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当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2026-01-29 |
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1708670
PMID:41601785
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞，并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱（树突状细胞），并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 | 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 | 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，生物信息学算法 | Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 来自TCGA、GEO（GSE68465和GSE31210）和单细胞数据集（GSE131907）的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1242 | 2026-01-29 |
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/fragi.2025.1721744
PMID:41602167
|
综述 | 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用，并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 | 超越对通路的简单罗列，提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架，并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 | 机制复杂性高，动物模型和体外系统存在局限性 | 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制，并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 | 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型（心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞）的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1243 | 2026-01-29 |
JAK-centric explainable few-shot gene-expression diagnosis framework for alopecia via MultiPLIER priors and relation-style set-to-set comparison
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1753206
PMID:41602548
|
研究论文 | 本文开发了一个基于JAK-STAT信号通路的可解释少样本基因表达诊断框架，用于区分斑秃和雄激素性脱发 | 提出了一种结合生物学先验知识（MultiPLIER潜在变量）和关系式集合比较的少样本深度学习分类器，增强了小样本条件下的诊断鲁棒性和机制可解释性 | 研究样本量有限，且框架在更广泛疾病类型中的应用仍需验证 | 开发可解释的AI框架，用于小样本转录组诊断，以区分斑秃和雄激素性脱发 | 斑秃和雄激素性脱发患者的头皮样本 | 机器学习 | 脱发疾病 | RNA-seq | 少样本深度学习分类器（Relation-style set-to-set comparator） | 基因表达数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及独立AA/AGA/健康头皮样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1244 | 2026-01-29 |
Spatiotemporal dynamics of spermatogenesis: insights from high-resolution spatial transcriptomics and pseudotime trajectories in mouse testes
2025, Frontiers in reproductive health
IF:2.3Q3
DOI:10.3389/frph.2025.1747902
PMID:41602862
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了小鼠睾丸中精子发生的时空动态过程 | 采用Salus-STS高分辨率空间转录组学（约1微米分辨率）结合Salus Cellbins算法，首次在单细胞水平上解析了睾丸的空间转录组特征，克服了传统空间转录组学分辨率不足的问题 | 研究仅基于小鼠模型，未直接验证人类样本；高分辨率技术可能受限于样本处理和成本 | 探究精子发生的分子基础和时空动态，以增进对男性生殖生物学的理解 | 小鼠睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | Salus-STS | Salus-STS高分辨率空间转录组学（约1微米分辨率） |
| 1245 | 2026-01-28 |
TREM2 Impedes Recovery After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Lysosomal Membrane Permeabilization-Mediated Autophagy
2025-Oct, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70047
PMID:40320759
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在脊髓损伤后通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬来影响恢复的机制 | 首次揭示了TREM2通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬在脊髓损伤恢复中的具体作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究TREM2在脊髓损伤中的潜在机制及其对小胶质细胞功能的影响 | 野生型和Trem2敲除小鼠的小胶质细胞，以及脊髓损伤模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序，免疫荧光，3D步态分析，运动诱发电位实验，H&E染色，Masson染色 | NA | 测序数据，图像数据，行为数据 | 野生型和Trem2敲除小鼠在脊髓损伤前后的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1246 | 2026-01-28 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
|
研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS，通过单细胞RNA-seq数据识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据，首次识别出与2型糖尿病和肥胖相关的独特β细胞亚群，并验证了CDKN1C和DLK1基因的表达差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA-seq数据，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集以揭示复杂的多细胞相互作用 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好地理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗的相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自健康和非糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1247 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
|
研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提升胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议和靶向耗竭胰岛素转录本，提高了单细胞长读长测序的读长和转录本检测效率 | 单细胞长读长测序存在技术挑战，如读长不足和错误率较高 | 优化单细胞长读长测序协议，以增强胰腺胰岛中异构体的检测 | 胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1248 | 2026-01-28 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
|
研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 | microRNA诱导的沉默复合体（miRISC）及其靶向的mRNAs | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1249 | 2026-01-28 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序，首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 | 研究基于非病理组织，可能未完全反映疾病状态下的衰老特征；细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 | 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 | 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium，10x Chromium | Visium空间转录组学用于空间基因表达分析，单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析 |
| 1250 | 2026-01-27 |
Cross-organ single-cell integration identifies liver-specific fibroblast programs and HGF-MET/AGT-AGTR1B axes that link fibrosis to hepatocarcinogenesis
2025-Dec-29, Neuro endocrinology letters
PMID:41565578
|
研究论文 | 本研究通过跨器官单细胞整合分析，识别了肝脏特异性成纤维细胞程序及HGF-MET/AGT-AGTR1B轴，揭示了肝纤维化与肝细胞癌发生之间的潜在联系 | 采用跨器官单细胞RNA-seq数据整合方法，通过减去共享的全纤维化特征来提名肝脏特异性成纤维细胞基因和通路，并识别了肝脏选择性基质环路及肝细胞-成纤维细胞轴 | 研究依赖于公共数据集，可能存在批次效应或数据异质性；结论为假设性，需进一步实验验证 | 探究肝脏选择性基质机制，以及肝纤维化如何连接到肝细胞癌的发生 | 纤维化心脏、肾脏、肝脏和肺脏的单细胞RNA-seq数据，以及肝细胞癌数据集 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA-seq | Seurat整合工作流、Slingshot伪时间分析、CellChat配体-受体推断 | 单细胞RNA-seq数据 | 多个公共数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1251 | 2026-01-27 |
Intraperitoneal programming of tailored CAR macrophages via mRNA lipid nanoparticle to boost cancer immunotherapy
2025-Dec-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67674-9
PMID:41444487
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向巨噬细胞的mRNA脂质纳米颗粒系统，用于原位编程CAR-M，以增强对实体瘤腹膜转移的免疫治疗效果 | 通过mRNA-LNP系统评估了36种CAR格式，并发现CD3ζ TLR4 ICDs的CAR-M能有效激活适应性免疫，与PD-1/L1疗法协同作用，重塑肿瘤微环境 | CAR设计中潜在细胞内域及其抗肿瘤机制仍需系统探索，研究可能未全面评估所有CAR格式的长期效果或副作用 | 开发针对实体瘤腹膜转移的免疫治疗策略，通过编程CAR-M来增强抗肿瘤免疫反应 | 巨噬细胞、CAR-M、肿瘤微环境、CD8 T细胞 | 免疫治疗 | 实体瘤 | mRNA脂质纳米颗粒系统、单细胞RNA测序 | CAR-M模型 | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1252 | 2026-01-27 |
Comprehensive analysis of malignant subtypes of lung adenocarcinoma based on multi-omics landscape and functional validation of prognostic biomarker BAIAP2L2
2025-Dec-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33171-8
PMID:41436784
|
研究论文 | 本研究基于多组学数据，对肺腺癌恶性亚型进行了综合分析，并通过功能实验验证了预后生物标志物BAIAP2L2的作用 | 整合单细胞RNA测序和RNA测序数据，结合CNV评估、细胞轨迹分析、恶性细胞识别和细胞通讯分析等多种方法，深入解析肺腺癌上皮细胞的异质性，并首次通过CoxBoost模型挖掘并实验验证了BAIAP2L2作为肺腺癌预后风险基因的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于体外细胞实验，缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 | 深入探究肺腺癌的恶性亚型特征，并寻找有效的预后生物标志物 | 肺腺癌上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | CoxBoost模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1253 | 2026-01-27 |
PLAUR, C3, and EMP3 coordinate tumor progression and immune evasion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04292-3
PMID:41417143
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了PLAUR、C3和EMP3三个基因在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤进展和免疫逃逸中的协同作用，并指出PLAUR是主要驱动因子 | 首次系统性地将PLAUR、C3和EMP3三个基因联系起来，阐明它们在ccRCC肿瘤微环境和免疫逃逸中的协同作用机制，并通过单细胞RNA-seq数据明确了这些基因在不同细胞类型中的表达模式 | 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 | 识别驱动透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进展和免疫逃逸的关键分子，为ccRCC的诊断和治疗提供新靶点 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blotting, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验, ELISA | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 基于GSE6344和GSE781数据集，以及正常肾细胞和ccRCC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1254 | 2026-01-27 |
Identification of NK cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic signature in breast cancer
2025-Dec-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03647-0
PMID:41417435
|
研究论文 | 本研究基于单细胞测序数据识别NK细胞标志基因，构建了一个用于乳腺癌预后预测的模型 | 首次结合单细胞测序数据识别NK细胞标志基因，并利用机器学习构建乳腺癌预后模型，揭示了NK细胞在乳腺癌免疫浸润中的关键作用 | 研究依赖于公共数据库（TCGA和GEO）的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证 | 阐明NK细胞在乳腺癌预后和免疫浸润中的作用，并构建预测模型 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1255 | 2026-01-27 |
Celastrol suppresses bone destruction in rheumatoid arthritis by inhibiting ALOX5 expression in macrophages via the NF-κB pathway
2025-Dec-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33001-x
PMID:41408107
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了中药活性成分雷公藤红素通过抑制巨噬细胞中ALOX5基因表达，进而抑制NF-κB通路活化，从而减轻类风湿关节炎骨破坏的分子机制 | 首次系统性地结合多组学数据（GEO数据库、单细胞RNA测序）和分子对接技术，鉴定出雷公藤红素在RA中的13个潜在靶点，并明确了ALOX5在巨噬细胞中的关键作用及其通过TNF-NFκB通路调控MMP3的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证；单细胞分析的数据来源和样本量未具体说明 | 阐明雷公藤红素（Celastrol）在类风湿关节炎（RA）中抑制骨破坏的具体分子机制 | 类风湿关节炎（RA）相关的基因表达数据、雷公藤红素的分子靶点、巨噬细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 基因集变异分析（GSVA）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据（微阵列/RNA-seq）、单细胞转录组数据 | 基于三个GEO数据集（GSE55235, GSE93777, GSE200815），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1256 | 2026-01-27 |
DNMT1 modulation of RASSF1A methylation enhances breast cancer brain metastasis
2025-Dec-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08167-x
PMID:41381440
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研究论文 | 本研究探讨了DNMT1通过调控RASSF1A甲基化促进乳腺癌脑转移的机制 | 首次在单细胞水平利用循环肿瘤细胞（CTCs）的转录组测序，揭示了DNMT1作为乳腺癌细胞存活、迁移和侵袭的关键促进因子，并证实了RASSF1A是其直接甲基化靶点 | 研究主要基于原位乳腺癌模型，临床样本验证尚不充分；未探讨其他DNA甲基转移酶（如DNMT3A/B）的可能作用 | 阐明DNMT1调控RASSF1A甲基化在乳腺癌脑转移中的分子机制 | 乳腺癌细胞、循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序、DNA甲基化测序、甲基化特异性PCR、染色质免疫沉淀 | NA | 测序数据 | 未明确说明（基于原位乳腺癌模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1257 | 2026-01-27 |
RNASEH2C enhances TRAF3IP1 to degrade RAI14 in lysosomes thus hindering macrophage antigen presentation and advancing liver cancer
2025-Dec-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08305-5
PMID:41361104
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研究论文 | 本研究揭示了RNASEH2C通过增强TRAF3IP1表达，促进RAI14在溶酶体中的降解，从而抑制巨噬细胞抗原呈递，进而促进肝癌进展的分子机制 | 首次阐明了RNASEH2C在非极化巨噬细胞中通过调控RAI14的溶酶体降解来抑制抗原呈递，从而促进肝癌发展的新机制，并发现了HSC70和CMTM6在RAI14降解中的相反作用 | 研究主要基于体外细胞模型和小鼠肿瘤模型，尚未在临床样本中进行大规模验证；对RNASEH2C调控TRAF3IP1表达的具体分子机制阐述不够深入 | 探究RNASEH2C如何影响巨噬细胞抗原呈递功能及其在肝细胞癌进展中的作用 | 巨噬细胞（特别是非极化巨噬细胞）、肝细胞癌（HCC）细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫荧光、免疫沉淀、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞图像数据 | 未明确说明具体样本数量，使用了体外细胞模型和小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1258 | 2026-01-27 |
A decreased proportion of naïve MAIT cells is associated with the incomplete immune reconstitution in antiretroviral therapy-treated HIV-1 patients
2025-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.12.003
PMID:41352538
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体谱分析，揭示了在抗逆转录病毒治疗后的HIV-1患者中，幼稚MAIT细胞比例降低与不完全免疫重建之间的关联 | 首次通过单细胞测序技术比较分析免疫无应答者、免疫应答者和健康对照的免疫谱，并识别出幼稚MAIT细胞比例降低作为不完全免疫重建的关键细胞亚群 | 研究样本量有限，且主要基于外周血单核细胞分析，未涉及组织特异性免疫反应 | 探究抗逆转录病毒治疗后HIV-1患者不完全免疫重建的免疫学机制 | HIV-1感染患者（包括免疫无应答者和免疫应答者）以及健康对照个体的外周血单核细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体谱测序 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 未明确指定样本数量，但包括HIV患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 1259 | 2026-01-27 |
Targeting the ApoB100-ENO1 interaction with engineered peptides attenuates atherosclerotic inflammation and plaque progression
2025 Nov-Dec, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.12.003
PMID:41360283
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研究论文 | 本研究开发了一种名为PP3m的工程化肽，通过靶向抑制ApoB100与ENO1的相互作用，有效减轻动脉粥样硬化炎症和斑块进展 | 首次发现并靶向ApoB100-ENO1相互作用轴，开发了稳定的肽抑制剂PP3m，该疗法在不影响血脂水平的情况下独立减轻炎症和斑块进展 | 研究主要基于小鼠模型（Ldlr-/-小鼠），其临床转化效果尚需在人体中进一步验证；体外模型可能无法完全模拟体内复杂的炎症微环境 | 开发一种通过靶向ApoB100-ENO1相互作用来减轻动脉粥样硬化炎症和斑块进展的新型治疗策略 | 人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞、体外培养的巨噬细胞模型、以及喂食致动脉粥样硬化饮食的Ldlr-/-小鼠 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、组织病理学数据 | 人类动脉粥样硬化斑块的scRNA-seq数据（具体数量未明确说明）、Ldlr-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1260 | 2026-01-27 |
DeepDeconUQ estimates malignant cell fraction prediction intervals in bulk RNA-seq tissue
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013133
PMID:40465796
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepDeconUQ的深度神经网络模型，用于基于bulk RNA-seq数据估计恶性细胞分数的预测区间 | DeepDeconUQ首次将不确定性量化整合到恶性细胞分数预测中，利用单细胞RNA测序数据和保形化分位数回归生成可靠的预测区间 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于scRNA-seq数据的质量和可用性 | 开发一种能够量化预测不确定性的恶性细胞分数估计方法，以改进癌症诊断、预后和治疗决策 | 癌症组织中的恶性细胞分数 | 机器学习 | 癌症 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 深度神经网络, 分位数回归神经网络 | 基因表达数据 | 模拟和真实癌症数据集，具体数量未明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |