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当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2026-06-26 |
Integrating Ambient Ionization Mass Spectrometry Imaging and Spatial Transcriptomics on the Same Cancer Tissues to Identify RNA-Metabolite Correlations
2025-06-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502028
PMID:40216587
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研究论文 | 提出一种在相同组织切片上整合解吸电喷雾电离质谱成像（DESI-MSI）和空间转录组学（Visium）的方法，以识别RNA与代谢物之间的相关性 | 首次实现同一组织切片上空间代谢组学和空间转录组学的联合分析，避免了相邻切片间变异导致的数据整合问题 | 需要进一步验证该方法在更广泛组织类型和疾病中的适用性，以及分析通量可能有限 | 开发一种整合空间代谢组学和空间转录组学的新方法，识别癌症组织中RNA与代谢物的空间相关性 | 人类乳腺癌和肺癌组织 | 数字病理学 | 乳腺癌、肺癌 | DESI-质谱成像（DESI-MSI）、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据、代谢组数据 | 人类乳腺癌和肺癌组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学、空间代谢组学 | 10x Visium | DESI-MSI与10x Visium空间转录组学在同一组织切片上结合使用 |
| 1362 | 2026-06-26 |
A Temporal Single-Cell Multi-Omics Atlas of Murine Pancreatic Islet Remodeling During Hyperglycaemia Progression
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.29.656754
PMID:40568114
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研究论文 | 利用单细胞多组学技术绘制小鼠胰岛在高血糖进展过程中的动态重塑图谱 | 首次通过纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序结合，系统解析了肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰岛内分泌与非内分泌区室的分子变化，并整合人类数据集验证了保守的β细胞身份转变和免疫激活特征 | 未在摘要中明确提及局限性 | 探究肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰岛细胞重塑的分子动态变化及相关信号通路 | C57BL/6小鼠胰岛细胞（包括β细胞、α细胞、δ细胞、巨噬细胞等）及人类肥胖和2型糖尿病供体胰岛样本 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质开放性数据 | 高脂饮食喂养8、16、24周的C57BL/6小鼠及同龄正常饮食对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Chromium Single Cell ATAC |
| 1363 | 2026-06-26 |
Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones
2025-May-19, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.02.040
PMID:40250431
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新生鸡视网膜，追踪鸟类感光细胞与其他脊椎动物的进化关系，揭示双锥体感光细胞的独特起源 | 首次提出鸟类双锥体感光细胞（DC-P和DC-A）分别起源于祖先红锥体和蓝锥体，并通过CRISPR敲除、转录因子表达和顺式调控分析提供了多重证据 | 仅使用鸡作为模型，未涵盖所有鸟类物种；CRISPR实验仅验证了THRB的作用，其他转录因子的功能尚未确认 | 阐明鸟类感光细胞与其他脊椎动物感光细胞的进化同源性，尤其聚焦双锥体感光细胞的起源 | 新生鸡的视网膜细胞，以及绿安乐蜥视网膜细胞用于跨物种比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生鸡视网膜样本，未明确具体数量；绿安乐蜥视网膜样本用于比较 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq文库构建 |
| 1364 | 2026-06-26 |
Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model
2025-04-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052024
PMID:40114603
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研究论文 | 利用单细胞转录组学、三维成像和多模态磁共振成像技术，发现人类和多囊蛋白1突变小鼠多囊肾中的微血管异常，并揭示其早期特征 | 首次在人类和多囊蛋白1突变小鼠模型中共同鉴定出分子水平上独特的血液微血管亚群，并发现微血管异常出现在肾小管扩张的胎儿期，表明血管异常是早期事件 | 未提及具体限制信息 | 探究常染色体显性多囊肾病中肾脏微血管异常的起始时间和性质 | 人类多囊肾组织和多囊蛋白1突变小鼠肾脏 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞转录组学、三维成像、几何拓扑分析、多模态磁共振成像 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 人类晚期多囊肾样本和多囊蛋白1突变小鼠出生后及胎儿肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1365 | 2026-06-26 |
Single Cell RNA-Seq Identifies Cell Subpopulations Contributing to Idiopathic Pulmonary Fibrosis in Humans
2025-02, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70402
PMID:39928535
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序鉴定与特发性肺纤维化发病相关的人肺细胞亚群 | 首次系统揭示IPF患者肺内多个细胞亚群（包括成纤维细胞、巨噬细胞和B细胞亚群）比例显著变化，并追踪了成纤维细胞向肌成纤维细胞的分化轨迹以及肺泡巨噬细胞向巨噬细胞SPP1亚群的转化 | 研究样本量有限，未涉及功能验证实验，细胞亚群的具体致病机制有待深入探讨 | 阐明特发性肺纤维化中细胞亚群的变化及其贡献 | 特发性肺纤维化患者和健康对照的肺组织细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 特发性肺纤维化患者及对照者肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 1366 | 2026-06-26 |
Telomemore enables single-cell analysis of cell cycle and chromatin condensation
2025-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf031
PMID:39878215
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为Telomemore的新工具，通过分析单细胞ATAC-seq数据中的端粒样读取（主要来自亚端粒区域）来量化染色质凝聚状态，并表明这些读取可作为染色质凝聚的生物标志物，同时揭示高活性Tn5转座酶不会复制其目标序列的9 bp | 首次将亚端粒读取作为染色质凝聚的生物标志物，颠覆了ATAC-seq端粒样读取用于推断端粒长度的传统认知，并发现高活性Tn5不复制目标序列，提供了新的单细胞数据分析维度 | 未明确讨论亚端粒读取在复杂组织或疾病样本中的适用性，以及对不同Tn5批次或实验条件的鲁棒性，可能受限于现有公共数据集的异质性 | 探索从单细胞ATAC-seq数据中提取额外信息的新方法，特别是染色质凝聚状态，以增强单细胞数据解读 | 成纤维细胞和B细胞的多组学图谱，以及多个公共单细胞ATAC-seq数据集 | 单细胞组学 | NA | ATAC-seq、多组学（ATAC+RNA）、长读长测序 | NA | 单细胞ATAC-seq数据、单细胞多组学数据、长读长测序数据 | 多个公共数据集（未具体说明样本数量）以及新生成的多组学成纤维细胞和B细胞图谱（未明确样本数） | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1367 | 2026-06-26 |
A comprehensive analysis framework for evaluating commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-01-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1186
PMID:39675380
|
研究论文 | 本研究建立了一个综合分析框架，评估九种商业单细胞RNA测序技术，使用来自单供体的外周血单核细胞进行性能、时间和成本比较 | 引入读取利用度指标，用于区分不同单细胞RNA测序试剂盒在将测序读段转换为有效计数方面的效率，并基于此评估灵敏度和成本影响 | 信息不足 | 系统比较商业化单细胞RNA测序技术，为单细胞研究的有效实施提供指导 | 来自单个供体的外周血单核细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 169262个外周血单核细胞 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | Chromium Fixed RNA Profiling试剂盒, Rhapsody WTA试剂盒 | NA |
| 1368 | 2026-06-26 |
Endothelial Angpt2 Promotes Adipocyte Progenitor Cells Maturation to Increase Visceral Adipose Tissue Accumulation
2025-01, Diabetes/metabolism research and reviews
DOI:10.1002/dmrr.70012
PMID:39628006
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞通过Angpt2促进脂肪祖细胞成熟，从而增加内脏脂肪组织积累的机制 | 首次发现内皮细胞通过JAK1/STAT3信号激活分泌Angpt2，诱导脂肪祖细胞从MSLN表型转变为CFD表型，促进内脏脂肪积累 | 样本量较小（仅13份内脏脂肪样本），且主要基于人类scRNA-seq数据和小鼠模型验证 | 阐明内脏脂肪组织积累的分子机制 | 人类内脏脂肪组织中的内皮细胞、巨噬细胞和脂肪祖细胞 | 数字病理学 | 肥胖及相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序、PCR、Western blot、免疫荧光染色、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名肥胖合并糖尿病、9名肥胖和1名正常BMI个体的13份内脏脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1369 | 2026-06-26 |
Loss of FTH1 Induces Ferritinophagy-Mediated Ferroptosis in Anaemia of Myelodysplastic Syndromes
2025-01, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70350
PMID:39804099
|
research paper | FTH1缺失通过诱导铁蛋白自噬介导的铁死亡在骨髓增生异常综合征贫血中的作用 | 首次揭示FTH1缺失通过铁蛋白自噬途径诱导铁死亡，并表明FTH1可作为MDS贫血的新治疗靶点 | FTH1在MDS病理生理中的具体机制尚不完全清楚，研究主要基于细胞实验和临床样本，需进一步动物模型验证 | 评估FTH1在骨髓增生异常综合征贫血患者中的作用及其机制 | MDS患者Lin-细胞、GlycoA有核红细胞、K562和SKM1细胞 | machine learning | myelodysplastic syndromes | shRNA敲低、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | MDS患者和对照组样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞测序对Lin-细胞进行测序 |
| 1370 | 2026-06-26 |
Integrated Analysis of Bulk RNA Sequencing, eQTL, GWAS, and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Key Genes in Hepatocellular Carcinoma
2025-01, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70359
PMID:39853609
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研究论文 | 整合批量RNA测序、eQTL、GWAS和单细胞RNA测序数据，揭示肝细胞癌中的关键基因 | 通过多组学数据整合分析，结合eQTL、孟德尔随机化和单细胞RNA测序，识别出SERPING1和STEAP3两个可能对肝细胞癌发病和进展至关重要的基因，并揭示其在肿瘤微环境和免疫治疗中的潜在作用 | 仅利用公开数据集进行分析，可能受数据质量和样本异质性影响；结果需进一步在更大样本和临床队列中验证 | 识别肝细胞癌中的关键基因并阐明其分子机制，为诊断和治疗提供新靶点 | 肝细胞癌患者肿瘤样本及正常对照组织中的基因表达数据和遗传变异信息 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, eQTL分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组化, Western blot, qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 遗传变异数据 | 使用来自TCGA和GEO的公开HCC数据集，具体样本数未明确 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1371 | 2026-06-26 |
Integrative Machine Learning of Glioma and Coronary Artery Disease Reveals Key Tumour Immunological Links
2025-01, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70377
PMID:39868675
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研究论文 | 结合机器学习和单细胞RNA测序，探索胶质瘤肿瘤微环境，并揭示与冠状动脉疾病的免疫联系 | 首次整合机器学习与单细胞RNA测序，结合全基因组关联研究和孟德尔随机化，识别影响癌症和心血管疾病预后的肿瘤微环境遗传变异，发现F3基因作为关键调控因子揭示免疫治疗潜力 | 未明确说明限制 | 探索胶质瘤肿瘤微环境与冠状动脉疾病之间的免疫学联系，并通过机器学习识别新的分子亚型和生物标志物 | 胶质瘤肿瘤微环境 | 机器学习 | 胶质瘤, 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 | 机器学习模型（未具体说明） | 单细胞转录组数据, 遗传变异数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1372 | 2026-06-26 |
Multi-omics analysis reveals distinct gene regulatory mechanisms between primary and organoid-derived human hepatocytes
2025-01-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.050883
PMID:39878507
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研究论文 | 通过多组学分析揭示原代与类器官来源人肝细胞之间的基因调控机制差异 | 通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，发现AP-1因子与肝脏特异性转录因子共同占据调控区域，并识别出在两种肝细胞类型中特异性激活的转录因子集 | 未提及明显的局限性 | 揭示原代人肝细胞与类器官来源肝细胞之间基因调控机制的差异 | 原代人肝细胞和肝内胆管类器官来源的人肝细胞 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1373 | 2026-06-23 |
Think twice: how single-cell suspensions from solid tissues for single-cell transcriptomics are well prepared
2025-Jan, Infectious diseases & immunity
DOI:10.1097/ID9.0000000000000136
PMID:42325859
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综述 | 本文详细分析了从实体组织中制备高质量单细胞悬液的关键步骤，包括酶消化、机械解离和细胞活力评估 | 对实体组织单细胞悬液制备过程中的关键实验细节进行了深入分析和澄清 | 未提及具体实验比较或定量评价不同制备方法的优劣 | 指导研究人员优化从实体组织制备单细胞悬液的实验流程以获得高质量单细胞测序数据 | 实体组织单细胞悬液制备过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1374 | 2026-06-20 |
Molecular glue degrader function of SPOP inhibitors enhances STING-dependent immunotherapy efficacy in melanoma models
2025-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191772
PMID:41148213
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研究论文 | 揭示SPOP抑制剂通过分子胶降解STING和CBX4增强黑色素瘤免疫治疗疗效的机制 | 首次发现SPOP抑制剂具有分子胶降解剂功能，可重定向SPOP降解新底物CBX4，激活STING依赖的先天免疫 | 研究主要基于小鼠模型，需在人类样本中验证SPOP抑制剂的临床转化潜力 | 探索SPOP E3连接酶在肿瘤免疫中的角色及其抑制剂作为免疫治疗增敏剂的潜力 | 黑色素瘤细胞系、B16小鼠肿瘤模型、CAR.CD19-T细胞治疗模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | B16肿瘤模型小鼠（具体数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台用于单细胞RNA-seq分析 |
| 1375 | 2026-06-20 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies oxidative stress signatures of radiation-induced lung injury in mice through machine learning
2025-12, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106863
PMID:40967560
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研究论文 | 整合批量RNA测序和单细胞RNA测序，通过机器学习识别小鼠放射性肺损伤的氧化应激标志 | 首次结合批量与单细胞RNA测序及多种机器学习算法（随机森林、支持向量机），系统筛选出放射性肺损伤中与氧化应激相关的五个关键基因（Stk4、Aaas、Ets1、Sesn2、Kit），并构建了高准确率的诊断模型 | 研究基于小鼠模型，结果需进一步在人类样本中验证；未探讨五个关键基因在临床样本中的表达及功能 | 系统分析放射性肺损伤中与氧化应激相关的分子特征，筛选可用于早期诊断和靶向干预的生物标志物及分子机制 | 放射性肺损伤小鼠模型 | 机器学习 | 放射性肺损伤 | RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、免疫组化 | 随机森林、支持向量机、LASSO回归 | 基因表达数据 | 未明确样本数量，涉及小鼠批量与单细胞样本 | 未提供 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 1376 | 2026-06-20 |
Irf4 participates in benzene-induced hematopoietic senescence through mitochondrial ROS-dependent BCAA catabolism
2025-12, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154271
PMID:40885242
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研究论文 | 该研究揭示了Irf4通过线粒体ROS依赖的支链氨基酸分解代谢参与苯诱导的造血衰老 | 首次从代谢和衰老角度揭示环境剂量苯通过Irf4介导的支链氨基酸代谢异常导致造血干细胞损伤的分子机制 | NA | 探究苯暴露是否通过诱导细胞衰老造成造血损伤，以及其分子机制 | 雄性C57BL/6J小鼠和FDC-P1小鼠造血祖细胞系 | NA | 造血损伤、苯中毒 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 小鼠暴露于0、10、50 ppm苯蒸气12周；细胞暴露于0、5、10 μM 1,4-BQ 24小时 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1377 | 2025-12-23 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema"
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70723
PMID:41424021
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1378 | 2026-06-20 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-11-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
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研究论文 | 该研究揭示了脂肪细胞死亡通过促进S100A8+巨噬细胞浸润肝脏，进而驱动肝细胞脂质储存并加剧代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡后产生的S100A8+巨噬细胞通过抑制CCN3、上调CD36促进肝细胞脂质积累，为MASLD进展提供了新的细胞和分子机制 | 研究仅在动物模型中进行，缺乏人类样本验证；未明确S100A8+巨噬细胞与CCN3抑制之间的完整信号通路细节 | 探究脂肪细胞死亡后介导肝细胞脂肪储存并触发MASLD进展的额外信号 | 高脂饮食喂养的小鼠模型及基因修饰小鼠 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq | NA | 序列数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1379 | 2026-06-20 |
Macrophage EHD1 promotes inflammation and stabilizes sortilin to accelerate atherosclerosis
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684958
PMID:41279772
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研究论文 | 该研究揭示了巨噬细胞中EHD1蛋白通过促进炎症反应和稳定分拣蛋白（sortilin）加速动脉粥样硬化的作用机制 | 首次发现EHD1在巨噬细胞中通过调控TNFR2内吞循环和稳定retromer的逆向运输货物sortilin来促进炎症反应，从而加速动脉粥样硬化进展 | 未提及 | 探索EHD1在巨噬细胞免疫反应中的作用及其对动脉粥样硬化进展的贡献 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 机器学习 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类斑块样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1380 | 2026-06-20 |
Single-cell sequencing reveals distinct peripheral immune responses in anti-MDA5 antibody positive dermatomyositis with rapidly progressive interstitial lung disease
2025-10-08, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03639-z
PMID:41063280
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序揭示抗MDA5抗体阳性皮肌炎伴快速进展间质性肺病的外周免疫反应特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示MDA5+ DM伴RPILD患者外周血单个核细胞的免疫景观，发现抗病毒反应增强和MHC-II信号通路在CD4+幼稚T细胞中缺失 | 样本量较小（每组3-4例），且仅为外周血样本分析，未涉及组织或纵向时间点研究 | 探索MDA5+ DM伴RPILD的外周免疫机制，寻找潜在治疗靶点 | 抗MDA5抗体阳性皮肌炎伴快速进展间质性肺病患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病（皮肌炎伴间质性肺病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例（4例RPILD，3例非RPILD，3例健康对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |