战	开发了scPlantLLM模型，采用顺序预训练策略，结合掩码语言建模和细胞类型注释任务，生成鲁棒且可解释的单细胞数据嵌入	NA	解决植物单细胞RNA测序数据中的批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战	植物单细胞RNA测序数据	自然语言处理	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Transformer	单细胞RNA测序数据	数百万个植物单细胞数据点
1408	2025-03-19	Cell Fate Determination of the Potato Shoot Apex and Stolon Tips Revealed by Single-Cell Transcriptome Analysis 2025-Mar-17, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15459 PMID:40095217	研究论文	本文通过单细胞转录组分析揭示了马铃薯茎尖和匍匐茎尖的细胞命运决定	首次对马铃薯茎尖和匍匐茎尖进行单细胞RNA测序，揭示了23个不同的细胞簇及其特异性基因表达模式	未提及具体局限性	研究马铃薯茎尖和匍匐茎尖的转录差异及其细胞命运决定机制	马铃薯茎尖和匍匐茎尖的细胞	植物生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未提及具体样本数量
1409	2025-03-19	A Gremlin 1-expressing splenic niche cell population restrains chronic myeloid leukemia by antagonizing the BMP pathway 2025-Mar-17, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-025-00933-2 PMID:40097655	研究论文	本文探讨了脾脏在白血病发病机制中的关键作用，特别是Gremlin 1表达的脾脏微环境细胞群通过拮抗BMP通路抑制慢性髓性白血病（CML）的进展	揭示了Gremlin 1及其表达的脾脏微环境细胞群在抑制CML中的新机制，这是首次发现脾脏通过这种方式对抗白血病	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证尚不充分	研究脾脏微环境在慢性髓性白血病中的作用机制	小鼠模型和人类样本中的脾脏微环境细胞群	生物医学	慢性髓性白血病	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	小鼠模型和人类样本
1410	2025-03-19	Single-cell atlas of the pregnant equine endometrium before and after implantation† 2025-Mar-16, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf004 PMID:39756438	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了马在胚胎植入前后的子宫内膜细胞的转录组和细胞亚群	发现了马子宫内膜中新的免疫细胞亚群，如常驻先天淋巴细胞和黏膜相关不变T细胞，并揭示了子宫内膜自然杀伤细胞（eNK）在胚胎植入期间的重要作用	研究仅关注了马这一物种，未与其他物种进行广泛比较，且样本量相对较小	确定和比较马在胚胎植入前后的子宫内膜细胞的转录组和细胞亚群	马的子宫内膜细胞	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	近97,000个子宫内膜细胞
1411	2025-03-19	CCL20/CXCL5 Drives Crosstalk Between Anaplastic Thyroid Cancer Stem Cells and Tumor-Associated Macrophages to Promote Tumor Progression 2025-Mar-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405399 PMID:40091357	研究论文	本文探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）与未分化甲状腺癌（ATC）之间的动态相互作用，揭示了CCL20/CXCL5轴在促进肿瘤进展中的关键作用	揭示了CCL20/CXCL5轴在TAMs与未分化甲状腺癌干细胞（ATCSCs）之间的相互作用机制，并验证了其对肿瘤干细胞特性的调控作用	研究主要基于体外实验和异种移植模型，缺乏临床样本的直接验证	探究TAMs与ATCSCs之间的相互作用机制及其对肿瘤进展的影响	未分化甲状腺癌干细胞（ATCSCs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	肿瘤生物学	甲状腺癌	单细胞RNA测序、细胞因子/趋化因子阵列、蛋白质组学、mRNA表达数据集分析	异种移植模型	RNA测序数据、蛋白质组学数据	NA
1412	2025-03-19	Single-cell and chromatin accessibility profiling reveals regulatory programs of pathogenic Th2 cells in allergic asthma 2025-Mar-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57590-3 PMID:40089475	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析，揭示了过敏性哮喘中致病性Th2细胞的调控程序	发现了肺致病性Th2细胞的两个高度促炎亚群，并揭示了TSLP和TNFRSF成员在体外生成pTh2细胞中的重要作用	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类过敏性哮喘的复杂性	研究过敏性哮喘中致病性Th2细胞的异质性和表观遗传调控	小鼠模型中的肺致病性Th2细胞	免疫学	过敏性哮喘	单细胞RNA测序，染色质可及性分析	NA	RNA测序数据，染色质可及性数据	NA
1413	2025-03-19	Novel immune drug combination induces tumour microenvironment remodelling and reduces the dosage of anti-PD-1 antibody 2025-Mar-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87344-6 PMID:40089538	研究论文	本文探讨了一种新型免疫药物组合如何通过重塑肿瘤微环境来减少抗PD-1抗体的剂量	提出了一种结合两种佐剂和三种新抗原肽的新型免疫药物组合，有效增强了低剂量抗PD-1单克隆抗体的治疗效果	研究仅在鼠类结直肠癌模型中进行，尚未在人体临床试验中验证	研究目的是探索减少抗PD-1抗体剂量同时保持抗肿瘤效果的新策略	鼠类结直肠癌模型中的MC38细胞系	肿瘤免疫学	结直肠癌	流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体库分析	NA	基因表达数据、细胞表型数据	鼠类结直肠癌模型
1414	2025-03-19	LINC02363: a potential biomarker for early diagnosis and treatment of sepsis 2025-Mar-15, BMC immunology IF:2.9Q3 DOI:10.1186/s12865-025-00702-x PMID:40089725	研究论文	本研究旨在识别在脓毒症中起关键作用的lncRNAs，并为脓毒症的诊断和治疗提供潜在的生物标志物	通过转录组数据分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞测序，首次发现LINC02363在脓毒症中的关键作用，并验证其作为新的生物标志物的潜力	研究依赖于公开的转录组数据，样本来源和数量可能有限，且需要进一步实验验证LINC02363的临床应用价值	识别脓毒症中的关键lncRNAs，探索其作为诊断和治疗标志物的潜力	脓毒症患者的转录组数据	生物信息学	脓毒症	转录组分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、qPCR	NA	转录组数据	从中国国家基因库（CNGBdb）获取的脓毒症患者数据，具体样本数量未明确
1415	2025-03-19	Kinesin family member 14 expression and its clinical implications in colorectal cancer 2025-Mar-15, World journal of gastrointestinal oncology IF:2.5Q3 DOI:10.4251/wjgo.v17.i3.102696 PMID:40092935	研究论文	本研究评估了Kinesin家族成员14（KIF14）在结直肠癌（CRC）中的表达及其临床意义，并探讨了其与氯化硝基喹啉（NC）的相互作用	首次通过多中心高通量数据和单细胞测序技术验证了KIF14在CRC中的表达及其作为治疗靶点的潜力	研究样本量有限，且未进行大规模临床试验验证KIF14作为治疗靶点的有效性	评估KIF14在CRC中的临床意义及其作为治疗靶点的潜力	结直肠癌（CRC）患者和细胞系	癌症研究	结直肠癌	免疫组织化学染色、高通量数据分析、单细胞测序、CRISPR敲除筛选、全基因组测序、分子对接	NA	蛋白质表达数据、mRNA水平数据、单细胞测序数据	208名CRC患者、2436个CRC样本、1320个非癌性结直肠组织对照
1416	2025-03-19	Advances and global trends of precancerous lesions of gastric cancer: A bibliometric analysis 2025-Mar-15, World journal of gastrointestinal oncology IF:2.5Q3 DOI:10.4251/wjgo.v17.i3.102111 PMID:40092937	综述	本文通过文献计量学方法，全面回顾了胃癌前病变（PLGC）的研究现状，分析了发展趋势和研究热点	利用文献计量学工具（如VOSviewer、CiteSpace等）对2004年至2023年间发表的PLGC相关研究进行了系统分析，揭示了研究热点和未来方向	研究主要基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献，且未深入探讨具体研究方法的局限性	全面回顾胃癌前病变的研究现状，分析发展趋势和研究热点，为未来研究提供指导	胃癌前病变（PLGC）相关研究	文献计量学	胃癌	单细胞测序、空间分辨分析、多组学方法、人工智能、机器学习	NA	文献数据	4097篇文章
1417	2025-03-19	Comparative Single-Cell Transcriptomics of Human Neuroblastoma and Preclinical Models Reveals Conservation of an Adrenergic Cell State 2025-Mar-14, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1507 PMID:39808065	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了人类神经母细胞瘤与临床前模型的转录组特征，揭示了肾上腺素能细胞状态的保守性	首次通过单细胞RNA测序技术，系统比较了人类神经母细胞瘤与TH-MYCN转基因小鼠模型及体外肿瘤球模型的转录组特征，发现这些模型能很好地模拟神经母细胞瘤的细胞特性，并提出了将交感神经母细胞推向嗜铬细胞样状态作为潜在治疗策略的新思路	研究主要基于TH-MYCN转基因小鼠模型，可能无法完全代表所有类型的神经母细胞瘤	验证临床前模型在模拟神经母细胞瘤细胞特性方面的准确性，并探索潜在的治疗策略	人类神经母细胞瘤、TH-MYCN转基因小鼠模型、体外肿瘤球模型	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞RNA测序	TH-MYCN转基因小鼠模型、体外肿瘤球模型	RNA测序数据	人类神经母细胞瘤样本、TH-MYCN转基因小鼠肿瘤样本、体外肿瘤球样本
1418	2025-03-19	Functional and molecular single-cell analyses implicate PRDM14 in the initiation of B cell leukemia in mice 2025-Mar-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93043-z PMID:40087379	研究论文	本文通过单细胞功能与分子分析，探讨了PRDM14在小鼠B细胞白血病起始中的作用	揭示了PRDM14通过非特异性DNA结合激活致癌途径，并促使细胞向自我更新的B-1样表型发展，从而启动癌症的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类癌症中验证	探讨PRDM14在B细胞白血病起始中的分子机制	小鼠T细胞淋巴母细胞白血病/淋巴瘤模型中的Prdm14表达细胞	分子生物学	白血病	质谱流式细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序	小鼠模型	单细胞RNA测序数据、质谱流式细胞术数据	小鼠骨髓样本
1419	2025-03-19	Macrophage-derived SPP1 exacerbate myocardial injury by interacting with fibroblasts in viral myocarditis 2025-Mar-14, Biology direct IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13062-025-00621-2 PMID:40087693	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和体外共培养实验，研究了病毒性心肌炎（VMC）急性期巨噬细胞衍生的SPP1对心肌损伤的影响	揭示了Spp1+巨噬细胞在VMC急性期自我招募的机制，并发现巨噬细胞衍生的SPP1通过促进成纤维细胞高表达Ccl2/Ccl7加剧心肌免疫损伤	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨病毒性心肌炎的免疫致病机制	小鼠心脏中的巨噬细胞和成纤维细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	CVB3诱导的VMC小鼠模型
1420	2025-03-19	Combination therapy with Chicoric acid and PD-1/PD-L1 blockade improves the immunotherapy response in patient-derived ovarian cancer xenograft model 2025-Mar-14, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02146-7 PMID:40087780	研究论文	本研究探讨了Chicoric acid（CA）与PD-1/PD-L1阻断联合治疗在卵巢癌患者来源的异种移植模型中的免疫治疗效果	首次将CA与PD-1/PD-L1阻断联合应用于卵巢癌治疗，并发现CA能增强免疫细胞对卵巢癌细胞的抗肿瘤能力	研究仅限于患者来源的异种移植模型，未进行临床试验验证	开发新的有效治疗策略以改善难治性卵巢癌的免疫治疗效果	难治性卵巢癌患者来源的异种移植模型	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，免疫组化	患者来源的异种移植模型（PDX）	单细胞RNA测序数据，免疫组化数据	15个样本中的158,734个细胞