单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10570 篇文献,本页显示第 1081 - 1100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1081 2026-08-08
Temporal dynamics of the multi-omic response reveals the modulation of macrophage subsets post-myocardial infarction
2025-07-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学数据,揭示了心肌梗死后巨噬细胞亚群的异质性及其蛋白水平的动态变化,并表征了翻译后修饰特征。 首次结合scRNA-seq和蛋白质组学全面描绘心肌梗死后巨噬细胞亚群的动态蛋白变化,并解析磷酸化、乙酰化和乳酰化等翻译后修饰的作用。 未明确提及,但可能受限于蛋白质组学数据的覆盖深度和样本量大小。 探究心肌梗死后巨噬细胞亚群在蛋白水平上的动态变化及其翻译后修饰对预后的影响。 心肌梗死后的巨噬细胞亚群,包括Spp1hiMac、MHCIIhiMac、Ltc4shiMac等7个亚群。 生物信息学、蛋白质组学、单细胞组学 心肌梗死 单细胞RNA测序、蛋白质组学、翻译后修饰分析 计算流程(聚类、注释)和动物模型 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠心肌梗死模型和公共数据(ArrayExpress)中的细胞。 NA 单细胞RNA测序、蛋白质组学 NA NA
1082 2026-08-08
Paired mutation calling and spatial transcriptomics identify cellular neighbourhoods dictating the neoplastic outcome of colitis
2025-May-08, Research square
研究论文 该研究结合谱系追踪、建模、突变分析和空间转录组学,在结肠炎相关肿瘤发生的小鼠模型中,探讨细胞邻域如何影响突变克隆的命运及肿瘤结局 首次将配对突变检测与空间转录组学相结合,识别上皮和免疫富集的细胞邻域,并提出修复性组织环境通过促进致癌克隆选择与扩增来驱动肿瘤起始的模型 研究基于小鼠模型,可能不完全代表人类结肠炎相关肿瘤发生过程,且未提供人体样本验证 探究细胞环境如何影响炎症性肠病向癌症进展过程中突变克隆的流行和扩增,以及其对结肠炎肿瘤结局的影响 结肠炎相关肿瘤发生的小鼠模型中的细胞克隆和微环境 空间转录组学 炎症性肠病、结肠炎相关癌症 空间转录组学、突变分析、谱系追踪 计算模型 基因表达数据、突变数据、组织图像 小鼠模型(具体样本量未提供) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 空间转录组学平台用于组织切片分析
1083 2026-08-08
Elevated Serum and Urinary Secreted Protein Acidic and Rich in Cysteine Levels are Novel Biomarkers of Kidney Fibrosis Severity
2025-04, Archives of medical research IF:4.7Q1
研究论文 本研究评估了血清和尿液中富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(SPARC)水平作为肾纤维化严重程度的非侵入性生物标志物的诊断价值。 首次提出血清和尿液SPARC水平可作为肾纤维化的非侵入性生物标志物,并联合eGFR提高预测准确性。 未明确提及研究的局限性。 探索血清和尿液中SPARC水平在肾纤维化诊断中的价值。 慢性肾脏病(CKD)患者及健康对照肾脏样本。 机器学习和数字病理学 慢性肾脏病 单细胞转录组分析 NA 基因表达数据和临床数据 674名接受肾活检的CKD患者(训练队列322名,验证队列352名) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1084 2026-08-08
X-scPAE: An explainable deep learning model for embryonic lineage allocation prediction based on single-cell transcriptomics revealing key genes in embryonic cell development
2025-04, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 提出了一种基于可解释PCA和注意力自编码器的深度学习模型X-scPAE,用于预测人类和小鼠单细胞转录组数据中的胚胎谱系分配,并通过反事实梯度归因算法识别关键基因 结合PCA、自编码器、注意力机制和反事实梯度归因算法,实现对谱系预测的可解释性分析,优于现有方法并提取出关键基因 未提及具体局限性,可能依赖于单细胞转录组数据质量及模型泛化性 预测胚胎细胞谱系分配并识别谱系间基因表达差异,以理解细胞分化过程并减少早期流产 人类和小鼠单细胞转录组数据 机器学习、单细胞转录组学 早期流产 单细胞转录组测序 注意力自编码器、PCA、逻辑回归 单细胞转录组数据 未指定具体样本数量,涉及人类和小鼠单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1085 2026-08-08
Dynamic Reprogramming of Stromal Pdgfra-expressing cells during WNT-Mediated Transformation of the Intestinal Epithelium
2025-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了WNT介导的肠道上皮转化过程中,基质Pdgfra表达细胞的动态重编程及其在促进肿瘤形成中的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了WNT驱动肿瘤发生早期Pdgfra成纤维细胞的动态重编程,并发现TGFB信号在其中的关键作用 摘要中未提供明确的局限性信息 探究基质Pdgfra表达细胞在WNT介导的肠道上皮转化过程中的动态变化及其对肿瘤发生的促进作用 小鼠模型中的Pdgfra成纤维细胞和肠道上皮细胞 数字病理学 肠道肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型中的间充质细胞群体 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
1086 2026-08-08
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2025-01, The EMBO journal
研究论文 通过单细胞RNA测序等技术研究健康与恶性黏膜上皮中APOBEC3A和APOBEC3B的表达,发现APOBEC3A主要在终末分化细胞中表达,并且受GRHL3调控,而在鳞状细胞癌中其表达扩展到增殖细胞,提示其在分化中的作用及在肿瘤中突变活性的获得机制 首次揭示APOBEC3A在正常鳞状上皮中主要于终末分化细胞表达,并受GRHL3调控,在鳞癌中表达扩展至增殖细胞,提出APOBEC3A突变活性获得的新机制 未明确说明,可能涉及样本量或实验验证范围的限制 解析APOBEC3A和APOBEC3B在正常及恶性鳞状上皮中的表达模式及其调控机制,以理解其在肿瘤突变中的作用 健康和恶性黏膜上皮组织,包括角质形成细胞和鳞状细胞癌细胞 数字病理学 鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学、空间转录组学、功能实验 NA 单细胞基因表达数据、空间转录组数据、组织图像 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
1087 2026-08-08
Novel integrated multiomics analysis reveals a key role for integrin beta-like 1 in wound scarring
2025-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究开发了一种整合空间转录组学和单细胞RNA测序的高分辨率空间多组学方法,揭示了整合素β样1在伤口瘢痕形成中的关键作用 开发了一种新型高分辨率空间多组学方法,整合空间转录组学与单细胞RNA测序,首次识别了修复过程中细胞间通讯和信号传导的新特征,并发现Itgbl1在炎症相关瘢痕形成中的关键作用 摘要中未提及明显的局限性 探究伤口修复过程中分子和空间组织的单细胞水平关系,并识别炎症相关瘢痕形成的关键基因 PU.1小鼠、转基因小鼠、人类和小鼠原代成纤维细胞 空间转录组学 伤口瘢痕形成 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 研究中涉及小鼠和人类样本,具体数量未在摘要中提供 10x Genomics 空间转录组学、单细胞RNA测序 10x Visium 10x Visium空间转录组学
1088 2026-08-06
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-12, Sleep medicine IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了EP300在应激诱导的睡眠障碍中通过血脑屏障功能障碍和神经炎症发挥作用 首次揭示了EP300在睡眠障碍中的潜在作用,并结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序及小鼠模型进行验证 未提及 识别影响睡眠障碍的关键基因,为理解、预防和治疗提供新视角 睡眠障碍相关基因及小鼠前额叶皮层细胞 机器学习 睡眠障碍 RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR 加权基因共表达网络分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据 371个关键基因,5个枢纽基因,小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1089 2026-08-06
Distinct roles of Atf3, Zfp711 and Bcl6b in early embryonic hematopoietic and endothelial lineage specification
2025-12-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究在单细胞分辨率下探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b在小鼠早期胚胎造血和内皮谱系定型中的不同作用 首次在单细胞水平上系统研究了Atf3、Zfp711和Bcl6b这三个转录因子在早期胚胎造血中的功能,并揭示了Zfp711与Atf3之间的层级调控关系 研究主要基于体外分化的小鼠胚胎干细胞,可能不能完全反映体内复杂的胚胎微环境;且未深入探讨Bcl6b在其他发育阶段的潜在作用 阐明Atf3、Zfp711和Bcl6b在早期胚胎造血和内皮谱系定型中的特异性功能及调控机制 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的细胞群体,包括中胚层、内皮细胞、红系-髓系祖细胞等 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序、流式细胞术、基因敲除 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 未明确提及样本数量,涉及野生型和三种基因敲除(ΔAtf3, ΔZfp711, ΔBcl6b)的小鼠胚胎干细胞分化实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1090 2026-08-06
Spatial profiling of human pancreatic ductal adenocarcinoma reveals molecular alterations associated with venous invasion
2025-09-24, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过空间转录组学分析人类胰腺导管腺癌组织,揭示与静脉侵犯相关的分子改变 首次对胰腺导管腺癌的静脉侵犯进行空间转录组和蛋白质组学分析,发现静脉侵犯相关的分子特征与患者预后改善相关,并区分了两种形态学亚型 样本量较小,且仅来自未治疗患者,可能限制结果的普适性 探究胰腺导管腺癌中静脉侵犯的分子特征及其与转移和预后的关联 人类胰腺导管腺癌组织样本 空间转录组学 胰腺导管腺癌 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 95个组织样本(8例未治疗患者),独立验证队列19例 NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
1091 2026-08-06
A complete Sigmodon hispidus genome and dynamic single-cell transcriptomics reveal evolutionarily conserved responses to RSV infection
2025-09-17, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究报道了棉鼠的染色体基因组和呼吸道单细胞转录组图谱,揭示了其对人呼吸道合胞病毒(RSV)感染的进化保守反应机制 首次提供了棉鼠的染色体基因组和感染RSV过程中的呼吸道单细胞转录组图谱,证明了棉鼠与人类在组织保守性和病毒受体分布上的相似性,并识别了潜在的治疗靶点 未明确提及局限性,但可能受限于棉鼠作为模型的适用性及转录组分析的样本量 阐明棉鼠作为RSV感染模型的进化保守机制,并识别潜在的临床标志物和治疗靶点 棉鼠在RSV感染过程中的呼吸道细胞,包括club细胞、分泌细胞、间皮细胞和神经相关星形胶质细胞 基因组学与单细胞转录组学 呼吸道合胞病毒感染 染色体基因组组装、单细胞RNA测序 NA 基因组序列数据和单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1092 2026-08-06
PD-1-targeted cis-delivery of an IL-2 variant induces a multifaceted antitumoral T cell response in human lung cancer
2025-09-17, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该研究利用人源模型系统,探究PD1-IL2v融合蛋白在人类肺癌中引发的多层面抗肿瘤T细胞反应 首次在人源肿瘤模型系统中揭示PD1-IL2v通过靶向CD8和常规CD4 T细胞引发多层面抗肿瘤反应,并利用单细胞RNA测序提供机制见解 研究基于离体肿瘤片段平台,可能无法完全模拟体内复杂微环境,且未进行体内验证 阐明PD1-IL2v在人类肺癌中诱导抗肿瘤T细胞反应的机制,支持下一代免疫细胞因子的临床开发 人类肺癌患者来源的肿瘤片段及其中浸润的T细胞 免疫学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1093 2026-08-06
Interferon-induced senescent CD8+ T cells reduce anti-PD1 immunotherapy efficacy in early triple-negative breast cancer
2025-09-10, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、批量转录组学和病理学分析,发现干扰素诱导的CD8+ T细胞衰老降低早期三阴性乳腺癌抗PD1免疫治疗效果,并提出了烟酰胺单核苷酸恢复T细胞功能的策略 首次在早期三阴性乳腺癌中鉴定出干扰素诱导的CD8+ T细胞衰老亚群作为免疫治疗无反应的预测标志物,并揭示HLA-DR单核细胞产生的干扰素通过过度消耗NAD引发T细胞衰老的机制,提供烟酰胺单核苷酸恢复T细胞功能的新治疗策略 研究主要基于早期TNBC患者样本,结论可能不适用于晚期或其它亚型乳腺癌;机制验证依赖于患者来源类器官和鼠模型,仍需临床验证 探究早期三阴性乳腺癌免疫治疗无反应的预测生物标志物及机制,并寻找恢复CD8+ T细胞功能以增强免疫治疗效果的策略 早期三阴性乳腺癌患者样本、CD8+ T细胞、HLA-DR单核细胞、患者来源类器官以及小鼠模型 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、批量转录组学、病理学分析 NA 基因表达数据、病理图像 171名早期三阴性乳腺癌患者 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'转录组, Illumina NovaSeq批量RNA测序
1094 2026-08-06
Inhibiting SLC38A2 lowers blood pressure in rodent models of hypertension
2025-09-03, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究揭示了SLC38A2通过调节内皮细胞一氧化氮信号调控血压,抑制SLC38A2可降低高血压动物模型的血压,并提出其作为高血压治疗靶点的可能性 首次发现SLC38A2作为血压调节因子,通过调控内皮细胞谷氨酰胺摄取影响AKT-eNOS通路和一氧化氮合成,并在人群队列中验证了SLC38A2基因变异与高血压风险的相关性 主要基于动物模型和特定人群队列,未涉及人类临床试验验证;机制研究可能未涵盖SLC38A2在其他细胞类型或组织中的作用 探究SLC38A2在血压调节中的作用及其作为高血压治疗靶点的潜力 小鼠模型(全球和内皮细胞特异性基因敲除)、大鼠模型(高血压诱导)、以及两个人群队列(中国队列和UK Biobank欧洲队列) 机器学习 高血压 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、临床队列数据 包括小鼠和大鼠的多个实验组,以及两个独立人群队列(中国队列和欧洲UK Biobank队列,具体样本量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序分析
1095 2026-08-06
Targeting immune microenvironment in cervical cancer: current research and advances
2025-08-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 本文全面综述了宫颈癌肿瘤免疫微环境的细胞和分子组成,包括免疫细胞浸润模式、免疫检查点分子和细胞因子/趋化因子网络,并系统评估了免疫治疗策略及其临床疗效与挑战 强调利用高分辨率空间图谱和单细胞测序技术揭示免疫微环境异质性,并注重跨疾病阶段和治疗策略的差异分析 未能提供具体的实验数据或临床案例,主要基于现有研究文献进行综述 提供靶向免疫微环境以改善宫颈癌患者预后的转化医学视角 宫颈癌肿瘤免疫微环境及其中的免疫细胞、免疫检查点分子和细胞因子/趋化因子网络 免疫学 宫颈癌 单细胞测序, 空间转录组学 NA 文献资料 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1096 2026-08-06
Multi-omics data reveal that SAA1 + fibroblasts exacerbate periodontitis by regulating macrophage inflammation and chemotaxis
2025-08-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合多组学数据分析,揭示SAA1+成纤维细胞通过调控巨噬细胞炎症和趋化性加剧牙周炎的机制 首次利用单细胞RNA测序、空间转录组和批量转录组等多组学技术,系统描绘牙周炎微环境中细胞互作网络,并鉴定出具有促炎功能的SAA1+成纤维细胞亚群作为潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和细胞系,需进一步验证在人类牙周炎中的适用性;多组学数据来自公共数据库,可能受批次效应影响 利用多组学技术揭示牙周炎微环境中关键细胞群的调控机制,并寻找新的治疗靶点 牙周组织细胞(包括成纤维细胞、巨噬细胞等)及牙周炎模型小鼠 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量转录组测序 NA 基因表达数据, 空间转录组图像 65,979个牙周组织细胞(人类组织)及牙周炎模型小鼠(样本量未具体说明) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序 NA NA
1097 2026-08-06
Integrative multiomics analysis reveals the subtypes and key mechanisms of platinum resistance in gastric cancer: identification of KLF9 as a promising therapeutic target
2025-08-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合多组学分析揭示胃癌铂类耐药亚型及关键机制,并鉴定KLF9为潜在治疗靶点 首次利用相似性网络融合算法结合多组学数据对胃癌铂类耐药进行分子分型,并在单细胞和空间转录组水平验证耐药基因,同时通过机器学习构建预测模型 未提及具体局限性,可能包括样本量有限或缺乏体内实验验证 探索胃癌铂类耐药的分子亚型和关键机制,并寻找新的治疗靶点 胃腺癌患者样本、AGS细胞系 机器学习 胃癌 多组学分析、单细胞测序、空间转录组学、机器学习 相似性网络融合、机器学习预测模型 基因表达、甲基化、体细胞突变、单细胞和空间转录组数据 胃腺癌患者样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1098 2026-08-06
Fibro-NPC: a pathogenic subtype identified at single-cell resolution with secreted SFRP4 as a biomarker in intervertebral disc degeneration
2025-08-06, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
research paper 通过单细胞测序,本研究识别了椎间盘退变中的一个致病性亚型Fibro-NPC,并确立SFRP4作为其生物标志物 首次在单细胞分辨率下鉴定出纤维化相关髓核细胞(Fibro-NPC)作为椎间盘退变的致病亚型,并利用质谱分析和机器学习确定SFRP4为该亚型的关键分泌蛋白,为诊断和治疗提供了新靶点 样本量较小(仅五个椎间盘),且缺乏功能验证实验来直接证明SFRP4在退变过程中的因果作用 深入理解椎间盘退变的分子机制,特别是髓核细胞衰老和纤维化过程,以发现新的生物标志物和治疗靶点 来自五个退变椎间盘的髓核组织中的细胞,包括髓核细胞及其亚型 单细胞测序 椎间盘退变 单细胞RNA测序, 质谱分析 机器学习(具体模型未提及) 单细胞表达数据, 蛋白质组数据 5个椎间盘组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1099 2026-08-06
Single-cell RNA sequencing reveals a B cell-related immunosuppressive landscape and a potential suppressor in hepatocellular carcinoma
2025-07-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示肝细胞癌中B细胞相关的免疫抑制微环境,并鉴定SAA2为潜在的肿瘤抑制因子 首次通过单细胞转录组分析揭示B细胞在肝细胞癌微环境中通过脂质代谢参与免疫抑制,并鉴定SAA2作为新的肿瘤抑制因子 未在摘要中提及具体局限性,可能包括样本量小或缺乏体内验证 揭示肝细胞癌微环境中B细胞相关的免疫抑制景观,并发现新的治疗靶点 肝细胞癌组织和对应的非癌组织中的B细胞和肝细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组化、蛋白质印迹 NA 单细胞转录组数据、临床组织样本 未明确说明样本数量,但包括HCC组织和对应非癌组织 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1100 2026-08-06
Exploration and Application of Malignant Cell Heterogeneity Analysis with Single-Cell Transcriptome Sequencing Technology
2025-Jul-24, Aging and disease IF:7.0Q1
综述 本文探讨了利用单细胞转录组测序技术分析恶性肿瘤细胞异质性的应用,强调将研究焦点从免疫和基质细胞转向肿瘤细胞本身的重要性 提出将单细胞RNA测序研究的重点从免疫和基质细胞转向恶性肿瘤细胞本身,以深入理解肿瘤发生机制和治疗弱点 未明确指出具体局限性,但暗示当前对肿瘤细胞异质性研究不足 阐述单细胞转录组测序技术在分析恶性肿瘤细胞异质性中的应用,并呼吁转变研究范式以关注肿瘤细胞 恶性肿瘤细胞及其异质性 单细胞转录组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA NA NA NA
回到顶部