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当前共找到 10543 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2026-03-13 |
Kindlin-2-Mediated Hematopoiesis Remodeling Regulates Triple-Negative Breast Cancer Immune Evasion
2025-May-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0698
PMID:39918417
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研究论文 | 本研究揭示了接头蛋白Kindlin-2通过重塑造血过程和调节PD-L1表达，在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的关键作用 | 首次阐明Kindlin-2通过系统性调节造血过程（促进髓系细胞扩增）和肿瘤PD-L1表达，驱动三阴性乳腺癌免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；未详细探讨Kindlin-2调控造血和PD-L1表达的具体下游信号通路 | 探究Kindlin-2在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的作用机制，并评估其作为免疫治疗联合靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌肿瘤模型、荷瘤小鼠的造血系统及肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确说明具体样本数量，但涉及荷瘤小鼠模型及多种测序分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1322 | 2026-03-13 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542774
PMID:37398280
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研究论文 | 本研究优化了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法，用于人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系，以揭示胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控特征 | 开发了一种在生理营养水平和完整肿瘤微环境下评估胶质瘤代谢的可行方法，结合人血浆样培养基和稳定同位素示踪技术，揭示了传统培养条件中被抑制的代谢和免疫程序 | 该方法仍为体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的生理和免疫相互作用 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫微环境的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 代谢组学 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪技术、空间转录组学 | NA | 代谢数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1323 | 2026-03-13 |
[Research progress on the mechanistic role and constituents of hepatic macrophages during the occurrence and development of hepatic fibrosis]
2025-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了肝纤维化发生发展中肝巨噬细胞的机制作用、构成及其亚型，并探讨了单细胞测序技术揭示的新发现以及靶向巨噬细胞治疗的优势 | 总结了单细胞测序技术揭示的肝纤维化过程中巨噬细胞的新亚型和作用模式，并分析了靶向巨噬细胞治疗相较于传统抗纤维化疗法的优势 | NA | 阐明肝巨噬细胞在肝纤维化发生发展中的机制作用和构成，并探讨新的治疗方向 | 肝巨噬细胞 | NA | 肝纤维化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1324 | 2026-03-13 |
CancerTrace: Multi-stage single-cell analysis of networked cancer evolution for driver and modulator gene identification
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.014
PMID:41322005
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CancerTrace的计算框架，用于从单细胞RNA测序数据中识别癌症驱动基因及其上游调控因子 | 结合转移熵和稀疏条件结构于变分贝叶斯模型中，实现时间感知的动态调控机制重建，无需匹配DNA或外部扰动数据 | 仅基于九个纵向scRNA-seq文库（来自三名肺腺癌患者），样本规模较小，且仅应用于肺腺癌 | 识别患者特异性癌症驱动基因及其上游调控因子，以推进精准肿瘤学 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 变分贝叶斯模型 | 单细胞RNA测序数据 | 九个纵向scRNA-seq文库，来自三名肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1325 | 2026-03-13 |
Comparative single-cell landscape of immune cells in human livers affected HBV and non-viral cirrhosis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1708675
PMID:41815278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了HBV与非病毒性肝硬化患者肝脏中的免疫细胞景观，揭示了疾病进展中的不同免疫机制 | 首次在单细胞水平上系统比较HBV与非病毒性肝硬化中的免疫细胞异质性，并整合空间转录组数据验证细胞共定位 | 样本量有限，主要基于HBV肝硬化患者，未涵盖所有非病毒性肝硬化亚型 | 阐明HBV与非病毒性肝硬化中免疫细胞景观的差异及其在疾病进展中的作用 | HBV肝硬化患者、非病毒性肝硬化患者及健康对照者的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | HBV肝硬化患者与健康对照者的肝脏组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1326 | 2026-03-11 |
Renal Cell Type and State Estimation in Brightfield Histology Images: A Pilot Study on Diabetic Nephropathy
2025-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering
DOI:10.1117/12.3047996
PMID:41799653
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研究论文 | 本研究探索了基于机器学习的方法，利用深度学习模型从亮场组织学图像中预测细胞类型和状态，以提升糖尿病肾病的临床诊断和预后评估 | 提出了一种两阶段管道，结合图像到文本检索网络和视觉语言模型，利用CONCH模型从亮场图像中生成组织病理学文本提示，并预测细胞类型/状态比例，相比仅使用图像输入的模型有显著性能提升 | 研究为试点性质，样本量有限，仅基于印第安纳大学收集的糖尿病肾病样本，且依赖于10X Visium空间转录组学数据作为参考，可能限制了模型的泛化能力 | 开发一种从亮场组织学图像中预测细胞类型和状态的机器学习管道，以弥补传统组织病理学与分子诊断之间的差距 | 糖尿病肾病患者的肾组织样本，包括肾小球、肾小管、血管和间质等结构 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学，深度学习 | CONCH, ViT, ResNet | 图像，文本 | 来自印第安纳大学的糖尿病肾病样本的10X Visium FFPE全玻片图像 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Visium formalin-fixed paraffin-embedded whole slides images |
| 1327 | 2026-03-11 |
Bayesian Sparse Gaussian Mixture Model for Clustering in High Dimensions
2025, Journal of machine learning research : JMLR
IF:4.3Q2
PMID:41799364
|
研究论文 | 本文提出了一种贝叶斯稀疏高斯混合模型，用于高维数据聚类，特别是在单细胞RNA测序数据分析中应用 | 提出了一种计算可行的贝叶斯方法，使用连续尖峰-平板先验估计高维稀疏高斯混合模型，无需预先指定聚类数量，且后验收缩率达到了极小极大最优 | 未明确提及模型在处理极端高维或噪声数据时的具体限制，也未讨论计算复杂度随样本量增长的具体情况 | 开发一种在高维情况下能自适应估计聚类数量的计算可行聚类方法 | 高维数据，特别是单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯稀疏高斯混合模型 | 高维数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1328 | 2026-03-10 |
Diverse infections transcriptionally reprogram the intestinal epithelium and epithelial-immune cell interactions
2025-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695505
PMID:41497582
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研究论文 | 本文介绍了GutPath图谱，一个包含超过50万个单细胞的RNA和蛋白质表达谱的资源，用于研究不同感染类型下回肠的细胞状态和细胞间通讯 | 开发了GutPath图谱，首次系统性地揭示了回肠在多种感染下的细胞转录组多样性和上皮-免疫细胞相互作用，并识别了一种与细菌负荷和组织病理学空间相关的新型肠上皮细胞状态 | 研究主要关注回肠，可能未全面覆盖整个小肠或其他肠道区域，且依赖于单细胞和空间转录组学技术，可能存在技术偏差 | 研究回肠在感染期间的细胞响应和细胞间通讯复杂性，以增进对肠道免疫和病理机制的理解 | 回肠中的细胞状态，包括肠上皮细胞和免疫细胞，涉及多种感染类型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA表达谱, 蛋白质表达谱 | 超过500,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1329 | 2026-03-10 |
Specialized gas-exchange endothelium of the zebrafish gill
2025-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.11.30.690480
PMID:41738028
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多种成像技术，详细表征了斑马鱼鳃中的气体交换内皮细胞，并发现其与哺乳动物肺泡中的Cap2/Aerocyte内皮细胞具有相似性 | 首次在斑马鱼鳃中鉴定出与哺乳动物肺泡Aerocyte内皮细胞相似的细胞类型，并建立了斑马鱼作为研究气体交换血管系统的可实验操作脊椎动物模型 | 研究主要基于斑马鱼模型，与哺乳动物肺部系统的直接可比性仍需进一步验证 | 研究气体交换器官的发育和功能，特别是气体交换血管系统 | 成年斑马鱼鳃组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、共聚焦成像、超分辨率成像、杂交链式反应、阵列断层扫描、聚焦离子束扫描电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 成年斑马鱼鳃组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1330 | 2026-03-10 |
Pharmacological Inhibition of Ferroptosis Attenuates Experimental Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323269
PMID:41036562
|
研究论文 | 本研究探讨了铁死亡在腹主动脉瘤形成中的作用，并通过药理学抑制铁死亡来减轻实验性腹主动脉瘤的形成 | 首次在腹主动脉瘤形成中揭示了铁死亡的作用，并展示了使用liproxstatin-1抑制铁死亡可减轻主动脉炎症和重塑 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且仅使用了一种铁死亡抑制剂 | 探究铁死亡在腹主动脉瘤形成中的机制及药理学抑制的潜在治疗效果 | 人类腹主动脉瘤组织、C57BL/6小鼠（雄性和雌性）的主动脉组织、巨噬细胞和平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、质谱分析、组织学分析、体外细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、质谱数据、组织图像、体外实验数据 | 人类AAA组织数据库、使用弹性蛋白酶或弹性蛋白酶+β-氨基丙腈诱导的C57BL/6小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1331 | 2026-03-10 |
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Oct, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0441
PMID:41027482
|
研究论文 | 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式，首次实现了从混沌系统中进行准确预测 | 首次引入混沌学习，通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入交互式混沌动力系统，并调制其动态行为以实现准确预测 | NA | 探索混沌系统的可预测性，并开发一种能够从混沌中提取物理属性的新学习范式 | 28个数据集，包括脑波、蛋白质基准数据、单细胞RNA测序数据和图像数据，以及Lorenz和Rossler吸引子两种混沌动力系统 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混沌学习范式 | 脑波数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 28个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1332 | 2026-03-10 |
Nephrobase Cell+: Multimodal Single-Cell Foundation Model for Decoding Kidney Biology
2025-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.30.679471
PMID:41256511
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研究论文 | 本研究开发了首个专注于肾脏的大型基础模型Nephrobase Cell+，用于解码肾脏生物学 | 首次构建了肾脏特异性的大型基础模型，通过器官规模的多模态预训练和专门的Transformer架构，实现了跨物种、跨模态的高保真表示学习 | 模型主要针对四种哺乳动物物种，可能无法完全覆盖所有肾脏细胞类型或疾病状态 | 开发一个统一的、高保真的肾脏生物学表示模型，以提升单细胞分析能力 | 人类、小鼠、大鼠和猪的肾脏单细胞和单核转录组及空间转录组数据 | 机器学习 | 肾脏疾病 | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq, 空间转录组学 | Transformer-based encoder-decoder with gene-token cross-attention and mixture-of-experts | 单细胞和单核转录组、表观基因组及空间转录组数据 | 约39.5百万个单细胞和单核图谱，来自4,319个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1333 | 2026-03-10 |
Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424487122
PMID:40920930
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪技术，揭示了增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）中纤维化形成的细胞起源和机制，并识别了TSP-1作为关键驱动基因 | 首次结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪，系统绘制了PVR纤维化形成的细胞路线图，并发现TSP-1作为治疗靶点 | NA | 解析增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）中纤维化形成的细胞机制，以开发治疗策略 | 视网膜色素上皮细胞、免疫细胞和Müller细胞在PVR病变中的贡献 | 数字病理学 | 增殖性玻璃体视网膜病变 | 单细胞转录组学，遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1334 | 2026-03-10 |
Dynamic and precise electromagnetic levitation of single cells
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512246122
PMID:40920932
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Electro-LEV的创新平台，它结合电磁和磁悬浮原理，实现了在3-D微流体环境中对单细胞位置进行动态精确控制 | 该平台通过周期性调制和跟踪细胞在z轴的位置，能够区分单细胞与细胞簇的悬浮行为，并显著提高了悬浮分选的纯度和效率 | NA | 开发一种用于动态3-D控制细胞位置的新平台，以研究细胞异质性、区分细胞大小和类型，并提高细胞分选效率 | 单细胞和细胞簇 | 数字病理学 | NA | 电磁悬浮和磁悬浮 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1335 | 2026-03-10 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-02-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40036846
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研究论文 | 本研究构建了TcEVdb数据库，通过SEVtras方法从T细胞单细胞RNA测序数据中探索T细胞来源的小细胞外囊泡的表达和聚类 | 首次创建了专门针对T细胞来源小细胞外囊泡的综合性数据库，整合了多项目、多组织来源的单细胞转录组数据，揭示了TcEV的异质性 | 数据库依赖于现有单细胞RNA测序数据的质量和覆盖范围，可能无法完全捕捉所有TcEV亚群 | 探索T细胞来源细胞外囊泡的转录组特征和异质性，以促进基于EV的疾病诊断和治疗研究 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras方法 | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目中的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1336 | 2026-03-10 |
ScLineageAtlas: a comprehensive single-cell genomics database for characterizing cellular clones in cancer
2025-01-18, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf046
PMID:40996711
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研究论文 | 介绍了一个名为ScLineageAtlas的综合单细胞基因组学数据库，用于表征多种癌症类型中的细胞克隆 | 整合了24个处理过的单细胞RNA测序数据集，涵盖13种不同癌症类型，并利用先进计算方法识别细胞克隆，提供克隆关系和进化动力学的详细视图 | 数据库目前仅包含24个数据集，可能覆盖的癌症类型和样本量有限，且依赖于现有计算方法，可能受算法准确性限制 | 通过表征细胞克隆来研究癌症的起始、发展和治疗机制，促进对肿瘤异质性和进化轨迹的理解 | 多种癌症类型中的细胞克隆，包括单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24个处理过的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1337 | 2026-03-09 |
Epithelial pyroptosis-induced TREM1+ macrophages activate Th17 cells to accelerate oral mucosal inflammation
2025-Nov-29, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02853-7
PMID:41318555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组等技术，揭示了口腔黏膜慢性炎症中上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞通过激活Th17细胞加速炎症发展的机制 | 首次揭示了上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞在口腔黏膜慢性炎症中的关键作用，并建立了ORGUAMIA在线数据库整合多组学数据 | NA | 探究口腔慢性炎症的发病机制，特别是口腔扁平苔藓的恶性进展过程 | 口腔黏膜组织、免疫细胞（巨噬细胞、Th17细胞） | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 临床随访数据 | 大型临床随访队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1338 | 2026-03-08 |
In vivo differentiation of embryonic cells devoid of key reprogramming factors
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116498
PMID:41171758
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析斑马鱼胚胎中NPS突变细胞在野生型胚胎中的命运，探讨了NPS在发育重编程和分化中的作用 | 揭示了NPS在协调核与细胞质重编程、防止谱系特异性分化程序过早激活中的关键作用，并发现部分细胞可绕过短暂全能性达到类似野生型的中间发育状态 | 研究基于斑马鱼模型，结果可能不直接适用于其他物种；单细胞RNA-seq技术可能无法完全捕捉所有转录动态 | 探究NPS（Nanog、Pou5f3、Sox19b）在胚胎细胞发育重编程和分化中的功能 | 斑马鱼胚胎中的NPS突变细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量，涉及斑马鱼胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1339 | 2026-03-08 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，分析了肾细胞癌中干扰素信号在肿瘤免疫微环境中的作用，并探讨了其如何影响免疫检查点阻断疗法的疗效 | 通过混合效应模型推断细胞类型中干扰素诱导基因的可诱导性，并发现髓系细胞中的IFNγ信号而非肿瘤细胞信号可预测对一线免疫联合疗法的原发性耐药 | 研究主要基于体外实验和临床队列的推断模型，缺乏体内机制的深入验证 | 探究干扰素信号在肾细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 肾细胞癌的肿瘤免疫微环境，特别是髓系细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1340 | 2026-03-08 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
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研究论文 | 本研究利用现有RNA-seq数据集，回顾性分析了体积性肌肉损失（VML）损伤后线粒体基因和代谢通路的时序性失调 | 通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了VML损伤后长达42天的转录组变化，特别是线粒体相关基因和代谢通路的动态调控 | 研究为回顾性分析，依赖于现有公开数据集，可能受原始实验设计和技术差异的限制 | 探究VML损伤后线粒体和代谢转录组的变化 | 大鼠（Rattus norvegicus）和小鼠（Mus musculus）的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉损伤 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |