单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 9901 - 9920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9901 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Meihua Pig Testis Cells
2025-Mar-05, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15050752
PMID:40076035
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建梅花猪睾丸细胞图谱，揭示精子发生过程中的转录组特征 | 首次在梅花猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸细胞发育图谱，鉴定出生殖细胞和体细胞的标记基因 | 研究仅针对梅花猪特定发育阶段，样本来源和数量有限 | 表征猪精子发生的转录组景观并鉴定精原细胞的潜在标记基因 | 新生和性成熟六个月大梅花猪的睾丸细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,839个梅花猪睾丸细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 9902 | 2025-10-07 |
MLLT3 Regulates Melanoma Stemness and Progression by Inhibiting HMGB1 Nuclear Entry and MAGEA1 M5C Modification
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408529
PMID:39716999
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子MLLT3通过调控HMGB1核转位和MAGEA1 m5C修饰来抑制黑色素瘤干细胞特性与进展的机制 | 首次发现MLLT3通过双重机制调控黑色素瘤干细胞特性：与HMGB1互作抑制其核转位，与YBX1互作抑制MAGEA1的m5C修饰读取 | 未明确MLLT3与miR-542-3p/miR-3922-3p相互作用的具体分子机制 | 探索MLLT3在黑色素瘤干细胞特性和疾病进展中的调控作用 | 黑色素瘤干细胞和黑色素瘤细胞 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9903 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization reveals immune-mediated regulatory mechanisms and drug targets for COVID-19
2025-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105596
PMID:39933264
|
研究论文 | 通过单细胞转录组孟德尔随机化和共定位分析，揭示COVID-19的免疫介导调控机制和潜在药物靶点 | 首次在14种外周血免疫细胞中系统开展单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)的孟德尔随机化分析，发现58个先前未报道的COVID-19相关基因，并建立分级系统优先确定37个药物靶点 | 基于遗传数据的推断需要进一步实验验证，样本来源限于外周血免疫细胞 | 识别COVID-19的免疫介导调控机制和潜在药物靶点 | 14种外周血免疫细胞中的16,597个基因 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析, 共定位分析, 深度学习模型 | 深度学习 | 单细胞基因表达数据, 遗传数据 | 26,597个单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9904 | 2025-10-07 |
Biases in machine-learning models of human single-cell data
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01619-8
PMID:39972066
|
综述 | 本文讨论机器学习在人类单细胞数据分析中存在的各种偏见问题 | 系统性地识别和分类单细胞数据分析全流程中出现的多种偏见类型 | 主要进行理论讨论，缺乏实证数据验证 | 分析机器学习模型在人类单细胞数据中存在的偏见问题 | 人类单细胞数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 弱监督或无监督机器学习模型 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9905 | 2025-10-07 |
Intratumour oxidative hotspots provide a niche for cancer cell dissemination
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01617-w
PMID:39984655
|
研究论文 | 本研究开发了T-AP1探针可视化肿瘤内氧化应激微环境，揭示了中性粒细胞建立的HO热点区域促进癌细胞播散的新机制 | 首次开发肿瘤靶向HO探针T-AP1，发现肿瘤内HO热点区域作为癌细胞播散的生态位，揭示p38-MYC轴介导的部分上皮间质转化机制 | 未明确NRF2高活化肿瘤中p38反应被抑制的具体分子机制，缺乏在体功能验证实验 | 探究肿瘤微环境中氧化应激异质性对癌细胞播散的影响 | 肿瘤细胞、中性粒细胞、正常上皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 分子探针成像、单细胞分析 | NA | 分子成像数据、细胞表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9906 | 2025-10-07 |
TCL1A in naïve B cells as a therapeutic target for type 1 diabetes
2025-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105593
PMID:39946833
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现T1D早期阶段幼稚B细胞中TCL1A表达上调，并开发靶向Tcl1a mRNA的siRNA纳米药物治疗T1D | 首次发现幼稚B细胞中TCL1A在T1D早期阶段的关键作用，并开发了靶向TCL1A的siRNA纳米药物新疗法 | 研究样本量未明确说明，临床转化潜力需进一步验证 | 探索T1D发病机制并开发新的治疗方法 | 新诊断T1D患者、对照人群和NOD小鼠模型 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 磷酸化蛋白微阵列, siRNA纳米技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质磷酸化数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9907 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics Reveals Novel Mechanisms Involved in Perineural Invasion in Pancreatic Ductal Adenocarcinomas
2025-Mar-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050852
PMID:40075699
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术研究胰腺导管腺癌神经侵袭的新机制 | 首次使用空间转录组学揭示神经侵袭病灶对肿瘤微环境免疫景观的影响，并发现内源性大麻素和多胺代谢在神经侵袭中的作用 | 样本量较小（13例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探索胰腺导管腺癌中神经侵袭的分子机制 | 胰腺导管腺癌患者的神经侵袭和非神经侵袭病灶 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，全转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 13例PDAC患者 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析系统 |
| 9908 | 2025-10-07 |
Single cell analysis identifies distinct CD4 + T cells associated with the pathobiology of pediatric obesity related asthma
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88423-4
PMID:40000680
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学识别与儿童肥胖相关哮喘病理生物学相关的不同CD4+T细胞亚型 | 首次在儿童肥胖相关哮喘中鉴定出具有CDC42上调的特定CD4+T细胞亚群，并揭示其与糖皮质激素抵抗的关联机制 | 研究样本量有限，未涉及其他免疫细胞类型的分析 | 探究儿童肥胖相关哮喘中CD4+T细胞亚型的特征及其在疾病发生中的作用 | 儿童肥胖相关哮喘患者的CD4+T细胞 | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及肥胖哮喘、单纯肥胖和健康体重对照组的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9909 | 2025-10-07 |
Cancer-Associated Fibroblasts Genes and Transforming Growth Factor Beta Pathway in Gastric Cancer for Novel Therapeutic Strategy
2025-Feb-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050795
PMID:40075643
|
综述 | 本文综述了胃癌中癌症相关成纤维细胞基因及其与TGF-β通路的相互作用，为开发新治疗策略提供见解 | 整合单细胞RNA测序数据揭示CAFGs在广义CAFs（包括周细胞）中的表达模式，并系统评估其预后价值 | 与结直肠癌相比，胃癌中CAFGs功能机制研究不足，且缺乏足够的显微切割数据验证表达模式 | 总结CAFGs在胃癌中的分子特征、预后意义和功能机制，探索其治疗潜力 | 癌症相关成纤维细胞基因(CAFGs)和TGF-β信号通路 | 肿瘤微环境研究 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 临床病理学研究 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9910 | 2025-10-07 |
Differences in immune cells and gene expression in human milk by parity on integrated scRNA sequencing
2025-Feb, Clinical and experimental pediatrics
IF:3.2Q1
DOI:10.3345/cep.2024.01585
PMID:39810510
|
研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据，研究胎次对人类母乳中免疫细胞组成和基因表达的影响 | 首次利用公开scRNA-seq数据集系统分析胎次对人类母乳免疫细胞异质性的影响 | 使用公开数据集，样本量有限，需要进一步实验验证 | 阐明胎次对人类母乳免疫细胞异质性和基因表达的影响 | 人类母乳样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开数据集中的母乳样本（初产妇vs经产妇） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9911 | 2024-12-15 |
Author Correction: Dissection of artifactual and confounding glial signatures by single-cell sequencing of mouse and human brain
2025-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01855-5
PMID:39672966
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9912 | 2025-10-07 |
Timestamp calibration for time-series single cell RNA-seq expression data
2025-May-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169021
PMID:40010431
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ScPace的时间戳校准模型，用于处理带噪声标签的时间序列单细胞RNA测序数据 | 在基础分类器中引入潜变量指示器而非概率采样来有效检测噪声样本 | NA | 解决时间序列单细胞RNA测序数据中时间戳自动标注的噪声问题 | 时间序列单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ScPace（基于潜变量指示器的分类模型） | 基因表达数据 | 模拟和真实时间序列单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9913 | 2025-10-07 |
PLOD3 as a novel oncogene in prognostic and immune infiltration risk model based on multi-machine learning in cervical cancer
2025-Mar-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02031-2
PMID:40067513
|
研究论文 | 基于多机器学习方法构建宫颈癌预后和免疫浸润风险模型，并鉴定PLOD3作为新型致癌基因 | 首次将多机器学习算法与代谢相关基因结合构建宫颈癌预后模型，并发现PLOD3作为新型致癌基因 | 模型验证主要依赖公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 提高宫颈癌预后预测准确性和开发治疗策略 | 宫颈癌患者和细胞 | 机器学习 | 宫颈癌 | 基因组学、转录组学、空间转录组学、单细胞分析、功能实验 | 监督主成分分析、随机生存森林 | 基因组数据、转录组数据、空间数据 | 基于多个数据库的样本，识别112个关键代谢基因和337个WGCNA基因 | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 9914 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the cellular dynamics of hexafluoropropylene oxide dimer acid in exerting mouse male reproductive toxicity
2025-Mar-11, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01177-x
PMID:40069855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了六氟环氧丙烷二聚体酸(GenX)对小鼠雄性生殖系统的毒性作用及细胞动态变化 | 首次系统揭示了GenX暴露导致的睾丸细胞动态变化和转录组改变，包括精原干细胞平衡失调和体细胞-生殖细胞相互作用的紊乱 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索GenX暴露引起的雄性生殖毒性及其潜在的细胞和分子调控机制 | 正常发育的小鼠睾丸组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GenX暴露的小鼠睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9915 | 2025-10-07 |
PbImpute: Precise Zero Discrimination and Balanced Imputation in Single-Cell RNA Sequencing Data
2025-Mar-10, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c02125
PMID:39957720
|
研究论文 | 提出一种精确平衡的单细胞RNA测序数据插补方法PbImpute，通过多阶段处理实现技术性丢失零与生物零的精确区分和平衡插补 | 独特地将零膨胀负二项分布建模与静态和动态修复机制相结合，在过度插补和不足插补之间实现最佳平衡 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中零计数（dropout zeros）对下游分析的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项分布模型, 图嵌入神经网络 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集（包括PBMC数据） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9916 | 2025-10-07 |
Mitochondrial Regulator CRIF1 Plays a Critical Role in the Development and Homeostasis of Alveolar Macrophages via Maintaining Metabolic Fitness
2025-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e9
PMID:40078782
|
研究论文 | 本研究揭示线粒体调节因子CRIF1通过维持代谢适应性在肺泡巨噬细胞发育和稳态中的关键作用 | 首次发现CRIF1作为特异性调节肺泡巨噬细胞代谢适应性的关键因子，区别于其他广泛作用的线粒体调节因子 | 研究主要关注CRIF1在肺泡巨噬细胞中的作用，对其他组织驻留巨噬细胞的影响尚未深入探讨 | 探究CRIF1在肺泡巨噬细胞代谢调节和稳态维持中的具体作用机制 | 肺泡巨噬细胞和小鼠模型 | 细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 基因敲除模型 | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9917 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomes uncovers clinically relevant molecular subtypes in human prostate cancer
2025-Jan-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析揭示人类前列腺癌的临床相关分子亚型 | 首次整合单细胞和批量转录组数据构建前列腺癌分子分类系统，揭示抗雄激素治疗诱导的谱系可塑性 | 样本量相对有限（10个原发PCa组织+11个公共数据集样本） | 建立前列腺癌分子分类系统以促进精准肿瘤学 | 人类前列腺癌组织（包括原发PCa和CRPC肿瘤） | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 10个未治疗原发PCa组织 + 3个正常前列腺组织 + 2个未治疗原发PCa组织 + 6个CRPC肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9918 | 2025-10-07 |
Pathogenesis, attenuation, and treatment strategies for keloid management
2025-Jun, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102800
PMID:39999656
|
综述 | 本文综述了瘢痕疙瘩的发病机制、治疗策略及新型治疗方法 | 讨论了单细胞RNA测序等新技术在理解瘢痕疙瘩发病机制中的应用，并详细分析了纳米治疗等新型治疗方法的优势 | 瘢痕疙瘩治疗后易复发，治疗过程复杂，需要长期随访 | 探讨瘢痕疙瘩的发病机制和治疗管理策略 | 瘢痕疙瘩的病理过程和治疗方法 | 皮肤病学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序,转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9919 | 2025-10-07 |
Integrated multi-omics characterization of neuroblastoma with bone or bone marrow metastasis
2025-May, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101511
PMID:40070366
|
研究论文 | 通过整合多组学方法研究伴有骨或骨髓转移的神经母细胞瘤的特征 | 首次使用Swin-Transformer进行病理组织学特征识别，并通过单细胞转录组学发现与转移相关的肿瘤细胞亚群和肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 样本量相对有限（142例），仅使用石蜡包埋组织样本 | 阐明伴有骨或骨髓转移的神经母细胞瘤的发病机制和免疫微环境特征 | 神经母细胞瘤患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组学, 病理图像分析 | Swin-Transformer | 图像, 单细胞转录组数据 | 142例石蜡包埋苏木精-伊红染色肿瘤切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9920 | 2025-10-07 |
Distinct cellular mechanisms underlie chemotherapies and PD-L1 blockade combinations in triple-negative breast cancer
2025-Mar-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.01.007
PMID:39919737
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，揭示了不同化疗药物与PD-L1阻断剂联合治疗三阴性乳腺癌的细胞机制差异 | 发现纳布紫杉醇与紫杉醇在联合PD-L1阻断时对T细胞和髓系细胞的不同调控作用，并首次揭示肥大细胞在协调抗肿瘤免疫反应中的关键作用 | 机制研究仍需进一步验证，临床样本量有限 | 探究三阴性乳腺癌中化疗与免疫检查点阻断联合治疗的细胞机制 | 三阴性乳腺癌患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 已发表和新产生的三阴性乳腺癌患者scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |