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当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 1161 - 1180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2026-07-30 |
Single-cell transcriptomics identifies PDIA4 as a marker of progression and therapeutic vulnerability in multiple myeloma
2025-10-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07098-7
PMID:41121130
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学鉴定PDIA4作为多发性骨髓瘤进展和治疗脆弱性的标志物 | 首次从单细胞水平揭示PDIA4在多发性骨髓瘤终末阶段浆细胞中的上调表达及其在蛋白质未折叠反应中的关键调控作用，并证明靶向PDIA4可增强蛋白酶体抑制剂的疗效 | 研究主要基于RPMI-8226细胞系和异种移植模型，未在更多患者来源样本或临床队列中验证PDIA4靶向治疗的效果 | 阐明多发性骨髓瘤恶性进展和肿瘤细胞长期存活的转录调控机制，并探索潜在治疗靶点 | 健康供者、意义未明的单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤和新诊断多发性骨髓瘤患者的浆细胞 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | GEO数据集GSE124310和GSE271107中的健康供者、MGUS、SMM和NDMM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GEO数据集GSE124310和GSE271107（具体平台未在摘要中说明） |
| 1162 | 2026-07-30 |
Glioblastoma resistance to EGFR antibody-drug conjugate is driven by transcriptional reprogramming and TEK-induced EGFR suppression
2025-10-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07216-5
PMID:41121224
|
研究论文 | 本研究通过患者来源异种移植模型揭示了胶质母细胞瘤对EGFR抗体-药物偶联物耐药性的转录重编程及TEK诱导的EGFR抑制机制 | 首次发现TEK S466I点突变及TEK信号通路介导的EGFR下调是GBM对ABT-414耐药的新机制 | 临床转化验证尚未完成，部分机制在体外模型中验证 | 阐明胶质母细胞瘤对EGFR抗体-药物偶联物耐药性的分子机制 | 胶质母细胞瘤患者来源异种移植模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 全外显子测序、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 多个GBM12 PDX肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、全外显子测序 | NA | NA |
| 1163 | 2026-07-30 |
Macrophage dynamics and the role of TREM2 at the oral mucosal barrier
2025-10-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07135-5
PMID:41121278
|
研究论文 | 本研究探讨了TREM2在口腔黏膜屏障巨噬细胞动态变化及牙周病中的作用 | 首次揭示TREM2在口腔黏膜巨噬细胞中的表达及其在牙周病缓解期的免疫调节功能 | NA | 研究TREM2在牙周病期间对口腔黏膜巨噬细胞的调控作用 | 口腔黏膜巨噬细胞 | 机器学习 | 牙周病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,图像 | 野生型和TREM2-/-小鼠，以及人类口腔黏膜巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1164 | 2026-07-30 |
Compositional data modeling of high-dimensional single cell RNA-seq (CoDA-hd): its advantages over commonly used normalization approaches
2025-10-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07157-z
PMID:41121316
|
研究论文 | 探索高维组成数据分析（CoDA-hd）在单细胞RNA-seq数据中的应用优势 | 提出创新的计数添加方案（如SGM），使CoDA能应用于高维稀疏单细胞数据，并证明中心对数比（CLR）变换在降维、聚类和轨迹推断中优于常用归一化方法 | 仅基于模拟和有限真实数据集验证，未充分评估所有下游分析（如差异表达分析）的兼容性 | 评估CoDA框架在高维单细胞RNA-seq数据中的适应性及其对数比变换的优势 | 单细胞RNA-seq的原始计数矩阵（含超过20,000个基因成分） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达计数数据 | 使用模拟数据集和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1165 | 2026-07-30 |
Metabolic and immune crosstalk between cancer-associated fibroblasts and pancreatic cancer cells
2025-10-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07164-0
PMID:41107877
|
综述 | 探讨胰腺癌相关成纤维细胞与胰腺癌细胞之间的代谢和免疫相互作用，揭示其对肿瘤进展的影响 | 通过整合单细胞测序和空间组学数据，提供了CAFs驱动的代谢串扰和免疫景观重塑的新见解，为靶向基质相互作用的治疗策略奠定基础 | 未提及具体局限性 | 综述CAFs与胰腺癌细胞间的代谢和免疫相互作用，为开发新的治疗策略提供基础 | 胰腺癌相关成纤维细胞和胰腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | NA | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | NA |
| 1166 | 2026-07-30 |
Investigation into the molecular mechanism of obesity: an integrated approach of multi-omics analysis, machine learning and experimental validation
2025-10-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07096-9
PMID:41107929
|
research paper | 通过多组学分析、机器学习与实验验证的整合方法研究肥胖的分子机制 | 首次整合转录组、单细胞RNA测序与机器学习算法（LASSO回归和随机森林）系统鉴定肥胖关键基因，并通过动物实验验证TREM2在巨噬细胞中的特异性表达及其作为潜在诊断生物标志物的作用 | 仅基于GEO数据库的公开数据集，未进行大规模临床样本验证；动物实验仅限于小鼠模型，未涉及人类样本 | 系统识别影响肥胖病理进展的关键靶点及其潜在机制 | 肥胖相关的转录组和单细胞RNA测序数据以及肥胖小鼠脂肪组织 | machine learning | obesity | RNA-seq, scRNA-seq, LASSO回归, 随机森林 | LASSO, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个转录组和单细胞RNA测序数据集，具体样本量未详细说明 | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | 未明确说明平台具体配置 |
| 1167 | 2026-07-30 |
Elevating single-particle encapsulation in droplet microfluidics by utilizing surface acoustic wave and flow control
2025-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00787e
PMID:40302630
|
研究论文 | 提出一种集成表面声波和流体控制的液滴微流控系统，显著提高单颗粒封装效率 | 通过声波聚焦与鞘流调控相结合，打破泊松分布限制，实现高达78%的单颗粒封装效率，且无结构和参数约束 | 未提及长期稳定性及复杂生物样本的适用性验证 | 提升液滴微流控中单颗粒封装的效率，应用于单细胞测序、药物筛选等 | 聚苯乙烯微球、磁珠、H22细胞 | 微流控技术 | NA | 液滴微流控、表面声波、鞘流控制 | NA | 物理实验数据 | 多种浓度溶液，包括聚苯乙烯微球、磁珠及H22细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1168 | 2026-07-30 |
3D organoids containing endothelial and neural cells generation by serial inductions of differentiation on human iPSC-derived embryoid bodies
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.653559
PMID:40475416
|
研究论文 | 通过连续诱导分化人类iPSC来源的胚状体，生成含有内皮细胞和神经细胞的3D脑类器官 | 首次在不需外源添加内皮细胞或移植至动物的情况下，通过连续诱导分化人类iPSC来源的胚状体，生成了含有内皮细胞和神经细胞且具有血管样结构的3D脑类器官，可模拟体内神经与内皮细胞的发育相互作用 | 未明确说明，但可能涉及类器官复杂度有限及长期培养稳定性问题 | 构建同时含有内皮细胞和神经细胞的3D脑类器官，以研究人类大脑发育及神经疾病中内皮细胞与其他细胞的相互作用 | 人类iPSC来源的胚状体及生成的脑类器官 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq, RNA-Seq, siRNA处理 | 3D脑类器官 | scRNA-seq数据, RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1169 | 2026-07-30 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
|
研究论文 | 提出一种名为DeepDETAILS的深度学习框架，利用scATAC-seq参考数据库从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 核心创新在于能够使用scATAC-seq参考库对批量测序数据进行跨模态反卷积，实现碱基精度的细胞类型特异性基因组信号重建，且适用于多种组学数据集 | 未明确提及局限性，但整体依赖scATAC-seq参考数据的可用性和质量，可能受限于参考库的覆盖范围和准确性 | 开发一种从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程的计算方法 | 人类组织中的多种细胞类型，涵盖39种人体组织和86种细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | scATAC-seq, PRO-cap, PRO-seq, ChIP-seq | 深度学习（DeepDETAILS框架） | 测序数据（包括批量测序和单细胞测序数据） | 39种人体组织样本，86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序, 批量ChIP测序 | NA | NA |
| 1170 | 2026-07-30 |
Spatially Resolved Tumor Ecosystems and Cell States in Gastric Adenocarcinoma Progression and Evolution
2025-Apr-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0605
PMID:39774838
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，揭示了胃癌进展和演化中空间解析的肿瘤生态系统和细胞状态 | 首次整合GeoMx数字空间剖析仪和单细胞RNA测序数据，识别出与独特免疫微环境相关的空间解析表达异质性，并发现两种与特定分子亚型、临床预后、基质邻域和遗传驱动因素相关的独立进化轨迹 | NA | 研究胃癌进展和演化中空间解析的肿瘤生态系统和细胞状态 | 多个胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个胃癌患者样本 | NanoString | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler |
| 1171 | 2026-07-30 |
Single-cell analysis of the epigenome and 3D chromatin architecture in the human retina
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.28.630634
PMID:39764062
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研究论文 | 对人类视网膜进行单细胞多组学分析，构建转录组、表观基因组和三维染色质结构图谱 | 首次在单细胞水平上综合分析了人类视网膜的表观基因组和三维染色质结构，并利用深度学习解释非编码风险变异 | 未明确说明 | 填补视网膜细胞类型转录调控元件注释的空白，为眼科疾病风险变异机制研究提供资源 | 人类视网膜、黄斑、视网膜色素上皮/脉络膜组织 | 单细胞多组学 | 眼部疾病 | 单细胞多组学测序 | 序列预测模型 | 单细胞数据 | 未明确数量 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1172 | 2026-07-30 |
Glioblastoma Cortical Organoids Recapitulate Cell-State Heterogeneity and Intercellular Transfer
2025-Feb-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1336
PMID:39373549
|
研究论文 | 该研究通过培养胶质母细胞瘤(GBM)皮质类器官，模拟肿瘤微环境中的细胞状态异质性和细胞间转移 | 利用长期培养的人类皮质类器官更真实地再现GBM恶性细胞状态的多样性和表达程序，并首次揭示GBM转录本和GFP向非恶性细胞的广泛细胞间转移 | 研究主要集中于类器官模型，可能无法完全反映体内微环境的复杂性，且转移机制有待进一步验证 | 建模GBM神经胶质微环境中的细胞间通讯，特别是恶性细胞向非恶性细胞的mRNA和GFP转移 | 胶质母细胞瘤(GBM)细胞及人类皮质类器官中的神经胶质细胞类型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 长期培养的人类皮质类器官，包含主要神经胶质细胞类型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1173 | 2026-07-29 |
DAPK1-positve macrophages facilitate immunosuppressive microenvironment and determine immunotherapy efficacy in colorectal cancer
2025-11-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07268-7
PMID:41188869
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术，发现DAPK1阳性巨噬细胞促进结直肠癌免疫抑制微环境并影响免疫治疗效果 | 首次揭示DAPK1阳性巨噬细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫抑制特性及其作为免疫检查点阻断治疗协同靶点的潜力 | 仅基于小鼠模型和临床样本，缺乏大规模前瞻性验证研究 | 鉴定结直肠癌中促进癌症进展和免疫治疗耐药的特定巨噬细胞亚群 | 结直肠癌患者及小鼠模型的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本、测序数据 | 多个临床队列及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1174 | 2026-07-29 |
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-11-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07174-y
PMID:41184884
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞胞外陷阱（NETs）如何通过调节LDHA表达促进结直肠癌肝转移 | 首次揭示了NETs通过PI3K/AKT通路调控LDHA表达，进而促进结直肠癌肝转移的分子机制 | 主要基于体外实验和裸鼠异种移植模型，缺乏大规模临床样本验证 | 阐明NETs在结直肠癌肝转移中的作用及分子机制 | 结直肠癌组织和肝转移病灶 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 基于公开单细胞转录组数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1175 | 2026-07-29 |
A novel palmitoylation-based molecular signature reveals COX6A1 as a key regulator in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-11-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07253-0
PMID:41185013
|
研究论文 | 开发了一种基于棕榈酰化的分子特征，揭示COX6A1在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的关键调控作用 | 首次构建基于棕榈酰化相关基因的分子分型，并利用机器学习和单细胞分析发现COX6A1作为潜在诊断标志物和治疗靶点 | 主要基于公共数据库分析，缺乏大规模临床队列验证；体外实验仅使用HepG2细胞系，未进行体内动物模型验证 | 探索棕榈酰化、线粒体功能和免疫重塑在MASLD中的分子联系 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 共识聚类, WGCNA, 机器学习（12种算法，113种模型组合） | 基因表达数据 | 4个GEO批量RNA-seq队列和1个单细胞RNA-seq队列 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1176 | 2026-07-29 |
New perspectives in the treatment of liver cirrhosis: targeting macrophage regulatory mechanisms
2025-10-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07239-y
PMID:41174741
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞极化调控在肝硬化治疗中的核心作用与干预策略 | 首次系统阐述了巨噬细胞M1/M2极化平衡在肝纤维化逆转中的关键调控网络，并整合了从免疫调节、小分子靶向到基因工程巨噬细胞等三类前沿干预策略，提出基于单细胞测序技术的精准免疫调控新方向 | 策略临床转化仍面临极化状态动态变化和靶点特异性不足等挑战 | 探讨巨噬细胞靶向调控机制在肝硬化治疗中的应用前景，推动治疗模式从传统对症治疗向精准免疫调控转变 | 巨噬细胞极化调控机制及肝硬化治疗策略 | 机器学习和数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1177 | 2026-07-29 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-10-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
|
研究论文 | 通过全基因组关联研究、单细胞与空间转录组学分析揭示STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用，并确定STK24为潜在治疗靶点 | 首次整合GWAS、单细胞转录组和空间转录组数据，发现凋亡相关基因STK24及其阳性上皮细胞在肺腺癌进展中的关键作用，并构建了基于STK24的预后模型 | STK24作为潜在治疗靶点的功能验证主要在体外细胞实验中进行，缺乏体内动物模型验证以及大规模临床队列的外部验证 | 探究肺腺癌的遗传变异和分子机制，寻找新的治疗靶点 | 肺腺癌患者的基因组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据以及LUAD细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、空间转录组学 | CNN, LSTM, GAN, SCENIC, Monocle, CellCall, RCTD, stlearn, CellChat, Commot, Misty, STK24SuperPC | 基因型数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、RNA-seq数据 | GWAS数据来自FinnGen、IEU OpenGWAS和GWAS Catalog数据库，单细胞和空间转录组数据来自GEO数据库，预后模型评估基于TCGA-LUAD队列 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1178 | 2026-07-29 |
Targeting lncRNA MALAT1 attenuates lenalidomide resistance via CD38 epigenetic modulation, oxidative stress-mediated cell death, and remodeling of the pro-tumor microenvironment in multiple myeloma
2025-10-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07252-1
PMID:41168832
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研究论文 | 探讨长链非编码RNA MALAT1在多发性骨髓瘤来那度胺耐药中的作用及其机制 | 首次揭示MALAT1通过表观遗传调控CD38、氧化应激介导的细胞死亡及重塑促肿瘤微环境来促进来那度胺耐药 | 主要基于体外细胞实验和有限的患者样本，缺乏体内动物模型验证 | 阐明MALAT1在多发性骨髓瘤发病和来那度胺耐药中的功能及分子机制 | 多发性骨髓瘤细胞系、患者来源样本（骨髓单个核细胞） | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序、反义寡核苷酸敲低、荧光显微镜、比色法和发光法检测、MILLIPLEX多重分析 | NA | 基因表达数据、测序数据、细胞成像数据、细胞代谢数据 | 多发性骨髓瘤细胞系及患者骨髓单个核细胞样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序和批量RNA测序用于转录组分析 |
| 1179 | 2026-07-29 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-10-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
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研究论文 | SpateCV通过条件变分自编码器正则化单细胞RNA测序与空间转录组数据的细胞类型对齐，提升空间基因插补性能 | 提出SpateCV模型，利用聚类损失显式正则化两种数据中相似细胞的嵌入对齐，从而在共享潜在空间中实现跨模态对齐 | NA | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，改善空间基因表达插补，揭示组织结构和细胞异质性 | 来自十二个数据集的细胞类型及组织切片中的空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 包含十二个数据集的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1180 | 2026-07-29 |
Panmim: a resource of pan-cancer metastasis immune microenvironment
2025-10-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06484-5
PMID:41152997
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研究论文 | 开发了一个名为Panmim的泛癌转移免疫微环境综合资源数据库 | 首次整合来自不同起源的转移性癌症单细胞RNA-seq数据集，覆盖14个转移部位和36种原发癌症类型，提供细胞水平比较分析 | 未明确说明局限性，但可能受限于已有公开数据集的质量和覆盖范围 | 研究转移性肿瘤的免疫微环境，促进对癌症转移分子机制和细胞异质性的理解 | 转移性癌症及其微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 90个单细胞RNA-seq数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |