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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-03-24
Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs
2025-06-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究首次成功拯救了天然猪圆环病毒3型(PCV3),并利用剖腹产仔猪模型阐明了其致病机制,包括病毒复制特征、组织病理学变化及免疫抑制机制 首次通过透射电镜观察到PCV3病毒颗粒,并首次在剖腹产仔猪模型中系统阐明了PCV3的免疫抑制机制,特别是发现Th2细胞减少导致体液免疫受损 研究仅使用剖腹产仔猪模型,未在常规饲养猪只中验证;病毒分离和拯救过程依赖人工合成基因组,可能与天然病毒存在差异 阐明天然PCV3病毒的致病机制和免疫抑制特性 猪圆环病毒3型(PCV3)病毒颗粒、PK-15细胞、剖腹产仔猪(CD pigs) NA 猪圆环病毒感染 病毒拯救、免疫荧光检测、Western blotting、透射电镜、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 显微镜图像、蛋白质印迹数据、病毒滴度数据、单细胞转录组数据 未明确说明具体动物数量,使用剖腹产仔猪作为感染模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
82 2026-03-24
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-06-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了急性鳜鱼虹彩病毒感染如何靶向鳜鱼幽门盲囊的浆膜层,引发纤维性浆膜炎,并最终导致严重腹水形成的细胞和分子机制 首次在单细胞分辨率下解析了鳜鱼幽门盲囊对急性虹彩病毒感染的全局反应,明确了病毒驱动的浆膜炎是导致鳜鱼特有严重腹水症状的根本原因 研究主要关注急性感染期的反应,对慢性感染或恢复期的病理过程未作探讨,且实验模型为特定鱼类,结论的普适性有待验证 探究鳜鱼虹彩病毒急性感染导致严重腹水的病理机制 鳜鱼及其幽门盲囊组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
83 2026-03-24
Identifying Causal Brain Structures, Genes, and Proteins for Osteoarthritis: A Large-Scale Genetic Correlation Study Based on Brain Imaging-Derived Phenotypes, Transcriptomes, and Proteomes
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究通过整合脑影像衍生表型、转录组和蛋白质组数据,验证了脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,并识别了关键的因果基因和蛋白质 首次大规模整合脑影像表型、脑转录组、脑蛋白质组与骨关节炎GWAS数据,系统探索脑-关节轴的遗传基础,并利用单细胞RNA-seq eQTL数据在细胞类型水平定位因果基因 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,结论在其他族群中的普适性需进一步验证;脑蛋白质组样本量相对较小(152例) 验证脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,识别介导该关联的因果基因和蛋白质 骨关节炎患者及对照人群(GWAS样本826,690人)、脑转录组(5,138例)、脑蛋白质组(152例) 生物信息学与遗传学 骨关节炎 全基因组关联研究(GWAS)、连锁不平衡评分回归(LDSC)、孟德尔随机化(MR)、转录组范围关联研究(TWAS)、蛋白质组范围关联研究(PWAS)、单细胞RNA-seq eQTL分析 统计遗传学模型(LDSC、MR、TWAS、PWAS) 遗传汇总统计数据、脑影像衍生表型数据、脑转录组数据、脑蛋白质组数据、单细胞表达数据 GWAS:826,690人;脑转录组:5,138例;脑蛋白质组:152例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
84 2026-03-24
Elucidating Cellular Senescence-related Genes in Benign Prostatic Hyperplasia Through Mendelian Randomization and Single-cell RNA Sequencing
2025-06-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别了与良性前列腺增生(BPH)因果相关的细胞衰老相关基因,并分析了它们在多种前列腺细胞中的表达模式和调控网络 结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序,首次系统性地识别了BPH中因果相关的细胞衰老基因,并揭示了跨细胞类型的一致表达模式和核心转录调控网络 研究主要基于欧洲人群的遗传数据(如FinnGen和UKB),可能限制了结果在其他人群中的普适性;单细胞数据样本量未明确说明,可能影响统计效力 识别与良性前列腺增生(BPH)因果相关的细胞衰老基因,并探究其在不同前列腺细胞中的表达和调控机制 良性前列腺增生(BPH)相关的细胞衰老基因及其在前列腺细胞(如成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞、上皮细胞)中的表达 生物信息学 前列腺增生 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、共定位分析、单细胞调控网络推断与聚类 NA 遗传数据(eQTL)、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-03-24
Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs
2025-05-20, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变对H3N2犬流感病毒在小鼠和犬中致病性增强的协同作用及其分子机制 首次通过小鼠体内连续传代建立了致死性H3N2犬流感病毒感染模型,并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒致病性的新机制,同时利用单细胞RNA测序在单细胞水平阐明了病毒逃逸宿主抗病毒反应的机制 研究主要基于小鼠和犬的感染模型,对人类感染的直接风险评估仍需进一步研究;单细胞测序分析仅针对小鼠肺组织,犬类组织的免疫反应机制可能有所不同 阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制,评估其跨物种传播风险 H3N2犬流感病毒(CIV)及其突变株,感染的小鼠和犬 病毒学与传染病学 流感病毒感染 病毒连续传代、突变鉴定、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因序列数据、单细胞转录组数据、病毒滴度数据 小鼠和犬的感染模型(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
86 2026-03-24
Human long noncoding RNA VILMIR is induced by major respiratory viral infections and modulates the host interferon response
2025-04-15, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过大规模转录组数据分析,发现了一种新型长链非编码RNA VILMIR,它在多种主要呼吸道病毒感染后被上调,并调控宿主干扰素反应 首次鉴定并表征了长链非编码RNA VILMIR作为干扰素刺激基因,在流感、SARS-CoV-2和RSV感染中上调,并证明其调控宿主干扰素反应 研究主要基于细胞系和体外实验,体内功能和具体分子机制尚需进一步探究 识别在人类主要呼吸道病毒感染中起关键作用的新型长链非编码RNA靶点 人类上皮细胞系(如A549)、免疫细胞系(SUP-T1、THP-1)以及COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 自然语言处理 呼吸道病毒感染 RNA-seq NA 转录组数据 多个细胞系及COVID-19患者样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
87 2026-03-24
Myeloid-driven immunosuppression in head and neck cancer: single-cell ATAC/RNA and spatial transcriptomic perspectives
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 本文综述了单细胞ATAC/RNA测序和空间转录组学在揭示头颈癌中髓系细胞驱动的免疫抑制机制方面的进展,并评估了相关的转化机遇 整合单细胞多组学(ATAC/RNA)与空间转录组学数据,系统解析了头颈癌中不同于经典淋巴细胞耗竭的、以髓系细胞为中心的免疫抑制新机制(如SPP1 TAM屏障、cDC1/IL-12不足、CXCL8-CXCR1/2驱动的中性粒细胞迁移),并提出了将这些发现与现有疗法(如PD-1抑制剂、EGFR抗体)及新兴髓系检查点(如CD47-SIRPα、PI3Kγ、CXCR1/2)相结合的精准免疫治疗新策略 存在HPV状态异质性、检测方法标准化有限、预测性生物标志物缺乏等挑战,限制了临床转化应用 总结并评估单细胞多组学和空间转录组学在解析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)髓系免疫抑制机制及指导精准免疫治疗方面的进展与转化潜力 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的髓系免疫细胞(如肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞)及其介导的免疫抑制微环境 数字病理学 头颈癌 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
88 2026-03-23
Resistance of endothelial cells to SARS-CoV-2 infection in vitro
2025-12-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过体外实验和人类肺组织切片分析,证明内皮细胞对SARS-CoV-2感染具有抵抗性 首次结合体外培养的内皮细胞和活体人肺组织切片中的原生内皮细胞,并使用单细胞RNA测序追踪病毒存在,系统性地证明了内皮细胞对SARS-CoV-2的直接感染性很低 研究主要基于体外实验和肺组织切片,可能无法完全模拟体内复杂的微环境 探究内皮细胞对SARS-CoV-2感染的易感性,以理解COVID-19血管炎症和血栓形成的机制 体外培养的内皮细胞(来自肺、主动脉和内皮祖细胞)以及人肺组织切片中的原生内皮细胞 细胞生物学与病毒学 COVID-19 单细胞RNA测序、荧光成像、ELISA、RT-qPCR NA 基因表达数据、图像数据、蛋白质浓度数据 多种来源的内皮细胞(肺、主动脉、内皮祖细胞)及人肺组织切片 NA 单细胞RNA测序 NA NA
89 2026-03-23
Single-cell RNA sequencing highlights the role of epithelial-immune dual features of proximal tubule cells in BK polyomavirus nephropathy
2025-11-25, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了BK多瘤病毒肾病微环境中近端小管细胞的一个具有上皮-免疫双重特征的新亚群(IGKC+ PT),该亚群可能通过T细胞耗竭促进疾病进展,并可作为非侵入性诊断标志物 首次在BK多瘤病毒肾病中鉴定出具有上皮-免疫双重特征的近端小管细胞新亚群(IGKC+ PT),并阐明其通过诱导T细胞耗竭促进疾病进展的潜在机制 研究样本量有限,且主要基于观察性数据,需要进一步的功能性实验验证IGKC+ PT亚群的具体作用机制 探究BK多瘤病毒肾病的微环境特征,寻找新的治疗靶点和诊断标志物 BK多瘤病毒肾病患者的肾移植样本和尿液样本 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 BK多瘤病毒肾病样本和稳定移植肾样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
90 2026-03-23
Multi-omics Mendelian randomization and single-cell analysis identify novel therapeutic targets for osteosarcopenia
2025-11-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究通过多组学孟德尔随机化和单细胞分析,识别了骨肌减少症的潜在治疗靶点 整合了转录组、蛋白质组孟德尔随机化、SMR和共定位分析,结合单细胞RNA测序数据,首次系统性地识别了骨肌减少症的因果相关基因和蛋白质靶点 需要进一步在特定组织和细胞环境中验证这些靶点的功能和作用机制 识别骨肌减少症的潜在治疗靶点 骨肌减少症(骨质疏松和肌肉减少症共存) 生物信息学 老年疾病 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 孟德尔随机化模型 基因组关联研究数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 大规模GWAS数据集(包括eQTLgen, deCODE, Fenland) NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2026-03-23
A novel ZIKV-targeted scRNA-seq method for precise quantification of ZIKV RNA
2025-10-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究开发了一种新型的寨卡病毒靶向单细胞RNA测序方法,用于在单个细胞中精确定量寨卡病毒RNA 开发了一种针对缺乏poly(A)尾的寨卡病毒RNA的新型靶向scRNA-seq方法,克服了现有技术难以检测此类病毒的局限,并在检测外源性细胞方面显示出更高效率 研究仅在免疫健全的乳鼠脑部感染模型中进行,样本采集时间点单一(感染后10天),未涵盖其他组织或更广泛的感染时间动态 开发一种能够精确定量单个细胞内寨卡病毒RNA的测序方法,并鉴定寨卡病毒感染的关键易感细胞类型 寨卡病毒感染的免疫健全乳鼠脑组织细胞 数字病理学 寨卡病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 寨卡病毒感染及对照的乳鼠脑组织样本(具体数量未明确说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics scRNA-seq(具体配置未详述,作为对比方法使用)
92 2026-03-23
Elucidating brain transport pathways and cell type-dependent gene silencing of a durable lipid-siRNA conjugate administered into cerebrospinal fluid
2025-Jun-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究开发了一种脂质-siRNA偶联物(L2-siRNA),通过脑脊液注射实现全脑有效转运,并详细评估了其在小鼠和大鼠中的区域组织基因沉默效果及细胞类型特异性 开发了具有持久基因沉默效果的L2-siRNA偶联物,首次通过单细胞RNA测序绘制了细胞类型特异性敲低图谱,并与反义寡核苷酸进行了脑区基因沉默活性比较 研究主要基于动物模型(小鼠和大鼠),尚未在人体中进行验证,且长期毒性评估可能不足 探索脂质-siRNA偶联物通过脑脊液给药实现全脑转运和细胞类型依赖性基因沉默的机制 小鼠和大鼠的脑组织及脑脊液 神经科学 中枢神经系统疾病 单细胞RNA测序,基因沉默技术 NA RNA测序数据,基因表达数据 小鼠和大鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
93 2026-03-23
Single Cell Profiling in the Sox10Dom Hirschsprung Mouse Implicates Hox Genes in Enteric Neuron Trajectory Allocation
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探究了Sox10Dom突变对小鼠肠道神经系统发育中神经元轨迹分配的影响,并首次将Hox基因表达变化与神经元轨迹改变相关联 首次在Sox10Dom突变模型中,通过单细胞RNA测序揭示了Hox基因(特别是Hoxa6)表达变化与肠道神经元轨迹分配异常的关联 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类疾病;样本量相对较小,且仅聚焦于早期发育阶段 探究Sox10缺陷如何改变肠道神经元比例,并阐明其在早期肠道神经系统发育中的作用机制 Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的肠道神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 单细胞组学 先天性巨结肠症 单细胞RNA测序,免疫组织化学,杂交链式反应 NA 单细胞转录组数据,图像数据 Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的肠道神经系统细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
94 2026-03-23
Spatial transcriptomics reveals distinct role of monocytes/macrophages with high FCGR3A expression in kidney transplant rejections
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,揭示了高表达FCGR3A的单核细胞/巨噬细胞在肾移植排斥反应中的关键作用 首次在肾移植排斥反应中,通过空间转录组学识别出高表达FCGR3A的单核细胞/巨噬细胞亚群,并关联其空间分布与组织病理学特征 研究基于有限的人类肾移植活检样本,未涉及长期随访或功能验证实验 探究先天免疫细胞亚群在肾移植排斥反应中的具体作用机制 人类肾移植物的福尔马林固定石蜡包埋核心针活检样本 空间转录组学 肾移植排斥反应 空间转录组学 NA 空间转录组数据 人类肾移植活检样本(具体数量未明确) NA 空间转录组学 NA NA
95 2026-03-21
Distinct populations of lung capillary endothelial cells and their functional significance
2025-Dec-26, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了肺毛细血管内皮细胞的分子异质性,识别出五个新的gCaps亚群及其功能角色 首次在肺毛细血管中识别出五个新的gCaps亚群,包括表达Scn7a和Clic4离子转运蛋白的两种主要亚群、有丝分裂活跃的'根'细胞以及表达Lingo2的静脉-毛细血管内皮,并阐明了它们在血管表型转换、再生修复和血管生成调节中的作用 研究主要基于单细胞转录组学数据,功能验证可能有限,且缺氧模型可能无法完全模拟所有肺疾病的病理条件 探究肺毛细血管内皮细胞的分子异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能意义 肺毛细血管内皮细胞 数字病理学 肺疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-03-21
Single-cell transcriptome profiling reveals immunological fitness of HIV long-term non-progressors
2025-12-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序,揭示了HIV长期不进展者(LTNPs)相较于典型进展者(TPs)具有更平衡和有利的免疫学特征 首次在单细胞分辨率下系统比较了LTNPs、TPs和健康供体的免疫细胞转录组特征,并应用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)揭示了LTNPs特有的先天免疫/髓系相关模块高表达及B细胞/细胞毒性相关模块低表达模式 样本量较小(仅12名个体),且为横断面研究,无法确定观察到的转录组差异是HIV不进展的原因还是结果 探究与HIV慢性感染中疾病不进展相关的免疫学特征 HIV长期不进展者(LTNPs)、典型进展者(TPs)和健康供体(HDs)的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 HIV感染 单细胞RNA测序 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) 单细胞转录组数据 12名个体(4名LTNPs、4名TPs、4名HDs) NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-03-21
Cmss1 limits FMDV infection by enhancing antigen presentation and CD8+ T cell responses
2025-12-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过构建小鼠感染模型和单细胞RNA测序,揭示了FMDV感染如何改变树突状细胞亚群比例并抑制抗原呈递过程,并鉴定出Cmss1作为拮抗该抑制、限制FMDV致病性的新型宿主因子 首次在缺乏I型干扰素受体的小鼠模型中,利用单细胞RNA测序绘制了FMDV感染后脾脏树突状细胞的高分辨率图谱,并鉴定出Cmss1作为调控抗原呈递过程、限制FMDV感染的新型宿主因子 研究主要基于小鼠模型,其在免疫应答方面与猪(FMDV的自然宿主)存在差异;单细胞测序仅针对脾脏组织,未涵盖其他免疫器官 探究树突状细胞在FMDV感染中的作用机制,寻找限制病毒感染的新型宿主因子 缺乏I型干扰素受体的C57BL/6小鼠、FMDV病毒、树突状细胞 免疫学 口蹄疫 单细胞RNA测序、基因编辑、抗原呈递能力评估系统 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,使用基因编辑小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-03-21
Single-cell sequencing of rodent ventral pallidum reveals diverse neuronal subtypes with noncanonical interregional continuity
2025-Dec-05, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术,揭示了啮齿动物腹侧苍白球(VP)的神经元亚型多样性及其跨区域连续性 首次在跨物种(小鼠和大鼠)水平上对VP进行转录组表征,识别出16个保守的神经元亚类,并发现这些亚类超越了传统VP边界,与纹状体、下丘脑和扩展杏仁核等区域共享细胞类型 研究主要基于啮齿动物模型,结果在人类中的适用性尚需验证;高脂饮食的影响分析可能未涵盖所有相关基因或通路 探究腹侧苍白球的区域身份和细胞类型多样性,及其在摄食等行为中的作用 小鼠和大鼠的腹侧苍白球组织 单细胞测序 NA 单细胞核RNA测序 NA RNA序列数据 啮齿动物(小鼠和大鼠)的腹侧苍白球组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-03-21
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2025-Dec-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过整合多种技术方法,揭示了细胞外基质刚度在急性肾损伤修复中的关键作用,并识别出Mfap2作为通过非经典Hippo通路调控酮生成和修复的核心介质 首次绘制了AKI肾脏基质支架的全面蛋白质组图谱,并发现Mfap2通过LATS1介导的非经典Hippo通路调控机械代谢信号,而不影响整合素受体活性 研究主要基于动物模型,其发现向人类临床转化的有效性尚需进一步验证 探究细胞外基质如何调控急性肾损伤的修复机制 急性肾损伤动物模型、肾脏成纤维细胞、周细胞及肾小管细胞 数字病理 急性肾损伤 数据非依赖性采集全局与磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程方法 NA 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
100 2026-03-21
Genome doubling as a dynamic driver of ovarian cancer evolution: insights from single-cell sequencing
2025-Nov-19, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
综述 本文综述了全基因组加倍(WGD)作为卵巢癌进化动态驱动因子的最新见解,特别是通过单细胞测序技术揭示其在高级别浆液性卵巢癌中的作用 重新定义了WGD的角色,从基因组不稳定的结果转变为肿瘤进化的核心动态驱动因子,并解决了WGD驱动的染色体不稳定性与免疫抑制表型相关的生物学悖论 NA 探讨全基因组加倍在卵巢癌,特别是高级别浆液性卵巢癌进化中的动态驱动作用及其临床意义 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC) 基因组学 卵巢癌 单细胞测序 NA 基因组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
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