单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10549 篇文献,本页显示第 1341 - 1360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1341 2026-01-24
Pig jejunal single-cell RNA landscapes revealing breed-specific immunology differentiation at various domestication stages
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了野猪、金华猪和杜洛克猪空肠组织的免疫细胞图谱,揭示了不同驯化阶段猪品种间免疫功能的差异和进化 首次在单细胞分辨率下构建了猪空肠组织的免疫细胞图谱,开发了免疫细胞评估系统,并识别了与驯化相关的品种特异性基因模式 研究仅关注空肠组织,可能未全面反映整个肠道的免疫变化;样本量相对有限,未来可扩展至更多品种和部位 探究猪在驯化过程中肠道免疫功能的进化变化和细胞异质性 野猪、中国地方品种(金华猪)和集约化品种(杜洛克猪)的空肠组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 26,246个细胞,来自三个猪品种的空肠组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1342 2026-01-24
Hydrogen improves the efficacy of tetrandrine in the treatment of silicosis by inhibiting vascular endothelial mesenchymal transition caused by oxidative stress
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
研究论文 本研究探讨了氢气如何通过抑制氧化应激诱导的血管内皮间质转化,来提高汉防己甲素治疗矽肺的疗效 首次提出氢气通过抑制凋亡肺泡巨噬细胞释放淀粉样前体蛋白及其与血管内皮细胞CD74的相互作用,来缓解肺血管狭窄,从而提高治疗药物在肺组织中的浓度 研究基于小鼠模型,结论在人体中的有效性尚需进一步验证 探究汉防己甲素在肺组织中浓度低的原因,并提出联合氢气吸入的治疗方案以提高矽肺治疗效果 矽肺小鼠模型 数字病理学 肺病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1343 2026-01-24
Downregulation of OPCML is associated with activation of AKT signaling and aggressive phenotypes in glioblastoma cells
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了OPCML在胶质母细胞瘤中的下调与AKT信号通路激活及侵袭性表型的关系 首次在单细胞分辨率下定位OPCML在胶质母细胞瘤中的表达,并揭示其通过调节PI3K-AKT-mTOR信号通路影响肿瘤侵袭性 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内模型验证;临床相关性分析依赖于公共数据库,可能存在样本偏差 阐明OPCML在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其临床意义 胶质母细胞瘤细胞系(U87和U251)及公共数据库中的患者数据 生物信息学与分子生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、微阵列、Western blotting、siRNA敲低、细胞功能实验 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床数据 两个批量微阵列队列、单细胞RNA测序数据、TCGA和HPA数据库中的患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1344 2026-01-24
Integrative bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals COL1A2-driven ECM remodeling and focal adhesion signaling associated with the transition from non-muscle-invasive to muscle-invasive bladder cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合分析bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了COL1A2驱动的细胞外基质重塑和黏着斑信号在膀胱癌从非肌层浸润向肌层浸润转变过程中的关键作用 首次整合bulk和单细胞转录组数据,系统揭示了COL1A2介导的基质CAFs与EMT上皮细胞间的细胞通讯轴在膀胱癌进展中的机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 探究COL1A2在膀胱癌进展中的作用机制及其作为预后生物标志物的潜力 膀胱癌(非肌层浸润型和肌层浸润型) 生物信息学 膀胱癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, ssGSEA, 细胞通讯分析 Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析 转录组数据 TCGA和GEO数据库中的膀胱癌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1345 2026-01-24
Metabolic reprogramming-driven stratification and therapeutic targeting in lung adenocarcinoma: implications for prognosis and personalized treatment
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究开发了一种基于代谢相关基因的预后评分系统(MRPs),用于肺腺癌(LUAD)患者的风险分层和个性化治疗指导 提出了一个新颖的代谢相关预后评分系统(MRPs),该系统超越了传统的临床病理参数,能够捕获LUAD的代谢和免疫异质性,并识别出WARS2作为关键功能驱动因子和治疗靶点 研究主要基于回顾性转录组和临床数据,需要进一步的前瞻性临床验证来确认MRPs系统的临床应用价值 开发一个基于代谢相关基因的预后评分系统,并研究其在肺腺癌中的生物学、免疫学和治疗学意义 肺腺癌(LUAD)患者 数字病理学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 免疫组织化学 LASSO-Cox回归模型 转录组数据, 临床数据 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者队列(具体样本数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1346 2026-01-24
Metabolic reprogramming in the post-metastatic tumor microenvironment: multi-omics insights into determinants of immunotherapy response
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了转移后肿瘤微环境中代谢重编程如何决定免疫治疗反应,并探讨了多组学技术在此领域的应用前景 系统整合了代谢重编程(糖酵解、脂代谢、铁死亡、铜死亡、色氨酸代谢轴)与免疫抑制微环境的关联,并强调了多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、空间组学)在解码这些复杂相互作用、发现生物标志物和治疗靶点方面的突破性作用 NA 探讨转移后肿瘤微环境(TIME)中代谢重编程如何调控免疫应答并影响免疫治疗疗效,旨在为克服治疗耐药性和开发个性化疗法提供见解 转移性肿瘤的肿瘤免疫微环境(TIME)及其代谢与免疫相互作用网络 肿瘤生物学与免疫学 转移性癌症 多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、空间组学) NA 多组学数据 NA NA 单细胞测序, 空间转录组学 NA NA
1347 2026-01-24
Decidual stromal cells drive CD16+ macrophages towards an immunoregulatory phenotype via extracellular matrix-adhesion molecule interaction during early pregnancy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了在早期妊娠中,蜕膜基质细胞通过细胞外基质-黏附分子相互作用调控CD16+巨噬细胞向免疫调节表型分化的机制 首次揭示了蜕膜基质细胞通过细胞外基质成分(如胶原IV、骨桥蛋白和透明质酸)与其受体相互作用,驱动CD16+巨噬细胞向免疫调节表型分化,并发现复发性流产患者中此调控链减弱 研究主要基于体外共培养系统和单细胞测序数据分析,体内验证和临床样本量可能有限,且具体分子机制细节需进一步探索 研究早期妊娠中蜕膜基质细胞与CD16+巨噬细胞通过细胞外基质-黏附分子相互作用的调控机制及其在复发性流产中的病理意义 蜕膜基质细胞、CD16+巨噬细胞、复发性流产患者 生殖免疫学 复发性流产 单细胞测序、共培养系统、组织与细胞水平分析 NA 单细胞测序数据、组织样本、细胞培养数据 包括子宫内膜和蜕膜组织样本,以及复发性流产患者样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1348 2026-01-24
Identify GDPD3 as a key regulator of epithelial-mesenchymal transition and prostate adenocarcinoma progression via the LPA/LPAR1/AKT axis: transcriptomic and experimental study
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和Bulk RNA测序数据,识别GDPD3作为前列腺腺癌进展的关键调控因子,并通过LPA/LPAR1/AKT轴促进上皮-间质转化 首次将GDPD3与前列腺腺癌的LPA/LPAR1/AKT信号轴联系起来,并开发了一个21基因预后模型 研究主要基于体外细胞实验(DU145细胞),缺乏体内模型验证,且临床样本验证有限 探索前列腺腺癌进展的分子机制并识别潜在治疗靶点 前列腺腺癌(PRAD) 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序,Bulk RNA测序,免疫组织化学,qPCR,体外敲低实验 预后模型(基于Cox回归和LASSO分析) RNA测序数据,临床数据,图像数据 来自GEO的单细胞RNA-seq数据和来自TCGA的Bulk RNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,Bulk RNA-seq NA NA
1349 2026-01-24
Single-cell sequencing reveals the tumor immune microenvironment in thyroid cancer: a narrow review
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术揭示甲状腺癌肿瘤免疫微环境的研究进展 通过单细胞测序技术,首次系统描绘了从PTC到PDTC再到ATC这一分化依赖的肿瘤免疫微环境重塑轨迹,揭示了传统批量分析中常被掩盖的细胞异质性、免疫互作和空间组织特征 本文为综述性文章,未涉及原始数据生成或新模型开发,主要基于现有研究进行总结和分析 阐明甲状腺癌肿瘤免疫微环境的特征及其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 甲状腺癌的肿瘤免疫微环境,重点关注乳头状甲状腺癌(PTC)、低分化甲状腺癌(PDTC)和间变性甲状腺癌(ATC) 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1350 2026-01-24
Glutamate enhances the production of inflammatory cytokines IL-6 and IL-11, as well as chemokines CXCL2, CXCL3, and CXCL8 in keloid fibroblasts
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过转录组学和代谢组学分析,揭示了谷氨酸代谢在促进瘢痕疙瘩成纤维细胞炎症功能中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和代谢组学,发现谷氨酸受体GRIN2D在瘢痕疙瘩成纤维细胞中特异性高表达,并证实谷氨酸能增强炎症因子和趋化因子的产生 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量可能有限,未明确具体数量 探究谷氨酸代谢在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 人类瘢痕疙瘩组织与正常皮肤组织,以及体外培养的人成纤维细胞 数字病理学 皮肤瘢痕疙瘩 RNA测序(RNA-seq)、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、定量RT-PCR、ELISA NA 基因表达数据、代谢物数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1351 2026-01-23
Transcriptome-wide Mendelian randomization and single-cell analysis during CD4+ T cell activation deciphers immunotherapeutic targets for colorectal cancer
2025-Dec-29, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过转录组范围孟德尔随机化与单细胞分析,揭示了CD4+ T细胞活化在结直肠癌进展中的关键作用,并识别出潜在的免疫治疗靶点 首次结合转录组范围孟德尔随机化、单细胞RNA测序与多组学验证,系统解析CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系,识别出PARP14和ORMDL3等关键免疫治疗靶点 研究主要基于遗传学与转录组数据,需进一步实验验证靶点的功能机制与临床转化潜力 识别结直肠癌免疫治疗的潜在靶点 CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系 生物信息学 结直肠癌 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 多组学分析 孟德尔随机化模型, 单细胞转录组分析 遗传学数据, 转录组数据, 单细胞表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1352 2026-01-23
The Distinct Monocyte Subsets and Intercellular Communication in Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec-27, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了原发性干燥综合征患者中单核细胞亚群、亚群间通讯的异常变化及其在疾病发病机制中的作用 首次在pSS患者中利用scRNA-seq全面表征单核细胞亚群和亚群的异质性,识别出新的亚群变化和潜在生物标志物 样本量有限,未进行功能验证实验,且研究仅关注单核细胞,未全面评估其他免疫细胞类型 探究原发性干燥综合征患者单核细胞亚群和亚群的变异及其功能角色 原发性干燥综合征患者和健康对照者的单核细胞样本 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定具体样本数量,涉及pSS患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1353 2026-01-23
Intrinsic and non-cell autonomous roles for a neurodevelopmental syndrome-linked transcription factor
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文揭示了转录因子UNC-3在运动神经元中的细胞自主和非细胞自主功能,及其与人类EBF3综合征的关联 首次发现UNC-3作为终端选择因子,不仅通过细胞自主方式调控神经元身份,还通过胆碱能神经传递介导非细胞自主效应,影响下游GABA运动神经元的转录、形态和连接 研究基于线虫模型,人类EBF3综合征的直接机制仍需进一步验证 探究转录因子在神经元身份和电路组装中的内在与外在调控作用 线虫的胆碱能和GABA运动神经元 神经发育生物学 神经发育综合征 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1354 2026-01-23
FlashDeconv enables atlas-scale, multi-resolution spatial deconvolution via structure-preserving sketching
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为FlashDeconv的框架,用于图谱规模的空间转录组学解卷积,通过结构保持的随机草图技术,在保持计算效率的同时保留稀有生物信号 采用杠杆得分重要性采样来优先处理转录组学上独特的标记,保留标准特征选择丢弃的稀有细胞类型信号,相比基于方差的方法能更准确地解卷积 未明确提及具体局限性,但可能依赖于特定数据质量或算法假设 开发一个可扩展的数学框架,用于图谱规模的空间转录组学解卷积,以快速进行患者分层和生物结构发现 人类卵巢癌队列数据,包括细胞共定位信号和Tuft细胞微环境 空间转录组学 卵巢癌 空间转录组学解卷积 结构保持随机草图框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1355 2026-01-23
In vivo human embryonic spinal cord atlas validates stem cell-derived human dorsal interneurons and reveals ASD spinal signatures
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种改进的方法,通过神经中胚层祖细胞状态从人类胚胎干细胞生成脊髓背侧中间神经元,并构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱,用于验证干细胞来源的神经元并揭示与自闭症谱系障碍相关的脊髓特征 提出了一种通过生理中间体(神经中胚层祖细胞)生成人类脊髓背侧中间神经元的新方法,并首次构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱,揭示了dI4/dI5群体的显著扩张及其与自闭症谱系障碍的关联 未明确说明样本大小或实验验证的局限性,可能依赖于体外模型,缺乏体内功能验证 开发干细胞分化协议以生成脊髓背侧中间神经元,用于脊髓损伤后的感觉恢复,并探索脊髓在自闭症谱系障碍中的作用 人类胚胎干细胞(hESCs)、人类胚胎脊髓组织、脊髓背侧中间神经元(dI1-dI6) 干细胞生物学与神经科学 脊髓损伤、自闭症谱系障碍 单细胞RNA-Seq、干细胞定向分化 NA 单细胞RNA-Seq数据、基因表达谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1356 2026-01-23
Hydrophobic complementarity-determining region 3 (CDR3) sequences elucidate the cardiotoxic effects of immune checkpoint inhibitors
2025-Dec-16, Research square
研究论文 本研究通过分析免疫检查点抑制剂(ICIs)引发心脏毒性患者的免疫细胞,揭示了T细胞受体(TCR)CDR3序列的疏水性特征在心肌炎发病机制中的作用 首次发现免疫相关不良事件(irAE)心肌炎患者的T细胞具有更短的TCR CDR3序列和更高的疏水性残基比例,提出了基于TCR功能混杂性和TCR-MHC相互作用的T细胞激活新机制 研究样本来自特定患者群体,结果可能受限于样本量,且机制研究主要在描述性层面,需要进一步功能验证 阐明免疫检查点抑制剂引发心脏毒性的免疫学机制,为开发靶向TCR物理特性的精准治疗策略提供依据 经历ICIs治疗并出现心脏毒性的癌症患者的外周血单个核细胞、心脏组织及心包液中的T细胞 免疫学 心血管疾病 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、T细胞受体(TCR)测序 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 经历ICIs治疗并出现心脏毒性的癌症患者(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1357 2026-01-23
Integrative bulk and single-cell transcriptomic profiling identifies core gene networks and potential therapeutic targets in glioma
2025-Dec-13, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合多个队列的转录组数据和单细胞分析,系统性地识别了胶质瘤的核心基因网络和潜在治疗靶点 结合多队列批量转录组数据与单细胞RNA测序分析,识别出六个在胶质瘤中一致下调的枢纽基因,并揭示了它们与免疫微环境和肿瘤细胞谱系的关联 研究主要基于公共数据集和有限的临床样本验证,未来需要更大规模的独立队列和功能实验进一步验证 识别胶质瘤的核心基因网络和潜在诊断生物标志物及治疗靶点 胶质瘤组织样本 生物信息学 胶质瘤 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR WGCNA, LASSO, SVM-RFE, 随机森林 基因表达数据 504个批量转录组样本(来自5个GEO数据集)和69个临床样本用于qRT-PCR验证,外加三个单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1358 2026-01-23
Multiomics insights into rumen microbiome and function in grazing lambs: implications for nutrient absorption and grassland sustainability
2025-Dec-12, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究通过多组学方法探究了放牧羔羊瘤胃微生物组与功能,揭示了其对养分吸收和草地可持续性的影响 首次结合宏基因组、宏转录组、单细胞RNA测序和血清代谢组学,系统分析了瘤胃微生物与宿主上皮细胞在草料消化和短链脂肪酸代谢中的相互作用 研究样本仅限羔羊,结果可能无法直接推广到其他反刍动物或不同放牧条件 探究瘤胃微生物组如何调控草料摄入和宿主代谢,以优化反刍动物管理策略和草地可持续性 72只放牧羔羊的瘤胃微生物组、瘤胃壁上皮细胞和血清代谢物 微生物组学 NA 宏基因组分析, 宏转录组分析, 单细胞RNA测序, 血清代谢组学 NA 基因组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 代谢组数据 72只羔羊 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1359 2026-01-23
CD9-positive tumor-associated macrophages promote renal cell carcinoma progression by activating the orphan nuclear receptor Nor1/Nr4a3
2025-Dec-12, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD9阳性肿瘤相关巨噬细胞通过激活孤儿核受体Nor1/Nr4a3促进肾细胞癌进展 首次在肾细胞癌肿瘤组织中鉴定出CD9巨噬细胞亚群,并揭示其通过激活Nor1/Nr4a3促进肿瘤发展的新机制 样本量较小(仅3例患者),机制研究仍需进一步验证 探究肾细胞癌肿瘤微环境中巨噬细胞的作用机制 肾细胞癌患者肿瘤组织、外周血免疫细胞及体外细胞模型 单细胞组学 肾细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3例肾细胞癌患者的肿瘤组织及匹配的外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1360 2026-01-23
Nuclear PD-L1 drives IFN-γ-promoted lung metastasis of triple-negative breast cancer via POLR2A-mediated transcriptional activation of LY6E
2025-Dec-12, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本文揭示了IFN-γ通过促进PD-L1核转位并与POLR2A形成转录复合体激活LY6E表达,从而驱动三阴性乳腺癌肺转移的新机制 发现了PD-L1在免疫检查点功能之外的新角色,即核内PD-L1与POLR2A结合直接激活LY6E转录,驱动TNBC肺转移 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限,且机制在人体中的普适性需进一步确认 探究PD-L1在TNBC肺转移中的非免疫检查点依赖性功能及IFN-γ的作用机制 三阴性乳腺癌细胞系、小鼠模型及TNBC患者样本 癌症生物学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、RNA测序、染色质免疫沉淀测序、CRISPR/Cas9基因编辑、共免疫沉淀 NA 基因表达数据、测序数据 未明确具体样本数量,涉及TNBC肺转移的scRNA-seq数据、细胞系及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部