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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10041 | 2025-10-07 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639556
PMID:40060457
|
研究论文 | 开发了一种人源化小鼠模型系统,模拟产前寨卡病毒感染并揭示神经干细胞过早分化的机制 | 建立了首个能够模拟人类产前寨卡病毒感染表型谱的人源化免疫健全小鼠模型系统 | 小鼠模型与人类生理存在差异,需要进一步验证临床转化价值 | 建立可靠的产前寨卡病毒感染实验模型并研究其致病机制 | 人源化小鼠模型和寨卡病毒感染后的脑组织 | 传染病模型 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10042 | 2025-10-07 |
MIG-21 is a novel regulator of Wnt and Netrin signaling in gonad migration identified from published scRNA-seq data and functionally validated in C. elegans
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639896
PMID:40060509
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序数据,发现了一个新的生殖系干细胞生态位调节因子MIG-21,并验证其在引导远端尖端细胞迁移中的功能 | 首次发现MIG-21基因整合Wnt和Netrin信号通路信息来指导细胞迁移,揭示了传统筛选方法因基因冗余而被掩盖的遗传网络 | 研究仅在线虫模型中进行验证,未在其他生物体系中确认该机制的普适性 | 探索生殖系干细胞生态位调节的新机制 | 秀丽隐杆线虫的远端尖端细胞(DTC) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 经典遗传学技术, RNAi敲低, 活细胞成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | 成年雌雄同体线虫的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10043 | 2025-10-07 |
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639868
PMID:40060644
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研究论文 | 本研究通过单核转录组数据分析发现PLXNB1等信号驱动病理性星形胶质细胞状态Ast10,该状态与阿尔茨海默病认知衰退相关 | 首次通过大规模单核转录组数据meta分析鉴定出关键的病理性星形胶质细胞亚群Ast10,并验证其在认知衰退中的独立作用 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步功能实验验证具体分子机制 | 探究阿尔茨海默病中病理性星形胶质细胞状态的驱动机制及其在认知衰退中的作用 | 人脑组织样本、小鼠模型、人iPSC来源的星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 基因敲除 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 869个大脑样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10044 | 2025-10-07 |
Molecular differences between young and mature stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111832
PMID:40028281
|
研究论文 | 本研究通过建立幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹组织外植体模型并进行单细胞RNA测序,揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 开发了首个幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹全组织外植体模型,并结合单细胞RNA测序技术系统分析发育过程中的分子变化 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类转化的有效性需要进一步验证 | 研究耳蜗血管纹在发育过程中的分子差异,为治疗血管纹退化相关听力损失提供新见解 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序, 组织外植体培养 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10045 | 2025-10-07 |
A Nerve-Fibroblast Axis in Mammalian Lung Fibrosis
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611003
PMID:39314391
|
研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物肺纤维化中交感神经与表达α1-肾上腺素能受体的肌成纤维细胞之间形成的新型促纤维化轴 | 首次发现并表征了跨物种保守的神经-成纤维细胞轴,揭示了神经对组织重塑的关键贡献 | 纤维化机制尚未完全阐明,需要进一步研究验证 | 探究肺纤维化中肌成纤维细胞积累的机制 | 小鼠和人类纤维化肺组织、肺成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液 | 病理生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 光学透明化, 全肺成像, 基因删除, 共培养, 精准肺切片 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 测序数据 | 多种肺纤维化患者的肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10046 | 2025-10-07 |
Shiba: a versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf098
PMID:39997221
|
研究论文 | 开发了Shiba计算方法用于系统识别不同平台间的差异RNA剪接 | 能够捕获注释和未注释的剪接事件,解决连接读段不平衡问题,统计框架对样本量不敏感,并扩展了单细胞RNA-seq分析功能 | NA | 开发一个跨平台的差异RNA剪接分析方法 | RNA剪接事件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10047 | 2025-10-07 |
Subepicardial adipose genes contribute to the deterioration of heart failure preserved ejection fraction
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1501397
PMID:40060963
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了心外膜下脂肪基因通过影响细胞衰老促进射血分数保留型心力衰竭发展的机制 | 首次系统筛选并验证了心外膜下脂肪组织中OGN、FOS和ALOX5等枢纽基因在HFpEF发病中的作用机制 | 研究样本量有限,机制研究主要基于体外实验,需要更多临床验证 | 探索内脏脂肪细胞基因在射血分数保留型心力衰竭发展中的作用机制 | 心力衰竭患者的心外膜下组织、血液样本、细胞系和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 生物信息学分析, 蛋白互作网络分析, 细胞实验 | PPI网络, ROC分析 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床样本数据 | GSE251971数据集、人类组织样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10048 | 2025-10-07 |
scLTNN: an innovative tool for automatically visualizing single-cell trajectories
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf033
PMID:40061870
|
研究论文 | 开发了一种名为scLTNN的创新工具,用于自动可视化单细胞轨迹 | 结合人工神经网络和分布模型,基于高变异基因的一致表达分布发现,创建了能够自动推断细胞起源和终末状态的新工具 | NA | 开发计算效率高的单细胞轨迹推断工具 | 人类骨髓细胞、小鼠胰腺内分泌谱系、斑马鱼胚胎轴中胚层谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10049 | 2025-10-07 |
Application of Spatial Omics in the Cardiovascular System
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0628
PMID:40062231
|
综述 | 探讨空间组学技术在心血管系统研究中的应用及其前景 | 系统整合多种空间组学技术(转录组、蛋白质组、代谢组、基因组、表观基因组)在心血管研究中的创新应用 | NA | 推动心血管疾病精准医疗、靶向治疗和个性化治疗的发展 | 心血管系统 | 空间组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学 | NA | NA |
| 10050 | 2025-10-07 |
CD177+ neutrophils exacerbate septic lung injury via the NETs/AIM2 pathway: An experimental and bioinformatics study
2025-Apr-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114292
PMID:40007380
|
研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学分析揭示了CD177+中性粒细胞通过NETs/AIM2通路加剧脓毒症肺损伤的机制 | 首次发现CD177+中性粒细胞是脓毒症肺组织中的主要中性粒细胞亚群,并阐明其通过NETs激活AIM2炎症小体加重肺损伤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;样本量相对有限 | 阐明脓毒症诱导急性肺损伤的免疫细胞异质性及其关键作用机制 | CLP模型小鼠的肺组织免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞测序,分子生物学实验 | NA | 单细胞测序数据,基因表达数据 | CLP模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10051 | 2025-10-07 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
|
综述 | 本文回顾了TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的研究历程与临床转化潜力 | 首次系统梳理TREM2从基础研究到治疗干预的转化路径,提出其作为动脉粥样硬化新型治疗靶点的可行性 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的理论基础与临床应用前景 | 动脉粥样硬化斑块中的泡沫样巨噬细胞及TREM2阳性髓系细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10052 | 2025-10-07 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
|
研究论文 | 本研究通过计算分析方法探讨了染色体外DNA在膀胱尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示了ecDNA在膀胱癌中的时空多样性特征,阐明了ecDNA通过结构重排驱动克隆进化的机制,并发现ecDNA+恶性细胞通过下调MHC I类分子表达逃避免疫监视 | 研究主要基于计算分析,需要进一步实验验证ecDNA的功能机制;样本来源相对单一 | 探究ecDNA在膀胱尿路上皮癌进化过程中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 595例膀胱尿路上皮癌患者 | 计算生物学 | 膀胱癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 计算分析方法 | 基因组测序数据,单细胞转录组数据 | 595例患者,包含多区域采样 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10053 | 2025-03-11 |
Corrigendum to "ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost" [Microbiol. Res. 289 (2024) 127912]
2025-Mar-08, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128137
PMID:40058996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10054 | 2025-10-07 |
Sustained NF-κB activation allows mutant alveolar stem cells to co-opt a regeneration program for tumor initiation
2025-Mar-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.01.011
PMID:39978341
|
研究论文 | 本研究通过命运图谱和单细胞转录组学揭示了肺再生与肿瘤发生之间的相似性,发现持续NF-κB激活使突变肺泡干细胞劫持再生程序启动肿瘤 | 发现两个独立的AT2干细胞亚群具有不同的致瘤能力,揭示Il1r1作为AT2重编程的共同激活因子,阐明NF-κB持续激活是肿瘤发生与再生区别的关键机制 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究干细胞命运调控信号破坏如何导致肿瘤发生 | 小鼠野生型和KrasG12D突变型肺泡II型干细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 命运图谱、克隆分析、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、谱系追踪数据 | 数千个小鼠AT2干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10055 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1
2025-Mar-06, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815
PMID:40057081
|
研究论文 | 利用肺芯片模型和单细胞RNA测序技术研究甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响,重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 首次结合肺芯片模型和单细胞RNA测序技术揭示IAV和SP共感染诱导的独特转录组变化,特别是ZO-1表达下调和定位异常的分子机制 | 研究基于体外肺芯片模型,可能与体内真实肺部环境存在差异 | 探索甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响机制 | 人肺芯片模型、肺上皮细胞、外周血单核细胞分化的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序、GO富集分析、多重微珠免疫分析、免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据、图像数据、细胞因子数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10056 | 2025-10-07 |
Endoplasmic reticulum stress and unfolded protein response play roles in recurrent pregnancy loss: A bioinformatics study
2025-Mar, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104446
PMID:39923360
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研究论文 | 通过生物信息学方法探讨内质网应激和未折叠蛋白反应在复发性流产中的作用机制 | 首次整合多组学数据系统分析ERS/UPR在RPL中的作用,发现单核/巨噬细胞中相关基因表达上调 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 探索ERS和UPR过程作为复发性流产预防、诊断和治疗潜在靶点的可能性 | 复发性流产患者基因表达数据 | 生物信息学 | 复发性流产 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE165004和GSE26787数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10057 | 2025-10-07 |
Endothelial senescence induced by PAI-1 promotes endometrial fibrosis
2025-Mar-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02377-0
PMID:40050610
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)诱导的内皮细胞衰老促进子宫内膜纤维化的机制 | 首次揭示PAI-1通过uPAR受体诱导内皮细胞衰老在宫腔粘连发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究宫腔粘连中子宫内膜纤维化的分子机制 | 宫腔粘连患者和小鼠模型中的内皮细胞与基质细胞 | 单细胞生物学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10058 | 2025-10-07 |
Targeting Caveolin-1 for enhanced rotator cuff repair: findings from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-05, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02359-2
PMID:40044676
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肩袖损伤组织中细胞亚群的异质性,并评估Caveolin-1对脂肪细胞浸润的调控作用 | 首次在单细胞水平揭示Cav-1表达与成脂活性的负相关性,并验证其作为治疗靶点的潜力 | NA | 探索Caveolin-1在肩袖损伤修复中的作用机制 | 肩袖损伤组织中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10059 | 2025-10-07 |
PCBP2 promotes immune evasion via cGAS-STING pathway in biochemical recurrence of prostate cancer
2025-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250173
PMID:40051782
|
研究论文 | 本研究探索前列腺癌中癌症内在免疫逃逸相关基因,并开发了预测生化复发的风险特征 | 首次发现PCBP2通过抑制cGAS-STING通路促进前列腺癌免疫逃逸,并建立了基于CIERGs的生化复发预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索前列腺癌免疫逃逸机制并开发生化复发预测模型 | 前列腺癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | TCGA-PRAD和GSE70769队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10060 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing defines distinct disease subtypes and reveals hypo-responsiveness to interferon in asymptomatic Waldenstrom's Macroglobulinemia
2025-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56323-w
PMID:39929803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无症状华氏巨球蛋白血症的疾病亚型和干扰素低反应性特征 | 首次在单细胞水平定义了华氏巨球蛋白血症的分子亚型,并发现干扰素低反应性这一治疗脆弱点 | 样本量相对有限(79例患者),需要进一步验证研究 | 解析华氏巨球蛋白血症进展的肿瘤内在和免疫机制 | 华氏巨球蛋白血症患者、冒烟型骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓肿瘤和免疫细胞 | 单细胞组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 294,206个骨髓细胞,来自30例AWM/WM患者、26例冒烟型骨髓瘤患者和23例健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |