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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-02-05 |
Commentary: Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1752400
PMID:41624851
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2026-02-05 |
Decoding thymic development: a single-cell atlas of tree shrew immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689906
PMID:41624883
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了树鼩出生后胸腺发育的全面细胞图谱,揭示了其免疫系统在物种间的保守性与特异性 | 首次通过单细胞RNA测序构建树鼩胸腺发育的细胞图谱,并识别出如ZNF683基因在CD8aa细胞发育后期表达等物种特异性变异 | 研究主要关注胸腺细胞,可能未全面覆盖树鼩整个免疫系统的复杂性;样本年龄范围可能限制了对发育全阶段的理解 | 解析树鼩作为临床前哺乳动物模型的免疫系统,特别是胸腺发育过程 | 树鼩的出生后胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及年轻和年老树鼩的胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-02-03 |
Disturbed flow induces reprogramming of endothelial cells to immune-like and foam cells under hypercholesterolaemia during atherogenesis
2025-Dec-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf233
PMID:41288601
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系示踪技术,验证了在动脉粥样硬化形成过程中,紊乱血流与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞发生免疫样和泡沫样细胞重编程的“双重打击”假说 | 提出了内皮细胞在紊乱血流和高胆固醇血症共同作用下,可重编程为免疫样细胞(EndIT)和泡沫样细胞(EndFT)的新概念,并通过遗传谱系示踪模型进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,虽然分析了人类斑块数据,但仍需更多人类在体研究进一步验证 | 探究紊乱血流与高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生中的协同作用机制,特别是对内皮细胞重编程的影响 | 小鼠颈动脉内皮细胞、人类主动脉内皮细胞(HAECs)以及动脉粥样硬化斑块 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学染色,谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-02-03 |
Single-cell analysis of B cell dysregulation in pediatric sepsis stratified by disease severity
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34126-9
PMID:41476192
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了儿童脓毒症患者外周血白细胞,揭示了B细胞在疾病严重程度分层中的关键作用及其耗竭机制 | 首次在儿童脓毒症中应用单细胞RNA测序技术,识别并验证了自然杀伤样B细胞(NKB)等B细胞亚群的耗竭和转录重编程,拓宽了人类脓毒症中B细胞表型的认知 | 样本量较小(仅6名脓毒症患者和4名健康对照),且研究集中在儿科群体,可能限制结果的普遍性 | 探究儿童脓毒症中B细胞耗竭的机制及其与疾病严重程度的关系 | 儿童脓毒症患者(包括轻度和重度)及健康对照的外周血白细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 6名儿童脓毒症患者(3名轻度,3名重度)和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics and spatial validation reveal dysfunction of keratinocytes and NK cells driving acne development
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34373-w
PMID:41476262
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间免疫荧光技术,揭示了健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮中角质形成细胞与自然杀伤(NK)细胞的功能失调是驱动痤疮发展的关键机制 | 提出了“双重免疫-屏障失衡”的创新病理模型,首次系统阐述了角质形成细胞从防御到异常分化、以及NK细胞从激活到耗竭的时序性功能转变在痤疮进展中的核心作用 | 未明确说明样本的具体数量与人口统计学特征,且空间验证主要依赖免疫荧光技术,可能缺乏更高通量的空间多组学数据支撑 | 阐明痤疮发生发展的细胞与分子机制,为早期诊断和精准干预提供理论基础 | 健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病(痤疮) | 单细胞RNA测序,空间免疫荧光 | 伪时间分析,功能富集分析 | 单细胞转录组数据,空间成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2026-02-03 |
VAMP5 promotes glioma progression through bioinformatics analysis clinical correlation and functional validation
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04375-1
PMID:41467924
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、临床关联和功能验证,揭示了VAMP5在胶质瘤进展中的促进作用 | 首次系统性地整合多组学数据(TCGA、GEO、单细胞RNA测序)并结合体外体内实验,全面阐明了VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义、功能角色及免疫调节机制,提出其作为新型预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和细胞系/动物模型,缺乏大规模前瞻性临床队列验证;VAMP5的具体下游信号通路和与免疫微环境相互作用的分子细节仍需进一步探索 | 探究VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义及功能作用,以寻找新的诊断、预后和治疗靶点 | 胶质瘤组织、正常脑组织、胶质母细胞瘤(GBM)细胞系、动物模型 | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、实时定量PCR、免疫组织化学、Western blot、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析、免疫浸润分析、体外功能实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、临床病理数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据、实验数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集及临床样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2026-02-03 |
Integrated transcriptomic and single-cell analysis reveals cell cycle dysregulation and cellular heterogeneity in lung cancer
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04303-3
PMID:41467951
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析,揭示了肺癌中细胞周期失调和细胞异质性 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,识别了与临床表型相关的基因模块及细胞周期关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和有限组织样本,未在大型临床队列中进行验证 | 解析肺癌的转录景观和肿瘤微环境中的细胞异质性,以识别潜在治疗靶点和预后生物标志物 | 肺癌组织、邻近正常样本以及A549和H1299肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | WGCNA, 伪时间轨迹分析 | RNA序列数据 | 肺癌组织与邻近正常样本,以及A549和H1299细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-02-03 |
CCL20 secreted by KRT15high tumor Cells promotes tertiary lymphoid structure formation and enhances anti-PD-1 therapy response in HPV+HNSCC
2025-Dec-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08359-5
PMID:41462011
|
研究论文 | 本研究揭示了HPV阳性头颈鳞状细胞癌中KRT15高表达肿瘤细胞通过分泌CCL20促进三级淋巴结构形成,从而增强抗PD-1疗法疗效的机制 | 首次阐明HPV感染通过KRT15高表达肿瘤细胞分泌CCL20促进三级淋巴结构形成的具体机制,并证实其对抗PD-1疗法疗效的增强作用 | 样本量相对有限(59例患者),且机制研究主要在动物模型中进行,需进一步临床验证 | 探究HPV阳性头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构形成的机制及其对抗PD-1免疫疗法疗效的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者组织样本、单细胞测序数据、空间转录组数据及小鼠模型 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq、免疫组织化学、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 59例头颈鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-02-03 |
Downregulated Expression of the IL7R and BACH2 Genes Is Associated with Immune Memory Loss in Adults Vaccinated Against HBV at Birth
2025-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010047
PMID:41614877
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了出生时接种乙肝疫苗的成年个体中免疫记忆丧失与IL7R和BACH2基因表达下调的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了IL7R和BACH2基因表达下调与乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的关联,为理解免疫记忆机制提供了新视角 | 样本量较小(仅15名参与者),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的分子机制 | 出生时接种乙肝疫苗的成年个体,包括5名无症状HBsAg携带者和10名HBsAg及抗-HBs阴性对照 | 单细胞组学 | 乙肝病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名参与者(5名病例,10名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-12-29 |
Exploring cellular heterogeneity: single-cell and spatial transcriptomics of Alzheimer's disease brains and iPSC-derived microglia
2025-Dec-28, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01944-y
PMID:41456076
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2026-02-03 |
Distinct populations of lung capillary endothelial cells and their functional significance
2025-Dec-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09420-x
PMID:41449269
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术,识别了肺毛细血管内皮细胞中的五个新亚群,并探讨了它们在血管生成、修复及疾病中的作用 | 首次通过单细胞转录组学揭示了肺毛细血管内皮细胞中五个分子特征和功能各异的新亚群,包括表达离子转运蛋白的gCaps、有丝分裂活跃的“根”细胞以及Lingo2表达的静脉-毛细血管内皮,这些发现深化了对肺微循环异质性和细胞通讯的理解 | 研究主要基于单细胞转录组学数据,可能未完全捕捉到蛋白质水平或功能活性的变化,且缺氧模型的应用可能限制了结论在更广泛生理或病理条件下的普适性 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能意义 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-02-03 |
Dynamic neutrophil-keratinocyte communication network centered on IL-36/TNFSF15 responses characterizes inflammatory responses in generalized pustular psoriasis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67917-9
PMID:41436466
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了泛发性脓疱型银屑病(GPP)病变中中性粒细胞与角质形成细胞之间的动态通讯网络,特别是IL-36/TNFSF15信号通路在炎症反应中的核心作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合空间转录组学,系统描绘了GPP病变中的免疫微环境,识别了中性粒细胞从炎症前状态向促炎状态转变的关键特征,并发现了以成纤维细胞和毛细血管内皮细胞为中心的动态受体-配体相互作用网络 | 样本量相对有限(GPP病变皮肤13例,健康皮肤4例),且研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 | 探究泛发性脓疱型银屑病(GPP)病变中免疫微环境的特征,特别是中性粒细胞与角质形成细胞之间的通讯机制 | GPP患者的病变皮肤样本(13例)和健康成人皮肤样本(4例) | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 13例GPP病变皮肤样本,4例健康皮肤样本,总计约60,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2026-02-03 |
Combined HIF-1α blockade and CHIR99021 treatment reverses pulmonary fibrosis via modulation endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114028
PMID:41399517
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研究论文 | 本研究通过联合抑制HIF-1α和GSK-3β,逆转了辐射诱导的肺纤维化,揭示了其通过调控内皮-间质转化、DNA修复和染色质重塑的机制 | 首次提出联合靶向HIF-1α和GSK-3β(使用2-ME和CHIR99021)来逆转肺纤维化,并通过单细胞RNA测序和谱系追踪证实了其在恢复内皮细胞特性和抑制间质转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者成纤维细胞,尚未在人体临床试验中验证,且具体信号通路细节需进一步探索 | 研究旨在开发逆转辐射诱导肺纤维化的治疗策略 | 小鼠辐射诱导肺纤维化模型、患者特发性肺纤维化成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型和患者成纤维细胞样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2026-02-03 |
Development and application of a barcoded rabies viral tracing method for mapping brain-wide inputs to single neurons
2025-Dec-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101244
PMID:41338190
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研究论文 | 本研究开发了一种条形码狂犬病毒示踪方法,用于在单细胞水平上绘制全脑对单个神经元的输入连接图谱 | 将逆行病毒示踪与单细胞RNA测序相结合,创建了条形码狂犬病毒示踪方法,首次实现了在单细胞分辨率下对转录组定义的神经元进行局部和长程输入连接的同时绘制 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够绘制单个神经元输入连接图谱的方法,以构建细胞分辨率的大脑介观连接组 | 小鼠内侧前额叶皮层神经元 | 神经科学 | NA | 逆行病毒示踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,连接数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2026-02-03 |
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2025-Dec-15, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04131-5
PMID:41396398
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 | 首次在口腔癌中通过单细胞RNA测序分析炎症性肠病相关基因的表达,揭示了NFKBIA与趋化因子介导信号通路的关联 | 样本来源和数量未在摘要中明确说明,可能限制结果的普遍性 | 研究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的作用,以识别潜在治疗靶点 | 口腔癌组织样本 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP, t-SNE | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2026-02-03 |
Decoding osteosarcoma from heterogeneity to precision therapy
2025-Dec-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04256-7
PMID:41379383
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综述 | 本文综述了骨肉瘤的分子亚型研究进展,强调了亚型特异性致癌驱动因素及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,并探讨了基于分子谱的精准医学策略潜力 | 整合了多组学数据(包括单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱)来解码骨肉瘤的异质性,并识别了新的生物标志物 | NA | 解码骨肉瘤的异质性,并探索针对其分子亚型的精准治疗策略 | 骨肉瘤(OS),一种青少年中最常见的恶性骨肿瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 多组学研究,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间分析, 表观遗传图谱 | NA | NA |
| 137 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics identifies altered neutrophil dynamics and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco flavored e-cigarette exposed mouse lungs
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638715
PMID:40027777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了小鼠肺部在急性暴露于不同口味电子烟气溶胶后,免疫细胞(特别是髓系和淋巴系细胞)的动态变化及风味依赖性影响 | 首次利用单细胞转录组学全面解析了不同口味电子烟暴露下小鼠肺部的细胞特异性免疫变化,并发现了烟草口味电子烟导致的嗜中性粒细胞动态改变和T细胞毒性增强 | 研究仅基于小鼠模型,样本量较小(每组2只/性别),且为急性暴露实验,长期效应尚不明确 | 探究不同口味电子烟气溶胶急性暴露对小鼠肺部免疫景观的影响 | C57BL/6J小鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,图像数据 | 71,725个细胞,来自对照组和处理组(每组每性别2只小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2026-02-03 |
A molecular, spatial and regulatory atlas of the Hydra vulgaris nervous system
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204983
PMID:41071669
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,对Hydra vulgaris神经系统进行了全面的分子和空间图谱绘制 | 首次提供了Hydra vulgaris神经系统最全面的分子和空间特征,识别了8种神经元类型和15种转录亚型,并整合了基因调控网络分析 | 研究主要基于单细胞测序数据,可能未完全覆盖所有神经元功能或动态变化 | 揭示Hydra vulgaris神经系统的发育、稳态、再生和功能的分子机制 | Hydra vulgaris的神经系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-02-03 |
Multi-scaled transcriptomics of chronically inflamed nasal epithelium reveals immune-epithelial dynamics and tissue remodeling in nasal polyp formation
2025-Oct-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.009
PMID:40945518
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了慢性鼻窦炎中免疫细胞与上皮细胞之间的相互作用及组织重塑机制,特别是在鼻息肉形成过程中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统解析了慢性鼻窦炎中免疫-上皮细胞互作网络,并识别了与鼻息肉形成相关的基底细胞轨迹 | 研究主要基于人类组织样本,可能受样本异质性影响,且机制验证仍需进一步功能实验 | 探究慢性鼻窦炎的病理生理机制,特别是免疫-上皮细胞相互作用在疾病进展和组织重塑中的作用 | 慢性鼻窦炎患者(伴或不伴鼻息肉)及对照个体的鼻窦组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过100名慢性鼻窦炎患者及对照个体的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 140 | 2026-02-03 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本文报道了乳腺癌中肿瘤细胞通过去分化程序表达白细胞表面受体蛋白,称为“免疫拟态”,并探讨其与肿瘤进展和治疗抵抗的关系 | 首次提出乳腺癌细胞通过“免疫拟态”表达白细胞表面受体蛋白,并证明这赋予肿瘤细胞增殖优势,促进早期肿瘤生长 | 需要更多乳腺癌队列验证其预后价值,并评估与远端转移、生存期和治疗反应的相关性 | 研究乳腺癌细胞去分化程序中的免疫拟态现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理学标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺癌症模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据、图像、细胞系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |