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当前共找到 10543 篇文献，本页显示第 1381 - 1400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1381 | 2026-03-06 |
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf052
PMID:40440093
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研究论文 | 本文提出了一种名为自动投影追踪（APP）的无监督聚类方法，通过将高维数据顺序投影到低维表示来缓解维度诅咒，并在多种生物数据模态上验证其有效性 | 提出了一种替代传统高维空间聚类的方法，通过自动投影追踪技术降低维度诅咒的影响，从而更有效地揭示生物数据中的模式 | 未明确说明方法在极端高维或噪声数据下的鲁棒性，以及计算效率的详细评估 | 开发一种能缓解维度诅咒的无监督聚类方法，以改善高维生物数据的分析 | 高维生物数据，包括转录组学、蛋白质组学、单细胞组学数据等 | 机器学习 | NA | 自动投影追踪（APP） | 无监督聚类算法 | 高维生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 质谱细胞术, 多重成像, T细胞受体库分析 | NA | NA |
| 1382 | 2026-03-06 |
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_502
PMID:37930627
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研究论文 | 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的样本制备方法 | 开发了针对角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液的分离协议，并结合自噬缺陷模型进行scRNA-seq分析 | NA | 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的影响 | 小鼠角膜缘上皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1383 | 2026-03-06 |
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549206
PMID:40201184
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研究论文 | 本研究通过免疫组化、bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，分析了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征，并探讨了梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃逸机制 | 首次结合单细胞RNA测序和免疫组化技术，系统描绘了二期梅毒皮肤病变中的免疫细胞组成和细胞间通讯网络，并揭示了表皮TLR-MYD88通路在宿主应答中的关键作用 | 研究样本来源于福尔马林固定石蜡包埋的组织，可能影响RNA质量和单细胞测序的灵敏度；体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境 | 阐明梅毒螺旋体在皮肤感染过程中的免疫逃逸机制和宿主免疫应答特征 | 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人外周血单个核细胞（PBMCs）、原代角质形成细胞和MyD88敲除角质形成细胞 | 数字病理学 | 梅毒 | 免疫组化（IHC）、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 二期梅毒患者的皮肤活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1384 | 2026-03-06 |
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105299
PMID:40303351
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研究论文 | 本研究探讨了丝氨酸补充对抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管新生的作用及其机制 | 首次系统性地在氧诱导视网膜病变小鼠模型中，通过多组学分析和单细胞RNA测序，揭示了丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性血管新生的新机制，并鉴定出HMGB1蛋白作为关键介导因子 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证；干预时间点和剂量方案有待优化；对丝氨酸代谢下游具体信号通路的解析还不够深入 | 探究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的病理性视网膜血管新生中的作用及分子机制 | 野生型C57BL/6J小鼠的氧诱导视网膜病变模型 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 代谢组学, 脂质组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 | 动物模型 | 多组学数据, 图像, 文本 | 未明确具体数量的小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1385 | 2026-03-06 |
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1646849
PMID:41208961
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了犬和人类肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征，并评估了犬NK免疫疗法试验中的候选生物标志物 | 首次在犬类中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析，建立了犬肉瘤浸润NK细胞特征，并将此特征应用于首次犬免疫疗法临床试验的NK细胞变化背景分析 | 研究样本可能有限，且犬类模型虽与人类相似，但物种间差异仍需谨慎考虑，临床试验的规模和多样性可能不足 | 改善NK细胞在实体癌症中的疗效，并识别跨物种反应的潜在生物标志物 | 犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本，具体数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1386 | 2026-03-05 |
Tumor-infiltrating B cells produce tumor-specific antibodies and may contribute to suppressing tumor in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2543019
PMID:40778950
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等多组学技术，首次揭示了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤浸润B细胞通过产生肿瘤特异性抗体并激活免疫细胞来抑制肿瘤的机制 | 首次在头颈部鳞状细胞癌中系统性地证明了肿瘤浸润B细胞能够产生肿瘤特异性抗体，并揭示了其通过激活巨噬细胞和NK细胞来增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于手术切除的肿瘤样本，缺乏对治疗过程中B细胞动态变化的纵向观察，且抗体功能验证主要在体外进行 | 阐明肿瘤浸润B细胞在头颈部鳞状细胞癌肿瘤免疫中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，B细胞受体谱分析，多重免疫荧光染色，空间转录组学分析，蛋白质微阵列 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，蛋白质表达数据，免疫组化图像 | 68例头颈部鳞状细胞癌手术切除标本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1387 | 2026-03-05 |
Spatial analysis reveals the cellular microenvironments and mechanisms of inflammation and kidney injury in acute interstitial nephritis
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.29.684811
PMID:41278888
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率成像质谱流式细胞术和单细胞空间转录组学分析急性间质性肾炎（AIN）患者肾活检组织，揭示了其独特的免疫微环境和分子机制 | 首次通过空间多组学技术系统解析AIN的细胞微环境，发现CXCL9-CXCR3轴是AIN的特异性免疫特征，并鉴定出烟酰胺磷酸核糖转移酶（NAMPT）在协调代谢-炎症微环境中的关键作用 | 样本量相对有限，且为横断面研究，未能验证潜在治疗靶点的临床疗效 | 阐明急性间质性肾炎的发病机制并识别潜在治疗靶点 | 人类肾活检组织（包括AIN、非免疫性急性肾小管损伤及对照组织） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 成像质谱流式细胞术，单细胞空间转录组学 | 空间分析模型 | 空间多组学数据（蛋白质+转录组） | 人类肾活检组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1388 | 2026-03-05 |
p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia
2025-Sep-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182880
PMID:40763040
|
研究论文 | 本研究揭示了p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真性的关键作用 | 首次发现Cap2细胞在高氧损伤中被Cap1细胞替代，并证实EC特异性p53缺失可通过诱导过渡性内皮细胞状态改善血管表型和肺泡简化 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限；过渡性EC状态的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究p53在新生儿高氧诱导肺损伤修复过程中对内皮细胞谱系保真性的调控作用 | 新生小鼠肺组织内皮细胞亚群（Cap1/Cap2）及人类支气管肺发育不良（BPD）伴肺动脉高压样本 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良（BPD） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量（含小鼠模型和人类BPD样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1389 | 2026-03-05 |
Increased inflammation as well as decreased endoplasmic reticulum stress and translation differentiate pancreatic islets from donors with pre-symptomatic stage 1 type 1 diabetes and non-diabetic donors
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06417-3
PMID:40457096
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析比较了1型糖尿病前期（阶段1）与非糖尿病供体的胰岛蛋白质变化 | 首次在人类胰岛中应用无偏蛋白质组学方法，揭示1型糖尿病前期胰岛的分子变化，包括免疫反应增强和内质网应激及蛋白质翻译减少 | 样本量较小（n=3 vs n=3），存在供体间变异，统计分析的挑战性较大 | 识别胰岛中指示β细胞功能障碍的途径，了解1型糖尿病前期的分子机制 | 来自器官供体的胰岛组织，包括多自身抗体阳性（mAAb+）的1型糖尿病前期供体与非糖尿病（ND）对照供体 | 蛋白质组学 | 1型糖尿病 | 激光显微切割，质谱（MS）蛋白质组学，无标记定量，单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据，RNA-seq数据 | 10名器官供体（5名自身抗体阳性，5名非糖尿病对照），最终分析聚焦于3名多自身抗体阳性供体与3名匹配对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1390 | 2026-03-04 |
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509534122
PMID:41337486
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研究论文 | 本文通过结合遗传条形码和单细胞转录组学技术，追踪食管癌前病变细胞的谱系，揭示了高可塑性前体细胞的动态变化及其在肿瘤发生中的作用 | 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合，用于追踪食管癌前病变细胞的谱系，并识别出具有高可塑性的独特前体细胞群体 | 未明确提及样本量或具体技术平台细节，可能限制结果的普遍性 | 阐明食管癌前病变细胞的起源和轨迹，以理解早期肿瘤发生机制 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，遗传条形码，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1391 | 2026-03-04 |
Single-cell analysis identifies PI3+S100A7+keratinocytes in early cervical squamous cell carcinoma with HPV infection
2025-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003795
PMID:40947786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在早期宫颈鳞状细胞癌中鉴定出与HPV感染相关的PI3+S100A7+角质形成细胞，并揭示了其与肿瘤微环境中巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的相互作用 | 首次在早期HPV阳性宫颈鳞状细胞癌中鉴定出PI3+S100A7+角质形成细胞亚群，并系统揭示了该细胞亚群与巨噬细胞之间的空间邻近性和信号通路互作，以及不同HPV亚型（如HPV16与HPV66）驱动的独特肿瘤促进机制 | 样本量较小（仅4例患者），且研究聚焦于早期肿瘤，未涵盖晚期或转移性病例 | 探究HPV感染在早期宫颈鳞状细胞癌发生发展中的作用机制，特别是肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间互作 | 早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及配对癌旁组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，病毒序列比对，轨迹分析，免疫荧光染色，CIBERSORTx分析 | NA | 单细胞转录组数据，临床预后数据，免疫荧光图像数据 | 4例早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤及配对癌旁组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台（具体配置未在摘要中说明，推断为10x Chromium单细胞3'基因表达解决方案） |
| 1392 | 2026-03-04 |
Tumor-expressed GPNMB orchestrates Siglec-9+ TAM polarization and EMT to promote metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503081122
PMID:40892920
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤表达的GPNMB如何通过调控Siglec-9+ TAM极化和EMT来促进三阴性乳腺癌的转移 | 揭示了GPNMB通过诱导单核细胞中次级GPNMB表达，形成前馈放大环路，促进免疫抑制性TAM极化，并首次阐明了GPNMB不同唾液酸化修饰（α2,3 vs α2,6）导致Siglec-9差异识别的机制 | 研究主要基于体外共培养和体内小鼠模型，人类临床样本验证相对有限，且Siglec-9在人体中的功能需进一步验证 | 阐明GPNMB在三阴性乳腺癌转移中的分子机制，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、单核细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、去卷积分析、体外共培养、体内小鼠模型 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 基于公开可用的TNBC scRNA-seq数据集和TNBC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1393 | 2026-03-04 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Aug-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7232080/v1
PMID:40799738
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研究论文 | 本研究通过分析晚期阿尔茨海默病（LOAD）的死后脑组织DNA甲基化数据，识别出两种不同的表观基因组亚型，并揭示了它们与特定小胶质细胞签名和功能机制的关联 | 首次在LOAD中基于全基因组DNA甲基化数据识别出两种一致的表观基因组亚型，并整合单细胞RNA-seq数据揭示了亚型特异性小胶质细胞炎症状态 | 研究基于死后脑组织样本，可能无法完全反映疾病早期或活体状态；样本量相对有限（N=831），且为回顾性分析 | 识别LOAD的表观基因组亚型，并探索其与小胶质细胞签名、功能机制及临床病理特征的关系 | 晚期阿尔茨海默病患者的死后脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、RNA-seq数据 | 831个死后脑组织样本（来自三个独立队列） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1394 | 2026-03-04 |
Gene regulatory networks and essential transcription factors for de novo-originated genes
2025-Aug, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02747-y
PMID:40659874
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研究论文 | 本研究通过计算方法和单细胞RNA测序数据，识别了调控de novo基因表达的关键转录因子，并利用果蝇遗传工具验证了这些转录因子的作用 | 首次揭示了de novo基因的调控程序，识别了关键转录因子如achintya和vismay，并探讨了转录因子复制与de novo基因表达调控的关联 | 研究主要基于果蝇模型，结果在其他物种中的普适性有待验证，且调控机制的实验验证可能有限 | 探究de novo起源基因的调控网络和关键转录因子 | 果蝇中的de novo基因及其调控转录因子 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1395 | 2026-03-04 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.29.646124
PMID:40236135
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架，用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 | 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架，能够同时估计局部（位置特异性）和全局（组织范围）的分子共表达，相比现有主要依赖地理空间指标（如双变量莫兰指数和李氏指数）的方法具有更高的特异性和统计效力 | 未明确说明方法对计算资源的需求或可扩展性限制，也未讨论在超大规模数据集上的应用性能 | 开发稳健的统计方法来检测空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达模式 | 空间转录组学和空间蛋白质组学数据中的分子（基因、肽段、脂质、N-聚糖）共表达关系 | 空间组学 | 癌症（多种类型） | 空间转录组学、质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1396 | 2026-03-04 |
Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011537
PMID:40518290
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内在的SREBP1通过促进巨噬细胞M2样重编程驱动免疫排斥的机制 | 首次通过大规模多组学分析结合单细胞RNA测序和空间脂质组学，系统性识别了肝细胞癌中与免疫排斥相关的32条致癌通路，并确定SREBP1为核心调控因子 | 研究主要基于体外三维共培养模型，缺乏体内实验验证；样本量虽大但单细胞RNA测序样本相对较少（31个） | 识别肝细胞癌中导致免疫检查点抑制剂耐药的新治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本（包括肿瘤组织）和体外培养的HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式细胞术, 空间脂质组学, CRISPR基因敲除 | 三维共培养模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱成像数据 | 900多个人类样本（RNA测序和蛋白质组学）和31个肿瘤单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间脂质组学 | NA | NA |
| 1397 | 2026-03-04 |
Single cell immunophenotyping identifies CD8+ GZMK+ IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.09.658661
PMID:40661371
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和适应性免疫受体测序，首次全面解析了莱姆病皮肤红斑移行（EM）病变中的T细胞免疫应答 | 首次在莱姆病皮肤病变中鉴定出CD8+ GZMK+ IFNG+ T细胞的关键免疫亚群，并发现其克隆扩增和干扰素调控基因的显著差异表达 | 研究样本量虽已扩大但仍有限，且主要聚焦于皮肤局部免疫应答，未涉及系统性免疫反应或长期随访 | 解析莱姆病皮肤病变（红斑移行）中的T细胞免疫表型及其在病原体防御中的作用 | 莱姆病患者的红斑移行（EM）皮肤病变组织与自体未受累皮肤组织 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扩大后的样本集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1398 | 2026-03-04 |
GUIDING CLUSTERING AND ANNOTATION IN SINGLE-CELL RNA SEQUENCING USING THE AVERAGE OVERLAP METRIC
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652497
PMID:40654835
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研究论文 | 本文提出使用平均重叠度量来指导单细胞RNA测序中的聚类和注释，以提高细胞类型识别的准确性和生物学意义 | 引入平均重叠度量来比较差异表达基因的排名列表，从而更精确地评估单细胞聚类结果，特别是在高度相似的细胞群体中 | 方法主要基于转录组相似性，可能未考虑其他生物学因素，且在未知细胞身份的数据集中验证有限 | 开发一种新方法来改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的比较和注释，以更准确地识别细胞类型和亚群 | 单细胞RNA测序数据，包括已知T细胞群体和未分选小鼠胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类算法 | 转录组数据 | 包括已知T细胞群体和未分选小鼠胸腺细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1399 | 2026-03-04 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.15.643144
PMID:40166175
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研究论文 | 本研究通过分析三个独立尸检脑队列的全基因组DNA甲基化数据，识别了晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型，并揭示了它们与特定小胶质细胞状态的关联 | 首次在晚发性阿尔茨海默病中基于全基因组DNA甲基化模式识别出两种可重复的表观基因组亚型，并揭示了它们与特定小胶质细胞炎症状态的关联 | 研究基于尸检脑组织样本，可能无法完全反映疾病早期或活体状态；样本量相对有限（n=831），且为回顾性设计 | 识别晚发性阿尔茨海默病的表观基因组亚型，并探索其细胞类型特异性和功能影响 | 晚发性阿尔茨海默病患者的尸检脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序、转录组分析 | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、转录组数据 | 831例尸检脑组织样本（来自三个独立队列） | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1400 | 2026-03-04 |
Seq-Scope: repurposing Illumina sequencing flow cells for high-resolution spatial transcriptomics
2025-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01065-0
PMID:39482362
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Seq-Scope的高分辨率空间转录组学技术，通过改造Illumina测序流动池实现低成本、高效率的空间转录组分析 | 将Illumina测序平台重新用于高分辨率空间转录组分析，实现了亚微米级分辨率、高捕获效率和低成本，克服了现有商业技术分辨率低、流程复杂、成本高的限制 | 需要研究人员具备分子生物学、组织学和基本Unix技能，且组织处理、文库制备和计算流程仍需3天完成 | 开发一种高分辨率、低成本的空间转录组学技术 | 新鲜冷冻组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 可在7 mm × 7 mm或更大区域内分析多个组织切片 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序流动池 |