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当前共找到 10619 篇文献,本页显示第 1221 - 1240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1221 2026-01-04
Spatiotemporal Atlas of Heart Development Reveals Blood-Flow-Dependent Cellular, Structural, Metabolic, and Spatial Remodeling
2025-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过扰动鸡胚胎心脏血流,结合单细胞和空间转录组学,构建了血流依赖的心脏发育时空图谱,揭示了血流力学如何重塑心脏组织的细胞、结构和代谢特征 首次在胚胎心脏发育中系统整合血流力学扰动与高分辨率空间转录组学,揭示了血流依赖的跨尺度(分子、细胞、结构)重塑机制,并识别了LOX表达心肌细胞等新的血流敏感细胞状态 研究基于鸡胚胎模型,其结论在哺乳动物或人类中的普适性需进一步验证;空间转录组分辨率虽高但仍存在技术限制 探究血流力学如何调控胚胎心脏的细胞程序、组织结构和代谢适应,阐明血流依赖的发育重塑机制 鸡胚胎心脏组织 空间转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 空间转录组数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1222 2026-01-04
Riemannian Metric Learning for Alignment of Spatial Multiomics
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为Manifold Gromov-Wasserstein (MGW)的度量学习框架,用于对齐空间多组学数据中的异构模态 MGW框架利用神经场推断模态特定的黎曼度量,并通过Gromov-Wasserstein最优传输对齐这些度量,实现了无需超参数的成本计算,并具有理论不变性 未在摘要中明确提及 开发一种能够对齐空间多组学数据中不同模态的方法 空间多组学数据,包括转录组、表观基因组、蛋白质组和代谢组等 机器学习 结直肠癌、肾癌 空间转录组学、空间代谢组学 神经场 空间多模态数据 数千个细胞 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium NA
1223 2026-01-04
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
研究论文 本文介绍了人类肿瘤图谱网络(HTAN)开发的基于云的基础设施,用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据 引入了两个关键创新:基于来源的HTAN ID表简化了队列构建和跨检测整合;以及将BigQuery的地理空间功能创新性地应用于空间生物学,实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 未明确提及具体的技术或应用限制 开发一个基于云的基础设施,以降低整合和分析大规模、多模态癌症数据的技术和计算障碍 人类肿瘤图谱网络(HTAN)生成的多模态癌症数据,包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 生物信息学 癌症 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 单细胞数据、空间数据、临床数据、图像数据 NA Google 单细胞RNA-seq、空间转录组学 Google BigQuery 基于Google BigQuery的云基础设施,托管于系统生物学研究所癌症云网关(ISB-CGC)
1224 2026-01-04
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文通过小鼠模型和单细胞转录组学,揭示了急性髓系白血病(AML)微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能,导致免疫抑制和感染易感性 首次使用非照射中性粒细胞报告小鼠模型,结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选,系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路影响中性粒细胞成熟和功能,并发现其免疫抑制能力 研究主要基于小鼠模型,虽然患者数据支持类似生物学现象,但人类AML的异质性可能未被完全覆盖,且机制细节如特定细胞因子作用需进一步验证 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响,以解释患者中性粒细胞减少和感染易感性的机制 AML暴露的中性粒细胞(来自小鼠模型和患者样本) 血液肿瘤学 急性髓系白血病 单细胞转录组学,体外细胞因子筛选,染色质重塑分析,基序发现 NA 转录组数据,染色质数据 小鼠模型和患者样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1225 2026-01-04
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal a Tumor-Associated Macrophage Subpopulation that Mediates Prostate Cancer Progression and Metastasis
2025-Jul-02, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光数据,揭示了前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的异质性,并识别出一个与转移相关的SPP1+/TREM2+ TAM亚群 首次整合单细胞和空间转录组学数据,识别出SPP1+/TREM2+ TAM亚群在前列腺癌转移中的关键作用,并验证其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模临床验证;SPP1阻断策略的长期疗效和安全性未充分评估 探究前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用机制 人类前列腺癌患者样本、小鼠前列腺癌模型(RM1模型) 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 人类患者样本和小鼠模型样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1226 2026-01-04
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法,并实现了名为klue的程序 提出了一种基于k-mer伪组装的方法,用于识别单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性变异 NA 开发一种识别基因组序列变异的新方法 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 生物信息学 黑色素瘤 单细胞RNA-seq 彩色de Bruijn图 基因组序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1227 2026-01-04
Microglia depletion reduces human neuronal APOE4-related pathologies in a chimeric Alzheimer's disease model
2025-Jan-02, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过在小鼠海马中移植人类iPSC来源的神经元,并利用小胶质细胞耗竭技术,探讨了小胶质细胞对神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理的影响 首次在嵌合模型中结合神经元APOE基因型和小胶质细胞耗竭,揭示了APOE4与小胶质细胞协同促进Aβ和tau病理形成的机制 研究基于嵌合小鼠模型,可能不完全反映人类AD的复杂环境;样本量未明确说明 探究小胶质细胞在神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理形成中的作用 人类iPSC来源的神经元(APOE4、APOE3和APOE-KO基因型)移植到人类APOE3或APOE4敲入小鼠海马中 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 嵌合小鼠模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1228 2026-01-04
Histopathologic Analysis of Human Kidney Spatial Transcriptomics Data: Toward Precision Pathology
2025-Jan, The American journal of pathology
研究论文 本研究通过形态学方法分析人类肾脏空间转录组学数据,旨在推进精准病理学的发展 首次将基于形态学的分析方法应用于人类肾脏空间转录组学数据,以病理学为基础识别聚类,并成功投影到其他样本中 仅基于单一人类肾脏样本进行建模,未涉及大规模验证或多种疾病状态的比较 探索基于形态学的空间转录组学数据分析方法,以提升对慢性肾脏病病变机制的理解 人类肾脏组织样本,包括健康与疾病状态 数字病理学 慢性肾脏病 空间转录组学 NA 图像与空间转录组学数据 单个人类肾脏样本,并扩展到肾切除或针吸活检样本 NA 空间转录组学 NA NA
1229 2026-01-04
Spatial Transcriptomics: Integrating Morphology and Molecular Mechanisms of Kidney Diseases
2025-Jan, The American journal of pathology
综述 本文综述了空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的应用,整合形态学与分子生物学以提升对组织生物学和疾病机制的理解 整合了空间转录组学技术与肾脏疾病研究,强调了高分辨率空间技术在生命科学中的革命性潜力 NA 探讨空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的科学和潜在医学价值 肾脏疾病 数字病理学 肾脏疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1230 2026-01-04
Differential TGF-β1/SMAD4 Signaling Regulates PMN-MDSC Differentiation and Reshapes the Immune Microenvironment in Breast Cancer
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
研究论文 本研究探讨了TGF-β1/SMAD4信号通路如何调节多形核髓源性抑制细胞的分化并重塑乳腺癌免疫微环境 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析乳腺癌组织中中性粒细胞亚群的异质性,并揭示了TGF-β1在正常与荷瘤小鼠中对PMN-MDSC分化的差异调控作用 需要进一步在临床环境中验证TGF-β1通路作为治疗靶点的疗效 阐明TGF-β1/SMAD4信号通路调控PMN-MDSC分化及调节乳腺癌免疫微环境的机制 乳腺癌组织中的中性粒细胞亚群、4T1小鼠乳腺癌转移模型及脾源性造血干细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 流式细胞术, Western blotting NA 基因表达谱, 图像 使用GSE176078数据集及建立的4T1小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
1231 2026-01-04
Inhibitors of KAT2A Alleviate the Progression of AKI by Alleviating Macrophage Ferritinophagy
2025, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术,揭示了组蛋白乙酰转移酶KAT2A通过调控NCOA4介导的巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING炎症信号通路,促进急性肾损伤(AKI)的进展,并发现KAT2A抑制剂MB-3可减轻AKI的病理变化 首次阐明了KAT2A在AKI中通过调节巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING信号通路的作用机制,并验证了KAT2A抑制剂MB-3的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,人类样本验证有限,且MB-3的长期疗效和安全性尚未在临床中评估 探究KAT2A在急性肾损伤(AKI)进展中的作用机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 小鼠肾脏组织、RAW264.7巨噬细胞系、人类AKI活检样本 单细胞测序与分子病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲低与过表达 NA 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像 未明确样本数量,涉及小鼠模型、细胞系和人类活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1232 2026-01-04
IL-18 receptor axis in allergic conjunctivitis: a multi-omics study
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学策略,揭示了过敏性结膜炎中IL-18受体/IFN-γ轴在NK细胞和T细胞中的作用及其与疾病严重程度的相关性 首次通过整合人类GWAS数据、小鼠单细胞RNA测序和体内验证,系统性地将IL-18受体信号轴与过敏性结膜炎的病理机制和严重程度联系起来,超越了传统的Th2中心模型 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序数据仅来自小鼠模型,未直接应用于人类患者样本 识别过敏性结膜炎相关的候选基因并描绘免疫通路,特别关注可能导致疾病异质性的细胞类型特异性机制 过敏性结膜炎患者(通过GWAS数据)和卵清蛋白诱导的过敏性结膜炎小鼠模型 数字病理学 过敏性结膜炎 GWAS分析(FUSION, MAGMA, UTMOST)、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据 未明确说明具体样本数量,涉及人类GWAS数据和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1233 2026-01-04
Machine learning-derived cellular senescence index for predicting prognosis and drug sensitivity in patients with renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析识别肾透明细胞癌中的衰老细胞,并整合多种机器学习算法构建了一个仅含9个基因的衰老相关评分模型,用于预测患者预后和药物敏感性 结合十种机器学习算法生成101种组合模型,从中筛选出最优的Lasso-StepCox模型,构建了显著少于典型范围(15-30个基因)的最小化基因特征(仅9个基因),并基于此开发了衰老相关评分模型(SRSM) 未明确说明样本量大小,且模型验证主要依赖于内部数据,需要进一步的外部验证 开发一个可量化的衰老相关评分模型,用于肾透明细胞癌患者的预后分层和治疗靶向 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 机器学习 肾细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) plsRcox, Ridge, Enet, CoxBoost, Lasso, StepCox, RSF, SuperPC, GBM, survivalSVM, Lasso-StepCox 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1234 2026-01-04
Single-cell analysis reveals shared adaptive responses across different types of podocyte injury
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了不同肾脏疾病中足细胞损伤的异质性和共享适应性反应 首次整合多种肾脏疾病的单细胞数据,系统比较足细胞损伤机制,并识别出跨疾病的共享适应性反应路径 样本量相对有限,且主要基于转录组数据,功能验证不足 探究不同肾脏疾病中足细胞损伤的分子机制和共享适应性反应 人类肾脏组织中的足细胞及其他肾细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16个样本,共73,684个细胞,来自健康对照和IgA肾病、特发性膜性肾病、急性肾损伤患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1235 2026-01-03
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between ketone body synthesis and morphogenic profile of intestinal epithelia in neonatal mice
2025-Dec-30, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠肠道上皮细胞中酮体合成与细胞形态发生特征之间的关联 首次在新生小鼠肠道上皮细胞中发现酮体合成相关基因的上调与细胞形态发生基因的高表达相关,而非主要作为能量来源,这为理解早期肠道上皮成熟提供了新视角 研究仅针对小鼠模型,且样本年龄范围有限(仅10天和21天),微生物条件的影响可能未完全阐明 探究新生期肠道上皮细胞的成熟特征及其与微生物定植的关系 新生(10天)和幼年(21天)小鼠的肠道上皮细胞 单细胞转录组学 肠道疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 新生和幼年小鼠的肠道上皮细胞(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1236 2026-01-03
Single-cell RNA-seq analysis of longitudinal CD4+ T cell samples reveals cell-type-specific changes during early stages of type 1 diabetes
2025-Dec-29, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了1型糖尿病早期阶段CD4+ T细胞中细胞类型特异性的转录变化和基因调控网络 首次对1型糖尿病早期阶段的CD4+ T细胞进行纵向单细胞转录组分析,识别了与疾病进展相关的细胞类型特异性基因表达模式和调控网络变化 样本量相对较小(N=22),且仅关注CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 探究1型糖尿病早期阶段CD4+ T细胞的转录组变化和基因调控网络,以理解早期免疫失调机制 来自后续发展为1型糖尿病的儿童(N=11)及其匹配对照(N=11)的纵向CD4+ T细胞样本 单细胞转录组学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 73个纵向CD4+ T细胞样本,来自22名儿童(11名病例,11名对照),分析超过99,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1237 2026-01-03
Multi-omics analysis reveals shared diagnostic and therapeutic targets in endometriosis and recurrent implantation failure
2025-Dec-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析,揭示了子宫内膜异位症和反复种植失败在影响子宫内膜容受性方面的共享分子机制 首次利用多组学数据结合加权基因共表达网络分析,识别出子宫内膜异位症和反复种植失败共有的15个枢纽基因,并验证了其高诊断准确性 研究依赖于公共数据库的数据,可能受限于样本异质性和批次效应,且需要进一步的体内外实验验证 阐明影响子宫内膜容受性在子宫内膜异位症和反复种植失败中的共享分子机制 子宫内膜异位症和反复种植失败相关的基因表达数据 生物信息学 子宫内膜异位症 多组学数据分析,加权基因共表达网络分析,单细胞测序,免疫荧光 加权基因共表达网络分析 基因表达数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
1238 2026-01-03
Centromere Protein I, a Cell Cycle Checkpoint Gene, Accelerates Tumor Progression via the Hippo Pathway and Mediates Immune Escape in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后意义,并揭示了CENPI通过Hippo通路促进肿瘤进展及免疫逃逸的机制 首次将CENPI鉴定为肝细胞癌的关键枢纽基因,阐明其通过抑制YAP磷酸化增强核转位驱动恶性进展,并揭示其通过破坏肿瘤抗原呈递和趋化因子介导的CD8+ T细胞趋化作用促进免疫逃逸的新机制 研究主要基于公共数据库和体外实验,临床样本验证和体内机制深度探索有待加强,免疫逃逸机制的具体信号通路细节需进一步阐明 探索细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其促进肿瘤进展的分子机制 肝细胞癌患者数据集、HCC细胞系、动物模型及患者来源的HCC组织标本 肿瘤生物学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学、体外功能实验、动物实验 预后模型(Kaplan-Meier、nomogram、决策曲线分析、ROC分析) 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 来自TCGA和ICGC的HCC数据集、GSE149614单细胞RNA测序数据、患者来源的HCC标本及细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1239 2026-01-03
PDK4 Regulates Inflammatory Injury in Acute-on-chronic Liver Failure by Phosphorylating STAT1-mediated M1 Polarization of Macrophages
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)在慢加急性肝衰竭(ACLF)中通过磷酸化STAT1介导巨噬细胞M1极化来调节炎症损伤的作用机制 首次揭示了PDK4在ACLF中作为关键促炎调节因子,通过激活STAT1信号通路促进巨噬细胞M1极化的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,临床验证尚不充分,且PDK4抑制剂的具体临床应用潜力需进一步评估 探究PDK4在ACLF中的作用机制,以寻找调节巨噬细胞功能、缓解ACLF进展的治疗靶点 健康与ACLF肝组织、ACLF患者外周血单个核细胞、LO2肝细胞、ACLF小鼠模型 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序、转录组学分析、体外实验、体内验证 NA RNA测序数据、转录组数据 来自数据库的单细胞RNA测序数据、ACLF患者外周血单个核细胞转录组数据(GSE168048)、体外细胞实验、ACLF小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1240 2026-01-03
Single-cell analysis identifies inflammatory and tissue remodeling tumor-associated macrophages distinct from M1/M2 paradigm
2025-Dec-26, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文通过整合分析公开的单细胞RNA测序数据,识别了乳腺癌中七种与M1/M2范式不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群,揭示了其功能异质性 首次在单细胞水平上系统识别了乳腺癌中七种转录特征不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群,这些亚群不遵循传统的M1/M2极化分类,并发现了与组织修复和干扰素反应相关的独特功能特征 研究主要基于公开数据集进行生物信息学分析,实验验证部分仅在小规模墨西哥患者队列中进行初步验证,样本代表性可能有限 深入表征乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性,探索其功能亚群与患者预后的关系 乳腺癌患者及健康个体的血液、肿瘤和非肿瘤乳腺组织中的单细胞RNA测序数据 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 生物信息学整合分析 单细胞转录组数据 来自公共数据库的多个乳腺癌患者和健康个体样本,具体数量未明确说明,但包含血液、肿瘤及非肿瘤组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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