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当前共找到 10619 篇文献,本页显示第 1081 - 1100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1081 2026-01-11
Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression
2025-Sep-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过多组学方法探讨了热休克因子HSF5在调控减数分裂前期I中染色质动态和转录重编程的关键作用 首次揭示了HSF5通过调控染色质可及性、转录调控网络和组蛋白修饰,特别是与USP7形成复合物抑制H2AK119ub在性染色体上的沉积,从而驱动粗线期进展的新机制 HSF5与USP7复合物的具体作用机制及其在减数分裂其他阶段的功能尚未完全阐明 阐明HSF5在哺乳动物减数分裂前期I中调控染色质组织和转录重编程的分子途径 小鼠精母细胞,特别是粗线期精母细胞 表观遗传学 男性不育症 ATAC-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因组可及性数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1082 2026-01-11
Single-cell atlas of grass carp ( Ctenopharyngodon idella) peripheral blood IgM + B cells provides insights into B cell-mediated immune responses in teleost fish
2025-Sep-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了草鱼外周血IgM+ B细胞在细菌感染后的转录组图谱和免疫应答特征 首次在硬骨鱼类中通过单细胞RNA测序系统解析了外周血IgM+ B细胞的异质性,并发现了两个感染诱导的B细胞亚群,揭示了鱼类B细胞通过I型干扰素信号通路参与先天抗菌免疫应答的新机制 研究仅针对草鱼一种硬骨鱼类,且感染模型为单一细菌病原体,结论在其他鱼类或病原体中的普适性有待验证 阐明硬骨鱼类外周血B细胞在细菌感染中的免疫应答机制 草鱼(Ctenopharyngodon idella)外周血IgM+ B细胞 单细胞转录组学 细菌感染(水产病原体) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 感染与未感染草鱼的外周血B细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
1083 2026-01-11
Spatial Transcriptomics to Study Virus-Host Interactions
2025-09, Annual review of virology IF:8.1Q1
综述 本文综述了空间转录组学在研究病毒-宿主相互作用、病毒致病机制及开发抗病毒策略中的变革性潜力 强调空间转录组学在病毒-宿主相互作用研究中的创新应用,揭示其在解析病毒感染空间动态方面的独特优势 NA 探讨空间转录组学在理解病毒致病机制、识别关键病毒与宿主因子以及开发抗病毒疗法和免疫策略中的应用 植物、动物和人类中的病毒性疾病 空间转录组学 病毒性疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1084 2026-01-11
Coordinated changes in midkine expression and midkine-associated multiomic profile in glioma microenvironment
2025-Aug-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了中期因子在胶质母细胞瘤微环境中的表达变化及其对免疫调节的影响 首次系统性地整合了四个RNA-Seq数据集,结合单细胞RNA-Seq和功能实验,阐明了MDK在GBM中的多组学特征及其对巨噬细胞分泌组的调控作用 研究主要基于回顾性队列和体外实验,缺乏体内模型验证;样本量虽大但异质性可能影响结果 探究中期因子在胶质瘤特别是胶质母细胞瘤中的功能及其在肿瘤微环境重塑中的作用 成人胶质瘤患者样本(包括胶质母细胞瘤)、匹配的原代细胞培养物以及巨噬细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq NA RNA序列数据, 单细胞RNA序列数据 1,017例成人胶质瘤(包括256例GBM样本) NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1085 2026-01-11
Comprehensive analysis of the PLXNA3 gene on prognosis and immune characteristics in breast cancer
2025-Aug-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文通过综合分析PLXNA3基因在乳腺癌中的预后价值和免疫特征,揭示了其高表达与不良预后及免疫抑制相关 首次系统性地将PLXNA3基因表达与乳腺癌的恶性程度、生存预后、肿瘤免疫微环境特征及抗PD1免疫治疗反应相关联,并验证了其在体外对癌细胞增殖、侵袭和迁移能力的功能影响 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 探究PLXNA3基因在乳腺癌中的生物学意义、预后价值及其在肿瘤免疫微环境中的作用 乳腺癌患者样本(通过公共数据库获取)及乳腺癌细胞系 癌症生物学与生物信息学 乳腺癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外功能实验(基因敲低和过表达) NA RNA测序数据, 临床生存数据, 体外实验数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1086 2026-01-11
IDENTIFICATION OF DISEASE-SPECIFIC VULNERABILITY STATES AT THE SINGLE-CELL LEVEL
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过整合单细胞转录组数据和CRISPR功能缺失筛选,识别了胶质母细胞瘤中的三种单细胞脆弱性状态,并评估了它们对癌症药物的敏感性 开发了一种新颖的计算流程,首次在单细胞水平上整合CRISPR筛选数据和scRNA-seq数据来识别肿瘤内的脆弱性状态,为患者分层和药物发现提供了新策略 研究主要基于体外细胞系数据,可能无法完全反映体内肿瘤微环境的复杂性;样本量相对有限(49个肿瘤) 识别胶质母细胞瘤中的疾病特异性脆弱性状态,以指导靶向治疗和患者分层 胶质母细胞瘤肿瘤细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR功能缺失筛选 迭代层次聚类 转录组数据 49个胶质母细胞瘤肿瘤 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1087 2026-01-11
Overexpression of Meis factors in late-stage retinal progenitors yields complex effects on temporal patterning and neurogenesis
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过在小鼠晚期视网膜祖细胞中过表达Meis1和Meis2转录因子,探究其对细胞时间身份和神经发生的影响 首次在晚期视网膜祖细胞中系统研究Meis1和Meis2过表达对时间模式调控和神经发生能力的影响,揭示了二者在晚期发育阶段具有非重叠的调控功能 过表达Meis因子未能完全重编程晚期祖细胞的时间身份,且研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类细胞或体内长期功能验证 探究转录因子Meis1和Meis2在晚期视网膜祖细胞中对时间身份决定和神经发生的调控作用 出生后小鼠的视网膜祖细胞 发育生物学 NA 电穿孔转染、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,使用小鼠视网膜祖细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1088 2026-01-10
Single-cell RNA-sequencing-guided reactive oxygen species-scavenging hydrogel design for regeneration of osteoporotic bone
2025-Dec-31, Journal of Zhejiang University. Science. B
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,设计了一种微环境自适应水凝胶系统,用于促进骨质疏松性骨缺损的再生修复 利用单细胞RNA测序识别骨质疏松微环境中的关键病理特征,并以此指导设计具有双重功能的水凝胶系统 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 开发适用于骨质疏松病理微环境的生物材料以促进骨缺损再生 骨质疏松小鼠的骨缺损模型及骨髓来源的间充质干细胞 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1089 2026-01-10
Constructing a PANoptosis-based prognostic signature to evaluate the immune landscape and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-31, Journal of Zhejiang University. Science. B
研究论文 本研究构建了一个基于PANoptosis的预后特征模型,用于评估透明细胞肾细胞癌的免疫景观和治疗反应 首次在ccRCC中整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡相关基因构建预后模型,并验证其在免疫治疗反应预测中的价值 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在外部数据集验证有限 识别ccRCC中PANoptosis相关基因,构建预后模型并评估免疫治疗反应 透明细胞肾细胞癌患者 生物信息学 肾癌 单细胞RNA测序,免疫组化,RT-qPCR,CCK-8,Transwell实验 LASSO回归,Cox回归 基因表达数据,临床数据 未明确样本数量,使用公共数据集和实验验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1090 2026-01-10
CausalGRN: deciphering causal gene regulatory networks from single-cell CRISPR screens
2025-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为CausalGRN的可扩展计算框架,用于从单细胞CRISPR筛选数据中推断因果基因调控网络并预测细胞对未知扰动的响应 提出了一种新颖的自适应阈值校正方法,以减轻稀疏单细胞RNA-seq数据中普遍存在的虚假偏相关,从而能够稳健地推断无向图,并利用观察到的扰动结果进行定向,最终通过网络传播预测新扰动的下游效应 NA 从单细胞CRISPR筛选数据中解码因果基因调控网络 单细胞RNA-seq数据及CRISPR扰动结果 机器学习 NA 单细胞RNA-seq, CRISPR筛选 网络推断与传播模型 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1091 2026-01-10
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了GLP-1R激动剂对小鼠集合淋巴管泵血能力的直接影响 首次发现GLP-1R在淋巴管内皮细胞中的特异性表达,并证明GLP-1R激动剂能直接改善淋巴管收缩功能 潜在的信号通路成分尚未完全阐明,需要进一步研究 研究GLP-1R激动剂是否对淋巴管功能有直接作用,而非仅通过体重减轻产生系统效益 野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 NA 继发性淋巴水肿 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 NA 基因表达数据、图像数据、生理测量数据 多种小鼠模型(WT、DIO、ApoE KO)的淋巴管样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1092 2026-01-10
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文详细介绍了针对小鼠肌肉骨骼组织样本的全面处理流程,旨在通过10x Genomics的Xenium Prime 5K平台实现高质量的空间转录组学数据生成 开发了一种综合样本处理流程,包括经心灌注、固定、脱钙、石蜡处理及样本共包埋策略,成功解决了在脱钙肌肉骨骼组织中保持RNA完整性的挑战 NA 旨在实现从小鼠肌肉骨骼组织中生成高质量的空间转录组学数据 小鼠的完整膝关节、胫骨和腰椎等肌肉骨骼组织样本 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组学数据 涉及成年小鼠的多种组织类型,包括滑膜、半月板、髌腱、关节软骨、软骨下骨、皮质骨、骨髓、肌肉、骨折骨痂和背根神经节 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Prime 5K Xenium Prime 5K平台,用于基于成像的空间转录组学分析
1093 2026-01-10
Single-Cell Dissection of Fibroblast Heterogeneity in Diabetic Ulcers: Platelet-Rich Plasma (PRP) Therapy Activates Core Regenerative Programs via PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7 Networks
2025-Dec-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多组学方法,揭示了糖尿病溃疡中成纤维细胞的异质性,并评估了富血小板血浆(PRP)疗法通过激活PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7网络促进愈合的机制 首次在糖尿病溃疡中系统表征成纤维细胞异质性,并鉴定出PRP疗法通过PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7转录因子网络激活核心再生程序的新机制 研究样本量相对较小(人类样本n=14,动物模型验证),且主要基于观察性数据,需要进一步功能实验验证机制 表征糖尿病溃疡中成纤维细胞的异质性,并评估PRP疗法的疗效及分子机制 糖尿病足溃疡患者(愈合n=9,未愈合n=5)的皮肤组织,以及链脲佐菌素诱导的糖尿病溃疡大鼠模型 数字病理学 糖尿病溃疡 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞间通讯分析,转录因子分析,伪时间轨迹重建,动物模型验证 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据 人类样本:14例(愈合9例,未愈合5例);动物模型:糖尿病溃疡大鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1094 2026-01-10
Comprehensive Multi-Omics Analysis Identifies Lactylation-Related Gene RAN as a Novel Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Glioma
2025-Dec-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法,鉴定出乳酸化修饰相关基因RAN是胶质瘤的新型预后生物标志物和治疗靶点 首次系统性地将乳酸化修饰与胶质瘤进展联系起来,并通过创新的多步骤分析流程(结合scRNA-seq、空间转录组学和101种机器学习组合策略)鉴定出RAN这一关键基因,揭示了其通过PI3K/AKT通路促进肿瘤恶性表型的新机制 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,功能验证仅在有限的胶质瘤细胞系(LN229, U87, U251)中进行,缺乏体内动物模型实验和临床样本的进一步验证 系统鉴定胶质瘤中关键的乳酸化修饰相关基因,阐明其功能和作用通路,并探索其作为新型治疗靶点的潜力 胶质瘤(中枢神经系统原发性恶性肿瘤) 生物信息学, 计算生物学 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习特征选择, shRNA敲低, 细胞功能实验(CCK-8, 克隆形成, EdU, 伤口愈合, Transwell), 蛋白质印迹 多种机器学习算法(共10种)及其组合策略(共101种), 包括弹性网络(ENet, α = 0.4) 基因表达数据(RNA-seq, scRNA-seq), 空间转录组数据, 临床预后数据 来自TCGA、GEO和CGGA数据库的多个数据集, 具体样本数量未在摘要中明确说明;功能验证使用了LN229、U87和U251三种胶质瘤细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
1095 2026-01-10
Cancer-Associated Fibroblast-Centric Risk Model Predicts Immunotherapy Resistance in Pancreatic Cancer and Reveals PLOD2 as a Key Stromal Therapeutic Target
2025-Dec-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过整合多组学数据与实验验证,构建了以癌症相关成纤维细胞为中心的风险模型,用于预测胰腺癌免疫治疗耐药性,并揭示PLOD2作为关键基质治疗靶点 首次系统性结合加权基因共表达网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,识别出CAF相关核心基因,并通过单细胞RNA测序验证其在CAF中的表达,建立风险模型预测免疫治疗反应 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,且未深入探讨所有核心基因的具体作用机制 探究癌症相关成纤维细胞在胰腺腺癌中的作用机制,并开发靶向CAF的治疗策略 胰腺腺癌患者的多组学数据、肿瘤细胞行为及癌症相关成纤维细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、多组学数据分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 风险预测模型 多组学数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但基于多数据库分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1096 2026-01-10
Hypoxia-Activated PERK Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition in Gliomas: A Single-Cell and Spatial Transcriptomic Study With Therapeutic Implications
2025-Dec-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了缺氧激活的PERK通路在胶质瘤中促进上皮-间质转化(EMT)的关键作用及其治疗意义 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术,系统阐明了缺氧环境下PERK通路通过SPP1-CD44相互作用驱动胶质瘤EMT和侵袭的新机制 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分在细胞系和动物模型中进行,临床样本验证有限 探究内质网应激(ERS)特别是PERK通路在胶质瘤EMT和恶性进展中的作用 胶质瘤细胞系、裸鼠模型、公共单细胞和空间转录组数据 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、伪时间分析、细胞通讯分析 NA 转录组数据、空间转录组数据、细胞实验数据 公共数据库中的胶质瘤样本、PERK沉默的胶质瘤细胞系、裸鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1097 2026-01-10
Cross-Study Meta-Analysis of Blood Transcriptomes in Type 2 Diabetes
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合自身和公开的血液RNA-seq数据,进行跨研究荟萃分析,探索2型糖尿病的转录组变化和潜在生物标志物 首次通过跨研究荟萃分析整合多个血液转录组数据集,识别出2065个差异表达基因,其中包括713个在原始研究中未发现的新基因,并揭示了中性粒细胞活化和增殖在2型糖尿病中的潜在作用 不同研究间的基因表达变化一致性较低,仅少数差异表达基因在所有数据集中被一致识别,样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 阐明2型糖尿病的致病机制并识别潜在的生物标志物 2型糖尿病患者和对照受试者的全血样本 自然语言处理 2型糖尿病 bulk RNA-seq NA 转录组数据 9名T2D患者和9名对照受试者(自身研究),加上七个公开数据集 NA bulk RNA-seq NA NA
1098 2026-01-10
Multi-dimensional omics integrated machine learning framework identifies macrophage-fibroblast-tumor co-infiltration patterns to predict prognosis in gastric cancer
2025-Dec-09, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和机器学习技术,识别并验证了胃癌中巨噬细胞-成纤维细胞-肿瘤细胞共浸润的空间模式,并开发了一个基于迁移学习的预测模型 首次在胃癌中系统性地识别了巨噬细胞-成纤维细胞-肿瘤细胞的空间共浸润模式,并利用迁移学习构建了能够识别该模式的机器学习框架 研究主要基于回顾性数据,需要在前瞻性队列中进一步验证模型的临床适用性 揭示胃癌肿瘤微环境的空间异质性,开发预后预测工具 胃癌组织样本 数字病理学 胃癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 机器学习 ResNet-50, 迁移学习 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1099 2026-01-10
Immune landscape-driven subtyping reveals distinct microenvironment and prognostic profiles in thymic epithelial tumors
2025-Dec-06, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合公共数据集和内部验证队列的免疫相关基因表达数据,对胸腺上皮肿瘤进行免疫亚型分型,揭示了两种具有不同微环境特征和预后的亚型 首次基于免疫景观对胸腺上皮肿瘤进行亚型分型,并揭示了髓系/基质富集亚型通过MIF介导的机制抑制CD8+ T细胞功能 研究依赖于公共数据集和单中心验证队列,样本量有限,需要更大规模的多中心研究进行验证 建立胸腺上皮肿瘤的临床相关免疫分类系统,以整合分子、免疫学和临床特征 胸腺上皮肿瘤患者 数字病理学 胸腺上皮肿瘤 RNA测序,单细胞转录组学,多重免疫荧光 共识聚类 基因表达数据,单细胞转录组数据,图像数据 公共数据集和内部验证队列共119例样本(LRS亚型86例,MSRS亚型33例),以及瑞金队列的FFPE-RNA测序验证 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1100 2026-01-10
Promoting astrocyte-neuron triiodothyronine shuttling attenuates brain damage in neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了新生儿缺氧缺血性脑病中星形胶质细胞与神经元之间的转录耦合,并鉴定了一个具有神经保护功能的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群 首次在HIE中鉴定出具有代谢和神经保护特征的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群,并揭示了T3介导的星形胶质细胞-神经元交互作用机制 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 探索星形胶质细胞-神经元交互在新生儿缺氧缺血性脑病中的作用,并寻找潜在治疗靶点 出生后第7天的大鼠幼崽(Rice-Vannucci模型诱导的缺氧缺血性脑损伤) 神经科学 新生儿缺氧缺血性脑病 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,多重免疫荧光,ELISA,Western blotting,激光散斑对比成像 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,图像数据,行为学数据 出生后第7天的大鼠幼崽,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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