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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10081 | 2025-10-07 |
Single cell RNA sequencing improves the next generation of approaches to AML treatment: challenges and perspectives
2025-Jan-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01085-w
PMID:39885388
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在急性髓系白血病治疗中的改进作用、面临的挑战及未来展望 | 系统阐述scRNA-seq在AML分类、风险分层、治疗靶点识别及白血病干细胞鉴定中的创新应用 | 面临高维数据分析、技术噪音、批次效应和小生物模式识别等挑战 | 提升急性髓系白血病的治疗策略和疗效 | 急性髓系白血病患者及白血病干细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 人工智能模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10082 | 2025-10-07 |
Epithelial cell diversity and immune remodeling in bladder cancer progression: insights from single-cell transcriptomics
2025-Jan-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06138-6
PMID:39885578
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示膀胱癌进展过程中上皮细胞多样性和免疫重塑的动态变化 | 首次在单细胞水平系统描绘膀胱癌从非肌层浸润向肌层浸润进展过程中肿瘤微环境的动态变化,发现糖酵解增强、T细胞耗竭和免疫细胞重塑等关键机制 | 样本量相对有限(11个样本),需要更大队列验证发现 | 探究膀胱癌进展过程中肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境的重塑机制 | 膀胱癌患者组织样本(包括NMIBC、MIBC和癌旁正常组织) | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 11个膀胱癌样本(4个NMIBC、4个MIBC、3个癌旁正常组织) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10083 | 2025-10-07 |
Inhibition of Retinal Neovascularization by BEZ235: Targeting the Akt/4EBP1/Cyclin D1 Pathway in Endothelial Cells
2025-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.1.66
PMID:39888634
|
研究论文 | 本研究探讨BEZ235通过抑制Akt/4EBP1/Cyclin D1通路在视网膜新生血管形成中的治疗作用 | 首次揭示BEZ235通过抑制PI3K/Akt/mTOR通路下调cyclin D1表达,从而抑制内皮细胞周期进程和视网膜新生血管形成 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未进行临床试验验证 | 研究BEZ235对视网膜新生血管形成的抑制作用及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型、人脐静脉内皮细胞、人视网膜微血管内皮细胞 | 生物医学 | 视网膜新生血管疾病 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光染色、H&E染色、视网膜电图 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、组织形态数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型、两种内皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10084 | 2025-10-07 |
The next generation of regenerative dentistry: From tooth development biology to periodontal tissue, dental pulp, and whole tooth reconstruction in the clinical setting
2025-Mar, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.01.002
PMID:39885872
|
综述 | 本文综述了从牙齿发育生物学到牙周组织、牙髓及全牙再生的新一代牙科再生医学进展 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学等前沿技术,探索基于多能干细胞类器官和基因改造动物异种移植的创新再生策略 | 目前牙齿和牙周组织完全再生仍处于研究阶段,尚未实现临床应用 | 实现牙齿和牙周组织的完全功能性再生 | 人类和小鼠的牙齿发育过程及牙周组织、牙髓组织 | 再生医学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10085 | 2025-10-07 |
MAZ-mediated tumor progression and immune evasion in hormone receptor-positive breast cancer: Targeting tumor microenvironment and PCLAF+ subtype-specific therapy
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102280
PMID:39805182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析激素受体阳性乳腺癌,发现PCLAF+肿瘤细胞亚型及其关键调控因子MAZ在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 首次识别C3 PCLAF+肿瘤细胞亚型,揭示MAZ作为关键转录因子通过MK信号通路与癌症相关成纤维细胞相互作用促进肿瘤进展 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索激素受体阳性乳腺癌治疗抵抗的分子机制,寻找新的治疗靶点 | 激素受体阳性乳腺癌肿瘤细胞亚型及其微环境 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Slingshot, CellChat, pySCENIC, 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10086 | 2025-10-07 |
GP73 reinforces cytotoxic T-cell function by regulating HIF-1α and increasing antitumor efficacy
2025-Jan-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009265
PMID:39762082
|
研究论文 | 本研究揭示了GP73通过调控HIF-1α增强细胞毒性T细胞功能并提高抗肿瘤疗效的机制 | 首次发现GP73通过调节HIF-1α介导的糖酵解过程来增强T细胞抗肿瘤功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本数量有限 | 探究GP73在肿瘤微环境中调节T细胞介导的抗肿瘤免疫的机制 | T细胞、肿瘤浸润免疫细胞、临床肿瘤患者血液样本 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序、RNA测序、实时定量PCR、Western blotting、流式细胞术、海马分析、葡萄糖摄取测定、L-乳酸分泌测定 | GP73基因敲除小鼠模型、MC38和B16肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和临床患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10087 | 2025-10-07 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveal cellular heterogeneity and a novel cancer-promoting Treg cell subset in human clear-cell renal cell carcinoma
2025-Jan-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010183
PMID:39755578
|
研究论文 | 通过空间和单细胞转录组学揭示人透明细胞肾细胞癌中的细胞异质性和新型促癌Treg细胞亚群 | 识别了具有末端效应Treg细胞分子特征但表达多种细胞因子的特殊Treg细胞亚群,并揭示了其与MRC1+FOLR2+TAMs在肿瘤-正常组织界面形成正反馈环的协同促癌机制 | 样本量相对较小(4例单细胞测序,15例体外验证),需要在更大队列中进一步验证 | 研究ccRCC中免疫抑制细胞的空间和功能异质性及其相互作用机制 | 透明细胞肾细胞癌患者组织样本 | 单细胞转录组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据, 组织微阵列数据 | 4例单细胞测序样本(来自肿瘤核心、肿瘤-正常界面和远端正常组织多个区域),15例体外验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10088 | 2025-01-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Age-Related Changes in Epidermal Cell Populations and Interactions
2025-Jan-03, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.12.013
PMID:39756533
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10089 | 2025-10-07 |
RASGRF2 as a potential pathogenic gene mediating the progression of alcoholic hepatitis to alcohol-related cirrhosis and hepatocellular carcinoma
2025-Jan-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01853-4
PMID:39875737
|
研究论文 | 本研究通过多组转录组数据分析发现RASGRF2是介导酒精性肝炎向酒精性肝硬化和肝细胞癌进展的关键致病基因 | 首次通过多数据库整合分析结合机器学习算法鉴定出RASGRF2作为AH向AC和HCC进展的核心共享基因,并利用单细胞和空间转录组数据进行了验证 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于HepG2细胞系,缺乏更广泛的体内功能验证 | 探索酒精性肝炎向肝硬化和肝细胞癌进展的分子机制 | 酒精性肝炎、酒精性肝硬化、肝细胞癌患者组织样本及HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组测序、免疫浸润分析、免疫组化、细胞功能实验 | 机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 多个转录组数据库的样本数据,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10090 | 2025-10-07 |
Computational Identification of Migrating T cells in Spatial Transcriptomics Data
2025-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619870
PMID:39484480
|
研究论文 | 开发了一种利用空间转录组数据追踪T细胞迁移模式的计算方法ReMiTT | 首次提出基于空间转录组数据计算识别T细胞迁移轨迹的计算方法 | NA | 研究T细胞在肿瘤微环境中的迁移模式 | 肿瘤组织中的T细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | ReMiTT | 空间转录组数据 | 多个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10091 | 2025-10-07 |
The Role of Dectin-1-Akt-RNF146 Pathway in β-Glucan Induced Immune Trained State of Monocyte in Sepsis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482213
PMID:39881796
|
研究论文 | 本研究探讨了Dectin-1-Akt-RNF146通路在β-葡聚糖诱导的单核细胞免疫训练状态中的作用及其在脓毒症中的机制 | 首次揭示RNF146通过dectin-1-Akt-mTOR通路调控单核细胞免疫训练状态,为逆转脓毒症免疫抑制提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明β-葡聚糖诱导的免疫训练在脓毒症中的作用机制 | 脓毒症患者外周血单核细胞、脓毒症小鼠模型、RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞系 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者PBMCs、小鼠模型和细胞系(具体数量未明确说明) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10092 | 2025-10-07 |
Therapeutic potential and mechanisms of umbilical cord mesenchymal stem cells differentiating into tendon cells and promotion of rotator cuff tendon-bone healing
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251315185
PMID:39882545
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研究论文 | 本研究探讨脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其促进肩袖肌腱-骨愈合的治疗潜力 | 首次通过单细胞测序分析脐带间充质干细胞向肌腱细胞分化过程中的关键细胞亚群和信号通路,并揭示Hes1基因在促进分化和肩袖损伤修复中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 探索脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其在肩袖损伤修复中的应用价值 | 脐带间充质干细胞、肌腱细胞、肩袖损伤动物模型 | 干细胞研究 | 肩袖损伤 | 单细胞测序、基因过表达、细胞诱导分化 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10093 | 2025-10-07 |
Airway stenosis: classification, pathogenesis, and clinical management
2025-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70076
PMID:39866837
|
综述 | 本文系统介绍气道狭窄的分类、发病机制及临床管理策略 | 基于单细胞RNA测序等新技术展望多机制交叉研究前景 | 未涉及具体临床实验数据验证 | 揭示气道狭窄发病机制并推动临床转化 | 气道狭窄疾病及其治疗方式 | 医学研究 | 气道狭窄 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 鸟枪法宏基因组测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 10094 | 2025-10-07 |
A deep learning framework for in silico screening of anticancer drugs at the single-cell level
2025-Feb, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae451
PMID:39872221
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研究论文 | 开发名为Shennong的深度学习框架,用于在单细胞水平上进行抗癌药物的计算机筛选 | 首次利用泛癌种和泛组织的单细胞转录组图谱构建深度学习框架,能够预测单个细胞对药物的反应并评估组织损伤效应 | 基于计算机模拟预测,需要实验验证 | 开发用于抗癌药物筛选的深度学习框架 | 恶性细胞、癌前细胞、癌症相关基质细胞和内皮细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 泛癌种和泛组织单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10095 | 2025-10-07 |
To describe the subsets of malignant epithelial cells in gastric cancer, their developmental trajectories and drug resistance characteristics
2025-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01715-5
PMID:39869282
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌细胞亚群,揭示其发育轨迹和耐药特性 | 首次在单细胞水平系统鉴定胃癌中5个恶性上皮细胞亚群,构建具有预测能力的预后风险评分模型 | 样本来源和数量有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 解析胃癌细胞异质性及其与治疗抵抗的关系 | 胃癌组织样本中的细胞 | 单细胞基因组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | 262,532个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 10096 | 2025-10-07 |
Fetal fibroblast heterogeneity defines dermal architecture during human embryonic skin development
2025-Jan-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.12.027
PMID:39880186
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研究论文 | 本研究通过分析人类胚胎皮肤发育过程中的成纤维细胞异质性,揭示了8个不同的成纤维细胞群体及其时空分布特征 | 首次系统描绘了人类胚胎皮肤发育过程中成纤维细胞的异质性图谱,发现了发育阶段特异性的细胞群体动态变化和空间分布模式 | 研究样本仅涵盖8-16孕周的胚胎皮肤,缺乏更早期和更晚期的发育阶段数据 | 探究人类胚胎皮肤发育过程中成纤维细胞的异质性及其在皮肤结构形成中的作用 | 人类胚胎皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,单分子荧光原位杂交 | 聚类分析,基于分区的图抽象,伪时间分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 8和16孕周的人类胚胎皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10097 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals microenvironmental infiltration of myeloid cells and pancreatic prognostic markers in PDAC
2025-Jan-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01830-x
PMID:39847195
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示PDAC中髓系细胞的微环境浸润特征并建立胰腺癌预后预测模型 | 首次在单细胞水平系统解析PDAC髓系细胞异质性,发现TAM-spp1细胞与不良预后密切相关,并构建了8基因风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据,缺乏独立验证队列和实验验证 | 探究胰腺导管腺癌中髓系细胞的异质性及其对预后的影响 | 胰腺导管腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因集变异分析, CIBERSORT, LASSO回归, Cox回归分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自多个公共数据库的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10098 | 2025-10-07 |
Sleeve gastrectomy reveals the plasticity of the human gastric epithelium
2025-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56135-y
PMID:39833151
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研究论文 | 本研究通过组织学和单细胞RNA测序揭示了袖状胃切除术后人类胃上皮的可塑性变化 | 首次在分子和细胞水平展示袖状胃切除术后胃上皮重塑,发现壁细胞亚群和肠嗜铬样细胞的适应性变化 | 研究样本仅包括12名女性患者,样本量有限 | 探究袖状胃切除术后胃上皮的适应性变化机制 | 人类胃上皮组织 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 组织学, 单细胞RNA测序, 数学建模 | 非线性比例积分控制模型 | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 12名女性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10099 | 2025-10-07 |
A practical guide for choosing an optimal spatial transcriptomics technology from seven major commercially available options
2025-Jan-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11235-3
PMID:39833687
|
指南 | 本文分析和比较七种主要商业化空间转录组技术平台,为研究人员选择最适合其需求的平台提供实用指导 | 首次系统性地对七种主要商业化空间转录组平台进行全面比较分析 | 仅涵盖商业化平台,未包括实验性或早期开发阶段的技术 | 为研究人员提供选择合适空间转录组技术的实用指南 | 七种主要商业化空间转录组技术平台 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10100 | 2025-10-07 |
From Genes to Clinical Practice: Exploring the Genomic Underpinnings of Endometrial Cancer
2025-Jan-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17020320
PMID:39858102
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综述 | 探讨子宫内膜癌的基因组基础及其向临床实践的转化 | 整合单细胞基因组学和空间转录组学等多组学技术,提供识别新型生物标志物和治疗靶点的整体视角 | 患者反应存在变异性、基因组数据整合到临床工作流程存在挑战以及伦理考量 | 探索子宫内膜癌的基因组基础并推动精准医疗发展 | 子宫内膜癌及其分子亚型 | 基因组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞基因组学, 空间转录组学, 多组学技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |