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当前共找到 10796 篇文献，本页显示第 10121 - 10140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10121 | 2025-10-07 |
Single-cell dual-omics reveals translational and transcriptional landscapes and regulations in oocytes from ovarian endometriosis patients
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1534648
PMID:40034233
|
研究论文 | 本研究通过单细胞双组学测序揭示了卵巢子宫内膜异位症患者卵母细胞的翻译组和转录组特征 | 首次对卵巢子宫内膜异位症患者GV期卵母细胞进行单细胞转录组和翻译组联合分析，发现2480个差异表达基因 | 样本来源仅限于特定类型的不孕患者，未涉及其他类型的子宫内膜异位症 | 探究卵巢子宫内膜异位症导致卵母细胞质量下降的分子机制 | 卵巢子宫内膜异位症患者和因输卵管或男性因素不孕的对照者的卵母细胞 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序, 单细胞翻译组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 卵巢子宫内膜异位症患者和对照组的不孕患者卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞翻译组测序 | NA | NA |
| 10122 | 2025-10-07 |
An integrated transcriptomic analysis unveils the regulatory roles of RNA binding proteins during human spermatogenesis
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1522394
PMID:40034235
|
研究论文 | 通过整合转录组分析揭示RNA结合蛋白在人类精子发生过程中的调控作用 | 首次系统揭示RBP在睾丸发育和精子发生过程中的动态表达模式，并发现RPL10、RPL39和SETX作为非梗阻性无精子症的潜在诊断生物标志物 | 基于已发表的测序数据进行分析，缺乏实验验证 | 研究RNA结合蛋白在人类睾丸发育和精子发生过程中的调控机制 | 人类睾丸发育和精子发生过程中的各种细胞类型，非梗阻性无精子症患者 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 转录组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10123 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptome analysis in bladder cancer: Current status and future perspectives
2025 Jan-Mar, Bladder cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1177/23523735251322017
PMID:40034247
|
综述 | 综述膀胱癌研究中单细胞RNA测序和空间转录组技术的应用现状与未来展望 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组技术解析膀胱癌异质性和肿瘤微环境 | 存在技术限制和临床应用可及性等挑战 | 探讨单细胞和空间技术在膀胱疾病研究中的应用价值 | 膀胱疾病相关研究文献 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 10124 | 2025-10-07 |
The role of macrophages in liver metastasis: mechanisms and therapeutic prospects
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1542197
PMID:40034694
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞在肿瘤微环境中促进肝癌转移的机制及其治疗前景 | 系统阐述了巨噬细胞在肝转移微环境中的多重调控机制，特别关注了单细胞测序技术带来的新见解 | NA | 探讨巨噬细胞在肝转移中的作用机制及潜在治疗靶点 | 巨噬细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、肝转移肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌转移 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10125 | 2025-10-07 |
WCSGNet: a graph neural network approach using weighted cell-specific networks for cell-type annotation in scRNA-seq
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1553352
PMID:40034748
|
研究论文 | 提出一种基于图神经网络的细胞类型自动注释方法WCSGNet，利用加权细胞特异性网络改进单细胞RNA测序数据分析 | 首次使用加权细胞特异性网络(WCSNs)来捕获单个细胞内的独特基因相互作用模式，克服了现有方法忽略细胞特异性基因关联网络的局限性 | 未明确说明方法在超大型数据集上的可扩展性以及在噪声数据下的鲁棒性 | 开发更准确的单细胞RNA测序数据细胞类型自动注释方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10126 | 2025-10-07 |
Gbp2 driving macrophages dynamics in murine heart transplant
2025-Apr, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102695
PMID:39709712
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析鉴定出Gbp2是驱动心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因 | 首次发现Gbp2在心脏移植急性排斥过程中调控巨噬细胞极化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 鉴定心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因并评估其对巨噬细胞极化的影响 | 小鼠心脏移植模型中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 器官移植排斥 | 单细胞测序, 伪时序分析, hdWGCNA | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠心脏移植模型数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10127 | 2025-10-07 |
Impaired primitive erythropoiesis and defective vascular development in Trim71-KO embryos
2025-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402956
PMID:39909558
|
研究论文 | 本研究揭示RNA结合蛋白Trim71通过调控中胚层先驱转录因子Eomes的表达，在胚胎原肠胚形成阶段建立器官发生正常发育框架的重要机制 | 首次发现Trim71通过NHL结构域直接抑制Eomes mRNA，建立了这两种重要调控基因之间的功能联系 | 内皮细胞条件性敲除未诱导明显缺陷，表明Trim71在内皮细胞及其前体细胞中的表达对胚胎存活并非必需 | 探究Trim71在胚胎发育过程中对基因表达的调控机制 | Trim71基因敲除小鼠胚胎 | 发育生物学 | 胚胎发育缺陷 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | E7.5阶段全局敲除胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10128 | 2025-10-07 |
A novel coarsened graph learning method for scalable single-cell data analysis
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109873
PMID:39999493
|
研究论文 | 提出一种基于特征感知图粗化的新型方法FACH，用于可扩展的单细胞数据分析 | 首次将局部敏感哈希技术整合到图粗化过程中，实现高效的单细胞数据分析 | NA | 解决单细胞数据大规模图表示的计算挑战 | 单细胞RNA测序和质谱流式细胞术数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | 图神经网络 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 10129 | 2025-10-07 |
Enhanced single-cell RNA-seq embedding through gene expression and data-driven gene-gene interaction integration
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109880
PMID:39999494
|
研究论文 | 提出一种整合基因表达和基因间相互作用的新型单细胞RNA测序嵌入方法 | 通过构建细胞-叶图(CLG)和K近邻图(KNNG)的融合图结构，首次将数据驱动的基因间相互作用整合到单细胞嵌入中 | 未明确说明方法对特定细胞类型或组织的适用性限制 | 开发更全面的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10130 | 2025-10-07 |
X-scPAE: An explainable deep learning model for embryonic lineage allocation prediction based on single-cell transcriptomics revealing key genes in embryonic cell development
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109787
PMID:39946788
|
研究论文 | 提出一种基于单细胞转录组数据的可解释深度学习模型X-scPAE，用于预测胚胎细胞谱系分配并识别关键基因 | 结合PCA降维、自编码器特征提取、注意力机制和反事实梯度归因算法，构建可解释的深度学习模型 | NA | 准确预测细胞谱系分配并识别谱系间基因表达差异 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 胚胎发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 自编码器, 注意力机制, 逻辑回归 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10131 | 2025-10-07 |
Profiling Multiple CD8+ T-cell Functional Dimensions Enhances Breast Cancer Immune Assessment
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0235
PMID:39715293
|
研究论文 | 开发基于bulk RNA测序的FuncDimen模型评估CD8+ T细胞多功能维度，提升乳腺癌免疫评估 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据开发多维度功能评估模型，克服传统CD8+ T细胞丰度评估的局限性 | 临床应用中单细胞RNA测序技术存在限制 | 提升乳腺癌抗肿瘤免疫力评估和免疫治疗反应预测 | 乳腺癌患者CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫荧光, 成像质谱流式 | FuncDimen模型, FuncAggre评分模型 | RNA测序数据, 免疫组化数据 | 乳腺癌队列和外部数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10132 | 2024-09-13 |
From genes to geography: Mapping allergic disease landscapes with spatial transcriptomics
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.08.025
PMID:39260791
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10133 | 2025-10-07 |
Cell autonomous TLR4 signaling modulates TGF-β induced activation of human cardiac fibroblasts
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42452
PMID:40028530
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现TLR4是心脏成纤维细胞中主要表达的免疫传感器，并证明抑制TLR4信号可减轻TGF-β诱导的纤维化变化 | 首次揭示心脏成纤维细胞中自主性TLR4信号通路在调节TGF-β诱导纤维化过程中的关键作用 | 研究仅在体外实验条件下进行，缺乏体内验证 | 探究细胞自主性免疫信号在成人心脏成纤维细胞纤维化调节中的作用机制 | 小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | FACS, 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自Collagen1-α1GFP小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10134 | 2025-10-07 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (class Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2025-Feb-27, BMC ecology and evolution
IF:2.3Q3
DOI:10.1186/s12862-025-02353-3
PMID:40011795
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组数据，结合多物种溯祖模型进行物种界定，并开发了从转录组数据重建核糖体RNA基因序列的工作流程 | 样本主要来自韩国和美国，地理覆盖范围有限，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，系统发育分析，物种界定分析 | 多物种溯祖模型，邻接网络分析 | 转录组数据，蛋白质编码基因序列 | 37个旋口虫标本（25个新生成转录组+12个来自GenBank） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10135 | 2025-10-07 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析全球肝类器官研究的发展格局和趋势 | 首次对肝类器官研究领域进行全面的文献计量学分析，识别关键研究趋势和学术合作机会 | 仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 分析肝类器官研究的全球科研产出并评估当前成就与未来趋势 | 肝类器官研究相关的科学文献 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析，单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 991篇文献（2010-2024年） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10136 | 2025-10-07 |
Uncovering immune cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma by combining single-cell RNA sequencing with T-cell receptor sequencing
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.99046
PMID:40027555
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，揭示肝细胞癌中免疫细胞的异质性 | 首次在肝细胞癌中结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析免疫细胞异质性，发现两个新的T细胞亚群 | 样本量有限，研究结果需要在更大队列中验证 | 研究肝细胞癌发展过程中的关键生物标志物基因和免疫细胞亚群反应 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 肝细胞癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 10137 | 2025-10-07 |
Shiba: A versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596331
PMID:38895326
|
研究论文 | 开发了一种名为Shiba的计算方法，用于系统识别不同RNA测序平台上的差异RNA剪接 | 整合了转录本组装、剪接事件识别、读数计数和差异剪接分析，能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决了连接读段不平衡问题 | NA | 开发一种跨平台的差异RNA剪接识别计算方法 | RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10138 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis Explored Changes in Midnolin-Related Immune Microenvironment and Constructed Combined Prognostic Model for Pancreatic Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503326
PMID:40026303
|
研究论文 | 通过单细胞测序和转录组分析探索midnolin相关免疫微环境变化并构建胰腺癌联合预后模型 | 首次将MIDN、midnolin相关基因和midnolin相关免疫浸润细胞整合构建胰腺癌联合预后模型 | NA | 评估MIDN及相关因子在胰腺癌预后中的价值并构建预后模型 | 胰腺癌患者数据及胰腺癌细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,转录组分析,CIBERSORT,Cox回归,LASSO | Cox回归模型,LASSO模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10139 | 2025-10-07 |
Integration of Single Cell and Bulk RNA-Sequencing Reveals Key Genes and Immune Cell Infiltration to Construct a Predictive Model and Identify Drug Targets in Endometriosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497643
PMID:40026309
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示子宫内膜异位症的关键基因和免疫细胞浸润特征，构建预测模型并识别潜在药物靶点 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析子宫内膜异位症，识别出8个关键基因构建高精度预测模型，并发现相关免疫细胞浸润变化 | 样本来源仅限于基因表达综合数据库，需要进一步实验验证 | 探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，开发疾病诊断和预测模型 | 子宫内膜异位症患者和健康对照者的增生期内膜组织 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10140 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peripheral Immune Cell Senescence and Inflammatory Phenotypes in Patients with Premature Ovarian Failure
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496130
PMID:40026314
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者外周免疫细胞衰老和炎症表型 | 首次在单细胞水平系统描绘POF患者外周免疫细胞特征，发现非经典单核细胞通过CCL5介导CD8+效应T细胞趋化和卵巢损伤的新机制 | 样本量较小（3例健康对照和4例POF患者），需要在更大队列中验证发现 | 探究早发性卵巢功能不全的免疫学机制 | 早发性卵巢功能不全患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | SCENIC分析、拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 3例健康对照和4例POF患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |