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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2026-08-16
Gene context drift identifies drug targets to mitigate cancer treatment resistance
2025-Sep-08, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 介绍RECODR计算流程,结合单细胞RNA测序的共表达图网络与图嵌入方法,测量癌症治疗中基因共表达背景的变化,以揭示耐药机制并设计有效联合治疗 提出基因共表达背景而非表达水平本身能揭示治疗耐药的关键信息,并通过图嵌入方法检测传统计算方法无法识别的耐药机制 未明确说明局限,但依赖于单细胞RNA测序数据质量,可能受样本异质性和计算资源限制 通过检测基因相互作用的背景特异性变化,揭示癌症治疗耐药的复杂性,并预测新的联合治疗方案 脉络丛癌小鼠模型、髓母细胞瘤和三阴性乳腺癌患者样本 机器学习 癌症 单细胞RNA测序 图神经网络 单细胞转录组数据 NA(摘要未提供具体数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
982 2026-08-16
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过空间和单细胞转录组学分析,揭示了成人皮肌炎皮肤病变中与癌症相关的免疫-基质生态位 首次对成人期皮肌炎进行全面的空间免疫和基质细胞图谱描绘,并发现了与癌症相关的独特免疫浸润模式及基质重塑机制 未提供明确的局限性信息 阐明成人皮肌炎皮肤病变中的免疫和基质细胞空间组织及其与癌症关联的机制 成人皮肌炎和皮肤红斑狼疮患者的皮肤病变组织 空间转录组学 皮肌炎 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提供具体样本数量 NA 空间转录组学、单细胞RNA-seq NA NA
983 2026-08-13
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-12, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术,发现MASLD小鼠模型中高表达CD29的调节性T细胞通过增强细胞粘附,促进MASH向肝细胞癌的恶性转化 首次揭示CD29高表达的Treg亚群在MASLD恶性转化中的作用机制,即通过上调CD29增强细胞粘附驱动MASH进展为HCC 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 阐明Tregs在MASLD向HCC进展中的作用,并探索CD29作为潜在治疗靶点的可能性 MASLD小鼠模型中的调节性T细胞(Tregs)及其亚群 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外功能实验 无 基因表达数据、流式细胞术数据 MASLD小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
984 2026-08-13
scRNA-Seq Reveals Sustained Pro-Inflammation by Innate Immune Activation in In Utero HBV-Exposed Neonates of High HBsAg Mothers
2025-12, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学测序分析,揭示了高HBsAg母亲所生新生儿在出生时及接种乙肝疫苗后的免疫状态,发现其存在持续的前炎症状态,并影响适应性免疫。 首次利用单细胞多组学测序整合转录组和表面标记物,揭示高HBsAg母亲所生新生儿先天性免疫激活引起的持续前炎症状态,并验证了CD8+T细胞耗竭标志物的持续高表达。 研究样本量较小,且仅评估了短期(出生至疫苗接种后)的免疫变化;功能验证仅限于免疫表型,未深入探讨机制。 探究母亲HBsAg滴度对新生儿出生时和接种乙肝疫苗后免疫状态的影响,特别是先天性和适应性免疫的变化。 高、低HBsAg滴度母亲所生的新生儿(分别为Gr.2和Gr.1组)的PBMCs。 单细胞测序、免疫学 乙型肝炎 单细胞多组学测序、免疫表型分析 Seurat R包(用于整合分析) 单细胞转录组和表面蛋白表达数据 两组新生儿(高HBsAg组和低HBsAg组),具体数量未在摘要中给出。 未明确指定,可能包括10x Genomics等(基于单细胞多组学测序) 单细胞多组学(转录组+表面蛋白) 未明确指定 未明确指定
985 2026-08-13
Associations of Plasma Metabolite Phenylacetylglutamine on Coronary Plaque Characterization in Patients with ST-Segment Elevation Myocardial Infarction
2025-12, Cardiovascular toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了血浆代谢物苯乙酰谷氨酰胺与ST段抬高型心肌梗死患者冠状动脉斑块特征之间的关联。 首次揭示了血浆PAGln水平与罪犯斑块脆弱性独立相关,并提示巨噬细胞可能参与该过程。 仅基于观察性研究,未进行因果推断;样本仅限于接受OCT成像的STEMI患者,可能限制结果的普遍性。 调查血浆PAGln与STEMI患者罪犯斑块特征(通过OCT评估)之间的关联。 776名接受初级经皮冠状动脉介入治疗并接受OCT成像的ST段抬高型心肌梗死患者。 机器学习和数字病理学 心血管疾病 光学相干断层扫描、单细胞RNA测序 逻辑回归模型 影像数据、基因组数据 776名患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
986 2026-08-13
MNDA promotes immunosuppression in microsatellite instability-high colorectal cancer by facilitating PMN-MDSC infiltration via H3K18 lactylation
2025-10-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了MNDA通过H3K18乳酸化修饰促进PMN-MDSC浸润,导致微卫星不稳定型结直肠癌免疫抑制和PD-1耐药的新机制 首次发现MNDA通过招募EP300促进CXCR2启动子H3K18乳酸化,增强CXCR2转录,从而促进PMN-MDSC浸润和免疫抑制,并提出靶向MNDA/EP300-CXCR2轴恢复PD-1治疗敏感性的新策略 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,临床转化价值需进一步验证 阐明MSI-H结直肠癌中PD-1耐药机制,寻找新的治疗靶点 MSI-H结直肠癌患者肿瘤样本及MC38小鼠模型 免疫学 结直肠癌 scRNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq, qRT-PCR, Co-IP NA 基因表达数据, 表观遗传修饰数据 未明确,包含PD-1敏感和耐药结直肠癌患者肿瘤样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
987 2026-08-13
Integrative Multiomics Identifies CD64⁺ Monocytes as Potential Contributors to Age-Related Macular Degeneration
2025-09-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过整合多组学方法,识别出CD64⁺CD14⁻CD16⁻单核细胞可能是年龄相关性黄斑变性的潜在贡献者,并揭示其与视网膜色素上皮细胞的免疫调节相互作用 首次通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和流式细胞术,确定CD64⁺单核细胞亚群在AMD中的因果作用,并揭示其与RPE细胞的关键信号通路 未明确提及,但可能包括样本量有限、小鼠模型的局限性以及需要进一步功能验证 识别AMD中因果免疫细胞群体并阐明其在疾病进展中的功能作用 AMD患者和健康对照的视网膜色素上皮/脉络膜组织,以及钠碘诱导的干性AMD小鼠模型 多组学整合分析 年龄相关性黄斑变性 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 基因组关联研究汇总统计、单细胞转录组数据、流式细胞术数据 包括GSE230348数据集中的AMD患者和健康对照样本,以及干性AMD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
988 2026-08-13
Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction
2025-09, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 本研究揭示了干扰素ε(IFNε)是9p21缺失导致免疫冷肿瘤、免疫检查点治疗耐药和内源性CXCL9/10诱导缺失的关键分子连接 首次将IFNε确定为9p21.3缺失导致免疫逃逸的关键分子,并通过小鼠模型和人类肿瘤数据验证了其与CD8 T细胞抑制和CXCL9/10趋化因子缺失的因果关系 研究主要依赖观察性数据和多组学分析,尚需进一步的功能实验和临床试验验证DC-CXCL9/10疫苗的有效性 阐明9p染色体缺失(特别是9p21.3 IFN-I基因)导致肿瘤免疫逃逸和免疫检查点治疗耐药的分子机制,并探索潜在治疗策略 人类肿瘤样本(包括HPV阴性头颈鳞癌、非鳞状非小细胞肺癌、黑色素瘤、尿路上皮癌和间皮瘤)及小鼠模型(KPC胰腺癌和KPL-3M非鳞状NSCLC模型) 肿瘤免疫学 头颈鳞癌、非小细胞肺癌、黑色素瘤、尿路上皮癌、间皮瘤、胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、拷贝数变异分析、中介分析 NA 基因组数据、转录组数据、单细胞表达数据 涉及13篇报告、36个免疫检查点治疗队列,以及人类肿瘤、细胞系和小鼠模型(具体样本数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
989 2026-08-13
Regulatory KIR+CD8+ T cells are elevated during human pregnancy
2025-08-06, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 研究发现妊娠期间调节性KIR+CD8+ T细胞数量升高,可能通过抑制胎儿特异性同种异体反应性T细胞反应来促进母胎耐受 首次揭示KIR+CD8+ T细胞在妊娠期间的作用,特别是其在男性胎儿孕妇中的升高及对男性特异性蛋白的抑制,并关联先兆子痫和自然流产 摘要未明确提及研究局限 探究KIR+CD8+ T细胞在妊娠期间的作用及其在母胎耐受中的潜在机制 孕妇外周血和蜕膜中的KIR+CD8+ T细胞,以及脐带血细胞和男性胎儿 免疫学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 孕妇外周血和蜕膜样本(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
990 2026-08-13
Systematic analysis of cellular cross-talk reveals a role for SEMA6D-TREM2 regulating microglial function in Alzheimer's disease
2025-07-30, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过重建细胞间通讯网络,揭示了SEMA6D-TREM2在调节小胶质细胞功能中的作用,并关联阿尔茨海默病病理过程 首次系统分析细胞间通讯网络,发现SEMA6D-TREM2相互作用在AD中的新角色,并通过多种技术验证其机制 研究基于转录组数据,可能未涵盖蛋白水平或翻译后修饰的影响,且样本来源有限 探索阿尔茨海默病中细胞间通讯失调的机制,特别是小胶质细胞功能调控 阿尔茨海默病患者和对照组的脑组织样本,以及人诱导多能干细胞来源的小胶质细胞 生物信息学、神经科学 阿尔茨海默病 单核转录组测序、空间转录组学、免疫染色、基因敲除细胞系实验 NA 转录组数据、空间表达数据、免疫组化图像 67例脑组织样本(来自Knight ADRC和DIAN队列) 10x Genomics 单核RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单核RNA测序,10x Visium空间转录组学(具体配置未提供)
991 2026-08-13
The impact of de novo lipogenesis on predicting survival and clinical therapy: an exploration based on a multigene prognostic model in hepatocellular carcinoma
2025-06-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 基于从头脂肪生成通路构建多基因预后模型,用于预测肝细胞癌的生存和临床治疗反应 首次构建基于从头脂肪生成通路的多基因预后模型,并结合单细胞RNA测序和多因子免疫荧光染色,揭示高风险组免疫抑制微环境与治疗耐药性的关联 未提及明显的局限性 探索从头脂肪生成在肝细胞癌预后预测中的作用,并评估其与免疫微环境和临床治疗的相关性 肝细胞癌患者样本 机器学习和数字病理学 肝细胞癌 RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组化、Western blotting、多因子免疫荧光染色 LASSO-Cox回归模型 基因表达数据、免疫组化图像、单细胞转录组数据 TCGA、GEO、ICGC-LIRI数据集及湘雅队列(n=106) NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
992 2026-08-13
Pathway-based cancer transcriptome deciphers a high-resolution intrinsic heterogeneity within bladder cancer classification
2025-06-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究基于通路分析膀胱癌转录组,揭示其内在异质性,并识别出四种内在亚型,其中DP亚型与不良预后相关,并找到潜在治疗靶点BEXO2 通过通路级别癌症转录组分类方法,从单细胞数据中分离纯肿瘤细胞,揭示膀胱癌内在转录异质性,并识别出具有不同预后和治疗响应特征的四种内在亚型 研究主要依赖公开数据集,实验验证有限,且需要进一步临床验证 探索膀胱癌内在基因表达谱对患者分类和预后的贡献,并识别新的治疗靶点 膀胱癌患者肿瘤细胞及其亚型 机器学习 膀胱癌 单细胞转录组测序 机器学习算法(具体模型未指定) 基因表达数据(单细胞和批量转录组) 涉及GSE135337和TCGA膀胱癌数据集(具体样本数未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
993 2026-08-13
Decoding hippocampal subfield and glial responses in ischemia using single-cell transcriptomics
2025-06-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学解码缺血过程中海马亚区和胶质细胞反应 首次揭示缺血后海马CA1和CA3-DG亚区在胶质细胞和血管细胞反应上的差异性分子特征,并识别出缺血特异性的少突胶质细胞亚型和cd74阳性周细胞增加 未提及明确的局限性 探究瞬时全局性脑缺血前后海马CA1和CA3-DG亚区的细胞组成和分子变化,以及胶质和血管细胞的区域差异反应 Sprague-Dawley大鼠的海马CA1和CA3-DG区域细胞,包括胶质细胞和血管细胞 单细胞转录组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 未明确样本数量,但涉及接受四血管闭塞手术的大鼠和正常对照大鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
994 2026-08-13
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal MAZ(+) NPC-like clusters as key role contributing to glioma recurrence and drug resistance
2025-06-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组分析,发现MAZ(+) NPC样细胞簇在胶质瘤复发和耐药中起关键作用,并提出了潜在的联合治疗策略 首次利用单细胞和空间转录组技术揭示MAZ(+) NPC样细胞簇在胶质瘤耐药中的核心作用,并发现MAZ通过上调FOXM1增强干性和耐药性,提出紫杉醇和曲美替尼联合治疗的策略 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;样本量可能有限,需要更大规模的临床验证 在单细胞和空间转录组水平研究胶质瘤对替莫唑胺耐药的异质性,以识别耐药机制和潜在的治疗策略 胶质瘤细胞,包括治疗前后的样本 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq NA 基因表达数据、空间转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
995 2026-08-13
Integrative analysis of bulk and single-cell gene expression profiles to identify bone marrow mesenchymal cell heterogeneity and prognostic significance in multiple myeloma
2025-06-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 整合批量与单细胞基因表达谱分析,识别多发性骨髓瘤中骨髓间充质细胞的异质性及其预后意义 发现了高迁移率族蛋白高表达的独特亚克隆HMGhMSC,并基于此构建预后模型 未在摘要中提及局限性 探究多发性骨髓瘤中骨髓间充质干细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用,并构建预后模型 健康供者和不同R-ISS分期多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 基因组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序,批量转录组测序 COX回归,LASSO 单细胞基因表达数据,批量转录组数据 未明确提及具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq 10x Chromium,GSE4581,GSE136337 10x Genomics单细胞RNA测序平台(具体版本未提及),以及GSE4581和GSE136337数据集
996 2026-08-13
Anti-BCL2 therapy eliminates giant congenital melanocytic nevus by senolytic and immune induction
2025-05-16, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究揭示了BCL2抑制剂通过抗衰老和免疫诱导机制清除巨大先天性黑色素细胞痣,为治疗提供了新策略。 首次发现BCL2在衰老和增殖的GCMN细胞中均表达,并证明BCL2抑制剂联合中性粒细胞胞外诱捕网发挥协同治疗作用。 长期随访未显示复发,但研究主要基于动物模型,临床转化仍需验证。 评估BCL2抑制剂治疗巨大先天性黑色素细胞痣的疗效并阐明其作用机制。 巨大先天性黑色素细胞痣患者的细胞、患者来源异种移植模型及Nras/Braf突变转基因小鼠。 数字病理学 巨大先天性黑色素细胞痣 单细胞测序、免疫染色 NA 图像、基因表达数据 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
997 2026-08-13
Deep learning inference of cell type-specific gene expression from breast tumor histopathology
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种基于深度学习的工具,从乳腺癌组织病理学全切片图像直接推断细胞类型特异性基因表达和丰度 首次利用深度学习直接从常规乳腺癌组织病理学全切片图像预测细胞类型特异性基因表达,无需进行bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,成本低且速度快 训练于TCGA乳腺队列,对乳腺癌相关成纤维细胞和癌细胞表现最佳,其他细胞类型预测效果可能有限;独立验证队列规模相对较小 开发一种通用方法,通过组织病理学图像快速、经济地推断肿瘤微环境中细胞类型特异性基因表达,以促进精确肿瘤学应用 乳腺癌肿瘤组织病理学全切片图像及对应的去卷积bulk RNA-seq数据 数字病理学 乳腺癌 NA 深度学习模型 图像,基因表达数据 TCGA乳腺队列及独立队列160例 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
998 2026-08-13
Single-cell transcriptomic analysis reveals gut microbiota-immunotherapy synergy through modulating tumor microenvironment
2025-05-02, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示肠道菌群与免疫检查点抑制剂协同作用通过调节肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫反应的机制 首次在单细胞分辨率下阐明肠道菌群与免疫检查点抑制剂协同作用的机制,提出γδ T细胞-抗原呈递细胞-CD8 T细胞轴,并发现Spp1巨噬细胞重编程的负调控作用 研究主要基于小鼠模型,尚需在人类临床样本中验证 探讨肠道菌群与免疫检查点抑制剂协同作用增强免疫治疗效果的细胞和分子机制 小鼠肿瘤微环境中的免疫细胞(包括T细胞、巨噬细胞等)及肠道菌群 单细胞转录组学 肿瘤 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 小鼠模型,具体样本量未在标题和摘要中说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
999 2026-08-13
A donor PD-1+CD8+ TSCM-like regulatory subset mobilized by G-CSF alleviates recipient acute graft-versus-host-disease
2025-04-02, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究首次发现供者体内一种由G-CSF动员的PD-1+CD8+TSCM样调节性T细胞亚群,能减轻受者急性移植物抗宿主病(aGVHD)并促进免疫重建 首次鉴定出一种新型供者外周血T细胞亚群(PD-1+CD8+CD45RA+CCR7+),该亚群在G-CSF动员下通过BCL6依赖性方式上调PD-1表达,具有干细胞样记忆T细胞的转录组特征及Treg和Teff双重功能,既能抑制aGVHD又能保留移植物抗白血病效应,可作为供者选择指标和治疗靶点 研究样本量有限(发现队列80例,验证队列30例),且小鼠模型与人类临床样本的对应性验证尚需进一步确认,该亚群在自身免疫疾病中的应用前景有待更多研究 优化异基因造血干细胞移植的供者选择标准,寻找与受者良好预后相关的供者淋巴细胞亚群,并探索其在aGVHD预防和治疗中的应用 80名G-CSF动员的健康供者外周血CD4和CD8 T细胞亚群及其对应80名单倍体相合同种异体HSCT受者,另加30名验证队列受者 免疫学 移植物抗宿主病 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,临床随访数据 发现队列80对供者-受者,验证队列30名受者,另加小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
1000 2026-08-13
MicroRNA-mediated Ets1 repression in retinal endothelial cells: A novel anti-angiogenic mechanism in nonproliferative diabetic retinopathy
2025-04, Diabetes, obesity & metabolism
研究论文 本研究旨在探索非增殖性糖尿病视网膜病变中血管生成的调控机制,发现了一种新型微RNA通过抑制Ets1表达发挥抗血管生成作用 首次发现一种新型微RNA靶向Ets1,通过下调Ets1表达抑制血管生成,为NPDR的抗血管生成机制提供新见解 未提及局限性,但可能涉及样本量有限或机制验证不足 探索非增殖性糖尿病视网膜病变中血管生成的调控机制 2型糖尿病患者(伴有和不伴有NPDR)的血浆和视网膜样本,以及小鼠和大鼠模型的单细胞测序数据 基因组学 糖尿病视网膜病变 微RNA测序 NA 测序数据 未提及具体样本量 NA 微RNA测序、单细胞测序 NA NA
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