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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2026-04-17 |
Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis
2025-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825
PMID:40436260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,比较了局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控作用及其临床意义 | 首次整合单细胞测序和TCGA数据库,系统比较了LAIT和ICI对NK细胞的转录调控,并构建了基于NK细胞基因特征的预后模型 | 研究基于小鼠乳腺癌模型,临床转化需进一步验证;单细胞测序样本量有限 | 阐明局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤微环境中NK细胞的调控机制 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠乳腺癌模型,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1022 | 2026-04-17 |
ChemPerturb-seq screen identifies a small molecule cocktail enhancing human beta cell survival after subcutaneous transplantation
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.002
PMID:40562034
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研究论文 | 本研究开发了一种结合化学筛选与单细胞RNA测序的ChemPerturb-seq平台,用于系统分析小分子处理后人源β细胞的分子变化,并发现了一种能增强皮下移植后β细胞存活的小分子混合物 | 创新性地将化学筛选与单细胞RNA测序结合,开发了ChemPerturb-seq平台,实现了高通量分析小分子对细胞分子层面的影响,并发现了性别特异性的小分子混合物效果 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未在人体临床试验中证实效果;且发现的小分子混合物对雌性小鼠有效,但对雄性小鼠效果有限,存在性别差异 | 旨在通过化学筛选和单细胞分析,发现能增强人源β细胞在皮下移植后存活和功能的小分子混合物 | 人源β细胞和原代胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | AI驱动的网站分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,涉及人源β细胞和原代胰岛的体外及小鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1023 | 2026-04-17 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
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研究论文 | 本研究揭示了酒精相关性肝病中肠道与肝内CD8+ T细胞的反向调控机制及其在疾病进展中的关键作用 | 首次发现酒精暴露导致十二指肠CD8+ T细胞特异性减少而肝内CD8+ T细胞增加的反向调控现象,并证明BCL2在其中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的关联分析,需要进一步验证BCL2调控机制在人体中的直接作用 | 探究肠道与肝内CD8+ T细胞在酒精相关性肝病中的调控机制及其对疾病进展的影响 | ALD患者样本、野生型小鼠、CD8特异性Bcl2转基因小鼠和Cd8基因敲除小鼠 | 单细胞组学 | 酒精相关性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ALD患者样本及多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1024 | 2026-04-17 |
Identification of Immune Hub Genes in Obese Postmenopausal Women Using Microarray and Single-Cell RNA Seq Data
2025-Jun-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070783
PMID:40725440
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研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据,识别了绝经后肥胖女性脂肪组织中的关键免疫枢纽基因 | 结合WGCNA、PPI网络分析和单细胞RNA测序验证,首次在绝经后肥胖女性中鉴定出与脂肪组织炎症相关的免疫枢纽基因,并揭示了NK细胞在这些基因表达中的重要作用 | 研究样本来源于公共数据库,可能受限于原始数据质量;动物模型验证仅使用斑马鱼,与人类生理存在差异 | 阐明绝经后肥胖女性脂肪组织中免疫失调的分子机制 | 绝经后肥胖女性的脂肪组织 | 生物信息学 | 肥胖症 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | WGCNA, PPI网络分析, ssGSEA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的微阵列数据集GSE151839和单细胞RNA测序数据集GSE176171,以及肥胖和对照斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 1025 | 2026-04-17 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
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研究论文 | 本研究揭示了放疗通过上调铜转运蛋白CTR1、消耗线粒体谷胱甘肽来诱导铜死亡,并发现放疗抵抗与BACH1下调导致的铜螯合蛋白MT1E/X表达升高有关,铜离子载体治疗可增强放疗敏感性 | 首次揭示了放疗诱导铜死亡的机制,并发现铜死亡诱导剂可协同放疗克服肿瘤放疗抵抗 | NA | 阐明放疗诱导铜死亡的机制,并探索通过靶向铜死亡克服肿瘤放疗抵抗的治疗策略 | 食管癌细胞、患者肿瘤样本、细胞系及患者来源的异种移植模型 | NA | 食管癌 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1026 | 2026-04-17 |
Machine learning approach to single cell transcriptomic analysis of Sjogren's disease reveals altered activation states of B and T lymphocytes
2025-Jun, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103419
PMID:40318561
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了干燥综合征患者外周血单个核细胞中B细胞和T细胞独特的基因表达模式和异常的激活状态 | 首次在干燥综合征患者中应用单细胞转录组学结合机器学习方法,系统揭示了B细胞和T细胞中独特的基因表达特征和激活状态改变 | 研究样本量未明确说明,且仅分析了外周血单个核细胞,未直接研究唾液腺等靶器官中的免疫细胞 | 探究干燥综合征的发病机制,识别参与疾病过程的细胞类型和功能变化 | 干燥综合征患者和症状性非干燥综合征对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1027 | 2026-04-17 |
Organ-specific microenvironments drive divergent T cell evolution in acute graft-versus-host disease
2025-Jan-29, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ads1298
PMID:39879321
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研究论文 | 本研究利用非人灵长类动物急性移植物抗宿主病模型,结合多参数流式细胞术、群体转录组分析和单细胞RNA/TCR测序,揭示了肺和肝脏中浸润T细胞在转录程序和克隆扩增方面的器官特异性差异 | 首次在aGVHD模型中系统揭示组织微环境信号如何独立于抗原特异性驱动T细胞的器官特异性转录程序和克隆进化 | 研究基于非人灵长类动物模型,临床转化需进一步验证;单细胞测序样本量相对有限 | 探究组织特异性T细胞免疫应答在急性移植物抗宿主病中的机制 | 非人灵长类动物急性移植物抗宿主病模型中的组织浸润T细胞 | 系统免疫学 | 移植物抗宿主病 | 多参数流式细胞术、群体转录组分析、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 | 非人灵长类动物模型样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 1028 | 2026-04-15 |
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01523-6
PMID:40399534
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研究论文 | 本文通过全基因组测序发现PPM1D基因的功能获得性突变可减轻缺血性脑卒中损伤,并揭示了其通过PPARα通路影响内皮细胞脂肪酸代谢的机制,同时鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在疗法 | 首次在缺血性脑卒中患者中鉴定出PPM1D基因的功能获得性突变具有保护作用,并发现小分子化合物T2755可通过稳定PPM1D蛋白减轻脑损伤 | 研究样本中PPM1D突变携带者仅8例,样本量较小;机制研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证有限 | 探究PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并寻找潜在治疗策略 | 缺血性脑卒中患者(人类)和Ppm1d基因缺陷小鼠(动物模型) | 基因组学与分子机制研究 | 缺血性脑卒中 | 全基因组测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 | NA | 基因组测序数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 10,241名缺血性脑卒中患者(其中8例携带PPM1D突变)及Ppm1d缺陷小鼠模型 | NA | 全基因组测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1029 | 2026-04-15 |
Mechanical confinement governs phenotypic plasticity in melanoma
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09445-6
PMID:40866703
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型和人类样本,揭示了机械限制通过染色质重塑介导黑色素瘤细胞表型可塑性转换的机制 | 首次证明机械限制通过HMGB2蛋白介导的染色质重塑驱动黑色素瘤细胞在增殖与侵袭状态间的可逆转换 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证相对有限,且机械限制的具体物理参数尚未完全量化 | 探究黑色素瘤细胞表型可塑性转换的外部触发机制 | 黑色素瘤细胞(斑马鱼模型及人类样本) | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、单细胞转录组学、形态学分析、定量建模 | NA | 转录组数据、形态学图像 | 斑马鱼黑色素瘤模型及人类肿瘤样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1030 | 2026-04-15 |
Amoeboid-Mesenchymal Transition and the Proteolytic Control of Cancer Invasion Plasticity
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684403
PMID:41278919
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研究论文 | 本文研究了癌症细胞在侵袭过程中通过阿米巴-间质转化和蛋白水解控制来调节侵袭可塑性的机制 | 意外发现阿米巴型和间质型侵袭程序均涉及通过ECM屏障的主动隧道形成和基质降解金属蛋白酶的表达,并强调MMP14在维持核完整性和支持侵袭活性中的关键作用 | 研究主要基于癌症球体-3D基质模型、单细胞RNA测序和人组织外植体,可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究控制间质与阿米巴侵袭的机制,特别是MMP14在癌症侵袭可塑性中的角色 | 癌症细胞,包括在3D基质模型和人乳腺癌组织外植体中的侵袭行为 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学分析,CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 未明确指定样本数量,但涉及癌症球体模型和人组织外植体 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1031 | 2026-04-15 |
Sepsis Induces Age- and Sex-Specific Chromatin Remodeling in Myeloid-Derived Suppressor Cells
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.26.656229
PMID:41279791
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研究论文 | 本研究利用单分子检测技术MAPit-FENGC,结合单细胞RNA测序,揭示了脓毒症后骨髓源性抑制细胞中年龄和性别特异性的染色质重塑机制 | 首次应用MAPit-FENGC技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性,在临床相关小鼠模型中系统揭示了脓毒症诱导的年龄和性别特异性表观遗传重编程 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;样本量相对有限,可能影响统计效力 | 探究脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制,特别是骨髓源性抑制细胞在年龄和性别特异性免疫失调中的作用 | 年轻和老年成年雄性和雌性小鼠的脾脏骨髓源性抑制细胞 | 表观遗传学 | 脓毒症 | MAPit-FENGC, 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 表观遗传数据, 转录组数据 | 年轻和老年成年雄性和雌性小鼠的脾脏MDSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1032 | 2026-04-15 |
RESCUE: recovery of idiosyncratic expression patterns in spatial transcriptomics
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.11.669542
PMID:40832184
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RESCUE的计算方法,用于恢复空间转录组学数据中被现有分析方法遗漏的独特表达模式 | RESCUE能够捕获脆弱或代表性不足的细胞类型、亚细胞结构(如神经突)和细胞外表达等现有方法可能忽略的重要表达模式 | NA | 开发一种计算方法来改善空间转录组学数据分析的完整性和准确性 | 空间转录组学数据,特别是来自蜜蜂大脑的MERFISH数据及其他ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,MERFISH | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学,MERFISH | NA | NA |
| 1033 | 2026-04-14 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
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研究论文 | 本研究探讨了小肠中组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的空间和时间印记机制 | 利用空间转录组学、小鼠模型和新型光学编码基因扰动策略,揭示了肠道结构区域化信号支持两种不同T细胞状态,并开发了计算方法来可视化细胞类型和基因表达的空间时间分布 | NA | 研究组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和机制 | 人类样本和小鼠模型中的病原体特异性CD8 T细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单转录本分辨率分析 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1034 | 2026-04-14 |
Cell motility influences microfluidics capturing in scRNA-seq
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19781.2
PMID:41971304
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研究论文 | 本研究探讨了微流体捕获方法在单细胞RNA测序中对运动性细胞(如鞭毛寄生虫)的适用性,并提出了一种快速冷却策略以提高封装效率 | 首次系统研究了微流体系统对运动性细胞的捕获偏差,并开发了一种通过快速冷却至0°C来降低细胞运动性、避免转录组变化的优化方法 | 研究仅针对鞭毛寄生虫在10x Genomics平台上的应用,未涵盖其他运动性细胞类型或微流体系统,且样本规模可能有限 | 优化微流体单细胞RNA测序协议,以更准确地捕获和分析运动性细胞,避免因细胞运动性导致的亚群丢失偏差 | 鞭毛寄生虫(具体物种未在摘要中明确说明) | 单细胞测序技术 | 寄生虫感染(未指定具体疾病) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium(推断,基于平台描述) | 10x Genomics微流体单细胞RNA测序平台(具体配置未详细说明) |
| 1035 | 2026-04-13 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09653-0
PMID:41125888
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转换和宿主-寄生虫相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术,系统解析了疟原虫在按蚊中肠内的发育过程,并发现了PfSIP2转录因子在子孢子感染人肝细胞中的关键作用 | 研究主要基于实验室模型,尽管验证了野外来源的寄生虫,但实际自然环境中的复杂性可能未被完全覆盖 | 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育机制和宿主-寄生虫相互作用,以寻找阻断传播的策略 | 恶性疟原虫和按蚊中肠细胞 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫和蚊子细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1036 | 2026-04-13 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程,专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据,以提高RNA生物标志物和细胞间通信研究的准确性和鲁棒性 | EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法,显著提高了单碱基分辨率下的多映射读段分配,并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析,这是现有工具所不具备的功能 | NA | 开发一个标准化的计算工作流程,以应对细胞外囊泡RNA测序数据分析中的挑战,包括低丰度、片段化及污染问题 | 细胞外囊泡RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 总RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1037 | 2026-04-12 |
Comparative analysis of human and mouse ovaries across age
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx0659
PMID:41066539
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研究论文 | 本研究通过三维成像、单细胞转录组学和功能实验,比较了人类和小鼠卵巢在衰老过程中的差异 | 首次构建了跨物种卵巢衰老的比较图谱,揭示了物种特异性和年龄相关的转录与信号差异,并发现了卵巢交感神经在卵泡生成中的作用 | 研究可能未涵盖所有卵巢细胞类型或衰老阶段,且功能验证主要在小鼠中进行 | 比较人类和小鼠卵巢的生物学特征,特别是衰老过程中的变化 | 人类和小鼠的卵巢组织 | 单细胞生物学 | 生殖衰老 | 三维成像、单细胞转录组学、功能研究 | NA | 图像数据、转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及人类和小鼠卵巢 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1038 | 2026-04-12 |
Dual-modality Molecular Cartography: Integrating Multiplex mRNA Detection with Protein Imaging Mass Cytometry
2025-11-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68616
PMID:41325369
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研究论文 | 本文介绍了一种整合多重mRNA检测与蛋白质成像质谱流式技术的双模态分子图谱方法,用于同时分析组织切片中的蛋白质和mRNA | 创新性地将蛋白质成像质谱流式技术与mRNA原位杂交结合,利用金属探针系统避免了荧光光谱溢出和组织自发荧光问题 | NA | 开发一种能够同时检测蛋白质和mRNA的空间解析技术,以更好地理解细胞在微环境中的通讯机制 | 组织切片中的蛋白质和mRNA分子 | 数字病理学 | NA | mRNA原位杂交,蛋白质成像质谱流式技术 | NA | 图像,分子表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 基于金属探针的检测系统 |
| 1039 | 2026-04-12 |
Microfluidics-based High-throughput Circulating Tumor Cell Sorting and Single-cell Sequencing Technology
2025-11-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68708
PMID:41325384
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研究论文 | 本文介绍了一种集成了微流控技术的高通量循环肿瘤细胞分选与单细胞测序平台 | 提出了一种集CTC富集、纯化和单细胞测序于一体的统一微流控工作流程,采用动态控制磁捕获、涡旋混合和基于流阻差异的高精度单细胞捕获芯片,克服了传统方法回收率低、工作流程繁琐和污染风险高的问题 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一种高效、高通量的循环肿瘤细胞分选与单细胞测序技术,以克服现有方法的不足 | 循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2026-04-12 |
Cell Subtype-specific Analysis of Neuronal Membrane Proteasome in Somatosensory Neurons
2025-10-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69061
PMID:41144432
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研究论文 | 本文研究了神经元膜蛋白酶体(NMP)在体感神经元亚型中的特异性表达及其在机械、痒和痛觉感知中的关键作用 | 首次在体感神经元亚型中鉴定出神经元膜蛋白酶体(NMP),并揭示其作为感觉神经元间通讯的关键调节器,选择性抑制NMP可减少机械和痛觉敏感性而不引起神经病变 | 研究主要基于小鼠模型,体外研究结果需在体内进一步验证,且NMP的具体信号肽释放机制尚未完全阐明 | 探究神经元膜蛋白酶体(NMP)在体感神经元中的亚型特异性表达及其在感觉感知中的功能 | 小鼠外周体感神经元,特别是表达MrgprA3和Cysltr2的神经元亚型 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、抗体喂养、荧光激活细胞分选(FACS) | NA | RNA测序数据、细胞分选数据 | 小鼠体感神经元样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |