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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2026-01-01
Turncoat antibodies unmasked in a model of autoimmune demyelination: From biology to therapy
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中发现了分泌自身抗体的卵泡外浆母细胞,并开发了一种合成抗体变体来中和致病性抗MOG抗体 首次在EAE模型中鉴定出分泌非亲和力成熟IgG抗体的卵泡外浆母细胞,并证明合成抗体8-18C5及其变体可阻断致病性抗体结合并减轻疾病严重程度 研究基于小鼠模型,结果在人类疾病中的直接应用需进一步验证 开发选择性中和自身抗体的疗法,以治疗自身免疫性疾病 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型及MOG抗体疾病患者 NA 自身免疫性脱髓鞘疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
982 2026-01-01
Single-nucleus and spatial transcriptomics reveal the cell populations of intercalary meristems in bamboo
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术,结合染色体水平基因组组装和高分辨率解剖图谱,揭示了竹子节间分生组织的细胞群体动态及其遗传基础 首次在竹子中整合单核RNA测序与空间转录组学,构建了节间分生组织的动态单核转录组连续体,并识别了关键的干细胞样亚群及其功能 研究主要基于毛竹,结果在其他单子叶植物中的普适性有待验证,且功能实验仅初步探索了特定基因的作用 理解单子叶植物节间分生组织的细胞群体动态、遗传基础及其在快速茎伸长中的作用 毛竹的节间分生组织及其相关细胞群体 植物发育生物学 NA 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位杂交, 超微结构成像 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 涉及毛竹节间分生组织的三个关键发育阶段(初始细胞分裂期、快速细胞分裂期、快速细胞伸长期) NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
983 2026-01-01
Mapping Gene Impact on Single-cell Transcriptomic Networks via Perturbation Response Scanning
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为单细胞扰动影响指数(scPII)的数据驱动度量方法,用于量化基因扰动对系统层面的影响,无需依赖CRISPR筛选信息 将最初为蛋白质结构动力学开发的扰动响应框架应用于单细胞转录组网络,以识别最易受扰动的基因模块 未明确提及具体的技术或数据限制,但方法依赖于基因调控网络的准确性 开发一种量化基因扰动系统级影响的方法,以识别对细胞状态有最大全局影响的基因 单细胞转录组网络和基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
984 2026-01-01
CrebA regulation of secretory capacity: genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-Dec-10, Genetics IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过DNA结合实验、表达分析和单细胞RNA测序,揭示了果蝇CrebA转录因子通过直接调控分泌途径组分基因来增强胚胎唾液腺的分泌能力,并探讨了其与哺乳动物同源蛋白的保守功能 首次结合全基因组转录谱分析和体内DNA结合研究,系统评估CrebA在调控分泌能力中的作用,并利用单细胞RNA测序技术比较突变体与野生型样本,深入探索CrebA结合与基因调控的关系 CrebA结合大量基因但仅调控部分,功能结合与非功能结合的区分机制尚不明确;CrebA是否在所有果蝇胚胎组织中驱动分泌途径组分基因表达或调控其他组织特异性功能仍需进一步研究 探究果蝇CrebA转录因子在增强分泌能力中的调控机制及其与哺乳动物同源蛋白的保守性 果蝇胚胎唾液腺及多种组织中的分泌途径组分基因 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、DNA结合实验、表达分析、结合位点诱变 NA 基因表达数据、DNA结合数据 CrebA缺失突变胚胎与现有野生型样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
985 2026-01-01
Stem cell-based approach to identify regulatory TFs during mammalian cell differentiation
2025-Dec-09, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本文开发了一种结合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR转录因子功能缺失筛选的方法,用于识别哺乳动物细胞分化过程中的关键转录因子 整合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR筛选,系统性识别脊髓运动神经元分化中的关键转录因子,并揭示小鼠与人类之间的调控保守性 方法主要针对脊髓运动神经元分化,在其他分化途径中的普适性有待进一步验证 识别哺乳动物细胞分化过程中关键的转录因子 小鼠和人类的脊髓运动神经元分化过程 单细胞组学 NA 单细胞转录组学, CRISPR筛选 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
986 2026-01-01
Plasma metabolites, metabolic risk score and colorectal cancer risk: a prospective cohort study
2025-Dec, European journal of epidemiology IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过前瞻性队列分析,探讨了血浆代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险之间的关联 首次结合LASSO-COX和随机森林方法筛选代谢物,并构建代谢风险评分,同时联合生活方式因素评估结直肠癌风险 研究基于英国生物银行数据,可能受人群特异性限制,且代谢物测量为单时间点,无法反映动态变化 评估代谢物、代谢风险评分及其与生活方式因素的联合效应对结直肠癌风险的影响 英国生物银行中的82,514名参与者 代谢组学与流行病学 结直肠癌 血浆代谢物分析、单细胞RNA测序 LASSO-COX、随机森林、Cox回归 代谢组数据、临床随访数据、单细胞RNA测序数据 82,514名参与者,其中1,151例结直肠癌病例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
987 2026-01-01
Distinct roles of Atf3, Zfp711 and Bcl6b in early embryonic hematopoietic and endothelial lineage specification
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术结合基因敲除,探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b三个转录因子在小鼠胚胎干细胞早期造血和内皮谱系分化中的不同作用 首次在单细胞分辨率下系统研究Atf3、Zfp711和Bcl6b在早期胚胎造血发育中的功能,揭示了它们对谱系分化的特异性调控机制 研究基于体外小鼠胚胎干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂性;Bcl6b敲除未观察到明显表型,其功能需进一步探索 解析早期胚胎造血发育中转录因子的调控网络 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的造血和内皮谱系细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因敲除 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 未明确样本数量,使用体外分化的小鼠胚胎干细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
988 2026-01-01
Immunological dynamics in orthotopic compared with subcutaneous murine models of HPV-positive oropharyngeal cancer
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了皮下与舌根原位小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的差异 首次利用单细胞RNA测序系统比较了不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽癌免疫动态方面的准确性,并揭示了模型选择与免疫治疗反应预测的相关性 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类肿瘤样本的免疫特征,且样本量有限 评估不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的适用性 HPV阳性口咽鳞状细胞癌的小鼠模型(皮下和舌根原位模型) 单细胞测序 口咽癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
989 2026-01-01
The mouse neonatal small intestine is regionally specialized for protein absorption and transepithelial transport
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究揭示了小鼠新生儿小肠中空肠与回肠肠上皮细胞在蛋白质吸收与跨上皮转运方面的区域特异性功能分工 首次通过体内外转运实验结合转录组学方法,系统阐明了新生儿小肠不同区段(空肠与回肠)肠上皮细胞在完整蛋白质转运与降解方面的功能分化及其分子基础 研究主要基于小鼠模型,人类新生儿肠道是否存在完全相同的机制仍需验证;Dab2条件性敲除对蛋白质转运的影响机制尚未完全解析 探究新生儿肠道蛋白质吸收的区域特异性机制及其分子调控网络 新生小鼠小肠肠上皮细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序、转录组分析、遗传学方法、体内外转运实验 NA 转录组数据、遗传数据、功能实验数据 新生小鼠肠道组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
990 2026-01-01
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和类器官实验,揭示了ETV1作为肠道L细胞中PYY激素表达的关键转录调节因子 首次发现ETV1特异性调控PYY表达而不影响GLP-1,揭示了L细胞谱系中特定激素的转录调控机制 研究主要基于小鼠模型和类器官实验,尚未在人体中验证;ETV1对PYY的调控作用较为有限 探究肠道L细胞中激素GLP-1和PYY的转录调控机制 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 单细胞组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
991 2026-01-01
NETosis-Like Response Triggered by Extracellular Vesicle (EV)-Delivered Viral Nucleic Acid, a Novel Cellular Immune Mechanism in Crustacean
2025-Dec, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 本研究揭示了在甲壳动物中,细胞外囊泡递送病毒核酸触发NETosis样反应的新型细胞免疫机制 首次在甲壳动物中基于单细胞转录组学鉴定出中性粒细胞样细胞,并揭示了由EVs递送病毒核酸介导的新型NETosis诱导机制 研究主要聚焦于甲壳动物模型,机制在脊椎动物中的普适性尚未验证 探究甲壳动物中细胞外囊泡在病毒核酸递送和NETosis样免疫反应中的作用机制 泥蟹的血细胞(特别是中性粒细胞样细胞)和WSSV病毒 免疫学 病毒感染 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
992 2026-01-01
High Shear Stress-Induced Endothelial Piezo1 Downregulation Promotes Intracranial Aneurysm Formation via the PDGF-BB/PDGFRβ Paracrine Signaling Pathway
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了高剪切应力通过下调内皮细胞Piezo1表达,进而激活YAP/β-catenin信号通路促进PDGF-BB分泌,最终通过PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路诱导血管平滑肌细胞表型转化,从而促进颅内动脉瘤形成的机制 首次阐明了内皮细胞机械敏感离子通道Piezo1在高剪切应力诱导颅内动脉瘤形成中的关键作用,并发现了PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路作为Piezo1下游效应器的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;AAV2-BR1-Tie2-Cre介导的Piezo1条件性敲除可能存在脱靶效应 探究高剪切应力诱导颅内动脉瘤形成的分子机制,重点关注内皮细胞Piezo1通道在其中的作用 人类颅内动脉瘤样本、小鼠颅内动脉瘤模型、体外共培养的内皮细胞和血管平滑肌细胞 血管生物学与疾病机制研究 颅内动脉瘤 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、平行板流动腔系统、AAV介导的基因敲除、细胞共培养、受体-配体对分析 小鼠颅内动脉瘤模型、体外细胞共培养模型 基因表达数据、单细胞转录组数据、组织病理学数据 未明确说明具体样本数量,但包括人类IA样本、Piezo1flox/flox转基因小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
993 2026-01-01
A novel computational analysis integrating social determinants information from EHR and literature with Alzheimer's disease biological knowledge through large language models and knowledge graphs
2025-Dec, Innovation in aging IF:4.9Q1
研究论文 本研究利用大型语言模型和知识图谱整合电子健康记录与文献中的社会健康决定因素信息,通过图深度学习预测阿尔茨海默病相关生物网络中的链接 首次将社会健康决定因素与阿尔茨海默病生物知识通过知识图谱和大型语言模型进行整合,并利用图深度学习进行链接预测 研究主要基于现有文献和电子健康记录数据,可能受数据质量和覆盖范围的限制 探索社会健康决定因素对阿尔茨海默病的影响,并整合生物知识以增强疾病理解 阿尔茨海默病及相关痴呆症 自然语言处理 老年疾病 单细胞RNA测序、蛋白质组学 图深度学习 文本、多模态生物数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
994 2026-01-01
Exploration of the Prognostic Value of PANoptosis-Related Genes in Bladder Cancer
2025 Nov-Dec, American journal of men's health
研究论文 本研究系统探讨了PANoptosis相关基因在膀胱癌中的预后价值及临床意义 首次在膀胱癌中识别出两种具有显著生存差异的PANoptosis分子亚型,并构建了一个包含九个关键基因的预后模型,该模型在训练集和验证集中均表现出强大的风险分层能力,同时通过单细胞测序分析揭示了这些基因在肿瘤微环境中的细胞类型特异性表达模式 研究主要基于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进行进一步验证,实验验证仅针对KCNJ15、FASN和ADAMTS12三个基因在组织中的过表达,未涵盖模型中的所有基因 探索PANoptosis相关基因在膀胱癌中的预后价值,并构建一个用于患者风险分层的预后模型 膀胱癌患者及其相关的基因表达数据 生物信息学 膀胱癌 单细胞测序,生物信息学分析 预后风险模型 基因表达数据 来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
995 2026-01-01
B cell transcriptomics reveals lasting dysregulation and rapid decline of protective memory after hepatitis C cure
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和抗体库特征分析,揭示了慢性丙型肝炎治愈后B细胞转录失调持续存在及保护性记忆快速下降的机制 首次通过整合单细胞转录组学和抗体库分析,发现慢性丙型肝炎治愈后B细胞仍存在转录失调,并识别出TNF-α信号作为慢性B细胞过度活化的关键驱动因素,以及CD86hi记忆B细胞亚群在病毒清除后快速下降 研究未明确探讨B细胞失调的长期临床影响或具体干预策略 探究慢性丙型肝炎治愈后B细胞免疫记忆失调的机制及其可逆性 慢性丙型肝炎患者的B细胞 单细胞组学 丙型肝炎 单细胞转录组学, 抗体库特征分析 NA 转录组数据, 抗体序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
996 2026-01-01
Adhesion-Related Pathways and Functional Polarization of Astrocytes in Traumatic Brain Injury: Insights from Single-cell RNA Sequencing
2025-04-27, Neuromolecular medicine IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析创伤性脑损伤小鼠模型中星形胶质细胞的亚型与功能动态,揭示了A1与A2两种反应性亚型的功能差异及黏附相关通路在功能极化中的关键调控作用 首次在创伤性脑损伤模型中系统描绘星形胶质细胞的功能异质性,发现黏附相关通路(间隙连接、黏附连接、钙依赖性黏附)具有亚型特异性表达模式和时间动态变化,并提出A1与A2状态间存在潜在转换轨迹 研究基于小鼠模型,人类创伤性脑损伤的星形胶质细胞反应可能存在差异;单细胞RNA测序未能完全揭示蛋白质水平的功能变化 探究创伤性脑损伤后星形胶质细胞功能异质性的调控机制 创伤性脑损伤小鼠模型的皮质与海马组织中的星形胶质细胞 单细胞组学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 多个不同损伤严重程度的数据集(未明确具体样本数) NA 单细胞RNA-seq NA NA
997 2026-01-01
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-07, Research square
研究论文 本研究验证了“双重打击”假说,即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因,但需要高胆固醇血症才能诱导完全的内皮重编程和动脉粥样硬化斑块形成 首次在遗传谱系示踪模型中验证了血流诱导的内皮细胞重编程假说,并发现了内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞转变的新现象 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步深入 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生过程中对内皮细胞重编程的协同作用 小鼠动脉内皮细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,谱系示踪 NA 单细胞转录组数据,图像数据 来自95只小鼠的98,553个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
998 2026-01-01
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,验证了在动脉粥样硬化形成过程中,紊乱血流与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞重编程的机制 首次提出并验证了“两阶段假说”,即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因,但需要高胆固醇血症才能诱导完全重编程和动脉粥样硬化斑块发展,并发现了内皮细胞向泡沫细胞转化的新现象 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证依赖于公开数据集,且实验时间点仅限于2周和4周,可能未覆盖长期动态变化 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化形成中对内皮细胞重编程的协同作用机制 小鼠动脉内皮细胞,特别是暴露于紊乱血流的左颈总动脉区域 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,谱系追踪 NA 单细胞转录组数据,图像数据 95只小鼠,共98,553个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
999 2026-01-01
Annexin A's Life in Pan-Cancer: Especially in Glioma Immune Cells
2025-02-26, Neuromolecular medicine IF:3.3Q2
研究论文 本文通过整合多组学数据,全面评估了ANXA2和ANXA4在多种癌症中的表达模式及功能影响,特别聚焦于胶质母细胞瘤 利用单细胞测序分析揭示ANXA2和ANXA4在胶质母细胞瘤中主要由M2巨噬细胞表达,并强调了使用多种分析方法识别差异表达基因的重要性 分析工具之间存在差异,可能影响结果的一致性 研究ANXA家族在泛癌分析及胶质瘤中的预后意义和功能作用 ANXA2和ANXA4基因,以及胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤 生物信息学 胶质瘤 单细胞测序分析,多组学数据整合 NA 基因组数据,单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1000 2026-01-01
Cross-tissue multi-omics analyses reveal the gut microbiota's absence impacts organ morphology, immune homeostasis, bile acid and lipid metabolism
2025-Feb, iMeta IF:23.7Q1
研究论文 本研究通过跨组织多组学分析,揭示了肠道菌群缺失对器官形态、免疫稳态、胆汁酸和脂质代谢的影响 首次结合空间转录组学、单细胞RNA测序和靶向胆汁酸代谢组学,系统评估了无菌小鼠中肠道菌群缺失的多器官效应,并发现了自噬驱动的脂滴分解和ZBTB20-LPL轴在脂质稳态中的关键作用 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且仅比较了无菌和特定病原体自由状态,未涵盖菌群组成变化的中间状态 探究肠道菌群缺失如何影响宿主器官形态、免疫稳态及代谢过程 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的多个器官 多组学分析 非传染性疾病 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向胆汁酸代谢组学 NA 转录组数据, 代谢组数据 无菌和特定病原体自由小鼠的多器官样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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