单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1141	2025-03-27	IFN-γand donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation  2025-Mar-25, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.190655 PMID:40131369	研究论文	本研究探讨了IFN-γ联合供体白细胞输注（DLI）在异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤中的安全性和初步疗效	首次在临床试验中评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的效果，并通过单细胞RNA测序技术验证了IFN-γ对恶性髓系细胞的体内作用机制	样本量较小（n=7），仅为I期临床试验结果，需要更大规模研究验证疗效	评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的安全性和初步疗效	异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者	血液肿瘤学	急性髓系白血病/骨髓增生异常综合征	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	临床数据/基因表达数据	7名患者（6名接受DLI治疗）
1142	2025-03-27	Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis 2025-Mar-25, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-025-05216-1 PMID:40131629	研究论文	本研究探讨了乳酸化相关基因标记在绝经后骨质疏松症中的作用及其验证	首次利用单细胞RNA测序数据和转录组数据，结合机器学习算法，揭示了乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的重要作用，并构建了诊断模型	研究样本量有限，且未进行实验验证	探究乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的作用，并寻找潜在的诊断生物标志物	绝经后骨质疏松症患者	数字病理学	骨质疏松症	scRNA-seq, 转录组测序, Mendelian randomization (MR) 分析	机器学习算法组合	单细胞RNA测序数据, 转录组数据	未明确提及具体样本数量
1143	2025-03-27	Macrophage Subpopulation Promotes Skeletal Muscle Regeneration Through HGF/MET Signaling-Mediated Skeletal Muscle Stem Cell Proliferation 2025-Mar-25, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70042 PMID:40132988	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了巨噬细胞亚群Mac_1通过HGF/MET信号通路促进骨骼肌干细胞增殖，从而促进骨骼肌再生的机制	首次鉴定出促进骨骼肌再生的巨噬细胞亚群Mac_1，并阐明其通过HGF/c-Met信号通路抑制Cdkn1b表达来促进肌肉卫星细胞增殖的分子机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究骨骼肌再生过程中巨噬细胞亚群的作用及其分子机制	年轻(8周龄)和老年(24月龄)小鼠的骨骼肌组织和肌肉卫星细胞	细胞生物学	肌肉疾病	单细胞RNA测序	3D肌肉类器官模型	基因表达数据	年轻和老年小鼠的骨骼肌组织
1144	2025-03-27	Single-cell sequencing combined with urinary multi-omics analysis reveals that the non-invasive biomarker PRDX5 regulates bladder cancer progression through ferroptosis signaling 2025-Mar-24, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-13881-y PMID:40122834	研究论文	本研究通过单细胞测序和尿液多组学分析揭示了非侵入性生物标志物PRDX5通过铁死亡信号调控膀胱癌进展的机制	首次结合单细胞RNA测序和尿液多组学数据，系统研究了PRDX5在膀胱癌中的表达特征及其通过调控ROS水平和铁死亡通路促进肿瘤进展的机制	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在临床患者中进行验证	阐明过氧化物酶5(PRDX5)在膀胱癌中的表达特征及其生物学意义，特别是研究其通过调控活性氧(ROS)水平和激活铁死亡通路对膀胱癌进展的影响	膀胱癌组织和细胞	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、尿液蛋白质组学、转录组学	NA	蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据	TCGA数据库中的膀胱癌组织样本和单细胞测序数据
1145	2025-03-27	Checkpoint kinase 1 in colorectal cancer: Upregulation of expression and promotion of cell proliferation 2025-Mar-24, World journal of clinical oncology IF:2.6Q3 DOI:10.5306/wjco.v16.i3.101725 PMID:40130044	研究论文	本研究探讨了检查点激酶1（CHEK1）在结直肠癌（CRC）中的表达及其对癌细胞增殖的促进作用	首次通过单细胞RNA测序和组织微阵列数据全面分析CHEK1在CRC中的表达和功能，并探索其作为治疗靶点的潜力	数据集多样性有限，需要进一步研究其具体机制	研究CHEK1在CRC中的表达和功能，探索其作为新型治疗靶点的潜力	结直肠癌细胞和组织	癌症研究	结直肠癌	单细胞RNA测序、免疫组织化学、分子对接、CRISPR敲除实验	NA	RNA测序数据、组织微阵列数据、公共数据库mRNA表达数据	GSE144735数据集中的CRC细胞及多个公共数据库中的mRNA表达数据
1146	2025-03-27	Enhancing TREM2 expression activates microglia and modestly mitigates tau pathology and neurodegeneration 2025-Mar-23, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-025-03420-8 PMID:40122810	研究论文	本研究探讨了TREM2在tau病理和神经退行性变中的作用，发现增强TREM2表达可适度减轻tau病理和神经退行性变	首次在PS19 tauopathy小鼠模型中诱导过表达人类野生型TREM2和R47H变体，揭示了TREM2在调节小胶质细胞活性和tau病理中的作用	研究仅在小鼠模型中进行，结果对人类疾病的适用性尚不明确	探究TREM2在tau病理和神经退行性变中的作用及其潜在治疗价值	PS19 tauopathy小鼠模型	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	未明确说明
1147	2025-03-27	Inhibition of stromal MAOA leading activation of WNT5A enhance prostate cancer immunotherapy by involving the transition of cancer-associated fibroblasts 2025-Mar-22, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010555 PMID:40121032	研究论文	研究探讨了基质细胞中MAOA抑制通过激活WNT5A增强前列腺癌免疫治疗的机制	揭示了MAOA通过调节癌症相关成纤维细胞转化和WNT5A-Ca2+-NFATC1信号通路增强CD8+ T细胞活性的新机制	研究主要基于小鼠模型，人体内的效果尚需进一步验证	探索基质MAOA在前列腺癌免疫微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力	前列腺癌基质细胞、CD8+ T细胞、癌症相关成纤维细胞	肿瘤免疫学	前列腺癌	单细胞测序、体外共培养、小鼠移植瘤模型、双人源化小鼠模型	动物模型	测序数据、细胞实验数据	未明确说明样本数量，使用了小鼠模型和体外培养细胞
1148	2025-03-27	Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the roles of neutrophils in pediatric Crohn's disease 2025-Mar-22, Pediatric research IF:3.1Q1 DOI:10.1038/s41390-025-03961-x PMID:40121337	research paper	本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，探索了中性粒细胞在儿童克罗恩病中的作用及其潜在生物标志物和治疗靶点	揭示了中性粒细胞在克罗恩病中的数量和功能状态变化，及其与其他细胞类型的增强相互作用，提出了中性粒细胞作为治疗靶点的潜力	研究样本仅限于回肠和结肠活检样本，可能无法全面反映克罗恩病的整体情况	探索克罗恩病的分子机制、细胞类型及其潜在生物标志物和治疗靶点	儿童克罗恩病患者的中性粒细胞	digital pathology	Crohn's disease	single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing	NA	RNA sequencing data	回肠和结肠活检样本
1149	2025-03-27	Mapping Gene Expression in Whole Larval Brains of Bicyclus anynana Butterflies 2025-Mar-13, Methods and protocols IF:2.3Q3 DOI:10.3390/mps8020031 PMID:40126249	研究论文	优化了杂交链反应3.0（HCR v3.0）协议，以可视化非洲蝴蝶幼虫大脑中多个RNA分子的表达	优化了聚丙烯酰胺凝胶固定、固定和样品渗透步骤，并在单细胞分辨率下绘制了十个基因在幼虫全脑组织中的表达域	未提及具体局限性	研究蝴蝶幼虫大脑在分子水平上的行为变化	非洲蝴蝶（Bicyclus anynana）的幼虫大脑	分子生物学	NA	杂交链反应3.0（HCR v3.0）	NA	RNA分子表达数据	未提及具体样本数量
1150	2025-03-27	Single-Cell Transcriptomic Approaches for Decoding Non-Coding RNA Mechanisms in Colorectal Cancer 2025-Mar-10, Non-coding RNA IF:3.6Q2 DOI:10.3390/ncrna11020024 PMID:40126348	综述	本文综述了单细胞转录组学方法在解码结直肠癌中非编码RNA机制方面的最新进展	强调了单细胞生物信息学方法在非编码RNA分析中的应用，包括序列和结构基础的方法、机器学习应用以及多组学数据整合	未提及具体的研究局限性	综述单细胞生物信息学在结直肠癌非编码RNA研究中的现状并展望未来方向	结直肠癌中的非编码RNA	生物信息学	结直肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	机器学习	转录组数据	NA
1151	2025-03-27	IL-4 alters TLR7-induced B cell developmental program in lupus 2025-Mar-09, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110472 PMID:40068727	research paper	该研究探讨了IL-4如何改变TLR7诱导的B细胞发育程序，从而影响系统性红斑狼疮（SLE）中的自身抗体形成	研究发现IL-4能够重编程B细胞发育，减少自身抗体和特定B细胞亚群，为SLE治疗提供了新的潜在靶点	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类SLE患者的临床转化效果尚需进一步验证	探究IL-4对TLR7诱导的B细胞发育程序的影响及其在SLE中的作用机制	BXD2自身免疫小鼠模型和SLE患者B细胞	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞转录组分析	动物模型（BXD2小鼠）	基因表达数据	未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和SLE患者B细胞
1152	2025-03-27	Myeloma cell-intrinsic ANXA1 elevation and T cell dysfunction contribute to BCMA-negative relapse after CAR-T therapy 2025-Mar-08, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.03.001 PMID:40057828	research paper	该研究探讨了多发性骨髓瘤（MM）在抗B细胞成熟抗原（BCMA）CAR-T细胞治疗后复发的原因，发现ANXA1的高表达与BCMA阴性复发相关	首次发现ANXA1的高表达与BCMA阴性多发性骨髓瘤复发相关，并验证了ANXA1作为潜在治疗靶点的有效性	研究样本量较小，仅基于单例患者的单细胞转录组测序数据	探究多发性骨髓瘤在CAR-T细胞治疗后BCMA阴性复发的机制	多发性骨髓瘤患者和CAR-T细胞	肿瘤免疫治疗	多发性骨髓瘤	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	1例CAR-T治疗后复发的多发性骨髓瘤患者
1153	2025-03-27	Identifying gene expression and cellular pathways involved in glomerular AL-amyloidosis and correlation with experimental data: seeking novel therapeutic interventions 2025-Mar-04, Ultrastructural pathology IF:1.1Q4 DOI:10.1080/01913123.2025.2468708 PMID:39985165	research paper	本研究通过空间转录组学分析肾小球淀粉样变性不同阶段的基因表达和细胞通路，寻找新的治疗靶点	首次在人类肾小球中探测了淀粉样轻链与系膜细胞相互作用时的基因表达谱和激活的细胞通路	样本量较小（仅5例肾活检样本）	寻找改善或消除肾损伤的新型治疗干预措施	肾小球淀粉样变性患者的系膜细胞	digital pathology	renal disease	spatial transcriptomics	NA	gene expression data	5例肾活检样本（不同阶段肾小球淀粉样变性）和正常对照
1154	2025-03-27	Spatially Resolved Single-Cell Transcriptome Analysis of Mycosis Fungoides Reveals Distinct Biomarkers GNLY and FYB1 Compared With Psoriasis and Chronic Spongiotic Dermatitis 2025-Mar, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.modpat.2024.100681 PMID:39675427	research paper	通过空间分辨单细胞转录组分析，研究蕈样肉芽肿（MF）与银屑病及慢性海绵性皮炎的差异生物标志物GNLY和FYB1	首次利用空间分辨单细胞转录组技术鉴定出GNLY和FYB1作为区分MF与银屑病及慢性海绵性皮炎的特异性生物标志物	样本量相对有限（150例患者），且免疫组化验证的敏感性和特异性仍有提升空间	探索区分蕈样肉芽肿与炎症性皮肤病的诊断标志物	蕈样肉芽肿、银屑病和慢性海绵性皮炎患者的表皮内T细胞	digital pathology	skin disease	spatially resolved single-cell transcriptome analysis, immunohistochemistry	NA	transcriptomic data, immunohistochemical data	150例患者（56例MF，48例银屑病，46例慢性湿疹）
1155	2025-03-27	Esr1-Dependent Signaling and Transcriptional Maturation in the Medial Preoptic Area of the Hypothalamus Shapes the Development of Mating Behavior during Adolescence 2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.26.640339 PMID:40060480	research paper	本研究探讨了青春期期间内侧视前区（MPOA）的转录动态及其对交配行为发展的影响	揭示了雌激素受体1（Esr1）在青春期MPOA GABA能神经元转录成熟中的关键作用，并发现了性别特异的基因调控网络	研究仅在小鼠中进行，未涉及人类或其他哺乳动物	探究青春期期间MPOA的转录动态及其对交配行为发展的影响	青春期发育期间的雄性和雌性小鼠	神经科学	NA	单细胞RNA测序（scRNAseq）和杂交技术	NA	RNA测序数据	雄性和雌性小鼠
1156	2025-03-27	CD271 regulates osteogenic differentiation of ectomesenchymal stem cells via the RhoA/ROCK signaling pathway 2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114068 PMID:39826451	research paper	本研究探讨了CD271通过RhoA/ROCK信号通路调控外间充质干细胞（EMSCs）成骨分化的机制	揭示了CD271通过RhoA/ROCK信号通路调控EMSCs成骨分化的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞中进行验证	探究CD271对EMSCs成骨分化的影响及其分子机制	外间充质干细胞（EMSCs）和小鼠下颌骨发育	干细胞生物学	颌骨发育异常	单细胞测序	小鼠模型	基因表达数据	CD271缺陷小鼠
1157	2025-03-27	mitoXplorer 3.0, A Web Tool for Exploring Mitochondrial Dynamics in Single-cell RNA-seq Data 2025-Feb-12, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2025.169004 PMID:40133780	研究论文	介绍了一个名为mitoXplorer 3.0的网络工具，用于探索单细胞RNA测序数据中的线粒体动态	mitoXplorer 3.0新增了适应单细胞测序数据分析的功能，包括生成仅包含线粒体相关基因的单细胞表达矩阵，并提供交互式界面用于分析细胞间的变异性	NA	研究线粒体在不同细胞类型和单细胞分辨率下的功能和动态	线粒体在单细胞RNA测序数据中的动态	生物信息学	脊髓小脑共济失调1型	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA
1158	2025-03-27	AQP1 Affects Necroptosis by Targeting RIPK1 in Endothelial Cells of Atherosclerosis 2025, Vascular health and risk management IF:2.6Q2 DOI:10.2147/VHRM.S487327 PMID:40129682	研究论文	本研究探讨了AQP1通过靶向RIPK1影响动脉粥样硬化内皮细胞中的坏死性凋亡	揭示了AQP1通过抑制RIPK3和MLKL的表达来抑制动脉粥样硬化中的坏死性凋亡的新机制	研究主要基于体外实验和测序分析，缺乏体内实验验证	探究AQP1是否通过结合RIPK1并降低RIPK3和MLKL的表达来影响动脉粥样硬化中的坏死性凋亡	动脉粥样硬化患者和正常人的股动脉和主动脉样本	分子生物学	心血管疾病	单细胞测序、空间转录组学、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、Western Blot(WB)	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	动脉粥样硬化组织和正常组织的样本
1159	2025-03-27	Hypoxia-associated genes as predictors of outcomes in gastric cancer: a genomic approach 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1553477 PMID:40129974	研究论文	研究缺氧相关基因在胃腺癌中的作用并构建预后模型	通过单细胞RNA测序分析鉴定出四个缺氧亚群和四个非缺氧亚群，构建了一个由五个H1特异性转录因子组成的预后模型，该模型在预测总生存期方面表现出色	研究依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探讨缺氧相关基因在胃腺癌中的影响并构建预后模型	胃腺癌(STAD)患者和细胞系	基因组学	胃癌	scRNA-seq, qRT-PCR, WGCNA, GO-BP/KEGG富集分析	LassoCox算法	RNA表达数据和临床数据	来自TCGA和GEO数据库的胃腺癌样本，以及GSE183904中的原发胃癌样本
1160	2025-03-27	Interleukin-27-polarized HIV-resistant M2 macrophages are a novel subtype of macrophages that express distinct antiviral gene profiles in individual cells: implication for the antiviral effect via different mechanisms in the individual cell-dependent manner 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1550699 PMID:40129989	research paper	该研究探讨了IL-27极化的HIV抗性M2巨噬细胞（27-Mac）作为一种新型巨噬细胞亚型的生物学功能和基因表达特征，及其通过不同抗病毒基因产物在个体细胞中抵抗HIV感染的机制	发现27-Mac是一种新型巨噬细胞亚型，具有独特的抗病毒基因表达谱和不同于其他M2d亚型的抗HIV机制	研究仅基于体外实验，未在体内模型中验证27-Mac的抗病毒效果	探究IL-27极化的巨噬细胞（27-Mac）的生物学特性和抗HIV机制	健康供体来源的单核细胞分化而来的巨噬细胞	免疫学	HIV感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、p24抗原捕获试验、活性氧（ROS）测定、吞噬试验、IsoPlexis细胞因子检测系统	NA	基因表达数据、细胞功能数据	健康供体来源的单核细胞