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当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2026-08-11 |
Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis
2025-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204307
PMID:40110772
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术创建了稳定敲除hepcidin（hamp）的斑马鱼模型，发现hamp缺失导致胚胎母体铁过载，下调血红蛋白基因并减少血红蛋白含量，通过单细胞RNA测序揭示了血液祖细胞中的异常表达模式和铁死亡现象。 | 首次利用CRISPR/Cas9系统构建稳定的斑马鱼hamp敲除模型，并结合单细胞RNA测序技术，揭示了hamp在胚胎造血中的关键作用，特别是发现特定血液祖细胞亚型中铁死亡和发育延迟的新机制。 | 研究仅基于斑马鱼模型，其结论在人类中的适用性需进一步验证；未详细探讨hamp调控铁代谢和造血的具体分子信号通路。 | 探究hepcidin在斑马鱼胚胎发育过程中对铁稳态和造血作用的影响。 | 斑马鱼胚胎及其血液祖细胞。 | 单细胞转录组学 | 血液疾病 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞RNA测序数据 | 研究所用样本为斑马鱼胚胎，具体数量未在标题和摘要中说明。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1042 | 2026-08-11 |
Insulin-like growth factor 2 as a driving force for exponential expansion and differentiation of the neonatal thymus
2025-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204347
PMID:40110795
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究小鼠胸腺基质，揭示成纤维细胞来源的胰岛素样生长因子2在新生胸腺快速扩张和分化中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示新生胸腺向稳态转变过程中主要转录组变化发生在内皮和间充质细胞，并鉴定出成纤维细胞来源的IGF2驱动胸腺皮质上皮细胞增殖和分化 | 研究主要基于小鼠模型，人体样本仅用于验证，可能限制了对人类胸腺生物学机制的全面理解 | 探究新生胸腺快速生长后停止的分子机制，特别是IGF2在胸腺扩张和分化中的作用 | 小鼠胸腺基质细胞及人类胸腺组织 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 研究包括小鼠胸腺基质细胞（多个时间点）和人类胸腺样本（跨时期） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1043 | 2026-08-11 |
Accurate trajectory inference in time-series spatial transcriptomics with structurally-constrained optimal transport
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644194
PMID:40166168
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研究论文 | 提出一种基于结构约束最优传输的轨迹推断方法SOCS，用于时间序列空间转录组数据，以保持生物学结构的完整性并提高轨迹推断的准确性 | 引入结构约束的最优传输方法，在轨迹推断中同时保持基因表达相似性、全局几何结构和生物学单元的空间连续性 | 未在摘要中提及明显局限性 | 开发一种能够在时间序列空间转录组数据中准确推断细胞发育轨迹的方法，并保持生物学结构的完整性 | 时间序列空间转录组数据中的发育轨迹，以及卵巢滤泡、肾小管和肾小球等空间连续结构单元 | 机器学习和空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 最优传输模型 | 空间转录组数据 | 未在摘要中指定具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1044 | 2026-08-11 |
Targeting Zfp36 to combat cardiac hypertrophy: Insights into ferroptosis pathways
2025-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70247
PMID:40000392
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研究论文 | 本研究探讨Zfp36在心肌肥大中通过调控铁死亡途径的作用机制，发现Zfp36通过Ythdc2/SLC7A11/GSH通路抑制铁死亡，减轻心肌肥大 | 首次证明Zfp36通过抑制心肌细胞铁死亡来减轻心肌肥大，并揭示其调控Ythdc2 mRNA降解进而影响SLC7A11表达的新机制 | 摘要中未提及具体研究局限性 | 探究Zfp36在心肌肥大相关铁死亡中的调控功能及其潜在机制 | 心肌细胞和心肌组织（经血管紧张素II处理或主动脉缩窄诱导） | 分子生物学 | 心肌肥大 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1045 | 2026-08-11 |
Topical TYK2 inhibitor ameliorates psoriasis-like dermatitis via the AKT-SP1-NGFR-AP1 pathway in keratinocytes
2025-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70256
PMID:40038877
|
研究论文 | 本研究探索了局部应用TYK2抑制剂BMS-986165对银屑病小鼠模型的治疗效果及其机制，发现其通过AKT-SP1-NGFR-AP1通路抑制角质形成细胞的炎症反应 | 首次探索了选择性TYK2抑制剂局部给药治疗银屑病的潜力，并揭示了一个未被充分研究的调控机制，即TYK2通过AKT-SP1-NGFR-AP1通路调控角质形成细胞炎症 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化性需进一步验证；局部给药的长期安全性和有效性未评估 | 评估局部应用TYK2抑制剂治疗银屑病的疗效，并阐明其潜在的作用机制 | 咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型及人角质形成细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、RNA测序、双荧光素酶报告基因、ChIP-qPCR | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠皮肤样本和人角质形成细胞，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1046 | 2026-08-11 |
Histone methyltransferase KMT2A promotes pulmonary fibrogenesis via targeting pro-fibrotic factor PU.1 in fibroblasts
2025-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70217
PMID:39888275
|
研究论文 | 本研究探讨组蛋白甲基转移酶KMT2A通过靶向促纤维化因子PU.1在成纤维细胞中促进肺纤维化的机制 | 首次揭示KMT2A通过催化H3K4me3修饰上调PU.1表达，促进肺纤维化，并验证KMT2A抑制剂可缓解纤维化，为IPF治疗提供新靶点 | 研究主要在动物模型和体外细胞中进行，缺乏临床患者样本验证，且未深入探讨KMT2A在其他细胞类型中的作用 | 探究KMT2A在肺纤维化发病机制中的作用及其作为IPF治疗靶点的潜力 | KMT2A阳性成纤维细胞、特发性肺纤维化组织、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型、原代纤维化成纤维细胞 | 表观遗传学 | 特发性肺纤维化 | 微阵列分析、单细胞测序、AAV6介导的基因敲低、染色质免疫沉淀 | 基因敲除小鼠模型、AAV6介导的基因敲低模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | IPF肺组织、博来霉素处理小鼠肺组织、成纤维细胞样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1047 | 2026-08-11 |
Monocyte-macrophage dynamics as key in disparate lung and peripheral immune responses in severe anti-melanoma differentiation-associated gene 5-positive dermatomyositis-related interstitial lung disease
2025-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70226
PMID:39902678
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了抗MDA5阳性皮肌炎相关间质性肺病患者外周和肺部截然不同的免疫景观，并强调了单核-巨噬细胞动态变化在免疫病理中的核心作用 | 首次描绘了严重抗MDA5阳性皮肌炎患者外周与肺部免疫反应的对比图谱，并揭示了循环单核细胞从免疫抑制表型向促炎和促纤维化的单核细胞来源肺泡巨噬细胞转化的动态过程 | 样本量较小（5例患者），且未提供健康对照组或疾病对照组的比较，可能限制结果的普适性 | 探究抗MDA5阳性皮肌炎合并快速进展性间质性肺病外周和肺部免疫失调的机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 抗MDA5阳性皮肌炎合并快速进展性间质性肺病患者的外周血单核细胞和支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞转录组学 | 皮肌炎相关间质性肺病 | 单细胞RNA测序, Luminex检测, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞表型数据 | 5例患者的支气管肺泡灌洗液和外周血单核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 1048 | 2026-08-11 |
Immune profiling of the macroenvironment in colorectal cancer unveils systemic dysfunction and plasticity of immune cells
2025-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70175
PMID:39934971
|
研究论文 | 通过CyTOF和RNA-seq等技术，对结直肠癌患者的肿瘤、血液及肠道不同区域的免疫宏环境进行免疫谱分析，揭示了免疫细胞的功能失调和可塑性 | 首次系统性地对结直肠癌免疫宏环境进行全面的免疫谱分析，识别出不同的免疫类型，并发现血液中PD-1和CD69在效应记忆CD8+ T细胞上的表达可作为预测三级淋巴结构存在的生物标志物 | 未明确提及局限性 | 表征结直肠癌免疫宏环境的免疫细胞异质性，并评估其对患者生存和免疫治疗反应的预测价值 | 结直肠癌患者的肿瘤、血液和肠道组织（包括正常肠壁和肿瘤邻近肠壁的上皮、固有层、黏膜下层、肌层） | 免疫学 | 结直肠癌 | CyTOF, RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 免疫细胞表型数据, 空间转录组数据 | 发现队列和验证队列（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 1049 | 2026-08-11 |
Single-cell transcriptomic atlas of different endometriosis indicating that an interaction between endometriosis-associated mesothelial cells (EAMCs) and ectopic stromal cells may influence progesterone resistance
2025-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70216
PMID:39968688
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术构建了不同类型子宫内膜异位症（腹膜型、深部浸润型和卵巢型）的转录组图谱，并探讨了细胞间通讯对孕激素抵抗的影响 | 首次系统描绘不同类型子宫内膜异位症的单细胞转录组图谱，发现卵巢型子宫内膜异位症中亦存在间皮细胞，并揭示间皮细胞通过FN1-AKT通路影响基质细胞孕激素抵抗的新机制 | 样本量较小（仅6例患者），且未对间皮细胞与基质细胞间的相互作用进行功能验证实验 | 探索不同类型子宫内膜异位症在细胞组成、分子特征及孕激素抵抗方面的差异及其潜在机制 | 来自6例患者的子宫内膜异位症手术活检样本，包括腹膜型、深部浸润型和卵巢型三种病理类型 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | 无 | 单细胞转录组数据 | 6例患者的手术活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1050 | 2026-08-11 |
Single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptomic analysis reveal a distinct population of APOE- cells yielding pathological lymph node metastasis in papillary thyroid cancer
2025-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70172
PMID:39810624
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，识别出甲状腺乳头状癌中与淋巴结转移相关的APOE阴性肿瘤细胞亚群，并探讨其分子机制 | 首次揭示APOE阴性肿瘤细胞亚群通过ABCA1-LXR轴调控肿瘤增殖和侵袭，并利用机器学习模型基于单细胞数据预测淋巴结转移 | 未明确提及研究的局限性 | 探索甲状腺乳头状癌的肿瘤内异质性和转移机制，识别与淋巴结转移相关的关键细胞亚群 | 甲状腺乳头状癌组织样本中的肿瘤细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1051 | 2026-08-11 |
Single-cell landscape of the intrahepatic ecosystem in alcohol-related liver disease
2025-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70198
PMID:39834100
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析酒精性肝病（ALD）患者和健康供体的肝脏组织，揭示了ALD不同阶段的细胞景观，并发现ALB+KRT7+上皮细胞具有干细胞特性和恶性转化潜力 | 首次描绘了人类ALD不同阶段的肝脏单细胞图谱，鉴定出表达肝细胞和胆管标志物的ALB+KRT7+上皮细胞群，并证明其通过激活Wnt/β-catenin信号促进肿瘤生长，提出靶向Wnt信号可预防晚期肝硬化恶变 | 摘要中未明确提及局限性 | 阐明酒精性肝病的分子机制，特别是细胞异质性和恶性转化风险 | 酒精性肝病患者的肝脏组织及健康供体的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1052 | 2026-08-11 |
Disturbed shear stress promotes atherosclerosis through TRIM21-regulated MAPK6 degradation and consequent endothelial inflammation
2025-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70168
PMID:39763069
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研究论文 | 本研究揭示了 disturbed shear stress 通过 TRIM21 介导的 MAPK6 降解促进动脉粥样硬化，并阐明了 MAPK6 通过 EGR1/CXCL12 轴调节内皮炎症的机制 | 首次揭示 MAPK6 在剪切应力和斑块形成中的未知作用，并阐明其通过 TRIM21 泛素化降解和 EGR1/CXCL12 轴的调控机制 | 未明确提及研究的局限性 | 阐明 MAPK6 在 disturbed shear stress 诱导的动脉粥样硬化中的作用及其上下游机制 | 内皮细胞、ApoE-/- 小鼠和 ApoE-/-MAPK6flox/floxTEKCre 小鼠 | 分子生物学 | 动脉粥样硬化 | RNA-seq、CO-IP、蛋白质组学分析、单细胞 RNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | 未明确提及 | RNA-seq、单细胞 RNA-seq | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 1053 | 2026-08-09 |
The High Expression of PD-1 Defines A Subpopulation of Tfh Cells Responding to COVID-19 Vaccine in Humans
2025-12-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf019
PMID:40080696
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术，探究了COVID-19疫苗加强接种后，表达PD-1的Tfh细胞亚群的激活与持久性及其对抗体反应的促进作用 | 识别出具有高表达PD-1和IFN-γ的cTfh细胞亚群，并开发了定制算法来识别病毒诱导的T细胞受体，以深入探究病毒诱导的CD4+ T细胞反应 | 研究仅限于人类样本，且未明确探讨PD-1high cTfh细胞长期持久性的具体机制 | 了解COVID-19疫苗加强接种后cTfh细胞如何辅助抗体产生，为优化疫苗策略提供见解 | 人类外周血中的CD4+ T细胞，特别是cTfh细胞亚群 | 免疫学、单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞测序、流式细胞术 | 轨迹分析算法 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1054 | 2026-08-09 |
Human fetal kidney organoids model early human nephrogenesis and Notch-driven cell fate
2025-Sep, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00504-2
PMID:40691416
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研究论文 | 建立了一种化学定义、无血清的延长培养人类胎儿肾脏类器官的协议，该类器官能自我组织为极性肾上皮，并重现早期人类肾发生和Notch驱动的细胞命运决定 | 首次提供了可持续培养的人类胎儿肾脏类器官模型，用于基准PSC衍生类器官，并通过单细胞分析揭示Notch抑制下的成熟阻滞和新型prominin-1表达细胞状态 | 摘要中未明确提及局限性，可能包括类器官培养的复杂性和体内外差异 | 建立人类胎儿肾脏类器官模型以研究人类肾脏发育和疾病，并评估Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 人类胎儿肾脏衍生的类器官（hFKOs） | 干细胞生物学, 再生医学 | 肾脏疾病 | bulk转录组学, 单细胞RNA测序, 伪时间分析, 免疫染色 | 类器官模型 | 转录组数据, 单细胞表达数据, 图像数据 | NA（摘要中未提供样本数量） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1055 | 2026-08-09 |
Controlling Human Stem Cell-Derived Islet Composition Using Magnetic Sorting
2025-Aug, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29030
PMID:40400171
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研究论文 | 本研究利用磁性激活细胞分选技术，通过CD49a标记富集干细胞来源胰岛中的β细胞，改善其组成和功能，为1型糖尿病细胞替代治疗提供新方法 | 首次采用磁性激活细胞分选（MACS）基于CD49a标记对干细胞来源胰岛（SC-islets）进行细胞组成控制，显著提高β细胞比例和转录同一性，并在体内外增强葡萄糖刺激的胰岛素分泌 | 摘要未提及具体局限性 | 探讨通过磁性分选控制干细胞来源胰岛的细胞组成，以提高β细胞同一性和整体功能，优化1型糖尿病的细胞替代治疗 | 人多能干细胞来源的胰岛（SC-islets） | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1056 | 2026-08-09 |
Mechanistic study of CTHRC1 in promoting Wilms' tumor progression by regulating M2-type tumor-associated macrophages polarization
2025-07-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06752-4
PMID:40629408
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研究论文 | 本研究探讨CTHRC1通过调控M2型肿瘤相关巨噬细胞极化促进肾母细胞瘤进展的分子机制 | 首次揭示CTHRC1通过TNFSF9-TNFRSF9轴诱导M2-TAMs极化，进而激活PI3K/Akt通路促进肾母细胞瘤进展的新机制 | 未提及具体局限性 | 研究CTHRC1在肾母细胞瘤进展中的作用及其通过调控M2型肿瘤相关巨噬细胞极化促进肿瘤恶性的分子机制 | 肾母细胞瘤组织、细胞系及异种移植模型 | 机器学习 | 肾母细胞瘤 | RT-qPCR, Western blot, 免疫组化, 免疫荧光, 转录组测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、免疫细胞浸润数据、单细胞测序数据、转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1057 | 2026-08-09 |
Uncovering key markers and therapeutic targets for renal fibrosis in diabetic kidney disease through bulk and single-cell RNA sequencing
2025-07-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06554-8
PMID:40615901
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research paper | 通过批量与单细胞RNA测序揭示糖尿病肾病肾纤维化的关键标志物和治疗靶点 | 首次结合WGCNA、ssGSEA、机器学习与单细胞RNA测序构建FibrosisScore模型，并识别出PROM1和THY1作为肾纤维化的关键基因，同时通过ZINC数据库筛选和分子对接发现潜在治疗化合物 | 研究主要基于数据分析和动物模型验证，缺乏大规模临床样本的多中心验证，且分子对接结果需进一步的实验验证 | 识别糖尿病肾病中肾纤维化的关键基因标志物，构建预测模型，并探索潜在治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的转录组数据、链脲佐菌素（STZ）诱导的DKD小鼠模型以及临床数据（来自Nephroseq V5数据库） | machine learning, digital pathology | diabetic kidney disease | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, WGCNA, ssGSEA, molecular docking | FibrosisScore model (ssGSEA-based), machine learning models | gene expression data, single-cell transcriptomic data, clinical data, molecular docking data | 两个DKD数据集（样本数未明确给出），STZ小鼠模型，临床数据未指明样本量 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1058 | 2026-08-09 |
Dynamic WT1 expression during gastrulation specifies peritoneal smooth muscle fate independently of mesothelial fate
2025-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204332
PMID:40554754
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研究论文 | 本研究揭示了WT1在小鼠原肠胚形成期间的动态表达，独立于间皮命运指定腹膜平滑肌细胞命运，并影响肠道血管化 | 首次发现WT1在小鼠原肠胚形成期间的动态表达，并证明其独立于间皮命运指定平滑肌细胞命运，提供了关于平滑肌发育谱系的新见解 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及人类样本，且对WT1表达调控机制及其与疾病关联的探讨有限 | 探究WT1表达在小鼠原肠胚形成期间对腹膜平滑肌细胞命运指定的作用及其与间皮细胞命运的关系 | 小鼠胚胎原肠胚形成期间的细胞，特别是表达WT1的前体细胞及其衍生的平滑肌细胞 | 发育生物学 | NA | 基因谱系追踪、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠胚胎在不同发育阶段（E7.5、E8.5、E12.5）的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序数据集的生成 |
| 1059 | 2026-08-09 |
One probe fits all: a highly customizable modular RNA in situ hybridization platform expanding the application of SABER DNA probes
2025-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204775
PMID:40446186
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研究论文 | 介绍了一种高度可定制的模块化RNA原位杂交平台OneSABER，该平台基于SABER DNA探针，统一了多种常见和新兴的原位杂交方法，适用于多种样本类型。 | OneSABER是一个统一开放平台，使用单一类型的DNA探针，兼容多种原位杂交技术，简化了实验流程并降低了成本，具有高灵活性和广泛适用性。 | 主要局限于所测试的样本类型和物种，可能需要进一步验证在其他模型或临床样本中的适用性。 | 开发一种统一、开放且高效的RNA原位杂交平台，以简化多种ISH技术的应用并扩大SABER探针的使用范围。 | 再生扁虫Macrostomum lignano和Schmidtea mediterranea的全组织样本以及福尔马林固定、石蜡包埋的小鼠肠道切片。 | 分子生物学 | 不适用 | RNA原位杂交（ISH），包括单重和多重、比色和荧光方法，基于SABER信号放大技术 | 不适用 | 图像 | 两种扁虫物种的全组织样本和一种小鼠肠道组织切片。 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 1060 | 2026-08-09 |
HemaScope: A Tool for Analyzing Single-cell and Spatial Transcriptomics Data of Hematopoietic Cells
2025-05-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf002
PMID:39862439
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研究论文 | 介绍HemaScope，一个专门用于分析造血细胞单细胞和空间转录组数据的生物信息学工具包，提供多种用户友好形式。 | HemaScope采用模块化设计，整合了单细胞和空间转录组数据分析功能，特别针对造血细胞特征（如谱系归属评估、细胞周期预测和标志基因收集），并提供多种部署形式（R包、网页服务器、Docker镜像和图形界面）。 | 未在摘要中提及局限性。 | 开发一个专业且用户友好的工具包，用于分析造血细胞的单细胞和空间转录组数据，以促进对造血细胞异质性和空间特征的研究。 | 造血细胞的单细胞和空间转录组数据，包括人类骨髓、小鼠急性髓系白血病细胞、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤和原发中枢神经系统淋巴瘤样本。 | 生物信息学 | 急性髓系白血病、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、原发中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明，但包括人类骨髓、小鼠和淋巴瘤样本。 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |