单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 10001 - 10020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10001 | 2025-10-07 |
Decoding Müllerian Duct Epithelial Regionalization
2025-Feb, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.70018
PMID:39994938
|
综述 | 本文系统综述了苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制及其在女性生殖道器官形成中的作用 | 整合了遗传小鼠模型、单细胞测序和类器官培养等多方面研究进展，全面解析苗勒氏管区域分化的关键调控因子 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有研究进行总结和分析 | 阐明苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制 | 苗勒氏管及其衍生的女性生殖道器官（输卵管、子宫、宫颈和上阴道） | 发育生物学 | 苗勒氏管异常和女性生殖道疾病 | 单细胞测序, 类器官培养, 遗传小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10002 | 2025-10-07 |
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635498
PMID:39975411
|
研究论文 | 开发了一种名为crumblr的可扩展统计方法，用于分析细胞组成差异 | 采用精度加权线性混合模型处理计数比率数据，并在细胞谱系层次结构的多个水平上进行统计检验 | NA | 识别细胞类型频率变化的统计分析方法 | 单细胞RNA测序数据集（衰老、结核感染、前列腺癌骨转移、SARS-CoV-2感染） | 生物信息学 | 结核病, 前列腺癌, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10003 | 2025-10-07 |
Optimizing duodenal tissue acquisition for mechanistic studies of duodenal ablation in type 2 diabetes
2025, Endoscopy international open
IF:2.2Q2
DOI:10.1055/a-2503-2135
PMID:40007651
|
研究论文 | 本文开发了一种优化的十二指肠组织采集方案，用于研究十二指肠消融对2型糖尿病和代谢综合征的影响 | 设计了使用十二指肠冷圈套切除术创建组织微阵列和进行单细胞RNA测序的优化组织采集方案 | 样本量相对较小（DIRECT研究9名患者），需要进一步验证 | 优化十二指肠组织采集方法，以支持十二指肠消融在2型糖尿病和代谢综合征中的机制研究 | 接受上消化道介入内镜检查的患者 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，组织微阵列技术 | NA | 组织样本，基因表达数据 | DIRECT研究：9名患者，16个冷圈套切除术；EMINENT-2研究：38个冷圈套样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10004 | 2025-10-07 |
Integrated Bioinformatic Analyses Reveal Thioredoxin as a Putative Marker of Cancer Stem Cells and Prognosis in Prostate Cancer
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251319872
PMID:40008390
|
研究论文 | 通过生物信息学分析发现硫氧还蛋白可作为前列腺癌干细胞标记物和预后预测因子 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别硫氧还蛋白作为前列腺癌干细胞的潜在标记物，并揭示其与预后的关联 | 样本量有限，需要进一步的体外和体内实验验证TXN对前列腺癌干细胞的功能调控作用 | 识别调控前列腺癌干细胞特性并预测预后的新因子 | 前列腺癌组织和前列腺癌干细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,轨迹分析 | Seurat,monocle 3 | 单细胞RNA测序数据 | 2个前列腺癌组织的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10005 | 2025-10-07 |
Gestational diabetes induces autistic-like behaviors in offspring by disrupting the GABAergic system
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1538115
PMID:40012680
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨妊娠期糖尿病如何通过破坏GABA能系统诱导子代出现自闭症样行为 | 首次结合单细胞转录组学和代谢组学揭示GDM通过GAD2启动子区DNA高甲基化减少GABA能神经元和GABA水平的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，结果需要进一步在人类研究中验证 | 阐明妊娠期糖尿病导致子代自闭症风险的神经生物学机制 | 妊娠期糖尿病小鼠模型的雄性子代 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学, 代谢组学, c-Fos染色, DNA甲基化分析 | 小鼠疾病模型 | 行为学数据, 基因表达数据, 代谢物数据, 免疫组织化学数据 | 妊娠期糖尿病小鼠模型的子代 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 10006 | 2025-10-07 |
Seurat function argument values in scRNA-seq data analysis: potential pitfalls and refinements for biological interpretation
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1519468
PMID:40013100
|
研究论文 | 探讨单细胞RNA测序数据分析中Seurat函数参数设置的潜在问题及生物学解释优化方法 | 采用生物学与生物信息学相结合的集成方法，揭示数据处理过程中的生物学见解 | 未讨论这些数学方法在生物学中应用的理论依据 | 优化单细胞RNA测序数据分析中参数设置的生物学解释 | 单细胞RNA测序数据处理方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10007 | 2025-10-07 |
Ephrin-B2 acts as a positive regulator of osteogenesis-angiogenesis coupling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140555
PMID:39894124
|
研究论文 | 本研究探讨了Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的正向调控作用及其机制 | 首次通过单细胞测序发现牙周炎中成骨细胞谱系Ephrin-B2信号缺陷，并构建过表达Ephrin-B2的成骨细胞与内皮细胞共移植系统证实其促进血管化骨再生的作用 | 研究主要基于体外共培养和动物实验，尚未进行临床验证 | 探索Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的作用机制，为牙周组织工程提供指导 | 牙周组织、成骨细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自公共数据库GEO: GSE171213的牙周组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10008 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional footprint for pseudogene SsCLEC9A is associated with antigen processing and presentation in Sus scrofa
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140629
PMID:39904428
|
研究论文 | 本研究首次发现猪的CLEC9A基因因远古突变成为假基因，但其突变转录本仍影响树突状细胞的抗原呈递功能 | 首次揭示猪CLEC9A基因成为假基因的进化事件，并发现其突变转录本仍具有生物学功能 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究假基因SsCLEC9A的转录适应及其在抗原呈递中的作用 | 猪树突状细胞和骨髓造血细胞 | 免疫学 | NA | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10009 | 2025-10-07 |
Pan-cancer characterization of m6A-mediated regulation of T cell exhaustion dynamics and clinical relevancies in human cancers
2025-Mar-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102465
PMID:39995977
|
研究论文 | 通过整合多组学数据对m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的泛癌作用进行系统性分析 | 首次在泛癌层面揭示m6A修饰与T细胞耗竭动态的相互作用，并基于此识别出三个具有不同临床预后的分子亚型 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证m6A调控T细胞耗竭的具体机制 | 探索m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的作用及其临床相关性 | 人类多种癌症类型中的T细胞耗竭动态 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析 | 多变量分析 | 多组学数据,单细胞RNA测序数据,免疫治疗数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10010 | 2025-10-07 |
Liver transcriptome analysis reveals PSC-attributed gene set associated with fibrosis progression
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101267
PMID:39996122
|
研究论文 | 通过肝脏转录组分析识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 首次系统识别PSC特异性胆道纤维化基因特征，并通过单细胞RNA测序数据揭示不同细胞类型在纤维化中的特异性作用 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证研究 | 识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 原发性硬化性胆管炎、原发性胆汁性胆管炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者的肝脏活检样本 | 转录组学 | 肝脏疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，差异基因表达分析 | NA | 转录组数据 | 47例肝脏活检（PSC 16例，PBC 15例，MASLD 16例），外部验证集73例PSC样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10011 | 2025-10-07 |
Targeting Zfp36 to combat cardiac hypertrophy: Insights into ferroptosis pathways
2025-Mar, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70247
PMID:40000392
|
研究论文 | 本研究揭示了Zfp36通过调控铁死亡通路抑制心脏肥大的新机制 | 首次证明Zfp36通过Ythdc2/SLC7A11/GSH通路调控铁死亡从而抑制心脏肥大 | Zfp36在心脏肥大中的具体作用机制仍需进一步探索 | 研究Zfp36在心脏肥大中铁死亡的调控功能 | 心肌细胞和心肌组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10012 | 2025-10-07 |
Molecular profiling of skin cells identifies distinct cellular signatures in radiation-induced skin injury across various stages in the murine dataset
2025-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00596-w
PMID:40001256
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析辐射诱导皮肤损伤中不同细胞亚群的分子特征和相互作用机制 | 首次在辐射诱导皮肤损伤中系统鉴定32个细胞亚群，揭示循环角质形成细胞通过BMP-Wnt-SMAD通路驱动伤口愈合和纤维化过程 | 研究基于小鼠模型，结果需要进一步在人类样本中验证 | 阐明辐射诱导皮肤损伤的分子机制和细胞相互作用 | C57BL/6小鼠皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 辐射性皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, 多重免疫荧光染色 | Seurat, Cellchat, SCP, ssGSEA | 单细胞转录组数据 | 71,412个细胞，来自辐射后7天和30天及未辐射小鼠皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10013 | 2025-10-07 |
Targeted delivery of CCL3 reprograms macrophage antigen presentation and enhances the efficacy of immune checkpoint blockade therapy in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010947
PMID:39988347
|
研究论文 | 本研究探讨CCL3通过重编程巨噬细胞抗原呈递功能增强肝细胞癌免疫检查点阻断疗法疗效的机制 | 首次揭示CCL3通过CCR5通路增强巨噬细胞代谢和抗原摄取能力，重塑肿瘤免疫微环境并提高免疫治疗敏感性 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 研究CCL3在调节肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的增强效果 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光,共培养系统,共聚焦成像,代谢物检测 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据,影像数据 | 癌症基因组图谱数据库中的人肝细胞癌样本及临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10014 | 2025-10-07 |
SREBF1-based metabolic reprogramming in prostate cancer promotes tumor ferroptosis resistance
2025-Feb-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02354-7
PMID:39988626
|
研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中SREBF1介导的代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及其治疗潜力 | 首次通过单细胞测序揭示SREBF1在前列腺癌中的高转录活性，并证明其通过代谢重编程促进铁死亡抵抗的新机制 | NA | 探究前列腺癌代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及治疗策略 | 正常前列腺组织和不同类型前列腺癌组织 | 生物医学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 转录因子调控网络分析, hdWGCNA, bulk RNA分析 | NA | 单细胞测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10015 | 2025-10-07 |
Advances and Challenges in Modeling Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease: A Focus on Kidney Organoids
2025-Feb-19, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020523
PMID:40002937
|
综述 | 本文总结了常染色体显性多囊肾病器官模型构建的最新进展与挑战 | 重点关注iPSC衍生模型在模拟肾脏发育和病理表型方面的创新应用 | 当前技术存在血管化不足和成熟度有限等挑战 | 探索ADPKD疾病机制和促进药物发现 | 常染色体显性多囊肾病(ADPKD)器官模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学,微流体生物反应器培养系统 | 器官模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10016 | 2025-10-07 |
The Endothelial Cell-Related Genes EIF1 and HSPA1B Contribute to the Pathogenesis of Alzheimer's Disease by Modulating Peripheral Immunoinflammatory Responses
2025-Feb-16, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15020205
PMID:40002537
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B通过调节外周免疫炎症反应参与阿尔茨海默病发病机制 | 首次鉴定出内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B作为AD关键基因，并揭示其通过调节外周免疫炎症反应参与AD发病的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认分子机制 | 探索内皮细胞通过调节外周免疫炎症反应参与阿尔茨海默病发病的分子机制 | 阿尔茨海默病患者的内皮细胞和免疫炎症反应 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 随机森林算法, GSEA, GSVA, ssGSEA | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据 | 数据集GSE157827和队列外周血RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10017 | 2025-10-07 |
EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma Cell-Derived Exosomal miR-651-5p Induces CD8+ T Cell Apoptosis via Downregulating BCL2 Expression
2025-Feb-15, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020482
PMID:40002895
|
研究论文 | 本研究揭示了EGFR突变肺腺癌细胞通过外泌体miR-651-5p诱导CD8+ T细胞凋亡的机制 | 首次发现EGFR突变肺腺癌细胞通过外泌体传递miR-651-5p下调BCL2表达促进CD8+ T细胞凋亡，并提出miR-651-5p拮抗剂可增强PD-1抑制剂疗效 | NA | 探究EGFR突变非小细胞肺癌患者对PD-1/PD-L1抑制剂疗效不佳的机制 | EGFR突变肺腺癌细胞、CD8+ T细胞、人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 小RNA测序, 单细胞测序, 流式细胞术, 细胞共培养 | NA | 测序数据, 流式细胞数据, 临床标本数据 | NA | NA | small RNA sequencing, single-cell sequencing | NA | NA |
| 10018 | 2025-10-07 |
Assessing the Causal Relationship Between Plasma Proteins and Pulmonary Fibrosis: A Systematic Analysis Based on Mendelian Randomization
2025-Feb-14, Biology
DOI:10.3390/biology14020200
PMID:40001968
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化方法系统评估血浆蛋白与肺纤维化之间的因果关系并识别潜在药物靶点 | 首次系统应用MR方法结合多种生物信息学分析识别肺纤维化的因果蛋白靶点 | 基于欧洲人群的GWAS数据，可能限制结果在其他人群的普适性 | 识别肺纤维化的因果血浆蛋白靶点并评估其治疗潜力 | 血浆蛋白与肺纤维化患者 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 孟德尔随机化, 富集分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 药物预测, 分子对接, 单细胞测序 | MR分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据 | 血浆蛋白数据35,559例, PF相关数据469,126例 | NA | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10019 | 2025-10-07 |
The Involvement of RIPK1 in Alopecia Areata
2025-Feb-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041565
PMID:40004031
|
研究论文 | 本研究探讨了RIPK1在斑秃发病机制中的作用及其抑制剂对疾病发展的影响 | 首次发现RIPK1在斑秃中表达上调，并通过调节树突状细胞和CD8 T细胞参与疾病发病 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类临床中得到验证 | 研究RIPK1在斑秃发病机制中的作用 | 斑秃小鼠模型和毛囊器官培养 | 皮肤病学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 斑秃小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10020 | 2025-10-07 |
Towards the Prediction of Responses to Cancer Immunotherapy: A Multi-Omics Review
2025-Feb-12, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15020283
PMID:40003691
|
综述 | 本文综述了利用多组学特征预测癌症免疫治疗反应的最新进展 | 系统总结了多组学特征在免疫治疗预测中的应用，包括新测量方法、研究队列和数据整合策略 | 需要更大更多样的临床数据集，多组学数据标准化不足，模型可解释性有限 | 预测癌症患者对免疫治疗的反应 | 癌症患者和肿瘤样本 | 机器学习 | 癌症 | 多组学分析，包括基因组学、转录组学、表观基因组学 | 传统机器学习和深度学习框架 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |