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当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-12-31 |
Bulk and single-cell transcriptome analysis reveal shared key genes and patterns of immune dysregulation in systemic lupus erythematosus and sepsis
2025-Dec-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01350-y
PMID:41462079
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1022 | 2026-02-13 |
Spatial transcriptomics and immunophenotyping uncover chronic inflammation-induced immune adaptations favoring dysplasia development in patients at risk of colitis-associated cancer
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf184
PMID:41081629
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫表型分析，揭示了慢性炎症诱导的免疫适应如何促进炎症性肠病患者中结肠炎相关癌症的发育 | 结合GeoMx数字空间分析和成像质谱流式技术，首次在组织学未发炎的结肠中识别出代谢和应激反应通路上调，以及CD8+上皮内T细胞减少与癌症风险的关联 | 样本量较小（发现队列11例，验证队列最多18例），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 确定慢性炎症诱导的免疫细胞重编程在炎症性肠病患者中促进结肠炎相关癌症发展的机制 | 结肠炎相关癌症患者、散发性结直肠癌患者、有或无发育不良的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 结肠炎相关癌症 | 空间转录组学、成像质谱流式、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、成像质谱数据、组织图像 | 发现队列11例（CAC和SCRC患者），验证队列包括CAC患者10例、SCRC患者14例，以及IBD患者有发育不良6例、无发育不良18例 | NA | 空间转录组学, 成像质谱流式 | GeoMx | GeoMx数字空间分析 |
| 1023 | 2026-02-13 |
Exploring the regulatory mechanisms of paraptosis-related prognostic genes in gastric cancer using single-cell sequencing and transcriptome analysis
2025-Oct-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-20037-2
PMID:41094022
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组分析，探索了胃癌中类凋亡相关基因的调控机制及其预后价值 | 首次将单细胞RNA测序与TCGA转录组数据结合，系统性地鉴定了胃癌中8个与类凋亡相关的预后基因，并构建了有效的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证，且未进行深入的体外或体内功能实验验证 | 探究类凋亡相关基因在胃癌中的功能、预后意义及对肿瘤微环境的影响，为临床预后评估和治疗策略提供新见解 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 回归分析模型，风险预测模型，列线图 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 未明确具体样本数量，数据来源于公共数据库（TCGA等） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1024 | 2026-02-13 |
ER-phagy Activation by AMFR Attenuates Cardiac Fibrosis Post-Myocardial Infarction via mTORC1 Pathway
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504552
PMID:40673870
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研究论文 | 本研究探讨了自分泌运动因子受体（AMFR）通过激活内质网选择性自噬（ER-phagy）抑制心肌梗死后心脏纤维化的机制 | 首次揭示了AMFR通过催化FAM134B的K27和K33连接泛素化来增强ER-phagy活性，进而抑制mTORC1通路，从而减轻心脏纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床样本中进行验证 | 探究ER-phagy在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其调控机制 | 小鼠心脏组织、心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1025 | 2026-02-13 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity in Differentiation Trajectory and Tumor Microenvironment Leading to More Aggressive Phenotypes of Papillary Thyroid Cancer in Children and Young Adult Patients
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417672
PMID:40719066
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌的异质性、分化轨迹及肿瘤微环境特征，并指出其更具侵袭性的表型 | 首次在儿童及年轻成人PTC患者中通过单细胞RNA测序系统描绘了肿瘤生态系统异质性，发现其缺乏成人患者中存在的'温和状态'恶性甲状腺细胞群，并揭示了emCAFs_LAMP5在促进肿瘤血管生成和转移中的关键作用 | 样本量相对较小（11例患者），且研究为观察性，需要更大规模队列和功能实验验证 | 阐明儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌的肿瘤生态系统异质性及其与临床侵袭性的关系 | 11例儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌患者的肿瘤及癌旁组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者（儿童及年轻成人）的肿瘤及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1026 | 2026-02-13 |
Metabolic state uncovers prognosis insights of esophageal squamous cell carcinoma patients
2025-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06087-0
PMID:40098145
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研究论文 | 本研究首次通过整合代谢物-蛋白质相互作用网络与多尺度转录组学数据，全面绘制了食管鳞状细胞癌微环境的代谢图谱 | 首次在ESCC微环境中全面映射代谢景观，基于代谢状态组成识别了与预后相关的独特亚型 | 研究主要基于转录组数据，缺乏直接的代谢物验证实验 | 探索ESCC微环境中代谢状态与患者预后的关系 | 食管鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 64个ESCC样本中的208,659个细胞，以及两个独立队列（n=79和119） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1027 | 2026-02-13 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析，揭示了嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 结合单细胞基因表达和可及染色质谱分析，识别了激活干细胞中的转录异质性，并发现了一组在损伤前就表观遗传学上准备就绪的静息细胞 | NA | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1028 | 2026-02-12 |
Distinct immune landscapes between murine and human periodontitis
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114073
PMID:41659164
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的免疫景观差异，并评估了Pg补充对模型可转化性的影响 | 首次系统性地比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的单细胞免疫景观，揭示了B/浆细胞和巨噬细胞在比例和激活状态上的显著差异 | Pg补充未能减少小鼠与人类之间的免疫学差异，模型的可转化性有限 | 评估小鼠结扎模型作为人类牙周炎研究模型的适用性 | 人类牙周炎患者和小鼠结扎模型的牙龈组织 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结扎、结扎+Pg和对照组牙龈组织，整合人类数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1029 | 2026-02-12 |
[Expression Characteristics and Prognostic Study of PPP1R13L in Brain Metastases
of Lung Adenocarcinoma]
2025-Nov-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和临床样本分析，探讨了PPP1R13L基因编码的iASPP蛋白在肺腺癌脑转移组织中的表达特征及其临床意义 | 首次在肺腺癌脑转移的肿瘤微环境中，结合单细胞测序和临床样本，揭示了PPP1R13L作为上调差异基因在特定上皮细胞亚群中的高表达，并发现其阳性细胞与成纤维细胞之间的相互作用通过COL1A1-CD44配体-受体对激活细胞-基质粘附相关通路 | 单细胞测序样本量较小（仅4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织），且临床样本来自单一医院，可能存在选择偏倚 | 分析肺腺癌脑转移患者的肿瘤微环境特征，并探索PPP1R13L在脑转移组织中的表达及其临床意义 | 肺腺癌脑转移患者的脑组织、临床样本及公共数据库中的肺腺癌和正常肺组织单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞测序数据, 临床病理数据, 图像数据 | 单细胞测序：4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织；临床分析：50例肺腺癌脑转移患者的石蜡切片和临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1030 | 2026-02-12 |
Atlas-Guided Discovery of Transcription Factors for T Cell Programming
2025-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522354
PMID:36711632
|
研究论文 | 本文通过整合转录组和表观遗传数据，构建了CD8+ T细胞状态的综合图谱，并利用CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术，鉴定了调控T细胞分化的关键转录因子 | 开发了一个综合图谱平台，结合了转录和表观遗传数据，并首次通过体内Perturb-seq技术系统性地识别了调控T细胞状态的转录因子，包括新发现的ZSCAN20和JDP2 | 研究主要基于小鼠模型，人类T细胞验证数据有限，且未涵盖所有可能的T细胞状态或疾病环境 | 系统定义驱动CD8+ T细胞不同状态的转录因子，以优化免疫疗法设计 | CD8+ T细胞，特别是终末耗竭T细胞（TEXterm）和组织驻留记忆T细胞（TRM） | 免疫学 | 癌症和慢性感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR筛选，表观遗传分析 | NA | 转录组数据，表观遗传数据 | 涉及九个CD8+ T细胞状态，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1031 | 2026-02-12 |
Divergence between neural and retinal lineage specification during human brain development by signal transduction
2025-Oct-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.034
PMID:41135878
|
研究论文 | 本研究利用基因工程人类胚胎干细胞衍生的脑类器官，探讨了p70 S6激酶1（S6K1）在人类大脑发育中的作用 | 首次在人类脑类器官模型中揭示S6K1信号通路在神经元与视网膜谱系分化中的精细调控作用，并区分了细胞自主与非自主功能 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 | 阐明S6K1在人类大脑发育过程中的功能机制 | S6K1缺失的人类胚胎干细胞衍生的背侧前脑类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，ATAC测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 早期（5周）和晚期（14周）阶段的脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq，ATAC-seq | NA | NA |
| 1032 | 2026-02-12 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7564369/v1
PMID:41282090
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 | VISTA结合变分推理和几何深度学习，联合建模单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据，并引入不确定性量化，以解决空间转录组学技术中基因数量有限的问题 | NA | 旨在通过预测未观测基因的表达，增强空间转录组学数据的分析能力，以更好地理解空间诱导的细胞状态和特征 | 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推理, 几何深度学习 | 基因表达数据 | 四个空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1033 | 2026-02-12 |
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNOW的深度学习算法，用于解卷积单细胞时间序列数据，以分离时间依赖和独立成分 | 提出SNOW算法，能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞时间序列 | NA | 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战，如时间与细胞类型贡献的解卷积、区分真实动态与批次效应 | 单细胞RNA测序时间序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1034 | 2026-02-12 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6248794/v1
PMID:40321776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组，并发现转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中起关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子，并揭示其在肾上腺性别二态性和脂质代谢调控中的多功能作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾上腺中的具体机制尚未完全阐明 | 探究维持肾上腺皮质细胞差异响应能力的分子机制 | 肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞（zona fasciculata） | 单细胞组学 | 肾上腺功能障碍 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 使用报告基因小鼠的肾上腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1035 | 2026-02-12 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609718
PMID:40166134
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研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平，以解决现有技术基因覆盖限制的问题 | VISTA结合变分推断和几何深度学习，联合建模单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，并引入不确定性量化，实现了对未观测基因表达的高效预测 | 方法依赖于单细胞RNA-seq和空间转录组学数据的联合可用性，且性能可能受数据质量和整合难度的影响 | 开发一种能够预测空间转录组学数据中未观测基因表达水平的方法，以增强空间诱导细胞状态和特征的分析能力 | 单细胞RNA-seq数据和亚细胞空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1036 | 2026-02-12 |
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2025.1726096
PMID:41647192
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研究论文 | 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者胃肠道中MRGPRX2表达肥大细胞的增加及其在炎症性肠病（IBD）中的作用 | 首次在HαT背景下，结合空间转录组学和质谱流式细胞术，揭示了胃肠道肥大细胞表型改变及MRGPRX2表达上调与IBD活动的关联 | 样本量较小（空间转录组学n=8，质谱流式n=14），且仅针对特定肠道部位（降结肠和小肠）进行分析，可能限制结果的普适性 | 阐明HαT对胃肠道肥大细胞表型及MRGPRX2表达的影响，探索其在IBD症状发生中的潜在机制 | 遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者及匹配的非HαT对照者的肠道组织样本 | 空间转录组学 | 炎症性肠病 | 空间转录组分析、质谱流式细胞术（CyTOF）、微滴数字PCR（ddPCR）、基因分型 | NA | 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 | 854份生物样本库IBD样本进行基因分型；空间转录组分析8例（HαT=4，对照=4）；质谱流式分析14例（HαT=5，对照=9） | NA | 空间转录组学、单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 1037 | 2026-02-12 |
Multi-omics integration and machine learning-driven construction of an immunogenic cell death prognostic model for colon cancer and functional validation of FCGR2A
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1746907
PMID:41657770
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研究论文 | 本研究通过多组学整合与机器学习构建了一个基于免疫原性细胞死亡（ICD）相关基因的结肠癌预后模型，并验证了关键基因FCGR2A的功能 | 首次系统性地利用ICD相关基因构建结肠癌预后模型，结合单细胞RNA-seq数据解析T细胞状态，并通过大量机器学习模型组合优化特征选择 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证；体外功能实验仅针对单个基因（FCGR2A） | 开发基于免疫原性细胞死亡的预后模型，探索其与肿瘤免疫微环境及治疗敏感性的关联 | 结肠腺癌（COAD）患者 | 机器学习 | 结肠癌 | 转录组学分析、单细胞RNA-seq、机器学习模型构建 | 随机生存森林（Random Survival Forest） | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA和GTEx的结肠腺癌患者数据，以及GSE17538和GSE38832作为外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1038 | 2026-02-12 |
Multi-omics characterization of RNF157 expression patterns in hepatocellular carcinoma and development of an RNF157-associated prognostic signature
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1738424
PMID:41657776
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析，表征了肝细胞癌中E3泛素连接酶RNF157的表达模式，开发了一个RNF157相关的预后特征，并探讨了其与肿瘤微环境的关系 | 在单细胞分辨率下表征RNF157在肝细胞癌中的异质性表达模式，并基于此开发了一个新的预后特征模型 | 预后模型的预测性能中等，需要独立验证才能临床应用 | 表征RNF157在肝细胞癌中的表达模式，开发预后特征，并探索其与肿瘤微环境的关系 | 肝细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 流式细胞术 | 预后特征模型 | RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、GEO数据库和scRNA-seq数据集(GSE149614)的临床和RNA表达数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1039 | 2026-02-12 |
Integrative multi-omics and experimental analyses implicate PTK2 as a lorazepam-associated biomarker and potential therapeutic target in ovarian cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1744802
PMID:41657774
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和实验验证，发现PTK2是劳拉西泮与卵巢癌之间的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次将神经活性药物劳拉西泮与卵巢癌的分子靶点联系起来，并通过空间转录组学揭示了PTK2在肿瘤微环境中的特异性分布 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接药效学证据 | 识别和验证劳拉西泮与卵巢癌共有的分子靶点，以发现新的生物标志物和治疗机制 | 卵巢癌相关基因与劳拉西泮潜在靶点的交集基因，特别是PTK2基因 | 计算生物学 | 卵巢癌 | qPCR, CCK-8, 克隆形成, 伤口愈合, 流式细胞术, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | Lasso-Cox模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1040 | 2026-02-12 |
Single-cell RNA-seq reveals a key role for Vibrio cholerae Mak toxins in Tetrahymena pyriformis killing and bacterial survival
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1729243
PMID:41657991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq技术揭示了霍乱弧菌Mak毒素在杀死四膜虫和细菌在EFVs中存活的关键作用 | 首次利用单细胞转录组学分析霍乱弧菌暴露于四膜虫时的异质性基因表达，并识别出Mak毒素作为抵抗原生动物捕食和EFVs内存活的关键介质 | 研究仅关注霍乱弧菌和四膜虫的相互作用，分子机制细节仍需进一步探索 | 探究霍乱弧菌抵抗原生动物捕食的分子机制及其在EFVs中的存活策略 | 霍乱弧菌和四膜虫 | 单细胞转录组学 | 霍乱 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 5,344个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |