单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10548 篇文献，本页显示第 9981 - 10000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9981 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of lipid metabolic signatures identified CEBPD promotes breast cancer cell proliferation
2025-Feb-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90869-5
PMID:39994306
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组数据分析脂质代谢特征，发现CEBPD基因抑制乳腺癌细胞增殖 | 首次整合单细胞和批量转录组数据构建基于脂质代谢特征的预后风险模型，并鉴定CEBPD为新的抑癌基因 | 研究样本量有限，功能验证实验需进一步扩展 | 探索脂质代谢特征在乳腺癌预后评估和治疗靶点开发中的应用价值 | 乳腺癌患者样本和乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 功能验证实验 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 原发性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9982 | 2025-10-07 |
POU2F2+ B cells enhance antitumor immunity and predict better survival in non small cell lung cancer
2025-Feb-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90817-3
PMID:39994401
|
研究论文 | 本研究揭示了POU2F2+ B细胞在非小细胞肺癌中的重要作用及其与患者生存和免疫细胞浸润的关系 | 首次系统阐明POU2F2+ B细胞在NSCLC免疫微环境中的空间分布特征及其对免疫细胞浸润的调控作用，提出POU2F2作为NSCLC免疫治疗新靶点 | 研究样本量有限，未进行功能性验证实验，LUAD和LUSC亚型间的机制差异需要进一步探究 | 阐明POU2F2+ B细胞在非小细胞肺癌患者生存和免疫细胞浸润中的作用机制 | 非小细胞肺癌患者组织样本和相关的单细胞及批量RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组织化学, 伪时间分析, CIBERSORT分析 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 生存数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和两个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9983 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA transcriptome uncovers distinct developmental trajectories in the embryonic skeletal muscle of Daheng broiler and Tibetan chicken
2025-Feb-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11363-w
PMID:39994525
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了大恒肉鸡和藏鸡胚胎骨骼肌发育的分子机制差异 | 首次构建了鸡胚胎骨骼肌单细胞图谱，揭示不同品种间肌母细胞和纤维脂肪祖细胞发育轨迹及基因表达动态差异 | 研究仅针对胚胎期三个时间点，未涵盖出生后发育阶段 | 探究不同鸡品种骨骼肌表型差异的分子机制 | 大恒肉鸡和藏鸡的胚胎腿部肌肉组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 29,579个高质量细胞，来自两个鸡品种三个胚胎期(E10,E14,E18) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9984 | 2025-10-07 |
THBS1 in macrophage-derived exosomes exacerbates cerebral ischemia-reperfusion injury by inducing ferroptosis in endothelial cells
2025-Feb-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03382-x
PMID:39994679
|
研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞来源的外泌体通过THBS1-OTUD5-GPX4轴诱导内皮细胞铁死亡，加剧脑缺血再灌注损伤 | 首次发现THBS1作为外泌体关键分子通过结合OTUD5促进GPX4泛素化诱导内皮细胞铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化仍需进一步验证 | 探索巨噬细胞来源外泌体在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 内皮细胞、巨噬细胞、tMCAO小鼠模型、AIS患者外周血样本 | 分子生物学 | 脑血管疾病 | 蛋白质组测序、转录组测序、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、高通量筛选、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | tMCAO小鼠模型、THP-1和RAW264.7细胞系、AIS患者外周血样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9985 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analysis of TCR and BCR Repertoires: Insights into Methodologies, Challenges, and Applications
2025-Feb-24, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-024-00034-z
PMID:39994831
|
综述 | 本文系统综述了T细胞受体和B细胞受体谱系分析的方法学、挑战及应用前景 | 整合免疫学、生物信息学和临床研究，系统比较了批量与单细胞测序在免疫受体分析中的技术差异 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证 | 探讨TCR和BCR受体谱系分析的技术方法及其在免疫功能和精准医疗中的应用 | T细胞受体和B细胞受体的序列多样性 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9986 | 2025-10-07 |
Discovery of Endothelial-Monocyte Crosstalk in Ischemic-Reperfusion Injury Following Liver Transplantation Based on Integration of Single-Cell RNA and Transcriptome RNA Sequencing
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70336
PMID:39993960
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据，揭示了肝移植后缺血再灌注损伤中肝窦内皮细胞与单核细胞之间的相互作用机制 | 首次发现ANXA1-FPR2轴在肝窦内皮细胞与单核细胞互作中的关键作用，揭示了缺血再灌注损伤中细胞通讯的新机制 | 研究样本来源于公共数据库，部分发现仅在小鼠模型中进行了初步验证，需要进一步临床验证 | 探究肝移植后缺血再灌注损伤的细胞相互作用机制和信号通路 | 肝移植患者的肝组织样本和缺血再灌注损伤小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组RNA测序, 免疫荧光, 流式细胞术, Western Blot | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组RNA测序数据, 实验验证数据 | 来自GEO数据库的肝移植患者样本和建立的小鼠缺血再灌注损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组RNA测序 | NA | NA |
| 9987 | 2025-10-07 |
Bulk and Single-Cell Transcriptomic Reveals Shared Key Genes and Patterns of Immune Dysregulation in Both Intestinal Inflammatory Disease and Sepsis
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70415
PMID:39993996
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示炎症性肠病和脓毒症在免疫失调方面的共同关键基因和分子机制 | 首次通过整合批量转录组和单细胞RNA测序技术，识别出IBD和脓毒症共有的58个差异表达基因，并发现IL1B巨噬细胞在两种疾病中的核心作用 | 研究样本量有限，动物模型验证需要进一步扩展，临床转化价值需更多验证 | 探索炎症性肠病和脓毒症之间共享的分子和病理生理机制 | 炎症性肠病和脓毒症患者数据及小鼠疾病模型 | 生物信息学 | 炎症性肠病,脓毒症 | 单细胞RNA测序,实时PCR,Western blot | 机器学习算法 | 转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9988 | 2025-10-07 |
Decoding Müllerian Duct Epithelial Regionalization
2025-Feb, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.70018
PMID:39994938
|
综述 | 本文系统综述了苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制及其在女性生殖道器官形成中的作用 | 整合了遗传小鼠模型、单细胞测序和类器官培养等多方面研究进展，全面解析苗勒氏管区域分化的关键调控因子 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有研究进行总结和分析 | 阐明苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制 | 苗勒氏管及其衍生的女性生殖道器官（输卵管、子宫、宫颈和上阴道） | 发育生物学 | 苗勒氏管异常和女性生殖道疾病 | 单细胞测序, 类器官培养, 遗传小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9989 | 2025-10-07 |
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635498
PMID:39975411
|
研究论文 | 开发了一种名为crumblr的可扩展统计方法，用于分析细胞组成差异 | 采用精度加权线性混合模型处理计数比率数据，并在细胞谱系层次结构的多个水平上进行统计检验 | NA | 识别细胞类型频率变化的统计分析方法 | 单细胞RNA测序数据集（衰老、结核感染、前列腺癌骨转移、SARS-CoV-2感染） | 生物信息学 | 结核病, 前列腺癌, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9990 | 2025-10-07 |
Optimizing duodenal tissue acquisition for mechanistic studies of duodenal ablation in type 2 diabetes
2025, Endoscopy international open
IF:2.2Q2
DOI:10.1055/a-2503-2135
PMID:40007651
|
研究论文 | 本文开发了一种优化的十二指肠组织采集方案，用于研究十二指肠消融对2型糖尿病和代谢综合征的影响 | 设计了使用十二指肠冷圈套切除术创建组织微阵列和进行单细胞RNA测序的优化组织采集方案 | 样本量相对较小（DIRECT研究9名患者），需要进一步验证 | 优化十二指肠组织采集方法，以支持十二指肠消融在2型糖尿病和代谢综合征中的机制研究 | 接受上消化道介入内镜检查的患者 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，组织微阵列技术 | NA | 组织样本，基因表达数据 | DIRECT研究：9名患者，16个冷圈套切除术；EMINENT-2研究：38个冷圈套样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9991 | 2025-10-07 |
Integrated Bioinformatic Analyses Reveal Thioredoxin as a Putative Marker of Cancer Stem Cells and Prognosis in Prostate Cancer
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251319872
PMID:40008390
|
研究论文 | 通过生物信息学分析发现硫氧还蛋白可作为前列腺癌干细胞标记物和预后预测因子 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别硫氧还蛋白作为前列腺癌干细胞的潜在标记物，并揭示其与预后的关联 | 样本量有限，需要进一步的体外和体内实验验证TXN对前列腺癌干细胞的功能调控作用 | 识别调控前列腺癌干细胞特性并预测预后的新因子 | 前列腺癌组织和前列腺癌干细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,轨迹分析 | Seurat,monocle 3 | 单细胞RNA测序数据 | 2个前列腺癌组织的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9992 | 2025-10-07 |
Gestational diabetes induces autistic-like behaviors in offspring by disrupting the GABAergic system
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1538115
PMID:40012680
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨妊娠期糖尿病如何通过破坏GABA能系统诱导子代出现自闭症样行为 | 首次结合单细胞转录组学和代谢组学揭示GDM通过GAD2启动子区DNA高甲基化减少GABA能神经元和GABA水平的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，结果需要进一步在人类研究中验证 | 阐明妊娠期糖尿病导致子代自闭症风险的神经生物学机制 | 妊娠期糖尿病小鼠模型的雄性子代 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学, 代谢组学, c-Fos染色, DNA甲基化分析 | 小鼠疾病模型 | 行为学数据, 基因表达数据, 代谢物数据, 免疫组织化学数据 | 妊娠期糖尿病小鼠模型的子代 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 9993 | 2025-10-07 |
Seurat function argument values in scRNA-seq data analysis: potential pitfalls and refinements for biological interpretation
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1519468
PMID:40013100
|
研究论文 | 探讨单细胞RNA测序数据分析中Seurat函数参数设置的潜在问题及生物学解释优化方法 | 采用生物学与生物信息学相结合的集成方法，揭示数据处理过程中的生物学见解 | 未讨论这些数学方法在生物学中应用的理论依据 | 优化单细胞RNA测序数据分析中参数设置的生物学解释 | 单细胞RNA测序数据处理方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9994 | 2025-10-07 |
Ephrin-B2 acts as a positive regulator of osteogenesis-angiogenesis coupling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140555
PMID:39894124
|
研究论文 | 本研究探讨了Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的正向调控作用及其机制 | 首次通过单细胞测序发现牙周炎中成骨细胞谱系Ephrin-B2信号缺陷，并构建过表达Ephrin-B2的成骨细胞与内皮细胞共移植系统证实其促进血管化骨再生的作用 | 研究主要基于体外共培养和动物实验，尚未进行临床验证 | 探索Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的作用机制，为牙周组织工程提供指导 | 牙周组织、成骨细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自公共数据库GEO: GSE171213的牙周组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9995 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional footprint for pseudogene SsCLEC9A is associated with antigen processing and presentation in Sus scrofa
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140629
PMID:39904428
|
研究论文 | 本研究首次发现猪的CLEC9A基因因远古突变成为假基因，但其突变转录本仍影响树突状细胞的抗原呈递功能 | 首次揭示猪CLEC9A基因成为假基因的进化事件，并发现其突变转录本仍具有生物学功能 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究假基因SsCLEC9A的转录适应及其在抗原呈递中的作用 | 猪树突状细胞和骨髓造血细胞 | 免疫学 | NA | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9996 | 2025-10-07 |
Pan-cancer characterization of m6A-mediated regulation of T cell exhaustion dynamics and clinical relevancies in human cancers
2025-Mar-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102465
PMID:39995977
|
研究论文 | 通过整合多组学数据对m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的泛癌作用进行系统性分析 | 首次在泛癌层面揭示m6A修饰与T细胞耗竭动态的相互作用，并基于此识别出三个具有不同临床预后的分子亚型 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证m6A调控T细胞耗竭的具体机制 | 探索m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的作用及其临床相关性 | 人类多种癌症类型中的T细胞耗竭动态 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析 | 多变量分析 | 多组学数据,单细胞RNA测序数据,免疫治疗数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9997 | 2025-10-07 |
Liver transcriptome analysis reveals PSC-attributed gene set associated with fibrosis progression
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101267
PMID:39996122
|
研究论文 | 通过肝脏转录组分析识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 首次系统识别PSC特异性胆道纤维化基因特征，并通过单细胞RNA测序数据揭示不同细胞类型在纤维化中的特异性作用 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证研究 | 识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 原发性硬化性胆管炎、原发性胆汁性胆管炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者的肝脏活检样本 | 转录组学 | 肝脏疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，差异基因表达分析 | NA | 转录组数据 | 47例肝脏活检（PSC 16例，PBC 15例，MASLD 16例），外部验证集73例PSC样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9998 | 2025-10-07 |
Intratumoral Injection of Cytotoxic Drugs Plus Hapten Elicits Significant Immune Responses in Sentinel Lymph Nodes: Implications for Cancer Immunotherapy
2025-Mar-01, Pancreas
IF:1.7Q3
DOI:10.1097/MPA.0000000000002439
PMID:39999315
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析前哨淋巴结在胰腺癌原发灶经细胞毒性药物加半抗原瘤内注射治疗后的细胞和基因组变化 | 首次结合细胞毒性药物与半抗原进行瘤内注射，系统揭示前哨淋巴结微环境的动态重组机制 | 研究仅针对胰腺癌模型，未验证其他癌症类型的普适性 | 探索前哨淋巴结在癌症免疫治疗中的作用机制及远隔效应 | 胰腺癌患者的前哨淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9999 | 2025-10-07 |
Targeting Zfp36 to combat cardiac hypertrophy: Insights into ferroptosis pathways
2025-Mar, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70247
PMID:40000392
|
研究论文 | 本研究揭示了Zfp36通过调控铁死亡通路抑制心脏肥大的新机制 | 首次证明Zfp36通过Ythdc2/SLC7A11/GSH通路调控铁死亡从而抑制心脏肥大 | Zfp36在心脏肥大中的具体作用机制仍需进一步探索 | 研究Zfp36在心脏肥大中铁死亡的调控功能 | 心肌细胞和心肌组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10000 | 2025-10-07 |
Molecular profiling of skin cells identifies distinct cellular signatures in radiation-induced skin injury across various stages in the murine dataset
2025-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00596-w
PMID:40001256
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析辐射诱导皮肤损伤中不同细胞亚群的分子特征和相互作用机制 | 首次在辐射诱导皮肤损伤中系统鉴定32个细胞亚群，揭示循环角质形成细胞通过BMP-Wnt-SMAD通路驱动伤口愈合和纤维化过程 | 研究基于小鼠模型，结果需要进一步在人类样本中验证 | 阐明辐射诱导皮肤损伤的分子机制和细胞相互作用 | C57BL/6小鼠皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 辐射性皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, 多重免疫荧光染色 | Seurat, Cellchat, SCP, ssGSEA | 单细胞转录组数据 | 71,412个细胞，来自辐射后7天和30天及未辐射小鼠皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |