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当前共找到 10349 篇文献，本页显示第 10101 - 10120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10101 | 2025-10-07 |
Primitive to visceral endoderm maturation is essential for mouse epiblast survival beyond implantation
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111671
PMID:39868030
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠胚胎植入后原始内胚层向脏壁内胚层成熟的分子机制及其对胚胎外胚层存活的重要性 | 首次在胚胎植入后关键时期（E5.0）通过单细胞RNA测序揭示BMP信号上调和Sox7表达短暂增加驱动原始内胚层向脏壁内胚层转化的动态信号活动 | 研究主要聚焦于Hnf1b基因缺陷模型，可能未涵盖其他潜在调控机制；样本时间点相对有限 | 探索小鼠胚胎植入后原始内胚层向脏壁内胚层成熟的分子机制及其对胚胎发育的影响 | 小鼠胚胎（包括野生型和Hnf1b-/-突变体）在胚胎第5.0天的发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎第5.0天的小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10102 | 2025-10-07 |
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632775
PMID:39868099
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研究论文 | 开发了一种基于群体学习的去中心化单细胞测序数据细胞类型注释方法 | 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释，实现了隐私保护的分布式模型训练 | NA | 开发标准化、自动化的细胞类型注释方法，同时保护患者隐私 | 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞测序数据 | 单细胞分析 | NA | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 单细胞测序数据 | 多个实验室生成的多组织数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10103 | 2025-10-07 |
PPARG/SPP1/CD44 signaling pathway in alveolar macrophages: Mechanisms of lipid dysregulation and therapeutic targets in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e41628
PMID:39866448
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研究论文 | 本研究揭示了肺泡巨噬细胞中PPARG/SPP1/CD44信号通路在特发性肺纤维化脂质代谢失调中的作用机制 | 首次提出肺泡巨噬细胞中PPARG/SPP1/CD44信号通路调控脂质代谢并促进肺纤维化进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索特发性肺纤维化中脂质代谢失调的分子机制并寻找治疗靶点 | 肺泡巨噬细胞和脂质代谢相关基因 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习, 网络药理学 | 机器学习 | 基因表达数据 | 12个bulk RNA-seq数据集和2个单细胞RNA-seq数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10104 | 2025-10-07 |
The Progression of Mycosis Fungoides During Treatment with Mogamulizumab: A BIO-MUSE Case Study of the Tumor and Immune Response in Peripheral Blood and Tissue
2025-Jan-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010186
PMID:39857770
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病例研究 | 通过单细胞测序和空间转录组学分析一例蕈样肉芽肿患者在莫格利珠单抗治疗期间的疾病进展机制 | 首次结合外周血单细胞RNA测序与组织空间转录组学分析MF疾病进展的分子特征 | 单病例研究，样本量有限，需要更大规模验证 | 探索蕈样肉芽肿疾病进展的分子机制和生物标志物 | 一例接受莫格利珠单抗治疗的晚期蕈样肉芽肿患者 | 单细胞组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，数字空间分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 1例患者的多时间点样本 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, GeoMx DSP | 10x单细胞RNA测序用于CD3+外周T细胞，GeoMx数字空间分析用于皮肤活检组织 |
| 10105 | 2025-10-07 |
Debiasing Sinkhorn divergence in optimal transport of cellular dynamics
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.11.632566
PMID:39868085
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研究论文 | 本文通过最优传输理论分析单细胞RNA测序数据，研究细胞动态过程中的Sinkhorn散度去偏方法 | 提出在细胞动态最优传输中使用Sinkhorn散度平衡熵正则化引起的算法偏差 | Sinkhorn散度的有效性依赖于时间点稀疏性，在某些细胞类型和稀疏时间点下效果不显著 | 提高单细胞RNA测序数据分析中细胞命运预测的准确性 | 小鼠胚胎成纤维细胞重编程和表皮形态发生过程中的细胞动态 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 最优传输，Sinkhorn散度 | 单细胞RNA测序数据 | 多个时间点（密集时间点、9个时间点、5个时间点）的细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10106 | 2025-10-07 |
Identifying MTHFD1 and LGALS4 as Potential Therapeutic Targets in Prostate Cancer Through Multi-Omics Mendelian Randomization Analysis
2025-Jan-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010185
PMID:39857769
|
研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化分析鉴定MTHFD1和LGALS4作为前列腺癌的潜在治疗靶点 | 首次通过整合eQTL和pQTL数据进行多组学孟德尔随机化分析，识别出前列腺癌的潜在治疗靶点 | 需要未来实验验证这些候选蛋白的实用性和有效性 | 筛选前列腺癌的药物靶点以改善治疗前景 | 前列腺腺癌(PRAD) | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,生存分析,免疫微环境评估 | SMR, HEIDI, IVW, Wald ratio, weighted median, MR-Egger | eQTL数据,pQTL数据,基因表达谱,单细胞RNA测序数据 | eQTLGen联盟、UK Biobank Proteome Plasma Proteins、deCODE健康数据集、TCGA数据库、GSE176031数据集 | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 10107 | 2025-10-07 |
Exploring RNA-Seq Data Analysis Through Visualization Techniques and Tools: A Systematic Review of Opportunities and Limitations for Clinical Applications
2025-Jan-12, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12010056
PMID:39851330
|
系统综述 | 系统综述RNA-seq数据可视化技术与工具在临床应用中的机遇与局限性 | 首次系统性地分类和评估不同类型RNA-seq数据（环状RNA、单细胞RNA、批量RNA和长链非编码RNA）的可视化工具及其临床应用 | 仅纳入2017-2024年期间的英文全文研究，可能存在发表偏倚 | 概述当前用于从RNA-seq数据构建临床推论的最先进数据可视化技术与工具 | RNA-seq数据可视化工具和技术 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 33项符合纳入标准的研究 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10108 | 2025-10-07 |
Ex Vivo Regional Gene Therapy Compared to Recombinant BMP-2 for the Treatment of Critical-Size Bone Defects: An In Vivo Single-Cell RNA-Sequencing Study
2025-Jan-01, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12010029
PMID:39851303
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较区域基因治疗与重组BMP-2在临界尺寸骨缺损修复中的细胞和转录机制差异 | 首次在临界尺寸骨缺损模型中应用单细胞RNA测序技术比较两种BMP-2介导的骨再生策略 | 研究仅基于6只大鼠的小样本量，需要更大规模验证 | 比较区域基因治疗与重组BMP-2在骨缺损修复中的细胞和分子机制差异 | 大鼠临界尺寸股骨缺损模型中的血肿组织细胞 | 单细胞测序分析 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6只大鼠（每组3只） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 10109 | 2025-10-07 |
The Prognostic Significance of TRs in Hepatocellular Carcinoma: Insights from TCGA and GEO Databases
2025, Biomarker insights
IF:3.4Q2
DOI:10.1177/11772719251315321
PMID:39866810
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证探讨甲状腺激素受体在肝细胞癌中的预后价值 | 首次系统评估THRB在肝细胞癌中的预后意义，并结合单细胞RNA测序揭示其在CD16+单核细胞中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索甲状腺激素受体在肝细胞癌患者中的预测价值 | 肝细胞癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 功能实验 | Kaplan-Meier分析, Cox回归, 逻辑回归 | 基因表达数据, 实验数据 | TCGA和3个GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10110 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Seq Uncovers Cellular Heterogeneity from Deep Fascia in Necrotizing Fasciitis Patients
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496650
PMID:39867946
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示坏死性筋膜炎患者深筋膜中的细胞异质性 | 首次在坏死性筋膜炎患者中报道深筋膜的细胞异质性，发现三种成纤维细胞亚群和三种巨噬细胞亚群的比例变化 | 样本量较小（NF组n=3，对照组n=4） | 研究坏死性筋膜炎中深筋膜细胞的响应变化 | 坏死性筋膜炎患者和志愿者的筋膜样本 | 单细胞组学 | 坏死性筋膜炎 | 单细胞RNA测序，多重染色，多光谱成像，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | NF患者3例，对照组4例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10111 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics identifies the common perturbations of monocyte/macrophage lineage cells in inflammaging of bone marrow
2025-Jan, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.09.013
PMID:39868348
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示骨髓炎症衰老中单核/巨噬细胞谱系的共同扰动机制 | 首次在多种衰老和炎症小鼠模型中系统识别单核/巨噬细胞谱系通过App-Cd74轴激活的共同病理通路 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究骨髓炎症衰老中是否存在共同的病理通路 | 端粒酶缺陷小鼠、5×FAD小鼠、Dmp1 Cre-DTA ki/wt小鼠、高脂饮食小鼠和腰椎神经压迫小鼠的骨髓样本 | 单细胞组学 | 炎症衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5种不同疾病小鼠模型的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10112 | 2025-10-07 |
Identifying Key Biomarkers Related to Immune Response in the Progression of Diabetic Kidney Disease: Mendelian Randomization Combined With Comprehensive Transcriptomics and Single-Cell Sequencing Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482047
PMID:39871959
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序分析识别与糖尿病肾病免疫反应相关的关键生物标志物 | 结合pQTL孟德尔随机化、共定位分析、转录组学和单细胞测序多维度方法识别糖尿病肾病关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅在糖尿病肾病小鼠模型中进行RT-qPCR验证 | 识别糖尿病肾病发病和进展中的关键基因，探索潜在治疗靶点 | 糖尿病肾病相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | pQTL孟德尔随机化, 转录组分析, 单细胞测序, RT-qPCR | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | 糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 10113 | 2025-10-07 |
Tumour heterogeneity and personalized treatment screening based on single-cell transcriptomics
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.12.020
PMID:39877290
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研究论文 | 基于单细胞转录组数据构建肿瘤细胞异质性图谱并探索个性化治疗策略 | 整合五种癌症的单细胞转录组数据，识别肿瘤细胞亚群特异性生物标志物和潜在治疗药物，并将不同癌症的肿瘤细胞亚群按治疗策略分为三大类 | 仅分析了五种常见癌症类型，样本量有限，需要进一步实验验证 | 研究肿瘤异质性并开发个性化治疗筛选方法 | 肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌和肝癌患者 | 数字病理学 | 肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌、肝癌 | 单细胞转录组测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 五个单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10114 | 2025-10-07 |
MAIT Cell-Mediated Immune Mechanisms of Dialysis-Induced Peritoneal Fibrosis and Therapeutic Targeting
2025-Jan-28, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000627
PMID:39874111
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研究论文 | 本研究揭示了黏膜相关恒定T细胞在腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的关键作用机制 | 首次发现MAIT细胞通过MR1受体与间皮细胞相互作用激活mTORC1信号通路促进腹膜纤维化 | 研究样本量有限，主要基于长期腹膜透析患者和动物模型 | 探索腹膜透析诱导腹膜纤维化的免疫机制并寻找治疗靶点 | 长期腹膜透析患者和Mr1基因敲除小鼠 | 免疫学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 长期腹膜透析患者和Mr1敲除小鼠 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10115 | 2025-10-07 |
ARP2/3 complex affects myofibroblast differentiation and migration in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Mar-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35246
PMID:39472297
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研究论文 | 本研究探讨ARP2/3复合物在胰腺导管腺癌中对癌症相关成纤维细胞迁移和分化的影响 | 首次揭示ARP2/3复合物在肌成纤维细胞样CAF分化中的关键作用，并发现其特异性影响TGFβ1介导的分化过程 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 阐明ARP2/3复合物在胰腺癌微环境中对CAF功能的调控机制 | 胰腺导管腺癌、癌症相关成纤维细胞、胰腺星状细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、微阵列分析、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | p48; LSL-Kras基因工程小鼠、人永生化胰腺星状细胞、原代PDAC来源CAFs | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10116 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of cancer-associated fibroblast subpopulations in prostate cancer: Implications for prognosis and immunotherapy
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102255
PMID:39721245
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示前列腺癌中癌症相关成纤维细胞亚群的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 首次系统识别前列腺癌中四个主要CAF亚群（C0 IER2+、C1 ABCA8+、C2 ABI3BP+、C3 MEOX2+），并发现C1 ABCA8+亚群通过NFAT5转录因子促进肿瘤增殖 | 研究样本量未明确说明，体外实验仅使用LNCaP FGC和22Rv1两种细胞系进行验证 | 阐明癌症相关成纤维细胞在前列腺癌肿瘤微环境中的多重作用及其对预后和免疫治疗策略的影响 | 前列腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞亚群 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10117 | 2025-10-07 |
Cortisol regulates neonatal lung development via Smoothened
2025-Jan-18, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03104-0
PMID:39827090
|
研究论文 | 本研究揭示了皮质醇通过竞争性结合Smoothened蛋白的CRD结构域抑制SHH信号通路，从而调控新生儿肺发育的分子机制 | 首次发现皮质醇可直接与SMO蛋白结合并竞争性抑制胆固醇激活的SHH信号通路，阐明其在新生儿肺发育中的新调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究皮质醇在新生儿肺发育中的分子调控机制 | 小鼠肺组织、细胞系 | 发育生物学 | 新生儿呼吸窘迫综合征 | 分子对接模拟、CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、荧光原位杂交 | 基因编辑小鼠模型 | 基因序列数据、图像数据、单细胞转录组数据 | 基因编辑小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10118 | 2025-10-07 |
Elucidating cardiomyocyte heterogeneity and maturation dynamics through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111596
PMID:39811652
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学揭示心肌细胞的异质性和成熟动态 | 识别了过渡性心肌细胞亚群，揭示了连续而非离散的成熟轨迹，并阐明了心肌细胞发育的空间组织 | 仅使用新生小鼠心脏细胞，未涉及其他发育阶段或物种 | 解析心肌细胞异质性及其在心脏发育中的动态变化 | 新生小鼠心脏中的心肌细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 新生小鼠心脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10119 | 2025-10-07 |
Smooth muscle cell-specific CD47 deletion suppresses atherosclerosis
2025-Jan-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123315
PMID:39675550
|
研究论文 | 本研究通过平滑肌细胞特异性CD47基因敲除揭示了TSP1-CD47信号通路在调控血管平滑肌细胞表型和动脉粥样硬化发展中的关键作用 | 首次发现CD47在动脉粥样硬化动脉中表型调制的平滑肌细胞内表达上调，且平滑肌细胞特异性CD47缺失能抑制动脉粥样硬化 | 未观察到体重增加、肝脏和脂肪组织质量、血浆总胆固醇及空腹血糖的显著差异 | 探究平滑肌细胞CD47在动脉粥样硬化发展中的作用机制 | 血管平滑肌细胞、小鼠模型、人类动脉粥样硬化血管组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、基因敲除、体外细胞实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织切片图像、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10120 | 2025-10-07 |
Elucidating stearoyl metabolism and NCOA4-mediated ferroptosis in gastric cancer liver metastasis through multi-omics single-cell integrative mendelian analysis: advancing personalized immunotherapy strategies
2025-Jan-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01769-z
PMID:39812999
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研究论文 | 通过多组学单细胞整合孟德尔分析阐明硬脂酰代谢和NCOA4介导的铁死亡在胃癌肝转移中的作用 | 首次整合孟德尔随机化、批量转录组分析和单细胞多组学技术揭示硬脂酰代谢通过铁死亡途径促进胃癌肝转移的机制 | NA | 探究硬脂酰代谢在胃癌肝转移肿瘤微环境异质性中的作用机制 | 胃癌肝转移患者的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 批量转录组分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |