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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-07-04 |
Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms
2025-07-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001175
PMID:40265506
|
综述 | 本文综述了免疫检查点抑制剂相关性肺炎的诊断、危险因素和治疗策略，特别强调了其潜在的病理生理机制 | 重点介绍了支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序和自身抗体等生物标志物的最新进展，揭示了细胞介导和体液机制在ICI相关性肺炎病理生理中的共同作用 | 信息未明确提供 | 提供免疫检查点抑制剂相关性肺炎诊断、风险因素和治疗策略的最新概述，特别关注其病理生理学 | 免疫检查点抑制剂相关性肺炎患者 | 医学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序 |
| 102 | 2026-07-04 |
Identifying condition-related cell-cell communication events using supervised tensor analysis
2025-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571918
PMID:38168391
|
研究论文 | 提出一种基于监督张量分析的细胞间通讯事件识别方法STACCato | 首次采用张量回归模型识别与生物学条件相关的细胞间通讯事件，同时调整混杂因素并考虑事件间的依赖性 | 未提及具体局限性 | 开发能够清晰解释细胞间通讯事件与生物学条件关系并调整混杂因素的分析工具 | 单细胞RNA测序数据中的细胞间通讯事件 | 机器学习 | 自身免疫疾病, 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 张量回归模型 | 单细胞基因表达数据 | 系统性红斑狼疮和自闭症的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-07-04 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-06-16, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
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综述 | 本文综述了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性，包括内皮-间质转化等过程的机制及治疗前景 | 系统阐述了内皮细胞多种表型转变（EndMT、EndHT、EndOT、EndICLT）及其在心血管疾病中的作用，并总结了基于单细胞RNA测序技术的新见解和潜在治疗策略 | 未涉及具体临床验证数据，部分机制和治疗的临床转化仍需进一步研究 | 探讨内皮细胞表型可塑性在心血管生理和疾病中的机制及治疗潜力 | 内皮细胞及其表型转变过程 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序技术用于分析内皮细胞异质性 |
| 104 | 2026-07-04 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656712
PMID:40501607
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对紧急髓系造血进行定量分子图谱分析，揭示造血激活的保守模块 | 开发了通用化细胞注释方法HemaScribe和精炼的造血分化定量模型HemaScape，并揭示多种紧急髓系造血诱导策略及共享与独特的转录响应模块 | NA | 阐明不同紧急髓系造血诱导物如何通过共享或独特的分子机制调控造血干细胞和祖细胞 | 造血干细胞和祖细胞（HSPC） | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多项紧急髓系造血模式样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-07-04 |
Tumor-colonizing Pseudoalteromonas elyakovii metabolically reprograms the tumor microenvironment and promotes breast ductal carcinoma
2025-05-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03873-24
PMID:40192290
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研究论文 | 研究肿瘤定殖的Pseudoalteromonas elyakovii通过代谢重编程肿瘤微环境促进乳腺导管癌的机制 | 首次在物种水平上揭示乳腺导管癌内微生物动态变化，并结合双免疫荧光、SweAMI探针杂交和单细胞RNA测序深入分析瘤内微生物与肿瘤免疫的关系 | 研究样本量为102例，相对较小，且仅关注乳腺导管癌，可能限制结论的普适性 | 探究瘤内微生物群在乳腺癌发展和进展中的作用及其潜在的临床应用价值 | 乳腺导管癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织中的微生物组成和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qRT-PCR, 双免疫荧光染色, SweAMI探针杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据, 免疫荧光图像 | 102份乳腺导管癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 106 | 2026-07-04 |
Single-cell sequencing in diabetic retinopathy: progress and prospects
2025-Jan-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06066-x
PMID:39806376
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综述 | 综述单细胞测序在糖尿病视网膜病变研究中的进展与前景 | 全面总结了单细胞测序及其多组学、空间转录组技术解析视网膜异质性及病理机制的最新应用 | 未提供具体实验数据及定量比较分析，主要集中在技术潜力的讨论上 | 探讨单细胞测序技术如何促进对糖尿病视网膜病变发病机制的理解及新治疗策略的开发 | 糖尿病视网膜病变的视网膜细胞、视网膜类器官及单细胞外囊泡 | 数字病理学， 单细胞组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序， 单细胞多组学测序， 立体测序 | NA | 转录组数据， 多组学数据， 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq， 单细胞多组学， 空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2026-07-04 |
Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409913
PMID:39498880
|
研究论文 | 利用负载全肿瘤抗原的纳米颗粒检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞，以预测免疫治疗效果 | 提出一种基于纳米颗粒负载全细胞肿瘤抗原的方法，可高效激活并检测泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞，将ETASTs与其他T细胞的差异转化为激活与非激活状态，并通过测量激活状态和细胞毒性功能标志物进行区分 | NA | 开发一种高效、非侵入性的生物标志物，用于预测肺癌及其他癌症的免疫治疗效果 | 肺癌患者、健康个体及良性肺结节患者血液中的效应肿瘤抗原特异性T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 纳米颗粒负载全肿瘤抗原、单细胞测序 | NA | 生物标志物数据 | 肺癌患者、健康个体及良性肺结节患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-07-04 |
Deficiency of FABP7 Triggers Premature Neural Differentiation in Idiopathic Normocephalic Autism Organoids
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406849
PMID:39556706
|
研究论文 | 通过正常头围自闭症患者类器官模型，发现FABP7缺乏引发神经干细胞过早分化，并揭示FABP7/MEK通路在自闭症发病中的作用 | 首次在正常头围自闭症患者的脑类器官模型中鉴定出FABP7表达下调及其通过MEK通路调控神经干细胞过早分化的分子机制 | 主要基于体外类器官模型和动物实验，需要进一步在人体组织中验证FABP7/MEK通路的临床相关性 | 探究正常头围自闭症患者神经干细胞异常分化的分子机制 | 来自前瞻性出生队列的正常头围自闭症患者诱导多能干细胞来源的脑类器官 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织形态学数据 | 多个细胞系和时间序列样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒进行scRNA-seq |
| 109 | 2026-07-04 |
Spatial differences in gene expression across the dorsal raphe nucleus in a model of early Alzheimer's disease
2025-01, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241299119
PMID:39584353
|
研究论文 | 利用空间基因表达技术研究早期阿尔茨海默病模型中背侧缝核的基因表达差异 | 首次在早期阿尔茨海默病的小鼠模型中应用空间转录组学技术，发现背侧缝核内不同亚区域对tau蛋白病理性损害的差异性易感，并鉴定了相关长链非编码RNA Map2k3os的可能调控作用 | 需要进一步研究Map2k3os的相互作用机制，并强调汇聚数据验证以克服空间转录组学技术的局限性 | 识别5-羟色胺神经元对阿尔茨海默病病理性损害的易感或抵抗的潜在遗传因素 | 过表达人tau蛋白的htau小鼠的背侧缝核 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、RNAscope、免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像 | htau小鼠（早期阿尔茨海默病临床前模型）的背侧缝核组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间基因表达平台 |
| 110 | 2026-07-03 |
Beyond FoxP3-Identification of a Chicken Regulatory T Cell Signature
2025-12, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70106
PMID:41416935
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析鸡脾细胞中的CD4+亚群，定义了一种新的鸡调节性T细胞标志组合 | 首次描述了鸡特异性CTLA-4抗体，该抗体仅能在细胞内区室中染色CTLA-4，与哺乳动物中的定位方式不同 | CTLA-4的细胞内表达限制了其在功能实验中的可用性 | 定义可靠标志物以鉴定和表征鸡调节性T细胞 | 鸡脾细胞中的CD4+ T细胞亚群 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-07-03 |
Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development
2025-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251336191
PMID:40454459
|
研究论文 | 研究Wnt1信号对颅面骨和牙齿发育的不同影响 | 揭示了Wnt1在颅面骨和牙齿发育中的差异性作用，特别是基于骨起源的差异，并通过体内外实验证明了Wnt1对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制 | 主要基于小鼠模型，且长期胚胎诱导导致出生后死亡，限制了部分表型观察 | 探究Wnt1信号在颅面骨和牙齿发育中的具体作用和机制 | 小鼠门齿中的颅面骨和牙齿组织 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、批量RNA测序、微计算机断层扫描 | 转基因小鼠模型 | 单细胞测序数据、基因表达数据、三维影像数据 | 公开的小鼠门齿单细胞测序数据及转基因小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-07-03 |
Single-Cell Atlas of Immune Microenvironment in Orthodontic Tooth Movement
2025-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251334583
PMID:40569824
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析正畸牙齿移动过程中的免疫微环境 | 首次在单细胞水平上全面描绘正畸牙齿移动过程中的免疫景观，揭示免疫细胞动态变化、功能及细胞间相互作用 | 研究仅基于小鼠模型，需进一步在人体中验证；未分析其他免疫细胞与基质细胞的相互作用 | 更全面地揭示正畸牙齿移动过程中的免疫微环境动态变化及细胞互作机制 | 正畸牙齿移动小鼠的牙周组织免疫细胞 | 单细胞组学 | 无特定疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-07-03 |
Dual oxic-anoxic co-culture enables direct study of anaerobe-host interactions at the airway epithelial interface
2025-05-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01338-24
PMID:40366160
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研究论文 | 描述了一种双有氧-无氧共培养方法，用于直接研究厌氧菌与气道上皮细胞在转录水平上的相互作用 | 提出双有氧-无氧共培养方法，能够同时维持厌氧菌和宿主细胞的活性，从而克服实验模型中厌氧菌和宿主细胞对氧气需求冲突的限制 | 共培养时间限于约48小时，且主要聚焦于单一厌氧菌模型，可能限制了长期相互作用和其他厌氧菌种类的普适性 | 研究厌氧菌与气道上皮细胞在疾病中的相互作用机制 | 厌氧菌（如具核梭杆菌）和气道气道上皮细胞 | 数字病理学 | 气道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-07-03 |
The trabecular and compact myocardium of adult vertebrate ventricles are transcriptionally similar despite morphological differences
2025-03, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15296
PMID:39934982
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研究论文 | 揭示了成年脊椎动物心室中致密心肌和小梁心肌在转录组水平上的相似性，尽管形态存在差异 | 通过空间转录组学和多物种转录组比较，首次系统证明成年心脏中致密层与小梁层心肌的转录组高度相似，挑战了传统认为致密心肌具有内在独特性的观点 | 未明确说明，但可能包括样本量有限、无法完全排除细微差异以及功能验证不足 | 研究脊椎动物心室致密心肌与小梁心肌在转录水平上是否存在根本差异 | 成年小鼠、人类胚胎、成年斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎和成年心脏样本，人类胚胎心脏数据，以及成年斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心脏样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术用于小鼠胚胎心脏；单细胞转录组数据来自人类胚胎 |
| 115 | 2026-07-03 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1710915
PMID:41601694
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研究论文 | 整合单细胞和批量转录组分析揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享致病机制及预后生物标志物 | 通过整合单细胞与批量RNA测序数据，首次系统揭示乳腺癌和甲状腺癌共享的分子机制，并构建了基于101种机器学习算法的预后模型，发现SMR3B作为共享预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析，功能性验证仅在细胞水平进行，缺乏临床样本和体内实验的进一步验证 | 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制，并鉴定共同的预后生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌和甲状腺癌的共享分子特征及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌, 甲状腺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-07-02 |
Neoadjuvant therapy-associated malignant phenotype score predicts prognosis and highlights the roles of MIF signaling and DUXAP8 in ESCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1683349
PMID:41613113
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据，建立新辅助治疗相关的恶性表型评分，预测食管鳞癌预后并揭示MIF信号通路和DUXAP8的作用 | 首次构建基于恶性上皮细胞转录重塑的新辅助治疗相关恶性表型评分，并整合单细胞和批量转录组数据，识别了MIF信号通路和长链非编码RNA DUXAP8作为潜在治疗靶点 | 未提及明确的局限性，但可能包括样本量有限、缺乏独立外部验证队列以及功能验证仅针对单一基因DUXAP8 | 开发基于恶性细胞内在分子特征的预后评分，并探索与新辅助治疗反应相关的分子机制，以改善食管鳞癌患者的预后分层和个体化治疗决策 | 食管鳞癌患者在术前行新辅助治疗前后的恶性上皮细胞 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、LASSO-Cox回归、免疫组织化学、qRT-PCR | LASSO-Cox回归模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 单细胞RNA测序数据（ESCC患者治疗前后）、TCGA和GEO队列的批量RNA-seq数据，以及TCGA-ESCA和GSE53624队列用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-07-02 |
TIMP1 as a context-dependent biomarker linking cancer progression and cardiovascular disorders: a multi-level and bioinformatics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699962
PMID:41613136
|
研究论文 | 通过多层级生物信息学分析，揭示TIMP1作为连接癌症进展与心血管疾病的上下文依赖性生物标志物的作用 | 首次系统性地跨疾病分析TIMP1在多种癌症与心血管疾病中的表达模式、调控机制及功能差异，发现其作为连接肿瘤生物学与心血管疾病的潜在中介分子 | 主要基于公开数据库的生物信息学分析，细胞系实验仅用于靶向验证，缺乏体内动物模型和临床试验验证 | 探究TIMP1在癌症与心血管疾病中的系统性表达模式及其作为跨疾病生物标志物的潜力 | 结直肠癌、胃癌、动脉粥样硬化、心力衰竭等疾病的组织样本及细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌, 胃癌, 动脉粥样硬化, 心力衰竭 | 微阵列分析, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学, Western blotting, Transwell实验 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库多队列数据，包括TCGA/GTEx及GEO数据集（如GSE63032, GSE100927, GSE5406），具体样本量未明确 | Illumina | 微阵列, 单细胞RNA-seq | Illumina微阵列, 单细胞测序平台（未具体说明） | 基于公开数据集的分析，平台细节未完全提供 |
| 118 | 2026-07-02 |
Integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics reveal the fibrosis-related genes in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659404
PMID:41613122
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学揭示肝细胞癌中纤维化相关基因 | 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq多组学数据，系统鉴定肝细胞癌肿瘤微环境中纤维化相关的预后基因，并通过细胞实验验证YIPF4基因促进肝癌细胞增殖和迁移的功能 | NA | 鉴定肝细胞癌肿瘤微环境中与纤维化相关的预后基因，为临床治疗决策提供依据 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及单细胞、空间转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序、随机生存森林算法、EDU掺入实验、Transwell迁移实验、CCK-8增殖实验 | 随机生存森林 | 基因表达数据、空间转录组数据 | GSE149614和GSE245908数据集中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-07-02 |
Multimodal analysis of TAAD pathogenesis: SHAP-enhanced interpretable models and single-cell sequencing analysis reveal immune microenvironment alterations
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1630404
PMID:41613150
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研究论文 | 通过整合多组学转录组数据和单细胞测序数据，结合SHAP可解释性机器学习模型，揭示了Stanford A型主动脉夹层（TAAD）的免疫微环境改变和发病机制 | 首次利用SHAP增强的可解释机器学习模型结合单细胞测序技术，系统鉴定出SIX4、SCNN1B和PCDH11X三个关键调控基因，并明确SIX4在血管平滑肌细胞表型转换和免疫信号调控中的核心作用 | 未明确说明，但可能包括样本量有限、功能验证仅在体外进行、缺乏体内实验验证等 | 阐明Stanford A型主动脉夹层的分子机制并识别可靠的生物标志物 | Stanford A型主动脉夹层患者样本及健康对照 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 整合了4个转录组数据集和2个单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-07-02 |
Decoding cellular stress states for toxicology using single-cell transcriptomics
2025, NAM journal
DOI:10.1016/j.namjnl.2025.100046
PMID:42369397
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研究论文 | 利用单细胞转录组学技术分析化学物质诱导的细胞应激状态，揭示毒性反应中的动态细胞转变 | 首次将单细胞转录组技术应用于环境毒理学领域，系统解析了多种应激反应通路在单细胞水平的异质性响应模式，并发现细胞在稳态、适应性反应和终末状态间动态转变的证据 | 仅使用HepaRG细胞系，未涉及原代细胞或体内模型；仅检测24小时单一时间点，无法捕捉长期或动态响应；化学物质浓度范围有限，可能遗漏低剂量效应 | 评估单细胞转录组学在毒理学中解码细胞应激状态的能力，揭示化学物质诱导的细胞适应性与终末状态转变机制 | HepaRG细胞系暴露于依托泊苷、布雷菲德菌素A、放线菌酮、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达矩阵 | 约40,000个HepaRG细胞，暴露于7种化学物质，每种化学物质3个浓度梯度 | BioSpyder | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC® | TempO-LINC®单细胞转录组平台 |