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当前共找到 10349 篇文献，本页显示第 10161 - 10180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10161 | 2025-10-07 |
Inferring single-cell and spatial microRNA activity from transcriptomics data
2025-Jan-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07454-9
PMID:39827321
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为miTEA-HiRes的方法，用于从单细胞和空间转录组学数据中推断miRNA活性 | 开发了首个能够从单细胞转录组学、细胞类型特异性单细胞群体和空间转录组学数据中高分辨率评估miRNA活性的计算方法 | 方法依赖于转录组学数据推断miRNA活性，可能无法完全捕获转录后调控的复杂性 | 开发计算工具来评估不同细胞类型和空间位置中miRNA的调控活性 | 单细胞转录组数据、细胞类型特异性群体、空间转录组数据 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 计算方法/统计模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10162 | 2025-10-07 |
Analysis of cellular NO-GC expression in the murine heart and lineage determination in angiotensin II-induced fibrosis
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111615
PMID:39829679
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研究论文 | 分析小鼠心脏中NO-GC的细胞表达及其在血管紧张素II诱导纤维化中的谱系决定作用 | 首次系统描述NO-GC在健康和纤维化心肌中的细胞特异性表达模式，并通过谱系追踪确定表达NO-GC的活化成纤维细胞来源 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究NO-GC在心脏纤维化过程中的细胞表达和功能作用 | 小鼠心脏组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10163 | 2025-10-07 |
Potent human antibodies against SpA5 identified by high-throughput single-cell sequencing of phase I clinical volunteers' B cells
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111627
PMID:39834865
|
研究论文 | 通过高通量单细胞测序技术从临床试验志愿者B细胞中筛选出针对SpA5蛋白的高效人类抗体 | 首次结合高通量单细胞RNA和VDJ测序技术从疫苗接种者记忆B细胞中快速筛选高效抗体 | 研究样本量相对有限，仅包含64名志愿者 | 筛选能够预防耐药菌感染的高效人类抗体 | 64名接种重组五组分疫苗的临床试验志愿者的记忆B细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,Alphafold2,分子对接 | NA | 单细胞转录组数据,VDJ序列数据 | 64名志愿者，676个抗原结合IgG1克隆型 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序 | NA | NA |
| 10164 | 2025-10-07 |
The role of cell cycle-related genes in the tumorigenesis of adrenal and thyroid neuroendocrine tumors
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41457
PMID:39834406
|
综述 | 本文综述了细胞周期相关基因在肾上腺和甲状腺神经内分泌肿瘤发生中的作用及当前单细胞RNA测序研究进展 | 系统总结了神经母细胞瘤、甲状腺髓样癌和嗜铬细胞瘤中差异表达的细胞周期相关基因及其作为治疗靶点和肿瘤分型标志物的潜力 | 关于这些肿瘤调控机制的信息仍然有限，需要进一步研究探索 | 理解肾上腺和甲状腺神经内分泌肿瘤的分子机制，包括肿瘤发生、进展和转移 | 肾上腺和甲状腺神经内分泌肿瘤（神经母细胞瘤、甲状腺髓样癌、嗜铬细胞瘤） | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10165 | 2025-10-07 |
Integrative Analyses of Single-Cell RNA-Sequencing and Bulk RNA-Sequencing Reveal Prognostic Markers of Peripheral Blood Mononuclear Cells in Patients with Cardiogenic Shock Receiving Venous-Arterial Extracorporeal Membrane Oxygenation Support Collected before Venous-Arterial Extracorporeal Membrane Oxygenation Establishment
2025-Jan-14, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c07339
PMID:39829552
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示心源性休克患者VA-ECMO治疗前外周血单核细胞中与预后相关的生物标志物 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，鉴定出HSPA1B在B细胞和NK/NKT细胞中的表达与VA-ECMO患者不良预后相关 | 数据来源于公共数据库，样本量有限，需要更多临床样本验证 | 探索心源性休克患者VA-ECMO治疗前外周血单核细胞变化与预后的关系 | 接受静脉-动脉体外膜肺氧合支持的心源性休克患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Seurat, limma | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10166 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analysis of m6A-Related Programmed Cell Death Genes Unveils a Novel Prognostic Model for Lung Adenocarcinoma
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70255
PMID:39828988
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据，开发了一个基于m6A相关程序性细胞死亡基因的肺腺癌预后模型 | 首次整合m6A修饰与程序性细胞死亡基因构建肺腺癌预后模型，并实验验证RCN1作为潜在致癌基因 | 需要进一步实验验证模型的临床应用价值 | 开发肺腺癌预后预测模型和个性化治疗策略 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | CoxBoost, SuperPC | RNA测序数据 | 多个验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10167 | 2025-10-07 |
Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2452701
PMID:39829399
|
研究论文 | 本研究基于中性粒细胞胞外诱捕网相关基因构建儿童急性淋巴细胞白血病的预后模型 | 首次将中性粒细胞胞外诱捕网相关基因与儿童急性淋巴细胞白血病预后关联，并通过多组学分析和体外实验验证 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发儿童急性淋巴细胞白血病的预后预测模型 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 转录组测序, 单细胞转录组测序, RT-qPCR, 多组学分析 | LASSO回归, Cox回归, 风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自TARGET-ALL-P2、TARGET-ALL-P3队列和GSE26713、GSE130116数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10168 | 2025-10-07 |
Identification of circadian rhythm-related biomarkers and development of diagnostic models for Crohn's disease using machine learning algorithms
2025-Jan-21, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453922
PMID:39836385
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别克罗恩病的昼夜节律相关生物标志物并开发诊断模型 | 首次将昼夜节律相关基因与克罗恩病诊断相结合，并利用单细胞测序技术验证基因表达特征 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发克罗恩病的诊断模型并预测生物疗法疗效 | 克罗恩病患者和对照组的基因表达数据 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞测序, 加权基因共表达网络分析 | 机器学习算法, 回归技术 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10169 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Small-Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Cervix
2025-Jan, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70183
PMID:39831355
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞起源和演化过程 | 首次在单细胞分辨率下提供宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞组成、HPV感染特征和基因表达谱的全面见解 | 仅基于两名患者的样本数据，样本量较小 | 探究宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞异质性、起源和肿瘤发生轨迹 | 宫颈小细胞神经内分泌癌患者肿瘤组织和邻近正常宫颈组织 | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,全外显子测序 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 2名患者 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子测序 | NA | NA |
| 10170 | 2025-10-07 |
HapCNV: A Comprehensive Framework for CNV Detection in Low-input DNA Sequencing Data
2025-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629494
PMID:39763944
|
研究论文 | 开发了一个用于单倍体低输入DNA测序数据中CNV检测的综合统计框架HapCNV | 构建了新型基因组位置特异性伪参考，通过初步细胞聚类方法选择无偏参考，有效保留常见CNV | NA | 开发针对单倍体低输入测序数据的CNV检测方法 | 单倍体和二倍体生物的低细胞和单细胞DNA测序数据 | 生物信息学 | 寄生虫病 | 低输入DNA测序，单细胞DNA测序 | 统计框架，聚类方法 | DNA测序数据 | NA | NA | DNA测序 | NA | NA |
| 10171 | 2024-08-13 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal that Oncofetal Reprogramming of Fibroblasts Is Associated with Malignant Degeneration of Burn Scar
2025-Feb, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.07.022
PMID:39128494
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10172 | 2025-01-20 |
Unlocking the potential of spatial transcriptomics with custom microfluidic chips
2025-Jan-14, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2771-9
PMID:39826037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10173 | 2025-10-07 |
Targeting MXD1 sensitises pancreatic cancer to trametinib
2025-Jan-16, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333408
PMID:39819860
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌对trametinib耐药的分子机制，并发现MXD1可作为克服耐药性的潜在治疗靶点 | 首次发现trametinib治疗通过诱导MXD1表达激活转座元件转录和病毒模拟反应，导致耐药性产生 | NA | 阐明PDAC对trametinib耐药的机制并识别相关可成药靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC) | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源异种移植模型和原代细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 10174 | 2025-10-07 |
Encompassing view of spatial and single-cell RNA sequencing renews the role of the microvasculature in human atherosclerosis
2025-Jan, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00582-1
PMID:39715784
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，构建了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱 | 首次结合多研究单细胞RNA测序与12例不同阶段人类标本的空间转录组数据，揭示微血管系统在动脉粥样硬化中的新作用机制 | 样本量相对有限（12例人类标本），需要更大规模研究验证发现 | 揭示人类动脉粥样硬化中细胞类型特异性表达变化和空间受限的细胞间通讯 | 人类动脉粥样硬化斑块标本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 12例不同阶段人类动脉粥样硬化标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10175 | 2025-10-07 |
The loss of dNK1/2 and EVT1 cells at the maternal-fetal interface is associated with recurrent miscarriage†
2025-Jan-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae136
PMID:39303127
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研究论文 | 通过单细胞测序发现复发性流产患者母胎界面中dNK1/2和EVT1细胞亚群的缺失 | 首次鉴定出同时表达dNK1和dNK2生物标志物的新NK细胞亚群dNK1/2，并发现其在复发性流产组织中缺失 | NA | 研究复发性流产患者母胎界面的细胞特征异常 | 复发性流产患者和健康捐赠者的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 复发性流产 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 复发性流产患者和健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10176 | 2025-10-07 |
PerturbDB for unraveling gene functions and regulatory networks
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae777
PMID:39265120
|
研究论文 | 开发了PerturbDB平台，用于整合和分析Perturb-Seq数据集以揭示基因功能和调控网络 | 首个用户友好的Perturb-Seq数据整合平台，通过基因聚类和化学扰动整合识别潜在抑制剂 | 平台依赖现有公开数据集，未提及对新数据类型的扩展支持 | 构建基因功能研究和调控网络解析的平台工具 | 基因功能、调控网络、癌症相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | Perturb-Seq, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | Mixscape算法 | 单细胞转录组数据 | 4,518,521个单细胞转录组，涉及10,194个基因在19种细胞系中的敲低实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10177 | 2025-10-07 |
MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae911
PMID:39420633
|
研究论文 | 介绍了一个名为MAPbrain的灵长类大脑多组学图谱平台 | 开发了首个整合转录组学、表观基因组学和空间转录组学数据的灵长类大脑多组学图谱 | 未明确说明数据整合和分析方法的具体技术限制 | 理解基因如何影响大脑发育及神经系统疾病机制 | 灵长类大脑发育过程 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 多组学技术 | NA | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学数据 | 2100万大脑细胞，来自38个关键脑区和436个亚区，涵盖胚胎和成年阶段，包含人类和非人灵长类的164个时间点 | NA | 多组学整合分析 | MAPbrain | 在线交互式多组学分析平台，支持用户数据上传和整合分析 |
| 10178 | 2025-10-07 |
scTWAS Atlas: an integrative knowledgebase of single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae931
PMID:39420631
|
研究论文 | 介绍scTWAS Atlas知识库，这是一个整合单细胞转录组全关联研究数据的综合性数据库 | 开发首个整合文献整理和数据分析的scTWAS综合知识库，提供交互式知识图谱和多组学水平调控网络 | 当前版本仅涵盖34个性状、30种细胞类型和9种细胞条件，覆盖范围有待扩展 | 构建单细胞转录组全关联研究的综合知识库，解决细胞类型异质性解释难题 | 基因-性状关联、细胞类型特异性调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组全关联研究(scTWAS)、单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)分析 | NA | 基因表达数据、关联分析数据、多组学数据 | 2,765,211个关联，涵盖34个性状、30种细胞类型、9种细胞条件和16,470个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10179 | 2025-10-07 |
CancerSCEM 2.0: an updated data resource of single-cell expression map across various human cancers
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae954
PMID:39460627
|
研究论文 | 介绍单细胞表达图谱数据库CancerSCEM 2.0的更新内容与功能增强 | 新增拷贝数变异评估、转录因子富集、伪时间轨迹构建、生物特征评分等功能，并首次引入单细胞水平癌症代谢图谱 | 未提及具体的技术验证或数据质量评估细节 | 构建和优化人类癌症单细胞表达图谱数据库 | 127个研究项目中的1466个单细胞RNA测序数据集，涵盖74种癌症类型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1466个数据集，涵盖肿瘤、匹配正常组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10180 | 2025-10-07 |
ncPlantDB: a plant ncRNA database with potential ncPEP information and cell type-specific interaction
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1017
PMID:39470718
|
研究论文 | 介绍了一个整合植物非编码RNA和ncRNA编码肽数据的综合数据库ncPlantDB | 首个提供植物ncRNA编码肽信息和细胞类型特异性相互作用网络的综合数据库 | NA | 构建一个包含ncPEP信息和细胞类型特异性相互作用的植物ncRNA数据库 | 43种植物物种的非编码RNA和ncRNA编码肽 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, Ribo-seq分析, 文献挖掘 | NA | 基因组数据, 序列数据, 相互作用数据 | 包含353,140个ncRNAs, 3,799个ncPEPs和4,647,071个相互作用 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |