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当前共找到 10796 篇文献，本页显示第 10301 - 10320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10301 | 2025-10-07 |
Advancements in single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics: transforming biomedical research
2025, Acta biochimica Polonica
IF:1.4Q4
DOI:10.3389/abp.2025.13922
PMID:39980637
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术的发展及其在生物医学研究中的变革性应用 | 强调空间转录组学在保留RNA转录组空间信息方面的突破性进展，克服了传统单细胞测序技术丢失空间信息的局限性 | 传统单细胞RNA测序技术无法保留RNA转录组的空间信息，因为该过程需要组织解离和细胞分离 | 探讨单细胞测序和空间转录组学技术的最新发展、相关挑战及其在生物医学领域的应用 | 单细胞RNA测序和空间转录组学技术及其在生物医学研究中的应用 | 生物医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10302 | 2025-10-07 |
Cancer stem cells and tumor-associated macrophages as mates in tumor progression: mechanisms of crosstalk and advanced bioinformatic tools to dissect their phenotypes and interaction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529847
PMID:39981232
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综述 | 本文系统阐述癌症干细胞与肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展中的相互作用机制及生物信息学分析工具 | 整合前沿生物信息学工具（单细胞RNA测序、空间转录组学、轨迹分析）解析CSC-TAM相互作用的表型和机制 | NA | 阐明癌症干细胞与肿瘤微环境免疫细胞（特别是肿瘤相关巨噬细胞）相互作用的分子机制 | 癌症干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10303 | 2025-10-07 |
An anoikis-related signature predicts prognosis and immunotherapy response in gastrointestinal cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1477913
PMID:39981252
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于失巢凋亡相关基因的预后特征(Anoscore)，用于预测胃肠道癌症患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了基于失巢凋亡相关基因的预后评分系统，并验证其在胃肠道癌症预后预测和个性化治疗方案选择中的价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索失巢凋亡相关基因在胃肠道癌症预后中的作用 | 食管癌、胃癌、结肠癌和直肠癌患者 | 生物信息学 | 胃肠道癌症 | RNA测序、单细胞测序分析、无监督聚类分析、Cox回归分析 | LASSO回归、Cox回归模型 | RNA测序数据、临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃肠道癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10304 | 2025-02-21 |
Schwann Cell-Secreted S100B Promotes Wound Healing via Paracrine Modulation
2025-Mar, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241296103
PMID:39711160
|
研究论文 | 本研究探讨了Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的关键作用及其通过S100B/RAGE/NF-κB/Notch旁分泌轴的机制 | 揭示了Schwann细胞通过分泌S100B蛋白在腭黏膜伤口愈合中的关键作用，并阐明了其通过RAGE受体激活NF-κB和Notch信号通路的机制 | 研究主要基于非人灵长类动物模型，尚未在人类中进行验证 | 探究Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的作用及其分子机制 | 腭黏膜、颊附着龈和皮肤的伤口愈合 | 生物医学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 非人灵长类动物、大鼠和猴子的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10305 | 2025-02-21 |
ERK plays a conserved dominant role in pancreas cancer cell EMT heterogeneity driven by diverse growth factors and chemotherapies
2025-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.08.637251
PMID:39975093
|
研究论文 | 本文通过结合迭代间接免疫荧光成像和互信息建模，研究了胰腺癌细胞中EMT异质性的信号蛋白水平 | 使用互信息建模预测了ERK在胰腺癌细胞EMT异质性中的主导作用，并发现JNK在MEK抑制时的补偿作用 | 单细胞转录组学仅限于基于本体的间接推断，细胞群体水平的研究存在固有困难 | 研究胰腺癌细胞中EMT异质性的信号通路，以促进化疗反应 | 胰腺癌细胞和肿瘤 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 迭代间接免疫荧光成像，互信息建模 | 互信息模型 | 蛋白质测量数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10306 | 2025-02-21 |
NEAT1-mediated regulation of proteostasis and mRNA localization impacts autophagy dysregulation in Rett syndrome
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf074
PMID:39970285
|
研究论文 | 本文研究了长链非编码RNA NEAT1在MeCP2缺陷背景下对Rett综合征（RTT）中蛋白质稳态和mRNA定位的调控作用及其对自噬失调的影响 | 揭示了NEAT1在MeCP2功能中的关键作用，特别是通过RNA-RNA相互作用调控自噬基因的表达和亚细胞定位，从而影响自噬复合物的生物发生 | 研究主要基于人类神经细胞和RTT患者样本，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨NEAT1在MeCP2缺陷导致的Rett综合征中的作用机制 | 人类神经细胞和RTT患者样本 | 神经科学 | Rett综合征 | 单细胞RNA测序和分子分析 | NA | RNA测序数据 | 人类神经细胞和RTT患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10307 | 2025-02-21 |
Hypoxia-induced histone methylation and NF-κB activation in pancreas cancer fibroblasts promote EMT-supportive growth factor secretion
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635486
PMID:39974981
|
研究论文 | 本文研究了胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中缺氧诱导的组蛋白甲基化和NF-κB激活如何促进癌症相关成纤维细胞（CAFs）分泌支持上皮-间质转化（EMT）的生长因子 | 揭示了缺氧条件下CAFs通过IGF-2和HGF促进PDAC癌细胞EMT的机制，并发现活性氧激活的NF-κB与缺氧依赖性组蛋白甲基化共同作用促进这些生长因子的表达 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证 | 探讨缺氧条件下CAFs如何通过生长因子介导的细胞间通讯促进PDAC癌细胞的EMT | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和癌细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组分析、抑制剂筛选 | NA | 转录组数据、小鼠模型数据 | 患者肿瘤样本和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 10308 | 2025-02-21 |
Identification of High-Risk Cells in Single-Cell Spatially Resolved Transcriptomics Data Using Deep Transfer Learning
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635803
PMID:39975321
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DEGAS的深度迁移学习算法，用于在单细胞空间分辨转录组数据中识别高风险细胞和区域 | DEGAS算法通过基因表达数据的潜在表示和领域适应，将疾病属性从患者转移到单个细胞，解决了现有方法无法将单个细胞与疾病属性关联的问题 | NA | 识别单细胞空间分辨转录组数据中的高风险细胞和区域，以深入了解特定疾病过程 | 肿瘤样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 深度迁移学习 | 单细胞空间分辨转录组数据 | 包括10X Genomics Xenium和Nanostring CosMx平台的数据，以及新生成的T2D Xenium数据集和公开的黑色素瘤Xenium数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 10309 | 2025-10-07 |
The pancreatic tumor microenvironment of treatment-naïve patients causes a functional shift in γδ T cells, impairing their anti-tumoral defense
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2466301
PMID:39945298
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境对γδ T细胞功能的抑制作用 | 首次使用治疗初治患者的类器官条件培养基证明PDAC肿瘤微环境导致γδ T细胞功能转变 | 样本量有限，主要依赖体外实验验证 | 研究胰腺癌肿瘤微环境如何影响γδ T细胞的抗肿瘤功能 | 治疗初治胰腺导管腺癌患者的γδ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,类器官培养 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 治疗初治PDAC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10310 | 2025-10-07 |
Key RNA-binding proteins in renal fibrosis: a comprehensive bioinformatics and machine learning framework for diagnostic and therapeutic insights
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2463560
PMID:39957043
|
研究论文 | 通过综合生物信息学和机器学习方法识别与肾纤维化相关的关键RNA结合蛋白，并建立诊断模型 | 首次整合生物信息学、机器学习方法和单细胞RNA测序技术系统鉴定肾纤维化中的关键RNA结合蛋白 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，需要进一步临床验证 | 识别肾纤维化中的关键RNA结合蛋白，开发诊断模型并探索治疗靶点 | 肾纤维化患者样本和正常肾脏样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，机器学习建模 | lasso回归，logistic回归 | 基因表达数据 | 175个肾纤维化样本和99个正常肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10311 | 2025-10-07 |
Unveiling ferroptosis genes and inhibitors in diabetic retinopathy through single-cell analysis and docking simulations
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101932
PMID:39968183
|
研究论文 | 通过单细胞分析和分子对接模拟揭示糖尿病视网膜病变中的铁死亡相关基因和抑制剂 | 首次通过单细胞RNA测序结合分子对接模拟系统鉴定糖尿病视网膜病变中的铁死亡相关基因，并发现地塞米松作为潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 探索铁死亡在糖尿病视网膜病变中的作用机制并寻找潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者样本 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10312 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the multidimensional dynamic heterogeneity from primary to metastatic gastric cancer
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111843
PMID:39967875
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了胃癌从原发到转移过程中的多维动态异质性 | 首次系统描绘了胃癌从原发灶到器官特异性转移灶的多维特征动态变化，鉴定了卵巢转移的30基因标志物和关键配体-受体相互作用 | 未明确说明样本规模和具体技术平台细节 | 探究胃癌从原发到转移过程中肿瘤微环境的动态异质性特征 | 胃癌原发肿瘤和器官特异性转移灶 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10313 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and spatial transcriptomics reveals fibroblast subtypes in hepatocellular carcinoma: spatial distribution, differentiation trajectories, and therapeutic potential
2025-Feb-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06192-0
PMID:39966876
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了肝细胞癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型的空间分布、分化轨迹及其治疗潜力 | 首次系统鉴定肝细胞癌中三种成纤维细胞亚群的空间分布特征，发现VEGFA+CAF在缺氧微环境诱导下通过促进肿瘤血管生成影响预后 | 研究样本量相对有限，需要更大规模队列验证；机制研究主要基于转录组数据，缺乏功能性实验验证 | 解析肝细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及其临床意义 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 训练队列88例HCC样本，验证队列94例HCC样本，总计超过120万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10314 | 2025-02-20 |
Publisher Correction: Accurate RNA velocity estimation based on multibatch network reveals complex lineage in batch scRNA-seq data
2025-Feb-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02152-8
PMID:39966937
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10315 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals that EGR1 promotes epithelial IL33 production in T2 asthma
2025-Feb-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06116-y
PMID:39966984
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证，揭示了转录因子EGR1在T2型哮喘中直接调控上皮细胞IL33产生的机制 | 首次发现EGR1作为上皮细胞源基因直接调控IL33表达，为T2型哮喘的分子机制提供了新见解 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，需要在人类临床样本中进一步验证 | 探究过敏原暴露触发气道上皮细胞释放IL33的分子机制 | BEAS-2B细胞系和HDM诱导的小鼠哮喘模型 | 生物信息学 | 哮喘 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-PCR, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10316 | 2025-10-07 |
Uncovering endothelial to mesenchymal transition drivers in atherosclerosis via multi-omics analysis
2025-Feb-17, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-025-04571-5
PMID:39956907
|
研究论文 | 通过整合多组学数据识别动脉粥样硬化中内皮间质转化的新型调控因子 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和微阵列数据，系统识别动脉粥样硬化中内皮间质转化的七个新型候选基因 | 研究主要依赖生物信息学分析，实验验证仅限于qPCR和western blotting，缺乏更深入的功能验证 | 识别动脉粥样硬化中内皮间质转化的调控因子 | 人类动脉粥样硬化斑块中的内皮细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列, qPCR, western blotting | UMAP, limma包 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE159677, GSE118446, GSE56309) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 10317 | 2025-10-07 |
Age-Associated B Cells in Autoimmune Diseases: Pathogenesis and Clinical Implications
2025-Feb-17, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-025-09021-w
PMID:39960645
|
综述 | 本文综述了年龄相关B细胞在自身免疫性疾病中的致病机制和临床意义 | 系统总结了ABCs的异质性特征、分化调控机制及其在多种自身免疫病中的诊断和治疗潜力 | 需要进一步探索和验证针对ABCs的靶向治疗策略 | 探讨年龄相关B细胞在自身免疫性疾病中的致病作用和临床应用价值 | 年龄相关B细胞及其在自身免疫疾病中的作用机制 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10318 | 2025-10-07 |
Molecular subtyping combined with multiomics analysis to study correlation between TACE refractoriness and tumor stemness in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01955-z
PMID:39961903
|
研究论文 | 本研究通过分子分型与多组学分析探讨肝细胞癌中TACE抵抗性与肿瘤干性之间的相关性 | 首次系统性地将TACE抵抗性与肿瘤干性联系起来，并建立了基于肿瘤干性基因的新型分子分型系统 | 研究基于回顾性数据集分析，需要进一步实验验证 | 探索肝细胞癌中TACE抵抗性与肿瘤干性之间的相关性及其临床意义 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序，微阵列，单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据，临床数据 | 多个HCC数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 10319 | 2025-10-07 |
Analysis of fatty acid metabolism in prostate cancer and discovery of a new programmed cell death-associated luminal cell subpopulation
2025-Feb-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01982-w
PMID:39961915
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析前列腺癌中脂肪酸代谢的作用，发现与程序性细胞死亡相关的管腔细胞亚群 | 发现前列腺癌中脂肪酸代谢活性显著升高的管腔细胞亚群，并揭示其与程序性细胞死亡和肿瘤侵袭性的关联 | NA | 研究脂肪酸代谢在前列腺癌中的作用机制 | 前列腺癌组织中的细胞亚群，特别是管腔细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, NMF, 反卷积分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10320 | 2025-10-07 |
A method for the identification of lactate metabolism-related prognostic biomarkers and its validations in non-small cell lung cancer
2025-Feb-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85620-z
PMID:39962075
|
研究论文 | 本研究开发了一种识别乳酸代谢相关预后生物标志物的新方法，并在非小细胞肺癌中进行了验证 | 提出结合遗传算法的Cox弹性网络回归(GA-EnCox)方法构建预后预测模型，相比传统单一模型具有更好的预测性能 | NA | 开发非小细胞肺癌乳酸代谢相关预后生物标志物的识别方法和预后预测模型 | 非小细胞肺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox弹性网络回归, 遗传算法 | 基因表达数据 | 多个LUAD队列数据集和内部NSCLC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |