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当前共找到 10799 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2025-12-27 |
Single-cell transcriptomics reveals notch regulation in quiescent LEPR⁺ endometrial mesenchymal stem cells
2025-Dec-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04803-7
PMID:41437139
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了LEPR⁺子宫内膜间充质干细胞（eMSCs）作为原始、静止的干细胞亚群，并发现Notch信号通路在维持其干细胞特性和静止状态中起关键作用 | 首次在子宫内膜间充质干细胞中鉴定出LEPR⁺原始、静止亚群，并阐明Notch信号通路通过JAG1和DLL1维持其表型和静止状态 | 研究主要基于体外培养细胞和已发表的单细胞数据，体内功能验证可能有限，且样本来源和数量未明确说明 | 探究子宫内膜中更原始、静止的间充质干细胞亚群的身份和调控机制 | 人类子宫内膜间充质干细胞（eMSCs），特别是CD140b⁺CD146⁺培养细胞和LEPR⁺亚群 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜再生相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1142 | 2025-12-27 |
LONMF: a non-negative matrix factorization model based on graph Laplacian and optimal transmission for paired single-cell multi-omics data integration
2025-Dec-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06301-2
PMID:41437217
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图拉普拉斯和最优传输的非负矩阵分解模型LONMF，用于整合配对单细胞多组学数据 | LONMF结合图拉普拉斯和最优传输，提升了聚类性能和可解释性，在生物可解释性方面优于现有方法 | 未在摘要中明确提及 | 整合单细胞多组学数据以揭示细胞异质性并提供新的生物学视角 | 配对单细胞多组学数据，包括10X-multi-group、CITE-seq和TEA-multi-group seq | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞多组学数据 | 未在摘要中明确提及 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10X-multi-group | NA |
| 1143 | 2025-12-27 |
HiSTaR: identifying spatial domains with hierarchical spatial transcriptomics variational autoencoder
2025-Dec-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07404-3
PMID:41437257
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研究论文 | 本文提出了一种名为HiSTaR的分层空间转录组学变分自编码器，用于从空间转录组学数据中捕获多级潜在特征，以识别空间域并校正批次效应 | HiSTaR采用多个分层块来捕获多级潜在特征，支持空间域识别、批次效应校正、轨迹分析和差异基因表达分析，无需外部工具即可整合多个组织切片 | NA | 开发一种计算工具以改进空间转录组学数据的分析，特别是空间域识别和批次效应校正 | 空间转录组学数据中的点（spots） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 变分自编码器（VAE） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1144 | 2025-12-27 |
Parabacteroides goldsteinii mitigates parkinsonism in LRRK2 mutant mice by reducing neuroinflammation through Gut-Brain axis
2025-Dec-23, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.028
PMID:41448457
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研究论文 | 本文研究了Parabacteroides goldsteinii通过肠-脑轴减轻LRRK2突变小鼠帕金森病症状的作用机制 | 首次证明在运动症状出现前定植P. goldsteinii可通过非经典IL-12受体途径提供神经营养支持，并抑制小胶质细胞活化和LRRK2激酶活性 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证；且仅针对LRRK2 G2019S突变，未涵盖其他帕金森病亚型 | 探究P. goldsteinii在帕金森病早期阶段对疾病进展的影响 | 携带LRRK2 G2019S突变的无菌小鼠 | 神经科学 | 帕金森病 | 空间转录组分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、细胞生物能量分析 | NA | RNA测序数据、细胞表型数据、细胞能量代谢数据 | LRRK2 G2019S突变小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1145 | 2025-12-27 |
Novel insight into the gene etiology of ulcerative colitis gained from transcriptome association study and single-cell sequence analysis
2025-Dec-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046678
PMID:41431012
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组关联研究和单细胞测序分析，识别了与溃疡性结肠炎易感性相关的基因及其富集的细胞类型 | 结合跨组织转录组关联研究、功能汇总推断、多标记基因组注释分析和孟德尔随机化验证，系统识别UC易感基因，并利用单细胞RNA测序确定这些基因在特定细胞类型中的富集 | 研究主要基于公共数据库的GWAS和基因表达数据，可能受样本异质性和数据质量影响，且未进行实验验证 | 识别溃疡性结肠炎的易感基因及其表达的特定细胞类型 | 溃疡性结肠炎患者相关的基因和细胞类型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 转录组关联研究、功能汇总推断、多标记基因组注释分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵、GWAS数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1146 | 2025-12-27 |
THBS1 identificated as an endometriosis biomarker through evidence from single-cell and bulk transcriptomic profiling
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114164
PMID:41438033
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，鉴定THBS1为子宫内膜异位症的潜在生物标志物和疾病进展调节因子 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据鉴定THBS1在异位子宫内膜组织中的富集，并通过功能实验和动物模型验证其促进细胞增殖、迁移和侵袭的作用 | 研究主要基于转录组数据和体外/动物模型，尚未在大型临床队列中验证THBS1作为非侵入性诊断标志物的实际应用价值 | 寻找子宫内膜异位症的非侵入性诊断生物标志物 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 功能实验, 动物模型 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1147 | 2025-12-27 |
Single-cell analysis of testicular bacterial microbiome changes during aging and effect on reproductive capacity in mice
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114174
PMID:41438041
|
研究论文 | 本研究利用INVADE-seq单细胞RNA测序技术，探究了小鼠睾丸细菌微生物组在衰老过程中的变化及其对生殖能力的影响 | 首次应用INVADE-seq技术同时捕获宿主和细菌转录本，揭示了睾丸中细菌的广泛存在及其随年龄增加的变化，并关联了血睾屏障功能下降 | 研究仅基于小鼠模型，细菌检测稀疏，且未深入探讨细菌来源或因果机制 | 探究睾丸细菌微生物组在衰老过程中如何影响细胞状态和生殖能力 | 小鼠睾丸细胞，包括体细胞和早期生殖细胞 | 单细胞组学 | 男性不育 | INVADE-seq（入侵-粘附定向表达测序），单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及多个细胞类型的小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1148 | 2025-12-27 |
Single-cell transcriptomic profiling of zebrafish primary motor neurons reveals subtype-specific gene expression signatures
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114168
PMID:41438093
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析斑马鱼胚胎中的初级运动神经元，揭示了其亚型特异性基因表达特征 | 首次在斑马鱼中利用单细胞转录组学解析了初级运动神经元的分子身份，识别了14个聚类和7个亚型，并通过空间验证和蛋白质互作分析揭示了亚型特异性标记和潜在信号相互作用 | 研究基于斑马鱼胚胎模型，结果可能不完全适用于其他物种或成年阶段 | 探索斑马鱼初级运动神经元的分子身份和亚型特异性基因表达，以理解其在运动轴突决策中的作用 | 斑马鱼胚胎中的初级运动神经元，特别是RoP、MiP和CaP亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学、smiFISH（单分子荧光原位杂交）、伪时间分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间验证图像数据 | 斑马鱼胚胎样本，具体数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1149 | 2025-12-27 |
SS18::SSX and BRD9 Modulate Synovial Sarcoma Differentiation
2025-Dec-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14242022
PMID:41440042
|
研究论文 | 本研究探讨了SS18::SSX融合蛋白和BRD9在滑膜肉瘤分化中的作用，揭示了它们通过调控上皮-间质转化相关因子影响肿瘤表型和预后 | 首次系统研究了SS18::SSX和BRD9在滑膜肉瘤中对上皮-间质转化的多层调控机制，并利用单细胞RNA测序数据验证了BRD9的作用 | 未明确提及样本量或实验设计的局限性，可能缺乏体内验证或临床相关性分析 | 探究SS18::SSX和特定BAF亚基在滑膜肉瘤分化中的分子机制，以指导替代治疗策略 | 滑膜肉瘤细胞及其分化相关通路，特别是上皮-间质转化过程 | 分子生物学与肿瘤学 | 滑膜肉瘤 | Nanostring分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1150 | 2025-12-27 |
Remodeling of non-coding RNA regulatory networks: Decoding the pathological mechanisms and new therapeutic paradigms of cardiovascular diseases
2025-Dec-16, Physics of life reviews
IF:13.7Q1
DOI:10.1016/j.plrev.2025.12.007
PMID:41447890
|
综述 | 本文系统总结了非编码RNA在心血管疾病中的表达谱和多层调控机制，并探讨了其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 提出了一个整合网络拓扑、时空梯度和能量/化学计量约束的分析框架，以统一解释多种心血管疾病的机制 | 基于ncRNA的疗法在现实应用中面临递送效率低、功能冗余和微环境依赖等挑战 | 解码非编码RNA调控网络在心血管疾病中的病理机制，并探索新的治疗范式 | 心血管疾病，包括先天性心脏病、动脉粥样硬化、心肌病、心力衰竭和心律失常 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞多组学、空间转录组学、CRISPR-dCas9系统、深度学习 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1151 | 2025-12-27 |
Modeling Drug and Radiation Resistance with Patient-Derived Organoids: Recent Progress, Unmet Needs, and Future Directions for Lung Cancer
2025-Dec-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14241994
PMID:41440014
|
综述 | 本文总结了利用患者来源的类器官模型研究肺癌对化疗、放疗及新型疗法（如免疫检查点抑制剂和抗体药物偶联物）耐药性的最新进展，并强调了标准化研究的必要性 | 提出整合共培养系统和先进技术（如单细胞RNA测序和空间转录组学）以克服现有类器官模型在肿瘤微环境和获得性耐药研究方面的局限性 | 标准类器官模型缺乏免疫细胞等肿瘤微环境关键组分，限制了免疫治疗研究；对获得性耐药（尤其在肺癌中）的研究严重不足；缺乏生成和验证耐药模型的标准化方案 | 推进肺癌耐药性建模，以实现功能性精准医疗 | 肺癌患者来源的类器官模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | 类器官模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1152 | 2025-12-27 |
Sympathetic nerve inhibition enhances calvarial bone repair via senescent macrophage-induced osteogenesis and angiogenesis
2025-Dec-10, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02886-y
PMID:41372112
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研究论文 | 本研究通过抑制外周交感神经，揭示了其在调节小鼠颅骨缺损修复中的关键作用，并识别了衰老样巨噬细胞在促进骨再生中的机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术，系统阐明了交感神经抑制通过影响衰老样巨噬细胞和细胞间互作来增强骨修复的分子与细胞机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类临床中的适用性尚需验证；且未探讨长期交感神经抑制的潜在副作用 | 探究交感神经系统在骨再生过程中的调控作用及潜在治疗靶点 | 小鼠颅骨缺损模型中的损伤部位细胞 | 单细胞测序分析 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠颅骨损伤部位在损伤后7天和14天的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1153 | 2025-12-27 |
HLA-DQB1-mediated B cell-epithelial crosstalk drives EBV-associated inflammation in Hunner-type interstitial cystitis
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102783
PMID:41438366
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和靶向MHC测序数据，揭示了Hunner型间质性膀胱炎中HLA-DQB1介导的B细胞-上皮细胞相互作用驱动EBV相关炎症的机制 | 首次整合多组学数据揭示IRF8驱动的EBV感染B细胞通过变异HLA-DQB1介导的抗原呈递和上皮细胞因子环路维持HIC炎症的新机制 | 研究主要基于测序数据分析，缺乏体内实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 阐明Hunner型间质性膀胱炎的免疫遗传驱动机制 | Hunner型间质性膀胱炎患者样本中的B细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 间质性膀胱炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 靶向MHC测序 | CellChat, NicheNet, SCENIC | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1154 | 2025-12-27 |
mRNA-LNP vaccination orchestrates systemic immunity to control human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102780
PMID:41438364
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在小鼠模型中揭示了HPV靶向mRNA-LNP疫苗如何重塑全身免疫景观以控制头颈部鳞状细胞癌 | 首次在肿瘤引流淋巴结中发现了由LNP成分驱动的、跨多个淋巴亚群的独特干扰素刺激基因特征，并揭示了疫苗诱导的抗原特异性免疫细胞周期性爆发通过多向分化系统协调抗肿瘤细胞组成的机制 | 研究基于小鼠模型，其免疫反应与人类可能存在差异；尚未在临床环境中验证 | 阐明mRNA-LNP疫苗在HPV阳性头颈部鳞状细胞癌中引发全身免疫反应的细胞和分子动力学机制 | HPV阳性头颈部鳞状细胞癌小鼠模型 | 单细胞测序分析 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1155 | 2025-12-27 |
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Dec-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8148605/v1
PMID:41377951
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研究论文 | 本研究揭示了C型凝集素受体CD301b通过识别肿瘤糖基化抗原Tn，调控乳腺癌微环境中的髓系细胞功能，从而促进肿瘤生长的机制 | 首次将肿瘤特异性糖基化抗原（Tn）与髓系细胞表面的凝集素受体CD301b联系起来，阐明了糖-凝集素相互作用在肿瘤免疫微环境重塑中的关键作用 | 研究主要基于小鼠三阴性乳腺癌模型，人类临床样本的验证仍需进一步深入 | 探究肿瘤糖基化修饰与凝集素受体相互作用对肿瘤进展的影响 | 乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是表达CD301b的髓系细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，基因敲除模型 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1156 | 2025-12-27 |
HMGB3 promotes brain metastasis of lung adenocarcinoma by recruiting SSBP1 for nuclear translocation to remodel mitochondrial metabolism
2025-Dec, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70075
PMID:41194553
|
研究论文 | 本研究揭示了HMGB3通过招募SSBP1并诱导其核转位，重编程线粒体代谢，从而促进肺腺癌脑转移的分子机制 | 首次发现HMGB3通过招募SSBP1并诱导其核转位来重编程线粒体代谢，进而激活PI3K-Akt信号通路，促进肺腺癌脑转移的新机制 | 研究主要基于细胞模型和回顾性队列，缺乏前瞻性临床验证；体内模型可能无法完全模拟人脑微环境的复杂性 | 探究HMGB3在调节肿瘤细胞代谢以促进肺腺癌进展和脑转移中的作用 | 肺腺癌细胞、临床肺腺癌组织样本（包括原发灶和脑转移灶） | 肿瘤生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、Western blotting、免疫共沉淀结合质谱分析、功能获得与缺失实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | 两个回顾性队列（原发肺腺癌队列和肺腺癌脑转移队列） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1157 | 2025-12-27 |
Optimized protocol for processing murine tumor-bearing lung tissue for flow cytometry and single cell RNA-sequencing
2025-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.25.690629
PMID:41394615
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研究论文 | 本文介绍了一种从小鼠健康及肿瘤肺组织中分离高质量单细胞悬液的优化协议，适用于流式细胞术和单细胞RNA测序 | 针对KRAS突变小鼠模型中的肿瘤肺组织，开发了一套详细的逐步协议，能有效处理纤维化和异质性组织，确保细胞活力超过85% | 协议主要基于小鼠模型，可能无法直接适用于人类样本，且未涉及大规模临床验证 | 优化单细胞RNA测序的样本处理流程，以更好地解析非小细胞肺癌的异质性和可塑性 | 小鼠健康及肿瘤肺组织，特别是Kras; tdTomato报告小鼠模型中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1158 | 2025-12-27 |
Developing Topics
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70861_108464
PMID:41434493
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究了脑小血管病中微梗死负担对基因表达的影响 | 首次结合NanoString GeoMx DSP平台，在死后人脑组织中空间解析了不同细胞类型（星形胶质细胞、小胶质细胞、内皮细胞）对微梗死负担的转录组响应，揭示了早期胶质血管变化的关键作用 | 样本量较小（仅4例），且为死后组织，可能无法完全反映活体动态过程 | 阐明微梗死引起的分子和细胞后果，以理解血管损伤如何与阿尔茨海默病及相关痴呆中的神经退行性过程相互作用 | 死后人脑组织（来自4名受试者），重点关注中额回和基底神经节区域 | 数字病理学 | 脑小血管病 | 空间转录组学，全转录组测序 | NA | 空间基因表达数据 | 4名受试者的脑组织，共190个感兴趣区域 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | NanoString GeoMx数字空间分析平台，用于空间分段细胞的全转录组测序 |
| 1159 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_098987
PMID:41435002
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术，比较了阿尔茨海默病大脑和2型糖尿病胰腺中淀粉样蛋白沉积对周围细胞微环境的影响 | 首次在跨器官水平上，结合空间转录组学和淀粉样蛋白组织病理学图像，系统比较了AD大脑和T2D胰腺中淀粉样沉积相关的细胞和转录组响应 | 研究仅基于单个AD大脑和T2D胰腺样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究淀粉样蛋白沉积在AD和T2D中的共同病理生理过程，以理解这两种疾病之间的潜在联系 | 人类尸检AD大脑和T2D胰腺组织切片 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 2型糖尿病 | 单细胞空间转录组学, 组织病理学成像 | NA | 空间转录组学数据, 组织病理学图像 | AD大脑150,060个细胞, T2D胰腺256,907个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium单细胞空间转录组分析平台 |
| 1160 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_097563
PMID:41435138
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了脑脊液中独特的巨噬细胞群体，这些细胞与阿尔茨海默病遗传风险相关 | 首次在脑脊液中识别出独特的巨噬细胞群体，这些细胞表现出阿尔茨海默病多基因遗传风险的富集，包括APOE和TREM2高表达 | 研究基于特发性正常压力脑积水患者队列，样本量相对有限，且疾病特异性变化仍需进一步探索 | 探究外周免疫细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用，特别是脑脊液中的免疫细胞功能 | 特发性正常压力脑积水患者的配对脑组织、脑脊液和外周血单核细胞样本 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100个配对样本（来自iNPH患者），以及已发表数据集中超过200名患者和400,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |