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当前共找到 10473 篇文献,本页显示第 1121 - 1140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1121 2025-12-05
Sepsis Induces Age- and Sex-Specific Chromatin Remodeling in Myeloid-Derived Suppressor Cells
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单分子表观遗传学技术揭示了脓毒症后骨髓源性抑制细胞(MDSCs)中与年龄和性别相关的染色质重塑机制 首次使用MAPit-FENGC单分子技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性,构建了脓毒症后MDSCs的高分辨率表观遗传图谱,并揭示了年龄和性别特异性的染色质动态变化 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;样本量相对有限 阐明脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制 骨髓源性抑制细胞(MDSCs) 表观遗传学 脓毒症 MAPit-FENGC(单分子DNA甲基化和染色质可及性分析),单细胞RNA测序 无监督聚类分析 表观遗传数据,转录组数据 年轻和年老成年雄性和雌性小鼠的脾脏MDSCs NA 单细胞RNA测序 NA NA
1122 2025-12-05
A lifespan transcriptomic atlas of the human prefrontal cortex at single-cell resolution
2025-Oct-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究构建了人类背外侧前额叶皮层(DLPFC)的首个跨生命周期的单细胞核转录组图谱,揭示了其细胞和分子程序随年龄变化的动态规律 首次构建了覆盖人类完整生命周期(0-97岁)的DLPFC单细胞核转录组图谱,识别了三个不同的转录组阶段和十种年龄相关轨迹,并发现了成年晚期神经元核心生物钟节律丧失与胶质细胞应激适应性节律出现的新现象 研究基于死后样本,可能无法完全反映活体组织的动态过程;样本量虽大但个体差异可能影响部分结论的普适性 绘制人类前额叶皮层跨生命周期的细胞和分子图谱,以理解大脑发育、衰老及疾病易感性的基础 人类背外侧前额叶皮层(DLPFC) 数字病理学 老年性疾病 单细胞核RNA测序,空间转录组学 非线性建模,伪时间分析 转录组数据,空间基因表达数据 284例死后样本,超过130万个细胞核 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1123 2025-12-05
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
研究论文 本研究评估了一种小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的可行性和耐久性 首次在灵长类动物模型中评估小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的长期性能,并利用空间转录组学揭示了宿主细胞浸润对血管重塑的调控机制 研究样本量较小(n=5),仅评估了6个月的短期效果,未与传统自体血管进行直接比较 开发冠状动脉旁路移植术的替代血管移植物 成年狒狒的冠状动脉系统 组织工程 心血管疾病 空间转录组学,计算机断层扫描血管造影 NA 影像数据,基因表达数据,组织学数据 5只成年狒狒 NA NA NA NA
1124 2025-12-05
Loss of Ribosomal Protein L22 (RPL22) Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1-Deficient Endometrial Cancers With Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes
2025-Sep-24, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过免疫组化检测和数字空间转录组学分析,发现RPL22表达缺失可识别MLH1缺陷子宫内膜癌中一个免疫低亚型,该亚型具有较少的肿瘤相关淋巴细胞 首次证明RPL22缺失是MLH1缺陷子宫内膜癌中免疫低亚型的易检测标志物,并揭示其与β-2微球蛋白表达降低及CD8+ T细胞浸润减少相关 未发现RPL22表达或肿瘤相关T淋巴细胞水平与肿瘤突变负荷或PD-L1表达相关,且样本队列规模未明确说明 探究RPL22在MLH1缺陷子宫内膜癌中的表达意义及其与肿瘤免疫微环境的关系 子宫内膜癌(EC)样本,特别是MLH1缺陷亚型 数字病理学 子宫内膜癌 免疫组化(IHC),数字空间转录组学 NA 组织图像,转录组数据 NA NA 数字空间转录组学 NA NA
1125 2025-12-05
Airway Epithelial Heterogeneity and Mucus Plugging in Asthmatic Bronchioles
2025-Sep-23, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 本研究探讨了哮喘患者细支气管上皮异质性与黏液栓形成的关系,揭示了MUC5AC高表达细胞微环境在T2炎症驱动的上皮重塑中的作用 首次在哮喘细支气管中识别出MUC5AC高表达的异质性细胞微环境,并发现其独立于免疫细胞定位,为理解哮喘细支气管疾病的分子病理生理学提供了新视角 研究样本主要来自严重和致命性哮喘患者,可能无法代表所有哮喘亚型;体外培养模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 验证哮喘细支气管上皮生物学紊乱导致MUC5AC主导的黏液栓形成的假说 严重哮喘患者、致命性哮喘患者和对照者的外周肺组织,以及分离的细支气管和支气管基底细胞 空间转录组学 哮喘 组织学、RNA原位杂交、免疫组织化学、细胞培养、空间转录组学、多重免疫表型分析 NA 组织切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 严重哮喘患者、致命性哮喘患者和对照者的外周肺组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
1126 2025-12-05
A multimodal atlas of COVID-19 severity identifies hallmarks of dysregulated immunity
2025-Sep-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析,构建了COVID-19严重程度的多模态图谱,揭示了失调免疫的关键特征 首次在单细胞分辨率下整合了多种数据类型,包括单细胞RNA-seq、CITE-seq、TCR/BCR测序等,全面解析了COVID-19严重程度的生物学特征,并明确了托珠单抗治疗对免疫细胞特征的影响 研究主要基于急性感染期和恢复期患者,对长期后遗症(如慢性COVID综合征)的免疫机制探索仍有限 研究COVID-19严重程度与宿主免疫反应的关系,特别是托珠单抗治疗对免疫特征的影响 428名COVID-19患者,涵盖急性感染、托珠单抗治疗试验和恢复期三个队列 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA-seq, CITE-seq, TCR/BCR测序, 病毒载量测量, 病毒中和试验, 自身抗体检测, HLA基因分型, 血清蛋白质组学 线性模型 单细胞多组学数据, 临床元数据 428名患者的840个PBMC样本,共250万个循环免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
1127 2025-12-05
Direct oHSV Infection Induces DC Maturation and a Tumor Therapeutic Response
2025-Aug-19, Viruses
研究论文 本文探讨了溶瘤性单纯疱疹病毒直接感染树突状细胞如何促进其成熟并增强抗肿瘤免疫反应 揭示了oHSV直接感染DC而非仅通过肿瘤细胞感染来激活抗肿瘤免疫的新机制,为癌症免疫治疗提供了新视角 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且oHSV感染DC为流产性感染,其长期效果和安全性需进一步评估 探究溶瘤性单纯疱疹病毒通过直接感染树突状细胞增强抗肿瘤免疫治疗的机制 溶瘤性单纯疱疹病毒、树突状细胞、CT-2A胶质瘤细胞、T细胞 免疫治疗 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1128 2025-12-05
Identification of Novel Lactylation-Related Biomarkers for COPD Diagnosis Through Machine Learning and Experimental Validation
2025-Aug-18, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过机器学习筛选和实验验证,鉴定出CBR1和PRDX1作为与乳酸化相关的慢性阻塞性肺疾病诊断生物标志物 首次将乳酸化修饰与COPD诊断生物标志物发现相结合,并采用多算法集成筛选与单细胞转录组学分析进行验证 研究主要基于公共数据集和体外CSE诱导模型,需要在更大临床队列和体内模型中进一步验证 鉴定COPD中临床相关的乳酸化相关生物标志物并探究其在疾病发病机制中的潜在作用 慢性阻塞性肺疾病患者基因表达数据、香烟烟雾提取物诱导的COPD细胞模型 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 转录组学分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光 LASSO回归、支持向量机递归特征消除、加权基因共表达网络分析 基因表达数据、单细胞转录组数据 来自GSE21359和GSE76925数据集的COPD患者样本,以及GSE173896单细胞数据集 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq NA NA
1129 2025-12-05
Eed controls craniofacial osteoblast differentiation and mesenchymal proliferation from the neural crest
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了PRC2复合物核心亚基Eed在神经嵴诱导后对颅面成骨细胞分化和间充质细胞增殖的关键调控作用 首次结合小鼠遗传学、单细胞RNA测序和表观遗传分析,系统阐明了Eed在神经嵴细胞迁移后阶段通过表观遗传调控转录因子程序驱动颅面发育的分子机制 研究主要聚焦于胚胎发育阶段,对出生后颅面维持和成年疾病关联的探讨有限 探究PRC2复合物在神经嵴诱导后对颅面发育的调控机制 小鼠胚胎神经嵴细胞、颅面间充质细胞、原代颅面细胞培养物 发育生物学 先天性颅面畸形 单细胞RNA测序、表观遗传分析 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1130 2025-12-05
Linear structure unfolding : application to mouse brain in spatial transcriptomics
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
研究论文 本文提出了一种用于空间转录组学中分析细长弯曲形状或点云的方法,通过展开线性结构来研究细胞或转录本类型沿主轴的分布 结合k-means聚类和旅行商问题优化自动计算形状的中心线,实现沿中心线或垂直方向的细胞或转录本空间分布分析 NA 解决空间转录组学中特定形状区域(如细长弯曲结构)的计算分析问题 小鼠大脑组织中的细胞或RNA分子点云 空间转录组学 NA 空间转录组学 k-means聚类,旅行商问题优化 图像,点云数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1131 2025-12-05
Single-cell resolution uncovers neighboring cell subtypes that share steroidogenic capacity during fetal testis development
2025-Jun-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞技术揭示了小鼠胎儿睾丸发育过程中类固醇生成细胞(如胎儿Leydig细胞)的异质性及其在雄激素生产中的协同作用 通过单分子荧光原位杂交和单细胞RNA测序,首次发现胎儿Leydig细胞在类固醇生成基因表达上存在不同步性和不完整性,并揭示了邻近细胞类型间的合作机制 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他物种;且主要关注胎儿发育阶段,成年期变化未探讨 探究胎儿睾丸发育过程中单个及集体类固醇生成细胞对雄激素生产的贡献 小鼠胎儿睾丸中的类固醇生成细胞(包括胎儿Leydig细胞和其他间质细胞类型) 数字病理学 NA 单分子荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 NA 图像, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1132 2025-12-05
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用,使其从膜上移位,从而促进突变p53介导的突变KRAS过度激活的分子机制 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常,从而解释突变p53与KRAS致癌协同作用的具体通路 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证仍需扩大规模;GAP17-1膜移位的确切结构机制有待进一步解析 探究突变p53与KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序、组织芯片 NA 基因表达数据、组织病理数据 多种胰腺癌细胞系、三种基因工程小鼠模型(iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*)、临床前与临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1133 2025-12-05
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为Lloki的新框架,用于整合不同平台的空间转录组学数据,无需共享基因面板 Lloki通过特征对齐和批次对齐任务,利用最优传输引导的特征传播和scGPT单细胞基础模型,实现了跨平台ST数据的统一集成,克服了基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性等挑战 NA 开发一个跨平台空间转录组学数据整合框架,以促进组织结构和细胞相互作用的深入理解 小鼠脑样本和卵巢癌数据集 空间转录组学 卵巢癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 scGPT 空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 小鼠脑样本来自五种不同技术,以及五个卵巢癌数据集 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
1134 2025-12-05
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了巨细胞病毒感染期间,脾脏TNF-α信号通路如何通过调控NF-κB信号促进NK细胞从固有免疫向适应性免疫的转变 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过激活经典和非经典NF-κB通路,分别调控NK细胞的效应功能和适应性前体细胞分化,阐明了组织特异性信号在NK细胞免疫记忆形成中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人体内的验证尚需进一步研究;对TNF-α信号与其他细胞因子网络的相互作用探讨有限 探究病毒感染过程中NK细胞在脾脏微环境获得适应性免疫特征的分子机制 巨细胞病毒感染模型中的自然杀伤细胞 免疫学 病毒感染 单细胞RNA测序,纵向追踪 NA 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1135 2025-12-05
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为SIID的算法,用于整合不同空间转录组学平台的数据,通过联合非负矩阵分解模型实现基因表达的插补和细胞类型特异性表达的解卷积 首次提出能够同时处理空间转录组数据插补和解卷积的联合模型,通过空间对齐和联合非负矩阵分解,有效整合不同分辨率和技术特点的平台数据 算法性能依赖于配对数据集的质量和空间对齐的准确性,在技术平台差异过大时可能效果受限 开发能够整合不同空间转录组学平台数据的算法,实现基因表达插补和细胞类型解卷积 空间转录组学数据,特别是来自不同技术平台(如10x Genomics Visium和Xenium)的配对数据集 空间转录组学 乳腺癌, 结肠癌 空间转录组学技术 联合非负矩阵分解模型 空间基因表达数据 人类乳腺癌和结肠癌组织样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x Xenium 10x Visium(全转录组,多细胞分辨率), 10x Xenium(靶向数百个基因,亚细胞分辨率)
1136 2025-12-05
Immunological and Prognostic Profiling of Triple-Negative Breast Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing of T-Cell Exhaustion
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过单细胞和bulk RNA测序分析三阴性乳腺癌中的T细胞耗竭特征,构建风险评分模型并评估其与患者预后及免疫治疗响应的关系 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,系统分析三阴性乳腺癌中T细胞耗竭的免疫学特征,并构建基于TEX相关基因的风险评分模型用于预后评估 研究仅基于公开数据集GSE161529,缺乏独立验证队列和实验验证,样本量相对有限 评估T细胞耗竭特征对三阴性乳腺癌患者免疫治疗响应的影响,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的T细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 风险评分模型 RNA测序数据 12,477个高质量细胞,来自GSE161529数据集 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1137 2025-12-05
Infiltration of CXCL9+ macrophages confers a favorable prognosis in breast cancer: Insights from an integrated single-cell RNA and bulk RNA sequencing study
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序,揭示了CXCL9+巨噬细胞在乳腺癌中的浸润与患者良好预后相关,并构建了基于相关基因的生存风险模型 首次通过单细胞和bulk RNA测序整合分析,识别出CXCL9+巨噬细胞作为乳腺癌预后良好的关键细胞亚群,并验证了其通过CXCL9/10/11-CXCR3轴激活T细胞和NK细胞的抑制肿瘤机制 研究主要基于测序数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本来源和数量未具体说明,可能影响结论的普适性 探究乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性,识别与生存预后相关的关键细胞类型,并开发免疫治疗新靶点 乳腺癌肿瘤组织中的免疫细胞(特别是巨噬细胞亚群)及乳腺癌细胞系 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, 体外细胞实验 反卷积算法, 生存风险模型 RNA测序数据, 细胞实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1138 2025-12-05
Integrated multi-omics analysis reveals necroptosis-related biomarker BIRC3 for early diagnosis and therapeutic targeting in preeclampsia
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了坏死性凋亡相关基因BIRC3作为先兆子痫早期诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 首次将坏死性凋亡与先兆子痫发病机制联系起来,并通过多组学验证确定了BIRC3作为新型诊断标志物 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证;样本量有限且依赖于现有数据库 识别先兆子痫的坏死性凋亡相关生物标志物,并通过虚拟筛选寻找潜在天然化合物 先兆子痫患者胎盘组织及相关基因表达数据 生物信息学 先兆子痫 单细胞RNA测序,机器学习,分子对接 随机森林 基因表达数据 多个公共数据集(GSE66273、GSE44711、GSE173193) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1139 2025-12-05
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了脂肪来源干细胞(ADSCs)成脂分化过程中的关键基因及其调控网络 首次整合bulk和单细胞RNA-seq数据,系统揭示了ADSC成脂分化早期和晚期的阶段特异性转录调控因子,并构建了ceRNA网络 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于qPCR,缺乏功能验证和体内实验 阐明ADSC成脂分化的全局和阶段特异性转录调控网络,为脂肪组织稳态和脂肪移植提供候选调控靶点 脂肪来源干细胞(ADSCs) 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qPCR NA RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1140 2025-12-05
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过综合转录组学、孟德尔随机化和机器学习分析,探讨了内质网应激相关基因DNAJB1在慢性阻塞性肺疾病中的风险作用和临床价值 首次将DNAJB1识别为COPD的风险基因,并利用单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法构建了一个包含九个关键基因的诊断标志物组合 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和具体数据细节未明确说明 识别与COPD发病和进展相关的遗传变异和新型生物标志物,以改善临床预后 慢性阻塞性肺疾病患者及相关基因数据 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞测序、微阵列数据分析 机器学习 转录组数据、单细胞测序数据、微阵列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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