单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-09-15	Tanshinone IIA suppresses fibro-adipogenic progenitor differentiation and attenuates fat infiltration in rotator cuff injury via Wnt/β-catenin pathway 2025-Dec, Regenerative therapy IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.reth.2025.08.004 PMID:40837862	研究论文	本研究探讨丹参酮IIA通过激活Wnt/β-catenin通路抑制纤维脂肪祖细胞分化，减轻肩袖损伤后的脂肪浸润	首次揭示丹参酮IIA通过Wnt/β-catenin通路特异性抑制FAPs脂肪生成，并证实其在体内外改善肩袖损伤的功能恢复	研究主要基于细胞和动物模型，尚未进行临床验证	探究丹参酮IIA对肩袖损伤后脂肪浸润的抑制作用及分子机制	人源纤维脂肪祖细胞（FAPs）和肩袖损伤大鼠模型	分子病理学	肌肉骨骼疾病	FACS、RT-qPCR、单细胞RNA测序、Western blot、组织染色	NA	基因表达数据、蛋白质数据、影像数据	人源FAP细胞及大鼠肩袖损伤模型
122	2025-09-15	RAB26 promotes prostate cancer progression via the MAPK/ERK-TWIST1 signaling axis 2025-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101689 PMID:40821113	研究论文	本文探讨了RAB26通过MAPK/ERK-TWIST1信号轴促进前列腺癌进展的机制	首次揭示RAB26在前列腺癌中通过激活MAPK/ERK通路和TWIST1表达促进上皮-间质转化和肿瘤干细胞特性	NA	阐明RAB26在前列腺癌中的功能作用及其分子机制	前列腺癌细胞	癌症研究	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	基于GSE141445数据集的前列腺癌细胞
123	2025-09-15	Integrated analysis of single-cell RNA-seq and ATAC-seq in lens epithelial cells: Unveiling the role of ATF6 as a key transcription factor 2025-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101610 PMID:40837408	研究论文	通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序分析，揭示ATF6作为关键转录因子在晶状体上皮细胞稳态维持和上皮间质转化中的作用	首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，发现ATF6通过调节STAT3磷酸化影响晶状体上皮细胞的EMT过程	研究基于9-23周胎儿眼组织数据，结果在成人组织中的普适性需要进一步验证	探究晶状体上皮细胞上皮间质转化的分子机制	晶状体上皮细胞	单细胞组学	白内障	scRNA-seq, scATAC-seq	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	9-23周胎儿眼组织（具体样本数量未明确说明）
124	2025-09-03	Corrigendum to "Identification and validation of synergistic drug strategies targeting macrophage polarization in triple-negative breast cancer via single-cell transcriptomics and deep learning" [Translational Oncology 2025 Jun 26;59:102457] 2025-Oct, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102474 PMID:40818872	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
125	2025-09-15	NR4A3high mast cells promote ovarian cancer metastasis by reprogramming tumor-associated macrophages via JAK2/STAT6 signaling 2025-Oct, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102494 PMID:40789260	研究论文	本研究揭示NR4A3高表达的肥大细胞通过JAK2/STAT6信号通路重编程肿瘤相关巨噬细胞，促进卵巢癌转移	首次发现NR4A3high肥大细胞亚型在卵巢癌转移组织中特异性富集，并阐明其通过CXCL16/IL-8-STAT6轴介导巨噬细胞M2极化的新机制	样本量较小（6例临床样本），机制研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证	探究肥大细胞在卵巢癌转移微环境中的关键调控分子及作用机制	上皮性卵巢癌组织、骨髓源性肥大细胞、小鼠卵巢癌模型	肿瘤免疫学	卵巢癌	scRNA-seq、细胞过继转移、体内外功能实验	NA	单细胞转录组数据、体外功能实验数据、体内动物模型数据	6例人卵巢癌组织（3原发/3转移）+ 小鼠模型
126	2025-09-15	Neuroactive network tissue based on dual-factor neuroregenerative bioactive coating scaffolds and neural stem cells for spinal cord injury repair 2025-Oct, Materials today. Bio DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102172 PMID:40822932	研究论文	开发一种基于双因子神经再生生物活性涂层支架和神经干细胞的神经活性网络组织用于修复脊髓损伤	利用仿生贻贝粘附单元固定双重组生长因子于定向电纺纳米纤维支架上，并接种神经干细胞，形成持续刺激增强旁分泌功能的双因子系统	NA	修复脊髓损伤，改善感觉和运动功能障碍	脊髓损伤模型	组织工程	脊髓损伤	单细胞RNA测序，电纺纳米纤维技术	NA	基因表达数据，体外和体内实验数据	NA
127	2025-09-15	Single-cell transcriptomic analysis of interactions of peritoneal mesenchymal stem cells with macrophages in prevention of peritoneal membrane injury 2025-Sep-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152491 PMID:40829206	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析探讨腹膜间充质干细胞与巨噬细胞相互作用在预防腹膜损伤中的作用	首次使用单细胞RNA测序技术揭示pMSCs通过调控巨噬细胞亚群（促进抗炎型、抑制细胞毒型）来保护腹膜结构与功能	研究基于大鼠模型，临床转化需进一步验证；单细胞测序样本量有限	探究pMSCs与巨噬细胞相互作用机制以预防腹膜透析诱导的腹膜损伤	Sprague-Dawley大鼠的腹膜组织及巨噬细胞	单细胞组学	腹膜透析相关并发症	单细胞RNA测序（HiSeq × 10平台）、流式细胞术、STRING数据库分析	NA	单细胞转录组数据	大鼠模型（具体数量未明确），包含多个巨噬细胞亚群分析
128	2025-09-15	Rutaecarpine alleviates liver fibrosis by modulating the TRPV1/Connexin 43 axis: A study based on transcriptome data, single-cell sequencing data, and cell experiments 2025-Sep-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152506 PMID:40848544	研究论文	本研究基于转录组数据、单细胞测序和细胞实验，探讨吴茱萸碱通过调节TRPV1/Cx43轴缓解肝纤维化的机制	首次揭示TRPV1与Cx43在肝纤维化中的负相关关系，并证明吴茱萸碱通过调控该轴发挥治疗作用	研究主要基于体外细胞模型和生物信息学分析，缺乏体内动物实验验证	探索吴茱萸碱缓解肝纤维化的潜在分子机制	肝纤维化病理过程及相关分子靶点	生物医学研究	肝纤维化	转录组分析、单细胞测序、分子对接、细胞模型	逻辑回归模型、ROC曲线分析	基因表达数据、单细胞数据、分子对接数据	基于GSE84044数据集，具体样本量未明确说明
129	2025-09-15	Chronic kidney disease facilitates TNF-α + neutrophils dysfunction and progression in oral squamous cell carcinoma 2025-Sep-23, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.115184 PMID:40644859	研究论文	本研究探讨慢性肾脏病（CKD）通过TNF-α+中性粒细胞功能障碍促进口腔鳞状细胞癌（OSCC）进展的机制	首次揭示CKD通过降低TNF-α+中性粒细胞比例并调控Tregs和CTLs功能促进OSCC进展，提出'肾-口腔'轴新概念	样本量较小（52例患者），动物模型与人类疾病存在差异，机制研究仍需进一步验证	探究CKD在OSCC进展中的作用及免疫机制	OSCC患者（含CKD与非CKD群体）和CKD条件小鼠模型	肿瘤免疫学	口腔鳞状细胞癌和慢性肾脏病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多色免疫荧光、体外共培养实验	NA	临床数据、测序数据、图像数据	52例OSCC患者（23例伴CKD）及小鼠模型肿瘤样本
130	2025-09-15	Single-cell transcriptomics of neuroinflammation and cerebrovascular endothelial cells in the aged rat hippocampus 2025-Sep-19, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.113332 PMID:40933643	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了老年大鼠海马体神经炎症的细胞景观，特别关注脑血管内皮细胞的作用	首次在老年海马体中通过scRNA-seq揭示神经炎症微环境，并发现内皮细胞REDD1基因在氧化应激中的关键作用	研究仅基于LPS诱导的炎症模型，样本来源于老年大鼠，可能无法完全代表人类病理状况	阐明围手术期神经认知障碍中神经炎症的细胞机制和内皮细胞功能异常的作用	老年大鼠海马体细胞，包括小胶质细胞、浸润免疫细胞和脑血管内皮细胞	单细胞组学	神经认知障碍	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	老年大鼠海马体细胞（具体数量未明确说明）
131	2025-09-15	Decoding the gut microbiota metabolite-matrix metalloproteinase-3 axis in breast cancer: a multi-omics and network pharmacology study 2025-Sep-14, Molecular diversity IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11030-025-11351-y PMID:40946247	研究论文	通过多组学和网络药理学方法研究肠道微生物代谢物与基质金属蛋白酶-3在乳腺癌中的相互作用机制	首次系统揭示肠道微生物代谢物-MMP3轴在乳腺癌中的作用，并发现8种具有强结合亲和力的无毒代谢物	需要后续体外和体内实验验证	探究肠道微生物代谢物与乳腺癌发展的分子机制	乳腺癌相关的肠道微生物代谢物及其靶点	多组学分析	乳腺癌	网络药理学、机器学习、SHAP、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接	机器学习模型	多组学数据	NA
132	2025-09-15	Single-cell RNA sequencing analysis reveals a novel porcine alveolar macrophage subtype with high SLAMF7 expression promoting PRRSV infection 2025-Sep-13, Virulence IF:5.5Q1 DOI:10.1080/21505594.2025.2560894 PMID:40944943	研究论文	通过单细胞RNA测序分析发现猪肺泡巨噬细胞中高表达SLAMF7的新型亚型促进PRRSV感染	鉴定出表达SLAMF7的新型猪肺泡巨噬细胞亚型，并证明其调控PRRSV感染和炎症反应	体外培养与体内分离的PAMs转录谱存在差异，可能无法完全模拟体内疾病过程	探究PRRSV感染机制及宿主细胞响应	猪肺泡巨噬细胞(PAMs)、T细胞、B细胞	单细胞组学	猪繁殖与呼吸综合征	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	未明确样本数量，但包含体外培养和体内分离的PAMs以及感染PRRSV的细胞亚群
133	2025-09-15	Efficacy and safety of adjuvant TTFields plus pembrolizumab and temozolomide in newly diagnosed glioblastoma: A phase 2 study 2025-Sep-12, Med (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.medj.2025.100708 PMID:40466642	研究论文	评估TTFields联合pembrolizumab和替莫唑胺在新诊断胶质母细胞瘤中的疗效与安全性的II期临床研究	首次在临床试验中证明TTFields通过激活I型干扰素通路增强免疫检查点抑制剂疗效，并揭示T细胞克隆扩增与替代的协同机制	样本量较小（n=31），单中心II期研究，需要更大规模试验验证	探索TTFields与免疫疗法在胶质母细胞瘤中的协同治疗效果	新诊断胶质母细胞瘤患者	临床医学	胶质母细胞瘤	单细胞转录组测序，T细胞克隆分型	NA	临床数据，分子生物学数据	31例新诊断胶质母细胞瘤患者
134	2025-09-15	Tuberculosis susceptibility in genetically diverse mice reveals functional diversity of neutrophils 2025-Sep-12, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.102441 PMID:40937719	研究论文	利用19种地理来源多样的野生近交系小鼠研究结核病易感性，揭示中性粒细胞功能多样性在感染控制中的作用	首次在野生来源小鼠中鉴定出与感染控制失败相关的新型中性粒细胞特征，并发现高中性粒细胞数量与易感性并非绝对相关	研究仅关注早期感染阶段，尚未验证这些发现在人类中的适用性	探究遗传多样性对结核病易感性的影响及免疫细胞功能差异	19种野生来源近交系小鼠	免疫学	结核病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据、免疫细胞计数数据	19种小鼠品系
135	2025-09-15	The citrullinating enzyme PADI4 governs progenitor cell proliferation and translation in developing hair follicles 2025-Sep-12, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adx4511 PMID:40938992	研究论文	本研究揭示了PADI4酶通过瓜氨酸化修饰调控毛囊发育过程中祖细胞增殖和翻译的机制	首次发现PADI4通过瓜氨酸化翻译抑制因子4E-BP1并影响其磷酸化，从而调控蛋白质合成和核糖体RNA转录	研究主要基于小鼠毛囊发育模型，在人类或其他组织中的普适性仍需验证	阐明PADI4酶在毛囊发育过程中对祖细胞状态转换的调控作用	毛囊发育过程中的祖细胞和分化细胞，特别是LEF1阳性毛干定向祖细胞	发育生物学	NA	单细胞测序，体内功能验证	NA	单细胞转录组数据，蛋白质组数据	NA
136	2025-09-15	CLL to Richter syndrome: Integrating network strategies with experiments elucidating disease drivers and personalized therapies 2025-Sep-12, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu7705 PMID:40938978	研究论文	本文通过整合数学模型与实验数据，首次建立了慢性淋巴细胞白血病向Richter综合征转化的动态模型，并识别了关键疾病驱动因子及个性化治疗靶点	开发了首个疾病转化的计算机动态模型，结合数学逻辑建模与多层级实验数据验证，实现了机制探索与个性化靶点筛选的协同方法	动物模型和细胞系资源有限可能影响模型泛化能力，需进一步实验验证	揭示CLL向RS转化的机制并探索个性化治疗策略	慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者样本、单细胞RNA测序数据、FFPE组织队列	计算生物学	血液肿瘤	数学逻辑建模、单细胞RNA测序、FFPE组织分析	动态逻辑模型	基因组数据、转录组数据、临床样本数据	CLL/RS患者FFPE组织队列（具体数量未明确说明）
137	2025-09-15	Integrated transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis revealed the prognostic significance of GBP4 in pancreatic adenocarcinoma 2025-Sep-12, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102532 PMID:40944976	研究论文	本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析，揭示了GBP4基因在胰腺腺癌中的预后意义及其促癌功能	首次结合转录组与单细胞RNA测序技术系统解析GBP4在PAAD中的作用机制，并构建了基于GBP4相关基因的预后风险模型	数据主要来源于公共数据库，需进一步临床样本验证；功能实验仅针对GBP4，其他预后基因的作用未深入探讨	明确GBP4基因对胰腺腺癌（PAAD）患者预后的影响及其分子机制	胰腺腺癌（PAAD）患者及相关细胞系	生物信息学	胰腺癌	转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Cox回归、LASSO回归、体外功能实验、体内实验	预后风险模型（基于Cox和LASSO回归）	RNA测序数据、单细胞数据	公共数据库中的PAAD转录组和scRNA-seq数据（具体样本量未明确说明）
138	2025-09-15	Potential modulation of microglial ferroptosis by Linggui Zhugan decoction in Alzheimer's disease through IL-17 and TNF pathways 2025-Sep-12, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.115489 PMID:40945030	研究论文	本研究探讨苓桂术甘汤通过IL-17和TNF信号通路调节阿尔茨海默病中小胶质细胞铁死亡的潜在作用	首次结合单细胞RNA测序和网络药理学分析传统中药复方对AD中铁死亡的调控机制	研究发现仅为相关性结果，需进一步机制验证以确立因果关系	探究苓桂术甘汤成分通过炎症通路调节AD中铁死亡的潜在治疗效果	AD模型小鼠和Aβ1-42处理的小胶质细胞	生物医学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、网络药理学、体外实验	NA	基因表达数据、行为学数据	AD模型小鼠（具体数量未注明）和体外培养小胶质细胞
139	2025-09-15	Targeting CD161 inhibitory receptors enhances NK cell-mediated changes in synovial fibroblast function in rheumatoid arthritis 2025-Sep-12, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.115528 PMID:40945032	研究论文	本研究探讨CD161作为抑制性受体在类风湿关节炎中的作用及其治疗潜力	首次揭示CD161通过IFN-γ和PI3K-AKT通路抑制滑膜成纤维细胞肿瘤样特性的机制	NA	研究CD161在类风湿关节炎发病机制中的作用及治疗响应预测价值	类风湿关节炎患者样本、胶原诱导关节炎模型、NK细胞系和滑膜成纤维细胞	免疫学	类风湿关节炎	RNA-seq, scRNA-seq, 全基因组测序, 体外细胞共培养实验	NA	基因表达数据、临床样本数据、体外实验数据	类风湿关节炎患者临床样本和胶原诱导关节炎模型
140	2025-09-15	A comprehensive single-cell atlas of three centenarian cohorts unveils unique natural killer cell signatures and enhanced mutual interactions among peripheral immune cells 2025-Sep-12, EBioMedicine IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105922 PMID:40945050	研究论文	本研究通过单细胞测序等技术揭示了百岁老人外周免疫细胞中NK细胞的独特特征及其增强的细胞间相互作用	首次整合三个百岁老人队列的单细胞数据，发现NK细胞具有年轻化特征并增强与T细胞的互作	样本量相对有限，且主要基于中国特定地区人群	探究百岁老人超级长寿相关的免疫特征	百岁老人、其子女及对照人群的外周血单核细胞	免疫学	老年疾病	scRNA-seq, 质谱流式, 流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据	31名百岁老人、17名子女及26名对照