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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 10361 - 10380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10361 | 2025-10-07 |
COSIME: Cooperative multi-view integration and Scalable and Interpretable Model Explainer
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.11.632570
PMID:39868220
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研究论文 | 提出COSIME方法用于多组学数据整合和可解释性分析 | 结合可学习最优传输和蒙特卡洛采样，实现多视图整合并评估特征重要性和相互作用 | NA | 解决异质数据类型整合和生物特征关系解释的瓶颈问题 | 阿尔茨海默病相关表型 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 单细胞空间转录组学, 表观基因组学, 代谢组学 | 深度神经网络 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10362 | 2025-10-07 |
Aberrant c-AMP signalling in richter syndrome revealed by single-cell transcriptome and 3D chromatin analysis
2025-Jan-23, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00723-5
PMID:39849544
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研究论文 | 通过单细胞转录组和3D染色质分析揭示Richter综合征中异常的cAMP信号通路 | 首次整合单细胞RNA测序和Hi-C技术分析Richter综合征，揭示染色质重构和cAMP信号异常在疾病转化中的关键作用 | 仅基于单个患者的配对样本进行分析，样本量有限 | 阐明Richter综合征的发病机制 | DLBCL-RS患者的配对样本（CLL和DLBCL细胞） | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, Hi-C测序, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞转录组数据, 3D染色质构象数据 | 超过10,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量染色体构象捕获 | NA | NA |
| 10363 | 2025-10-07 |
The role of MRO as an M2 macrophage-associated gene in non-small cell lung cancer: insights into immune infiltration, prognostic significance, and therapeutic implications
2025-Jan-21, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01817-8
PMID:39838218
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研究论文 | 本研究探讨M2巨噬细胞相关基因MRO在非小细胞肺癌中的免疫浸润、预后意义和治疗潜力 | 首次系统揭示MRO基因作为M2巨噬细胞标志物在非小细胞肺癌中的预后价值和免疫治疗预测意义 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证MRO的具体功能机制 | 探索MRO基因在非小细胞肺癌免疫微环境中的作用和临床意义 | 非小细胞肺癌患者样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法, ESTIMATE算法, TIDE分析, Submap分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的非小细胞肺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10364 | 2025-10-07 |
Characterizing the diabetes-induced pathological changes of the mouse lung by single-cell RNA sequencing
2025-Jan-18, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123408
PMID:39832739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术表征糖尿病对小鼠肺部造成的病理变化 | 首次在晚期糖尿病小鼠肺中发现免疫细胞显著增加且主要为未成熟PMN-MDSCs，并揭示了肺泡细胞在糖尿病早期呈现间质表型及免疫功能下降的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病对肺部病理变化的影响机制 | 糖尿病小鼠模型肺组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10365 | 2025-10-07 |
Novel Integration of Spatial and Single-Cell Omics Data Sets Enables Deeper Insights into IPF Pathogenesis
2025-Jan-13, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13010003
PMID:39846634
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据，识别特发性肺纤维化中与疾病相关的细胞类型和潜在治疗靶点 | 创新性地整合空间多组学与单细胞RNA测序数据，并验证了空间蛋白质组学与单细胞RNA测序整合方法的有效性 | NA | 深入理解特发性肺纤维化发病机制，识别与组织病理区域相关的细胞类型 | 人类特发性肺纤维化肺组织样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 激光捕获显微切割质谱, 空间蛋白质组学 | Query方法, Overlap方法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 10366 | 2025-10-07 |
Galaxy as a gateway to bioinformatics: Multi-Interface Galaxy Hands-on Training Suite (MIGHTS) for scRNA-seq
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae107
PMID:39775842
|
研究论文 | 开发了一个多界面Galaxy实践培训套件(MIGHTS)，用于单细胞RNA测序分析 | 提供并行分析方法，支持图形界面和代码两种操作方式，促进不同编程水平科学家的同步培训 | NA | 解决生物信息学学习曲线陡峭的问题，为生物学家和临床医生提供单细胞分析培训工具 | 生物学家、临床医生和初学生物信息学的研究人员 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Galaxy平台 | Galaxy Training Network，支持Python-based (Scanpy)和R-based (Seurat & Monocle)分析 |
| 10367 | 2025-10-07 |
Cellular heterogeneity and cytokine signatures in acute myeloid leukemia: A novel prognostic model
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102194
PMID:39689517
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病的细胞异质性，并基于细胞因子相关基因构建预后风险评分模型 | 首次基于7个关键细胞因子相关基因(CCL23, IL2RA, IL3RA, IL6R, INHBA, TNFSF15, TNFSF18)构建AML预后风险模型，揭示了风险组间免疫细胞浸润和细胞因子信号传导的显著差异 | 使用公开数据集，缺乏前瞻性临床验证 | 开发急性髓系白血病的精准预后评估工具 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据 | 多个独立AML患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10368 | 2025-10-07 |
KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009
PMID:39577768
|
研究论文 | 提出基于Kolmogorov-Arnold网络的KanCell深度学习模型，通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据来增强细胞异质性分析 | 利用KAN网络有效捕捉非线性关系并优化计算效率，在多种评估指标上优于现有方法 | NA | 开发整合单细胞和空间转录组数据的计算模型以解析细胞异质性 | 人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、背外侧前额叶皮层和小鼠胚胎大脑 | 计算生物学 | 多种癌症（黑色素瘤、乳腺癌） | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | KAN（Kolmogorov-Arnold网络） | 基因表达数据 | 模拟和真实数据集（来自STARmap、Slide-seq、Visium和Spatial Transcriptomics平台） | 10x Genomics, 其他（STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics） | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Visium, 其他（STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics） | 10x Visium空间转录组平台及其他空间转录组技术 |
| 10369 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell transcriptome revealed the metabolic heterogeneity in human glioma
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41241
PMID:39844970
|
研究论文 | 本研究通过整合分析批量、单细胞和空间转录组数据，揭示了人类胶质瘤的代谢异质性并建立了基于四种关键代谢途径的预后分型系统 | 首次基于四种关键代谢途径（谷氨酰胺分解、糖酵解、磷酸戊糖途径和脂肪酸氧化）构建胶质瘤代谢分型系统，并结合单细胞和空间转录组分析揭示代谢异质性与肿瘤微环境的关联 | 研究基于转录组数据，未直接验证代谢功能；样本量相对有限；需要进一步实验验证CX3CL1/CX3CR1信号轴的功能 | 开发基于代谢途径的胶质瘤分类系统，揭示代谢异质性及其临床意义 | 人类胶质瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 批量转录组测序，单细胞RNA测序，空间转录组 | ConsensusClusterPlus，CellChat，stLearn | 转录组数据，单细胞数据，空间数据 | 多个胶质瘤数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组，批量RNA-seq | NA | NA |
| 10370 | 2025-10-07 |
Clinical and immunological outcomes after randomized trial of baked milk oral immunotherapy for milk allergy
2025-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184301
PMID:39782691
|
研究论文 | 本研究评估烘焙牛奶口服免疫疗法对牛奶过敏儿童的安全性和有效性 | 首次通过随机试验证明烘焙牛奶口服免疫疗法可在减少不良反应的同时诱导脱敏，并识别了成功的免疫学相关标志物 | 样本量相对较小，仅包含30名参与者 | 确定烘焙牛奶口服免疫疗法是否能减少不良反应同时诱导脱敏，并识别成功的免疫学相关因素 | 3-18岁牛奶过敏儿童 | 临床免疫学 | 食物过敏 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | 预测模型 | 临床数据，免疫学数据 | 30名牛奶过敏儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10371 | 2025-10-07 |
Altered Atlas of Exercise-Responsive MicroRNAs Revealing miR-29a-3p Attacks Armored and Cold Tumors and Boosts Anti-B7-H3 Therapy
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0590
PMID:39845707
|
研究论文 | 本研究揭示了miR-29a-3p作为运动响应性miRNA通过抑制B7-H3表达攻击装甲型和冷肿瘤并增强抗B7-H3治疗的机制 | 首次发现miR-29a-3p是关键的运动响应性miRNA，能同时靶向巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞下调B7-H3表达，并开发了具有良好生物相容性的lipo@miR-29a-3p纳米递送系统 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，尚未进行大规模临床试验验证 | 探索运动响应性miRNA在肿瘤抑制中的作用机制及其治疗潜力 | 乳腺癌及多种泛癌类型，包括巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，飞行时间质谱流式细胞术，体外实验，体内模型 | 动物模型 | 基因表达数据，预后数据，单细胞测序数据 | 多个独立公共队列和内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10372 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the carotid artery and femoral artery of rats exposed to hindlimb unloading
2025-Jan-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05572-x
PMID:39833543
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了后肢卸载大鼠颈动脉和股动脉的细胞图谱，揭示了模拟微重力条件下血管重塑的细胞分子机制 | 首次构建后肢卸载大鼠传导动脉的单细胞图谱，系统揭示了血管细胞异质性、细胞间通讯和转录因子网络在血管重塑中的作用 | 研究仅基于大鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证；样本量相对有限 | 探究模拟微重力条件下大鼠动脉血管重塑的细胞分子机制 | 后肢卸载处理3个月的大鼠颈动脉和股动脉组织 | 单细胞组学 | 血管功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析，细胞通讯分析，转录因子网络分析 | 单细胞转录组数据 | 后肢卸载大鼠的颈动脉和股动脉组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10373 | 2025-10-07 |
Inhibition of programmed cell death by melanoma cell subpopulations reveals mechanisms of melanoma metastasis and potential therapeutic targets
2025-Jan-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01789-9
PMID:39832036
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示黑色素瘤细胞亚群抑制程序性细胞死亡的机制及其在转移中的作用 | 首次通过单细胞测序技术识别出C0 SOD3+黑色素瘤核心亚群，并发现其与氧化途径和转移过程的密切关联 | 研究主要基于单细胞测序数据分析，部分机制需要进一步实验验证 | 探究黑色素瘤转移机制并识别潜在治疗靶点 | 黑色素瘤肿瘤组织中的细胞亚群 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10374 | 2025-10-07 |
Polycystin-1 regulates tendon-derived mesenchymal stem cells fate and matrix organization in heterotopic ossification
2025-Jan-20, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00392-y
PMID:39833160
|
研究论文 | 本研究揭示机械敏感蛋白Polycystin-1通过调控肌腱来源间充质干细胞的命运和细胞外基质组织影响异位骨化进程 | 首次发现CTSK谱系肌腱来源间充质干细胞是异位骨化的主要细胞来源，并阐明PC1-TAX信号轴在机械信号传导中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证 | 探究机械应力影响异位骨化的细胞机制和分子通路 | CTSK谱系肌腱来源间充质干细胞 | 干细胞生物学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 谱系追踪小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10375 | 2025-10-07 |
Revolutionizing ESCC prognosis: the efficiency of tumor-infiltrating immune cells (TIIC) signature score
2025-Jan-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01709-3
PMID:39833504
|
研究论文 | 本研究开发了基于肿瘤浸润免疫细胞特征评分的食管鳞癌预后模型 | 首次开发了肿瘤浸润免疫细胞特征评分，为ESCC预后和免疫治疗提供了新策略 | NA | 评估肿瘤浸润免疫细胞特征评分在食管鳞癌预后中的效能 | 食管鳞癌患者样本 | 机器学习 | 食管鳞癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | 二十种机器学习算法 | 转录组数据，单细胞RNA-seq数据 | 来自GEO和TCGA数据库的ESCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10376 | 2025-10-07 |
Benchmarking cell type annotation methods for 10x Xenium spatial transcriptomics data
2025-Jan-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06044-0
PMID:39833693
|
研究论文 | 本研究对10x Xenium空间转录组数据的细胞类型注释方法进行了基准测试 | 首次系统评估基于参考的细胞类型注释工具在成像空间转录组数据上的性能表现 | 仅评估了五种基于参考的注释工具，且仅使用人类乳腺癌Xenium数据进行验证 | 评估和比较不同细胞类型注释方法在10x Xenium空间转录组数据上的性能 | 人类乳腺癌组织的10x Xenium空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | SingleR, Azimuth, RCTD, scPred, scmapCell | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 成像空间转录组平台 |
| 10377 | 2025-10-07 |
Desmoglein-2 was a novel cancer-associated fibroblasts-related biomarker for oral squamous cell carcinoma
2025-Jan-20, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-024-05284-5
PMID:39833796
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出口腔鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞相关生物标志物DSG2 | 首次发现DSG2作为口腔鳞状细胞癌中CAFs相关的新型预后生物标志物 | CAFs在OSCC中的具体作用机制仍不完全清楚 | 探索口腔鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞相关生物标志物 | 口腔鳞状细胞癌样本 | 单细胞测序分析 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, western blot, 生物信息学分析 | Cox回归分析, ROC分析, Pearson相关分析 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10378 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and multi-omics analyses reveal ferroptosis-associated gene expression and immune microenvironment heterogeneity in gastric cancer
2025-Jan-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01798-8
PMID:39831925
|
研究论文 | 通过整合单细胞和多组学分析揭示胃癌中铁死亡相关基因表达和免疫微环境异质性 | 首次在胃癌中系统整合单细胞RNA测序与多组学数据研究铁死亡相关基因表达谱和免疫微环境异质性 | 未明确说明样本数量和具体实验验证细节 | 探究胃癌中铁死亡相关基因表达特征及其与免疫微环境的关系 | 胃癌组织和微环境中的细胞群体 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, ssGSEA分析, GO/KEGG富集分析 | 机器学习预测模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 10379 | 2025-10-07 |
Acquisition of discrete immune suppressive barriers contributes to the initiation and progression of preinvasive to invasive human lung cancer
2025-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.31.630523
PMID:39803458
|
研究论文 | 通过单细胞技术构建肺腺癌从癌前到浸润阶段的高分辨率免疫图谱，揭示免疫抑制屏障的形成机制 | 首次构建个体肺部分实性结节中非实性（癌前）和实性（浸润）区域的高分辨率单细胞图谱，发现4-1BB+ Treg新亚群及其IL2-STAT5抑制通路 | 研究样本量有限，主要聚焦肺腺癌的特定发展阶段 | 揭示肺腺癌从癌前病变向浸润性癌发展的早期决定因素 | 人类肺部分实性结节组织的微解剖样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 多重成像质谱流式, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间成像数据, 转录组数据 | 个体肺部分实性结节的微解剖样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重成像 | NA | NA |
| 10380 | 2025-10-07 |
Single-cell landscape of the intrahepatic ecosystem in alcohol-related liver disease
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70198
PMID:39834100
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了酒精相关肝病肝内生态系统的细胞景观，发现具有干细胞特性和恶性转化潜能的ALBKRT7上皮细胞群 | 首次在人类ALD肝脏中发现同时表达肝细胞和胆管标记的ALBKRT7上皮细胞群，并证明其通过Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤生长 | NA | 阐明酒精相关肝病的分子机制和恶性转化过程 | 酒精相关肝病患者和健康供体的肝脏组织 | 单细胞生物学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |