单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
1201 2025-03-25
Targeting p53 for immune modulation: Exploring its functions in tumor immunity and inflammation
2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文综述了p53在肿瘤免疫和炎症中的双重作用,探讨其对免疫动态的影响及其在癌症免疫治疗中的潜在应用 详细阐述了p53在免疫调节中的新功能,包括其在免疫原性细胞死亡(ICD)中的作用以及与NF-κB信号通路的相互作用 NA 探讨p53在免疫调节和肿瘤免疫逃逸中的作用,及其在癌症免疫治疗中的潜在应用 p53蛋白及其在免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞、T细胞和B细胞)中的功能 肿瘤免疫学 癌症 单细胞RNA测序、CRISPR筛选 NA NA NA
1202 2025-03-25
Huoxue Tongluo tablet enhances atherosclerosis efferocytosis by promoting the differentiation of Trem2+ macrophages via PPARγ signaling pathway
2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了活血通络片通过PPARγ信号通路促进Trem2+巨噬细胞分化,从而增强动脉粥样硬化中巨噬细胞的胞葬作用 首次揭示了活血通络片对巨噬细胞亚群的调控作用及其促进胞葬活性的机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 评估活血通络片在单细胞水平上治疗动脉粥样硬化的效果和机制 ApoE⁻/⁻小鼠 心血管疾病 动脉粥样硬化 UPLC-MS/MS, 单细胞测序, qPCR, 免疫组化, 流式细胞术, 免疫荧光染色, Western blotting 动物模型 转录组数据, 蛋白质表达数据 ApoE⁻/⁻小鼠(具体数量未明确说明)
1203 2025-03-25
Irreversible electroporation combined with PD-L1/IL-6 dual blockade promotes anti-tumor immunity via cDC2/CD4+T cell axis in MHC-I deficient pancreatic cancer
2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
research paper 研究探讨了不可逆电穿孔(IRE)联合PD-L1/IL-6双阻断如何通过cDC2/CD4+T细胞轴在MHC-I缺陷型胰腺癌中促进抗肿瘤免疫 揭示了IRE疗法后PD-L1阻断激活cDC2-CD4T细胞轴的补偿性抗肿瘤机制,并提出了PD-L1/IL-6双阻断联合消融治疗的新策略 研究主要基于临床样本和小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 探索MHC-I缺陷型胰腺癌的免疫治疗新方法 胰腺导管腺癌(PDAC)患者和小鼠模型 肿瘤免疫学 胰腺癌 scRNA-seq, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 细胞表型数据 临床样本和小鼠模型(具体数量未明确说明)
1204 2025-03-25
UBE2C mediates follicular thyroid carcinoma invasion and metastasis via K29-Specific vimentin ubiquitination
2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了UBE2C通过K29特异性波形蛋白泛素化调控滤泡性甲状腺癌的侵袭和转移 首次发现UBE2C在滤泡性甲状腺癌中的双重功能,即促进细胞增殖同时抑制迁移和侵袭,并通过K29特异性泛素化降解波形蛋白 动物模型中UBE2C敲低导致原发肿瘤减小但促进转移的现象需要进一步机制研究 探究UBE2C在滤泡性甲状腺癌进展中的具体作用机制 滤泡性甲状腺癌(FTC)组织和细胞系 癌症生物学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,动物模型 NA 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 未明确说明样本数量,但包含临床标本和细胞系实验
1205 2025-03-25
Lysozyme modulates inflammatory responses to exacerbate the severity of rheumatoid arthritis
2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究探讨了溶菌酶(LYZ)在类风湿性关节炎(RA)中的作用及其作为早期RA诊断生物标志物或治疗靶点的潜力 首次揭示了LYZ在早期RA患者血浆和滑膜巨噬细胞中的高表达,并通过基因敲除和沉默实验验证了LYZ在RA炎症调控中的作用 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未在更大规模的人类临床样本中验证LYZ的临床应用价值 探索RA的新治疗靶点或生物标志物以改善治疗效果 早期RA患者、CAIA小鼠模型和MH7A细胞 NA 类风湿性关节炎 血浆蛋白质组学、滑膜液单细胞测序分析、RNA-Seq CAIA小鼠模型 蛋白质表达数据、基因表达数据 未明确说明样本数量,涉及早期RA患者、CAIA小鼠和MH7A细胞
1206 2025-03-25
MultiOmics analysis of metabolic dysregulation and immune features in breast cancer
2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过多组学分析乳腺癌中的代谢失调和免疫特征,构建代谢风险模型以预测患者预后 首次综合代谢和免疫因素评估乳腺癌患者预后,并构建代谢风险模型 样本量相对较小(247例),且仅基于TCGA和GEO数据库 评估和预测乳腺癌患者的预后 乳腺癌样本 多组学分析 乳腺癌 GSVA、单细胞测序分析、机器学习算法 代谢风险模型 基因表达数据、临床病理特征数据、免疫浸润数据 247例乳腺癌样本
1207 2025-03-25
Comprehensive pan-cancer single-cell analysis reveals glycolysis-related signatures as predictive biomarkers for immunotherapy response and their role in bladder cancer
2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1
research paper 通过全面的泛癌单细胞分析,揭示了糖酵解相关特征作为免疫治疗反应的预测生物标志物及其在膀胱癌中的作用 发现了一个与免疫治疗反应强烈相关的糖酵解特征(Glycolysis.Sig),并证实其在预后和免疫反应预测中的优异性能 研究主要基于已有数据集的分析,需要进一步实验验证 探究糖酵解在泛癌尤其是膀胱癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系 泛癌及膀胱癌的单细胞和批量RNA测序数据 生物信息学 膀胱癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) NA RNA测序数据 34个单细胞RNA测序队列,8个接受ICI治疗的批量RNA测序队列,以及TCGA泛癌批量RNA测序队列
1208 2025-03-25
A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus
2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1
research paper 研究发现了一组在青少年系统性红斑狼疮中高度激活的CD99- CD72+ B细胞亚群,这些细胞通过表达高水平的TLR7促进自身免疫反应 首次识别并描述了CD72 BCs这一关键过渡细胞群体,其在系统性红斑狼疮中连接了初始B细胞和浆细胞的分化过程 研究主要基于青少年系统性红斑狼疮患者,结果在成人患者中的适用性尚待验证 探究系统性红斑狼疮中自身抗体分泌细胞的起源和分化机制 CD99- CD72+ B细胞亚群 免疫学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(RNA-seq) NA RNA测序数据 未明确说明样本数量,研究对象为青少年系统性红斑狼疮患者
1209 2025-03-25
Integration of Single-Cell and Bulk RNA-seq Data to Identify the Cancer-Associated Fibroblast Subtypes and Risk Model in Glioma
2025-Apr, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 该研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别了胶质瘤中与癌症相关的成纤维细胞亚型,并建立了一个风险模型 结合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,识别了23个预后CAF标记物,并开发了一个新的CRS模型,包括PCOLCE、TIMP1和CLIC1 研究依赖于公开数据集,可能受到数据质量和样本选择的限制 识别胶质瘤中癌症相关成纤维细胞的亚型,并开发预后风险模型 胶质瘤患者和癌症相关成纤维细胞(CAFs) 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq、RT-qPCR LASSO回归模型 RNA-seq数据 1333个胶质瘤样本(来自TCGA和CGGA数据集)
1210 2025-03-25
Single-Cell Analysis Reveals Histone Deacetylation Factor Guide Intercellular Communication of Tumor Microenvironment that Contribute to Colorectal Cancer Progression and Immunotherapy
2025-Apr, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 通过单细胞RNA-seq数据分析组蛋白去乙酰化因子(HDF)在结直肠癌(CRC)肿瘤微环境(TME)中的作用及其对免疫治疗的影响 首次在单细胞水平揭示HDF相关基因对CRC肿瘤微环境的调控机制,并开发了HDF-TME评分系统用于预测患者预后和免疫治疗效益 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏实验验证 探究HDF在CRC肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 结直肠癌肿瘤微环境中的基质细胞、巨噬细胞、T淋巴细胞和B淋巴细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 公共数据库中的CRC组织转录组和免疫治疗队列数据
1211 2025-03-25
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 该研究利用单细胞和空间转录组学技术,揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维响应 首次构建了水稻叶片的单细胞转录组图谱,揭示了细胞特异性和多维度的免疫响应机制 NA 研究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制 水稻叶片细胞和稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae) 植物病理学 稻瘟病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 236,708个单细胞转录组
1212 2025-03-25
Exosomal PKM2: A Noninvasive Diagnostic Marker Linking Macrophage Metabolic Reprogramming to Gastric Cancer Pathogenesis
2025-Mar-24, Cancer science IF:4.5Q1
research paper 该研究探讨了血浆外泌体PKM2作为胃癌诊断标志物的潜力及其在肿瘤微环境中通过调控巨噬细胞代谢重编程促进胃癌发展的机制 首次揭示外泌体PKM2通过抑制SCAP多聚泛素化激活SREBP1相关脂质合成通路促进胃癌发展的分子机制 样本量相对有限(216例),且机制研究主要在细胞水平进行 探究外泌体PKM2在胃癌诊断和发病机制中的作用 胃癌患者和健康供体的血浆样本(216例)及肿瘤相关巨噬细胞 肿瘤生物学 胃癌 单细胞转录组测序、Kaplan-Meier分析 NA 血液样本、单细胞转录组数据 216例血液样本(胃癌患者和健康对照)
1213 2025-03-25
Time, the final frontier
2025-Mar-24, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本文主张将时间动态整合到癌症研究中,强调从传统的终点实验向数据驱动的连续方法的根本转变 提出将时间动态整合到癌症研究中,开发先进的活体成像技术、创新的时间组学方法和新型计算工具 未提及具体的技术实施细节或实验验证结果 探索肿瘤的时间动态变化,以更全面地理解肿瘤的异质性和进化 肿瘤及其微环境 数字病理学 癌症 活体成像技术、时间组学方法 NA 时间序列数据 NA
1214 2025-03-25
Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究通过靶向胶原重塑细胞外基质(ECM)来增强卵巢癌化疗敏感性的策略 发现Halofuginone(HF)通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生,破坏胶原沉积并促进CD8+ T细胞浸润,从而增强化疗敏感性 NA 探索靶向ECM重塑以增强卵巢癌化疗敏感性的策略 卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和细胞外基质(ECM) 癌症研究 卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA
1215 2025-03-25
Single-Cell Analysis Clarifies Pathological Heterogeneity in Tenosynovial Giant Cell Tumor and Identifies Biomarkers for Predicting Disease Recurrence
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过单细胞RNA测序技术分析弥漫型和局限型腱鞘巨细胞瘤的转录差异,揭示疾病复发预测的生物标志物 发现D-TGCT中独特的肿瘤细胞簇及其通过COL6A3-(ITGAV+ITGB8)相互作用调控成纤维细胞分化的机制,并鉴定出预测疾病复发的生物标志物ROR1和PRKD1 NA 阐明弥漫型腱鞘巨细胞瘤的侵袭性行为机制并寻找疾病复发预测标志物 人类弥漫型(D-TGCT)和局限型(L-TGCT)腱鞘巨细胞瘤病变组织 单细胞组学 腱鞘巨细胞瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA
1216 2025-03-25
eNAMPT Is a Novel DAMP and Therapeutic Target in Human and Murine Pulmonary Fibrosis
2025-Mar-24, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
research paper 该研究探讨了eNAMPT作为人类和临床前IPF治疗靶点的潜力,并评估了ALT-100单克隆抗体的治疗效果 首次将eNAMPT鉴定为肺纤维化的新型DAMP和治疗靶点,并展示了ALT-100单抗的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的临床试验验证 探索eNAMPT在肺纤维化中的作用并评估其作为治疗靶点的潜力 IPF患者和小鼠模型 NA 肺纤维化 bulk和单细胞RNA测序 NA 血液、PBMCs、肺组织样本 IPF患者样本和C57Bl6小鼠模型
1217 2025-03-25
Endothelial-like cancer-associated fibroblasts facilitate pancreatic cancer metastasis via vasculogenic mimicry and paracrine signalling
2025-Mar-23, Gut IF:23.0Q1
research paper 该研究识别了一种新型的前肿瘤性癌症相关成纤维细胞(CAF)亚型,该亚型通过血管生成拟态和旁分泌信号促进胰腺癌转移 发现FAPα+CD144+内皮样CAFs(endoCAFs)并通过CD144-β-catenin-STAT3信号轴阐明其促进转移的机制,开发了靶向siRNA递送纳米系统 未明确说明样本量大小,且机制研究主要在动物模型中进行 鉴定胰腺导管腺癌(PDAC)中具有血管生成拟态功能的新型CAF亚型并探索其促转移机制 胰腺导管腺癌(PDAC)微环境中的FAPα+CD144+内皮样CAFs 肿瘤微环境 胰腺癌 单细胞RNA测序、mIHC、细胞因子阵列分析、RNA测序、IP-质谱、ChIP和荧光素酶分析 KPC小鼠模型(LSL-KrasG12D/+, LSL-Trp53R172H/+和Pdx1-Cre) 基因表达数据、蛋白质数据 NA
1218 2025-03-25
Mapping molecular landscapes in triple-negative breast cancer: insights from spatial transcriptomics
2025-Mar-22, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
review 本文综述了空间转录组学在三阴性乳腺癌肿瘤微环境研究中的应用及其在精准医学中的潜力 利用空间转录组学技术揭示三阴性乳腺癌的肿瘤微环境异质性,识别空间生物标志物,并预测免疫治疗反应 需要进一步发展空间转录组学技术、计算工具和多中心合作以促进其临床应用 探讨空间转录组学在三阴性乳腺癌研究中的应用及其对精准医学的贡献 三阴性乳腺癌的肿瘤微环境 digital pathology breast cancer spatial transcriptomics AI-based spatial analysis transcriptomic data NA
1219 2025-03-25
Constructing a disease-specific ceRNA coregulatory network for keratoconus diagnosis and landscape of the immune environment
2025-Mar-22, International ophthalmology IF:1.4Q3
研究论文 本研究通过构建圆锥角膜(KC)特异的ceRNA共调控网络和免疫环境图谱,旨在发现早期诊断的生物标志物并揭示其分子机制 首次构建KC特异的PPI和ceRNA网络,开发了基于ElasticNet算法的诊断模型,并揭示了KC患者独特的免疫微环境特征 研究基于公共数据库的转录组数据,需要进一步实验验证 确定圆锥角膜的潜在疾病特异性基因生物标志物并解析其免疫环境 圆锥角膜患者与对照组的转录组数据 生物信息学 圆锥角膜 转录组分析,单细胞测序分析 ElasticNet算法 RNA-seq数据 来自GEO和ArrayExpress数据库的圆锥角膜患者与对照组样本
1220 2025-03-25
Immunosuppressive JAG2+ tumor-associated neutrophils hamper PD-1 blockade response in ovarian cancer by mediating the differentiation of effector regulatory T cells
2025-Mar-22, Cancer communications (London, England)
research paper 该研究揭示了JAG2+肿瘤相关中性粒细胞(TANs)在高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中通过介导效应调节性T细胞(eTregs)的分化来阻碍PD-1阻断反应的机制 首次阐明了JAG2+ TANs通过Notch信号通路促进eTregs分化,从而导致免疫逃避和抗PD-1治疗抵抗的具体机制 研究主要基于HGSOC样本,其他类型卵巢癌或实体瘤的适用性需要进一步验证 阐明JAG2+ TANs在HGSOC肿瘤免疫抑制微环境中的作用机制 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者样本和肿瘤相关中性粒细胞 肿瘤免疫学 卵巢癌 多重免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外共培养系统、肿瘤移植小鼠模型 患者来源肿瘤类器官(PDTOs)模型和异种移植模型 临床样本数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 304例HGSOC样本(274例构成两个独立队列,30例用于建立PDTOs)
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