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当前共找到 10620 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 101 | 2026-03-21 |
Bile acids engage the SIPR-STAT3 signaling axis to modulate regulatory T cell responses in fibrosing cholangiopathies
2025-Nov, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.05.032
PMID:40545044
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研究论文 | 本研究探讨了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴调节调节性T细胞（Treg）在纤维化胆管病中的应答，揭示了其抑制Treg功能并促进Th17样表型的机制 | 首次在单细胞水平上揭示了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴抑制Treg功能并促进其向Th17样表型极化的机制，并提出了通过IBAT抑制剂恢复Treg功能的新治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，虽然验证了部分人类样本，但临床转化仍需进一步临床试验验证 | 阐明胆汁酸在纤维化胆管病中如何调节调节性T细胞（Treg）的应答机制 | 小鼠模型（包括硬化性胆管炎模型和Abcb4-/-模型）以及130例胆道闭锁婴儿的肝组织样本 | 单细胞组学 | 纤维化胆管病（包括胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq），功能验证实验 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据，临床肝组织样本数据 | 多个小鼠模型及130例胆道闭锁婴儿肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptional landscape of liver transplant rejection reveals tissue persistence of clonally expanded, treatment-resistant T cells
2025-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2025.08.004
PMID:40812614
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库分析，揭示了肝移植排斥中克隆扩增、治疗抵抗性T细胞的转录景观及其在组织中的持久性 | 首次在儿科肝移植排斥中，利用单细胞技术全面描绘了CD8 T细胞的克隆扩增、基因表达、空间定位及其在组织中的持久性，并揭示了库普弗细胞与CD8 T细胞间的差异互作机制 | 样本量相对较小（30例冷冻肝活检），且仅针对儿科患者，可能限制了结果的普遍性 | 探究肝移植后T细胞介导的排斥反应中CD8 T细胞的克隆扩增、持久性及分子机制 | 儿科肝移植患者的冷冻肝活检样本（包括排斥和非排斥状态） | 数字病理学 | 肝移植排斥 | 单细胞RNA测序，免疫组库分析 | MultiNicheNet分析 | 单细胞转录组数据，免疫组库数据 | 30例冷冻肝活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-03-21 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Oct, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00022-2025
PMID:40675771
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了特发性肺纤维化中PAK激酶作为治疗靶点，特别是在成纤维细胞灶和致密纤维化区域 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学，识别出在成纤维细胞灶和致密纤维化区域富集的新型肌成纤维细胞群，并发现PAK2激酶在这些区域的激活，为IPF提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本的验证可能有限，且PAK抑制剂在人体中的长期疗效和安全性需进一步评估 | 探究特发性肺纤维化中成纤维细胞灶和致密纤维化的细胞异质性及分子机制，以识别治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本、IPF来源的成纤维细胞以及博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类IPF肺组织样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2026-03-21 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Unique Macrophage Population in a Mouse Model of Ozone-induced Asthma Exacerbation
2025-Oct, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0358OC
PMID:40106801
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在小鼠臭氧诱导哮喘加重模型中识别了一个独特的巨噬细胞群体 | 首次通过单细胞RNA测序揭示臭氧暴露后肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群的独特转录特征，并发现这些细胞在哮喘加重中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类哮喘患者 | 探究臭氧吸入诱发哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 小鼠肺部免疫细胞，特别是肺泡巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 暴露于尘螨、豚草、臭氧或组合处理的小鼠肺部细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-03-21 |
Gastric cancer adapts high lipid microenvironment via suppressing PPARG-FABP1 axis after arriving in the lymph node
2025-09, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103759
PMID:40694956
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌细胞在淋巴结转移过程中通过抑制PPARG-FABP1轴适应高脂微环境的机制 | 揭示了胃癌细胞在淋巴结转移中通过下调PPARγ-FABP1轴来适应高脂微环境并避免铁死亡的新机制 | NA | 研究胃癌细胞在淋巴结转移过程中的代谢适应，特别是脂质代谢重编程 | 胃癌细胞 | 肿瘤代谢 | 胃癌 | 非靶向脂质组学测序、肿瘤细胞流式分选、RNA测序、单细胞测序、透射电子显微镜、BODIPY 581/591染色、ChIP-qPCR | NA | 测序数据、显微镜图像、染色数据 | NA | NA | 单细胞测序、RNA测序、脂质组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-03-21 |
Multi-Omics Integrated Analysis of the Protective Effect of Tertiary Lymphoid Structures and Associated Key Regulatory Genes in Human Gallbladder Cancer
2025-09, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70037
PMID:40997892
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析探讨了三级淋巴结构（TLSs）在人类胆囊癌中的保护作用及其相关关键调控基因 | 首次在胆囊癌中系统评估TLS与预后的关联，并利用单细胞RNA测序、批量RNA测序和深度学习筛选出六个TLS相关候选基因，通过实验验证了CTSG和HSPB8在免疫调节中的作用 | 样本量相对较小（85例患者），且研究主要基于回顾性分析，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究TLS在胆囊癌中的预后价值及其相关基因的调控机制 | 胆囊癌患者组织样本及相关基因 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 深度学习 | 深度学习 | RNA测序数据 | 85例胆囊癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-03-21 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells in Patients With Single Ventricle/Hypoplastic Left Heart Syndrome
2025-08, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70030
PMID:40831036
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了单心室/左心发育不全综合征患者外周血单个核细胞的转录组特征，揭示了疾病对不同细胞类型的差异影响 | 首次在SV/HLHS患者中应用单细胞RNA测序技术，系统性地揭示了PBMCs中不同细胞类型的转录组变化，并强调了MYC和IFN-γ活性的精确调控在疾病中的新见解 | 样本量相对较小（33名患者和33名对照），且仅关注了PBMCs，未涉及其他组织或器官的免疫细胞变化 | 探究SV/HLHS患者外周血单个核细胞的转录组特征，以理解疾病对免疫系统的影响 | 33名儿科SV/HLHS患者（10名女性和23名男性）的外周血单个核细胞，并与33名无心脏病的对照进行比较 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 66名参与者（33名SV/HLHS患者和33名对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-03-21 |
Emergence of regulatory and matrix-producing stromal cells during adipogenic induction in human ceiling culture-derived preadipocytes
2025-07-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152012
PMID:40409116
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和表观遗传分析，探索了人类天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了ccdPAs对脂肪生成诱导的响应，并发现ATOH8转录因子在ccdPAs中表达显著高于ASCs，且其表观遗传状态支持这一差异 | 研究仅关注早期转录组变化，未涉及长期分化过程或功能验证 | 探究人类天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导下的细胞异质性和转录调控机制 | 人类天花板培养来源的前脂肪细胞和脂肪来源的干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 表观遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-03-21 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程，专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据，以提高RNA生物标志物和细胞间通讯研究的准确性和鲁棒性 | EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法，通过有效利用比对分数和局部读取覆盖度，在单碱基分辨率上显著改进了多映射读取分配，特别针对片段化和低丰度的EV RNA；此外，它首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析，这是现有工具不具备的功能 | NA | 开发一个标准化的计算工作流程，以应对EV RNA测序中由于低丰度、片段化、组织来源广泛以及共分离材料污染带来的分析挑战 | 细胞外囊泡RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 总RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2026-03-21 |
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00296.2024
PMID:39772753
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综述 | 本文探讨了肺内皮细胞在健康和肺血管疾病中的异质性，重点关注单细胞RNA测序技术带来的新见解 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了肺内皮细胞的新型亚群（如肺泡毛细血管内皮细胞和通用毛细血管内皮细胞）及其在肺动脉高压发病机制中的新通路和机制 | 作为一篇小型综述，可能未涵盖所有最新研究或技术细节，且依赖于现有文献的总结 | 综述肺内皮细胞异质性在肺血管疾病（特别是肺动脉高压）中的作用及研究进展 | 肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 111 | 2026-03-21 |
Integrated Single-Cell Transcriptome and eQTL Analyses Reveal the Role of PZP in Aging and Chronic Kidney Disease
2025-03, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70015
PMID:40058366
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和eQTL分析，揭示了PZP蛋白在衰老和慢性肾病（CKD）相互作用中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序、eQTL和孟德尔随机化分析，系统揭示了CD8+中央记忆T细胞及其关键基因PZP在连接衰老与CKD中的遗传和免疫机制 | 样本来源仅限于外周血，未直接分析肾脏组织；样本量相对有限；机制验证主要在关联分析层面，需要进一步的功能实验证实 | 探索衰老与慢性肾病（CKD）相互作用的遗传和免疫机制，并寻找潜在生物标志物和治疗靶点 | 年轻对照个体、老年个体以及慢性肾病（CKD）患者的外周血样本 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 临床指标数据 | 年轻对照、老年个体和CKD患者的外周血样本（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-03-21 |
Gut microbial production of lithocholic acid reprograms pro-resolutive macrophages to enhance vedolizumab responsiveness via the TGR5/FXR-NF-κB axis
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrag028
PMID:41697021
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物石胆酸通过TGR5/FXR-NF-κB轴重编程巨噬细胞为促消退表型，从而增强克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应性的机制 | 首次阐明肠道微生物来源的石胆酸通过调控巨噬细胞表型转换来增强维多珠单抗疗效的分子机制，并发现TGR5/FXR-NF-κB轴在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于人源化小鼠模型，临床验证尚需进一步开展；机制研究多依赖体外实验，体内复杂微环境的影响需更深入探索 | 探究克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应差异的机制，寻找预测治疗反应的生物标志物 | 克罗恩病患者肠道微生物代谢物、肠道巨噬细胞、人源化小鼠结肠炎模型 | 微生物组学与免疫学 | 克罗恩病 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞RNA测序、转录组分析、粪便微生物移植 | 人源化小鼠模型 | 基因组数据、代谢组数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及临床供体粪便样本和人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-03-21 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用与进展 | 系统阐述了单细胞转录组学如何超越传统批量分析的限制，揭示肺动脉高压中复杂的细胞生态系统、细胞间相互作用和亚型转变，为发现新的治疗靶点和生物标志物提供了前所未有的精细视角 | 面临单细胞RNA测序分辨率需进一步提高、人体组织样本处理存在技术障碍、以及需要整合多种组学方法以全面理解疾病分子机制等挑战 | 探讨单细胞组学技术在理解肺动脉高压复杂病理机制和推动精准医疗发展中的作用 | 肺动脉高压患者的肺组织细胞，特别是内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-03-21 |
CellChat for systematic analysis of cell-cell communication from single-cell transcriptomics
2025-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01045-4
PMID:39289562
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研究论文 | 本文介绍了CellChat v2，一个用于从单细胞转录组数据中推断和分析细胞间通信网络的更新计算工具 | CellChat v2通过简化的质量作用模型量化细胞间信号通信概率，整合了配体-受体核心相互作用及辅助因子调制，并提供了系统比较分析和交互式探索功能 | 协议执行时间取决于数据集大小，且需要基本的R语言和单细胞数据分析知识，但无需专门的生物信息学培训 | 开发并应用计算工具来系统分析单细胞转录组数据中的细胞间通信网络 | 单细胞转录组数据中的细胞群体及其通信网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于质量作用的简化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-03-21 |
CX3CR1+ Monocytes/Macrophages Promote Regional Immune Injury in Mesangial Proliferative Glomerulonephritis through Crosstalk with Activated Mesangial Cells
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0716
PMID:40458609
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研究论文 | 本研究揭示了在系膜增生性肾小球肾炎中，活化的系膜细胞与CX3CR1+单核细胞/巨噬细胞通过CX3CL1-CX3CR1轴相互作用，促进肾小球局部免疫损伤的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析，明确了CX3CL1-CX3CR1轴在MsPGN局部免疫损伤中的核心作用，并验证了靶向该轴的抗体（quetmolimab）的治疗潜力 | NA | 阐明系膜增生性肾小球肾炎中局部免疫损伤的分子机制，并探索新的治疗靶点 | IgA肾病患者的临床标本、MsPGN动物模型、系膜细胞、单核细胞/巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, Luminex多重免疫分析, 分子分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-03-21 |
Fibroblast-derived interleukin-11 as a potential biomarker for intestinal fibrostenosis in Crohn's disease
2025, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848251391093
PMID:41245384
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-11（IL-11）作为克罗恩病（CD）相关肠道纤维狭窄潜在生物标志物的价值 | 首次通过转录组学、血清检测和单细胞RNA测序综合验证了成纤维细胞来源的IL-11在CD肠道纤维狭窄中的表达增加及其促纤维化功能 | 这是一项观察性研究，样本量有限，且未在独立队列中进行外部验证 | 研究白细胞介素在检测CD相关肠道纤维狭窄中的价值 | 克罗恩病患者的肠道组织样本和血清样本 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA测序，实时聚合酶链反应，免疫组织化学，单细胞RNA测序，Luminex血清检测 | NA | 转录组数据，血清蛋白数据，单细胞RNA测序数据 | 来自CD手术切除的配对组织样本（非受累和纤维狭窄段）及血清样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-03-21 |
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680437
PMID:41488614
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研究论文 | 本研究使用10x Genomics平台和canFam4基因组，通过单细胞RNA测序构建了健康小型犬外周白细胞的单细胞图谱，揭示了51个独特的免疫亚群及其免疫检查点机制 | 首次使用更新后的canFam4基因组进行高分辨率单细胞RNA测序，在健康犬中识别出多个在canFam3.1研究中未被充分代表的免疫亚群，并揭示了免疫检查点程序如PDCD1、LAG3、CD274和CTLA4在免疫稳态中的新功能关联 | 样本仅来自六只健康小型犬，可能无法完全代表所有犬种或健康状况，且研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证 | 旨在通过高分辨率单细胞RNA测序全面解析健康犬的免疫异质性，识别新的免疫亚群并探索免疫检查点机制 | 健康小型犬的外周白细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6只健康小型犬，共30,040个高质量转录本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序 |
| 118 | 2026-03-20 |
A chromosome-level assembly and functional genomic resources for the model annelid Capitella teleta
2025-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.31.685816
PMID:41279112
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研究论文 | 本研究通过结合长读长和短读长测序与Hi-C染色质构象捕获数据，组装了多毛类模型生物Capitella teleta的染色体水平核基因组和线粒体基因组，提供了高质量的基因组资源 | 首次为Capitella teleta提供了染色体水平的基因组组装，揭示了核基因组与线粒体基因组之间的重排现象，并利用多组学数据集改进了功能基因组分析 | NA | 更新Capitella teleta的基因组资源，以支持进化发育生物学、比较基因组学、保护和生态毒理学研究 | 多毛类模型生物Capitella teleta的实验室品系 | 比较基因组学 | NA | 长读长测序, 短读长测序, Hi-C染色质构象捕获, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | 基因组序列, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-03-20 |
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505656122
PMID:40966282
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研究论文 | 本研究通过动物模型探究了杜氏肌营养不良症（DMD）中淋巴系统功能障碍与疾病发病机制之间的关联 | 首次在DMD动物模型中系统性地揭示了淋巴管结构和功能失调，并发现炎症性淋巴管生成与肌肉功能改善相关 | 研究主要基于动物模型（小鼠和大），尚未在DMD患者中得到直接验证 | 探究淋巴系统在DMD疾病进展中的作用，特别是淋巴功能失调与慢性炎症的关系 | DMD动物模型（mdx小鼠、GRMD犬）以及小鼠和大鼠的淋巴肌细胞 | 单细胞组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序，显微淋巴管造影，磁共振淋巴管造影，免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据，影像数据，蛋白质数据 | 使用mdx小鼠、GRMD犬模型以及对照动物的淋巴肌细胞和组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-03-22 |
Spatial Transcriptomics Reveals Differential Inflammatory Pathways in Discoid Lupus Erythematosus and Lichen Planus
2025-Sep, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |