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当前共找到 10549 篇文献,本页显示第 1381 - 1400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1381 2026-01-22
Visualizing stability: a sensitivity analysis framework for t-SNE embeddings
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本文提出一个计算框架,用于扩展标准t-SNE图,通过可视化线索展示t-SNE嵌入的稳定性 结合隐函数定理与自动微分进行敏感性分析,计算嵌入对输入数据的敏感性,并通过雅可比矩阵热图可视化特征影响和结构不稳定区域 未明确讨论框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 开发一个框架来评估t-SNE嵌入的稳定性和可解释性,以增强生物信息学中的科学结论严谨性 高维生物数据,包括批量RNA-seq、蛋白质组学和单细胞转录组学数据集 机器学习 NA t-SNE, 敏感性分析, 自动微分 t-SNE 高维数据 三个不同的生物数据集 NA bulk RNA-seq, proteomics, single-cell transcriptomics NA NA
1382 2026-01-22
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
综述 本文综述了肿瘤内微生物组研究中的新兴技术、当前挑战以及未来的发展方向 系统性地总结了用于克服肿瘤内微生物低生物量检测挑战的新兴技术,包括改进的污染控制策略、高分辨率检测方法以及人工智能辅助的多组学整合分析,并指出了该领域从描述性研究向机制理解和临床转化发展的趋势 NA 探讨肿瘤内微生物组研究领域的技术挑战、最新进展及未来前景,以推动该领域向机制研究和临床转化发展 肿瘤内微生物组 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 厌氧培养优化, 基因组解析分析, 酶水平分析, 人工智能辅助分析 NA 微生物组数据, 临床数据, 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1383 2026-01-22
Tumor-like characteristics of vascular smooth muscle cells in atherosclerosis
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
综述 本文综述了动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表现出的类肿瘤特征,包括DNA损伤、基因组不稳定性、逃避衰老、过度增殖、迁移与侵袭激活、癌症干细胞样特性以及癌症相关信号通路激活 通过谱系追踪和单细胞转录组学技术,揭示了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中表现出高度可塑性和类肿瘤特征,这一发现挑战了传统观点 NA 探讨动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的类肿瘤特征,为针对血管平滑肌细胞的新治疗策略提供理论基础 血管平滑肌细胞及其衍生细胞 数字病理学 心血管疾病 谱系追踪,单细胞转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1384 2026-01-21
The role of IRF-1 in mediating T-cell immune imbalance in systemic lupus erythematosus and the construction of a diagnostic model
2025-12-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 本研究探讨了IRF-1在系统性红斑狼疮中T细胞免疫失衡的作用,并构建了一个基于机器学习的诊断模型 整合单细胞转录组、批量转录组和临床样本数据,首次系统分析了IRF-1在SLE不同疾病阶段T细胞亚群中的动态变化,并开发了基于IRF-1相关基因的机器学习诊断模型 NA 阐明IRF-1在系统性红斑狼疮免疫失衡中的作用,并开发一种非侵入性诊断工具 系统性红斑狼疮患者和对照个体的T细胞亚群 自然语言处理 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 广义线性模型, 偏最小二乘法, 以及其他四种机器学习模型 转录组数据, 临床数据 单细胞数据集GSE254176,6个批量转录组数据集(共1079名SLE患者和137名对照),以及临床样本(70名SLE患者和58名对照) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1385 2026-01-21
Transcriptome-wide mapping reveals an RNA-dependent mechanism of platinum cancer drugs
2025-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过开发PlatRNA-seq技术,系统性地研究了铂类抗癌药物(如顺铂)与RNA的相互作用,揭示了其RNA依赖性作用机制 首次开发了PlatRNA-seq技术,在全转录组水平上绘制顺铂的RNA结合图谱,并发现顺铂通过结合RNA G-四链体结构介导细胞毒性,为非经典RNA作用机制提供了直接证据 研究主要聚焦于顺铂,其他铂类药物的RNA结合特性尚未全面探索;临床样本分析仅限于卵巢癌患者,需在其他癌症类型中验证 探究临床抗癌药物(特别是顺铂)与RNA的相互作用及其在化疗中的功能意义 临床批准的抗癌药物(以顺铂为代表)及其在癌细胞中的RNA靶标 转录组学 卵巢癌 PlatRNA-seq(点击化学增强的全转录组分析)、单细胞RNA-seq、基因组学、生物物理学和计算分析 NA RNA-seq数据 来自初治卵巢癌患者肿瘤活检的单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1386 2026-01-21
PD-1 regulates CD4+ T cell-mediated CD8+ T cell responses in the brain to balance viral control and neuroinflammation
2025-Dec-12, Research square
研究论文 本研究探讨了PD-1在鼠多瘤病毒脑炎中如何通过调节CD4+ T细胞介导的CD8+ T细胞反应,平衡病毒控制与神经炎症 揭示了PD-1在脑部自主性作用中,通过CD4 T细胞内在信号调节CD8 T细胞效应功能,平衡抗病毒防御与神经损伤的新机制 研究基于鼠模型,可能不完全反映人类进行性多灶性白质脑病的复杂情况,且未详细探讨PD-1阻断治疗在患者中效果多变的临床因素 探究PD-1在多瘤病毒中枢神经系统感染中调节T细胞反应以平衡病毒清除与神经炎症的机制 鼠多瘤病毒感染模型中的脑部CD4和CD8 T细胞 免疫学 神经感染性疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1387 2026-01-21
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境中的叶片细胞,以探索异叶性的分子机制 首次对水蓑衣这一新兴异叶性模型植物进行单细胞转录组测序,为在单细胞水平解析植物环境适应机制提供了基础数据 未明确提及实验样本量或技术重复次数,可能影响统计可靠性 探索异叶性(植物根据环境改变叶片形态的适应策略)的分子机制 水蓑衣(Hygrophila difformis)在陆生和水生环境中的叶片原生质体 植物生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1388 2026-01-21
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了胶质母细胞瘤中LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动替莫唑胺耐药的新机制 首次发现LMNA-PRKDC轴通过形成DNA修复复合物增强胶质母细胞瘤的DNA修复能力,并鉴定PRKDC抑制剂可作为逆转耐药的新策略 研究主要基于患者来源的异种移植模型和单细胞测序数据,临床转化效果仍需进一步验证 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺产生耐药性的分子机制,并寻找逆转耐药的潜在治疗靶点 胶质母细胞瘤患者来源的肿瘤组织、异种移植模型以及原发和复发肿瘤标本 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、免疫共沉淀 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 患者来源的异种移植模型和原发/复发胶质母细胞瘤标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1389 2026-01-21
Spatial transcriptomics of glioblastoma defines biologically and clinically significant reprogramming patterns across unique spatial microenvironments
2025-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析胶质母细胞瘤,揭示了其在独特空间微环境中的生物学重编程模式及其临床意义 开发了一种新颖的空间信息整合方法,将基因共表达网络模块识别的生物学重编程与细胞间通讯的特定变化相结合,提供了对转录因子调控、细胞相互作用和生物通路活性的空间模式的新见解 研究样本量相对较小(14个样本),可能限制了结果的普遍性 定义胶质母细胞瘤的生物学重编程、肿瘤微环境重组和细胞间相互作用,以揭示空间微环境对肿瘤行为和治疗反应的影响 胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤样本,特别是来自Ivy胶质母细胞瘤图谱项目的空间定义区域 数字病理学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 基因共表达网络模块 空间转录组数据 14个胶质母细胞瘤样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间转录组学平台
1390 2026-01-21
Clinical Interventions and Inflammatory Signaling Shape the Transcriptional and Cellular Architecture of the Early Postnatal Lung
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞测序技术构建了人类出生后早期(0-2岁)肺部的细胞图谱,揭示了肺泡II型细胞的两种新转录状态及其与炎症信号和临床干预的关联 首次在人类出生后早期肺部发现了肺泡II型细胞的两种互斥转录状态,并建立了其与炎症信号通路及临床抗炎干预的直接联系 样本量相对有限(23例),且均为组织学正常的标本,可能无法完全代表疾病状态下的情况 探究人类出生后早期肺部的细胞发育和重塑机制,及其与肺部疾病的关系 人类出生后早期(0-2岁)的肺部组织 单细胞组学 肺部疾病 单核RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 23例个体的组织学正常肺部标本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1391 2026-01-21
Cell and molecular profiles in peripheral nerves shift toward inflammatory phenotypes in diabetic peripheral neuropathy
2025-Oct-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过转录组学和空间转录组学分析,揭示了糖尿病周围神经病变(DPN)中周围神经的细胞和分子谱向炎症表型转变,并探讨了感觉轴突mRNA转运在神经退行性变中的潜在作用 首次在人类DPN神经中结合转录组学和空间转录组学分析,揭示了神经类型特异性免疫特征,并发现了感觉轴突中mRNA(如SCN9A和TRPV1)的显著定位现象 样本主要来自截肢手术的糖尿病患者,对照组来自跨面神经移植手术,可能存在组织来源和疾病状态的异质性 深入探究糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞表型变化 糖尿病患者的胫神经和腓肠神经,以及对照组的腓肠神经 数字病理学 糖尿病周围神经病变 转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 来自下肢截肢术的胫神经和腓肠神经(主要来自糖尿病患者),以及来自跨面神经移植手术的对照腓肠神经 NA 空间转录组学 NA NA
1392 2026-01-21
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
研究论文 本文介绍了一种名为Spatia的多模态模型,用于预测和生成空间细胞表型,通过融合细胞形态、基因表达和空间上下文信息来学习统一表示 Spatia首次提出了一种多尺度生成和预测模型,能够整合图像衍生的形态标记和转录组向量标记,并通过跨注意力机制和Transformer模块在单细胞、生态位和组织水平上捕获空间依赖性,同时利用生成扩散解码器合成高分辨率细胞图像 NA 学习统一的、空间感知的表示,以整合细胞形态、基因表达和空间上下文,从而理解组织功能 细胞形态、基因表达和空间组织 数字病理学 NA 空间转录组学 Transformer, 生成扩散模型 图像, 基因表达数据 涉及49名捐赠者、17种组织类型和12种疾病状态,包括1700万个细胞-基因对、100万个生态位-基因对和1万个组织-基因对 NA 空间转录组学 NA NA
1393 2026-01-21
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了唐氏综合征患者中肝脏代谢的改变,特别是胆汁酸水平升高和肝功能异常蛋白标志物 首次在唐氏综合征中系统报道了广泛的代谢变化,并利用小鼠模型和单细胞转录组学验证了胆汁酸代谢紊乱与肝脏病理的关联 研究样本量相对有限,且主要基于血浆分析,未深入探讨其他组织或长期临床影响 探究唐氏综合征中肝脏代谢的改变及其潜在机制 唐氏综合征患者和小鼠模型 代谢组学 唐氏综合征 多组学分析、bulk RNA-seq、单细胞转录组学 Dp16小鼠模型 血浆、RNA序列数据 超过400人 NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 NA NA
1394 2026-01-21
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法,用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 scLANE测试基于可解释的广义线性模型,通过经验选择的基样条处理非线性,并扩展至估计方程和混合模型,以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 NA 开发一种可解释的轨迹推断方法,以识别与生物轨迹进展显著相关的基因表达变化 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq 广义线性模型(GLM)、基样条、估计方程、混合模型 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1395 2026-01-21
Cigarette smoke and biological age induce degenerative heterogeneity in retinal pigment epithelium
2025-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了香烟烟雾通过表观遗传变化诱导视网膜色素上皮细胞退行性异质性,并加速衰老的过程 首次结合snRNA-seq和snATAC-seq技术,揭示了香烟烟雾诱导的RPE细胞退行性异质性及其与衰老的差异,并在人类样本中验证了与早期年龄相关性黄斑变性的关联 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,可能无法完全反映人类疾病的复杂性 探究香烟烟雾如何通过表观遗传机制诱导视网膜色素上皮细胞的退行性异质性,并加速衰老过程 年轻和老年小鼠的视网膜色素上皮/脉络膜组织,以及吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 snRNA-seq, snATAC-seq, scRNA-seq, TUNEL标记 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 年轻和老年小鼠的RPE/脉络膜组织,以及来自吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1396 2026-01-20
Erythrocyte-microglia crosstalk contributing to sex differences in pediatric brain tumorigenesis
2025-Dec-10, Research square
研究论文 本研究揭示了红细胞与小胶质细胞之间的相互作用如何导致儿童脑肿瘤(以髓母细胞瘤为模型)发病率的性别差异,并发现新生儿高胆红素血症是潜在的可干预风险因素 首次发现红细胞膜糖蛋白GYPA表达差异通过影响小胶质细胞的红细胞吞噬作用及脂质代谢,导致神经前体细胞分化速度的性别差异,从而解释男性儿童脑肿瘤发病率更高的机制 研究主要基于髓母细胞瘤模型,其他儿童脑肿瘤类型的普适性需进一步验证;临床数据的meta分析可能存在混杂因素 探究儿童脑肿瘤发病率性别差异的细胞与分子机制 发育中的人和小鼠小脑组织、神经前体细胞、小胶质细胞、红细胞 肿瘤生物学 髓母细胞瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据、临床数据 未明确说明具体样本数量,涉及人和小鼠的发育小脑组织及临床数据meta分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1397 2026-01-20
Hypoxia-induced USP13 expression drives ferroptosis resistance and tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma through the stabilization of ACLY
2025-Dec-02, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了缺氧诱导的USP13通过稳定ACLY蛋白,驱动肝细胞癌的铁死亡抵抗和肿瘤免疫逃逸,并验证了靶向USP13的治疗潜力 首次阐明了缺氧/HIF-1α/USP13/ACLY轴在肝细胞癌中介导铁死亡抵抗和免疫逃逸的分子机制,并发现USP13抑制剂2-Methoxyestradiol具有抗肿瘤疗效 研究主要基于临床前模型(细胞系、动物模型、PDOs),尚未进行人体临床试验;USP13抑制剂的特异性和潜在脱靶效应需进一步评估 探索USP13在肝细胞癌进展中的作用,并评估其作为诱导铁死亡和增强免疫反应的治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者来源的类器官、肝细胞癌细胞系和动物模型 癌症生物学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术分析、蛋白质稳定性分析 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 未明确具体样本数量,但使用了患者来源的类器官、多种细胞系和动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1398 2026-01-20
Folic acid prevents inner hair cell degeneration via genomic stability
2025-Dec-02, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了钙稳态破坏在内毛细胞损伤中的作用,并发现叶酸可能是一种有前景的保护毛细胞的治疗剂 首次揭示了低频率与高频率内毛细胞在钙清除率上的差异与PMCA1表达相关,并利用特异性敲除小鼠模型结合单细胞RNA-seq分析,发现叶酸通过降低DNA损伤标志物γ-H2A.X水平来保护内毛细胞 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证,且具体分子机制细节有待深入探索 探究内毛细胞损伤的机制及预防策略 内毛细胞,特别是Pmca1特异性敲除小鼠模型中的内毛细胞 NA 听力损失 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1399 2026-01-20
HDAC4 Promotes Neuroprotection of Retinal Ganglion Cells After Optic Nerve Injury
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了HDAC4在视神经损伤后视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的作用 首次将HDAC4鉴定为视神经损伤后RGC生存和轴突再生的关键调节因子,并展示了其突变体对基因表达变化的调控能力 研究基于小鼠视神经挤压模型,可能无法完全模拟人类青光眼或其他视神经病变的复杂性 探索HDAC4在视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的功能,以开发针对青光眼等视神经病变的治疗策略 小鼠视网膜神经节细胞 神经科学 青光眼 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1400 2026-01-20
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控心脏神经嵴细胞分化,为CHARGE综合征相关心脏缺陷提供了新见解 首次发现CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控其自身表达,并证明SOX5过表达可恢复CHD7单倍体不足细胞中的基因表达和心肌细胞分化能力 研究主要基于体外细胞培养模型,体内验证和临床转化潜力仍需进一步探索 探究CHD7在心脏神经嵴细胞分化中的作用机制及其与CHARGE综合征心脏缺陷的关联 心脏神经嵴细胞 发育生物学 先天性心脏病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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