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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10421 | 2025-10-07 |
Genome-wide characterization of circular RNAs in three rat models of pulmonary hypertension reveals distinct pathological patterns
2025-Feb-10, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11239-z
PMID:39930385
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研究论文 | 通过高通量RNA测序分析三种肺动脉高压大鼠模型中环状RNA的全基因组表达模式 | 首次在三种肺动脉高压大鼠模型中全面揭示circRNA调控网络,发现不同模型特异的circRNA分布模式 | 研究仅限于大鼠模型,人类样本验证不足 | 探索环状RNA在肺动脉高压发病机制中的作用 | 三种肺动脉高压大鼠模型的肺动脉组织 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 高通量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络 | RNA测序数据 | 三种大鼠模型(缺氧、缺氧/Sugen5416、野百合碱诱导) | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10422 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the alteration of immune cell profile in peripheral blood of Henoch-Schonlein purpura
2025-Feb-07, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110443
PMID:39924084
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示过敏性紫癜患者外周血免疫细胞谱的变化 | 首次结合单细胞RNA测序和多参数流式细胞术全面分析HSP患者外周血单个核细胞,发现不同临床亚型HSP的特异性免疫细胞特征 | 样本量相对有限,未涉及疾病不同阶段的动态追踪 | 探究过敏性紫癜患者外周血免疫细胞组成和状态的变化 | 健康供者和过敏性紫癜患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 过敏性紫癜 | 单细胞RNA测序,多参数流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 健康供者和HSP患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10423 | 2025-10-07 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-06, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法识别肺鳞状细胞癌的潜在治疗靶点及其分层 | 结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,首次对LUSC治疗靶点进行三级分层 | NA | 识别肺鳞状细胞癌的新型治疗靶点以改善治疗策略 | 肺鳞状细胞癌(LUSC) | 生物信息学 | 肺癌 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,生存分析,孟德尔随机化,LASSO回归,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,免疫浸润评估,通路富集分析,伪时序分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10424 | 2025-10-07 |
Single Cell RNA-Seq Identifies Cell Subpopulations Contributing to Idiopathic Pulmonary Fibrosis in Humans
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70402
PMID:39928535
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了特发性肺纤维化患者肺部细胞亚群的比例变化及其在疾病发生发展中的作用 | 首次在人类IPF肺部中系统鉴定出多种细胞亚群的比例变化,并发现成纤维细胞向肌成纤维细胞分化、肺泡巨噬细胞向macrophage_SPP1亚群转化的轨迹 | 研究未深入探讨细胞亚群比例变化的具体分子机制和功能验证 | 阐明特发性肺纤维化发病机制中的细胞群体变化 | 特发性肺纤维化患者的肺部组织细胞 | 单细胞生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 特发性肺纤维化患者肺部组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10425 | 2025-10-07 |
Dynamic Activation of NADPH Oxidases in Immune Responses Modulates Differentiation, Function, and Lifespan of Plasma Cells
2025-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350975
PMID:39931760
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了NADPH氧化酶在B细胞动态表达及其对浆细胞分化、功能和寿命的调控机制 | 首次结合单细胞转录组学和单细胞NOX活性检测,系统揭示了NOX1和NOX2在B细胞亚群中的动态表达模式及其与代谢、功能和寿命的关联 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;未完全阐明ROS与细胞存活之间的具体分子机制 | 探究NADPH氧化酶活性在B细胞免疫应答中对细胞分化、功能能力和存活的影响 | 小鼠B细胞(二次免疫后的B细胞应答) | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学,单细胞NOX活性检测 | NA | 单细胞基因表达数据,酶活性数据 | 未明确样本数量的小鼠B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10426 | 2025-10-07 |
Hunger Games: A Modern Battle Between Stress and Appetite
2025-Feb, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70006
PMID:39936619
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综述 | 探讨压力与食欲的相互作用机制及其在进食障碍发病过程中的神经生物学基础 | 强调海马-外侧隔区-下丘脑轴在整合压力与摄食信号中的新机制,并提出肠道微生物组等新兴研究方向 | 存在未解科学问题,如个体对压力易感性差异的机制尚未明确 | 阐明压力通过神经环路影响进食行为的机制,为进食障碍提供新的治疗靶点 | 进食障碍的神经生物学机制 | 神经科学 | 进食障碍 | 单细胞测序、先进人类成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10427 | 2025-10-07 |
TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function
2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.07.631757
PMID:39829747
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研究论文 | 本研究鉴定出一种表达免疫抑制效应分子模拟调节性T细胞的胶质瘤干细胞亚群,该亚群通过TGFBR2驱动抑制CD4+和CD8+ T细胞功能 | 首次发现间充质胶质瘤干细胞通过TGFBR2(而非TGFBR1)驱动免疫抑制性Treg样表型,并鉴定出6基因特征标志物 | 研究主要基于患者来源细胞和临床样本,需要进一步体内验证 | 阐明胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中胶质瘤干细胞的免疫调节机制 | 患者来源的胶质瘤干细胞、临床胶质母细胞瘤标本、CD4+和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、分子操作、药理学干预 | NA | 测序数据、基因表达数据、临床数据 | 患者来源细胞和临床标本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 10428 | 2025-10-07 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2025-Jan, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00298-9
PMID:39548236
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了APOBEC3A在鳞状上皮和鳞状细胞癌中通过GRHL3转录因子表达的分化信号机制 | 首次发现APOBEC3A表达受GRHL3调控并局限于终末分化细胞,而在鳞癌中该表达扩展至增殖细胞 | 研究主要聚焦于鳞状上皮和鳞癌,其他类型癌症中的机制尚需进一步验证 | 探究APOBEC脱氨酶在正常组织和癌症中的表达调控机制及其在肿瘤发生中的作用 | 健康黏膜上皮和恶性黏膜上皮组织 | 单细胞生物学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,空间转录组学,功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 10429 | 2025-10-07 |
Bronchoalveolar lavage single-cell transcriptomics reveals immune dysregulations driving COVID-19 severity
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309880
PMID:39928675
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19重症患者支气管肺泡灌洗液中免疫细胞失调机制 | 首次在单细胞水平系统揭示COVID-19重症患者中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞和T细胞的协同失调机制 | 基于二次数据分析,缺乏实验验证;样本量未明确说明 | 探索COVID-19疾病严重程度的免疫学机制 | COVID-19患者和健康对照的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10430 | 2025-10-07 |
Detection of hepatitis B virus mRNA from single cell RNA sequencing data without prior knowledge
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0314060
PMID:39932940
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研究论文 | 本研究开发了一种无需先验知识即可从单细胞RNA测序数据中检测乙型肝炎病毒mRNA的方法 | 无需16S rRNA扩增或先验知识即可直接从scRNA-seq数据中检测病毒mRNA | 仅验证了乙型肝炎病毒,且依赖病毒mRNA具有poly-A尾的特征 | 开发从单细胞RNA测序数据中检测病毒mRNA的新方法 | 慢性乙型肝炎病毒感染患者的肝脏样本 | 单细胞测序分析 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 慢性HBV感染患者肝脏样本(包括有和无HBsAg消失的患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10431 | 2025-10-07 |
Integrative multi-omics analysis for identifying novel therapeutic targets and predicting immunotherapy efficacy in lung adenocarcinoma
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2024.91
PMID:39935429
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研究论文 | 通过整合多组学分析识别肺腺癌的新型治疗靶点并预测免疫治疗疗效 | 识别了11个不同的细胞亚群和两种分子亚型,开发了多组学驱动的机器学习特征,发现RRM1作为化疗反应的关键生物标志物 | NA | 阐明肺腺癌的细胞亚群和分子亚型,识别关键生物标志物,探索潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者队列 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 全基因组关联研究 | 贝叶斯反卷积, 机器学习算法 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10432 | 2025-10-07 |
Identification of WDR74 and TNFRSF12A as biomarkers for early osteoarthritis using machine learning and immunohistochemistry
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1517646
PMID:39935469
|
研究论文 | 通过机器学习和免疫组化技术鉴定WDR74和TNFRSF12A作为早期骨关节炎的生物标志物 | 首次整合泛素化相关基因表达数据与机器学习方法识别早期骨关节炎生物标志物 | 研究样本来源单一(GEO数据库),需要更多临床样本验证 | 改善早期骨关节炎的诊断和预后 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化 | XGBoost | 基因表达数据,图像数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和人膝关节标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10433 | 2025-10-07 |
Exploring Core Genes Associated with Sepsis and Systemic Inflammatory Response Syndrome Using Single-Cell Sequencing Technology
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S448900
PMID:39935525
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研究论文 | 利用单细胞测序技术探索脓毒症和全身炎症反应综合征的核心基因 | 首次通过单细胞转录组分析揭示脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本中免疫细胞亚群的差异表达基因 | 样本量有限,缺乏独立验证队列 | 识别脓毒症和SIRS的独特生物标志物和免疫应答模式 | 脓毒症死亡患者和全身炎症反应综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 脓毒症,全身炎症反应综合征 | 单细胞RNA测序 | UMAP细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10434 | 2025-10-07 |
Targeting enteric glial CRF-R1/Cx43 attenuates stress-induced accelerated colonic motility
2025-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2025.01.009
PMID:39929591
|
研究论文 | 本研究揭示了肠胶质细胞中CRF-R1/Cx43信号通路在应激诱导的结肠运动加速中的作用机制 | 首次发现肠胶质细胞表达CRF-R1,并阐明其通过Cx43介导应激诱导的结肠运动反应 | 研究仅使用雄性C57BL/6小鼠,未涉及雌性动物或其他品系 | 探究肠胶质细胞CRF-R1/Cx43信号在应激诱导结肠运动加速中的作用 | 雄性C57BL/6小鼠的肠胶质细胞和结肠组织 | 神经胃肠病学 | 胃肠功能紊乱 | 免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | C57BL/6小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10435 | 2025-10-07 |
Exploring the therapeutic efficacy difference in claudin18.2-targeted cell therapy revealed by single-cell sequencing
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111768
PMID:39925434
|
研究论文 | 通过单细胞测序探索CLDN18.2靶向细胞疗法的疗效差异机制 | 首次在CLDN18.2阳性胃癌患者中通过单细胞测序分析CT041 CAR-T治疗的细胞特征与疗效关联 | 样本量较小(仅5名患者),需更大规模研究验证 | 探索CAR-T细胞疗法在实体瘤中的疗效差异机制 | 晚期CLDN18.2阳性胃癌患者 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5名患者的外周血和腹水样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10436 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal pre-metastatic subsets and therapeutic targets in penile carcinoma
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111765
PMID:39925432
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术识别阴茎癌中的前转移亚群并确定治疗靶点 | 首次在阴茎癌中发现MMP3+SPP1+前转移亚群和CK2α过表达,并验证Silmitasertib的抗肿瘤效果 | 样本量有限(6例原发癌、6例转移淋巴结、4例晚期癌的单细胞数据) | 解析肿瘤异质性并识别前转移亚群及治疗靶点 | 阴茎癌组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 细胞实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 6例原发阴茎癌、6例转移淋巴结、4例晚期阴茎癌(单细胞数据),另含98个单细胞数据集和6个空间数据集验证 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10437 | 2025-10-07 |
m6A related metabolic genes in breast cancer and their relationship with prognosis
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114121
PMID:39889412
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研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌中m6A相关代谢基因,构建预后风险模型并验证关键基因 | 首次整合单细胞转录组和bulk RNA-seq数据系统分析m6A相关代谢基因在乳腺癌中的作用,并构建预后风险模型 | 研究样本来源有限,主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证 | 探索m6A相关代谢基因在乳腺癌预后评估和治疗靶点开发中的价值 | 乳腺癌患者外周血单细胞数据和TCGA乳腺癌转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, RNA-seq, qRT-PCR, Western blot | Lasso-Cox回归模型 | 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据 | TCGA乳腺癌数据集和患者外周血scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10438 | 2025-10-07 |
Dapagliflozin alleviated seizures and cognition impairment in pilocarpine induced status epilepticus via suppressing microglia-mediated neuroinflammation and oxidative stress
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114117
PMID:39889414
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研究论文 | 本研究探讨达格列净通过抑制小胶质细胞介导的神经炎症和氧化应激减轻癫痫持续状态小鼠的癫痫发作和认知障碍 | 首次发现达格列净通过调节小胶质细胞表型转化和抑制SLC5A2表达发挥抗癫痫和神经保护作用 | 研究仅使用雄性小鼠和体外细胞模型,缺乏临床验证和性别差异分析 | 研究达格列净对癫痫持续状态引起的癫痫发作和认知障碍的治疗作用及机制 | 雄性C57BL/6小鼠、BV2小胶质细胞系、癫痫患者样本 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞转录组分析、免疫荧光染色、免疫组化、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、ELISA | 毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态小鼠模型、LPS诱导的神经炎症细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、行为学数据 | 动物模型和细胞实验,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10439 | 2025-10-07 |
Exploring the dynamic responses of group 3 innate lymphoid cells at different times in response to LPS challenge
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114162
PMID:39889415
|
研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据,探索了第3组先天淋巴细胞在LPS攻击后不同时间点的动态响应 | 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据揭示肠道ILC3可能迁移至肺部的机制,并系统分析LPS攻击后不同时间点ILC3的动态变化 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证ILC3迁移机制 | 阐明ILC3在LPS诱导的急性肺部炎症中的动态响应机制 | 第3组先天淋巴细胞(ILC3s) | 免疫学 | 肺部炎症 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10440 | 2025-10-07 |
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2025-Feb-10, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041621
PMID:39929729
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综述 | 回顾基因组学和生物信息学在帕金森病研究中的应用进展 | 系统总结了单细胞转录组学技术揭示帕金森病中细胞类型特异性失调的新发现 | NA | 解析帕金森病的复杂性质并识别新的治疗靶点 | 人类群体和模式生物 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因分型, 基因组测序, 转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 大规模人类群体队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |