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当前共找到 10619 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-01-16 |
Analysis of intracellular and intercellular crosstalk from omics data
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334981
PMID:41124151
|
研究论文 | 本文提出了一种名为“Ulisse”的分析方法，用于评估组学数据中细胞内和细胞间分子相互作用的改变 | 开发了Ulisse方法，补充了现有富集分析、通路串扰分析和细胞间通讯分析方法的不足，特别关注控制过程或细胞间相互作用的组分改变，并采用两种不同的零模型支持串扰量化 | 仅以三阴性乳腺癌单细胞RNA测序数据作为概念验证，未在其他疾病或数据类型中广泛验证 | 评估组学数据中细胞内和细胞间分子相互作用的可能改变 | 基因列表（通常来自组学或多组学研究） | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 网络分析、零模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1002 | 2026-01-15 |
Tumor prognostic risk stratification based on pseudo-time analysis of single-cell sequencing for patients with lung adenocarcinoma
2025-Dec-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1581
PMID:41522114
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研究论文 | 本研究利用单细胞伪时间序列分析识别与肺腺癌发展相关的伪时间差异基因，并构建基于这些基因的预后风险分层模型 | 首次将单细胞伪时间分析应用于肺腺癌预后风险分层，识别出13个与预后高度相关的伪时间差异基因，并构建了有效的风险模型 | 研究主要基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性验证；单细胞数据样本量可能有限 | 开发肺腺癌患者的准确预后风险分层方法 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学分析 | Cox回归，LASSO，随机森林 | 单细胞RNA测序数据，多中心转录组数据，免疫组织化学图像 | TCGA-LUAD患者队列及多中心验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1003 | 2026-01-15 |
Dynamic release of extracellular particles after opening of the blood-brain barrier predicts glioblastoma susceptibility to paclitaxel
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65681-4
PMID:41402297
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研究论文 | 本研究开发了一种用于捕获胶质母细胞瘤患者循环细胞外囊泡和颗粒的微流控设备，并发现血脑屏障打开后这些颗粒的释放动态可预测患者对紫杉醇的治疗反应 | 首次将血脑屏障打开与循环细胞外颗粒动态释放相结合，开发了基于Annexin-V化学的微流控捕获平台，并将其作为实时替代生物标志物用于评估胶质母细胞瘤治疗反应 | 需要未来前瞻性验证，样本量有限（I期临床试验），且仅针对紫杉醇治疗 | 探索血脑屏障打开后循环细胞外颗粒作为胶质母细胞瘤治疗反应生物标志物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 微流控技术、蛋白质组学、纳米颗粒追踪分析、Western blot、扫描电镜、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、影像数据 | I期临床试验患者（具体数量未明确说明），直至疾病进展或最多6个周期 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1004 | 2026-01-15 |
A comparative review of single-cell atlases: mapping cellular diversity across species and tissues
2025-Dec-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05952-x
PMID:41326763
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综述 | 本文对现有的单细胞图谱进行了深入的比较分析，评估了它们在物种、组织覆盖范围、数据集规模等方面的差异与局限性 | 基于Hrovatin等人提出的更新框架，对当前单细胞图谱进行了系统性比较评估，并提出了未来扩展、整合和标准化单细胞图谱计划的关键建议 | 现有图谱在物种代表性和组织类型覆盖上存在不足，部分物种和组织类型代表性较低 | 系统比较和评估现有单细胞图谱，为未来单细胞图谱计划的发展提供指导 | 人类细胞图谱、小鼠细胞图谱等跨物种和组织的单细胞参考图谱 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组学、表观基因组学、空间分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1005 | 2026-01-15 |
The intratumor microbiome and cancer immunity: from pathogenesis to therapeutic opportunities through artificial intelligence
2025-Dec, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2602537
PMID:41368873
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物组与癌症免疫之间的相互作用，探讨了其在肿瘤发生、发展和治疗中的作用，并评估了人工智能在整合多组学数据以推动精准肿瘤学中的应用潜力 | 系统性地整合了肿瘤内微生物组在癌症免疫调节中的作用，并强调了人工智能技术（包括机器学习和深度学习）在解析微生物空间定位、功能及其与治疗反应关联方面的创新应用 | 面临数据异质性、模型可解释性以及伦理问题等挑战，且需要更标准化的实验协议、高分辨率空间分析以及外部验证数据集来支持结论的稳健性 | 探讨肿瘤内微生物组如何影响癌症免疫，并评估人工智能技术在促进微生物组信息驱动的精准肿瘤学诊断和治疗中的机遇 | 肿瘤内微生物组（包括细菌、真菌和病毒）及其与宿主免疫系统的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 下一代测序、空间转录组学 | 机器学习、深度学习 | 多组学数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1006 | 2026-01-15 |
DAGFormer: A graph-based domain adaptation approach for single-cell cancer drug response prediction
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013832
PMID:41417875
|
研究论文 | 提出一种基于图的域适应方法DAGFormer，用于整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据以预测单细胞癌症药物反应 | 通过构建细胞邻域图并使用图域适应技术，克服了批量效应，并首次考虑了细胞间相互作用在药物反应预测中的作用 | 未明确提及方法在计算效率或可扩展性方面的具体限制 | 开发计算方法来预测单细胞水平的癌症药物反应，以深入理解肿瘤异质性和耐药机制 | 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 基于图的域适应框架（DAGFormer） | RNA测序数据 | 十个独立的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1007 | 2026-01-15 |
IL7-TBRII, a Dual Cytokine Modulator Targeting IL-7 and TGF-β Pathways, Inhibits Tumor Progression and Metastasis
2025-Dec, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e42
PMID:41523140
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为IL7-TBRII的双功能融合蛋白，通过同时靶向IL-7和TGF-β通路，增强CD8 T细胞的抗肿瘤活性，抑制肿瘤进展和转移 | 通过分析scRNA-seq数据发现IL-7治疗后TGF-β信号升高，并据此设计了一种新型双功能融合蛋白IL7-TBRII，首次将IL-7激动剂与TGF-β陷阱结合，以协同调控肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型（MC38、4T1、EMT6），临床转化效果尚需进一步验证；未详细探讨IL7-TBRII在人体内的安全性和药代动力学特性 | 旨在通过同时调节IL-7和TGF-β通路，克服肿瘤免疫抑制微环境，提升免疫治疗效果 | 肿瘤浸润CD8 T细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1008 | 2026-01-15 |
Aging Mediates Inflammatory Transformation of Kidney-Resident Macrophages via Thrombospondin-1 Signaling
2025-Dec, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e39
PMID:41523144
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老肾脏中肾驻留巨噬细胞（KRMs）的表型转变，发现其氧化磷酸化（OXPHOS）增加，并识别出由肾小管来源的血小板反应蛋白-1（THBS1）信号驱动这一转变，导致炎症微环境形成 | 首次在衰老肾脏中系统描述KRMs的表型演化，并阐明THBS1作为关键信号分子通过促进OXPHOS驱动巨噬细胞向炎症表型极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类组织验证样本有限，且具体信号通路机制需进一步深入探究 | 探究衰老肾脏中肾驻留巨噬细胞的表型变化及其对肾脏稳态的影响 | 小鼠肾脏的肾驻留巨噬细胞（KRMs）及人类老年个体肾脏组织 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1009 | 2026-01-15 |
Engineering CCR2/IFN-γ overexpression in enucleated mesenchymal stem cells enhances therapy for rheumatoid arthritis
2025-Nov-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09248-5
PMID:41310172
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞，增强其对类风湿关节炎的治疗效果 | 首次生成并应用过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞，以解决传统MSCs治疗中肺部滞留和安全性问题，同时增强归巢能力和治疗效果 | 研究仅在雄性大鼠模型中进行，未涉及雌性动物或更复杂的临床前模型，且长期安全性和免疫原性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的基于间充质干细胞的类风湿关节炎治疗方法 | 人间充质干细胞（特别是脐带来源）及其去核改造版本，以及类风湿关节炎雄性大鼠模型 | 细胞治疗与再生医学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1010 | 2026-01-15 |
Systematic evaluation of tools used for single-cell m6A identification
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09246-7
PMID:41275001
|
研究论文 | 本研究系统评估了四种单细胞m6A测序和预测方法，并开发了一个在线可访问的单细胞m6A数据库，用于人类和小鼠物种的修饰定位和水平分析 | 开发了首个单细胞m6A数据库，整合了多种方法的数据，并展示了在癌症单细胞转录组和空间转录组数据中预测和可视化m6A修饰的独特优越性能 | 评估的方法数量有限（仅四种），且存在操作复杂性、灵敏度、分辨率和不同技术间一致性等挑战 | 系统评估单细胞m6A识别工具，并开发相关数据库以促进表观遗传修饰研究 | 单细胞m6A修饰在人类和小鼠物种中的定位和修饰水平 | 表观遗传学 | 癌症（包括UCEC） | 单细胞m6A测序和预测方法 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1011 | 2026-01-15 |
The ANTsX ecosystem for mapping the mouse brain
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66741-5
PMID:41274934
|
研究论文 | 本文介绍了使用ANTsX生态系统开发的小鼠大脑映射流程，用于将多种空间转录组学和形态学数据对齐到共享坐标框架中 | 提出了两种新方法：基于速度场的发育时间点连续插值方法和使用最小标注公开数据的深度学习自动脑区划分框架 | NA | 解决小鼠大脑图谱构建中多样化数据集到共享坐标框架的映射挑战 | 小鼠大脑 | 数字病理学 | NA | MERFISH空间转录组学，fMOST高分辨率形态学，发育MRI，LSFM | 深度学习 | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 1012 | 2026-01-15 |
Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis
2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734
PMID:40910702
|
研究论文 | 本研究揭示了环状七肽FZ1通过作为整合素αvβ3激动剂，激活FAK-AKT/ERK1/2信号通路并诱导VEGFC表达，从而促进糖尿病皮肤伤口血管生成和愈合 | 首次发现并鉴定出FZ1是首个靶向整合素αvβ3并具有促进糖尿病伤口愈合作用的肽类激动剂 | NA | 开发有效的治疗剂并深入理解糖尿病伤口愈合的调控机制 | 糖尿病皮肤伤口愈合 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, RNA干扰, 表面等离子体共振, 分子对接 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1013 | 2026-01-15 |
HDGF derived from Müller cells enhances the activation of microglia in diabetic retinopathy
2025-Aug-07, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.38.20240386
PMID:40770862
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞瘤衍生生长因子（HDGF）在糖尿病视网膜病变（DR）中介导炎症的作用，发现HDGF主要由Müller细胞产生并靶向小胶质细胞，促进其激活和炎症反应 | 首次揭示HDGF在DR中作为Müller细胞来源的炎症介质，通过靶向小胶质细胞并上调整合素β2来驱动炎症过程，并验证了HDGF中和作为潜在治疗策略 | 研究主要基于体外细胞培养和小鼠模型，尚未在人类临床样本中全面验证HDGF阻断的治疗效果，且具体信号通路机制有待进一步阐明 | 阐明HDGF在糖尿病视网膜病变炎症反应中的作用机制，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 糖尿病视网膜病变患者房水样本、公共单细胞RNA测序数据集、培养的Müller细胞和小胶质细胞、DR小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、定量逆转录PCR、Western印迹、荧光免疫染色 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量，但包括患者房水、公共数据集、细胞培养和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1014 | 2026-01-15 |
CD36 promotes iron accumulation and dysfunction in CD8+ T cells via the p38-CEBPB-TfR1 axis in early-stage hepatocellular carcinoma
2025-07, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0948
PMID:40037690
|
研究论文 | 本研究揭示了CD36通过p38-CEBPB-TfR1轴促进早期肝细胞癌中CD8+ T细胞铁积累和功能障碍的新机制 | 首次发现CD36通过介导oxLDL-p38-CEBPB轴上调TfR1，导致CD8+ T细胞铁积累和功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究早期肝细胞癌肿瘤微环境中CD8+ T细胞功能障碍的机制 | 早期肝细胞癌肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA测序数据，流式细胞数据 | 小鼠肝细胞癌模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1015 | 2026-01-15 |
UHRF1-mediated epigenetic reprogramming regulates glycolysis to promote progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07532-0
PMID:40301374
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研究论文 | 本研究揭示了UHRF1通过表观遗传重编程调控糖酵解，从而促进B细胞急性淋巴细胞白血病进展的分子机制 | 首次利用单细胞转录组测序技术发现UHRF1与B-ALL进展的关联，并阐明了UHRF1-SFRP5-WNT5A-P38 MAPK-HK2信号轴在表观遗传和代谢重编程中的作用，同时鉴定出UHRF1靶向抑制剂UM164 | 未明确说明样本的具体数量及临床特征细节，体内外实验的转化潜力需进一步验证 | 探索复发难治性B细胞急性淋巴细胞白血病的分子机制，以改善临床预后 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1016 | 2026-01-15 |
inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1312
PMID:39797728
|
研究论文 | 本文介绍了inDrops-2，一种开源、灵活且成本效益高的液滴微流控单细胞RNA测序技术，适用于新鲜和保存的临床样本 | inDrops-2技术以6倍低于商业系统的成本，实现了与最先进商业系统相匹配的灵敏度，并支持指数和线性扩增两种协议 | NA | 开发一种高灵敏度、低成本、适用于大规模单细胞RNA测序的开源技术 | 人类肺癌样本中的新鲜和保存细胞 | 单细胞测序 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个人类肺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | inDrops-2 | 开源液滴微流控单细胞RNA测序平台，支持指数和线性扩增协议 |
| 1017 | 2026-01-15 |
Phase 1 study of chidamide in combination with venetoclax, azacitidine, aclarubicin, cytarabine and G-CSF for refractory/relapsed acute myeloid leukemia: clinical safety, efficacy, and correlative analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698710
PMID:41459484
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研究论文 | 本研究评估了西达本胺联合维奈托克、阿扎胞苷、阿柔比星、阿糖胞苷和G-CSF（CACAG-VEN方案）在复发/难治性急性髓系白血病（R/R-AML）患者中的疗效、安全性及相关生物学机制 | 首次在R/R-AML患者中评估CACAG-VEN联合方案的疗效和安全性，并利用单细胞RNA测序揭示了治疗后MCL1、HIF1A和ABCC1下调等分子机制 | 样本量较小（34例患者），为单臂I期研究，缺乏对照组，随访时间中位数为461天，可能不足以评估长期疗效和安全性 | 评估CACAG-VEN方案作为R/R-AML挽救诱导治疗的安全性和疗效，并探索其分子作用机制 | 复发或难治性急性髓系白血病（R/R-AML）患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞RNA测序数据 | 34例R/R-AML患者（难治性17例，复发17例），其中4例患者在治疗前后进行了骨髓样本的单细胞RNA测序（共8个样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1018 | 2026-01-14 |
KCNV2-Deficient Retinal Organoid Model of Cone Dystrophy-In Vitro Screening for AAV Gene Replacement Therapy
2025-Dec-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010449
PMID:41516321
|
研究论文 | 本研究建立了KCNV2缺陷的人视网膜类器官模型，用于评估AAV基因替代疗法的载体效力 | 首次利用患者来源和基因编辑的视网膜类器官作为生理相关模型，在体外评估AAV基因治疗载体的效力，并通过单细胞RNA测序在单细胞分辨率下验证治疗效果 | 研究为体外模型，仍需动物实验和临床试验进一步验证；类器官模型可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境 | 开发用于评估基因治疗载体效力的视网膜疾病模型，并筛选先导治疗候选物 | KCNV2基因缺陷的人视网膜类器官 | 基因治疗 | 视网膜锥细胞营养不良 | 单细胞RNA测序，基因编辑，AAV载体构建 | 视网膜类器官模型 | 基因表达数据，蛋白质定量数据 | 来自两个独立来源的视网膜类器官：患者血液来源的iPSCs和对照细胞系的基因编辑产物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1019 | 2026-01-14 |
MFAP5 Activates ITGA5 to Drive Tooth Germ Mineralization Through the MAPK/ERK Pathway: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010394
PMID:41516268
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术构建了小型猪牙胚的高分辨率细胞图谱，揭示了MFAP5通过激活ITGA5并驱动MAPK/ERK通路来调控牙胚矿化的新机制 | 首次在牙胚发育中识别出MFAP5作为牙源性程序的新调控因子，并阐明其通过MFAP5-ITGA5-ERK/MAPK信号轴以细胞状态特异性方式驱动矿化的机制 | 研究主要基于体外功能实验和小型猪模型，其在人类牙胚发育中的直接适用性及体内功能验证仍需进一步探索 | 探究牙胚矿化的分子调控机制 | 小型猪的牙胚组织 | 单细胞转录组学 | 牙科发育与再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
| 1020 | 2026-01-14 |
Primordial cardiomyocytes orchestrate myocardial morphogenesis and vascularization but are dispensable for regeneration
2025-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.29.696817
PMID:41502935
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在成年斑马鱼心脏中发现了一个独特的、表达特定标记物的心肌细胞亚群，并揭示了其在心脏形态发生中的关键作用及其在再生过程中的非必要性 | 首次在成年斑马鱼心脏中鉴定出一个独特的原始心肌细胞亚群，并明确其在心脏发育（形态发生和血管化）中起关键组织者作用，但在心脏再生中并非必需，揭示了发育与再生程序之间的根本差异 | 研究主要基于斑马鱼模型，结论在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证；原始心肌细胞再生能力有限的分子机制尚未完全阐明 | 探究脊椎动物心脏中不同心肌细胞亚群在心脏发育和修复中的具体作用 | 成年斑马鱼心脏中的心肌细胞亚群 | 发育生物学、心脏再生 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、遗传消融技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |