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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10141 | 2025-10-07 |
Cellular heterogeneity and cytokine signatures in acute myeloid leukemia: A novel prognostic model
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102194
PMID:39689517
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病的细胞异质性,并基于细胞因子相关基因构建预后风险评分模型 | 首次基于7个关键细胞因子相关基因(CCL23, IL2RA, IL3RA, IL6R, INHBA, TNFSF15, TNFSF18)构建AML预后风险模型,揭示了风险组间免疫细胞浸润和细胞因子信号传导的显著差异 | 使用公开数据集,缺乏前瞻性临床验证 | 开发急性髓系白血病的精准预后评估工具 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据 | 多个独立AML患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10142 | 2025-10-07 |
KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009
PMID:39577768
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研究论文 | 提出基于Kolmogorov-Arnold网络的KanCell深度学习模型,通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据来增强细胞异质性分析 | 利用KAN网络有效捕捉非线性关系并优化计算效率,在多种评估指标上优于现有方法 | NA | 开发整合单细胞和空间转录组数据的计算模型以解析细胞异质性 | 人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、背外侧前额叶皮层和小鼠胚胎大脑 | 计算生物学 | 多种癌症(黑色素瘤、乳腺癌) | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | KAN(Kolmogorov-Arnold网络) | 基因表达数据 | 模拟和真实数据集(来自STARmap、Slide-seq、Visium和Spatial Transcriptomics平台) | 10x Genomics, 其他(STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics) | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Visium, 其他(STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics) | 10x Visium空间转录组平台及其他空间转录组技术 |
| 10143 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell transcriptome revealed the metabolic heterogeneity in human glioma
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41241
PMID:39844970
|
研究论文 | 本研究通过整合分析批量、单细胞和空间转录组数据,揭示了人类胶质瘤的代谢异质性并建立了基于四种关键代谢途径的预后分型系统 | 首次基于四种关键代谢途径(谷氨酰胺分解、糖酵解、磷酸戊糖途径和脂肪酸氧化)构建胶质瘤代谢分型系统,并结合单细胞和空间转录组分析揭示代谢异质性与肿瘤微环境的关联 | 研究基于转录组数据,未直接验证代谢功能;样本量相对有限;需要进一步实验验证CX3CL1/CX3CR1信号轴的功能 | 开发基于代谢途径的胶质瘤分类系统,揭示代谢异质性及其临床意义 | 人类胶质瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 批量转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组 | ConsensusClusterPlus,CellChat,stLearn | 转录组数据,单细胞数据,空间数据 | 多个胶质瘤数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组,批量RNA-seq | NA | NA |
| 10144 | 2025-10-07 |
Clinical and immunological outcomes after randomized trial of baked milk oral immunotherapy for milk allergy
2025-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184301
PMID:39782691
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研究论文 | 本研究评估烘焙牛奶口服免疫疗法对牛奶过敏儿童的安全性和有效性 | 首次通过随机试验证明烘焙牛奶口服免疫疗法可在减少不良反应的同时诱导脱敏,并识别了成功的免疫学相关标志物 | 样本量相对较小,仅包含30名参与者 | 确定烘焙牛奶口服免疫疗法是否能减少不良反应同时诱导脱敏,并识别成功的免疫学相关因素 | 3-18岁牛奶过敏儿童 | 临床免疫学 | 食物过敏 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 预测模型 | 临床数据,免疫学数据 | 30名牛奶过敏儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10145 | 2025-10-07 |
Altered Atlas of Exercise-Responsive MicroRNAs Revealing miR-29a-3p Attacks Armored and Cold Tumors and Boosts Anti-B7-H3 Therapy
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0590
PMID:39845707
|
研究论文 | 本研究揭示了miR-29a-3p作为运动响应性miRNA通过抑制B7-H3表达攻击装甲型和冷肿瘤并增强抗B7-H3治疗的机制 | 首次发现miR-29a-3p是关键的运动响应性miRNA,能同时靶向巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞下调B7-H3表达,并开发了具有良好生物相容性的lipo@miR-29a-3p纳米递送系统 | 研究主要基于公共数据库和动物模型,尚未进行大规模临床试验验证 | 探索运动响应性miRNA在肿瘤抑制中的作用机制及其治疗潜力 | 乳腺癌及多种泛癌类型,包括巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术,体外实验,体内模型 | 动物模型 | 基因表达数据,预后数据,单细胞测序数据 | 多个独立公共队列和内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10146 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the carotid artery and femoral artery of rats exposed to hindlimb unloading
2025-Jan-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05572-x
PMID:39833543
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了后肢卸载大鼠颈动脉和股动脉的细胞图谱,揭示了模拟微重力条件下血管重塑的细胞分子机制 | 首次构建后肢卸载大鼠传导动脉的单细胞图谱,系统揭示了血管细胞异质性、细胞间通讯和转录因子网络在血管重塑中的作用 | 研究仅基于大鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证;样本量相对有限 | 探究模拟微重力条件下大鼠动脉血管重塑的细胞分子机制 | 后肢卸载处理3个月的大鼠颈动脉和股动脉组织 | 单细胞组学 | 血管功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析,细胞通讯分析,转录因子网络分析 | 单细胞转录组数据 | 后肢卸载大鼠的颈动脉和股动脉组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10147 | 2025-10-07 |
Inhibition of programmed cell death by melanoma cell subpopulations reveals mechanisms of melanoma metastasis and potential therapeutic targets
2025-Jan-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01789-9
PMID:39832036
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示黑色素瘤细胞亚群抑制程序性细胞死亡的机制及其在转移中的作用 | 首次通过单细胞测序技术识别出C0 SOD3+黑色素瘤核心亚群,并发现其与氧化途径和转移过程的密切关联 | 研究主要基于单细胞测序数据分析,部分机制需要进一步实验验证 | 探究黑色素瘤转移机制并识别潜在治疗靶点 | 黑色素瘤肿瘤组织中的细胞亚群 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10148 | 2025-10-07 |
Polycystin-1 regulates tendon-derived mesenchymal stem cells fate and matrix organization in heterotopic ossification
2025-Jan-20, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00392-y
PMID:39833160
|
研究论文 | 本研究揭示机械敏感蛋白Polycystin-1通过调控肌腱来源间充质干细胞的命运和细胞外基质组织影响异位骨化进程 | 首次发现CTSK谱系肌腱来源间充质干细胞是异位骨化的主要细胞来源,并阐明PC1-TAX信号轴在机械信号传导中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床适用性需进一步验证 | 探究机械应力影响异位骨化的细胞机制和分子通路 | CTSK谱系肌腱来源间充质干细胞 | 干细胞生物学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 谱系追踪小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10149 | 2025-10-07 |
Revolutionizing ESCC prognosis: the efficiency of tumor-infiltrating immune cells (TIIC) signature score
2025-Jan-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01709-3
PMID:39833504
|
研究论文 | 本研究开发了基于肿瘤浸润免疫细胞特征评分的食管鳞癌预后模型 | 首次开发了肿瘤浸润免疫细胞特征评分,为ESCC预后和免疫治疗提供了新策略 | NA | 评估肿瘤浸润免疫细胞特征评分在食管鳞癌预后中的效能 | 食管鳞癌患者样本 | 机器学习 | 食管鳞癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | 二十种机器学习算法 | 转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | 来自GEO和TCGA数据库的ESCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10150 | 2025-10-07 |
Benchmarking cell type annotation methods for 10x Xenium spatial transcriptomics data
2025-Jan-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06044-0
PMID:39833693
|
研究论文 | 本研究对10x Xenium空间转录组数据的细胞类型注释方法进行了基准测试 | 首次系统评估基于参考的细胞类型注释工具在成像空间转录组数据上的性能表现 | 仅评估了五种基于参考的注释工具,且仅使用人类乳腺癌Xenium数据进行验证 | 评估和比较不同细胞类型注释方法在10x Xenium空间转录组数据上的性能 | 人类乳腺癌组织的10x Xenium空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | SingleR, Azimuth, RCTD, scPred, scmapCell | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 成像空间转录组平台 |
| 10151 | 2025-10-07 |
Desmoglein-2 was a novel cancer-associated fibroblasts-related biomarker for oral squamous cell carcinoma
2025-Jan-20, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-024-05284-5
PMID:39833796
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出口腔鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞相关生物标志物DSG2 | 首次发现DSG2作为口腔鳞状细胞癌中CAFs相关的新型预后生物标志物 | CAFs在OSCC中的具体作用机制仍不完全清楚 | 探索口腔鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞相关生物标志物 | 口腔鳞状细胞癌样本 | 单细胞测序分析 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, western blot, 生物信息学分析 | Cox回归分析, ROC分析, Pearson相关分析 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10152 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and multi-omics analyses reveal ferroptosis-associated gene expression and immune microenvironment heterogeneity in gastric cancer
2025-Jan-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01798-8
PMID:39831925
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研究论文 | 通过整合单细胞和多组学分析揭示胃癌中铁死亡相关基因表达和免疫微环境异质性 | 首次在胃癌中系统整合单细胞RNA测序与多组学数据研究铁死亡相关基因表达谱和免疫微环境异质性 | 未明确说明样本数量和具体实验验证细节 | 探究胃癌中铁死亡相关基因表达特征及其与免疫微环境的关系 | 胃癌组织和微环境中的细胞群体 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, ssGSEA分析, GO/KEGG富集分析 | 机器学习预测模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 10153 | 2025-10-07 |
Acquisition of discrete immune suppressive barriers contributes to the initiation and progression of preinvasive to invasive human lung cancer
2025-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.31.630523
PMID:39803458
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研究论文 | 通过单细胞技术构建肺腺癌从癌前到浸润阶段的高分辨率免疫图谱,揭示免疫抑制屏障的形成机制 | 首次构建个体肺部分实性结节中非实性(癌前)和实性(浸润)区域的高分辨率单细胞图谱,发现4-1BB+ Treg新亚群及其IL2-STAT5抑制通路 | 研究样本量有限,主要聚焦肺腺癌的特定发展阶段 | 揭示肺腺癌从癌前病变向浸润性癌发展的早期决定因素 | 人类肺部分实性结节组织的微解剖样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 多重成像质谱流式, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间成像数据, 转录组数据 | 个体肺部分实性结节的微解剖样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重成像 | NA | NA |
| 10154 | 2025-10-07 |
Single-cell landscape of the intrahepatic ecosystem in alcohol-related liver disease
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70198
PMID:39834100
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了酒精相关肝病肝内生态系统的细胞景观,发现具有干细胞特性和恶性转化潜能的ALBKRT7上皮细胞群 | 首次在人类ALD肝脏中发现同时表达肝细胞和胆管标记的ALBKRT7上皮细胞群,并证明其通过Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤生长 | NA | 阐明酒精相关肝病的分子机制和恶性转化过程 | 酒精相关肝病患者和健康供体的肝脏组织 | 单细胞生物学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10155 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analysis of Programmed Cell Death-Related Genes in Diagnosis and Synovitis During Osteoarthritis Development: Based on Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S491203
PMID:39839184
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,系统分析了程序性细胞死亡相关基因在骨关节炎滑膜炎中的作用 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术,系统研究PCD相关基因在OA滑膜炎中的表达模式及其与免疫微环境的相互作用 | 研究样本来源于公共数据库,需要进一步实验验证 | 探讨程序性细胞死亡相关基因在骨关节炎诊断和滑膜炎发展中的作用 | 骨关节炎患者的滑膜组织样本 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA测序, qRT-PCR, 机器学习算法, 单细胞RNA测序 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的OA滑膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10156 | 2025-10-07 |
Analysis and Validation of Autophagy-Related Gene Biomarkers and Immune Cell Infiltration Characteristic in Bronchopulmonary Dysplasia by Integrating Bioinformatics and Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S495132
PMID:39839185
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研究论文 | 通过整合生物信息学和机器学习方法,分析与验证支气管肺发育不良中自噬相关基因生物标志物及免疫细胞浸润特征 | 首次对BPD中自噬相关基因和免疫浸润进行生物信息学分析,并采用三种机器学习算法识别枢纽基因 | 研究基于单一数据集GSE8586,样本来源有限 | 筛选和验证支气管肺发育不良的特征基因 | 支气管肺发育不良患者基因表达数据和高压氧大鼠模型 | 生物信息学 | 支气管肺发育不良 | 基因表达分析,单细胞测序,免疫组织化学 | Lasso,MCC,Degree,MCODE | 基因表达数据 | GSE8586数据集样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10157 | 2025-10-07 |
Differential transcriptomic profiling of lipid metabolism and collagen remodeling in fast- and slow-twitch skeletal muscles in aging
2025-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402294R
PMID:39831549
|
研究论文 | 本研究通过比较分析老年小鼠快慢肌纤维的转录组差异,揭示了衰老过程中脂质代谢和胶原重塑的分子变化 | 首次整合小鼠bulk RNA测序和人类单细胞RNA测序数据,进行跨物种比较分析衰老对快慢肌纤维的影响 | 仅使用20月龄小鼠模型,缺乏更广泛的年龄阶段数据;样本量未明确说明 | 探究衰老过程中快慢肌纤维的转录组差异及其分子机制 | 老年小鼠的快慢骨骼肌纤维和人类单细胞RNA测序数据 | 转录组学 | 老年疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10158 | 2025-10-07 |
Fibrocyte enrichment and myofibroblastic adaptation causes nucleus pulposus fibrosis and associates with disc degeneration severity
2025-Jan-20, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00372-2
PMID:39828732
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研究论文 | 本研究通过整合分析多个单细胞RNA测序数据集,揭示了髓核纤维化与椎间盘退变严重程度相关的细胞机制 | 首次发现髓核纤维化与髓系来源的纤维细胞富集相关,并证实这些细胞通过转化为肌成纤维细胞表型促进椎间盘退变 | 研究主要基于单细胞测序数据和动物模型,需要进一步验证在人类患者中的临床相关性 | 探究椎间盘退变过程中髓核纤维化的细胞机制和关键细胞类型 | 人类退变性髓核标本和损伤诱导的小鼠椎间盘退变模型 | 单细胞基因组学 | 椎间盘退变疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10159 | 2025-10-07 |
TLR7/8/9 agonists and low-dose cisplatin synergistically promotes tertiary lymphatic structure formation and antitumor immunity
2025-Jan-19, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-024-01055-z
PMID:39827246
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研究论文 | 本研究开发了一种新型联合疗法,通过低剂量顺铂与TLR7/8/9激动剂CR108协同促进三级淋巴结构形成和抗肿瘤免疫 | 首次发现低剂量顺铂与TLR7/8/9激动剂CR108联合使用可协同促进三级淋巴结构形成,并揭示其作为功能性抗肿瘤效应T细胞储备库的新机制 | 研究仅限于小鼠模型(4T1和B16肿瘤),尚未在人体临床试验中验证 | 开发新型原位疫苗接种联合疗法以增强抗肿瘤免疫反应 | 小鼠肿瘤模型(4T1和B16肿瘤细胞系) | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞测序数据、血清细胞因子检测数据 | 小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10160 | 2025-10-07 |
ERG mediates the differentiation of hepatic progenitor cells towards immunosuppressive PDGFRα+ cancer-associated fibroblasts during hepatocarcinogenesis
2025-Jan-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07270-9
PMID:39827226
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研究论文 | 本研究揭示肝祖细胞通过TLR4/MAPK/ERG通路分化为免疫抑制性PDGFRα+癌症相关成纤维细胞的机制 | 首次发现ERG转录因子介导肝祖细胞向PDGFRα+ CAFs的分化过程,并阐明其在肝癌免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 研究主要基于大鼠原发肝癌模型,人类临床样本验证相对有限 | 探究肝癌中癌症相关成纤维细胞的起源及其在免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肝祖细胞、PDGFRα+癌症相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 大鼠原发肝癌模型不同时间点样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |