单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 9961 - 9980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9961 | 2025-10-07 |
Upregulation of LSP1 in AML cells enhances AML resistance to sorafenib and promotes apoptosis in CD8+ T cells
2025-Mar-26, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114255
PMID:39952006
|
研究论文 | 本研究通过RNA-seq和单细胞RNA-seq分析发现LSP1是AML的重要免疫相关标志物，影响索拉非尼耐药性和CD8+T细胞功能 | 首次揭示LSP1在AML免疫抑制微环境中的关键作用，及其对索拉非尼耐药性和CD8+T细胞凋亡的影响 | 未明确说明样本数量和研究人群的具体特征 | 探索AML免疫抑制肿瘤微环境的机制并寻找免疫治疗新靶点 | 急性髓系白血病(AML)细胞和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9962 | 2025-10-07 |
Applications of Single-Cell Omics Technologies for Induced Pluripotent Stem Cell-Based Cardiovascular Research
2025-Feb-28, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23183
PMID:39129179
|
综述 | 探讨单细胞组学技术与诱导多能干细胞在心血管研究中的整合应用 | 整合单细胞组学与iPSC技术，探索空间组学等新兴范式在揭示心脏组织空间结构方面的潜力 | NA | 阐明心脏健康与疾病的分子复杂性，推动心血管研究发展 | 心脏细胞、诱导多能干细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9963 | 2025-10-07 |
A novel telomere-associated genes signature for the prediction of prognosis and treatment responsiveness of hepatocellular carcinoma
2025-Feb-27, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00271-8
PMID:40016654
|
研究论文 | 本研究开发了一个包含18个端粒相关基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次建立了基于端粒相关基因的肝细胞癌预后模型，并通过孟德尔随机化分析确认了ASF1A基因与酒精性肝细胞癌的因果关系 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索端粒相关基因在肝细胞癌中的作用 | 肝细胞癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,Western blotting,Transwell迁移实验,伤口愈合实验,集落形成实验 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据 | 374例肝细胞癌样本和50例正常肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 9964 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Extensive Heterogeneity and Unique Gene Trajectories in Non-Transformed and Transformed Human Lung Epithelial Cells: Insights into the Role of LncRNAs in Tumor Heterogeneity
2025-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041690
PMID:40004153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人肺上皮细胞在非转化和转化状态下的转录组异质性及lncRNA在肿瘤异质性中的作用 | 首次在单细胞水平系统比较非转化与转化肺上皮细胞的lncRNA表达轨迹，揭示lncRNA亚型对细胞异质性的贡献机制 | 研究仅使用两种细胞系（BEAS2B和H460），未涉及原代肿瘤样本或体内模型验证 | 探究肺上皮细胞在癌变过程中的转录组异质性特征及lncRNA的作用机制 | 永生化非转化肺上皮细胞系BEAS2B和转化肺上皮细胞系H460 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种肺上皮细胞系（BEAS2B和H460） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9965 | 2025-10-07 |
Revealing the core suppression effects of various Di (2-ethylhexyl) phthalate exposure on early meiosis progression in postnatal male mice via single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.117866
PMID:39923572
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示DEHP暴露对雄性小鼠早期减数分裂进程的核心抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序全面证明DEHP通过Trp53介导的p38-MAPK通路抑制雄性生殖细胞早期减数分裂进程 | 研究仅限于啮齿类动物模型，未涉及人类样本验证 | 探究DEHP暴露对雄性生殖系统早期减数分裂影响的分子机制 | 出生后雄性小鼠睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 42,000个细胞，3,172,754,990条reads | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 9966 | 2025-10-07 |
Analysis of toxicity and mechanisms of busulfan in non-obstructive azoospermia: A genomic and toxicological approach integrating molecular docking, single-cell sequencing, and experimentation in vivo
2025-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.117878
PMID:39933234
|
研究论文 | 本研究通过整合分子对接、单细胞测序和体内实验，揭示了白消安导致非梗阻性无精子症的关键分子机制 | 首次发现POLE和LRAT蛋白是白消安诱导睾丸毒性的关键靶点，并揭示了免疫细胞浸润在疾病进程中的作用 | 研究主要聚焦于白消安的毒性机制，对其他化疗药物的适用性需要进一步验证 | 阐明白消安导致非梗阻性无精子症的分子机制和关键信号通路 | 白消安处理的睾丸组织及精原干细胞 | 生殖医学 | 男性不育症 | 分子对接, 单细胞RNA测序, 体内实验 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9967 | 2025-10-07 |
Atlas of expression of acyl CoA binding protein/diazepam binding inhibitor (ACBP/DBI) in human and mouse
2025-Feb-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07447-w
PMID:40011442
|
研究论文 | 本研究绘制了酰基辅酶A结合蛋白/地西泮结合抑制剂(ACBP/DBI)在人类和小鼠组织中的表达图谱 | 首次系统揭示ACBP/DBI在哺乳动物特定细胞类型中的保守表达机制及其共调控网络 | 研究主要基于数据库挖掘，缺乏实验验证 | 探究ACBP/DBI在人类和小鼠不同器官中的表达模式及调控机制 | 人类和小鼠的正常组织、恶性肿瘤组织 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,转录组学,蛋白质组学,系统数据挖掘 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 人类和小鼠多种组织器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9968 | 2025-10-07 |
KRT7 promotes pancreatic cancer metastasis by remodeling the extracellular matrix niche through FGF2-fibroblast crosstalk
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-84129-1
PMID:40011455
|
研究论文 | 本研究揭示了KRT7通过FGF2-成纤维细胞相互作用重塑细胞外基质微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现KRT7通过调控FGF2分泌影响癌症相关成纤维细胞功能，重塑转移前微环境 | 样本量有限，机制研究主要基于动物模型 | 探究KRT7在胰腺癌转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和肿瘤细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA测序,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | 原位肿瘤模型小鼠 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 24个PDAC样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9969 | 2025-10-07 |
Immunological profile of lactate metabolism-related genes in Psoriasis a comprehensive analysis based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91237-z
PMID:40011693
|
研究论文 | 通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，研究银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学特征 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据系统分析银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学作用 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明乳酸代谢在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病患者皮肤组织 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个数据集(GSE13355, GSE109248)的合并样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9970 | 2025-10-07 |
Immune dysregulation in COVID-19 induced ARDS in kidney transplant recipients revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91439-5
PMID:40011702
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫失调差异 | 首次构建肾移植受者COVID-19相关ARDS的单细胞图谱，发现S100A9+巨核细胞亚群和XAF1+效应T细胞亚群的特异性变化 | 样本来源仅限于外周血，未涉及肺部局部免疫反应；样本量相对有限 | 探索肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫应答差异，寻找潜在治疗靶点 | 肾移植受者、非移植受者的COVID-19相关ARDS患者及健康对照 | 单细胞组学 | COVID-19相关急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、富集分析 | 单细胞转录组数据 | 108,320个外周血细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9971 | 2025-10-07 |
Combining single-cell ATAC and RNA sequencing for supervised cell annotation
2025-Feb-26, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06084-6
PMID:40011801
|
研究论文 | 本研究探索了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的效果 | 首次系统评估了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的性能提升，而非仅关注无监督方法 | 在神经元细胞注释中未观察到性能提升，结果可能受细胞类型和数据集特性影响 | 评估多组学数据整合对监督式细胞类型注释性能的改善 | 人类外周血单个核细胞(PBMC)和阿尔茨海默病神经元细胞 | 单细胞多组学分析 | 阿尔茨海默病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, 支持向量机, 逻辑回归, scVI | 单细胞多组学数据 | 两个独立数据集：PBMC和神经元细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics多组学平台 |
| 9972 | 2025-10-07 |
Pathological and molecular insights into intravenous leiomyomatosis: an integrative multi-omics study
2025-Feb-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05919-9
PMID:40011937
|
研究论文 | 通过整合多组学方法研究静脉内平滑肌瘤病的病理和分子特征 | 首次对静脉内平滑肌瘤病进行综合多组学分析，揭示了染色体10q缺失与血管形态作为预测侵袭性行为的重要标志物 | 样本量有限，疾病罕见性限制了研究的规模 | 探索静脉内平滑肌瘤病的发生发展机制，为诊断和治疗提供新见解 | 静脉内平滑肌瘤组织、子宫肌瘤组织和正常子宫肌层组织 | 数字病理学 | 平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, H&E染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 病理图像 | 8对配对的IVL和正常子宫肌层新鲜冷冻组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 9973 | 2025-10-07 |
Exploring the hepatic-ophthalmic axis through immune modulation and cellular dynamics in diabetic retinopathy and non-alcoholic fatty liver disease
2025-Feb-26, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00730-z
PMID:40011971
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索糖尿病视网膜病变和非酒精性脂肪肝病中的免疫调节和细胞动态变化 | 首次系统揭示T细胞、巨噬细胞和内皮细胞在DR和NAFLD中的共同基因特征及CD45信号通路的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 阐明糖尿病视网膜病变和非酒精性脂肪肝病之间的肝-眼轴相互作用机制 | T细胞、巨噬细胞、内皮细胞等免疫相关细胞群体 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变,非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,伪时间分析,细胞通讯分析 | CellChat,GSEA,GSVA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的PDR和NAFLD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9974 | 2025-10-07 |
Enhanced conversion of T cells into CAR T cells by modulation of the MAPK/ERK pathway
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101970
PMID:39938523
|
研究论文 | 通过调节MAPK/ERK通路增强T细胞向CAR T细胞的转化效率 | 首次通过单细胞多组学分析揭示CAR T细胞生成过程中的分子事件，发现ERK2磷酸酶在CAR T细胞中上调 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 改善CAR T细胞的生成效率 | 健康供体和患者的T细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 9975 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial analysis reveals the interaction between ITLN1+ foam cells and SPP1+ macrophages in atherosclerosis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1510082
PMID:40017519
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了动脉粥样硬化中ITLN1+泡沫细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现VSMC来源的ITLN1+泡沫细胞与SPP1+FABP5+巨噬细胞通过MIF-(CD74+CD44)和SPP1-CD44配体-受体轴相互作用 | 需要进一步验证这些机制以开发有效的免疫治疗策略 | 研究动脉粥样硬化发病机制中不同细胞群体的调控功能 | 动脉粥样硬化斑块中的细胞群体，特别是VSMC来源的ITLN1+泡沫细胞和SPP1+FABP5+巨噬细胞 | 单细胞分析, 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 伪时间轨迹分析 | CellChat, GO分析, KEGG通路分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9976 | 2025-10-07 |
Single-cell Analysis Highlights Anti-apoptotic Subpopulation Promoting Malignant Progression and Predicting Prognosis in Bladder Cancer
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251323569
PMID:40018511
|
研究论文 | 通过单细胞分析识别膀胱癌中具有抗凋亡特性的肿瘤亚群及其在肿瘤进展中的作用 | 首次在膀胱癌中鉴定出具有抗凋亡特性的肿瘤亚群，揭示了该亚群通过特定信号通路与微环境相互作用促进肿瘤进展的机制 | NA | 阐明膀胱癌肿瘤异质性对患者预后的影响机制 | 膀胱癌肿瘤样本和类器官 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9977 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing revealed the necessity of macrophages in brain microenvironment remodeling by breast cancer metastasis
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102287
PMID:39837060
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示巨噬细胞在乳腺癌脑转移微环境重塑中的必要性 | 首次在小鼠乳腺癌脑转移模型中实施单细胞RNA测序，发现巨噬细胞亚群在中枢神经系统的变化及癌细胞对肿瘤微环境细胞互作的重塑 | 研究样本量有限，仅重新分析了三个脑外科标本数据并使用小鼠模型 | 全面研究乳腺癌脑转移的肿瘤微环境，识别促进脑转移的促肿瘤机制和关键分子 | 乳腺癌脑转移患者手术标本和小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三个脑外科标本和一个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9978 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis and experiments identified ANXA1 as an unfavorable prognosticator in glioma
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102286
PMID:39842212
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证ANXA1在胶质瘤中的促癌作用及预后价值 | 首次结合单细胞测序数据和功能实验系统揭示ANXA1在胶质瘤恶性进展中的关键作用 | ANXA1在胶质瘤中的促癌机制及其与患者功能状态的相关性仍需进一步研究 | 探讨ANXA1在胶质瘤中的预后价值和生物学功能 | 胶质瘤患者样本、胶质瘤细胞系、动物模型 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 实时定量PCR, Western blotting, 单细胞测序, 慢病毒载体, 伤口愈合实验, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | 两个患者队列, GSE162631数据集样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9979 | 2025-10-07 |
CD47 is a tumor cell-derived exosomal signature and regulates tumor immune microenvironment and immunotherapy responses
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102291
PMID:39864342
|
研究论文 | 本研究揭示CD47作为肿瘤源性外泌体标志物，可区分免疫热肿瘤和冷肿瘤并预测免疫治疗反应 | 首次发现CD47是肿瘤源性外泌体特异性标志物，能够有效区分免疫热/冷肿瘤并预测免疫治疗敏感性 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证机制 | 探索肿瘤源性外泌体标志物在肿瘤免疫微环境调控和免疫治疗反应中的作用 | 卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌、乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、组织芯片 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 | 多个癌症队列的大规模数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 9980 | 2025-10-07 |
Cellular heterogeneity and communication networks in gastric cancer: Single-cell analysis reveals β-hydroxybutyrylation-associated genes and immune infiltration characteristics
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102270
PMID:39884220
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析胃癌细胞异质性和通讯网络，揭示β-羟基丁酰化相关基因与免疫浸润特征 | 首次在胃癌中发现20个β-羟基丁酰化相关基因，并构建基于这些基因的风险评分模型 | 样本量相对有限，需要进一步验证 | 解析胃癌细胞异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胃癌细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | 风险评分模型 | 单细胞基因表达数据 | 189,700个单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |