单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10543 篇文献,本页显示第 1041 - 1060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1041 2026-04-12
Flow Cytometry and Single-Cell Analysis for Characterizing Microglia Activation in Early Postnatal Mouse Brain Development
2025-10-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种结合流式细胞术和单细胞RNA测序的互补方法,用于研究小鼠小脑组织中小胶质细胞在早期出生后大脑发育中的激活状态 为早期出生后大脑组织优化了流式细胞术方案,并首次将相同的上游细胞分离步骤与10X Genomics单细胞RNA测序结合,提供了一个可重复且适应性强的框架来研究小胶质细胞的多样性 协议主要针对小鼠小脑组织,其通用性在其他脑区或物种中可能需要进一步验证;单细胞测序部分仅在区分性别样本时应用了随机森林分类器,功能分析可能有限 研究早期出生后大脑发育中小胶质细胞的激活特征和多样性 小鼠小脑组织中的小胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 流式细胞术 随机森林 基因表达数据, 细胞表面标记物数据 未明确说明具体样本数量,但涉及早期出生后小鼠脑组织 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10X Genomics 未指定具体产品型号,但遵循10X Genomics单细胞RNA测序流程
1042 2026-04-12
Epigenetic dynamics and molecular mechanisms in oncogenesis, tumor progression, and therapy resistance
2025-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
综述 本文综述了癌症发生、进展和治疗抵抗中涉及的遗传、表观遗传及分子机制 整合了分子、遗传和表观遗传视角,并强调了CRISPR-Cas9表观基因组编辑和单细胞RNA测序等前沿技术在理解癌症异质性中的作用 作为一篇综述,不包含原始实验数据或新的模型验证 阐明癌症发生、进展和治疗抵抗的复杂机制,为开发创新性靶向治疗提供理论基础 癌症(肿瘤) NA 癌症 CRISPR-Cas9介导的表观基因组编辑,单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1043 2026-04-12
Lung NR3C1+ and CXCR6high T cells distinguish immunopathogenesis of human emphysema
2025-Sep-24, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了肺气肿中T细胞的免疫病理机制,特别是NR3C1+和CXCR6high CD4 T细胞亚群的作用 首次通过单细胞RNA测序结合临床数据,识别出肺气肿中特定的T细胞亚群(NR3C1+和CXCR6high CD4 T细胞),并揭示了它们与肺功能保留的关联,为肺气肿的免疫治疗提供了新靶点 研究基于两个独立的单细胞RNA测序数据集,样本量可能有限,且机制验证需要进一步的实验研究 探究T细胞在吸烟者慢性阻塞性肺疾病(COPD)肺气肿中的免疫病理作用 人类肺组织样本,包括肺气肿性COPD、非肺气肿性COPD和对照组的免疫细胞 数字病理学 肺气肿 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 两个独立的人类肺组织单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1044 2026-04-12
Post-Liver Transplantation Management and Specimen Collection in Daurian Ground Squirrels for Single-Cell RNA Sequencing
2025-09-16, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文详细介绍了针对达乌尔黄鼠肝移植后的动物护理、生理监测以及用于单细胞RNA测序的高质量肝移植物样本制备标准化流程 利用冷适应性达乌尔黄鼠作为新型肝移植模型,以研究低温诱导的移植物损伤机制,填补了传统啮齿动物模型的局限 协议主要针对达乌尔黄鼠这一特殊物种,可能在其他生物中的普适性有限,且未涉及大规模临床验证 开发并标准化肝移植后管理及样本收集方法,以促进对移植功能恢复和免疫兼容性机制的研究 达乌尔黄鼠的肝移植物样本 数字病理学 肝移植相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、组织病理学检查 NA RNA序列数据、组织样本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1045 2026-04-12
Mining Spatial Transcriptomics Datasets using DeepSpaceDB
2025-09-05, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了DeepSpaceDB数据库,一个用于空间转录组学数据探索的综合动态数据库,并通过示例展示了其工作流程和应用 开发了DeepSpaceDB数据库,提供高级工具和交互功能,促进空间转录组学数据的访问和深入分析 空间转录组学仍是一种高度专业化的实验技术,存在显著的技术和财务限制 促进空间转录组学数据的访问和分析,以探索组织结构和疾病生物学 小鼠脑样本和鼠肝中的结直肠癌转移区域与健康组织区域 空间转录组学 结直肠癌 空间转录组学 NA 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1046 2026-04-12
Development of Drug-resistant Cell Lines for Experimental Procedures
2025-08-12, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了用于实验程序的耐药细胞系的开发方法及其在癌症治疗研究中的应用 系统描述了通过逐步增加药物浓度诱导耐药细胞系的方法,并强调这些模型可用于多种高通量分析和体内外实验 未提及具体癌症类型或药物种类,方法描述较为通用,缺乏特定实验数据支持 开发耐药细胞系以研究癌症治疗中的耐药机制并寻找克服治疗失败的策略 癌症细胞系(具体类型未指定) NA 癌症(未指定具体类型) 细胞活力测定、非线性回归分析、微阵列、单细胞测序 NA 实验数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
1047 2026-04-12
Using R, Seurat, and CellChat to Analyze a Single-Cell Transcriptomics Dataset of Mouse Skin Wound Healing
2025-08-01, Journal of visualized experiments : JoVE
方法学论文 本文提供了一个使用R、Seurat和CellChat分析小鼠皮肤伤口愈合单细胞转录组数据集的逐步可视化工作流程 为缺乏生物信息学背景的伤口愈合科学家提供了一个图形化编码环境下的详细、可视化单细胞分析协议,旨在降低技术门槛 主要是一个方法学指南,依赖于已发表的数据集,未提出新的生物学发现或算法 旨在使更多伤口愈合科学家能够在自己的实验室中直接使用生物信息学工具,以促进对其自身单细胞数据集的深入分析以及对已发表数据集的更广泛再分析 小鼠皮肤伤口愈合过程中的细胞 生物信息学 皮肤伤口愈合 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1048 2026-04-12
Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours
2025-07, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过识别并表征蓝斑核周围异质性的GABA能神经元群,揭示了它们如何调控蓝斑核功能,进而控制全局觉醒水平和相关行为 首次在蓝斑核树突场中识别出一群在转录组、空间分布和功能上均具有多样性的GABA能神经元,并阐明了它们通过接收远程输入、调节蓝斑核放电模式来控制觉醒和探索行为的新机制 NA 探究局部神经调制输入如何控制蓝斑核功能,以及蓝斑核及其周围神经元在调控觉醒、回避状态和相关行为中的具体作用 小鼠的蓝斑核及蓝斑核周围区域的神经元 神经科学 神经精神疾病 病毒示踪,单细胞RNA测序,空间转录组学,神经环路研究方法 NA 转录组数据,空间定位数据,行为数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1049 2026-04-12
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究构建了一个多维策略,用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后和反应 通过整合基因组特征(如序列熵和突变)与肿瘤免疫微环境(如单细胞转录组数据中的细胞通讯分析),开发了集成模型EM-CXCL10,其预测性能优于传统指标如肿瘤突变负荷 样本量相对较小(60名患者),且部分分析基于公共单细胞数据集(GSE125449),可能限制模型的泛化能力 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗(抗PD-1)的反应和预后,以指导个性化临床决策 晚期胆道癌患者 机器学习 胆道癌 520基因面板测序、多重循环细胞因子检测、单细胞转录组测序 LASSO算法、Cox回归 基因组序列数据、细胞因子数据、单细胞转录组数据 60名晚期胆道癌患者,其中30名进行基因面板测序,50名进行细胞因子检测 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1050 2026-04-12
Single-cell analysis of CD14+CD16+ monocytes identifies a subpopulation with an enhanced migratory and inflammatory phenotype
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析人类CD14+CD16+单核细胞,识别出一个具有增强迁移和炎症表型的亚群,该亚群可能对神经炎症疾病有重要贡献 首次在CD14+CD16+单核细胞中通过单细胞RNA测序识别出具有独特迁移和炎症特征的亚群(Group 1单核细胞),并关联其与神经炎症疾病的潜在机制 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏体内验证和临床样本的直接证据 探究CD14+CD16+单核细胞的异质性及其在神经炎症疾病中的作用 人类CD14+CD16+单核细胞 数字病理学 神经炎症疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1051 2026-04-11
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2025-12-31, Biostatistics (Oxford, England)
研究论文 本文开发了一种名为scGBM的新方法,用于单细胞RNA-seq数据的模型降维,以解决标准方法可能引入虚假异质性和掩盖真实生物变异的问题 提出基于泊松双线性模型的scGBM方法,通过快速估计算法实现大规模数据集的可扩展性,并量化细胞潜在位置的不确定性以评估聚类置信度 未明确提及具体局限性,但暗示现有直接建模方法在计算上难以处理大型数据集且不量化低维表示的不确定性 开发一种模型降维方法,以更好地捕获单细胞RNA-seq数据中的生物信息并去除不需要的变异 单细胞RNA-seq数据 机器学习 NA 单细胞RNA-seq 泊松双线性模型 计数矩阵 数百万个细胞的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1052 2026-04-11
The cell-type-specific genetic architecture of chronic pain in brain and dorsal root ganglia
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过整合慢性疼痛的GWAS数据与人类大脑、背根神经节的单细胞RNA-Seq数据,以及人类大脑和小鼠背角的单细胞染色质可及性数据,揭示了慢性疼痛在脑和外周神经系统中的细胞类型特异性遗传结构 首次系统性地整合了GWAS与单细胞多组学数据,识别了慢性疼痛相关遗传变异在特定神经元亚型(如谷氨酸能神经元和hPEP.TRPV1/A1.2神经元)中的富集,并揭示了中枢与外周神经系统中细胞类型特异性的遗传机制 研究主要基于关联分析,未进行功能验证实验;数据来源包括小鼠模型,可能不完全反映人类生物学;样本量在单细胞分析中可能有限 阐明慢性疼痛的细胞类型特异性遗传结构,为靶向转化研究提供基础 人类大脑、背根神经节(hDRG)、小鼠背角组织 生物信息学 慢性疼痛 GWAS, 单细胞RNA-Seq, 单细胞染色质可及性分析 NA 基因组关联数据, 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1053 2026-04-11
Promoting astrocyte-neuron triiodothyronine shuttling attenuates brain damage in neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了新生儿缺氧缺血性脑病中星形胶质细胞与神经元之间的转录耦合,并发现了一个具有神经保护特性的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群,其耗损与疾病相关,而增强该亚群或外源性T3递送可促进神经修复并改善行为功能 首次在全脑单细胞转录组水平上识别并功能表征了HIE中一个具有代谢和神经保护特征的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群,揭示了其耗损动态及T3介导的星形胶质细胞-神经元交互机制作为治疗靶点 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证;单细胞测序和蛋白质组学分析可能受技术偏差影响;长期治疗效果和潜在副作用需更深入评估 探索新生儿缺氧缺血性脑病的病理机制,并寻找基于星形胶质细胞-神经元交互的治疗策略 出生后第7天的大鼠幼崽(通过Rice-Vannucci模型诱导缺氧缺血性脑损伤),以及体外氧糖剥夺处理的星形胶质细胞 神经科学 新生儿缺氧缺血性脑病 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,多重免疫荧光,ELISA,Western blotting,激光散斑对比成像,组织病理学,Morris水迷宫测试 NA 转录组数据,蛋白质组数据,图像数据,行为数据 大鼠幼崽模型及体外细胞样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1054 2026-04-11
Quantum annealing for enhanced feature selection in single-cell RNA sequencing data analysis
2025-Dec, Quantum machine intelligence IF:4.1Q2
研究论文 本研究探索了量子退火在单细胞RNA测序数据特征选择中的应用,以识别与细胞分化和抗癌药物耐药性相关的关键基因 首次将量子退火赋能的二次无约束二进制优化方法应用于单细胞RNA测序数据的特征选择,能够揭示传统方法可能遗漏的复杂基因表达模式 未明确说明量子退火与传统方法在计算效率或准确性方面的量化比较,也未讨论该方法在其他类型单细胞数据中的适用性 开发一种基于量子退火的增强型特征选择方法,以改进单细胞RNA测序数据的分析和解释 人类细胞分化系统和抗癌药物耐药性研究中的单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 量子退火赋能的二次无约束二进制优化 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1055 2026-04-11
Patient phenotyping for molecular profiling of neck and low back pain - Study protocol
2025 Jul-Dec, Neurobiology of pain (Cambridge, Mass.)
研究论文 本文介绍了针对慢性颈痛和腰痛患者进行分子特征分析的研究方案,旨在通过表型分型促进转录组学发现 结合全面的患者表型分型与多组学技术(包括单细胞和空间转录组学),在人类疼痛背景下研究分子神经生物学机制 研究依赖于手术获取的组织样本,可能无法完全代表所有慢性疼痛患者群体,且控制组织来自器官捐献者,可能存在匹配偏差 通过分子特征分析,揭示慢性颈痛和腰痛的分子神经生物学和神经免疫学机制,以发现治疗靶点 接受C1-2和腰椎融合手术的慢性颈痛和腰痛患者,以及器官捐献者的对照组织 数字病理学 慢性疼痛 转录组学 NA 组织样本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
1056 2026-04-11
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,绘制了人类皮肤老化过程中表皮和真皮细胞衰老的图谱,并探讨了衰老细胞在光老化和时序老化中的作用 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并通过单细胞和空间分析揭示了衰老细胞在皮肤中的聚集趋势及其对色素沉着和胶原合成的影响 NA 通过细胞衰老的视角表征与年龄相关的皮肤功能障碍 人类皮肤中的表皮细胞(如黑色素细胞)和真皮细胞(如网状真皮成纤维细胞) 数字病理学 皮肤老化 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1057 2026-04-11
RARS1 inhibits ENO1 ubiquitination and degradation to protect against ferroptosis in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了RARS1基因在肝细胞癌进展中的作用,揭示了其通过调控ENO1泛素化与降解来抑制铁死亡,并作为潜在的治疗靶点 首次将RARS1与ENO1的泛素化降解及铁死亡抑制联系起来,并基于AR-DEGs对LIHC进行分子亚型分类,识别了AH.6809作为潜在RARS1抑制剂 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内模型验证,且临床转化潜力需进一步评估 探究RARS1在肝细胞癌进展中的功能机制及其作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者数据、LIHC细胞系 生物信息学与分子生物学 肝细胞癌 差异表达分析、Cox回归分析、非负矩阵分解、转录组学、单细胞测序、空间转录组学、分子生物学技术 NA 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1058 2026-04-10
Reversing lysosomal dysfunction restores youthful state in aged hematopoietic stem cells
2025-Dec-04, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究揭示了溶酶体功能障碍是造血干细胞衰老的关键驱动因素,通过抑制溶酶体过度活化可恢复老年造血干细胞的年轻状态 首次发现老年造血干细胞中溶酶体呈现过度酸化、耗竭、损伤和异常激活状态,并证明通过抑制v-ATPase逆转溶酶体功能障碍可显著恢复造血干细胞的再生能力 研究主要在体外和小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 探究溶酶体在造血干细胞衰老中的作用机制,并寻找恢复老年造血干细胞功能的干预策略 老年造血干细胞 干细胞生物学 血液系统疾病 单细胞转录组学、功能分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1059 2026-04-10
Standardized metrics for assessment and reproducibility of imaging-based spatial transcriptomics datasets
2025-Dec-03, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究通过生成Spatial Touchstone数据集,评估了Xenium和CosMx平台在成像空间转录组学中的标准化指标,并开发了SpatialQM软件以促进数据评估和整合 首次提出了标准化指标和操作程序(STSOPs)以及开源软件SpatialQM,用于评估成像空间转录组学技术的可重复性和性能,并建立了多组学数据整合的最佳实践 研究仅评估了Xenium和CosMx两个平台,可能未覆盖所有成像空间转录组学技术;样本来源和数量(254个空间谱)可能限制通用性 评估成像空间转录组学技术的标准化指标,提高数据可重复性和跨平台比较能力 六种组织类型的空间转录组学数据,使用Xenium和CosMx平台进行分析 空间转录组学 NA 成像空间转录组学,原位杂交技术 NA 空间转录组学数据,图像数据 254个空间谱,涵盖六种组织类型 10x Genomics, NanoString 空间转录组学,单细胞分析 Xenium, CosMx Xenium和CosMx平台用于成像空间转录组学分析,具有不同的化学方法
1060 2026-04-10
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过比较血浆蛋白质组学和单细胞转录组学,描述了HIV-1治疗停止后病毒反弹前的免疫反应特征 发现病毒反弹前CD16++单核细胞显著增加并具有增强的抗病毒基因表达,以及血浆中炎症蛋白在可检测反弹后出现 研究样本可能有限,且未详细探讨长期临床影响或治疗策略的具体验证 识别治疗停止后病毒反弹前的早期信号,以延长病毒反弹时间并治愈HIV-1 外周血单个核细胞和血浆样本 单细胞转录组学 HIV-1感染 单细胞转录组学, 血浆蛋白质组学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部