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当前共找到 10549 篇文献,本页显示第 1061 - 1080 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1061 2026-02-09
Precision T cell correction platform for inborn errors of immunity
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9和同源定向修复的T细胞单核苷酸变异精确校正平台,用于治疗先天性免疫缺陷病 开发了一种高效的T细胞单核苷酸变异校正平台,通过同源定向修复实现高达80%的校正率,并在多个IEI模型中验证了功能校正,同时通过多组学安全分析未检测到基因组、转录组或蛋白质组异常 该平台可能不适用于晚期疾病、严重炎症或急性感染患者,且目前仅针对特定单基因免疫缺陷病模型进行了验证 开发一种精确的基因编辑平台,用于治疗先天性免疫缺陷病,特别是通过校正T细胞来替代造血干细胞移植 T细胞,以及STAT1功能获得性突变、软骨毛发发育不全、ADA2缺乏症和自身免疫性多内分泌病-念珠菌病-外胚层营养不良等IEI模型 基因编辑与细胞治疗 先天性免疫缺陷病 CRISPR-Cas9基因编辑,同源定向修复,GUIDE-seq,单细胞RNA测序,长读长基因组测序,蛋白质组学分析 NA 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序,长读长基因组测序 NA NA
1062 2026-02-09
Prediction of cell states and key transcription factors of the human cornea through integrated single-cell omics analyses
2025-Aug, PNAS nexus IF:2.2Q1
研究论文 本研究通过整合多个已发表的人类角膜单细胞RNA-seq数据,创建了一个角膜细胞状态元图谱,并开发了机器学习工具cPredictor进行细胞状态注释,同时结合染色质可及性数据识别关键转录因子 整合多个单细胞RNA-seq研究数据创建统一的人类角膜细胞状态元图谱,开发了cPredictor机器学习流程进行细胞状态注释,并首次将单细胞转录组数据与染色质可及性数据整合进行基因调控网络分析 研究依赖于已发表数据,可能存在批次效应;cPredictor的准确性需要在更多独立数据集中验证;多能干细胞来源的角膜类器官与真实角膜的差异需要进一步研究 解决人类角膜研究中细胞状态注释不一致的问题,建立可靠的角膜细胞状态参考图谱 人类角膜组织、多能干细胞来源的角膜类器官 单细胞组学 角膜疾病 单细胞RNA-seq、染色质可及性分析、机器学习 机器学习管道(cPredictor) 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、免疫组化图像 整合了四个已发表研究的人类角膜单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1063 2026-02-09
Maintenance of chronic neuroinflammation in multiple sclerosis via interferon signaling and CD8 T cell-mediated cytotoxicity
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和T细胞受体测序,揭示了多发性硬化症中慢性神经炎症的维持机制,特别是干扰素信号和CD8 T细胞介导的细胞毒性作用 首次将放射学特征(PRL)与单细胞水平的免疫特征相关联,揭示了B细胞耗竭治疗后仍持续的CD8 T细胞介导的神经炎症机制,并提名了潜在治疗靶点 样本量相对有限(34名MS患者),且研究主要关注白质病变,未全面评估灰质或整个中枢神经系统的炎症情况 探究多发性硬化症中慢性神经炎症的分子和细胞机制,并寻找疾病进展的生物标志物和治疗靶点 多发性硬化症患者的脑脊液和血液免疫细胞,重点关注慢性活动性白质病变(CAL/PRL)相关的免疫特征 数字病理学 多发性硬化症 单细胞转录组测序(scRNAseq)、单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)、蛋白质组学、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 34名经放射学特征表征的多发性硬化症成人患者(17名未治疗,6名接受B细胞耗竭治疗)和5名健康对照 NA 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA NA
1064 2026-02-09
Identification of increased dedifferentiation along the Prom1+ cancer cells in Müllerian adenosarcoma with sarcomatous overgrowth
2025-Mar, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析,揭示了Müllerian腺肉瘤中Prom1+癌细胞亚群的异质性和去分化轨迹 首次在MASO中鉴定出Prom1+癌细胞沿发育轨迹的三个表型(分化样、中间样、去分化样),并发现HMGB2/3+亚型是主要的去分化样癌细胞,E2F1被确认为Prom1谱系去分化的关键转录因子 研究样本量较小(基于单细胞测序),且主要聚焦于Prom1谱系,可能未涵盖肿瘤的全部异质性 探究Müllerian腺肉瘤伴肉瘤样过度生长(MASO)的肿瘤病因和细胞异质性 MASO肿瘤组织及配对正常组织 数字病理学 子宫肉瘤 单细胞RNA测序,免疫组化,体外实验 轨迹分析,转录因子调控网络 单细胞RNA-seq数据,TCGA数据,图像数据 未明确样本数量,但涉及MASO和配对正常组织的单细胞测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1065 2026-02-09
Single-cell RNA sequencing via endoscopic ultrasound-guided fine-needle biopsy for pancreatic tumors uncovered an aggressive subclone with a poor prognosis
2025-Mar, ESMO gastrointestinal oncology
研究论文 本研究通过内镜超声引导下细针穿刺活检结合单细胞RNA测序技术,揭示了胰腺肿瘤中一个与不良预后相关的侵袭性亚克隆 首次利用内镜超声引导下细针穿刺活检样本进行单细胞RNA测序,成功识别出与胰腺癌晚期阶段相关的UBE2C高表达侵袭性亚克隆 样本量较小,仅对4名患者成功进行了单细胞RNA测序分析,可能影响结果的普遍性 评估内镜超声引导下细针穿刺活检用于单细胞RNA测序的可行性,并探索胰腺肿瘤的细胞异质性 胰腺肿瘤患者 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 20名患者,40份标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1066 2026-02-09
CRISPR-based genetic screens in human pluripotent stem cells derived neurons and brain organoids
2025-Jan, Cell and tissue research IF:3.2Q3
综述 本文综述了基于CRISPR的功能基因组学筛选方法在人类多能干细胞衍生的神经元和脑类器官中的应用,以研究神经发育障碍的发病机制 结合CRISPR基因筛选与单细胞RNA测序技术,揭示人类神经细胞中遗传变异的下游基因和细胞通路,为神经发育障碍提供新见解 存在当前挑战,如技术应用的限制和未来方向需进一步探索 利用CRISPR技术研究神经发育障碍的遗传机制和潜在治疗策略 人类多能干细胞衍生的神经元和脑类器官 自然语言处理 神经发育障碍 CRISPR基因编辑,单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1067 2026-02-09
A monocyte-derived blood transcriptomic signature reveals systemic immunosuppression in HCC and partial reversal following curative therapy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期肝细胞癌(HCC)诱导的系统性免疫抑制转录组特征,并发现治愈性治疗可部分逆转该特征,同时开发了一个源自单核细胞的23基因血液标志物,具有诊断和预后潜力 首次在早期HCC患者中通过纵向单细胞RNA测序(治疗前后)结合健康对照,系统描绘了肿瘤负荷及其切除对系统性免疫转录组的重塑,并鉴定出一个与肿瘤组织免疫抑制特征一致的CD14+单核细胞亚群及其23基因标志物 样本量较小(仅6名患者),治疗后随访时间较短(1-3个月),且未完全恢复至健康水平 阐明肿瘤负荷及其切除如何重塑系统性免疫转录组,并提取具有诊断和预后潜力的血液标志物 早期肝细胞癌(HCC)患者、健康对照者、外周血单个核细胞(PBMCs)、肿瘤及癌旁肝组织免疫细胞 单细胞组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、bulk PBMC转录组分析 NA 单细胞转录组数据、bulk转录组数据 6名早期HCC患者(治疗前后配对样本)及6名年龄匹配的健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1068 2026-02-09
Single-cell and machine learning integration reveals OS-driven CCND1 promotes an aggressive phenotype in papillary thyroid carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习方法,揭示了氧化应激驱动的CCND1在甲状腺乳头状癌中促进侵袭性表型的关键作用 首次在单细胞水平上系统评估了氧化应激与甲状腺乳头状癌的关系,并利用机器学习模型识别出CCND1、SOX4和TFF3作为关键生物标志物,同时通过体外实验验证了氧化应激直接驱动CCND1过表达的机制 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型,缺乏体内实验验证和临床样本的深入功能验证 识别甲状腺乳头状癌中与氧化应激相关的生物标志物,为临床诊断和治疗提供潜在靶点 甲状腺乳头状癌组织、正常甲状腺组织以及TPC-1细胞系 数字病理学 甲状腺乳头状癌 单细胞RNA测序, 机器学习, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析, CellChat分析, 蛋白质印迹, 免疫印迹, ROS检测, 细胞活力测定 机器学习模型 单细胞RNA测序数据, 独立验证数据集, 体外实验数据 未明确指定样本数量,但使用了PTC和正常甲状腺组织的单细胞RNA测序数据以及TPC-1细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1069 2026-02-08
EPI-SauriCas9-based mouse ovarian cancer models recapitulating pten deletion in patients
2025-Dec-29, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究开发并验证了使用EPI-SauriCas9系统构建的携带Pten和Trp53缺失的小鼠卵巢上皮模型(MEPP),用于模拟患者PTEN缺失的卵巢癌 利用EPI-SauriCas9系统创建了首个模拟PTEN和TP53缺失的小鼠卵巢癌模型,揭示了Pten缺失在促进肿瘤发生和转移中的作用,并通过单细胞RNA测序鉴定了具有不同转移潜能的独特上皮亚群 模型可能无法完全复制人类卵巢癌的所有复杂性,且研究主要聚焦于PTEN和TP53缺失的特定亚型 开发一个用于研究PTEN缺失卵巢癌的平台,并探索其肿瘤发生机制及潜在治疗方法 小鼠卵巢上皮细胞及由此衍生的肿瘤模型 癌症研究 卵巢癌 EPI-SauriCas9基因编辑系统,单细胞RNA测序,高通量药物筛选 基因编辑小鼠模型 基因表达数据,药物反应数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1070 2026-02-08
ScRNA profiling of peripheral blood in kidney transplant recipients across rejection responses and treatments
2025-Dec-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾移植受者外周血细胞,比较了不同排斥类型和治疗阶段的免疫细胞组成差异 首次提供了肾移植后不同排斥类型和治疗阶段的外周血单细胞转录组数据集,支持免疫细胞亚群的比较分析 样本量较小(仅5名参与者),且为初步分析,需要更大规模研究验证 探索肾移植受者外周血免疫细胞在排斥反应和免疫抑制治疗中的变化 肾移植受者的外周血细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 5名肾移植受者,98,595个质量控制通过的细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1071 2026-02-08
CIA: unveiling cellular identities with cluster-independent annotation in single-cell RNA sequencing data for comprehensive cell type characterization and exploration
2025-Dec-17, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CIA(Cluster Independent Annotation)的新型计算工具,用于在单细胞RNA测序数据中准确识别细胞类型,无需完全注释的参考数据集或复杂机器学习过程 开发了CIA工具,基于预定义细胞类型签名,提供用户友好且实用的单细胞类型和功能注释解决方案,支持Python和R语言,适用于所有主要单细胞分析框架 NA 解决单细胞RNA测序数据中细胞识别和分类的挑战,提供高效且可解释的细胞类型注释工具 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1072 2026-02-08
BGN Secreted by Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via Activation of TLR4-Mediated Erk and NF-κB Signaling Pathways
2025-Dec-13, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的BGN通过激活TLR4介导的Erk和NF-κB信号通路促进食管鳞状细胞癌进展 首次在ESCC中鉴定出CAF分泌的BGN是关键促癌因子,并阐明其通过TLR4受体激活Erk和NF-κB信号通路的分子机制 研究主要基于细胞系和体外共培养模型,缺乏体内动物实验验证;临床样本量有限(66例) 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的具体作用机制 食管鳞状细胞癌细胞系(TE-9、TE-10、TE-15)、间充质干细胞、66例ESCC组织样本 肿瘤生物学 食管鳞状细胞癌 cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 共培养模型 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 3个ESCC细胞系、间充质干细胞、66例ESCC组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1073 2026-02-08
Single-Cell transcriptomic profiles of peripheral blood immune cells reveal early monocyte and platelet activation in the transition from high-risk states to clinical sepsis
2025-Sep-25, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了外周血免疫细胞在脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中,单核细胞和血小板早期激活的转录组重编程特征 首次在单细胞水平上系统描绘了脓毒症进展过程中单核细胞和血小板的动态转录组变化,并发现了一个在多种高风险人群中一致、早期且持续上调的核心基因特征(S100A8, S100A9, IFITM2, IFITM3) 研究样本量相对有限,且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证 阐明从脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中的免疫细胞转录组变化特征 健康对照、脓毒症高风险个体、临床脓毒症患者的外周血免疫细胞,以及独立队列中的极早产脓毒症婴儿和老年糖尿病患者 单细胞组学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 健康对照、高风险个体、临床脓毒症患者,以及独立队列的极早产婴儿和老年糖尿病患者(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1074 2026-02-08
Immune-responsive gene 1: The mitochondrial key to Th17 cell pathogenicity in CNS autoimmunity
2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文探讨了免疫响应基因1(IRG1)在CNS自身免疫性疾病中调控致病性Th17细胞的关键作用 首次揭示IRG1通过NLRP3/IL-1β轴抑制巨噬细胞MHC II类表达,从而防止髓鞘特异性CD4+ T细胞向致病性Th17细胞极化 研究主要基于EAE动物模型,尚未在人类MS患者中直接验证IRG1的保护机制 阐明IRG1在CNS自身免疫性疾病中对致病性Th17细胞的调控机制 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中的免疫细胞(包括巨噬细胞、CD4+ T细胞、B细胞) 免疫学 多发性硬化症 RNA-seq,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确指定样本数量,使用EAE小鼠模型及基因敲除小鼠 NA RNA-seq,单细胞RNA测序 NA NA
1075 2026-02-08
A recurrent de novo damaging variant in EMP2 causes progressive symmetric erythrokeratoderma
2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文发现EMP2基因的一个反复出现的从头错义变异与进行性对称性红斑角化病相关,并通过单细胞空间转录组学揭示了其通过EGFR信号通路导致皮肤增厚的机制 首次将EMP2基因变异与进行性对称性红斑角化病联系起来,并利用单细胞空间转录组学技术揭示了突变导致EGFR信号通路异常激活的功能获得性机制 NA 研究遗传性皮肤疾病中导致皮肤增厚和红斑的基因变异及其分子机制 进行性对称性红斑角化病患者及其皮肤组织 数字病理学 皮肤疾病 单细胞空间转录组学,Western blotting NA 转录组数据,蛋白质数据 NA NA 单细胞空间转录组学 NA NA
1076 2026-02-08
Spatial Analysis of Hereditary Diffuse Gastric Cancer Reveals Indolent Phenotype of Signet Ring Cell Precursors
2025-Aug-04, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析遗传性弥漫性胃癌,揭示了早期印戒细胞病变的惰性表型及其与晚期胃癌的分子差异 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序,系统比较了CDH1变异携带者中早期印戒细胞病变与晚期弥漫性胃癌的分子特征,发现早期病变缺乏已知胃癌驱动基因突变 样本量较小(仅20例),且仅针对CDH1变异携带者,可能不适用于其他类型的胃癌 探究遗传性弥漫性胃癌中早期印戒细胞病变的分子表型及其与晚期胃癌的差异 人类全胃切除标本中的早期印戒细胞病变和晚期弥漫性胃癌组织 数字病理学 胃癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 20例人类全胃切除标本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
1077 2026-02-08
Longitudinal single-cell profiles of lung regeneration after viral infection reveal persistent injury-associated cell states
2025-Feb-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学结合谱系追踪技术,探索了小鼠肺部在流感损伤后的再生过程,揭示了不同细胞区室的异步响应和持久性损伤相关细胞状态 首次利用纵向单细胞转录组学结合谱系追踪,系统描绘了肺部损伤后的再生动态,并鉴定出一种持久存在的损伤诱导毛细血管内皮细胞(iCAP),该细胞状态与人类肺部退行性疾病中的内皮异常相似 研究基于小鼠模型,可能无法完全反映人类肺部再生过程;且未深入探讨iCAP细胞在疾病中的具体功能机制 理解肺部损伤后气体交换表面功能再生的细胞和分子机制,并探索其与人类发育和疾病的相关性 小鼠肺部细胞,特别是肺泡微环境中的细胞,包括损伤诱导的毛细血管内皮细胞(iCAP) 单细胞转录组学 肺部疾病 单细胞转录组学,谱系追踪 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1078 2026-02-07
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过多组学分析揭示了一种微生物-胆汁酸-TLR信号轴在间质性膀胱炎中驱动膀胱损伤的机制 首次整合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序,识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变,并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 研究主要基于实验模型验证,人类样本的直接临床转化和长期效果需进一步评估 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征(HIC)的上游驱动机制,以寻找生物标志物和靶向治疗机会 Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 多组学分析 间质性膀胱炎 宏基因组测序、靶向代谢组学、单细胞RNA测序 NA 基因组、代谢组、转录组数据 NA NA 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 NA NA
1079 2026-02-07
Construction of a single-cell transcriptome atlas for Pogostemon cablin embryoids reveals PcNAC048 as a dual regulator coordinating lateral root morphogenesis and patchouli alcohol biosynthesis
2025-Dec-29, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了广藿香胚状体的单细胞转录组图谱,揭示了PcNAC048作为协调侧根形态发生和广藿香醇生物合成的双重调控因子 首次在广藿香中应用单细胞RNA测序技术构建胚状体转录组图谱,并鉴定出PcNAC048作为同时调控发育和次生代谢的新转录因子 研究主要基于体外培养的胚状体,可能无法完全反映自然生长条件下的基因表达模式,且转基因验证仅在拟南芥中进行 探究广藿香胚状体发育的细胞分化轨迹及调控广藿香醇生物合成的分子机制 广藿香(Pogostemon cablin)的胚状体,包括球形胚、心形胚、鱼雷形胚和子叶胚 植物生物学 NA 单细胞RNA测序,酵母单杂交,双荧光素酶报告基因检测,病毒诱导基因沉默 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但包括球形胚和子叶胚阶段的单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1080 2026-02-07
CYP27A1 suppresses brain metastasis via ferroptosis in lung adenocarcinoma: a six-gene signature predicting the immunotherapy response and clinical outcomes
2025-Dec-10, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别了肺腺癌脑转移的分子驱动因素,构建了一个六基因预后模型,并验证了CYP27A1通过铁死亡抑制脑转移的功能 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据识别肺腺癌脑转移相关基因,构建了六基因预后模型,并揭示了CYP27A1通过调控铁死亡抑制脑转移的新机制 样本量相对较小(仅4例患者的单细胞数据),功能验证仅限于体外实验,缺乏体内模型验证 识别肺腺癌脑转移的分子驱动因素,构建预后模型并评估免疫治疗反应 肺腺癌患者及其脑转移相关细胞 数字病理学 肺癌 scRNA-seq, bulk RNA-seq LASSO Cox回归模型 基因表达数据 4例LUAD患者的scRNA-seq数据(GSE117570)和TCGA-LUAD队列的批量RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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