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当前共找到 10620 篇文献，本页显示第 10321 - 10340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10321 | 2025-10-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_13
PMID:39900764
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研究论文 | 介绍SciDAP平台如何简化单细胞测序数据分析流程 | 开发了基于通用工作流语言的便携可重复分析流程，为非计算背景的生物学家提供用户友好的单细胞数据分析方案 | 未提及平台性能的具体量化评估数据 | 解决单细胞测序数据分析的复杂性和可重复性问题 | 单细胞测序数据分析流程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | SciDAP | 基于通用工作流语言的计算分析平台 |
| 10322 | 2025-10-07 |
Improving doublet cell removal efficiency through multiple algorithm runs
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.009
PMID:39911841
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研究论文 | 提出一种多轮双细胞去除策略，通过多次运行算法提高单细胞RNA测序数据中双细胞的去除效率 | 首次提出多轮双细胞去除策略，通过循环运行算法减少随机性，显著提升双细胞检测效果 | 未明确说明计算成本增加程度，且策略效果依赖于基础算法的性能 | 提高单细胞RNA测序数据分析中双细胞去除的效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | DoubletFinder, cxds, bcds, hybrid | 单细胞RNA测序数据 | 14个真实数据集、29个条形码标记数据集和106个合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10323 | 2025-02-07 |
SCovid v2.0: a comprehensive resource to decipher the molecular characteristics across tissues in COVID-19 and other human coronaviruses
2025-Feb-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01933-24
PMID:39714149
|
研究论文 | SCovid v2.0是一个更新的数据库，旨在通过转录组测序帮助研究人员揭示2019冠状病毒病（COVID-19）在不同组织中的分子特征 | SCovid v2.0相较于其前身，增加了全面的数据、实用的功能，并重建了分析流程，包括更多的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，以及与其他人类冠状病毒的比较分析 | NA | 揭示COVID-19在不同组织中的分子特征，并进行与其他人类冠状病毒的比较分析 | COVID-19及其他人类冠状病毒的分子特征 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 3,544,360个细胞来自45个单细胞RNA测序数据集，涵盖15个组织的789个样本；1,688个样本来自12个组织的62个COVID-19批量RNA测序数据；7个与其他人类冠状病毒相关的批量RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 10324 | 2025-02-07 |
Development of a prognostic model based on four genes related to exhausted CD8+ T cell in triple-negative breast cancer patients: a comprehensive analysis integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-Feb-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01812-z
PMID:39899181
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研究论文 | 本研究旨在开发基于与耗竭CD8+ T细胞相关的四个基因的三阴性乳腺癌（TNBC）预后模型，并探讨其临床和免疫相关性 | 通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，筛选出与TNBC患者生存显著相关的四个基因，构建了一个新的预后模型 | 研究主要依赖于公开数据集，缺乏独立的外部验证队列 | 开发一个基于耗竭CD8+ T细胞相关基因的TNBC预后模型，并评估其临床和免疫相关性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | TCGA队列和外部队列的TNBC患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 10325 | 2025-02-07 |
EMT-driven plasticity prospectively increases cell-cell variability to promote therapeutic adaptation in breast cancer
2025-Feb-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03637-w
PMID:39901189
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研究论文 | 本文研究了上皮-间质转化（EMT）驱动的细胞可塑性在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗适应中的作用 | 首次揭示了EMT驱动的可塑性如何增加细胞间表型多样性，并在化疗前产生罕见的预适应状态 | 研究仅基于体外模型，未涉及体内环境 | 探讨EMT驱动的可塑性在TNBC治疗适应中的作用 | 三阴性乳腺癌（TNBC）细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个TNBC体外模型 | NA | NA | NA | NA |
| 10326 | 2025-02-06 |
Single-cell transcriptomics and metabolomic analysis reveal adenosine-derived metabolites over-representation in pseudohypoxic neuroendocrine tumours
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70159
PMID:39902723
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10327 | 2025-02-06 |
Gal-3 activates Tyro3 to ameliorate ferroptosis of hippocampal neurons after traumatic brain injury
2025-Mar-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102433
PMID:39902149
|
研究论文 | 本文研究了创伤性脑损伤（TBI）后海马神经元的铁死亡机制，并探讨了Gal-3通过激活Tyro3来改善神经元铁死亡的作用 | 首次揭示了Tyro3在TBI后神经元铁死亡中的关键作用，并发现Gal-3通过激活Tyro3具有神经保护作用 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨TBI后海马神经元铁死亡的机制及其潜在治疗靶点 | 创伤性脑损伤后的海马神经元 | 生物信息学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10328 | 2025-02-06 |
Single-cell omics in inflammatory bowel disease: recent insights and future clinical applications
2025-Feb-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334165
PMID:39904604
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在炎症性肠病（IBD）研究中的应用及其未来临床应用的潜力 | 单细胞组学技术克服了传统批量分析的局限性，揭示了多细胞组织的复杂性，并发现了与疾病活动或并发症发展相关的新细胞类型和功能 | 尽管单细胞组学技术在IBD研究中显示出巨大潜力，但其在临床实践中的应用仍处于早期阶段，存在一定的局限性 | 探讨单细胞组学技术在炎症性肠病（IBD）研究中的应用及其未来临床应用的潜力 | 溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD） | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10329 | 2025-02-05 |
Dynamic evolution of TCF3-PBX1 leukemias at the single-cell level under chemotherapy pressure
2025-Feb, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70071
PMID:39901941
|
研究论文 | 本文通过建立TCF3-PBX1条件性敲入小鼠模型，研究了化疗压力下急性淋巴细胞白血病（ALL）在单细胞水平的动态演化 | 首次在单细胞水平上揭示了TCF3-PBX1白血病在化疗后的克隆动态演化和表型多样性，并发现了与化疗耐药相关的信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类ALL中的适用性需要进一步验证 | 研究TCF3-PBX1白血病在化疗压力下的动态演化和耐药机制 | TCF3-PBX1条件性敲入小鼠模型和化疗后的白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序技术（NGS）和质谱流式细胞术 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据和质谱流式细胞数据 | TCF3-PBX1白血病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 10330 | 2025-10-07 |
GraphVelo allows for accurate inference of multimodal velocities and molecular mechanisms for single cells
2025-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626638
PMID:39677753
|
研究论文 | 提出基于图机器学习的方法GraphVelo，用于从单细胞数据中准确推断多模态速度和分子机制 | 通过图机器学习方法将RNA速度扩展到多模态数据，保留向量大小和方向信息，揭示基因、病毒与宿主细胞之间的定量非线性调控关系 | 需要依赖现有方法推断的RNA速度作为输入，对复杂转录动态、低表达或缺乏剪接动态的基因可能仍有局限 | 开发能够从高通量单细胞快照数据中提取时间分辨信息的方法 | 单细胞数据，包括病毒-宿主相互作用组和多组学数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, 多组学分析 | 图机器学习 | 单细胞RNA测序数据，多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，多组学 | NA | NA |
| 10331 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evolutionary Reconfiguration of Embryonic Cell Fate Specification in the Sea Urchin Heliocidaris erythrogramma
2025-Jan-06, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evae258
PMID:39587400
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较两种海胆胚胎发育过程，揭示进化过程中细胞命运决定机制的重构 | 首次在进化发育生物学中应用比较单细胞转录组时间序列分析，发现细胞命运决定与主要信号中心在进化过程中发生时空分离 | 研究主要基于转录组数据，需要后续实验验证调控相互作用的改变 | 探究海胆进化过程中胚胎发育机制的演化改变 | Heliocidaris erythrogramma和Lytechinus variegatus两种海胆的胚胎细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种海胆物种的胚胎发育时间序列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10332 | 2025-02-06 |
Biologically inspired heterogeneous learning for accurate, efficient and low-latency neural network
2025-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae301
PMID:39758128
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研究论文 | 本文提出了一种受生物启发的异质学习机制，用于构建准确、高效且低延迟的神经网络 | 结合了自抑制突触和神经元异质性的神经科学发现，创新性地提出了具有增强学习和记忆能力的脉冲神经网络（SNN） | 未明确提及具体限制 | 追求与生物神经网络相媲美的准确性、效率和低延迟的人工神经网络 | 脉冲神经网络（SNN）及其在AI任务中的应用 | 机器学习 | 脑部疾病 | scRNA-seq | SNN | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 10333 | 2025-02-05 |
Hepatic HSD17B6 is dispensable for diet-induced fatty liver disease in mice
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101924
PMID:39896111
|
研究论文 | 本研究探讨了HSD17B6在饮食诱导的脂肪肝疾病中的作用 | 首次揭示了HSD17B6在肝脏中的表达与脂肪肝疾病的相关性，并发现其肝脏特异性缺失不影响脂肪肝疾病的发展 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究HSD17B6在饮食诱导的脂肪肝疾病中的作用 | 小鼠模型 | 代谢疾病研究 | 脂肪肝疾病 | 单细胞RNA测序, AAV8介导的基因编辑 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 10334 | 2025-02-05 |
Single-cell RNA sequencing provides new insights into the interaction between astrocytes and neurons after spinal cord injury in mice
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101917
PMID:39896108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠脊髓损伤后不同阶段及正常组织中星形胶质细胞和神经元亚型的动态变化及其功能，揭示了特定星形胶质细胞亚型在脊髓损伤过程中可能向神经元转化的机制 | 发现了一种特定亚型的星形胶质细胞，其具有独特的基因表达特征，并在脊髓损伤过程中可能转化为神经元，同时揭示了糖酵解途径在这一细胞转化过程中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨脊髓损伤后星形胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在疾病进展中的机制 | 小鼠脊髓损伤模型中的星形胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 小鼠脊髓损伤模型及正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10335 | 2025-02-05 |
Single-cell transcriptome atlas of male mouse pituitary across postnatal life highlighting its stem cell landscape
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111708
PMID:39898054
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研究论文 | 本文构建了雄性小鼠内分泌垂体的单细胞转录组图谱，涵盖了健康与损伤状态下的重要出生后年龄段，重点研究了垂体干细胞及其复杂身份和微环境 | 通过单细胞转录组技术揭示了垂体干细胞的标记物和调控因子，并利用垂体干细胞类器官功能验证了转录组发现，特别是KLF5、AP-1复合物和EGF通路在垂体干细胞调控中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，尽管部分发现可转化至人类，但仍需进一步验证 | 揭示垂体干细胞的生物学特性及其在衰老过程中的变化 | 雄性小鼠的垂体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖健康与损伤状态下的雄性小鼠垂体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10336 | 2025-02-05 |
Molecular characterization of ovarian mesonephric-like adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing and mitochondrial metabolism
2025-Feb, Gynecologic oncology reports
IF:1.2Q3
DOI:10.1016/j.gore.2024.101670
PMID:39895896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对卵巢中肾样腺癌（MLA）进行了分子特征分析，并与高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）进行了比较 | 首次使用单细胞RNA测序技术对卵巢MLA进行分子特征分析，揭示了其与HGSOC的差异，并提出了针对MAP激酶和PI3K/AKT/mTOR通路的联合治疗策略 | 需要在更大规模的队列中进行验证以支持临床应用 | 揭示卵巢MLA的分子特征及其与HGSOC的差异，探索潜在的治疗靶点 | 卵巢中肾样腺癌（MLA）和高级别浆液性卵巢癌（HGSOC） | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 一个卵巢MLA样本和HGSOC的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 10337 | 2025-02-05 |
Bioinformatics combining machine learning and single-cell sequencing analysis to identify common mechanisms and biomarkers of rheumatoid arthritis and ischemic heart failure
2025-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e41641
PMID:39897930
|
研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞测序分析，旨在识别类风湿性关节炎（RA）和缺血性心力衰竭（IHF）的共同机制和生物标志物 | 通过整合多个RA和IHF数据集的RNA测序数据，识别出177个共同差异表达基因，并通过PPI网络分析和机器学习确定了五个枢纽基因，揭示了炎症免疫反应在RA患者IHF进展中的关键作用 | 研究依赖于现有数据集，可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别RA和IHF的共同机制和生物标志物，为早期诊断、个性化治疗和预防策略提供方向 | 类风湿性关节炎（RA）和缺血性心力衰竭（IHF）患者 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎, 缺血性心力衰竭 | RNA测序, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | RNA测序数据 | 五个RA和IHF数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 10338 | 2025-02-05 |
Multi-omics analysis of core E3 ubiquitin ligase identifies prognostic biomarkers associated with immune infiltration and drug sensitivity in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104837
PMID:39895786
|
研究论文 | 本文通过多组学分析核心E3泛素连接酶，识别了与肺腺癌免疫浸润和药物敏感性相关的预后生物标志物 | 首次系统研究了E3泛素连接酶在肺腺癌中的表达、预后、免疫浸润、药物敏感性及潜在分子机制，并发现其与不良预后和特定免疫细胞浸润相关 | 研究主要基于数据库分析和计算机模拟，缺乏实验验证 | 研究E3泛素连接酶在肺腺癌中的调控作用及其作为预后和药物敏感性标志物的潜力 | 肺腺癌（LUAD）患者及肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 多组学分析、免疫荧光分析、免疫组化、单细胞分析、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、免疫浸润数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10339 | 2025-02-05 |
Integrating of Radiomics and Single-cell Transcriptomics Uncovers the Crucial Role of γδ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105586
PMID:39895781
|
研究论文 | 本研究通过整合放射组学和单细胞转录组学，揭示了γδ T细胞在肺腺癌中的关键作用 | 首次结合多组学数据研究γδ T细胞在肺腺癌中的功能，并建立了基于放射组学的预测模型 | γδ T细胞在肿瘤中的双重作用及其对肺腺癌的影响仍存在争议 | 探讨γδ T细胞在肺腺癌中的功能及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 放射组学、单细胞转录组学 | 预测模型 | CT图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10340 | 2025-02-05 |
Integration of Single-Cell and Bulk Transcriptomes to Identify a Poor Prognostic Tumor Subgroup to Predict the Prognosis of Patients with Early-stage Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105926
PMID:39895784
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了早期肺腺癌的不良预后肿瘤亚群，并构建了预后模型 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征，并开发了一个基于KRT8和PERP的新型预后模型 | 研究主要依赖于已发表的文献和数据库中的细胞标记物，可能限制了新细胞类型的发现 | 研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征并开发预后模型 | 早期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR），蛋白质印迹（western blot） | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |