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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9941 | 2025-10-07 |
High expression of stearoyl-coenzyme A desaturase in colorectal cancer oncogenic functions and its potential as a therapeutic target
2025-Feb-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i2.100237
PMID:40061980
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研究论文 | 本研究探讨硬脂酰辅酶A去饱和酶在结直肠癌中的致癌功能及其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过多中心高通量数据整合分析SCD在结直肠癌中的表达意义,并验证氯化两面针碱与SCD的靶向亲和性 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探索SCD在结直肠癌中的临床病理学意义及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色、CRISPR基因敲除筛选、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 2482例结直肠癌样本和1334例非癌结直肠组织对照 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9942 | 2025-10-07 |
Cross-species imputation and comparison of single-cell transcriptomic profiles
2025-Feb-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03493-x
PMID:40012008
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研究论文 | 开发了跨物种单细胞转录组数据插补与比较的神经网络框架Icebear | 首次实现跨物种单细胞基因表达谱的准确预测,并揭示哺乳动物X染色体上调的进化适应机制 | 未明确说明模型验证的具体样本规模和应用场景限制 | 解决跨物种单细胞转录组比较的挑战,促进从模式生物到人类的知识迁移 | 真兽类哺乳动物和鸡的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9943 | 2025-10-07 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639556
PMID:40060457
|
研究论文 | 开发了一种人源化小鼠模型系统,模拟产前寨卡病毒感染并揭示神经干细胞过早分化的机制 | 建立了首个能够模拟人类产前寨卡病毒感染表型谱的人源化免疫健全小鼠模型系统 | 小鼠模型与人类生理存在差异,需要进一步验证临床转化价值 | 建立可靠的产前寨卡病毒感染实验模型并研究其致病机制 | 人源化小鼠模型和寨卡病毒感染后的脑组织 | 传染病模型 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9944 | 2025-10-07 |
MIG-21 is a novel regulator of Wnt and Netrin signaling in gonad migration identified from published scRNA-seq data and functionally validated in C. elegans
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639896
PMID:40060509
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序数据,发现了一个新的生殖系干细胞生态位调节因子MIG-21,并验证其在引导远端尖端细胞迁移中的功能 | 首次发现MIG-21基因整合Wnt和Netrin信号通路信息来指导细胞迁移,揭示了传统筛选方法因基因冗余而被掩盖的遗传网络 | 研究仅在线虫模型中进行验证,未在其他生物体系中确认该机制的普适性 | 探索生殖系干细胞生态位调节的新机制 | 秀丽隐杆线虫的远端尖端细胞(DTC) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 经典遗传学技术, RNAi敲低, 活细胞成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | 成年雌雄同体线虫的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9945 | 2025-10-07 |
Molecular differences between young and mature stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111832
PMID:40028281
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研究论文 | 本研究通过建立幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹组织外植体模型并进行单细胞RNA测序,揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 开发了首个幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹全组织外植体模型,并结合单细胞RNA测序技术系统分析发育过程中的分子变化 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类转化的有效性需要进一步验证 | 研究耳蜗血管纹在发育过程中的分子差异,为治疗血管纹退化相关听力损失提供新见解 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序, 组织外植体培养 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9946 | 2025-10-07 |
A Nerve-Fibroblast Axis in Mammalian Lung Fibrosis
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611003
PMID:39314391
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物肺纤维化中交感神经与表达α1-肾上腺素能受体的肌成纤维细胞之间形成的新型促纤维化轴 | 首次发现并表征了跨物种保守的神经-成纤维细胞轴,揭示了神经对组织重塑的关键贡献 | 纤维化机制尚未完全阐明,需要进一步研究验证 | 探究肺纤维化中肌成纤维细胞积累的机制 | 小鼠和人类纤维化肺组织、肺成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液 | 病理生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 光学透明化, 全肺成像, 基因删除, 共培养, 精准肺切片 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 测序数据 | 多种肺纤维化患者的肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9947 | 2025-10-07 |
Shiba: a versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf098
PMID:39997221
|
研究论文 | 开发了Shiba计算方法用于系统识别不同平台间的差异RNA剪接 | 能够捕获注释和未注释的剪接事件,解决连接读段不平衡问题,统计框架对样本量不敏感,并扩展了单细胞RNA-seq分析功能 | NA | 开发一个跨平台的差异RNA剪接分析方法 | RNA剪接事件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9948 | 2025-10-07 |
Subepicardial adipose genes contribute to the deterioration of heart failure preserved ejection fraction
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1501397
PMID:40060963
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了心外膜下脂肪基因通过影响细胞衰老促进射血分数保留型心力衰竭发展的机制 | 首次系统筛选并验证了心外膜下脂肪组织中OGN、FOS和ALOX5等枢纽基因在HFpEF发病中的作用机制 | 研究样本量有限,机制研究主要基于体外实验,需要更多临床验证 | 探索内脏脂肪细胞基因在射血分数保留型心力衰竭发展中的作用机制 | 心力衰竭患者的心外膜下组织、血液样本、细胞系和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 生物信息学分析, 蛋白互作网络分析, 细胞实验 | PPI网络, ROC分析 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床样本数据 | GSE251971数据集、人类组织样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9949 | 2025-10-07 |
scLTNN: an innovative tool for automatically visualizing single-cell trajectories
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf033
PMID:40061870
|
研究论文 | 开发了一种名为scLTNN的创新工具,用于自动可视化单细胞轨迹 | 结合人工神经网络和分布模型,基于高变异基因的一致表达分布发现,创建了能够自动推断细胞起源和终末状态的新工具 | NA | 开发计算效率高的单细胞轨迹推断工具 | 人类骨髓细胞、小鼠胰腺内分泌谱系、斑马鱼胚胎轴中胚层谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9950 | 2025-10-07 |
Application of Spatial Omics in the Cardiovascular System
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0628
PMID:40062231
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综述 | 探讨空间组学技术在心血管系统研究中的应用及其前景 | 系统整合多种空间组学技术(转录组、蛋白质组、代谢组、基因组、表观基因组)在心血管研究中的创新应用 | NA | 推动心血管疾病精准医疗、靶向治疗和个性化治疗的发展 | 心血管系统 | 空间组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学 | NA | NA |
| 9951 | 2025-10-07 |
CD177+ neutrophils exacerbate septic lung injury via the NETs/AIM2 pathway: An experimental and bioinformatics study
2025-Apr-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114292
PMID:40007380
|
研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学分析揭示了CD177+中性粒细胞通过NETs/AIM2通路加剧脓毒症肺损伤的机制 | 首次发现CD177+中性粒细胞是脓毒症肺组织中的主要中性粒细胞亚群,并阐明其通过NETs激活AIM2炎症小体加重肺损伤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;样本量相对有限 | 阐明脓毒症诱导急性肺损伤的免疫细胞异质性及其关键作用机制 | CLP模型小鼠的肺组织免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞测序,分子生物学实验 | NA | 单细胞测序数据,基因表达数据 | CLP模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9952 | 2025-10-07 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
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综述 | 本文回顾了TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的研究历程与临床转化潜力 | 首次系统梳理TREM2从基础研究到治疗干预的转化路径,提出其作为动脉粥样硬化新型治疗靶点的可行性 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的理论基础与临床应用前景 | 动脉粥样硬化斑块中的泡沫样巨噬细胞及TREM2阳性髓系细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9953 | 2025-03-11 |
Corrigendum to "ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost" [Microbiol. Res. 289 (2024) 127912]
2025-Mar-08, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128137
PMID:40058996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9954 | 2025-10-07 |
Endothelial senescence induced by PAI-1 promotes endometrial fibrosis
2025-Mar-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02377-0
PMID:40050610
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)诱导的内皮细胞衰老促进子宫内膜纤维化的机制 | 首次揭示PAI-1通过uPAR受体诱导内皮细胞衰老在宫腔粘连发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究宫腔粘连中子宫内膜纤维化的分子机制 | 宫腔粘连患者和小鼠模型中的内皮细胞与基质细胞 | 单细胞生物学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9955 | 2025-10-07 |
Targeting Caveolin-1 for enhanced rotator cuff repair: findings from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-05, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02359-2
PMID:40044676
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肩袖损伤组织中细胞亚群的异质性,并评估Caveolin-1对脂肪细胞浸润的调控作用 | 首次在单细胞水平揭示Cav-1表达与成脂活性的负相关性,并验证其作为治疗靶点的潜力 | NA | 探索Caveolin-1在肩袖损伤修复中的作用机制 | 肩袖损伤组织中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9956 | 2025-10-07 |
PCBP2 promotes immune evasion via cGAS-STING pathway in biochemical recurrence of prostate cancer
2025-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250173
PMID:40051782
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研究论文 | 本研究探索前列腺癌中癌症内在免疫逃逸相关基因,并开发了预测生化复发的风险特征 | 首次发现PCBP2通过抑制cGAS-STING通路促进前列腺癌免疫逃逸,并建立了基于CIERGs的生化复发预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索前列腺癌免疫逃逸机制并开发生化复发预测模型 | 前列腺癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | TCGA-PRAD和GSE70769队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9957 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing defines distinct disease subtypes and reveals hypo-responsiveness to interferon in asymptomatic Waldenstrom's Macroglobulinemia
2025-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56323-w
PMID:39929803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无症状华氏巨球蛋白血症的疾病亚型和干扰素低反应性特征 | 首次在单细胞水平定义了华氏巨球蛋白血症的分子亚型,并发现干扰素低反应性这一治疗脆弱点 | 样本量相对有限(79例患者),需要进一步验证研究 | 解析华氏巨球蛋白血症进展的肿瘤内在和免疫机制 | 华氏巨球蛋白血症患者、冒烟型骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓肿瘤和免疫细胞 | 单细胞组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 294,206个骨髓细胞,来自30例AWM/WM患者、26例冒烟型骨髓瘤患者和23例健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9958 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptome and metabolome landscapes of cotton somatic embryos
2025-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-55870-6
PMID:39833155
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学技术,揭示了棉花体细胞胚胎发育过程中的时空基因表达和代谢模式 | 首次在棉花中应用单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学的整合分析方法,构建了公开可用的网络资源数据库 | 棉花体细胞胚胎发生过程仍然存在难以操作的问题,研究可能受限于样本获取的难度 | 解析棉花体细胞胚胎发生过程中的基因表达重编程机制 | 棉花体细胞胚胎 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 9959 | 2025-10-07 |
AI applications in HIV research: advances and future directions
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1541942
PMID:40051479
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综述 | 探讨人工智能在HIV研究中的应用进展及未来发展方向 | 整合人工智能与单细胞测序等技术,实现精准生物标志物识别和改进治疗靶向 | 存在数据限制和模型可解释性等挑战 | 探索人工智能技术在HIV研究各领域的应用进展 | 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)和获得性免疫缺陷综合征(AIDS) | 机器学习 | 艾滋病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9960 | 2025-10-07 |
Heterogeneities of Site-Specific N-Glycosylation in the Hippocampus of Depression-like Behavior Models in Mice Induced by Acute Stress and Chronic Stress
2025-Mar-07, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00655
PMID:39992808
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研究论文 | 通过整合N-糖蛋白组学和蛋白质组学分析,研究急性和慢性应激诱导的小鼠抑郁样行为模型中海马区糖蛋白和位点特异性糖基化的异质性 | 首次在急性和慢性应激抑郁模型中系统分析海马区位点特异性N-糖基化异质性,并发现两种应激模式对糖基化的不同影响模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本量相对有限 | 探索应激诱导抑郁的糖基化机制 | 对照组、急性应激组和慢性温和应激组小鼠的海马组织 | 蛋白质组学 | 抑郁症 | N-糖蛋白组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | tSNE | 蛋白质组数据、糖基化数据、单细胞转录组数据 | 三组小鼠海马组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |