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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10521 | 2024-12-23 |
The prognostic significance and potential mechanism of PFDN4 in hepatocellular carcinoma
2025-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113761
PMID:39644788
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研究论文 | 本研究探讨了PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对预后的影响和潜在机制 | 首次系统研究了PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对肿瘤进展的影响,并揭示了其通过MAPK/ERK信号通路调控肝细胞癌行为的机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏更大规模的临床样本验证 | 探讨PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对预后的影响和潜在机制 | PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对肿瘤进展的影响 | NA | 肝细胞癌 | CCK-8, EdU, 伤口愈合, Transwell, 蛋白质印迹, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 多个数据库和临床样本, 稳定敲低和过表达PFDN4的肝细胞癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 10522 | 2024-12-23 |
An Integrative analysis of single-cell RNA-seq, transcriptome and Mendelian randomization for the Identification and validation of NAD+ Metabolism-Related biomarkers in ulcerative colitis
2025-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113765
PMID:39647286
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、转录组数据和孟德尔随机化分析,识别和验证了与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)代谢相关的生物标志物在溃疡性结肠炎中的作用 | 首次通过多组学数据整合和孟德尔随机化分析,识别并验证了NAD+代谢相关基因在溃疡性结肠炎中的生物标志物作用 | 研究依赖于现有数据集,可能存在样本偏倚和外部验证不足的问题 | 探索NAD+代谢相关基因在溃疡性结肠炎中的潜在作用,并验证其作为生物标志物的可行性 | NAD+代谢相关基因在溃疡性结肠炎中的表达模式及其作为生物标志物的潜力 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、孟德尔随机化分析、实时定量聚合酶链反应 | 机器学习 | 基因表达数据 | 使用了GSE87466、GSE75214和GSE224758等多个数据集,样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 10523 | 2024-12-23 |
MSR1 in lung squamous cell carcinoma: Prognostic and immunological values in pan-cancer and single-cell analyses and a cohort study
2025-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113811
PMID:39667048
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞清道夫受体1(MSR1)在肺鳞状细胞癌(LUSC)中的预后和免疫学价值 | 首次系统分析了MSR1在泛癌和单细胞水平上的表达及其与免疫细胞浸润的关系,并验证了其在LUSC中的预后和诊断潜力 | 研究主要基于数据库分析和队列研究,缺乏体内实验验证 | 探讨MSR1在LUSC中的预后和免疫学价值,并评估其作为诊断和预后标志物的潜力 | MSR1在肺鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 49,566名UK Biobank参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 10524 | 2024-12-23 |
Transcriptomic heterogeneity of non-beta islet cells is associated with type 2 diabetes development in mouse models
2025-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06301-6
PMID:39508880
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研究论文 | 本研究探讨了非β细胞在胰腺胰岛中早期2型糖尿病发病机制中的作用 | 揭示了非β细胞在不同糖尿病易感性小鼠模型中的转录异质性,并发现这种异质性与人类2型糖尿病的发展相关 | 研究主要基于小鼠模型和人类胰岛数据,可能无法完全反映人类2型糖尿病的复杂性 | 理解非β细胞在胰腺胰岛中早期2型糖尿病发病机制中的作用 | 肥胖小鼠模型和人类胰岛中的非β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自肥胖小鼠和人类胰岛的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 10525 | 2024-12-23 |
Osteoarthritis year in review 2024: Genetics, genomics, and epigenetics
2025-Jan, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.10.014
PMID:39537019
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综述 | 本文综述了过去12个月在骨关节炎遗传学、基因组学和表观遗传学领域的进展 | 本文介绍了功能基因组学研究的增加,并确定了26个与骨关节炎病理相关的新基因,以及单细胞转录组学和两种新的组学技术(表观转录组学和线粒体基因组学)的应用 | 本文仅关注使用全基因组组学技术的人类材料研究 | 总结过去一年在骨关节炎遗传学、基因组学和表观遗传学领域的最新进展 | 骨关节炎的遗传学、基因组学和表观遗传学研究 | 基因组学 | 骨关节炎 | 全基因组组学技术、单细胞转录组学、表观转录组学、线粒体基因组学 | NA | 基因组数据 | 涉及多种骨关节炎相关组织的人类材料 | NA | NA | NA | NA |
| 10526 | 2024-12-23 |
GraCEImpute: A novel graph clustering autoencoder approach for imputation of single-cell RNA-seq data
2025-Jan, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109400
PMID:39561511
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研究论文 | 本文提出了一种基于图聚类自编码器(GCAE)的新方法GraCEImpute,用于单细胞RNA测序数据中的缺失数据插补 | GraCEImpute模型在插补单细胞RNA测序数据中的缺失值方面优于现有方法,并显著提高了下游分析的质量 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中由于技术限制导致的高丢失率问题 | 单细胞RNA测序数据中的缺失数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图聚类自编码器(GCAE) | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10527 | 2024-12-23 |
Identification of IFITM3 as a diagnostic biomarker of systemic lupus erythematosus and its association with disease activity based on multi-omics and experimental verification
2025-Jan, Lupus
IF:1.9Q3
DOI:10.1177/09612033241304454
PMID:39629611
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研究论文 | 本研究旨在通过多组学和实验验证,识别系统性红斑狼疮的诊断生物标志物IFITM3,并探讨其与疾病活动的关系 | 首次通过多组学分析和实验验证,发现IFITM3在系统性红斑狼疮患者中的表达显著上调,并具有诊断价值和与疾病活动相关的潜力 | 研究样本量相对较小,且仅限于特定人群,未来需要更大规模的研究来验证结果 | 识别系统性红斑狼疮的新型诊断生物标志物,并探讨其与疾病活动的关系 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照组的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | RNA-seq, 定量实时聚合酶链反应, 蛋白质印迹, 流式细胞术 | NA | RNA数据 | 68名系统性红斑狼疮患者和31名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 10528 | 2024-12-23 |
The impact of PTEN status on glioblastoma multiforme: A glial cell type-specific study identifies unique prognostic markers
2025-Jan, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109395
PMID:39531927
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研究论文 | 本研究分析了PTEN状态对胶质母细胞瘤的影响,通过单细胞转录组和批量RNA表达谱数据,识别了与PTEN状态相关的独特分子通路和预后标志物 | 首次在胶质细胞类型水平上分析了PTEN状态对胶质母细胞瘤的分子机制,并识别了与PTEN状态相关的独特预后标志物 | 研究依赖于公开的单细胞和批量RNA表达数据,可能无法完全代表所有胶质母细胞瘤患者的情况 | 探讨PTEN状态对胶质母细胞瘤的分子机制及其在不同胶质细胞类型中的预后标志物 | PTEN野生型和缺失型的胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组分析,批量RNA表达谱分析 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | RNA表达数据 | 公开的单细胞转录组和批量RNA表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 10529 | 2024-12-23 |
Integrative multi-omics analysis of Crohn's disease and metabolic syndrome: Unveiling the underlying molecular mechanisms of comorbidity
2025-Jan, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109365
PMID:39541897
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了克罗恩病和代谢综合征之间的潜在分子机制 | 本研究首次通过多组学分析揭示了克罗恩病和代谢综合征之间的共享基因及其在免疫反应和代谢调节中的作用 | 本研究主要依赖于公共数据库中的微阵列数据,可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 揭示克罗恩病和代谢综合征之间的潜在分子机制 | 克罗恩病和代谢综合征的共享基因及其功能 | 生物信息学 | 消化系统疾病 | 微阵列数据分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建、随机森林、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归、极端梯度提升(XGBoost)算法、CIBERSORT、基因集变异分析(GSVA)、孟德尔随机化分析、共定位分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 极端梯度提升(XGBoost) | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的微阵列数据 | NA | NA | NA | NA |
| 10530 | 2024-12-21 |
A diagnostic signatures for intervertebral disc degeneration using TNFAIP6 and COL6A2 based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analyses
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2443568
PMID:39704340
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析,识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路 | 首次通过单细胞和批量RNA测序结合的方法,识别出TNFAIP6和COL6A2作为椎间盘退变的诊断标志物,并验证了ZEB2作为转录因子在调控这些关键基因中的潜在作用 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在样本偏倚和数据质量问题 | 识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路,以辅助诊断和预测疾病活动 | 椎间盘退变病例的生物标志物和信号通路 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、批量RNA测序、RT-qPCR、免疫组化(IHC) | NA | RNA | 多个数据集(GSE70362、GSE124272)和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10531 | 2024-12-21 |
Genomic and cell-specific regulation of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in opium poppy
2025-Jan-01, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae317
PMID:39046316
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综述 | 本文综述了罂粟中苯基异喹啉生物碱(BIA)生物合成的基因组和细胞特异性调控机制 | 本文强调了基因组测序、单细胞和空间转录组学的最新进展,并探讨了这些技术如何帮助我们更好地理解BIA生物合成的调控机制 | 本文主要为综述性质,未提供新的实验数据或研究结果 | 探讨罂粟中BIA生物合成的基因组和细胞特异性调控机制,为罂粟的遗传改良和代谢工程提供理论基础 | 罂粟中的苯基异喹啉生物碱(BIA)生物合成 | NA | NA | 基因组测序、单细胞和空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10532 | 2024-12-21 |
Aberrant neurodevelopment in human iPS cell-derived models of Alexander disease
2025-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24618
PMID:39308436
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研究论文 | 本研究探讨了Alexander疾病患者来源的诱导多能干细胞(iPS细胞)在神经发育中的异常表现 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,首次在AxD患者来源的iPS细胞衍生的神经类器官和共培养体系中观察到神经元和星形胶质细胞的分化异常,并揭示了突变GFAP对细胞分化和基因表达的影响 | 研究主要集中在GFAP突变对神经元和星形胶质细胞的影响,未深入探讨其他细胞类型的变化 | 探讨GFAP突变对Alexander疾病患者神经发育的影响 | AxD患者来源的iPS细胞衍生的神经元和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | AxD患者来源的iPS细胞衍生的神经元和星形胶质细胞共培养体系及神经类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 10533 | 2024-12-20 |
Characterisation of the tumour microenvironment and PD-L1 granularity reveals the prognostic value of cancer-associated myofibroblasts in non-invasive bladder cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2438291
PMID:39698899
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研究论文 | 研究分析了非肌肉浸润性膀胱癌(NMIBC)的肿瘤微环境(TME)组成和PD-L1表达,并探讨了癌症相关肌成纤维细胞(myoCAF)的预后价值 | 首次系统分析了NMIBC的肿瘤微环境组成,并揭示了myoCAF在预测疾病进展和复发中的潜在预后价值 | 研究样本量有限,且仅限于NMIBC患者,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨NMIBC的肿瘤微环境特征及其在治疗预后中的作用 | NMIBC患者的肿瘤和非肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学分析、组织微阵列 | NA | 组织 | 73名NMIBC患者及888名独立队列患者 | NA | NA | NA | NA |
| 10534 | 2024-12-20 |
VNN2 regulates hepatic steroid synthesis in response to dietary changes
2025-Feb-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.149128
PMID:39613052
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研究论文 | 研究探讨了VNN2在鸡肝脏中对脂质代谢和类固醇合成的调控作用 | 首次揭示了VNN2通过上调MSMO1和FDPS促进类固醇合成的机制 | 研究仅在鸡肝脏中进行,未涉及其他物种或组织 | 研究VNN2在肝脏脂质代谢和类固醇合成中的具体功能 | 鸡肝脏中的VNN2表达及其对脂质代谢和类固醇合成的影响 | NA | NA | RNA测序、qPCR、甘油三酯和总胆固醇检测 | NA | RNA测序数据 | 使用了多个数据集,包括GSM5764402、GSM5764403、GSE128340、GSE129840和PRJEB44038 | NA | NA | NA | NA |
| 10535 | 2024-12-20 |
Clinical Implications of Basic Research: Exploring the Transformative Potential of Spatial 'Omics in Uro-oncology
2025-Jan, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2024.08.025
PMID:39227262
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研究论文 | 本文探讨了空间'组学技术在泌尿肿瘤学中的临床应用潜力 | 本文介绍了新的空间分子技术,通过绘制肿瘤的空间分子结构,揭示了肿瘤内部和周围的复杂异质性,为疾病的发展、进展、诊断和治疗提供了新的见解 | 当前的挑战包括试剂成本高、协议标准化和计算需求大 | 探索空间'组学技术在泌尿肿瘤学中的转化潜力,推动个性化癌症治疗的未来 | 泌尿系统肿瘤 | 数字病理学 | 泌尿系统肿瘤 | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 基因组,转录组,蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10536 | 2024-12-19 |
Abatacept Induces Long-Term Reconstitution of the B-Cell Niche in a Patient With CTLA-4 Haploinsufficiency: A Case Report
2025-Mar, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200351
PMID:39689284
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病例报告 | 本文报告了一例CTLA-4单倍体不足患者在接受abatacept治疗后,B细胞微环境长期重建的病例 | 首次展示了abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中对骨髓功能的长期影响,并通过单细胞RNA测序验证了B细胞的重建 | 由于是单一病例报告,缺乏对照组,证据级别较低 | 探讨abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中的长期疗效及其对骨髓功能的影响 | 一名39岁CTLA-4单倍体不足女性患者,伴有中枢神经系统受累、多器官自身免疫和淋巴细胞减少 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 10537 | 2024-12-19 |
Dedifferentiation of vascular smooth muscle cells upon vessel injury
2025-Jan-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113691
PMID:39591824
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程及其机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了血管平滑肌细胞在健康和病理状态下的复杂多样性 | NA | 探讨血管损伤后血管平滑肌细胞去分化的动态过程及其机制 | 血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10538 | 2024-12-18 |
A bipolar disorder-associated missense variant alters adenylyl cyclase 2 activity and promotes mania-like behavior
2025-Jan, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02663-w
PMID:39003412
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研究论文 | 本文研究了与双相情感障碍相关的单核苷酸多态性rs13166360对腺苷酸环化酶2(ADCY2)活性和小鼠狂躁样行为的影响 | 首次展示了ADCY2错义突变通过改变亚细胞定位降低酶生成第二信使cAMP的能力,并建立了携带该突变的小鼠模型,揭示了其与狂躁样行为和认知障碍的关系 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨ADCY2基因突变与双相情感障碍的关联及其潜在机制 | ADCY2基因突变对小鼠行为和神经生物学过程的影响 | NA | 双相情感障碍 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 携带ADCY2基因突变的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 10539 | 2024-12-15 |
Modulating Treg cell activity in prostate cancer via chitosan nanoparticles loaded with si-BATF/PRDM1
2025-Jan-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113445
PMID:39577215
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研究论文 | 本研究探讨了通过装载si-BATF/PRDM1的壳聚糖纳米颗粒调节调节性T细胞活性以抑制前列腺癌发展的潜力 | 首次展示了壳聚糖纳米颗粒在体内外实验中有效递送siRNA,抑制BATF和PRDM1表达,从而抑制肿瘤生长和转移 | 研究主要集中在体外和体内实验,尚未进行临床试验验证其疗效 | 探索通过调节Treg细胞活性来抑制前列腺癌发展的方法 | 前列腺癌中的Treg细胞活性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、基因沉默 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 10540 | 2024-12-15 |
ITGB4/GNB5 axis promotes M2 macrophage reprogramming in NSCLC metastasis
2025-Jan-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113564
PMID:39577216
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研究论文 | 研究探讨了ITGB4/GNB5轴在调节M2巨噬细胞重编程及影响非小细胞肺癌(NSCLC)转移中的作用和潜在机制 | 首次揭示了ITGB4/GNB5轴通过促进M2巨噬细胞极化,增强其在肿瘤微环境中的功能,从而促进NSCLC的侵袭和转移 | 研究主要集中在体外细胞实验和体内小鼠模型,尚未在临床样本中验证其机制 | 探讨ITGB4/GNB5轴在NSCLC转移中的作用及其分子机制 | 非小细胞肺癌(NSCLC)中的M2巨噬细胞及其相关分子ITGB4和GNB5 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序技术、流式细胞术、免疫组化、RNA测序、蛋白质组分析 | NA | 单细胞数据、RNA数据、蛋白质数据 | 包括体外细胞实验和体内小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |