单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10548 篇文献,本页显示第 10081 - 10100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
10081 2025-10-07
[Chitinase-like protein Ym2 regulates olfactory epithelium homeostasis and olfactory behavior in mice]
2025-Feb-21, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
研究论文 本研究探讨了Ym2蛋白在小鼠嗅觉上皮稳态和嗅觉行为中的关键作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了Ym2在老年小鼠嗅觉上皮中的高表达模式及其对嗅觉功能的调控机制 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 研究Ym2在嗅觉上皮稳态和嗅觉行为中的功能 年轻和老年小鼠的嗅觉上皮组织 分子生物学 嗅觉功能障碍 单细胞RNA测序,免疫染色,RNAscope原位杂交,埋藏食物颗粒测试 基因敲除小鼠模型 基因表达数据,行为学数据,组织学数据 年轻和老年小鼠嗅觉上皮样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10082 2025-10-07
Impaired inflammatory resolution with severe SARS-CoV-2 infection in leptin knock out obese hamster
2025-Feb-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用基因编辑的瘦素敲除肥胖仓鼠建立严重SARS-CoV-2感染模型,通过单细胞转录组学揭示肥胖相关重症COVID-19的机制 首次建立瘦素敲除肥胖仓鼠的严重感染模型,发现单核细胞源性肺泡巨噬细胞在肺过度炎症中的关键作用及两个独特细胞命运分支 动物模型与人类疾病存在物种差异,样本规模有限 探究肥胖个体罹患重症COVID-19的分子机制 基因编辑瘦素敲除肥胖仓鼠及肺组织样本 单细胞转录组学 COVID-19 单细胞RNA测序,基因编辑 动物疾病模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10083 2025-10-07
Harnessing omics data for drug discovery and development in ovarian aging
2025-Feb-20, Human reproduction update IF:14.8Q1
综述 本综述系统整合卵巢衰老相关的多组学数据,探讨如何利用这些数据发现药物靶点并指导治疗策略 首次从组织和单细胞双重视角系统整合基因组、转录组、蛋白组、代谢组和微生物组等多组学数据,结合人工智能模型预测药物靶点 文献检索仅限于PubMed数据库和英文文献,可能遗漏其他语言或数据库的相关研究 探索利用多组学数据发现卵巢衰老药物靶点和开发治疗策略 卵巢衰老相关的分子机制和药物靶点 生物信息学 卵巢衰老相关疾病 基因组学、转录组学、表观基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学、单细胞技术、空间转录组学 机器学习、人工智能、深度学习 多组学数据 NA NA 单细胞多组学、空间转录组学 NA NA
10084 2025-10-07
Advancements in single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics: transforming biomedical research
2025, Acta biochimica Polonica IF:1.4Q4
综述 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术的发展及其在生物医学研究中的变革性应用 强调空间转录组学在保留RNA转录组空间信息方面的突破性进展,克服了传统单细胞测序技术丢失空间信息的局限性 传统单细胞RNA测序技术无法保留RNA转录组的空间信息,因为该过程需要组织解离和细胞分离 探讨单细胞测序和空间转录组学技术的最新发展、相关挑战及其在生物医学领域的应用 单细胞RNA测序和空间转录组学技术及其在生物医学研究中的应用 生物医学 癌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
10085 2025-10-07
Cancer stem cells and tumor-associated macrophages as mates in tumor progression: mechanisms of crosstalk and advanced bioinformatic tools to dissect their phenotypes and interaction
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文系统阐述癌症干细胞与肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展中的相互作用机制及生物信息学分析工具 整合前沿生物信息学工具(单细胞RNA测序、空间转录组学、轨迹分析)解析CSC-TAM相互作用的表型和机制 NA 阐明癌症干细胞与肿瘤微环境免疫细胞(特别是肿瘤相关巨噬细胞)相互作用的分子机制 癌症干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹分析 NA NA NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
10086 2025-10-07
An anoikis-related signature predicts prognosis and immunotherapy response in gastrointestinal cancers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于失巢凋亡相关基因的预后特征(Anoscore),用于预测胃肠道癌症患者的预后和免疫治疗反应 首次构建了基于失巢凋亡相关基因的预后评分系统,并验证其在胃肠道癌症预后预测和个性化治疗方案选择中的价值 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 探索失巢凋亡相关基因在胃肠道癌症预后中的作用 食管癌、胃癌、结肠癌和直肠癌患者 生物信息学 胃肠道癌症 RNA测序、单细胞测序分析、无监督聚类分析、Cox回归分析 LASSO回归、Cox回归模型 RNA测序数据、临床数据 来自TCGA和GEO数据库的胃肠道癌症患者样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
10087 2025-02-21
Schwann Cell-Secreted S100B Promotes Wound Healing via Paracrine Modulation
2025-Mar, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的关键作用及其通过S100B/RAGE/NF-κB/Notch旁分泌轴的机制 揭示了Schwann细胞通过分泌S100B蛋白在腭黏膜伤口愈合中的关键作用,并阐明了其通过RAGE受体激活NF-κB和Notch信号通路的机制 研究主要基于非人灵长类动物模型,尚未在人类中进行验证 探究Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的作用及其分子机制 腭黏膜、颊附着龈和皮肤的伤口愈合 生物医学 伤口愈合 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质组学分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据 非人灵长类动物、大鼠和猴子的皮肤样本 NA NA NA NA
10088 2025-02-21
ERK plays a conserved dominant role in pancreas cancer cell EMT heterogeneity driven by diverse growth factors and chemotherapies
2025-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过结合迭代间接免疫荧光成像和互信息建模,研究了胰腺癌细胞中EMT异质性的信号蛋白水平 使用互信息建模预测了ERK在胰腺癌细胞EMT异质性中的主导作用,并发现JNK在MEK抑制时的补偿作用 单细胞转录组学仅限于基于本体的间接推断,细胞群体水平的研究存在固有困难 研究胰腺癌细胞中EMT异质性的信号通路,以促进化疗反应 胰腺癌细胞和肿瘤 生物信息学 胰腺癌 迭代间接免疫荧光成像,互信息建模 互信息模型 蛋白质测量数据 NA NA NA NA NA
10089 2025-02-21
NEAT1-mediated regulation of proteostasis and mRNA localization impacts autophagy dysregulation in Rett syndrome
2025-Feb-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文研究了长链非编码RNA NEAT1在MeCP2缺陷背景下对Rett综合征(RTT)中蛋白质稳态和mRNA定位的调控作用及其对自噬失调的影响 揭示了NEAT1在MeCP2功能中的关键作用,特别是通过RNA-RNA相互作用调控自噬基因的表达和亚细胞定位,从而影响自噬复合物的生物发生 研究主要基于人类神经细胞和RTT患者样本,可能无法完全反映体内复杂环境 探讨NEAT1在MeCP2缺陷导致的Rett综合征中的作用机制 人类神经细胞和RTT患者样本 神经科学 Rett综合征 单细胞RNA测序和分子分析 NA RNA测序数据 人类神经细胞和RTT患者样本 NA NA NA NA
10090 2025-02-21
Hypoxia-induced histone methylation and NF-κB activation in pancreas cancer fibroblasts promote EMT-supportive growth factor secretion
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中缺氧诱导的组蛋白甲基化和NF-κB激活如何促进癌症相关成纤维细胞(CAFs)分泌支持上皮-间质转化(EMT)的生长因子 揭示了缺氧条件下CAFs通过IGF-2和HGF促进PDAC癌细胞EMT的机制,并发现活性氧激活的NF-κB与缺氧依赖性组蛋白甲基化共同作用促进这些生长因子的表达 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证 探讨缺氧条件下CAFs如何通过生长因子介导的细胞间通讯促进PDAC癌细胞的EMT 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和癌细胞 癌症生物学 胰腺癌 单细胞转录组分析、抑制剂筛选 NA 转录组数据、小鼠模型数据 患者肿瘤样本和小鼠模型 NA NA NA NA
10091 2025-02-21
Identification of High-Risk Cells in Single-Cell Spatially Resolved Transcriptomics Data Using Deep Transfer Learning
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为DEGAS的深度迁移学习算法,用于在单细胞空间分辨转录组数据中识别高风险细胞和区域 DEGAS算法通过基因表达数据的潜在表示和领域适应,将疾病属性从患者转移到单个细胞,解决了现有方法无法将单个细胞与疾病属性关联的问题 NA 识别单细胞空间分辨转录组数据中的高风险细胞和区域,以深入了解特定疾病过程 肿瘤样本中的单细胞RNA测序数据 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 深度迁移学习 单细胞空间分辨转录组数据 包括10X Genomics Xenium和Nanostring CosMx平台的数据,以及新生成的T2D Xenium数据集和公开的黑色素瘤Xenium数据集 NA NA NA NA
10092 2025-10-07
The pancreatic tumor microenvironment of treatment-naïve patients causes a functional shift in γδ T cells, impairing their anti-tumoral defense
2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境对γδ T细胞功能的抑制作用 首次使用治疗初治患者的类器官条件培养基证明PDAC肿瘤微环境导致γδ T细胞功能转变 样本量有限,主要依赖体外实验验证 研究胰腺癌肿瘤微环境如何影响γδ T细胞的抗肿瘤功能 治疗初治胰腺导管腺癌患者的γδ T细胞 肿瘤免疫学 胰腺癌 流式细胞术,单细胞RNA测序,类器官培养 NA 流式细胞数据,单细胞转录组数据 治疗初治PDAC患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10093 2025-10-07
Key RNA-binding proteins in renal fibrosis: a comprehensive bioinformatics and machine learning framework for diagnostic and therapeutic insights
2025-Dec, Renal failure IF:3.0Q1
研究论文 通过综合生物信息学和机器学习方法识别与肾纤维化相关的关键RNA结合蛋白,并建立诊断模型 首次整合生物信息学、机器学习方法和单细胞RNA测序技术系统鉴定肾纤维化中的关键RNA结合蛋白 研究主要基于公共数据库和动物模型,需要进一步临床验证 识别肾纤维化中的关键RNA结合蛋白,开发诊断模型并探索治疗靶点 肾纤维化患者样本和正常肾脏样本 机器学习 肾脏疾病 单细胞RNA测序,生物信息学分析,机器学习建模 lasso回归,logistic回归 基因表达数据 175个肾纤维化样本和99个正常肾脏样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10094 2025-10-07
Unveiling ferroptosis genes and inhibitors in diabetic retinopathy through single-cell analysis and docking simulations
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 通过单细胞分析和分子对接模拟揭示糖尿病视网膜病变中的铁死亡相关基因和抑制剂 首次通过单细胞RNA测序结合分子对接模拟系统鉴定糖尿病视网膜病变中的铁死亡相关基因,并发现地塞米松作为潜在治疗药物 研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证 探索铁死亡在糖尿病视网膜病变中的作用机制并寻找潜在治疗靶点 糖尿病视网膜病变患者样本 生物信息学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10095 2025-10-07
Single-cell transcriptomics reveals the multidimensional dynamic heterogeneity from primary to metastatic gastric cancer
2025-Feb-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了胃癌从原发到转移过程中的多维动态异质性 首次系统描绘了胃癌从原发灶到器官特异性转移灶的多维特征动态变化,鉴定了卵巢转移的30基因标志物和关键配体-受体相互作用 未明确说明样本规模和具体技术平台细节 探究胃癌从原发到转移过程中肿瘤微环境的动态异质性特征 胃癌原发肿瘤和器官特异性转移灶 单细胞转录组学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10096 2025-10-07
Integration of single-cell and spatial transcriptomics reveals fibroblast subtypes in hepatocellular carcinoma: spatial distribution, differentiation trajectories, and therapeutic potential
2025-Feb-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了肝细胞癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型的空间分布、分化轨迹及其治疗潜力 首次系统鉴定肝细胞癌中三种成纤维细胞亚群的空间分布特征,发现VEGFA+CAF在缺氧微环境诱导下通过促进肿瘤血管生成影响预后 研究样本量相对有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要基于转录组数据,缺乏功能性实验验证 解析肝细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及其临床意义 肝细胞癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 机器学习模型 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 训练队列88例HCC样本,验证队列94例HCC样本,总计超过120万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
10097 2025-02-20
Publisher Correction: Accurate RNA velocity estimation based on multibatch network reveals complex lineage in batch scRNA-seq data
2025-Feb-18, BMC biology IF:4.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10098 2025-10-07
Integrated analysis reveals that EGR1 promotes epithelial IL33 production in T2 asthma
2025-Feb-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了转录因子EGR1在T2型哮喘中直接调控上皮细胞IL33产生的机制 首次发现EGR1作为上皮细胞源基因直接调控IL33表达,为T2型哮喘的分子机制提供了新见解 研究主要基于细胞系和小鼠模型,需要在人类临床样本中进一步验证 探究过敏原暴露触发气道上皮细胞释放IL33的分子机制 BEAS-2B细胞系和HDM诱导的小鼠哮喘模型 生物信息学 哮喘 RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-PCR, 双荧光素酶报告基因检测 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
10099 2025-10-07
Age-Associated B Cells in Autoimmune Diseases: Pathogenesis and Clinical Implications
2025-Feb-17, Clinical reviews in allergy & immunology IF:8.4Q1
综述 本文综述了年龄相关B细胞在自身免疫性疾病中的致病机制和临床意义 系统总结了ABCs的异质性特征、分化调控机制及其在多种自身免疫病中的诊断和治疗潜力 需要进一步探索和验证针对ABCs的靶向治疗策略 探讨年龄相关B细胞在自身免疫性疾病中的致病作用和临床应用价值 年龄相关B细胞及其在自身免疫疾病中的作用机制 免疫学 自身免疫性疾病 单细胞测序技术 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10100 2025-10-07
Molecular subtyping combined with multiomics analysis to study correlation between TACE refractoriness and tumor stemness in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-17, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过分子分型与多组学分析探讨肝细胞癌中TACE抵抗性与肿瘤干性之间的相关性 首次系统性地将TACE抵抗性与肿瘤干性联系起来,并建立了基于肿瘤干性基因的新型分子分型系统 研究基于回顾性数据集分析,需要进一步实验验证 探索肝细胞癌中TACE抵抗性与肿瘤干性之间的相关性及其临床意义 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 RNA测序,微阵列,单细胞RNA测序 无监督聚类 基因表达数据,临床数据 多个HCC数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 NA NA
回到顶部