单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10796 篇文献，本页显示第 10461 - 10480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10461 | 2025-10-07 |
Multiomics identify the gene expression signature of the spinal cord during aging process
2025-Feb-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07475-4
PMID:39920442
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了衰老过程中脊髓的基因表达特征及其与铁死亡抵抗的关系 | 首次结合空间转录组学和批量RNA测序技术系统揭示衰老脊髓的转录组特征，发现Fth1基因在衰老混合胶质细胞铁死亡抵抗中的核心作用 | 研究主要聚焦于基因表达层面，对蛋白质水平和功能验证仍需进一步深入 | 探索衰老过程中脊髓的分子变化特征及其生物学意义 | 年轻和衰老的小鼠脊髓组织及混合胶质细胞 | 多组学分析 | 衰老相关疾病 | 批量RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, CCK-8检测, siRNA, 慢病毒实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞功能数据 | 年轻和衰老的脊髓组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10462 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiles of single-cell autophagy-related genes (ATGs) in lung diseases
2025-Feb-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-09990-w
PMID:39920481
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究自噬相关基因在肺部疾病中的转录组图谱 | 首次在单细胞水平系统揭示自噬相关基因在多种肺部疾病中的表达异质性和细胞类型特异性变化 | 研究主要关注转录组水平变化，未验证蛋白质功能；外部刺激实验仅限于细胞系模型 | 阐明自噬相关基因在肺部疾病发生发展中的作用机制 | 健康人群和肺部疾病患者的肺组织样本，包括COVID-19相关急性肺损伤、特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺疾病、系统性硬化症和肺腺癌 | 单细胞转录组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康受试者和多种肺部疾病患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10463 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
|
研究论文 | 基于NK细胞标记基因构建并验证了预测结直肠癌免疫治疗反应和预后的特征模型 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据构建基于NK细胞标记基因的预后特征，用于预测结直肠癌免疫治疗反应 | 验证队列样本量有限（共325个样本），需要更多独立队列验证 | 构建预测结直肠癌免疫治疗反应和预后的生物标志物特征 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, LASSO回归分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据 | 训练集587个TCGA样本，验证集两个GEO队列共325个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10464 | 2025-10-07 |
Mural cell dysfunction contributes to diastolic heart failure by promoting endothelial dysfunction and vessel remodelling
2025-Feb-07, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02623-w
PMID:39920783
|
研究论文 | 本研究探讨了壁细胞功能障碍通过促进内皮功能障碍和血管重塑在舒张性心力衰竭中的作用机制 | 首次探索了壁细胞在HFpEF中的作用，建立了新的糖尿病db/db小鼠高盐HFpEF模型，揭示了壁细胞通过TNFα依赖性旁分泌信号诱导内皮细胞生长停滞的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 研究壁细胞功能障碍在心力衰竭伴保留射血分数发病机制中的作用 | 糖尿病db/db小鼠和PDGFRβtg/tg-CreERT2-EYFPtg/tg转基因小鼠 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, NichetNet分析, 组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10465 | 2025-10-07 |
Decoding SFRP2 progenitors in sustaining tooth growth at single-cell resolution
2025-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04190-z
PMID:39920788
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了SFRP2hi成纤维祖细胞在维持牙齿持续生长中的关键作用 | 首次识别出小鼠切牙和人类磨牙发育牙根中特有的Sfrp2hi成纤维祖细胞群，并阐明其通过Twist1调控Wnt信号通路维持干细胞特性的分子机制 | 将小鼠牙齿研究发现应用于人类疾病的研究仍不够充分 | 构建全面的牙髓细胞图谱，阐明人类与小鼠之间的组织相似性和物种特异性差异 | 人类和小鼠的牙髓组织 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10466 | 2025-10-07 |
Myeloma cell-derived CXCL7 facilitates proliferation of tumor cells and occurrence of osteolytic lesions through JAK/STAT3 pathway
2025-Feb-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07413-6
PMID:39915476
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓瘤细胞通过分泌CXCL7趋化因子激活JAK/STAT3通路，促进肿瘤增殖和溶骨性病变发生的分子机制 | 首次发现高表达CXCL7的骨髓瘤细胞亚群具有强增殖和破骨信号通路激活能力，并阐明CXCL7通过CXCR2-JAK/STAT3-MMP13/C-myc轴驱动溶骨性病变的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大；CXCL7作为治疗靶点的具体干预策略尚未完全明确 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性病变的分子机制及潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤细胞、小鼠异种移植瘤模型 | 数字病理 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析、体内外功能验证 | 小鼠异种移植瘤模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 本中心和GEO数据库的骨髓瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10467 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of human pancreatic islet and acinar endothelial cells in health and diabetes
2025-Feb-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55415-3
PMID:39915484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类胰腺胰岛和腺泡内皮细胞在健康与糖尿病状态下的血管图谱 | 首次开发了富集胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞的策略，并揭示了它们在健康和糖尿病状态下的独特分子特征 | 仅分析了三个人类胰腺样本，样本量有限 | 表征胰腺内血管异质性并揭示糖尿病中的血管变化 | 人类胰腺胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个人类胰腺样本加上三个已发表的胰腺数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10468 | 2025-10-07 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路调控糖尿病认知功能障碍的分子机制 | 首次发现miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对靶向调控PRG-1在糖尿病认知障碍中的作用机制 | 研究主要基于体外HT22细胞模型，需要进一步在体实验验证 | 探究PRG-1在糖尿病诱导认知功能障碍中的分子机制和细胞异质性 | 海马体细胞、HT22细胞系、I型螺旋神经节神经元 | 单细胞测序分析 | 糖尿病认知功能障碍 | 单细胞RNA测序, RNA转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10469 | 2025-10-07 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
|
研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法，用于在单细胞水平同时分析细胞质和核蛋白及其翻译后修饰 | 提出简化的台式抗体偶联方法创建大型定制神经聚焦抗体面板，实现蛋白质与scATAC-seq的同时分析 | NA | 开发能够量化细胞内蛋白质动态并与顺式调控元件和转录靶标连接的多模态单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄视网膜和脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞ATAC-seq, 转录组测量, 抗体偶联 | NA | 蛋白质组, 表观基因组, 转录组 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 10470 | 2025-10-07 |
Expression of Osteopontin in M2 and M4 Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells in the Mouse Retina
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.14
PMID:39908128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法揭示了骨桥蛋白在小鼠视网膜M2和M4型内在光敏视网膜神经节细胞中的表达模式 | 首次发现骨桥蛋白不仅表达于M4-ipRGCs，还在M2-ipRGCs中表达，挑战了骨桥蛋白仅作为αRGCs特异性标志物的传统认知 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠视网膜，尚未在其他物种或病理条件下验证 | 表征骨桥蛋白在ipRGCs各亚型中的表达模式 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs) | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 神经突追踪 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | C57BL/6J小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10471 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of SEPN1 in glioma: Prognostic roles, functional implications, and potential therapeutic interventions
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318501
PMID:39919065
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了SEPN1在胶质瘤中的预后价值、功能作用及潜在治疗干预 | 首次系统阐明SEPN1在胶质瘤中的致癌作用，开发了SEPN1相关风险评分(SRS)，并基于此识别潜在抗胶质瘤药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证SEPN1的具体分子机制 | 探究SEPN1在泛癌中的表达特征和预后意义，特别聚焦于胶质瘤 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA、CGGA、GEO和ZN-GC多个队列的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10472 | 2025-10-07 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Feb-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
|
研究论文 | 通过先进单细胞转录组学分析识别囊性纤维化新型治疗靶点 | 采用增强分析方法整合多源数据，发现与CF气道疾病相关的新基因和调控网络 | 未明确说明样本规模和技术平台的具体限制 | 深入理解囊性纤维化相关基因表达机制，识别新型治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照者的肺部细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序 | 共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10473 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10474 | 2025-10-07 |
Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6
2025-Mar, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866
PMID:39884183
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞测序研究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症的关联机制 | 首次发现CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变人类疱疹病毒6比例影响多发性硬化进展 | 未明确说明样本规模和研究人群特征 | 探究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症的因果关系及潜在感染病原体 | 多发性硬化症患者和对照受试者的免疫细胞 | 生物医学 | 多发性硬化症 | 孟德尔随机化分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10475 | 2025-02-09 |
Unveiling heterogeneity in rare cells by combining RNA-based sorting and scRNA-seq
2025-Feb-07, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02073-2
PMID:39920268
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10476 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity, gene expression profiles, and pathway dynamics in acne vulgaris
2025-Feb-07, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-03894-9
PMID:39920471
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析痤疮皮损组织的细胞异质性、基因表达谱和通路动态 | 首次在单细胞水平揭示痤疮皮损组织的细胞异质性、异常细胞间通讯和代谢通路改变 | 样本量较小（仅6例患者），数据来源于公共数据库 | 探索痤疮发病的细胞和分子机制 | 痤疮患者的皮损和非皮损皮肤组织 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例痤疮患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10477 | 2025-10-07 |
Exploring molecular disparities of H-type vasculature endothelial cells in osteonecrosis of the femoral head through single-cell analysis
2025-Feb-06, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-08267-3
PMID:39910554
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子差异 | 首次在单细胞水平揭示ONFH中H型血管内皮细胞的分子特征及铁死亡和parthanatos死亡模式的作用 | 样本量较小（仅9个样本），数据为公开数据的重新分析 | 探索股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子变化 | 股骨头样本中的H型血管内皮细胞 | 单细胞分析 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 9个股骨头样本（3个HOA、3个ONFH 3A期、3个ONFH 4期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10478 | 2025-10-07 |
Identification of mitochondrial carrier homolog 2 as an important therapeutic target of castration-resistant prostate cancer
2025-Feb-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07406-5
PMID:39910035
|
研究论文 | 本研究探讨线粒体载体同源物2在去势抵抗性前列腺癌中的表达及其功能作用 | 首次揭示MTCH2通过维持线粒体功能促进去势抵抗性前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床患者中进行验证 | 探索MTCH2作为去势抵抗性前列腺癌治疗靶点的潜力 | 去势抵抗性前列腺癌细胞系、原代CRPC细胞和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、shRNA基因沉默、CRISPR-sgRNA基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 多种原代人CRPC细胞系和裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10479 | 2025-10-07 |
CoTF-reg reveals cooperative transcription factors in oligodendrocyte gene regulation using single-cell multi-omics
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07570-6
PMID:39910206
|
研究论文 | 开发了一个整合单细胞多组学数据的分析框架，用于识别少突胶质细胞中协同调控基因的转录因子对 | 提出了coTF-reg分析框架，首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据识别协同转录因子，并采用深度学习模型预测靶基因表达 | NA | 揭示少突胶质细胞中转录因子协同调控基因的机制 | 少突胶质细胞中的转录因子及其靶基因 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, ChIP-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 10480 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity in small cell neuroendocrine cervical carcinoma
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07605-y
PMID:39910262
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性 | 首次绘制SCNECC的单细胞图谱，识别出四种上皮细胞亚型及其关键转录因子，发现两种不同的致癌途径 | 样本量较小（仅6个样本），需要更大规模验证 | 探索小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性和分子特征 | SCNECC癌灶和正常邻近宫颈组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，western blotting，免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白质印迹数据，免疫组化数据 | 6个单细胞测序样本（68,455个高质量细胞），66例患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |