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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2026-04-10 |
CREBBP Mutation as a Culprit for Negative SSTR2 PET in Neuroendocrine Tumors
2025-Oct, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-025-02040-1
PMID:40779286
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研究论文 | 本研究旨在揭示导致神经内分泌肿瘤68Ga-DOTATATE PET成像阴性的分子和遗传因素 | 首次通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序,揭示了CREBBP突变与SSTR2表达阴性/低表达及PET成像阴性之间的关联 | 回顾性研究,样本量较小(18例患者),需要更大规模的前瞻性研究验证 | 阐明神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET成像阴性的分子遗传机制 | 肺、回肠或胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 单细胞体细胞变异检测, PET/CT成像 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 医学影像数据 | 18例神经内分泌肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 1062 | 2026-04-10 |
Autophagy Upregulation in Mutant Isocitrate Dehydrogenase 1 (IDH1) Glioma Uncovers a Novel Therapeutic Target
2025-Sep-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7483444/v1
PMID:40964044
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研究论文 | 本研究揭示了突变型异柠檬酸脱氢酶1(mIDH1)胶质瘤中自噬上调作为关键生存途径,并探索了通过自噬抑制增强放射敏感性的新治疗策略 | 首次发现mIDH1胶质瘤中自噬上调作为能量来源,并利用合成蛋白纳米颗粒递送siRNA靶向Atg7抑制自噬,从而增强放射敏感性并诱导肿瘤消退 | 研究主要基于人类和小鼠细胞模型及小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及小鼠模型 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 1063 | 2026-04-10 |
Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412159122
PMID:40324076
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了特发性正常压力脑积水患者外周血和脑脊液的细胞图谱,揭示了与认知功能下降相关的免疫失调 | 首次创建了特发性正常压力脑积水的单细胞转录组图谱,并发现了外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变与认知功能的相关性 | 样本仅来自特发性正常压力脑积水患者,缺乏健康对照组或其他神经系统疾病对照 | 探究特发性正常压力脑积水的免疫失调机制及其与认知功能的关系 | 特发性正常压力脑积水患者的外周血和脑脊液细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 140,207个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1064 | 2026-04-10 |
Single-cell transcriptomic analysis identified resistant MDSCs and a stress-tolerant gene co-expression network as common MDSC features across multiple disease settings
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565211
PMID:40264770
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析,识别了在多种疾病环境中常见的耐药性MDSCs和一个应激耐受基因共表达网络,作为MDSC的共同特征 | 首次结合炎症信号和细胞应激(血清饥饿)诱导出具有保留MDSC特征的细胞群(耐药性MDSCs),并识别了一个特异性于这些细胞的应激耐受基因共表达模块 | 研究主要基于体外诱导模型和已发表的转录组数据集,可能未完全反映体内复杂环境 | 识别跨多个疾病环境的MDSC共同分子特征,以帮助细胞分类 | 人源单核细胞性MDSCs(M-MDSCs)和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1065 | 2026-04-10 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
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综述 | 本文综述了调节性T细胞(Treg)疗法在治疗自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病和促进器官移植耐受方面的应用,并探讨了如何从临床样本和数据中学习以优化Treg疗法 | 整合了临床样本数据与先进的多组学监测技术(如单细胞多组学分析、表观遗传分析和空间转录组学),以优化Treg疗法作为“活体药物” | NA | 优化调节性T细胞疗法,以建立跨多种临床环境的免疫耐受 | 调节性T细胞(Treg),包括多克隆、抗原特异性、转化型、TCR工程化和CAR工程化Treg | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床样本数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 1066 | 2026-04-09 |
Selective Activation of Na V 1.3 Restores Lymphatic Contractility in Age and Injury
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694435
PMID:41446152
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研究论文 | 本文研究了NaV 1.3通道在成年淋巴肌肉中的选择性表达及其在恢复老龄和辐射损伤中淋巴收缩功能的作用 | 首次发现NaV 1.3在成年淋巴肌肉中特异性表达,并证明其选择性激活可恢复老龄和损伤后的淋巴泵功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据有限,且Tf2在辐射损伤中的恢复效果仅为部分 | 探索NaV 1.3在淋巴肌肉生理中的作用,并测试其激活是否可改善老龄和辐射损伤中的淋巴泵功能 | 小鼠和人类淋巴管、淋巴肌肉细胞 | 生物医学研究 | 淋巴功能障碍 | 单细胞RNA测序、免疫染色、体内荧光淋巴造影、生物发光测定 | NA | 基因表达数据、图像数据、生理测量数据 | 年轻、老龄和辐射损伤小鼠,以及人类淋巴管样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1067 | 2026-04-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Accumulation of Fcgr2b + Virtual Memory-Like CD8 T Cells With Cytotoxic and Inflammatory Potential in Aged Mouse White Adipose Tissue
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70278
PMID:41116748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,揭示了老年小鼠白色脂肪组织中Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累及其细胞毒性和炎症潜力 | 首次在老年小鼠白色脂肪组织中鉴定出Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞,并证明其具有细胞毒性和促炎功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;样本量相对有限 | 比较生理衰老与高脂饮食诱导肥胖对白色脂肪组织免疫细胞组成的影响,以识别不同的调控靶点 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织基质血管组分中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 来自年轻正常饮食、年轻高脂饮食和老年正常饮食小鼠的性腺白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1068 | 2026-04-09 |
Gene context drift identifies drug targets to mitigate cancer treatment resistance
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.005
PMID:40578362
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RECODR的计算流程,通过结合单细胞RNA测序谱的共表达图网络和图嵌入方法,测量癌症治疗期间基因共表达上下文的变化,以识别耐药机制并设计有效联合治疗方案 | RECODR首次将基因共表达上下文变化(而非仅表达水平)作为核心指标,结合图网络和图嵌入技术,揭示了传统计算方法无法检测的耐药机制 | 方法主要基于单细胞RNA测序数据,可能未涵盖其他分子层面的耐药机制,且临床验证仍需进一步扩展 | 开发计算工具以预测和缓解癌症治疗耐药性,通过分析基因共表达上下文变化来设计有效联合治疗方案 | 癌症治疗耐药机制,聚焦于脉络丛癌、髓母细胞瘤和三阴性乳腺癌的肿瘤样本 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图网络和图嵌入方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1069 | 2026-04-09 |
Axon targeting of transcriptionally distinct pioneer neurons is regulated by retinoic acid signaling
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61044-1
PMID:40593691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼后侧线感觉神经元中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的异质性,并发现视黄酸信号下调对先驱神经元轴突正确靶向至关重要 | 首次通过单细胞RNA测序证明先驱神经元与跟随神经元是转录上不同的群体,并揭示视黄酸信号在调节先驱神经元轴突靶向中的关键作用 | 研究仅基于斑马鱼后侧线感觉神经元模型,结果在其他神经系统或物种中的普适性有待验证 | 探究神经系统发育过程中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的差异及其调控机制 | 斑马鱼后侧线感觉神经元,包括先驱神经元和跟随神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1070 | 2026-04-09 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白在宿主防御利什曼原虫感染中的作用,通过平衡骨髓细胞中的iNOS/Arg-1表达来促进寄生虫控制 | 首次揭示了GBPs在皮肤利什曼病中的关键作用,通过调节iNOS和Arg-1的表达平衡来影响寄生虫生长环境,独立于GBPs的寄生虫定位 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;体外实验可能无法完全模拟体内复杂免疫环境 | 探究GBPs在皮肤利什曼病免疫防御机制中的具体作用 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠的骨髓来源巨噬细胞和单核细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠的骨髓细胞 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1071 | 2026-04-09 |
Global and Current Research Trends of Single-Cell Sequencing in Cancer: A Bibliometric and Visualization Study
2025-04-18, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67880
PMID:40323789
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综述 | 本文通过文献计量学和可视化方法,系统分析了2010年至2023年间癌症单细胞测序领域的研究趋势、合作网络和知识传播 | 首次对癌症单细胞测序领域进行了大规模、跨时间维度的文献计量学与可视化分析,揭示了该领域的全球研究格局、核心贡献者及前沿方向 | 分析基于Web of Science数据库,可能未涵盖所有相关出版物;文献计量方法主要反映数量与关联,对研究质量的深度评估有限 | 阐明癌症单细胞测序领域的研究趋势、国际合作网络及知识传播路径 | 2010年至2023年间Web of Science核心合集中收录的癌症单细胞测序相关学术出版物 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献元数据 | 5,680篇出版物,涉及34,074位作者、3,129个机构、75个国家/地区及788种学术期刊 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1072 | 2026-04-09 |
An Efficient Method for Extracting Human Fallopian Tube Epithelia for Single-cell Analyses
2025-03-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67753
PMID:40228013
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研究论文 | 本文介绍了一种高效分离人输卵管上皮细胞用于单细胞分析的方法 | 开发了一种能在4-6小时内从新鲜输卵管中分离出高纯度上皮细胞单细胞悬液的新方法,减少了基质细胞污染 | 未明确说明该方法在疾病研究中的具体应用效果或长期培养的稳定性 | 建立一种高效分离人输卵管上皮细胞的方法,以支持单细胞分析等下游研究 | 人输卵管上皮细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞悬液 | 未指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1073 | 2026-04-09 |
Derivation of a Human Brain Organoid with Microglia Development
2025-01-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67491
PMID:39895643
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研究论文 | 本文开发了一种包含小胶质细胞发育的人类大脑类器官模型,用于研究早期神经免疫相互作用 | 通过将iPSC分化的高度纯化造血祖细胞整合到胚胎体中,成功构建了同时包含小胶质细胞和神经元的大脑类器官,克服了现有方法在细胞数量和质量上的不一致问题 | 未明确说明类器官中微胶质细胞与神经元相互作用的长期稳定性及模型在模拟特定神经疾病方面的验证程度 | 建立包含微胶质细胞的人类大脑类器官模型,以研究早期神经免疫相互作用及神经炎症疾病 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)衍生的造血祖细胞和大脑类器官 | 数字病理学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序(sc-RNA-seq)、免疫染色 | 3D类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1074 | 2026-04-07 |
Comprehensive Spatial Profiling of Species-agnostic Transcriptomes via Stereo-seq
2025-10-31, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68619
PMID:41248068
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Stereo-seq的空间物种无关转录组分析方法,用于FFPE组织,通过随机探针方法实现亚细胞分辨率 | 该方法采用随机引物进行空间条形码,不同于标准空间转录组学方法,能同时检测宿主和非宿主RNA,包括微生物、病毒和真菌RNA | 协议需考虑环境和处理污染物对组织内外RNA的区分影响 | 开发一种空间物种无关的转录组分析技术,以研究细胞类型和病原物种的相互作用 | FFPE组织中的宿主和非宿主RNA,包括细菌、病毒和真菌RNA | 空间转录组学 | NA | 空间物种无关转录组分析,随机探针方法 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq方法使用0.22 µm大小的随机捕获珠,每0.5 µm在阵列中重复,实现基于测序的亚细胞分辨率 |
| 1075 | 2026-04-07 |
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-10-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69122
PMID:41212768
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研究论文 | 本文介绍了一种从接受体外受精个体中系统收集和处理卵泡液、卵泡体细胞及未成熟卵母细胞的标准化实验方案 | 开发了无需酶法脱颗粒的卵丘细胞分离方法以保持转录组完整性,并建立了从新鲜卵泡液制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 | 方案依赖于辅助生殖技术过程中产生的废弃生物材料,样本获取受临床流程限制 | 建立标准化方案以利用辅助生殖技术产生的生物副产物研究卵巢生理学 | 人类卵泡内容物(卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞、颗粒细胞等) | 生殖生物学 | 生殖功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、密度梯度离心、体外卵母细胞成熟 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子、激素、代谢物、环境毒物数据 | 未明确说明具体样本数量,但方案适用于接受取卵手术的女性个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1076 | 2026-04-07 |
Single-cell RNA sequencing defines developmental progression and reproductive transitions of Pneumocystis carinii
2025-Oct-07, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01277-25
PMID:40853149
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术首次绘制了卡氏肺孢子虫的发育进展和生殖转变图谱 | 首次应用单细胞RNA测序技术构建卡氏肺孢子虫的转录组图谱,揭示了其生命周期的关键发育阶段和生殖转变过程 | 研究依赖于从感染大鼠中分离的病原体,可能无法完全模拟人类感染环境,且无法进行连续培养验证 | 阐明卡氏肺孢子虫的生命周期和生殖转变机制 | 卡氏肺孢子虫(Pneumocystis carinii) | 数字病理学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 87,716个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | NA |
| 1077 | 2026-04-07 |
SARS-CoV-2 induced immune perturbations in infants vary with disease severity and differ from adults' responses
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59411-z
PMID:40379618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和血清分析,揭示了SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应特征,并与成人进行比较 | 首次系统研究重症COVID-19住院婴儿的免疫反应,发现婴儿与成人在T细胞和B细胞中的干扰素刺激基因签名存在显著差异 | 样本量较小(n=26),且仅针对住院婴儿,可能无法代表所有感染婴儿群体 | 探究SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应差异及其与疾病严重程度和成人反应的比较 | SARS-CoV-2感染的婴儿(n=26,包括亚急性、中度和重症)及匹配的对照组婴儿(n=14) | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),血清细胞因子分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,血清浓度数据 | 40名婴儿(26名感染,14名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1078 | 2026-04-07 |
RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08542-2
PMID:39910313
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肺纤维化中LEPR成纤维细胞通过肺泡成纤维细胞向病理成纤维细胞转化的机制,并发现RUNX2是调控该过程的关键因子 | 首次发现SCUBE2肺泡成纤维细胞是LEPR成纤维细胞的主要成分,并证明RUNX2是调控纤维化基因表达的关键转录因子 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;未探讨其他潜在细胞来源对病理成纤维细胞的贡献 | 探究肺纤维化中病理成纤维细胞的来源及其调控机制 | 小鼠肺组织中的LEPR成纤维细胞、SCUBE2肺泡成纤维细胞和CTHRC1POSTN病理成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 两个小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1079 | 2026-04-07 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2025-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55725-6
PMID:39755735
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通路通过调控R2反转录转座子表达,在果蝇生殖系中协调跨代核糖体DNA拷贝数维持的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2表达的主要抑制因子,并揭示了饮食调控通过胰岛素通路影响rDNA拷贝数扩张的跨代遗传机制 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性仍需验证 | 探究生殖系中核糖体DNA拷贝数维持的调控机制 | 果蝇雄性生殖干细胞及其核糖体DNA | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1080 | 2026-04-07 |
Optimized methods for scRNA-seq and snRNA-seq of skeletal muscle stored in nucleic acid stabilizing preservative
2025-Jan-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07445-2
PMID:39755918
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研究论文 | 本文开发了一种从保存在Allprotect® Tissue Reagent中的人类骨骼肌组织中获取高质量细胞和细胞核的优化方法,用于单细胞RNA测序和单核RNA测序 | 开发了一种从存档组织(特别是保存在核酸稳定保存剂中的骨骼肌)中获取高质量单细胞基因组材料的新协议,解决了新鲜起始材料需求的障碍 | 流式细胞分选虽然能富集更高质量的细胞和细胞核,但会导致总体输入材料减少 | 优化单细胞RNA测序和单核RNA测序方法,以从存档组织中获取高质量基因组材料 | 人类骨骼肌组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |