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当前共找到 10496 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2025-12-02 |
Targeting tumor-intrinsic TAK1 triggers anti-tumor immunity and sensitizes pancreatic cancer to checkpoint blockade
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681226
PMID:41280086
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研究论文 | 本文发现TAK1是胰腺导管腺癌中维持基因组完整性的关键介质，并揭示其作为治疗靶点可诱导炎症性肿瘤微环境，使PDAC对免疫检查点阻断敏感 | 首次将TAK1鉴定为胰腺癌中与T细胞功能障碍相关的异常激活激酶，并阐明其通过磷酸化EphA2和RAD51调控DNA修复和cGAS-STING通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床验证尚需进一步开展 | 探索逆转胰腺癌免疫抑制微环境的新治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫组化、蛋白质组学 | 基因工程小鼠模型（GEMM） | 测序数据、图像数据、蛋白质数据 | 人类PDAC样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1362 | 2025-12-02 |
Optimal Gene Panel Selection for Targeted Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681071
PMID:41279853
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ReconST的新方法，用于自动设计空间转录组学分析中的最优基因面板 | ReconST利用现有scRNA-seq数据，通过门控自编码器识别最优基因子集，在重建准确性和空间模式保留方面优于现有方法 | NA | 优化基因面板选择以最大化空间转录组学分析的效用 | 基因面板设计 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析，scRNA-seq | 门控自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1363 | 2025-12-02 |
Accelerating scRNA-seq Analysis: Automated cell type annotation using representation learning and vector search
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680787
PMID:41279915
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于表示学习和向量搜索的自动化细胞类型注释服务，用于加速单细胞RNA测序分析 | 采用反向搜索方法，避免依赖预定义标记基因或组织特异性参考，提供细粒度和粗粒度注释 | NA | 自动化单细胞RNA测序中的细胞类型注释，以提高分析速度和准确性 | 10x Genomics单细胞基因表达样本中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 表示学习 | 基因表达谱数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 1364 | 2025-12-02 |
SpaDiff: Denoising for Sequence-based Spatial Transcriptomics via Diffusion Process
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681011
PMID:41280001
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaDiff的去噪方法，用于处理基于序列的空间转录组学数据中的spot-swapping噪声 | 将spot-swapping噪声建模为扩散过程，并模拟RNA分子的位移以逆转噪声，从而恢复原始空间分布 | NA | 提高空间转录组学数据的空间特异性和数据完整性 | 空间转录组学数据中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 扩散过程模型 | 序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1365 | 2025-12-02 |
Multi-omics analysis identifies S100a10/Anxa2 complex within proximal tubule aggravates acute kidney injury through p-Stat3/Spp1 signaling
2025-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.11.003
PMID:41265636
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研究论文 | 通过多组学分析发现S100a10/Anxa2复合物在近端小管内通过p-Stat3/Spp1信号通路加剧急性肾损伤 | 首次结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术，系统性地识别了S100a10/Anxa2复合物在AKI中的作用，并通过实验验证了其通过p-Stat3/Spp1信号通路调控AKI的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证，且具体信号通路的上下游调控细节有待进一步探索 | 探究急性肾损伤（AKI）的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠肾脏组织，特别是近端小管上皮细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq | NA | RNA-seq数据, 空间转录组数据, ChIP-seq数据 | 未明确指定样本数量，但涉及对照组和AKI模型组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1366 | 2025-12-02 |
Immune cell communication networks and memory CD8+ T cell signatures sustaining chronic inflammation in COVID-19 and Long COVID
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689507
PMID:41200182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19及长新冠患者的免疫细胞图谱，揭示了记忆CD8+ T细胞在慢性炎症中的核心作用及其分子特征 | 在单细胞分辨率下绘制了COVID-19及长新冠的免疫景观，首次系统性地揭示了记忆CD8+ T细胞在MHC-I介导的细胞通讯网络中的中心地位及其与慢性炎症的关联，并利用机器学习模型识别出预测慢性免疫失调的关键基因标志 | 研究样本量相对有限（73,110个PBMCs），且仅基于外周血单核细胞分析，未能涵盖组织特异性免疫反应；机器学习模型的验证仍需在独立队列中进行 | 探究COVID-19及长新冠中持续免疫失调和慢性炎症的分子机制，特别是记忆CD8+ T细胞的功能异常与炎症维持的关系 | 来自健康、暴露、感染及住院四个疾病状态个体的外周血单核细胞（PBMCs） | 生物信息学 | COVID-19及长新冠 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、机器学习模型训练、SHAP解释框架 | XGBoost等九种机器学习模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 73,110个外周血单核细胞（PBMCs），来自四个疾病状态（健康、暴露、感染、住院）的个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1367 | 2025-12-01 |
Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control
2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250466
PMID:40986319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了I型干扰素在结核感染早期通过驱动中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞-巨噬细胞相互作用的新机制 | 发现相对耐药小鼠早期肺内I型干扰素反应更强，并阐明其通过中性粒细胞群聚阻碍T细胞-巨噬细胞空间互作的独特免疫调控机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；观察时间限于感染初期数周 | 探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结局的免疫机制 | C57BL/6和C3HeB/FeJ小鼠的肺部免疫细胞 | 免疫学 | 结核病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两种基因型小鼠在感染初数周内的肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1368 | 2025-12-01 |
Inhibition of Cholesterol Transport from Lysosomes by Itraconazole Repolarizes Tumor-associated Macrophages to Anti-tumor M1 type
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17866
PMID:41318128
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研究论文 | 本研究探讨伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇转运将肿瘤相关巨噬细胞从促瘤M2表型重编程为抗瘤M1表型的机制 | 首次揭示伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇释放实现巨噬细胞表型重编程的新机制 | 研究仅使用THP-1细胞来源的M2巨噬细胞，未在体内模型验证 | 探究伊曲康唑诱导肿瘤相关巨噬细胞表型重编程的分子机制 | THP-1细胞来源的M2巨噬细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,延时成像,Western blot | 细胞模型 | 基因表达数据,图像数据,蛋白质数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1369 | 2025-12-01 |
Potential Role of Tumor-derived MIF in B-Cell Antigen Presentation in Lung Adenocarcinoma: Single-cell and TCGA Analyses
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17874
PMID:41318120
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和TCGA分析探讨了肿瘤源性MIF在肺腺癌B细胞抗原呈递中的潜在作用 | 首次在单细胞水平揭示MIF通过调控B细胞获得抗原呈递细胞样功能在肺腺癌中的双重作用 | 样本量较小（仅3个肿瘤样本），需要更大规模验证 | 研究肿瘤源性MIF在肺腺癌免疫调控和预后中的作用 | 肺腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和恶性细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | Seurat，CellChat，GEPIA2 | 单细胞RNA测序数据，TCGA临床数据 | 3个肺腺癌肿瘤（29,936个细胞）和TCGA-LUAD队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1370 | 2025-12-01 |
Single-cell analysis reveals the diversity of human fetal membrane and adjacent placental cells with preterm premature rupture of membranes
2025-Nov-30, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf143
PMID:41319021
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早产胎膜早破患者胎膜及邻近胎盘细胞的多样性和细胞间相互作用差异 | 发现了一种新型滋养层细胞亚型FABP7+Tb，并识别了MMP11在EVT-1中的上调表达作为PPROM的潜在生物标志物 | 样本来源仅限于脐带周围约两厘米范围内的组织，可能无法完全代表整个胎膜和胎盘的情况 | 探索早产胎膜早破的细胞组成和分子机制 | 足月分娩、早产无胎膜早破和早产胎膜早破患者的胎膜及邻近胎盘组织 | 单细胞组学 | 产科疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 三种临床分组（FTIL、PPWROM、PPROM）的胎膜和胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1371 | 2025-12-01 |
Deep Transfer Learning Links Benign Glands to Prostate Cancer Progression via Transcriptomics
2025-Nov-29, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf119
PMID:41317378
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习分析前列腺癌空间转录组数据，揭示形态学良性腺体与癌症进展的关联 | 首次将DEGAS深度迁移学习框架应用于前列腺癌空间转录组学，发现形态学良性腺体中MSMB表达降低与癌症进展的关联 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；空间转录组技术分辨率限制可能影响细胞类型精确识别 | 探索前列腺癌进展中的场效应现象，识别与癌症进展相关的分子特征 | 前列腺癌患者的空间转录组数据、单细胞转录组数据和免疫组织化学样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 深度迁移学习, 免疫组织化学 | 深度迁移学习, 深度学习图像分析 | 转录组数据, 图像数据, 蛋白质表达数据 | 包含有和无5年远处转移患者的前列腺组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1372 | 2025-12-01 |
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell RNA Sequencing Data by Dual-Role Graph Contrastive Learning
2025-Nov-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518277
PMID:41317402
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研究论文 | 提出一种名为RegGAIN的双角色图对比学习模型，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 采用自监督对比学习最大化基因嵌入在扰动图视图间的一致性，并利用双编码器同时学习基因的调控者和靶标双重角色表征 | 未明确说明模型对特定生物环境或数据类型的适用性限制 | 从单细胞转录组数据准确重建细胞类型特异性基因调控网络 | 基因调控网络和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1373 | 2025-12-01 |
Identification and validation of SUN modification-related anti-PD-1 immunotherapy-resistance signatures to predict prognosis and immune microenvironment status in glioblastoma
2025-Nov-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15345-9
PMID:41318472
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别了与SUN修饰和抗PD-1免疫治疗耐药相关的六基因标志物，并构建了胶质母细胞瘤预后预测模型 | 首次整合泛素化、SUMO化和neddylation（统称SUN修饰）与抗PD-1耐药性，建立了六基因预后风险模型，并利用单细胞RNA测序和空间转录组分析验证基因表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于细胞系水平，需要进一步临床样本验证 | 探讨SUN修饰在胶质母细胞瘤预后和抗PD-1免疫治疗耐药中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞系和生物信息学数据集 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 差异表达分析、WGCNA、机器学习算法、RT-qPCR、Western blotting、单细胞RNA测序、空间转录组分析 | 预后风险模型、机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 胶质母细胞瘤细胞系和公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 1374 | 2025-12-01 |
Single-cell transcriptome analysis defines novel molecular subtypes and reveals therapeutic implications of T/myeloid mixed-phenotype acute leukemia
2025-Nov-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01585-8
PMID:41318446
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析定义了T/髓系混合表型急性白血病的新型分子亚型并揭示其治疗意义 | 首次构建T/My MPAL的单细胞转录组图谱，识别出三种恶性细胞亚群并发现传统流式细胞术分类的局限性 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证亚型分类的普适性 | 解析T/髓系混合表型急性白血病的分子异质性并开发个性化治疗策略 | T/髓系混合表型急性白血病患者样本，包括AML、T-ALL和正常供体对照 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约275,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1375 | 2025-12-01 |
Epithelial pyroptosis-induced TREM1+ macrophages activate Th17 cells to accelerate oral mucosal inflammation
2025-Nov-29, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02853-7
PMID:41318555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组等技术揭示了上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞通过激活Th17细胞加速口腔黏膜炎症的机制 | 首次发现上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞在口腔慢性炎症中的关键作用，并建立了ORGUAMIA在线数据库 | NA | 研究口腔慢性炎症的发病机制 | 口腔黏膜组织 | 单细胞生物学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序,空间转录组,多重免疫组化,细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量RNA测序数据 | 大型临床随访队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1376 | 2025-12-01 |
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06341-6
PMID:41318588
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境下的叶片细胞基因表达模式 | 首次在异形叶性研究中使用水蓑衣作为模式植物，并应用单细胞转录组技术解析其环境适应性分子机制 | 未明确说明样本具体数量，且作为新兴模式植物其分子机制研究基础较为薄弱 | 探索异形叶性现象的分子机制和植物环境适应性 | 水蓑衣（Hygrophila difformis）的陆生和水生茎部原生质体 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1377 | 2025-12-01 |
CD74+CCL5+ effector CD8+ T cells drive mucosal inflammation and predict biologics response in inflammatory bowel disease
2025-Nov-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07509-9
PMID:41318676
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现CD74+CCL5+效应CD8+T细胞是驱动炎症性肠病黏膜炎症的关键细胞亚群，并开发了预测生物制剂治疗反应的六基因模型 | 首次系统识别CCL5+效应CD8+T细胞作为IBD关键致病细胞，建立基于六基因的诊断和治疗反应预测模型 | 样本量相对有限，需要更大规模队列验证，外周血变化不如组织明显 | 识别驱动IBD发病的免疫细胞亚群和分子程序，开发治疗反应预测生物标志物 | 炎症性肠病患者和健康对照的结肠组织及外周血样本 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 转录组反卷积, 孟德尔随机化, 肠道微生物组分析, 免疫组织化学, 流式细胞术 | 六基因预测模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 基因组数据, 微生物组数据, 组织图像, 流式细胞数据 | 12名IBD患者和10名健康对照的结肠组织，7名IBD患者和12名健康个体的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组分析 | NA | NA |
| 1378 | 2025-12-01 |
T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 3-mediated immunomodulation in myeloid cells and keratinocytes in the development of severe acne
2025-Nov-27, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00367-3
PMID:41307843
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TIM3在重度痤疮发展中作为免疫检查点的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析揭示TIM3在重度痤疮中的免疫调节功能 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究TIM3在重度痤疮发病机制中的免疫调节作用 | 重度痤疮患者皮肤样本、人永生化角质形成细胞(HaCaT)、痤疮丙酸杆菌诱导的小鼠模型 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化分析, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像 | 重度痤疮、普通痤疮和正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1379 | 2025-12-01 |
Spatial gene expression profiling reveals the distinct microenvironment of tuberous sclerosis complex-associated angiomyolipoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26541-9
PMID:41309810
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的独特微环境特征 | 首次使用空间转录组技术比较TSC-AML、散发性AML和肾细胞癌的转录景观，识别出TSC特异性分子特征 | 研究仅基于单例样本设计，样本量有限 | 表征结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的转录特征并识别TSC特异性分子标志物 | 结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤、散发性肾血管平滑肌脂肪瘤和肾细胞癌组织样本 | 空间转录组学 | 结节性硬化症相关肾肿瘤 | 空间转录组测序 | 无监督聚类分析 | 空间基因表达数据 | 3例样本（TSC-AML、散发性AML和RCC各1例） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | CytAssist Visium平台，使用福尔马林固定石蜡包埋组织切片 |
| 1380 | 2025-12-01 |
Cathepsin B as a potential serum biomarker for early diagnosis and progression of diabetic foot ulcer complicated with peripheral vascular disease
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26599-5
PMID:41309848
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现组织蛋白酶B可作为糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清诊断标志物 | 首次通过单细胞转录组分析鉴定CTSB在DFU合并PVD血管内皮细胞中的富集，并验证其血清检测价值 | 样本量有限，需要更大规模临床研究验证CTSB的诊断效能 | 探索糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清生物标志物 | 糖尿病足溃疡合并外周血管疾病患者 | 生物医学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞转录组分析,免疫组化,ELISA,临床相关性分析,血管生成实验,CCK8实验,划痕实验 | NA | 基因表达数据,血清样本,组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |