单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10799 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-12-31 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveal the reorganization of cerebellar microglia with aging
2025-Dec-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116624
PMID:41307999
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术，揭示了小脑小胶质细胞在衰老过程中的重组现象 | 结合单核RNA测序、小胶质细胞批量RNA测序和基于MERFISH的空间转录组学，首次系统揭示了小脑小胶质细胞在衰老中的区域特异性适应和与颗粒细胞的邻近关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类小脑衰老的类似变化尚需进一步验证 | 探究小脑在衰老过程中的转录组变化及小胶质细胞的重组机制 | 小鼠小脑组织，特别是小胶质细胞和颗粒细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单核RNA-seq, 批量RNA-seq, MERFISH | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 十五个小鼠脑区域 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1022 | 2025-12-31 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-Dec-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195917
PMID:41433107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后再神经支配模型，揭示了肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了多个不同的雪旺细胞亚型，包括一种在去神经-再神经支配循环中起关键作用的新型终末雪旺细胞亚型，并确定了SPP1信号通路是调节神经肌肉接头动态的关键调控因子 | NA | 阐明肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留雪旺细胞 | 数字病理学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1023 | 2025-12-31 |
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through apoptosis in the neonatal lung
2025-Dec-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116750
PMID:41428484
|
研究论文 | 本研究利用Stc1小鼠模型，揭示了肺肌成纤维细胞中一个独特的发育谱系——次级嵴肌成纤维细胞的生命周期及其在肺泡发育中的作用 | 首次通过Stc1谱系示踪技术，在体内明确区分了次级嵴肌成纤维细胞和肺泡管肌成纤维细胞，并揭示了前者通过克隆增殖和凋亡被清除的独特发育命运 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类肺发育中的直接相关性尚需验证；遗传工具的特异性可能不完全排除其他细胞类型的标记 | 阐明肺肌成纤维细胞不同谱系在肺泡发育过程中的独特贡献和命运 | 小鼠肺组织中的肌成纤维细胞谱系，特别是Stc1表达的次级嵴肌成纤维细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，胚胎谱系示踪，遗传激活实验 | NA | 基因表达数据，谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1024 | 2025-12-31 |
Single cell RNA-seq characterization of non-fibrotic stromal wound repopulation in the rabbit
2025-Dec-18, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110816
PMID:41421445
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了兔子角膜冻伤模型中非纤维化伤口愈合过程中的转录变化，揭示了基质角质细胞向成纤维细胞的连续转化过程 | 首次在兔子角膜冻伤模型中，通过单细胞RNA测序揭示了非纤维化伤口愈合的转录动态，识别了保留角质细胞标记的成纤维细胞亚群，并发现了一种机械活跃但非纤维化的表型 | 研究仅基于兔子模型，可能无法完全反映人类角膜愈合过程；样本时间点有限（仅第7天和第28天），可能错过中间动态变化 | 探究角膜损伤后非纤维化伤口愈合的分子机制，以预防角膜手术或损伤后的瘢痕形成 | 兔子角膜基质细胞（包括角质细胞和成纤维细胞） | 单细胞转录组学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及对照和冻伤后第7天及第28天的兔子角膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1025 | 2025-12-31 |
Influenza A infection accelerates disease-associated microglia formation during physiological aging
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693336
PMID:41415465
|
研究论文 | 本研究探讨了甲型流感病毒感染如何加速生理性衰老过程中疾病相关小胶质细胞的形成 | 首次揭示了非神经侵袭性流感肺炎可诱导大脑小胶质细胞的转录反应，驱动疾病相关小胶质细胞的过早扩增，并阐明了其代谢特征和空间分布模式 | 研究主要使用雄性小鼠模型，未考虑性别差异；人类样本分析仅限于中额回区域 | 探究流感感染对大脑免疫细胞（特别是小胶质细胞）在衰老过程中的影响机制 | 年轻、中年和老年雄性小鼠的大脑免疫细胞；正常老年人、超级老人和痴呆患者的中额回组织 | 神经免疫学 | 老年性疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 不同年龄段的雄性小鼠；人类中额回组织样本（包括正常老年人、超级老人和痴呆患者） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1026 | 2025-12-31 |
Multimodal analysis defines GNG4 as a distinguishing feature of germinal center-positioned CD4 T follicular helper cells in humans
2025-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693235
PMID:41427421
|
研究论文 | 本文通过多模态单细胞测序和空间转录组学，揭示了人类生发中心定位的CD4 T滤泡辅助细胞中GNG4作为区分特征的关键作用 | 首次结合trimodal单细胞测序和空间转录组学，将GNG4鉴定为人类生发中心内活化Tfh细胞的标志性特征，其特异性优于传统GC相关标记 | 研究主要基于扁桃体和外周血样本，可能未涵盖其他淋巴组织或疾病状态下的Tfh细胞异质性 | 阐明人类Tfh细胞的功能异质性及其在生发中心微环境中的分子特征 | 人类扁桃体和外周血中的CD4 T滤泡辅助细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | trimodal单细胞测序、光谱流式细胞术、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据（表观基因组、转录组、蛋白质组）及空间转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及人类扁桃体和外周血样本 | NA | 单细胞多组学测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1027 | 2025-12-31 |
Building dynamical models of multi-step state transitions from single cell gene expression trajectories
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693064
PMID:41415381
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为NetDes的计算方法，用于从单细胞基因表达轨迹中推断核心转录因子调控网络并构建基于ODE的动态模型 | NetDes整合了自上而下和自下而上的系统生物学方法，能够在一个动态模型中捕获顺序状态转换，相比现有方法具有优势 | 未在摘要中明确说明 | 研究多步细胞状态转换（如细胞分化和疾病进展）的调控机制 | 单细胞基因表达轨迹，包括人类iPSC分化过程中的时间序列scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | ODE-based dynamical models | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1028 | 2025-12-31 |
Heat-shock pathway activation by TRC051384 protects spiral ganglion neurons from noise-induced hearing loss
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693048
PMID:41415422
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和空间转录组学发现噪声暴露会诱导螺旋神经元及其支持细胞内质网伴侣和蛋白酶体亚基的短暂上调，并证实小分子化合物TRC051384可通过激活热休克转录因子Hsf1来保护螺旋神经元免受噪声性听力损失 | 首次在噪声性听力损失模型中揭示螺旋神经元的蛋白毒性应激是关键驱动因素，并发现激活HSF1是一种有前景的治疗策略 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；TRC051384的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究噪声性听力损失的分子机制并开发保护螺旋神经元的治疗策略 | 小鼠耳蜗螺旋神经元及其支持细胞 | 空间转录组学 | 噪声性听力损失 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |
| 1029 | 2025-12-31 |
Plasma cell identity escape drives resistance to anti-BCMA T-cell-redirecting therapy in multiple myeloma
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692978
PMID:41415462
|
研究论文 | 本文通过全基因组测序和单细胞RNA测序，揭示了多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的T细胞重定向疗法产生原发性耐药的细胞和分子机制，包括基因组复杂性和浆细胞身份逃逸现象 | 首次提出“浆细胞身份逃逸”概念，并发现其与高增殖特征、BCMA表达降低及CD8 T细胞免疫失调相关，通过临床队列和临床前模型验证了这些机制 | 研究样本量相对有限（102例复发患者），且主要关注原发性耐药，对继发性耐药机制探讨不足，临床前模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的CAR-T和T细胞衔接子疗法产生原发性耐药的机制 | 接受抗BCMA CAR-T或T细胞衔接子治疗的复发多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 102例复发多发性骨髓瘤患者 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1030 | 2025-12-31 |
OddSNP: a predictive framework for optimizing multiplexed single-cell RNA-seq experiments
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692882
PMID:41415468
|
研究论文 | 开发了一个名为OddSNP的预测框架，用于优化多重单细胞RNA测序实验的设计 | 提出了SNP-信息含量（SNP-IC）这一可量化的新指标，能够基于简单的未混合先导数据准确预测基于基因型的分型成功率 | 未明确说明该框架在不同组织类型或疾病模型中的普适性验证情况 | 为单细胞RNA测序中的供体多重实验提供可靠的实验设计指导 | 干细胞和类器官模型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 基因型数据、测序数据 | 多个大规模数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1031 | 2025-12-31 |
Early skin seeding regulatory T cells modulate PPARγ-dependent skin pigmentation
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66229-2
PMID:41365874
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研究论文 | 本文探讨了早期皮肤定居调节性T细胞（ETregs）在新生儿皮肤中通过调控PPARγ信号通路，促进毛囊黑素干细胞介导的皮肤色素沉着的作用 | 首次揭示了ETregs在出生后第一周内对皮肤色素沉着的关键调控作用，并明确了PPARγ信号通路在此过程中的核心地位 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来源于对白癜风患者的单细胞转录组分析，需要进一步验证ETregs在人类皮肤发育中的具体机制 | 探究早期皮肤定居调节性T细胞（ETregs）在新生儿皮肤发育中对色素沉着的调控机制 | 小鼠新生儿皮肤组织、人类白癜风患者皮肤组织 | 免疫学与皮肤生物学 | 白癜风 | 单细胞转录组分析、转录组学分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1032 | 2025-12-31 |
Copula modeling of gene coexpression in single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692380
PMID:41415412
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研究论文 | 本文评估了六种Copula模型在单细胞RNA测序数据中模拟基因共表达的能力，发现高斯Copula在准确性和速度之间提供了最佳平衡 | 首次系统评估Copula模型在scRNA-seq数据中模拟基因共表达的应用，比较了不同模型的准确性和效率 | Vine Copula虽具高准确性潜力，但当前实现无法扩展到典型scRNA-seq数据集的大规模 | 开发准确的统计模型来模拟单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Copula模型（包括高斯Copula、Vine Copula等） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1033 | 2025-12-31 |
Phenotypic and functional characterization of tumor-reactive T cells in malignant pleural effusions
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.05.692662
PMID:41415427
|
研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术、单细胞RNA测序和T细胞受体测序，对恶性胸腔积液（MPE）中的肿瘤反应性T细胞进行了表型和功能表征，并与肺转移瘤和血液中的T细胞进行比较 | 首次系统比较了MPE、肿瘤和血液中T细胞的组成、转录组和功能特性，发现MPE富含肿瘤反应性T细胞且具有较低的终末耗竭特征和较高的细胞毒性潜力 | 研究仅基于一名黑色素瘤患者的样本，样本量小，结果可能需要更大规模研究验证 | 表征恶性胸腔积液中肿瘤反应性T细胞的表型和功能特性，评估其作为过继性细胞疗法来源的潜力 | 恶性胸腔积液、肺转移瘤和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 高维流式细胞术、单细胞RNA测序、T细胞受体测序、体外激活和细胞毒性实验 | NA | 流式细胞数据、单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 一名转移性黑色素瘤患者的同步采集的MPE、肺转移瘤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 1034 | 2025-12-31 |
From features to slice: parameter-cloud modeling of spatial transcriptomics for simulation and 3D interpolatory augmentation
2025-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692251
PMID:41415403
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研究论文 | 本文介绍了FEAST，一个用于空间转录组学数据计算模拟和三维插值增强的计算基础设施 | 提出了参数云建模方法，能够灵活控制空间和转录异质性，捕获高阶基因依赖性，并扩展到三维或对齐感知的上下文 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个用于空间转录组学数据模拟、增强和三维重建的计算平台 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 参数云建模 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1035 | 2025-12-31 |
C3a-C3aR1-Mediated Interactions Between Fibroblast-Like Synoviocytes and Macrophages Promote the Progression of Rheumatoid Arthritis
2025-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43319
PMID:40654154
|
研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜中成纤维样滑膜细胞与巨噬细胞通过C3a-C3aR1信号介导的相互作用，促进疾病进展的机制 | 首次结合成像质谱流式细胞术和单细胞RNA测序解析RA滑膜细胞邻域，并发现FLS与巨噬细胞间通过C3a-C3aR1信号形成正反馈环路驱动炎症 | 研究主要基于胶原诱导关节炎小鼠模型，人体内的验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究类风湿关节炎滑膜炎症微环境中细胞间相互作用机制及潜在治疗靶点 | 类风湿关节炎患者滑膜组织、胶原诱导关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 成像质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，涉及RA患者滑膜组织与CIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1036 | 2025-12-31 |
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106030
PMID:41265130
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研究论文 | 本研究探讨了成熟三级淋巴结构（mTLS）在直肠癌中的抗肿瘤免疫作用及其受新辅助治疗的影响 | 首次在直肠癌中系统评估mTLS与B细胞介导的免疫特征及预后的关联，并揭示新辅助治疗对TLS的破坏作用 | 回顾性研究设计可能引入选择偏倚，样本量有限且需进一步验证 | 阐明mTLS在直肠癌肿瘤免疫微环境中的作用及新辅助治疗的免疫调节效应 | 直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组化, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 组织图像 | 队列1：bulk RNA-seq 123例，免疫组化/多重免疫荧光161例，scRNA-seq/scBCR-seq 10例；队列2：bulk RNA-seq 19例，免疫组化125例 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 空间转录组学相关技术 | NA | NA |
| 1037 | 2025-12-31 |
Subpopulation-specific apoptotic responses of hemocytes to decapod iridescent virus 1 in Macrobrachium rosenbergii
2025-Dec, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110685
PMID:40865745
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研究论文 | 本研究整合流式细胞术和单细胞RNA测序，揭示了罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异 | 首次结合流式细胞术和单细胞RNA测序技术，系统解析了罗氏沼虾血细胞亚群在DIV1感染下的凋亡动态和分化轨迹，揭示了透明细胞的凋亡激活和补偿性分化机制 | 研究主要关注早期感染阶段（24小时），长期感染动态和具体凋亡信号通路的功能验证有待进一步探索 | 探究罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异和免疫机制 | 罗氏沼虾的血细胞亚群，包括无颗粒细胞（透明细胞和前血细胞）、半颗粒细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1038 | 2025-12-31 |
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through intrinsic apoptosis in the neonatal lung
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659126
PMID:40661545
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研究论文 | 本研究通过构建Stc1谱系标记小鼠，揭示了肺肌成纤维细胞中次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）作为一个发育上独特的谱系，其通过内在凋亡在新生儿肺中被清除 | 首次构建了能够特异性标记发育性短暂次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）的小鼠品系，并证明SCMF与肺泡管肌成纤维细胞（DMF）是发育上不同的独立谱系 | 研究主要基于小鼠模型，人类肺发育中SCMF的清除机制是否相同尚需验证 | 阐明肺肌成纤维细胞中不同谱系在肺泡发育过程中的独特贡献与命运 | 小鼠肺组织中的次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）和肺泡管肌成纤维细胞（DMF） | 发育生物学 | 肺发育异常 | 单细胞RNA测序、胚胎谱系追踪、基因敲除 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据、谱系追踪数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1039 | 2025-12-31 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.06.561193
PMID:38370853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用，特别是在去神经和再神经过程中的动态变化 | 发现了一种新型的末端施万细胞亚型，该亚型在去神经-再神经循环中起关键作用，并识别了SPP1信号作为神经肌肉接头动态的关键调节因子 | NA | 探究肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留施万细胞，包括末端施万细胞和髓鞘施万细胞亚型 | 数字病理学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2025-12-31 |
A Complete Spatial Map of Mouse Retinal Ganglion Cells Reveals Density and Gene Expression Specializations
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637538
PMID:39990332
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和机器学习技术，绘制了小鼠视网膜神经节细胞亚型的完整空间分布图，揭示了其密度和基因表达的特异性 | 首次结合en-face冷冻切片、空间转录组学和机器学习，全面映射所有已知RGC亚型的空间分布，并发现亚型内基因表达沿背腹轴或在ART区域内外存在意外变异 | ART区域与灵长类黄斑的基因谱相关性有限，提示小鼠与灵长类中央视觉的特化可能不同，研究结果可能受物种差异限制 | 探索小鼠视网膜神经节细胞亚型的空间分布特化和基因表达模式，以理解其视觉功能基础 | 小鼠视网膜神经节细胞亚型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，机器学习 | 机器学习 | 空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |